Fluorescentiemicroscopie (FM) kan worden gebruikt om de lokalisatie en distributie van het doeleiwit te verkrijgen. De context rond het doeleiwit gaat echter verloren, wat cruciaal is om het doeleiwit grondig te onderzoeken. Elektronenmicroscopie (EM) heeft de hoogste beeldresolutie en biedt verschillende subcellulaire details. Desalniettemin ontbreekt het EM aan doeletikettering. Door het fluorescentiebeeld dat door FM is gemaakt nauwkeurig samen te voegen met het grijze beeld dat door EM is verkregen, kunnen correlatieve licht- en elektronenmicroscopie (CLEM) de informatie combineren die wordt verkregen door deze twee beeldvormingsmodi 1,2,3,4.
CLEM is een afweging tussen fluorescentie en de ultrastructuur1. Vanwege de beperkingen van de huidige fluorescerende eiwitten en de traditionele EM-monstervoorbereidingsprocedures, met name het gebruik van osmisch zuur (OsO4) en hydrofobe harsen zoals Epon, brengt de ultrastructuur altijd fluorescentie5 in gevaar. OsO4 is een onmisbaar reagens bij de voorbereiding van EM-monsters, dat wordt gebruikt om het contrast van EM-beelden te verbeteren. Vergeleken met andere inbeddingsharsen is Epon superieur in ultrastructuurconservering en sectie-eigenschappen5. Er zijn echter geen fluorescerende eiwitten die het fluorescentiesignaal kunnen vasthouden na de behandeling van OsO4 en Epon inbedding6. Om de beperkingen van fluorescerende eiwitten te overwinnen, werd pre-embedding CLEM ontwikkeld, waarbij FM-beeldvorming wordt gedaan vóór de voorbereiding van EM-monsters6. Het nadeel van het vooraf inbedden van CLEM is echter de onnauwkeurige registratie tussen de FM- en de EM-beelden5.
Integendeel, de CLEM-methode na inbedding voert de FM-beeldvorming uit na de voorbereiding van het EM-monster, waarvan de registratienauwkeurigheid 6-7 nm 5,6 kan bereiken. Om de fluorescentie van fluorescerende eiwitten te behouden, zijn zeer lage concentraties OsO4 (0,001%)3 of de hogedruk bevroren (HPF) en vriessubstitutie (FS) EM-bereidingsmethoden 4,7 gebruikt ten koste van de aangetaste ultrastructuur of het contrast van het EM-beeld. De ontwikkeling van mEos4b bevordert de voortgang van CLEM na inbedding aanzienlijk, hoewel glycidylmethacrylaat wordt gebruikt als inbeddingshars5. Met de ontwikkeling van mEosEM, dat de OsO4-kleuring en Epon-inbedding kan overleven, werd voor het eerst Epon post-inbedding met superresolutie CLEM bereikt, waarbij de fluorescentie en ultrastructuur tegelijkertijd behoudenbleven 6. Na mEosEM zijn verschillende fluorescerende eiwitten ontwikkeld die de OsO4-kleuring en de Epon-inbedding kunnen overleven 8,9,10,11. Dit bevordert de ontwikkeling van CLEM enorm.
Er zijn drie belangrijke aspecten aan Epon na de inbedding van CLEM. De eerste is het fluorescerende eiwit, dat het fluorescerende signaal moet behouden na de voorbereiding van het EM-monster. Volgens onze ervaring is mScarlet superieur aan andere gerapporteerde fluorescerende eiwitten. De tweede is hoe je dezelfde cel kunt vinden die is afgebeeld door FM-beeldvorming in EM-beeldvorming. Om dit probleem op te lossen, verbeteren we de procedure voor deze stap, zodat men gemakkelijk de beoogde cel kan vinden. De laatste is de methode om het FM-beeld uit te lijnen met het EM-beeld. Hier beschrijven we de registratie tussen de FM- en de EM-beelden. In dit protocol brengen we mScarlet tot expressie in VGLUT2-neuronen en tonen we aan dat mScarlet zich kan richten op secundaire lysosomen met behulp van Epon post-embedding CLEM. We bieden stap-voor-stap details voor Epon post-embedding CLEM, zonder afbreuk te doen aan de fluorescentie en de ultrastructuur.