OPMERKING: Alle stappen voor de bereiding van media/reagens, het onderhoud van stamcellen en de differentiatie zijn overgenomen van Stebbins et al.22.
1. Voorbereiding van materialen die nodig zijn voor iPSC-cultuur en BEC-differentiatie.
- Matrixcoating van weefselkweek (TC) kunststof voor IMR90-4 iPSC-kweek
- Aliquot basale membraanmatrixgel (bijv. Matrigel) in aliquots van 2,5 mg en bewaren bij -20 °C.
OPMERKING: Werk snel bij het hanteren van de matrixgel en aliquot op ijs, aangezien het een gel vormt boven 4 °C en niet kan worden gealiquoteerd als het eenmaal gestold is.
- Voeg voor het coaten van TC-plastic snel een aliquot matrixgel toe aan 30 ml Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM)/F12-medium in een conische buis van 50 ml. Voeg 1 ml van het medium toe aan de bevroren matrixgel, pipetteer op en neer totdat het ontdooid is en breng onmiddellijk over naar de conische buis van 50 ml met het resterende medium.
- Gebruik 1 ml van deze matrix-gelcoatingoplossing per putje van een plaat met 6 putjes en 12 ml per T75-kolf.
NOTITIE: Matrix gel-gecoat TC-plastic kan tot twee weken voor gebruik worden bereid. Het is echter van cruciaal belang om te voorkomen dat de matrixgeloplossing uitdroogt, waardoor af en toe meer DMEM/F12 bovenop de putjes moet worden toegevoegd.
- Bereid stamcelonderhoudsmedium voor door 50 ml 50x-supplement toe te voegen aan 450 ml stamcelonderhoudsbasaal medium in de steriele omgeving van een bioveiligheidskast.
OPMERKING: Andere onderhoudsmedia voor stamcellen (mTeSR en E8) zijn gebruikt in andere onderzoeken 13,14,15, 22,23,24,25.
- Om 500 ml ongeconditioneerd medium (UM) te bereiden, combineert u 392,5 ml DMEM/F12 met 100 ml knock-out serumvervanging (KOSR), 5 ml niet-essentiële aminozuren, L-glutamine in een eindconcentratie van 1 mM en 3,5 μL β-mercaptoethanol. Filter en steriliseer en bewaar maximaal 2 weken bij 4 °C.
- Om 200 ml endotheelcelmedium (EC) plus retinoïnezuur (RA) plus bFGF te bereiden, combineert u 198 ml humaan endotheelserumvrij medium (hESFM), 2 ml filtergesteriliseerd bloedplaatjesarm afgeleid serum (PDS) en 20 ng/ml bFGF. Filter, steriliseer en bewaar maximaal 2 weken bij 4 °C. Voeg vlak voor toevoeging aan cellen 10 μM RA toe aan EC-medium.
OPMERKING: Aangezien PDS is stopgezet en daarom beperkt kan zijn, is dit protocol met succes uitgevoerd met B27 in plaats van PDS 15,23,26.
- Om 200 ml EC-medium zonder RA of bFGF te bereiden, combineert u 198 ml hESFM en 2 ml filter gesteriliseerde PDS en steriliseert u het filter. Maximaal 4 weken bewaren bij 4 °C.
2. Onderhoud IMR90-4 celkweek
OPMERKING: Hier gebruiken we de IMR90-4-cellijn als voorbeeld, maar andere geïnduceerde pluripotente stamcellijnen zoals CC3, CD10, CD12, DF19-9-11T, 83iCTR, 00iCTR en CS03iCTRn2 zijn met succes gebruikt voor differentiatie in BEC's 13,14,15,16,17,23,27,28.
- Kweek iPSC's bij 37 °C in 5% CO 2 en blijf doorgaans op platen met 6 putjes bij verschillende dichtheden met2 ml stamcelonderhoudsmedium per putje.
- Voor het behoud van de iPSC-cultuur kiest u een enkele put voor doorgang die niet samenvloeit en open ruimtes tussen kolonies heeft.
- Zuig het kweekmedium op, voeg 1 ml niet-enzymatische celdissociatiereagens toe en incubeer gedurende 7 minuten bij 37 °C. Terwijl de incubatie aan de gang is, vervangt u de matrixgeloplossing, op een nieuwe plaat met 6 putjes, door 2 ml vers stamcelonderhoudsmedium per putje.
- Zuig het niet-enzymatische celdissociatiereagens voorzichtig op en zorg ervoor dat u de cellen die nog aan de plaat vastzitten niet opzuigt.
- Voeg 6 ml stamcelonderhoudsmedium toe en spoel de bodem van het putje een paar keer totdat alle cellen volledig zijn losgemaakt. Zaai vervolgens de nieuwe plaat met 6 putjes met verschillende dichtheden, meestal 1:6 of 1:12 voor normaal onderhoud.
OPMERKING: Met behulp van de bovengenoemde verhoudingen worden de cellen ongeveer twee keer per week gesplitst.
- Verplaats de plaat naar de incubator en verdeel de gezaaide cellen gelijkmatig over de putjes door de plaat heen en weer en van links naar rechts te schudden, waarbij u tussen afwisselende schudbewegingen pauzeert totdat het medium is bezonken.
3. Differentiatie van endotheelcellen in de hersenen van menselijke iPSC's
- Plateren van iPSC's voor differentiatie (dag -3 van het differentiatieprotocol)
- Per IMR90-4 onderhoudskweekputje dat wordt gebruikt om te platen voor differentiatie, zuigt u het kweekmedium op, voegt u 1 ml enzymatische celdissociatiereagens per putje toe en incubeert u gedurende 7 minuten bij 37 °C.
- Inactiveer het enzymatische celdissociatiereagens door de 1 ml gedissocieerde celsuspensie over te brengen in een conische buis van 15 ml met ten minste 2 ml vers stamcelonderhoudsmedium per 1 ml cellen. Draai de celsuspensie gedurende 5 minuten rond bij 1.500 x g .
- Resuspendeer de celpellet in 1 ml stamcelonderhoudsmedium per putje gebruikte IMR90-4-cellen en tel de cellen met een hemocytometer.
OPMERKING: Het kan nuttig zijn om 1:1 te verdunnen met 0,4% trypanblauw om onderscheid te maken tussen levende en dode cellen bij het tellen. Afhankelijk van de dichtheid van iPSC's levert één putje van een plaat met 6 putjes meestal 1\u20122 x 106 cellen op.
- Voeg voor differentiatie in een T75-kolf 7,5 x 10,5 cellen toe aan 12 ml stamcelonderhoudsmedium en ROCK-remmer (Y27632-dihydrochloride) in een eindconcentratie van 10 μM. Aspireer de matrix-gelcoatingoplossing uit een T75-kolf en breng de celsuspensie over in de kolf. Verdeel de cellen gelijkmatig door de kolf heen en weer en van links naar rechts te schudden (zie stap 2.2.4) en incubeer bij 37 °C en 5 % CO2 .
OPMERKING: Het is van cruciaal belang om bij deze stap ROCK-remmer toe te voegen om de overleving van de gedissocieerde enkelvoudige stamcellen te verbeteren25,29. Cellen moeten gelijkmatig verdeeld zijn over de kolf en in enkeltjes die een gespreide, mesenchymale morfologie vertonen als gevolg van de behandeling met ROCK-remmers22.
- Verander op dag -2 en dag -1 van media naar vers stamcelonderhoudsmedium; 12 ml per T75.
- Begin op dag 0 met differentiatie door media te veranderen in UM; 12 ml per T75.
- Verander UM dagelijks (dag 1 – dag 5).
OPMERKING: De cellen bereiken meestal confluentie na 2 tot 3 dagen in UM, wat kan worden waargenomen met het blote oog of door een omgekeerde helderveldmicroscoop. Naarmate de differentiatie vordert, worden nestin+ "neurale kanalen" zichtbaar met PECAM-1+ cellen ertussenin, zoals eerder beschreven13,14.
- Breid de endotheelcelpopulatie selectief uit door over te schakelen op EC-medium met 20 ng/ml bFGF en 10 μM retinoïnezuur (RA) (dag 6) en gedurende twee dagen te incuberen. EC-medium met bFGF kan tot twee weken van tevoren worden bereid. RA wordt toegevoegd uit bevroren bouillon op de dag van gebruik (bijv. 1 μL 10 mM RA-bouillon per 1 ml EC + bFGF).
OPMERKING: Succesvolle differentiatie kan ook worden bereikt zonder suppletie van RA op dag 6 en 8. Het weglaten van RA levert echter BEC's op met verlaagde TEER12,13,14.
- Smeer celkweekplaten en membraaninzetstukken (bijv. Transwell) in met collageen IV en fibronectine (dag 7), voor zuivering van de BEC's en volgende experimenten.
- Combineer voor het coaten van membraaninzetstukken 4 delen collageen IV (1 mg/ml in 0,5 mg/ml azijnzuur), 1 deel fibronectine (1 mg/ml) en 5 delen steriel water van weefselkwaliteit. ECM-oplossing kan 1:5 worden verdund voor het coaten van celkweekplaten (d.w.z. 4 delen collageen IV, 1 deel fibronectine, 45 delen water). Incubeer gedurende een nacht met coatingoplossing bij 37 °C.
OPMERKING: Platen en membraaninzetstukken kunnen ook gedurende ten minste 4 uur voorafgaand aan de subcultuur op dezelfde dag van de zuiveringsstap worden gecoat.
- Zuiver BEC's door de gedifferentieerde cellen te subcultiëren op collageen IV en met fibronectine beklede platen of membraaninzetstukken (dag 8).
- Zuig het EC-medium op en voeg het enzymatische celdissociatiereagens toe (12 ml per T75). Incubeer bij 37 °C totdat 90% van de cellen uit de kolf is losgekomen.
OPMERKING: Celdissociatie kan tot 1 uur duren.
- Verwijder tijdens de incubatietijd de collageen IV/fibronectine-coatingoplossing van eerder voorbereide platen/inzetstukken en laat ze drogen in een steriele hoes. Het duurt ongeveer 20 minuten voordat de inzetstukken droog zijn.
- Zodra de cellen zijn losgekomen, spoelt u ze van de kolf met een pipet van 10 ml. Pipeteer op en neer om een eencellige suspensie te bereiken.
OPMERKING: Eencellige suspensie is belangrijk voor een betrouwbare celtelling en om vaste monolagen te verkrijgen.
- Verdun met ten minste een gelijk volume vers hESFM in een conische buis van 50 ml en tel de cellen met behulp van een hemocytometer.
- Pellet de cellen op 1.500 x g gedurende 10 min.
- Resuspendeer de cellen in het juiste volume vers bereide EC + bFGF + RA om een suspensie van 2 x 106 cellen/ml te verkrijgen voor het zaaien op membraaninzetstukken. Voeg 500 μl (1 x 106 cellen) toe aan een inzetstuk met 12 putjes en 1,5 ml EC + bFGF + RA-medium aan de onderkant. Voor het zaaien op platen met 24 en 48 putjes verdunt u de celsuspensie 1:2 en voegt u respectievelijk 500 μl (5 x 10 5 cellen) en 250 μl (2,5 x 105 cellen) per putje toe. Verdeel de cellen gelijkmatig over het putje/de insert (zie stap 2.2.4) en incubeer bij 37 °C onder 5% CO2.
- Vervang media op platen/transwells naar EC zonder bFGF of RA (dag 9).
- Voer infectie-experimenten, TEER-metingen en immunofluorescentiekleuring uit zoals beschreven in de volgende secties (dag 10).
OPMERKING: Succesvol gedifferentieerde en gezuiverde BEC's bereiken doorgaans de piek TEER op dag 10 en brengen karakteristieke markers tot expressie van endotheelcellen in de hersenen, zoals PECAM-1 (CD31) en VE-cadherine, de glucosetransporter GLUT-1, effluxtransporters zoals p-glycoproteïne en tight junction-componenten ZO-1, Occludine en Claudin-5 13,14,16,17,19,22 . Raadpleeg Lippmann et al., Stebbins et al. en anderen voor meer details en afbeeldingen van de celtypen, morfologieën en expressie van celtypespecifieke markers tijdens het differentiatieproces 13,14,15,16,17,19,22. Representatieve beelden van de IMR90-4-cellen in verschillende stadia van het BEC-differentiatieproces zijn te vinden in aanvullende figuur 1.
4. Transendotheliale elektrische weerstand (TEER) als maat voor de dichtheid van de barrière
OPMERKING: TEER wordt meestal afgelezen op membraaninzetstukken op dag 9 en 10 van differentiatie om het succesvol genereren van barrièrevormende iPSC-BEC's te bevestigen (Figuur 1A).
- Plaats de epitheliale volt-ohmmeter (EVOM) in de steriele omgeving van een bioveiligheidskap en sluit de elektrode aan op de EVOM.
- Desinfecteer de elektrode door deze gedurende ten minste 5 minuten onder te dompelen in 70% EtOH en volledig te laten drogen.
OPMERKING: Langere incubatie in 70% EtOH of decontaminatie van de elektrode met 5% hypochlorietoplossing is mogelijk indien nodig.
- Haal de iPSC-BEC's op membraaninzetstukken uit de incubator en meet TEER.
NOTITIE: Het is belangrijk om TEER snel af te lezen nadat u uit de incubator bent gehaald, aangezien temperatuurveranderingen van invloed kunnen zijn op de TEER-meting.
- Lees TEER af door de elektrode in het medium te dompelen, zodat de kortere elektrode bovenop het inzetstuk wordt geplaatst en de langere elektrode in het medium rond het inzetstuk reikt.
NOTITIE: Zorg ervoor dat de elektroden aan de uiteinden van de "eetstokjes" volledig bedekt zijn met vloeistof. Kantel indien nodig de put om dit te bereiken voordat u de plaat weer neerzet om te meten.
5. Immunofluorescentie (IF)-kleuring om het BEC-fenotype te valideren
OPMERKING: Om de kwaliteit van de volledig gedifferentieerde en gezuiverde cellen te valideren, worden iPSC-BEC-monolagen gekleurd voor de karakteristieke markers van endotheelcellen in de hersenen op dag 10 van het differentiatieproces zoals eerder beschreven (Figuur 1B\u2012G) 13,14,15,16,17,19,22.
- Zuig het medium op en was 1x met PBS.
- Fixeer de cellen met ijskoude methanol gedurende 15 minuten bij kamertemperatuur (RT).
- 3x wassen met fosfaatgebufferde zoutoplossing (PBS) en 1 uur blokkeren met 10% foetaal runderserum (FBS) in PBS bij RT.
- Aspireer en voeg primaire antilichamen toe die zijn verdund in een blokkerende oplossing. Incubeer gedurende een nacht bij 4 °C.
OPMERKING: Raadpleeg de tabel met materialen en Stebbins et al. voor informatie met betrekking tot de bron en verdunning van de antilichamen22.
- Was 3x met PBS voordat u secundair antilichaam verdund in blokkerende oplossing toevoegt. Incubeer bij RT gedurende 1 uur. Bescherm monsters vanaf dit punt tegen licht.
- 2x wassen met PBS. Voeg vervolgens DAPI toe in een verdunning van 1:5.000 in PBS en kleur gedurende 15 minuten bij RT.
- Was 1x terwijl u de PBS aan laat en foto's maakt met een fluorescentiemicroscoop.
6. Bereiding van bacteriën en infectie van iPSC-BEC's
- Start op de dag voor het infectie-experiment (dag 9 van de differentiatie) een nachtelijke kweek van de bacteriën uit bevroren bouillon. Voor infectie met Nm, streep bacteriën op Columbia-agar met 5% schapenbloed (bloedagar). Incubeer bacterieculturen bij 37 °C en 5% CO2 's nachts.
- Bereid de volgende dag (dag 10) verse PPM+ door Protease pepton media (PPM) aan te vullen met 50 μL 2 M MgCl 2, 50 μL2 M NaHCO3 en 100 μL Kellogg's supplement per 10 ml. Inoculeer 10 ml PPM+ medium in een conische buis van 50 ml met Nm van de nachtelijke kweekplaat met behulp van een steriel wattenstaafje. Incubeer schudden bij 200 tpm bij 37 °C gedurende 1,5 uur (d.w.z. totdat de bacteriën zich in de logaritmische groeifase bevinden).
- Bereid tijdens de bacteriële incubatie iPSC-BEC's in een plaat met 24 putjes of op membraaninzetstukken voor infectie door het oude medium te vervangen door 400 μL vers EC-medium (zonder bFGF of RA) per putje/bovenkant van het membraaninzetstuk.
- Centrifugeer de bacteriecultuur bij 4000 x g gedurende 10 minuten en zuig de media op. Resuspendeer de bacteriekorrel in 250 μL PBS.
- Gebruik in 4 ml verse PBS een deel van de bacteriële celsuspensie en pas deze aan tot een OD600 van 0,4 (ongeveer 1 x 108 CFU/ml).
- Verdun vervolgens de bacteriën in celkweekmedium (EC-medium) volgens de gewenste multipliciteit van infectie (MOI).
OPMERKING: Bijvoorbeeld, voor een MOI van 10, verdun 1:10 of 1:5 bij het infecteren van iPSC-BEC's in respectievelijk een plaat met 24 putjes of op membraaninzetstukken (1 x 105 cellen per monolaag in een plaat met 24 putjes). Toevoeging van humaan serum is niet opgenomen in de bereiding van Nm voor infectie, zoals beschreven in andere manuscripten, omdat werd waargenomen dat het een schadelijk effect had op het iPSC-BEC-barrièrefenotype zoals gemeten met TEER (gegevens niet getoond)30,31. De interactie van Nm en iPSC-BEC's wordt echter niet beïnvloed met of zonder humaan serum (gegevens niet getoond).
- Infecteer iPSC-BEC's in elk putje met 100 μL van de bereide bacteriesuspensie en incubeer gedurende de gewenste infectieduur.
OPMERKING: De expressie van een aantal pro-inflammatoire cytokines en chemokinen is verhoogd in iPSC-BEC's bij infectie met Nm, het meest prominent na 8 uur infectie, zoals eerder beschreven door Martins-Gomes et al (Figuur 2)19.
7. Aangeboren immuunactivatie door kwantitatieve PCR
OPMERKING: Gebruik een voorkeurs-RNA-isolatie, cDNA-synthese en qPCR-protocol, verzamel monsters en voer qPCR uit op geselecteerde cytokines.
- 7.1. Verzamel het RNA uit BEC-monsters na infectie op dag 10 van het differentiatieprotocol, met behulp van reagentia uit een in de handel verkrijgbare RNA-isolatiekit (zie de materiaaltabel).
OPMERKING: Voorkom nucleasebesmetting van monsters door voorzichtig te werken in een gereinigde en gesteriliseerde omgeving.- Bereid lysisbuffer voor en voeg 350 μL toe aan elk putje/monolaag van iPSC-BEC's.
- Verzamel de monsters door meerdere keren op en neer te pipetteren (bijv. 20x) en de suspensie over te brengen naar een steriele microcentrifugebuis.
OPMERKING: Monsters kunnen worden bewaard bij -80 °C totdat ze klaar zijn voor RNA-isolatie.
- Volg het protocol dat bij de RNA-isolatiekit wordt geleverd voor RNA-zuivering uit gekweekte cellen en weefsels.
- Bewaar RNA-monsters na elutie in nucleasevrij water op ijs om mogelijke RNase-activiteit te minimaliseren.
- Schat RNA-concentraties op een spectrofotometer (bijv. Nanodrop).
- Genereer een cDNA-bibliotheek van het verzamelde RNA met behulp van een cDNA-synthesekit (zie Tabel met materialen).
- Stel reacties op die bestaan uit cDNA-synthesemastermix, ten minste 200 ng (idealiter 500 ng) monster-RNA en nucleasevrij water in een bepaald totaal reactievolume zoals beschreven in het protocol van de cDNA-synthesekit.
- Voer op een standaard thermocycler een programma uit dat geschikt is voor de gebruikte reagentia van de gebruikte cDNA-synthesekit. Bijvoorbeeld: 25 °C gedurende 2 min, 55 °C gedurende 10 min, 95 °C gedurende 1 min.
- Verdun het cDNA na synthese tot 1:10 in nucleasevrij water en verplaats de monsters naar 4 °C voor korte termijn of -20 °C voor langdurige opslag.
OPMERKING: Een lagere verdunning kan nodig zijn als de RNA-concentratie laag was (bijv. minder dan 50 ng). Het verdunde cDNA kan tot een jaar lang bij -20 °C worden bewaard.
- Voer qPCR uit op de cDNA-monsters gericht op transcripten van aangeboren immuunresponsgenen zoals cytokines en chemokinen met zorgvuldig ontworpen en gevalideerde primers.
OPMERKING: Aangezien het ontwerp van de primer erg belangrijk is voor de kwaliteit van de qPCR-resultaten, moet de efficiëntie van de primer worden getest door middel van een verdunningsreeks en moet de afwezigheid van meerdere producten worden bevestigd op een DNA-gel.- Gebruik per reactie van 25 μL 0,5 μL voorwaartse en 0,5 μL omgekeerde primer (10 mM in nucleasevrij water), 1 μL cDNA, 10,5 μL nucleasevrije H2O en 12,5 μL qPCR mastermix.
- Voer de reactie uit op een qPCR-machine met behulp van het volgende cyclerprotocol: (a) 4 °C gedurende 2 min; b) 95 °C gedurende 15 min; c) 95 °C gedurende 15 s; d) 60 °C gedurende 1 min; 45 keer door (c) en (d) te fietsen; e) facultatieve smeltcurve: 30-99 °C in stappen van 1 °C; 25 °C gedurende 5 min.
- Gebruik voor gegevensanalyse de ΔΔCT-berekening om de expressieniveaus van cytokines en chemokine te vergelijken met een referentie-huishoudgen, zoals 18S of GAPDH.