Methodenartikel

Pyrosequencing: een eenvoudige methode voor Nauwkeurige Genotyping

28.9K weergaven

DOI:

10.3791/630

8 januari 2008

In dit artikel

Samenvatting

Pyrosequencing (R) is een van de meest grondige toch eenvoudige methoden tot op heden gebruikt om de polymorfismen te analyseren. Deze methode heeft geleid tot een snelle en efficiënte single-nucleotide polymorfisme evaluatie met inbegrip van vele klinisch relevante polymorfismen. De techniek en de methodologie van Pyrosequencing wordt uitgelegd.

Samenvatting

Farmacogenetische onderzoek voordelen eerste hand van de overvloed aan informatie die door de voltooiing van het Human Genome Project. Met zo'n enorme hoeveelheid gegevens die beschikbaar komt een explosie van genotypering methoden. Pyrosequencing (R) is een van de meest grondige toch eenvoudige methoden tot op heden gebruikt om de polymorfismen te analyseren. Het heeft ook de mogelijkheid om tri-allelische, indels, korte-repeat polymorfismen, te identificeren, samen met het bepalen van allel percentages voor de methylering of samengevoegd monster beoordeling. Daarnaast is er een gestandaardiseerde controle volgorde die interne kwaliteitscontrole biedt. Deze methode heeft geleid tot een snelle en efficiënte single-nucleotide polymorfisme evaluatie met inbegrip van vele klinisch relevante polymorfismen. De techniek en de methodologie van Pyrosequencing wordt uitgelegd.

Protocol

De volledige tekst protocol voor deze experimentele aanpak is beschikbaar in Springer Protocols .

Openbaarmakingen

De auteurs hebben niets te melden.

Herprints en machtigingen

Tags

SNP-analysegenotyperingsmethodeDNA-methyleringallelkwantificeringPCR-voorbereidinggebiotineerde primerinterne primernucleotide-doseringlichtdetectie