Actieve ingrediënten en werkingsdoelen van Xiaoyao-pillen
Door de TCMSP-database te doorzoeken en te screenen volgens de criteria van orale biologische beschikbaarheid (OB) ≥ 30% en geneesmiddelachtige eigenschappen (DL) ≥ 0,18, werden 125 actieve ingrediënten gevonden in Xiaoyao-pillen. Onder hen waren de ingrediënten 6, 4, 9, 13, 2, 6, 83 en 2 respectievelijk afkomstig van White Paeonia lactiflora, Atractylodes macrocephala, Menthae herba, Chaihu, Angelica sinensis, Poria cocos, zoethout en gember. Enkele van de actieve ingrediënten zijn weergegeven in tabel 1. Bovendien werden in totaal 879 doelen van effectieve actieve ingrediënten verkregen uit de TCMSP-database, en 232 doelen bleven over na ID-conversie en verwijdering van dubbele waarden.
Netwerkanalyse van TCM - Actief ingrediënt - Kruisend doelwit - Ziekte
Verschillende databases werden doorzocht met behulp van het trefwoord osteoporose voor genen die verband houden met de ziekte. In de GeneCards database werden 1692 genen verkregen na filtering op basis van Relevance score ≥1. In totaal werden 35 genen verkregen in de OMIM-database. Er waren respectievelijk 3, 33 en 386 genen in de databases van PharmGkb, TTD en DrugBank. Vervolgens is het snijpunt van de resultaten van deze vijf databases gebruikt voor verdere analyse (Figuur 1A). Een van de genen die in vier databases vertegenwoordigd was, was CALCR. In totaal werden 102 kruisende genen verkregen na het combineren van de ziektegerelateerde genen en het nemen van de kruising met het geneesmiddeldoelwit (Figuur 1B). Op basis van de interacties tussen de ziektedoelen en de actieve ingrediënten van het medicijn, werd een TCM-actief ingrediënt-kruisend doelwit-ziektenetwerk geconstrueerd met Cytoscape-software. Als gevolg hiervan werden relaties tussen de componenten van het geneesmiddel en de polymorfe regulatie van ziektegerelateerde genscans verkregen (Figuur 2A).
In de String-database werden eiwitinteracties geanalyseerd op het snijvlak van ziektegenen en geneesmiddeldoelen om hun interactienetwerkdiagrammen te verkrijgen (Figuur 2B), en deze werden vervolgens gescreend op de meest centrale eiwitten (Figuur 2C-D). De resultaten toonden de sterkste interacties tussen FOS, ESR1, MAPK3, TP53, MAPK1 en STAT3 onder de ziektegenen en medicijndoelen (Figuur 2E).
GO-functie en analyse van de verrijking van de KEGG-route
De GO-verrijkingsanalyse toonde in totaal 2177 ingangen, waaronder 1990 vermeldingen van biologische processen (BP), 58 ingangen van celcomponenten (CC) en 129 vermeldingen van moleculaire functies (MF). Bij BP waren genen voornamelijk gericht op de reactie op voedingsniveaus, de reactie op oxidatieve stress en de cellulaire respons op oxidatieve stress. MF richtte zich op DNA-bindende transcriptiefactorbinding, RNA-polymerase II-specifieke DNA-bindende transcriptiefactorbinding, nucleaire receptoractiviteit, ligand-geactiveerde transcriptiefactoractiviteit en cytokine-activiteit (Figuur 3A-B).
In de analyse van de verrijking van de KEGG-route werden in totaal 168 gerelateerde signaalroutes verkregen, en de meest significante waren de AGE-RAGE-signaleringsroute, de IL-17-signaleringsroute, de TNF-signaleringsroute, de HIF-1-signaleringsroute en de Th17-celdifferentiatie (Figuur 3C-D). Er wordt gesuggereerd dat Xiaoyao-pillen op meerdere manieren therapeutische effecten op PMOM kunnen uitoefenen. Ontsteking wordt sterk geassocieerd met osteoporose en kan worden versneld door de menopauze, en IL-17 is een belangrijke ontstekingsfactor7. Daarom is het volgende plan om te onderzoeken of Xiaoyao-pillen osteoporose kunnen behandelen vanuit een inflammatoir perspectief met betrekking tot IL-17.
Structurele veranderingen in botweefsel voor en na verwijdering van eierstokweefsel
HE-kleuring toonde aan dat in de dijbenen van Sham-muizen de trabeculae strak gerangschikt waren, met een goede continuïteit, kleine openingen tussen de trabeculae, zeldzame fracturen en een normale grootte van de beenmergholte. Vergeleken met de Sham-groep waren de dijbenen van de OVX-groep schaars gerangschikt, met ernstige fracturen van de trabeculae, verstoorde continuïteit en een duidelijk vergrote beenmergholte, die typische osteoporotische veranderingen vertoonden (Figuur 4A).
Micro-CT vergelijking tussen de groepen
De dijbenen van muizen in de OVX-groep vertoonden een onvolledig trabeculair netwerk, een gedeeltelijk lege beenmergholte en dunner worden van de botcortex in vergelijking met die van muizen in de Sham-groep. De Sham-groep muizen vertoonde een overvloed aan trabeculae, goede continuïteit en een vernauwing van de mergholte in hun dijbenen (Figuur 4B).
Gedragseffecten van Xiaoyao-pillen op muizen
Tijdens de onderzoeksperiode hadden alle muizen in de andere groepen, behalve de OVX-groep, betere leefgewoonten, een normale haarkleur, een hoge mobiliteit en een goede gezondheid. De urine en ontlasting van elke muis waren binnen 1 week na behandeling met Xiaoyao-pillen weer normaal. Er waren geen beten, wondinfecties, gastro-intestinale obstructie, loslating van de hechting, huidnecrose van de incisie of dood van een van de muizen. De muizen in de OVX-groep waren vatbaar voor haaruitval, donkerder worden van de haarkleur, verminderde mobiliteit, langere reflexen, verhoogde uitscheiding en minder eten en drinken.
HE-kleuring van pathologische secties van muizen na medicamenteuze interventie
In de Sham-groep was het dijbeenweefsel dicht, reticulair en regelmatig gerangschikt. De grootte en continuïteit van de beenmergholte was normaal en de afstand tussen aangrenzende bottrabeculae was relatief klein. Vergeleken met de Sham-groep vertoonden de femurcortex en het poreuze bot in de OVX-groep duidelijke defecten, verminderde trabeculae, verhoogde openingen, onderbroken continuïteit, dunner worden van de structuur, verbreding van de mergholte en dunner worden van de botcortex. Vergeleken met de OVX-groep leken de femurtrabeculae van de muizen in de met geneesmiddelen behandelde groepen (lage en hoge doses) structureel intact, met verminderde afstand, verhoogde connectiviteit, vernauwde beenmergholten en dichtere structuren (Figuur 5A).
Detectie van beeldvormingsindices bij muizen na medicamenteuze interventie
In vergelijking met de Sham-groep hadden de dijbenen van muizen in de OVX-groep schaarse en gebroken bottrabeculae en verdunde botcortex. Vergeleken met de OVX-groep hadden de muizen in de groep met hooggedoseerde Xiaoyao-pillen minder gebroken bottrabeculae, herstelde reticulatie en een significante mate van gedeeltelijke verkleining van de beenmergholte. De muizen die met een lage dosis Xiaoyao-pillen werden behandeld, hadden echter nog steeds gebroken bottrabeculae, hoewel er sprake was van verhoogde bottrabeculae en een verkleining van de beenmergholte. De trabeculaire structuur van de bottrabeculae van de schijngeopereerde groep vertoonde meer continuïteit en volledigheid (Figuur 5B).
Immunohistochemische resultaten van weefsels in de groepen na medicamenteuze interventie
Act1 en IL-6 zijn sleuteleiwitten in de IL-17-signaleringsroute, en ALP en COL-1 zijn osteogene genen. Expressie van ALP-, COL-1-, IL-6-, IL-17- en Act1-eiwitten leidt tot de vorming van bruine of gele korrels op botweefsel. Immunohistochemische resultaten toonden aan dat de gemiddelde optische dichtheidswaarden van ALP en COL-1 in de geneesmiddelgroep hoger waren dan die in de OVX-groep na behandeling met Xiaoyao-pillen, en het verschil was statistisch significant (p < 0,05). De gemiddelde optische dichtheidswaarden van IL-17, Act1 en IL-6 in de geneesmiddelgroep waren lager dan die in de OVX-groep, en het verschil was statistisch significant (p < 0,05; Figuur 6). Xiaoyao-pillen keerden de afname van ALP en COL-1 veroorzaakt door ovariëctomie om, terwijl ze de expressie van verschillende belangrijke eiwitten IL-17, IL-6 en Act1 in de IL-17-signaleringsroute verminderden, wat suggereert dat het medicijn zijn therapeutische effecten via deze route kan uitoefenen.

Figuur 1: Netwerkanalyse van de kruising van actieve ingrediënten uit de Chinese kruidengeneeskunde en ziektegerelateerde genen. (A) De kruising van ziektegerelateerde genen, verkregen uit de GeneCards-, OMIM-, PharmGkb-, TTD- en DrugBank-databases. Deze worden vertegenwoordigd door blauwe, rode, groene, gele en bruine kleuren met respectievelijk 1692, 35, 3, 33 en 386 genen. De kruising zijn de ziekte-geassocieerde genen in de vijf databases, en het overlappende deel geeft het aantal kruisende genen in elke database aan. (B) De kruising van de geneesmiddeldoelen (waarbij de blauwe kleur deze dataset aangeeft, d.w.z. de set geneesmiddelwerkende doelwitgenen die in de TCMSP-database zijn verzameld na ID-transformatie en verwijdering van duplicaten) en ziektegerelateerde genen (waarbij de rode kleur deze dataset aangeeft, die alle genen uit de vijf hierboven genoemde databases bevat) wordt weergegeven. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: Interactie van actieve ingrediënten van TCM met ziektegerelateerde genregulerende netwerken en kerneiwitten. (A) Het regulerende netwerk van actieve ingrediënten en ziektegerelateerde genen in TCM toont de genregulerende relaties die overeenkomen met elk actief ingrediënt in de Xiaoyao-pillen, waarbij elk ingrediënt is gekoppeld aan het gen dat het reguleert. (B) De resultaten van de analyse van eiwit-eiwitinteractie van kruisende genen in STRING (de netwerkknooppunten vertegenwoordigen eiwitten, randen vertegenwoordigen eiwit-eiwitassociaties en meerdere bindingen duiden op meerdere interacties tussen twee eiwitten). (C-E) De eiwitinteracties die door String werden verkregen, werden verschillende keren gescreend. (C) Het eiwitinteractienetwerk werd verkregen na de eerste screening en het gemarkeerde deel is het kerngedeelte. (D) Het resultaat van de tweede screening en het gemarkeerde deel is het kerndeel. (E) Het meest centrale eiwitinteractienetwerk in het eiwitinteractienetwerk. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3: GO- en KEGG-verrijkingsanalyse. (A-B) De resultaten van GO-verrijkingsanalyse van kruisende genen zijn onderverdeeld in 3 ingangen, Biologisch Proces (BP), Cellulaire Component (CC) en Moleculaire Functie (MF), en elke vermelding toont alleen de top 10 van meest significant verrijkte genen. (C-D) De resultaten van KEGG-verrijkingsanalyse van de kruisende genen (met de top 30 van meest significant verrijkte). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4: Opstelling en evaluatie van het model voor ovariëctomie van muizen. (A) Vergelijking van de metafysaire botmorfologie tussen de nep-geopereerde en de ovariëctomie-groepen (10x). In de OVX-groep waren de trabeculaire fracturen ernstig, de continuïteit was verstoord en de beenmergholte was aanzienlijk vergroot, terwijl in de schijngroep de trabeculaire fracturen zeldzaam waren en de beenmergholte normaal van grootte was. (B) Micro-CT-scans van het dijbeen in de groepen die werden geopereerd en geoperiëctomieën. In de OVX-groep was het trabeculaire netwerk onvolledig en was de beenmergholte gedeeltelijk leeg. In de Sham-groep waren de trabeculae overvloedig en continu, en de beenmergholte was smal. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 5: HE en micro-CT assay na behandeling met de Xiaoyao pillen. (A) HE-kleuring (10x) van dijbeensecties van muizen in elke groep na de behandeling met Xiaoyao-pillen. In de OVX-groep waren de bottrabeculae verminderd, werd de continuïteit onderbroken, was de structuur schaars en werd de mergholte vergroot. In de Sham-groep hadden de bottrabeculae een goede continuïteit, het dijbeenweefsel was structureel dicht en de beenmergholte was normaal. Vergeleken met de OVX-groep leken de bottrabeculae in de geneesmiddelgroep structureel intact, met verhoogde connectiviteit, een verminderde beenmergholte en een dichtere structuur dan in de modelgroep. (B) Vergelijking van micro-CT van dijbenen van muizen in elke groep na behandeling met Xiaoyao-pillen. De bottrabeculae in de dijbenen van muizen in de groep met ovariëctomie waren schaars en gebroken, terwijl de Sham-groep meer continue en intacte trabeculae had. Vergeleken met de groep met ovariëctomie hadden muizen in de groep met een hoge dosis medicamenteuze behandeling minder gebroken bottrabeculae, herstelde de reticulaire structuur en gedeeltelijk verminderde beenmergholte, terwijl de dieren in de groep met een lage dosis geneesmiddelen meer bottrabeculae en verminderde beenmergholte hadden, maar de gebroken bottrabeculae bleven. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 6: Immunohistochemie om het effect van Xiaoyao-pillen op de IL-17-signaleringsroute en osteogene markergeneiwitexpressie bij osteoporotische muizen te detecteren (40x). Positieve reacties voor de aanwezigheid van ALP-, COL-1-, IL-6-, IL-17- en Act1-eiwitten manifesteerden zich door het verschijnen van bruine of gele korrels op botweefsel. De expressie van ALP en COL-1 in de medicijngroep was hoger dan die in de OVX-groep (p < 0,05). De expressie van IL-17, Act1 en IL-6 in de geneesmiddelgroep was lager dan die in de OVX-groep (p < 0,05). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
| Naam van Traditionele Chinese geneeskunde | Moleculair ID | Naam van het molecuul |
| Witte paeonia lactiflora | MOL001918 | paeoniflorgenone |
| Witte paeonia lactiflora | MOL000211 | Kanton Mairin |
| Atractylodes macrocephala | MOL000022 | 14-acetyl-12-senecioyl-2E,8Z,10E-atractylentriol |
| Atractylodes macrocephala | MOL000049 | 3β-acetoxyatractylon |
| Menthae Herba | MOL000471 | Aloë-emodine |
| Menthae Herba | MOL005190 | Eriodictyol |
| Chai Hu | MOL000354 | Isorhamnetin |
| Chai Hu | MOL013187 | Cubebin |
| Sinensis van engelwortel | MOL000449 | Stigmasterol |
| Sinensis van engelwortel | MOL000358 | bèta-sitosterol |
| Poria cocos | MOL000282 | ergosta-7,22E-dien-3beta-ol |
| Poria cocos | MOL000283 | Ergosterol peroxide |
| Drop | MOL002311 | Glycyrol |
| Drop | MOL004990 | 7,2',4'-trihydroxy - 5-methoxy-3 - arylcoumarine |
| Verse gember | MOL006129 | 6-methylgingediacetaat2 |
| Verse gember | MOL001771 | poriferast-5-en-3beta-ol |
Tabel 1: Actieve ingrediënten in geselecteerde Chinese medicijnen. De eerste kolom bevat de namen van traditionele Chinese medicijnen, de tweede kolom is de ID van het actieve ingrediënt van de Chinese geneeskunde en de derde kolom is de naam van het actieve ingrediënt in de Chinese geneeskunde.
Aanvullend coderingsbestand 1: Kruidennaam, ingrediënt en doel-ID-samenvoegcode. Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullend coderingsbestand 2: Conversie van doel-ID's voor geneesmiddelen. Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullend coderingsbestand 3: Bestanden voor netwerkanalyse. Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullend coderingsbestand 4: Conversie van symbool naar gen-ID. Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullend coderingsbestand 5: GO-verrijkingsanalyse. Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullend coderingsbestand 6: KEGG-verrijkingsanalyse. Klik hier om dit bestand te downloaden.