Dit protocol geeft een volledige en uitgebreide beschrijving van het gedetailleerde proces voor de isolatie, zuivering en identificatie van bacitracineproducerende Bacillus licheniformis uit gezonde varkensuitwerpselen.
Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.
Methodenartikel
Dit protocol geeft een volledige en uitgebreide beschrijving van het gedetailleerde proces voor de isolatie, zuivering en identificatie van bacitracineproducerende Bacillus licheniformis uit gezonde varkensuitwerpselen.
Bacillus licheniformis en bacitracine hebben een enorme toepassingsmarkt en waarde op het gebied van geneeskunde, chemie, aquacultuur, landbouw en nevenproducten. Daarom is de selectie van B. licheniformis met een hoge productie van bacitracine van groot belang. In dit experimentele protocol werd Bacillus met een hoge opbrengst aan bacitracine geïsoleerd, gezuiverd en geïdentificeerd uit de verse uitwerpselen van gezonde varkens. Het remmende effect van secundaire metabolietbacitracine op Micrococcus luteus werd ook getest. Dunnelaagchromatografie en high-performance vloeistofchromatografie werden gebruikt voor de kwalitatieve en kwantitatieve detectie van bacitracine. De fysiologische en biochemische kenmerken van B. licheniformis werden bepaald door relevante kits. De fylogenetische relaties van B. licheniformis werden bepaald en geconstrueerd met behulp van gensequentiedetectie. Dit protocol beschrijft en introduceert het standaard isolatie-, zuiverings- en identificatieproces van B. licheniformis uit verse dierlijke uitwerpselen vanuit meerdere perspectieven, en biedt een methode voor het grootschalige gebruik van B. licheniformis en bacitracine in fabrieken.
Bacillus licheniformis is een soort Bacillus in de familie Firmicutes, die wijd verspreid is in verschillende omgevingen zoals water, bodem en darmen van dieren1. B. licheniformis heeft een korte en stevige staafvormige structuur en beweegt individueel2. De kolonie is bijna rond en dof, met een centrale uitstulping en nette randen van grijsachtig wit3. Het heeft een sterk groei- en voortplantingsvermogen en kan voedingsstoffen uit verschillende koolstofbronnen, zoals monosachariden, polysachariden, ketose en organische zuren, absorberen en gebruiken4. In het latere stadium van groei en ontwikkeling kan B. licheniformis bestaan in de vorm van slapende sporen en antibacteriële stoffen produceren, zoals bacitracine, lichenysine en oppervlaktefactine. Het is ook bestand tegen voedingstekorten en extreme externe omgevingen5. Er is geen duidelijke codonvoorkeur en het efficiënte secretiesysteem bepaalt de heterologe eiwitsecretie van B. licheniformis, die tweemaal zo groot is als die van Bacillus subtilis6. Het wordt vaak gebruikt om enzympreparaten zoals protease, amylase en cellulase7 te produceren. Vanwege het ontbreken van endogene gifstoffen is het gecertificeerd als een voedselveilige stam en vermeld op de QPS door EFSA8. Daarom zijn er verschillende mogelijke toepassingen, waaronder de productie van bioactieve stoffen, die een breed scala aan toepassingen hebben in de aquacultuur-, landbouw-, voedings-, biomedische en farmaceutische industrie. Ook is B. licheniformis een belangrijk onderdeel van de darmflora van dieren, die dieren kan bevorderen om de productieprestaties te verbeteren, de balans van de darmflora te verbeteren en ziekten te voorkomen. Het hele genoom van B. licheniformis ATCC14580 werd in 2004 geanalyseerd en de achtergrondinformatie over transcriptietranslatie, eiwitvouwing en secretiemechanisme is geleidelijk begrepen9. Deze genetische informatie maakt het bevorderlijk voor genetische modificatie op moleculair niveau en draagt bij aan het vergemakkelijken van de grootschalige productie van B. licheniformis.
Bacitracine is een dodecacyclisch peptide-antibioticum dat wordt geproduceerd door niet-ribosomaal peptidesynthetase door secundair metabolisme in B. subtilis en B. licheniformis. Bacitracine is een mengsel dat is samengesteld uit verschillende componenten zoals bacitracine A, B en C, waarbij een of twee aminozuren verschillen tussen elke component; Hiervan heeft bacitracine A de sterkste biologische activiteit10. Bacitracine kan grampositieve bacteriën zoals Staphylococcus en Micrococcus luteus en sommige gramnegatieve bacteriën remmen door de vorming van celwanden te remmen en te interageren met membraanbindende eiwitten11. Ondertussen is bacitracine veilig en stabiel, niet gemakkelijk om resistentie tegen geneesmiddelen te produceren en kan het compatibel zijn met andere antibacteriële geneesmiddelen12. Daarom wordt bacitracine gebruikt in de medische en veterinaire praktijk. Bovendien kan het vanwege zijn snelle eliminatiesnelheid en lage absorptiesnelheid ook worden gebruikt als additief voor diervoeder13.
B. licheniformis kan de darm koloniseren en de gastro-intestinale micro-omgeving verbeteren. De hechting en het voortplantingsvermogen en de daarmee samenhangende fysiologische functies van Bacillus uit verschillende bronnen in het maagdarmkanaal van verschillende dieren zijn verschillend. Van varkens afgeleide B. licheniformis is meer bevorderlijk voor kolonisatie in de darmen van varkens en ander vee. Er is een nauw verband tussen de relatieve overvloed aan intestinale probiotica en de gezondheidstoestand van gastheer14. Voedingssuppletie met B. licheniformis mix bij gespeende biggen verbetert het darmecosysteem door de samenstelling van de microbiota en de metabolische activiteit te veranderen, en beïnvloedt ook het darmslijmvlies15. Uitwerpselen van dieren kunnen een weerspiegeling zijn van het type en de hoeveelheid darmflora van dieren. Dit protocol beschrijft de isolatie en zuivering van bacitracineproducerende Bacillus spp. uit gezonde varkensuitwerpselen. De uitwerpselen zijn afkomstig van Taihu-zeugen die niet worden gevoed met mengvoer en uitstekende productieprestaties leveren in varkenshouderijen. De isolaten werden geïdentificeerd als B. licheniformis op basis van hun morfologische kenmerken, fysisch-chemische eigenschappen en biochemische identificatie.
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Alle experimentele procedures werden gedocumenteerd en goedgekeurd door de ethische commissie van de Nanjing Tech University. De uitwerpselen waren afkomstig van Taihu-zeugen van ongeveer 2 jaar oud (zie materiaaltabel), die werden grootgebracht op professionele en standaard varkenshouderijen.
1. Voorbereiding van de media
2. Isolatie en zuivering van Bacillus uit verse uitwerpselen van gezonde varkens
3. Screening op remming van de activiteit van M. luteus
4. Identificatie van bacitracine door middel van dunnelaagchromatografie
5. Detectie van bacitracine door HPLC
6. Morfologische identificatie
7. Fysiologische en biochemische identificatie
8. Bepaling van de sequentie van het stamgen
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
In dit experiment werden 48 stammen van Bacillus geïsoleerd uit verse uitwerpselen van gezonde varkens, genummerd van 1001 tot 1048. Onder hen hadden 15 stammen antibacteriële activiteit tegen M. luteus. Van de 15 stammen werden de titers van bacitracine gemeten met behulp van high-performance vloeistofchromatografie, zoals weergegeven in tabel 1. Onder hen had B. licheniformis nr. 1026 de hoogste bacitracine-titer, 456,35 ± 21,75 E/ml, dus nr....
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
B. licheniformis groeit snel met eenvoudige kweekomstandigheden en snelle suikerconsumptie, en de volwassen fermentatietechnologie is nuttig bij het besparen van industriële productiekosten13. De brede toepassing van B. licheniformis en zijn afscheidingen, bacitracine, heeft de veelbelovende marktwaarde bepaald. In de landbouw wordt B. licheniformis gebruikt als biomeststof om de plantengroei en de opname van voedingsstoffen te verbetere...
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
De auteurs hebben niets te onthullen.
Deze studie werd ondersteund door het National Key Research and Development Program van China (nr. 2022YFC2104800) en het Six Talent Peaks-project in de provincie Jiangsu (nr. 2019-NY-058).
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| 2 × Phanta Flash Master Mix | Nanjing Vazyme Biotechnology Co., Ltd., Nanjing,China | P252-01 | |
| 2kb DNA Marker | Beijing Trans Biotechnology Co., Ltd., Beijing, China | BM121-01 | |
| Acetonitrile | Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co.,Ltd., Shanghai, China | A104443 | |
| Agar poeder | Shanghai Macklin Biochemical Technology Co., Ltd., Shanghai, China | A800730 | |
| Agarose | Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co.,Ltd., Shanghai, China | A104062 | |
| Ammoniumsulfaat ((NH4)2SO4) | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd., Shanghai, China | 10002917 | |
| Autoclaaf sterilisator | Zealway Instrument Inc., Xiamen, China | GI36DWS | |
| Bacillus biochemische identificatiestrip | Qingdao Haibo Biotechnology Co., Ltd., Qingdao, China | HBIG14 | |
| Bacitracine | Shanghai Yuanye Bio-Technology Co., Ltd., Shanghai, China | B65740 | |
| Bacterie DNA Extractie Kit | Tiangen Biochemical Technology Co., Ltd., Beijing, China | DP209 | |
| Ademende afdichtingsfolie | Beijing Leiborun Biotechnology Co., Ltd. | BS-QM-01A | |
| Butanol | Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co., Ltd., Shanghai, China | B433378 | |
| C18 (5 μm, 4.6 × 250 mm) HPLC kolom | Rizhao Kepuno New Material Co., Ltd., Rizhao, China | C1805-462510 | |
| Calciumcarbonaat (CaCO3) | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd., Shanghai, China | 10005717 | |
| Centrifuge | New Brunswick Scientific Co., Inc., UK | 5452 | |
| Chromatografische tank | Nanjing Tenghui Experimental Technology Co., Ltd., Nanjing, China | P-1 | |
| Kegelfles | Sichuan Shubo Co., Ltd., Chengdu, China | 18012 | |
| Incubator met constante temperatuur | Taist Instrument Co., Ltd., Tianjin, China | GH4500 | |
| Dipotashfosfaat (K2HPO4) | Xilong Chemical Co., Ltd., Guangdong, China | XL0015 | |
| EDTA-2Na | Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co.,Ltd., Shanghai, China | E397526 | |
| Elektronische weegschaal | Mettler Toledo International Co., Ltd. | FA2104 | |
| Ethylalcohol | Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co.,Ltd., Shanghai, China | E130059 | |
| Gel Midi Zuiveringskit | Tiangen Biochemical Technology Co., Ltd., Beijing, China | DP302 | |
| Glasmaatje | Chengdu Yibang Kexi Instrument Co., Ltd. | 1294 | |
| Glucose | Shanghai Macklin Biochemical Technology Co., Ltd., Shanghai, China | D823520 | |
| Gram's kleurstofoplossing kit | Qingdao Haibo Biotechnology Co., Ltd., Qingdao, China | HB8278 | |
| Hoge prestatie vloeistof chromatograaf | Agilent Technologies, Inc., California, America | 1260 | |
| Horizontaal elektroforeseapparaat | Beijing Liuyi Biotechnology Co., Ltd., Beijing, China | DYCP-31DN BIOMATE | |
| Inoclatiering | Shanghai Muchen Biotechnology Co., Ltd., Shanghai, China | 3171026 | |
| Magneetroerder | Wiggens GmbH Co., Ltd., Germany | WH220 PLUS | |
| Methylalcohol | Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co.,Ltd., Shanghai, China | M116115 | |
| Microcentrifugebuisje | Shanghai Muchen Biotechnology Co., Ltd., Shanghai, China | 1351171 | |
| Micrococcus luteus | Bena Culture Collection, Suzhou, China | BNCC102589 | |
| Microporeuze filtermembraan | Nantong Suri Experimental Equipment Co., Ltd. | PES0.22 | |
| Ninhydrine | Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co., Ltd., Shanghai, China | N105629 | |
| Optische microscoop | Optical Instrument Factory, Shanghai, China | DYS-108 | |
| Varkensmest | Nanjing Quanfu Pig Farm, Nanjing, China | ||
| Polymerasekettingreactie (PCR) Versterker | Suzhou Dongsheng Xingye Scientific Instrument Co., Ltd., Suzhou, China | ETC811 | |
| Professioneel sequencing bedrijf | General Biology (Anhui) Co., Ltd., Anhui, China | ||
| Pyridien | Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co., Ltd., Shanghai, China | P111516 | |
| Schakelaar | Taicang Qiangle Experimental Equipment Co., Ltd.,Taicang, China | HYL-C | |
| Silica gel GF254 dunne laagplaat | Yantai Huayang New Material Co., Ltd., Yantai, China | HPT-HSGF5025023 | |
| Natriumchloride (NaCl) | Shanghai Macklin Biochemical Technology Co., Ltd., Shanghai, China | S805275 | |
| Natriumcitraat | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd., Shanghai, China | C39197100001 | |
| Oplosbare zetmeel | Shanghai Macklin Biochemical Technology Co., Ltd., Shanghai, China | S817547 | |
| Thermostaat waterbad | Shanghai Heheng Instrument Equipment Co., Ltd., Shanghai, China | DK-8D | |
| Trypton | Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co., Ltd., Shanghai, China | T139519 | |
| Ultra GelRed | Nanjing Vazyme Biotechnology Co., Ltd., Nanjing,China | GR501-01 | |
| Ultra puur water instrument | Merck KGaA Co., Ltd., Germany | Milli Direct-Q8 | |
| Ultrasoon reinigingsapparaat | Jiangsu Huaguan Electric Appliance Group Co., Ltd., Jiangsu, China | SB-100DT | |
| Schuifmaat | Sanfeng Company, Japan | N20P | |
| Gist extract poeder | Vicbio Biotechnology Co., Ltd., Beijing, China | LP0021 |
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Dit artikel is gepubliceerd
Video binnenkort beschikbaar