Hier wordt een nieuwe methode voorgesteld om de dynamiek en omzet van het mitochondriale systeem in een gekweekte astrocyt longitudinaal te volgen. In tegenstelling tot een time-lapse-benadering op een vaste groep cellen of één individuele cel tegelijk (meestal gebruikt in de literatuur)24,25, kunnen onderzoekers de evolutie van het mitochondriale systeem gedurende meerdere dagen op dezelfde individuele cellen volgen. In tegenstelling tot single well live imaging waar hoge niveaus van blootstelling aan licht vereist zijn, en de selectie van veel individuele cellen minder haalbaar is, maakt de voorgestelde methode gebruik van het vermogen van deze microscoop om verschillende cellen in verschillende gebieden van een put in beeld te brengen en terug te keren naar diezelfde cellen op verschillende tijdstippen om ze opnieuw in beeld te brengen. Dankzij normalisatie van een basislijn die wordt uitgevoerd voor elk gemeten criterium op elke cel van belang, houdt het rekening met de complexiteit van het mitochondriale systeem en onderzoekt het het effect van de behandeling op elke cel ten opzichte van zijn eigen basisbeeld. Het vermogen van de microscoop om dit type beeldvorming autonoom uit te voeren op maximaal 16 putten tegelijk (beeldvorming van 5 cellen per put) maakt het mogelijk om tijdens de analyse goed rekening te houden met de heterogeniteit van het mitochondriale systeem zonder de experimentele variabiliteit die gepaard gaat met beeldvorming van verschillende omstandigheden op verschillende dagen.
De kwaliteit van de culturen, de niveaus van virale infecties die de LV-G1-MitoTimer biosensor tot expressie brengen, het type microscoop en doelstellingen, en de selectie van geschikte cellen zijn kritieke variabelen die zo consistent mogelijk moeten blijven in dit protocol. De celdichtheden, het type vector en de virale titers kunnen worden aangepast aan de vraag. Hoewel eerder werk aantoont dat LV-G1-MitoTimer-expressie geen schadelijke gevolgen heeft voor de mitochondriale functie en dynamiek21,22,26,27, is het essentieel om te verifiëren dat de concentratie niet giftig is voor de cellen (bijvoorbeeld het controleren van het totale aantal cellen dat goed onder controle is). Als een enkel brandpuntsvlak wordt gebruikt, moeten astrocyten: (1) zo plat mogelijk zijn, (2) geïsoleerd van andere gelabelde cellen (om de analyse te vereenvoudigen in geval van verplaatsing in de schotel) en (3) hoge fluorescentieniveaus bezitten. Omdat cellen in cultuur zeer variabel kunnen zijn in morfologie, kan het mitochondriale systeem zeer heterogeen zijn. In deze context compenseert het analyseren van ROI's (en niet de hele cel) voor sommige problematische regio's, zoals de perinucleaire regio's, en vermindert de variabiliteit. Het is essentieel om de basislijn op relatief vergelijkbare cellen te doen en zoveel mogelijk cellen te bemonsteren. Daarom zijn high content acquisitie- en analysemicroscopen bij uitstek geschikt. Tijdens deze longitudinale monitoring is het ook belangrijk om de cellen niet te veel te belichten aan licht om biosensorbleking te voorkomen.
Deze beeldvormingsmethode is niet zonder complexiteit en in het hele protocol zijn verschillende opmerkingen opgenomen, die rekening houden met het oplossen van problemen tijdens eerdere tests met de microscoop. De keuze van de gebruikte plaatcoating hangt bijvoorbeeld af van de beoogde test, maar aanbevelingen voor de meest geschikte keuzes voor primaire astrocytenculturen zijn opgenomen. Bovendien moet beeldacquisitie worden uitgevoerd op ten minste 5 cellen per aandoening vanwege intercellulaire variabiliteit. Meer specifiek zullen sommige cellen die bij baseline imaging zijn geselecteerd, sterven, sommige zullen uit het kader van het toegewezen beeldacquisitiegebied bewegen en sommige zullen hun morfologie veranderen, waardoor de mitochondriën zeer moeilijk te individualiseren zijn in analyse. Het in beeld brengen van veel cellen vanaf het begin verhoogt de kans op een voldoende grote steekproefgrootte van cellen om aan het einde van het experiment te analyseren. Naast de meer complexe aspecten van deze beeldvormingstechniek, zijn er enkele regelrechte beperkingen voor wie baat kan hebben bij dit type beeldvorming en analyse. Om ten volle te profiteren van de automatisering van beeldacquisitie, moet de gebruikte microscoop een autofocussysteem hebben dat de snelheid van tijdsintervallen tussen afbeeldingen aankan (d.w.z. elke 3 s in dit protocol) en zich consequent kan concentreren op de cel in kwestie voordat elke afbeelding wordt gemaakt. Bovendien, zonder de JOBS-software, die het hele beeldacquisitieproces automatiseert, wordt deze methode moeilijk en mogelijk onmogelijk, afhankelijk van het aantal cellen dat wordt afgebeeld, omdat het nodig zou zijn om elke cel handmatig opnieuw te vinden en in beeld te brengen op het juiste moment. Ten slotte is deze beeldvormingsmethode niet immuun voor het probleem van fotobleaching. Om deze reden is het, zoals bij elke langetermijnacquisitiemethode, belangrijk om fluorescerende markers te kiezen die minder gevoelig zijn voor fotobleaching en om beeldacquisitie op maat te maken om dit probleem zoveel mogelijk te voorkomen.
Deze techniek verschilt op een cruciale manier van andere die momenteel worden gebruikt. In tegenstelling tot andere time-lapse studies, vereist deze techniek niet de hele tijd beeldvorming op dezelfde positie in de put, noch vereist het handmatige beweging van de plaat om andere gebieden in beeld te brengen. Dit stelt onderzoekers in staat om veel cellen in vele omstandigheden in één tijdsbestek van 24 uur in beeld te brengen. Bijgevolg geeft de mogelijkheid om deze beeldvorming en analyse uit te voeren op veel cellen in elke put dezelfde populatie-informatie die men zou verkrijgen door een grote groep cellen in grote lijnen te bestuderen, terwijl bovendien specifieke maatregelen van elke afgebeelde cel worden verstrekt. Hoewel sommige specifieke kenmerken van deze methode mogelijk niet van toepassing zijn op andere beeldacquisitiemethoden (hierboven beschreven), wegen de voordelen op tegen de complicaties met het type analyse dat mogelijk is na acquisitie. Met deze techniek kunnen onderzoekers de exacte vertakkingen van verschillende behandelingen op het mitochondriale systeem en bijgevolg op de gekweekte astrocyten zien.
Bovendien is deze methode zeer aanpasbaar aan veel verschillende wetenschappelijke vragen met betrekking tot mitochondriaal gedrag en rollen in specifieke contexten. Hier gaat het geschetste protocol specifiek over gekweekte astrocyten. Er kunnen echter veel andere celtypen worden gebruikt en de behandelingen die kunnen worden getest, worden alleen beperkt door de vragen die worden onderzocht. Dit type beeldvorming heeft het potentieel om de collectieve kennis en het begrip van mitochondriaal gedrag, de onderliggende mechanismen die leiden tot mitochondriale disfunctie en de effecten van vele pathologieën op de aangeboren dynamiek in verschillende soorten cellen te bevorderen.