$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
De hier beschreven testen zijn waardevol voor het bestuderen van de mate van internalisatie en de intracellulaire overleving van S. aureus in NPPCs, evenals de intracellulaire werkzaamheid van antimicrobiële verbindingen6,15,16. Sommige stappen in beide testprotocollen kunnen van cruciaal belang zijn. De gezondheidstoestand en de dichtheid van de cellen moeten perfect worden gecontroleerd en consistent zijn tussen onafhankelijke experimenten. Het bacteriële entmateriaal moet zorgvuldig worden gestandaardiseerd om een echte MOI te verkrijgen die dicht bij de beoogde theoretische MOI ligt. Over het algemeen moet ervoor worden gezorgd dat geen van de cellen wordt losgemaakt tijdens het pipetteren. De wasbeurten om lysostaphin en antibiotica te verwijderen zijn kritieke stappen in de EPA. Het gebruik van proteïnase K blijkt deze stap te verbeteren wanneer er geen antibioticum wordt gebruikt (zie hieronder). Last but not least moeten de cellen volledig worden losgemaakt in elke put en grondig worden gehomogeniseerd na de incubatie met de lysisbuffer om de intracellulaire belasting van S. aureus betrouwbaar te kwantificeren.
In sommige gevallen kunnen er problemen optreden en moeten eerst verschillende punten worden gecontroleerd. In geval van een gebrek aan reproduceerbaarheid moet er rekening mee worden gehouden dat S. aureus klonten kan vormen, waardoor kwantificering door absorptie onnauwkeurig wordt. Het klonteren van bacteriën kan worden verhoogd door centrifugerings- en wasstappen als het kweekmedium moet worden vervangen (bijvoorbeeld voor het elimineren van een uitgescheiden eiwit). De bacteriële suspensie moet snel worden gebruikt omdat bacteriën bij kamertemperatuur blijven groeien. De werkzaamheid van lysostapine kan afnemen als gevolg van onjuiste opslagomstandigheden, suboptimale pH voor enzymactiviteit in de kweekmedia, variabiliteit in de enzymatische activiteit tussen batches en providers en gebrek aan lysostapinegevoeligheid van sommige stammen in specifieke groeiomstandigheden. Fenolrood kan een licht bacteriostatisch effect hebben, vooral wanneer het kweekmedium relatief arm is aan voedingsstoffen in vergelijking met de typische bouillons die worden gebruikt voor het kweken van bacteriën. Het is dus raadzaam om een celkweekmedium zonder fenolrood te gebruiken, dat ook de microscopische waarnemingen van fluorescentie verbetert door het achtergrondgeluid te verminderen.
Hoewel deze methode een waardevol hulpmiddel is om het intracellulaire lot van verschillende stammen te bestuderen, moeten enkele grenzen van de methode worden overwogen. Het gebruik van een zeer hoge MOI kan het vermogen van internalisatie door NPPCs overbelasten en de verschillen tussen de verschillende geteste stammen nivelleren. De mate van internalisatie van de meest cytotoxische stammen kan worden onderschat omdat lysostaphin (of antibiotica) snel S. aureus vernietigt die wordt vrijgegeven door beschadigde cellen. Experimenten met langere duur (d.w.z. om intracellulaire overleving of intracellulaire activiteit van antibiotica te bestuderen) zijn dus gemakkelijker op te zetten met stammen met een lage cytotoxiciteit. Daarom moeten de incubatietijd en de MOI nauwkeurig worden aangepast aan de stamvirulentie, het celtype en het experimentele doel.
De hier beschreven methode met het gebruik van lysostaphin is betrouwbaarder dan die op basis van gentamicine omdat, in tegenstelling tot lysostaphin, gentamicine de neiging heeft om te worden geïnternaliseerd door gastheercellen13. Het andere voordeel is de mogelijkheid om de lysostaphin te inactiveren. Remming van de lysostapine-activiteit werd gemeld door Kim et al.13 met het gebruik van EDTA om zinkionen of 1,10-fenanthroline te cheleren; er zijn echter nog steeds intensieve wasbeurten nodig om het enzym te verwijderen voordat de bacteriën worden platgelegd. Hier maakt proteïnase K een snelle inactivatie van lysostaphin mogelijk. We zagen dat cellen de neiging hebben om los te komen van de kweekplaat wanneer ze zwaar geïnfecteerd raken vanwege de vermenigvuldiging van intracellulaire S. aureus. Door de laatste wasstap over te slaan, vereenvoudigde de iEPA-methode de technische behandeling aanzienlijk en maakte het herstel van de geïnternaliseerde bacteriën in losjes hechtende of reeds loszittende cellen mogelijk.
De meer geconcentreerde reagentia en buffers die in iEPA worden gebruikt, hielpen ook de pipetteerinspanning te verminderen en het verlies van cellen te minimaliseren. Bovendien kan iEPA worden gebruikt met cellen in suspensie, evenals met organoïden die moeilijk te wassen zijn. Kortom, enzymbeschermingstests maken de studie mogelijk van de mate van internalisatie en het intracellulaire lot van S. aureus, evenals de intracellulaire activiteit van antimicrobiële geneesmiddelen met verschillende in vitro modellen. Er moeten verbeteringen worden aangebracht om de relatie tussen internalisatie en cytotoxiciteit beter te karakteriseren om het belang van het ontwikkelen van geneesmiddelen die S. aureus in de cel kunnen bereiken, beter te begrijpen.