$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Kortom, de directe conversie is een snelle en eenvoudige methode om geïnduceerde neuronale voorlopercellen te genereren uit huidfibblasten van patiënten. Deze methode is voordelig vanwege de snelheid en het grote aantal gegenereerde cellen die gemakkelijk te onderhouden zijn. Bovendien suggereert toenemend bewijs dat directe herprogrammeringsmethoden minder epigenetische tekens verwijderen in vergelijking met klassieke iPSC-herprogrammeringstechnologie, waardoor het ziektemilieu intacter blijft4,7,8. De differentiatie van iNPC 's ten nadep aan astrocyten is zeer eenvoudig en zeer reproduceerbaar , zelfs tussen meerdere onafhankelijke laboratoria19,29,33. iNPC's kunnen in kleine porties worden ingevroren en direct worden ontdooid voor differentiatiedoeleinden, wat helpt de variatie tussen experimenten te verminderen, omdat passagenummers vergelijkbaar kunnen worden gehouden. Astrocyten spelen een cruciale rol in de progressie van ziekten bij veel neurologische ziekten en zijn daarom een interessant celtype om mee te werken. De astrocyten kunnen worden gebruikt voor mechanistische studies, metabolische studies of drug testen assays en worden meestal gekweekt als monolagen. Bovendien kunnen astrocyten worden gecombineerd in co-kweeksystemen met muis- of menselijke neuronen om de impact van astrocyten op neuronale overleving en morfologie te beoordelen, die beide goede uitlezingen zijn voor het testen van geneesmiddelen34.
Om dit protocol met succes te kunnen gebruiken, moeten een paar punten en mogelijke beperkingen in gedachten worden gehouden. De menselijke huidfibroblasten variëren bijvoorbeeld sterk in hun celdelingssnelheid en reactie op virale vectoren. Omdat dit geen gestandaardiseerde cellijnen zijn, zijn ze net zo variabel als de mensheid zelf, elke lijn is anders. Zoals voor veel herprogrammeringsmethoden, is het gemakkelijker om fibroblasten te herprogrammeren die een matige tot snelle celdelingssnelheid hebben ten opzichte van cellen die nauwelijks repliceren. De replicatiesnelheid kan worden beïnvloed door de kwaliteit van de huidbiopsie en de verwerking zelf, door het passagenummer van de fibroblasten en de behandeling. Bij het werken met primaire huidfibroblasten is het belangrijk om de cellen niet te dicht te laten worden om inductie van senescentie te voorkomen. Als de fibroblasten niet goed groeien, is het het beste om een nieuw bestand of een lagere passage te proberen, hoewel in sommige gevallen de ziekte zelf ook een rol kan spelen. Celdeling kan soms worden verbeterd door 15% of 20% FBS in de fibroblastmedia te gebruiken in vergelijking met de standaard 10%.
De kwaliteit van de herprogrammering van virale vectoren is van groot belang voor succes. In onze handen waren retrovirale vectoren efficiënter in vergelijking met lentivirale vectoren of andere niet-integrerende virussen; dit kan echter afhankelijk zijn van de virale vectorkwaliteit en zuiverheid. Commerciële retrovirale vectorkits specificeren meestal de virale vectorconcentratie en vaak ook een veelheid aan infecties voor een bepaalde cellijn. Het is belangrijk om in gedachten te houden dat primaire fibroblasten verschillen van de cellijn die door de bedrijven wordt gebruikt om de virale vectoropname te bepalen. Bovendien is, zelfs bij het bestellen van dezelfde commerciële kit, variatie tussen batches gebruikelijk. Bovendien varieert de opname van virale vectoren ook tussen fibroblastcellijnen. Sommige lijnen kunnen gevoeliger zijn en daarom kunnen getransduceerde cellen afsterven, terwijl andere cellijnen mogelijk beter bestand zijn tegen virale opname. Het bepalen van de transductie-efficiëntie voor een bepaalde cellijn kan dus belangrijk zijn, vooral als de cellijn langzaam groeit of eerdere conversiepogingen zijn mislukt. In onze handen is de beste manier om te evalueren hoeveel van een specifieke retrovirale vector nodig is voor conversie, het uitvoeren van een immunofluorescente kleuring met verschillende verdunningen van de virale vector. Het aantal cellen dat het transgene voor elke vector uitdrukt, kan vervolgens worden geteld, met als doel een transductie-efficiëntie van 70% of hoger. Onze ervaring is dat vergelijkbare MOIs voor de meeste cellijnen kunnen worden gebruikt, maar de MOI kan indien nodig worden aangepast.
Tijdens het conversieproces is het van cruciaal belang om de cellen niet te vroeg te splitsen. De tijd tot de cellen klaar zijn om te worden gesplitst, hangt af van meerdere factoren, waaronder de primaire cellijn en de kenmerken ervan, de kwaliteit van de gebruikte virale vector en de mediakwaliteit. Belangrijk is dat het slagingspercentage van de conversie veel hoger is wanneer de cellen op hoge dichtheid worden gehouden. Zelfs als de cellen de morfologie beginnen te veranderen, is het beter om de cellen in de eerste put langer te laten dan ze voortijdig te splitsen. Als de splitsing te vroeg plaatsvindt, kan de conversie stoppen in de voortgang en de cellen ertoe brengen om terug te differentiëren naar fibroblastachtige vorm en gedrag. Bovendien kan het te vroeg verdunnen ervan resulteren in meer langwerpige cellichamen in vergelijking met de kleine en compacte cellichamen van de EERDER waargenomen NPC's. De eerste splitsingen moeten dus altijd conservatief zijn; het is beter om de cellen te dicht te houden met een 1:1 of 1:2 split in vergelijking met het te veel verdunnen. Enige celdood wordt verwacht na de eerste splitsing. Let op, de cellen zien er altijd slechter (vlakker) uit de eerste dag na het splitsen, wat normaal is. De beste oordelen over de celvorm moeten 2-3 dagen later worden gemaakt. Belangrijk is dat ook de kwaliteit van de groeifactoren en mediacomponenten cruciaal is. Het is belangrijk om kleine hoeveelheden media met groeifactoren voor te bereiden, zodat de volledig voorbereide media maximaal 5-7 dagen worden gebruikt. Bewaar het medium niet langer op kamertemperatuur of 37°C. Snel gebruiken en in de koelkast bewaren zodra de mediawissel is uitgevoerd. Bovendien kan het laag houden van het mediavolume bij 1 ml in plaats van 2 ml helpen, vooral voor cellijnen die beter bestand zijn tegen conversie. Als de cellen de media snel consumeren, wat kan worden waargenomen door een verandering in mediakleur van rood naar geel (verzuringssnelheid), past u het volume van de media aan tot 2 ml. Snelle mediaconsumptie is een positief teken en wordt vaak waargenomen in latere stadia van conversie naast een toegenomen proliferatie.
NPC's zijn ook erg gevoelig voor de aanwezigheid van accutase in de media en het is erg belangrijk om de incubatietijd van de accutase kort te houden. We raden een incubatietijd van 2-4 minuten aan, controleer cellen vaak onder de microscoop om te zien wanneer ze zijn losgeraakt. Het is essentieel om de cellen na het splitsen te centrifugeren om de enzymmix uit de media te verwijderen. Het is ook belangrijk om het passagenummer in gedachten te houden, omdat cellijnen kunnen veranderen bij uitgebreide cultivering, wat leidt tot wijziging van expressieprofielen. Het is dus belangrijk om veel celvoorraden in vroege passages te bevriezen. Cellen moeten worden ingevroren in 10% DMSO en 90% NPC-media en op lange termijn worden opgeslagen in vloeibare stikstof. Vanwege het gebrek aan serum in dit medium is het van cruciaal belang om te zorgen voor een langzame bevriezing met behulp van vrieskamers en eenmaal 's nachts bevroren, onmiddellijk over te brengen naar vloeibare stikstof. Hoewel er in dit protocol geen klonale selectie wordt uitgevoerd, is het mogelijk dat uitgebreide cultivering en passaging leidt tot natuurlijke selectie van een initiële celpopulatie met gunstige groei en overlevingskans. Daarom is het belangrijk om het passagenummer en de behandeling in gedachten te houden bij het uitvoeren van experimenten. We geven er de voorkeur aan om lagere passages te gebruiken voor experimenten, indien mogelijk overschrijden we de doorlaatlijn van de cellijnen niet meer dan 20 keer. Omdat NPC's snel groeien, kunnen grote aantallen voorraden worden bevroren bij lagere passages voor experimenten. Cellijnen met bijzonder hoge groeisnelheden lopen een hoger risico op mediaverzuring. Naarmate cellijnen met verschillende snelheid groeien, moet de hoeveelheid media mogelijk worden aangepast op basis van proliferatie. Als de cellen continu in sterk verzuurde media worden achtergelaten, kan dit de gezondheid van zowel controle- als ziektecellijnen beïnvloeden. Dit zorgt ervoor dat zelfs gezonde astrocyten reactief worden, wat het gebruik ervan in verdere differentiatie en experimenten beïnvloedt.
Voor astrocytdifferentiatie is het belangrijk om de cellen op een lage dichtheid te houden, omdat een hoge dichtheid voorkomt dat de cellen differentiëren en ze zich met hogere snelheden blijven verspreiden. De zaaidichtheid moet dus worden aangepast voor elke cellijn, afhankelijk van hun proliferatiesnelheid. We raden aan om verschillende zaaidichtheden te proberen en kleuringen / RT-PCR uit te voeren met astrocytmarkers om een goede differentiatie te garanderen. De kwaliteit van de IAs kan worden beoordeeld naast gezonde controles met behulp van co-cultuurtesten met neuronen. Op voorwaarde dat ziektepathologie niet leidt tot een reactief fenotype, moeten neuronen gedurende meerdere dagen levensvatbaar blijven in contact met IA's. Astrocytmorfologie kan sterk variëren tussen individuele cellijnen en kan ook worden beïnvloed door het ziektefenotype. Bovendien kunnen ze bij ziekten waarbij astrocyten zwaar worden beïnvloed, een reactief fenotype vertonen met grote, langwerpige extensies.