De cellulaire architectuur van de darm vormt een unieke uitdaging bij het behouden van de structurele integriteit wanneer darmweefsel wordt bewaard voor immunokleuring. De dunne darm bestaat uit langwerpige vingerachtige structuren die bekend staan als villi1. Deze villi raken vaak misvormd tijdens inbeddingsprocessen. Ervoor zorgen dat onderzoekers technieken hebben om darmen goed in te bedden om dwarsdoorsneden te bereiken, waardoor visualisatie van alle delen van de darm mogelijk is, evenals de lagen waaruit de darm bestaat (d.w.z. muscularis propria, slijmvlies en de serosa), is cruciaal voor robuuste experimentele analyse2. Onvoldoende fixatie, overmatige fixatie en onjuiste weefselbehandeling zullen de weefselintegriteit in gevaar brengen, wat resulteert in onbedoelde schade aan het darmepitheel 3,4. Het beschadigen van het darmepitheel tijdens deze stappen kan de kwaliteit van latere analyses, zoals immunofluorescentie, aanzienlijk verminderen, ongeacht de werkzaamheid van immunohistochemische protocollen en gebruikte antilichamen.
Immunokleuring is, net als een goede weefselfixatie, een belangrijk onderdeel van biomedisch onderzoek. Als het goed wordt gedaan, kan immunokleuring voorheen onbekende aspecten van de cellulaire structuur en functie verlichten. Immunofluorescentiekleuring van paraffinesecties kan een uitdaging zijn vanwege fysisch-chemische veranderingen als gevolg van het fixatie- en paraffine-inbeddingsproces5. Fixatie en inbedding van paraffine resulteren in antigeenmaskering die de immunofluorescentiedetectie van interessante epitopen kan verstoren6. Vertraagde fixatie kan proteolytische degradatie induceren, wat resulteert in een verzwakte of afwezige kleuring van kritieke epitopen7. Bovendien zijn antilichamen vaak onnauwkeurig met een hoge achtergrond. Immunokleuringsprotocollen die consistente en specifieke antilichaambinding en een hoge signaal-ruisverhouding bevorderen, kunnen waardevolle informatie opleveren voor onderzoekers.
Hier bieden we een uitgebreid protocol dat is ontworpen om immunofluorescentiebeelden van hoge kwaliteit te verkrijgen door middel van fixatie van darmweefsel, Swiss roll-voorbereiding8 en immunokleuring. Het protocol legt de nadruk op richtlijnen om de integriteit van de darm te behouden en heeft tot doel onderzoekers een robuuste methodologie te bieden om de kwaliteit en betrouwbaarheid van immunofluorescentiebeeldvormingsonderzoeken te verbeteren. We hebben ook geprobeerd kosteneffectieve middelen te gebruiken, waaronder filterpapier en zelfgemaakte antigeenextractie, blokkeringsoplossingen en antilichaamverdunningsmiddelen om het protocol toegankelijker te maken voor laboratoria die mogelijk beperkte middelen hebben. Zoals voor alle experimentele protocollen, moeten onderzoekers het huidige protocol optimaliseren op basis van hun experimentele aanpak en interessegebieden.