Pseudogetypeerde virussen (PV's) zijn moleculaire hulpmiddelen die in de microbiologie worden gebruikt om interacties tussen gastheer en virus en pathogeen-pathogeen te bestuderen 1,2,3,4. PV's bestaan uit een binnenste deel, de virale kern die het virale genoom beschermt, en een buitenste deel, de envelopglycoproteïnen op het oppervlak van het virus dat het tropisme definieert5. Een pseudovirus is replicatie-incompetent in de doelcel omdat het niet alle genetische informatie bevat om nieuwe virusdeeltjes te genereren. Deze combinatie van bijzondere eigenschappen maakt PV's tot een veilig alternatief voor een wildtype virus. Wildtype virussen daarentegen zijn zeer pathogeen en kunnen niet worden gebruikt in BSL 2-laboratoria voor analyse6.
De besmettelijkheid van PV's kan worden gecontroleerd door een reporter-gen, dat meestal codeert voor een fluorescerend eiwit (GFP, RFP, YFP) of een enzym dat chemiluminescente producten produceert (luciferase). Dit zit in een van de plasmiden die worden gebruikt voor PV-productie en is opgenomen in het genoom van het pseudovirus7.
Er bestaan momenteel verschillende soorten PV-kernen, waaronder lentivirale deeltjes op basis van het HIV-1-genoom. Het grote voordeel van op HIV-1 gebaseerde PV's ten opzichte van andere platforms is hun intrinsieke integratieproces in het genoom van de doelcel8. Hoewel HIV-1 een zeer besmettelijk virus is en de veroorzaker van aids is, zijn deze lentivirale vectoren veilig te gebruiken vanwege de uitgebreide optimalisatiestappen door de jaren heen. Optimale veiligheidsomstandigheden werden bereikt met de introductie van lentivirale vectoren van de 2e generatie, waarin virale genen werden uitgeput zonder de transductiemogelijkheden te beïnvloeden9. De3e en 4egeneratie droegen bij aan de verhoogde veiligheid van de behandeling van lentivirale vectoren met de verdere splitsing van het virale genoom in afzonderlijke plasmiden10,11. De nieuwste generaties PV's worden over het algemeen gebruikt om lentivirale vectoren voor gentherapie te produceren.
PV's kunnen worden gebruikt om interacties tussen virussen en gastheercellen te bestuderen, zowel tijdens de productie- als de infectiefase. PV's worden vooral gebruikt in pseudovirusneutralisatietests (PVNA). PVNA's worden op grote schaal gevalideerd om het neutralisatiepotentieel van serum of plasma te beoordelen door zich te richten op het virale glycoproteïne op de PV-envelop12,13. Neutralisatieactiviteit, uitgedrukt als de remmende concentratie 50 (IC50), wordt gedefinieerd als de verdunning van serum/plasma die 50% van de toegang tot virale deeltjes blokkeert14. In dit protocol beschreven we de opzet van een PVNA om de antilichaamactiviteit tegen Severe Acute Respiratory Syndrome - Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) te testen in sera die zijn verzameld voor en na ontvangst van een boostervaccindosis.