Dit protocol beschrijft de isolatie van endotheelcellen van muizen uit de hele alvleesklier.
Methodenartikel
Dit protocol beschrijft de isolatie van endotheelcellen van muizen uit de hele alvleesklier.
De alvleesklier is een vitaal orgaan voor het handhaven van het metabolische evenwicht in het lichaam, deels vanwege de productie van metabole hormonen zoals insuline en glucagon, evenals spijsverteringsenzymen. De alvleesklier is ook een sterk gevasculariseerd orgaan, een kenmerk dat wordt vergemakkelijkt door het ingewikkelde netwerk van pancreashaarvaten. Dit uitgebreide capillaire netwerk bestaat uit sterk gefenestreerde endotheelcellen (EC's) die belangrijk zijn voor de ontwikkeling en functie van de alvleesklier. Dienovereenkomstig kan de disfunctie van EC's bijdragen aan die van de alvleesklier bij ziekten zoals diabetes en kanker. Onderzoek naar de functie van pancreas-EC's (pEC's) is dus niet alleen belangrijk voor het begrijpen van de biologie van de alvleesklier, maar ook voor het ontwikkelen van de pathologieën ervan. Muismodellen zijn waardevolle hulpmiddelen om stofwisselings- en hart- en vaatziekten te bestuderen. Er is echter geen opgesteld protocol met voldoende details beschreven voor de isolatie van pEC's bij muizen vanwege de relatief kleine populatie EC's en de overvloedige spijsverteringsenzymen die mogelijk vrijkomen uit het acinaire weefsel en die kunnen leiden tot celbeschadiging en dus lage opbrengst. Om deze uitdagingen aan te gaan, hebben we een protocol opgesteld om de pEC's van muizen te verrijken en te herstellen, waarbij zachte fysische en chemische dissociatie en antilichaam-gemedieerde selectie worden gecombineerd. Het hier gepresenteerde protocol biedt een robuuste methode om intacte en levensvatbare EC's uit de hele alvleesklier van de muis te extraheren. Dit protocol is geschikt voor meerdere downstream-assays en kan worden toegepast op verschillende muismodellen.
De alvleesklier, de sleutel tot metabole controle en homeostase, is een sterk gevasculariseerd orgaan. De alvleesklier heeft zowel endocriene als exocriene functies en regelt respectievelijk de regulatie van de bloedglucose en spijsverteringsenzymen. Deze twee compartimenten zijn met elkaar verbonden door het uitgebreide netwerk van pancreasbloedvaten, waardoor de uitwisseling en het transport van zuurstof, hormonen en enzymen wordt vergemakkelijkt. Van cruciaal belang is dat dit dichte capillaire netwerk het eilandje Langerhans binnendringt, een cluster van hormoonregulerende cellen in de alvleesklier die verantwoordelijk zijn voor de endocriene functie, bestaande uit de glucagon-afscheidende alfa (α) cellen, de insuline-afscheidende bèta (β) cellen en de somatostatine-afscheidende delta (δ) cellen 1,2. Hoewel de eilandjes slechts 1-2% van de pancreasmassa uitmaken, ontvangen ze 20% van de totale bloedstroom3, wat het belang van eilandjesvasculatuur benadrukt. De capillairen van de alvleesklier bestaan voornamelijk uit sterk gefenestreerde endotheelcellen (EC's), die zijn omgeven door murale pericyten. Deze capillaire EC's spelen een vitale rol bij de ontwikkeling, rijping en (dys)functie van eilandjes en vormen intieme overspraak met verschillende endo- en exocriene cellen4 (Figuur 1).
Endotheliale disfunctie is waargenomen bij zowel diabetes type 1 als type 2, de meest voorkomende aandoeningen veroorzaakt door disfunctie van de pancreaseilandjes 5,6. Zowel de microvasculaire dichtheid als de morfologie van de eilandjes kunnen worden gewijzigd bij diabetes7. Bovendien wordt alvleesklierkanker, een zeer agressieve tumor die zich ook als diabetes kan manifesteren, gekenmerkt door een hoge microvasculaire dichtheid met slechte perfusie8. Gezien de cruciale structurele en functionele rol van EC's in zowel normaal als ziek pancreasweefsel, is er een pertinente behoefte om de pEC's in ontwikkeling, fysiologie en pathologie te bestuderen om de mechanismen te onthullen die gezondheid of ziekten stimuleren.
Er zijn talloze protocollen ontwikkeld voor de isolatie van EC's uit verschillende muizen (bijv. hersenen 9,10, long11, hart12, lever13, skeletspieren14 en vetweefsel15) en mensen (bijv. hersenen16, visceraal vetweefsel17,18, perifere zenuwen19, long 20,21,22 en mesenteriale slagader 23) weefsels. Deze protocollen omvatten doorgaans het gebruik van enzymatische digesties (bijv. door collagenase, trypsine24, dispase 24,25 en liberase26), gevolgd door een op antilichamen gebaseerde verrijkingsstap. Bovendien zijn deze protocollen meestal gebaseerd op een langere duur van de spijsvertering in hoge concentraties enzymen met krachtige agitatie bij 37 °C (tabel 1). Vanwege de unieke kenmerken van de alvleesklier, waaronder het feit dat deze een overvloed aan endogene spijsverteringsenzymen herbergt, kunnen deze bestaande protocollen niet rechtstreeks worden toegepast om pEC's te isoleren. Ten eerste verschilt de samenstelling van de extracellulaire matrix (ECM) van de alvleesklier van andere weefsels. Hoewel collagenase vaak wordt gebruikt voor EC-isolatie, zijn er meerdere subtypes met verschillende weefselspecifieke dissociatiemogelijkheden, waardoor optimalisatie vereist is. Ten tweede, en cruciaal voor pEC-isolatie, kan de afgifte en activering van endogene enzymen van de pancreas het isolatieproces aanzienlijk belemmeren. Daartoe moet voorzichtigheid worden betracht om de breuk van de exocriene acinaire cellen (de primaire bron van zymogens, proteasen en RNase27) tot een minimum te beperken, wat verdere celbeschadiging kan veroorzaken en kan resulteren in een lage levensvatbaarheid van de cellen en het algehele herstel kan beïnvloeden 27,28,29.
Om deze uitdagingen aan te gaan, hebben we methoden aangepast uit bestaande EC-isolatieprotocollen en een nieuw protocol opgesteld dat geschikt is voor EC-isolatie van muizenpancreas. Concreet beschrijven we hier een workflow (Figuur 2) met collagenase Type I (typisch geïmplementeerd voor EC-isolatie van de long), lagere spijsverteringstemperaturen en geen agitatie (om activering van pancreaszymogenen te voorkomen) en DNase 30,31,32-suppletie (om DNA-geïnduceerde apoptose te voorkomen en de levensvatbaarheid van cellen te verbeteren, en een antilichaam voor CD3133 (PECAM1, een pan-EC-marker). Het beschreven protocol produceert EC-populaties geïsoleerd uit de alvleesklier van muizen die kunnen worden gebruikt voor genexpressieprofilering en eiwittesten.
Weefselisolatie werd uitgevoerd onder het goedgekeurde onderzoeksprotocol #17010 door het Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC) van het Beckman Research Institute, City of Hope (Duarte, Californië, VS). Hier gebruiken we Tie-2CreERT2; Rosa26-TdTomato muislijn in C57BL/6 achtergrond op een leeftijd van 8 - 12 weken. In deze lijn worden EC's gelabeld met TdTomato wanneer ze worden geïnduceerd met tamoxifen zoals eerder beschreven34. Dit protocol kan echter worden aangepast voor volwassen muizen van alle leeftijden met verschillende genotypen en genetische achtergronden.
1. Weefselafname (geschatte tijd: 1-2 uur)
OPMERKING: De geschatte tijd is 15 min/dier, aanbevolen maximum 3 dieren gepoold per dissociatiemonster.
2. Collagenasepreparaat (geschatte tijd: 15-30 min)
3. Spijsvertering (geschatte tijd: 40 min-1 uur)
4. Verrijking van endotheelcellen (EC) (geschatte tijd: 2-3 uur)
5. Kweken van pEC's
Volgens dit protocol kunnen ongeveer 2 x 106 levende cellen worden verkregen bij het samenvoegen van 3 muizenalvleesklieren en 750.000 cellen van een enkele muizenalvleesklier. Om de verrijking van EC te valideren, hebben we de volgende analyses uitgevoerd: 1) kwantitatieve PCR: vergeleken met de doorstroommonsters (FT) (d.w.z. de niet-CD31-antilichaamgebonden fracties), hadden de EC-fracties significant hogere niveaus van Pecam1 (coderend voor CD31) en Kdr (coderend voor VEGFR2), twee EC-markergenen33 en lagere niveaus van NK6 homeobox 1 (Nkx6.1), een transcriptiefactor in de endocriene cellen van de pancreas (Figuur 4A); 2) western blotting: EC-verrijkte monsters van drie preparaten (pEC-1-3) vertoonden sterke signalen van CD31 bij de verwachte grootte (~130 kDa). Ter vergelijking: de input- en FT-samples vertoonden een minimaal CD31-signaal. Als positieve controle vertoonden lysaten van MS1-cellen, een pEC-cellijn, ook een sterk CD31-signaal (Figuur 4B); 3) trypanblauwe kleuring: we ontdekten dat de levensvatbaarheid van geïsoleerde cellen ongeveer 50% was (Figuur 4C); 4) flowcytometrie volgens een gepubliceerd protocol15 : door gating op de levende celpopulatie (Figuur 4D), ontdekten we dat de CD31+-cellen op 88% zaten en de TdTomato+-cellen op 76%. Merk op dat de meerderheid van de geïsoleerde cellen CD31 en TdTomato samen tot expressie brengt (Figuur 4E). Als negatieve controles vertoonden de ongekleurde MS1-cellen en MS1 geïncubeerd met IgG geen levende cellen zoals gemarkeerd door CD31. Als positieve controle, d.w.z. MS1-cellen gekleurd voor CD31, vertoonden bijna 100% levende CD31+-cellen (Figuur 4F). We hebben ook de geïsoleerde cellen gekweekt, immunofluorescentiekleuring van PECAM1 uitgevoerd volgens een gepubliceerd protocol36 en TdTomato in beeld gebracht, dat robuuste signalen van beide markers in de geïsoleerde cellen liet zien, wat de aanwezigheid van EC's suggereert (Figuur 4G).

Figuur 1: Illustratie van vascularisatie van pancreas en pancreaseilandjes. Een picturale weergave van de endotheelcellen van de alvleesklier (EC's) en EC's binnen de eilandjes. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: Overzicht van de workflow. 1) Pancreasdissectie, 2) mechanische digestie, 3) enzymincubatie, 4) centrifugatie, 5a) verwijdering van supernatans en 5b) secundaire collagenasedigestie van de celpellets met trituratie voor filtering in 6), 7) en 8) reconstitutie van pellets en antilichaambinding, 9) incubatie van microbeads, 10) verrijking van de MACS-kolom, 11) celtelling voor levensvatbaarheid, en 12) stroomafwaartse analyse. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3: Stappen voor weefselverwerking. Afbeeldingen van (A) de buikholte, (B) de geïsoleerde muizenalvleesklier en (C) de bijgesneden muizenalvleesklier. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4: Validatie van geïsoleerde EC-fracties uit de alvleesklier van muizen. (A) qPCR van FT-monsters en verrijkte EC-fractie met CD31 voor verrijking. Pecam1 (CD31), Kdr (VEGFR2) en Nkx6.1 (pancreas-β-celspecifieke transcriptiefactor)33. * geeft p <0,05 aan in vergelijking met FT op basis van t-tests . n = 3-4 gepoolde monsters, bestaande uit elk 3 muizen. (B) Westerse blotting van CD31. pEC-1-3 geeft verrijkte EC's aan uit 3 afzonderlijke gepoolde muismonsters. Cellysaten van 30 mg werden op elke baan geladen, gevolgd door Ponceau S-kleuring. (C) Celtelling en trypanblauwe kleuring van verrijkte pEC's voor levensvatbaarheidstest. (D) Flowcytometrie-poortstrategie voor pEC's van muizen gekleurd door 4', 6-diamidino-2-fenylindool (DAPI) en CD31-antilichaam. (E) Flowcytometriehistogrammen van ongekleurd MS1 (linksboven), MS1 gekleurd met AlexaFluor-488 secundair antilichaam (IgG-controle; rechtsboven), MS1 gekleurd met CD31 (linksonder) en de geïsoleerde muizen-pEC's gekleurd met CD31 (rechtsonder). (F) Percentage levende cellen gekwantificeerd met behulp van flowcytometrie. (G) Immunofluorescentie van CD31-expressie (groen) met DAPI (blauw) tegenkleuring en endogene TdTomato fluorescerende reporter (rood). Schaalbalk = 100 μm. Klik hier om een grotere versie van deze afbeelding te bekijken.

Figuur 5: CD31- en CD144-specificiteit in de alvleesklier van muizen. (A) Immunofluorescentie van de alvleesklier van muizen met CD31 (Magenta) en CD144 (cyaan), met DAPI-tegenkleuring. Afbeelding vastgelegd met een 10x lens onder een breedveld fluorescerende omgekeerde microscoop. Schaal balk = 100 μm. Stippellijnen bakenen het eilandje af. (B) Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) die Cdh5- en Pecam1-expressie toont in de eilandjes-EC's van C57BL6-muizen gedetecteerd door scRNA-seq (GSE128565)37. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
| Enzym | Gebruiken | Temperatuur en tijd | Referentie |
| Collagenase I | Eencellige dissociatie, EC-verrijking van de hele alvleesklier | 37 °C, 20 min | Dit protocol |
| Collagenase IV | Isolatie van eilandjes en niet-enzymatische dissociatie | 37 °C, 20 min | 46 |
| Collagenase + Trypsine | Onderzoek naar ductale cellen in de alvleesklier van muizen | 37 °C, 30 min | 47 |
| Collagenase B | Eencellige suspensie van de alvleesklier | 37 °C, 30 min | 48 |
| Collagenase NBI | Eilandje isolatie | 37 °C, 30 min | 49 |
| Collagenase P | Acinar levensvatbare suspensie | 37 °C, 15 min | 45 |
| Collagenase XI | Eilandje isolatie | 37 °C, 15 min | 35 |
| Dispase | Ophanging met één cel | 37 °C, 45 min | 24 |
| Liberase | Ophanging met één cel | 37 °C, 10 min | 25, 48 |
| Trypsine | Dissociatie van enkele cellen, hele alvleesklier | 4 °C, O/N | 28 |
Tabel 1: Samenvatting van de verschillende protocollen die worden gebruikt om monsters van de alvleesklier van muizen te verwerken.
In dit artikel presenteren we een protocol voor verrijking en isolatie van de pEC's. Net als bij eerdere EC-isolatieprotocollen van andere weefsels of organen, bestaat dit protocol uit drie belangrijke processen, namelijk fysieke dissociatie, enzymatische vertering en op antilichamen gebaseerde EC-verrijking. Om de unieke uitdagingen bij de verwerking van de alvleesklier aan te pakken, hebben we verschillende belangrijke aanpassingen en cruciale stappen binnen ons protocol geïntroduceerd: 1) een zachte eenstaps collagenasevertering met een korte incubatietijd, 2) suppletie van een hogere concentratie DNase en een trypsineremmer om DNA-besmetting en endogene enzymvertering te minimaliseren, die de binding van antilichamen kunnen verstoren en zo de EC-verrijking en levensvatbaarheid kunnen verminderen en 3) celtelling na de verteringsstap om aan te passen hoe er wordt veel antilichaam aan het monster toegevoegd om de EC-verrijking te optimaliseren. Tijdens het optimaliseren van dit protocol hebben we andere enzymen getest die in eerdere studies zijn gebruikt, bijv. trypsine28, collagenase Type IV31 en andere spijsverteringstemperaturen, bijv. 4°C, evenals verschillende incubatietijden (Tabel 1). We vonden collagenase Type I, 20 min, bij 37 °C de optimale conditie voor de pEC-isolatie van muizen en gebruikten dit hier. Hoewel de toevoeging van een antistollingsmiddel tijdens de perfusie de algehele levensvatbaarheid van de cellen kan verbeteren, kan een typisch antistollingsmiddel, bijv. EDTA of heparine, de activiteit van bepaalde enzymen verstoren, bijv. collagenase voor celdissociatie en reverse transcriptase dat wordt gebruikt in qPCR. Om het onverwachte/ongewenste effect van deze anticoagulantia te voorkomen, wordt PBS (zonder Ca2+ en Mg2+) voor perfusie gebruikt.
We concentreerden ons op het ontwikkelen van een protocol voor het verrijken van de EC-populatie uit hele pancreasen van muizen, dat zowel EC's binnen eilandjes als EC's in de exocriene weefsels zou omvatten, wat zou resulteren in een hogere opbrengst. In het huidige protocol hebben we 3 dieren samengevoegd tijdens de dissociatiestap en bereikten we gemiddeld een eencellige suspensie met ongeveer 2,0 x 106 levensvatbare cellen. We hebben ook monsters getest van de alvleesklier van één muis en er kunnen ongeveer 750.000 cellen worden verkregen. Het is vermeldenswaard dat bij het aanpassen aan de verwerking van een enkel dier, minder dissociatieoplossing (3 ml dissociatie per alvleesklier) moet worden gebruikt. Een cruciale stap in het protocol is het volledig wegsnijden en verwijderen van eventueel achtergebleven vet dat aan de alvleesklier is bevestigd (Figuur 3B). Besmetting van vetweefsel in de collagenasevertering zal de dissociatiestap van één cel van de alvleesklier verstoren, waardoor de levensvatbaarheid van de cellen afneemt in de volgende verrijkingsstappen38. Om de pEC's te verrijken gebruikten we bovendien een pan-EC oppervlaktemerker, PECAM1/CD31. Met behulp van PECAM1/CD31-antilichaam konden we de EC-fracties aanzienlijk verrijken, wat blijkt uit de genexpressieanalyse. Bij de ontwikkeling van dit protocol hebben we ook het nut van CD144-antilichaam getest, dat ook vaak wordt gebruikt om EC's13 te isoleren. We waren echter niet in staat om de pEC's te verrijken (gegevens niet getoond). Intrigerend genoeg onthulde immunofluorescerende kleuring dat terwijl CD31 tot expressie komt in alle EC's in het pancreasweefsel, CD144-antilichaam alleen intra-eilandje EC's lijkt te kleuren (Figuur 5A). Daarnaast analyseerden we openbaar beschikbare eencellige RNA-seq-gegevens van eilandjes geïsoleerd uit C57BL/6-muizen (GSE128565)37 en ontdekten dat ongeveer 50% van de eilandjes-EC's expressie van zowel Cdh5 (VE-Cad) als Pecam1 vertoont, maar de rest van de eilandjes-EC's brengen alleen Cdh5 of Pecam1 tot expressie (Figuur 5B). We speculeren dus dat CD31-antilichamen geschikter zijn voor pEC-isolatie en dat het nut van CD144-antilichamen voor dit doel toekomstig onderzoek rechtvaardigt. Bovendien zijn er in de handel verkrijgbare anti-CD31 geconjugeerd met magnetische kralen die de tweestaps antilichaambindingsstap kunnen vereenvoudigen tot een enkelvoudige stap.
Zoals aangetoond, hebben we qPCR, immunoblotting, flowcytometrie en immunofluorescerende kleuring uitgevoerd om de geïsoleerde EC-fractie te valideren. Het is denkbaar dat deze fracties kunnen worden onderworpen aan andere testen, zoals (sc)RNA-seq en massaspectrometrie. Een beperking van dit protocol is dat we niet in staat zijn geweest om een robuuste subcultuur te bereiken en functionele assays uit te voeren. Gezien het feit dat is aangetoond dat de subcultuur van geïsoleerde muizen-EC's een uitdaging is, is dit een gebied dat toekomstige inspanningen rechtvaardigt. Een manier om dit aan te pakken kan de introductie zijn van groot T-antigeen, dat is gebruikt om primaire cellen te vereeuwigen39.
De recente ontwikkelingen en toepassing van scRNA-sequencing hebben profilering met hoge resolutie van pancreascellen40 en vooral eilandjescellen41 mogelijk gemaakt. De meeste van de bestaande onderzoeken hebben zich echter gericht op endocriene celpopulaties en gebruikten weefseldissociatieprotocollen die EC's niet efficiënt behouden. Als gevolg hiervan worden EC-fracties vaak schaars en vormen ze slechts 3%-5% in de gehele gevangen celpopulaties 42,43,44. Een recent protocol maakt gebruik van enzymatische vertering en deactivering in twee stappen en een fluorescerend geactiveerde celsorteerstap en haalt EC's op bij 12% van de gehele pancreascelpopulatie45. Als aanvulling op dit protocol biedt ons protocol een vereenvoudigde workflow, die kosteneffectiever en technisch minder veeleisend kan zijn als EC's de focus van het onderzoek zijn. Hoewel dit protocol alleen is getest in de alvleesklier van muizen, kan het worden opgeschaald en aangepast om EC's te isoleren van andere organismen, waaronder de menselijke alvleesklier.
De auteurs hebben niets te onthullen.
De auteurs danken Dr. Brian Armstrong van City of Hope en Mindy Rodriguez van de University of California, Riverside voor technische assistentie. Deze studie werd gedeeltelijk gefinancierd door subsidies van de NIH (R01 HL145170 aan ZBC), Ella Fitzgerald Foundation (aan ZBC), City of Hope (Arthur Riggs Diabetes Metabolism and Research Institute Innovation Award) en California Institute of Regenerative Medicine grant EDU4-12772 (aan AT). Onderzoek dat in deze publicatie wordt gerapporteerd, omvatte werk dat werd uitgevoerd in de lichtmicroscopie en digitale beeldvorming die werden ondersteund door het National Cancer Institute van de NIH onder toekenningsnummer P30CA033572. Figuur 1 en Figuur 2 zijn gemaakt met BioRender.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| 1.5 mL eppendorf | USA Scientific | 1615-5500 | |
| 10 cm dish | Genesee Scientific | 25-202 | |
| 25G needles | BD | 305145 | |
| 2X Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix | Vazyme | Q712-03-AA | |
| 5 mL eppendorf | Thermo Fisher | 14282300 | |
| 6-well plate | Greiner Bio-One | 07-000-208 | |
| 70 µm strainer | Fisher | 22-363-548 | |
| Anti-CD31-biotin | Miltenyi Biotech | REA784 | |
| Bovine serum albumin heat shock treated | Fisher | BP1600-100 | |
| CaCl2 | Fisher | BP510 | |
| Centrifuge | Eppendorf | ||
| Collagen Type 1, from calf skin | Sigma Aldrich | C9791 | Attachment reagent in the protocol |
| Collagenase Type 1 | Worthington Bio | LS004197 | |
| Countess Automatic Cell Counter | Thermo Fisher | ||
| DAPI | Thermo Fisher | D1306 | immunofluorescence |
| Disposable Safety Scalpels | Myco Instrumentation | 6008TR-10 | |
| DNAse I | Roche | 260913 | |
| D-PBS (Ca2+,Mg2+) | Thermo Fisher | 14080055 | |
| Ethanol | Fisher | BP2818-4 | |
| Fetal bovine serum | Fisher | 10437028 | |
| Incubator | Kept at 37 °C 5% CO2 | ||
| LS Columns | Miltenyi Biotech | 130-042-401 | |
| M199 | Sigma | M2520-1L | |
| MACS MultiStand with the QuadroMACS Separator | Miltenyi Biotech | 130-042-303 | |
| Medium 199 | Sigma Aldrich | M2520-10X | |
| Microbeads anti-biotin | Miltenyi Biotech | 130-090-485 | |
| Microscope | Leica | To assess cell morphology | |
| Molecular Grade Water | Corning | 46-000-CM | |
| NaCl | Fisher | S271-1 | |
| New Brunswick Innova 44/44R Orbital shaker | Eppendorf | ||
| PECAM1 (CD31) Antibody | Abcam | ab56299 | immunofluorescence |
| PECAM1 (CD31) Antibody | R&D Systems | AF3628 | |
| Phosphate Buffered Saline (10X) (no Ca2+,no Mg2+) | Genesee Scientific | 25-507-XB | |
| Primer 36B4 Forward mouse | IDT | AGATTCGGGATATGCTGTTGGC | |
| Primer 36B4 Revese mouse | IDT | TCGGGTCCTAGACCAGTGTTC | |
| Primer Kdr Forward mouse | IDT | TCCAGAATCCTCTTCCATGC | |
| Primer Kdr Reverse mouse | IDT | AAACCTCCTGCAAGCAAATG | |
| Primer Nkx6.1 Reverse mouse | IDT | CACGGCGGACTCTGCATCACTC | |
| Primer Nxk6.1 Forward mouse | IDT | CTCTACTTTAGCCCCAGCG | |
| Primer PECAM1 Forward mouse | IDT | ACGCTGGTGCTCTATGCAAG | |
| Primer PECAM1 Reverse mouse | IDT | TCAGTTGCTGCCCATTCATCA | |
| RNase ZAP | Thermo Fisher | AM9780 | |
| RNase-free water | Takara | RR036B | |
| Sterile 12" long forceps | F.S.T | 91100-16 | |
| Sterile fine forceps | F.S.T | 11050-10 | |
| Sterile fine scissors | F.S.T | 14061-11 | |
| Tissue Culture Dishes 2cm | Genesee Scientific | 25-260 | |
| TRIzol reagent | Fisher | 15596018 | |
| Trypan Blue | Corning | MT25900CI | |
| Trypsin Inhibitor | Roche | 10109886001 | |
| Tween-20 | |||
| VE-Cadherin Antibody | Abcam | ab33168 | immunofluorescence |
| Waterbath |