Dit protocol biedt zowel kwalitatieve als kwantitatieve analyses van totale sideroforen, pyoverdine en pyochelin van Pseudomonas aeruginosa.
Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.
Methodenartikel
Dit protocol biedt zowel kwalitatieve als kwantitatieve analyses van totale sideroforen, pyoverdine en pyochelin van Pseudomonas aeruginosa.
Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) staat bekend om zijn productie van een breed scala aan virulentiefactoren om infecties in de gastheer tot stand te brengen. Een voorbeeld van zo'n mechanisme is het opruimen van ijzer door middel van de productie van sideroforen. P. aeruginosa produceert twee verschillende sideroforen: pyocheline, dat een lagere ijzerchelerende affiniteit heeft, en pyoverdine, dat een hogere ijzerchelaatvorming heeft. Dit rapport toont aan dat pyoverdine direct kan worden gekwantificeerd uit bacteriële supernatanten, terwijl pyochelin moet worden geëxtraheerd uit supernatanten voordat het kan worden gekwantificeerd.
De primaire methode voor het kwalitatief analyseren van de productie van siderofoor is de Chrome Azurol Sulfonate (CAS) agarplaattest. In deze test leidt het vrijkomen van CAS-kleurstof uit het Fe3+-Dye-complex tot een kleurverandering van blauw naar oranje, wat wijst op de productie van sideroforen. Voor de kwantificering van de totale sideroforen werden bacteriële supernatanten in gelijke verhoudingen gemengd met CAS-kleurstof in een microtiterplaat, gevolgd door spectrofotometrische analyse bij 630 nm. Pyoverdine werd direct gekwantificeerd uit het bacteriële supernatans door het in gelijke verhoudingen te mengen met 50 mM Tris-HCl, gevolgd door spectrofotometrische analyse. Een piek bij 380 nm bevestigde de aanwezigheid van pyoverdine. Wat Pyochelin betreft, was directe kwantificering van het bacteriële supernatans niet mogelijk, dus moest het eerst worden geëxtraheerd. Daaropvolgende spectrofotometrische analyse onthulde de aanwezigheid van pyocheline, met een piek bij 313 nm.
Organismen hebben ijzer nodig om verschillende vitale functies uit te voeren, zoals elektronentransport en DNA-replicatie1. Van Pseudomonas aeruginosa, een Gram-negatieve opportunistische ziekteverwekker, is bekend dat het een verscheidenheid aan virulentiefactoren bezit om infectie in de gastheer tot stand te brengen, waaronder siderofoor vorming2. Tijdens ijzerafbrekende omstandigheden geeft P. aeruginosa gespecialiseerde moleculen af, sideroforen genaamd, die ijzer uit de omgeving blussen. Sideroforen cheleren ijzer extracellulair en het resulterende ijzer-siderofoor complex wordt actief terug naar d....
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Alle bacteriële isolaten van P. aeruginosa zijn afkomstig van medische microbiologische laboratoria in Vadodara en Jaipur, India. Alle geselecteerde klinische isolaten werden behandeld in het Biosafety Cabinet (BSL2) en er werd de grootst mogelijke zorg besteed aan het hanteren van bacteriële isolaten tijdens de experimenten. De commerciële details van alle reagentia/oplossingen zijn te vinden in de materiaaltabel.
1. Bereiding van chroom-azurolsulfonaat (CAS)-kleurstof en agarmedia
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Vóór de kwantificering van sideroforen uit klinische isolaten werd een kwalitatieve screening van de productie van sideroforen uitgevoerd om de productie van sideroforen te garanderen. Kwalitatieve detectie van sideroforen uit klinische isolaten werd waargenomen door strepen van bacteriën op CAS-agarplaten. Drie klinische isolaten, namelijk MR1, TL7, J3, samen met PAO1 (de referentiestam), werden geselecteerd voor de studie. Alle drie de klinische isolaten en PAO1 lieten positieve resulta.......
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Dit protocol stelt onderzoekers in staat om de totale sideroforen en twee verschillende sideroforen van P. aeruginosa, namelijk pyoverdine en pyochelin, te kwantificeren uit het bacteriële celvrije supernatant. In de CAS-agarplatentest vormen CAS-kleurstof en Fe3+-ionen een complex. Wanneer bacteriën sideroforen produceren, doven ze Fe3+-ionen van het CAS-Fe3+-complex, wat leidt tot een kleurverandering rond de bacteriegroei. Deze verandering resulteert in een duidelijke oranje h.......
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
De auteurs hebben niets te onthullen.
Auteurs erkennen financiering van DBT - Biotechnology Teaching Program, DBT - BUILDER Program en FIST. MR bedankt fellowship ontvangen van SHODH. HP bedankt fellowship ontvangen van CSIR.
....Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| Agar Agar, Type I | HIMEDIA | GRM666 | |
| 8-Hydroxyquinoline | Loba Chemie | 4151 | |
| Casamino Acid | SRL Chemicals | 68806 | |
| Cetyltrimethyl Ammonium Bromide (CTAB) | HIMEDIA | RM4867-100G | |
| Chloroform | Merck | 1070242521 | |
| Chrome azurol sulfonate | HIMEDIA | RM336-10G | |
| Citric acid | Merck | 100241 | |
| Dextrose monohydrate | Merck | 108342 | |
| Dichloromethane | Merck | 107020 | |
| Ferric chloride hexahydrate | HIMEDIA | GRM6353 | |
| Glass Flasks | Borosil | 5100021 | |
| Glass Test-tubes | Borosil | 9820U05 | |
| Hydrochloric acid | SDFCL | 20125 | |
| King's medium B base | HIMEDIA | M1544-500G | |
| M9 Minimal Medium Salts | HIMEDIA | G013-500G | |
| Magnesium Sulphate | Qualigens | 10034 | |
| MultiskanGO UV Spectrophotometer | Thermo Scientific | 51119200 | |
| Peptone Type I, Bacteriological | HIMEDIA | RM667-500G | |
| PIPES free acid | MP Biomedicals | 190257 | |
| Potassium dihydrogen phosphate | Merck | 1048731000 | |
| Proteose peptone | HIMEDIA | RM005-500G | |
| Shimadzu UV-Vis Spectrophotometer | Shimadzu | 2072310058 | |
| Sigma Laborzentrifuge | Sigma-Aldrich | 3-18K | |
| Sodium chloride | Qualigens | 15915 |
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.