$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Veranderingen in TMV in exciteerbare cellen in vitro veroorzaakt door elektrische pulsen kunnen met dit protocol optisch worden gevolgd en de fluorescentiesignalen kunnen worden geanalyseerd om hun relevante parameters te extraheren.
De experimentele opstelling is weergegeven in figuur 1A. Een typisch signaal van 100 μs elektrische puls dat in experimenten wordt gebruikt, wordt weergegeven in figuur 1B. Cellen in de kamers die onder de microscoop worden geplaatst, zien er meestal uit als de cellen in Figuur 1C (helderveldbeeld) en Figuur 1D (fluorescentiebeeld). We voeren een experiment uit waarbij elke 2 minuten een elektrische puls met toenemende spanning op dezelfde cellen wordt toegepast. Houd er rekening mee dat de interpulsatietijd van 2 minuten mogelijk niet lang genoeg is om de celmembranen volledig opnieuw af te sluiten en te herstellen, vooral bij gebruik van pulsen met de hoogste amplitude, die gepaard gaan met prominente elektroporatie. Er kunnen dus enkele cumulatieve effecten van de pulsen worden verwacht. Om deze cumulatieve effecten te voorkomen, kan de interpulsvertraging worden verlengd, maar ten koste van het verminderen van het aantal geteste pulsamplitudes en het voorkomen dat de cellen te lang op de microscoop worden gehouden.
Na het vastleggen van fluorescentiebeelden in experimenten, analyseert u ze met de aangepaste MATLAB-applicatie. Bepaal eerst de pixeldrempels (Figuur 2A); Door de lage drempel aan te passen, krijgen we een duidelijk beeld van de membranen rond de cellen (in paars), en door de hoge drempel aan te passen, verwijderen we het signaal van puin (groen). De applicatie bepaalt vervolgens de gemiddelde fluorescentie-intensiteit van alle drempelpixels voor elke afgeleverde opeenvolgende puls om een tijdsafhankelijk signaal te verkrijgen van de relatieve verandering in fluorescentie F/F0. Dit signaal wordt gecorrigeerd voor fotobleken van kleurstof door de helling van de lineaire afname van F af te trekken van de time-lapse-registratie van de controle waarin geen puls werd toegepast (Figuur 2B). Na het corrigeren van het signaal worden de parameters van de reacties geëxtraheerd in de vorm van een in-app-tabel en een grafiek van het gecorrigeerde fluorescentiesignaal (Figuur 2C). In zeldzame gevallen detecteert het algoritme geen duidelijke piek of detecteert het valse ruissignalen als valse positieven. In deze gevallen heeft de gebruiker de mogelijkheid om handmatig het overeenkomstige punt in het fluorescentiesignaal als piek te selecteren of om de gedetecteerde valse piek te verwijderen (Figuur 2D - verwijdering van een kleine piek die abnormaal werd gedetecteerd voordat de elektrische puls werd toegepast).
Door de MATLAB-applicatie te gebruiken, kunnen we beelden krijgen van TMV-responsen op elektrische pulsen in zowel exciteerbare S-HEK- (Figuur 3A) als niet-exciteerbare NS-HEK-cellen (Figuur 3B). De volgende responsparameters worden geëxtraheerd (Tabel 1): aantal pieken (NoPeaks), gemiddelde piek-tot-piektijd (wanneer meer dan één piek wordt gedetecteerd, MPPT), maximale respons (MR), tijd tot eerste piek (TtFP) en tijd van piek tot 25%, 50%, 75% en 90% herstel (respectievelijk T25, T50, T75, T90). Deze parameters maken de evaluatie mogelijk van reacties op verschillende elektrische pulsen (bepalen bijvoorbeeld het aantal pieken dat wordt veroorzaakt door elektrische pulsen van verschillende E, Figuur 3C) en het samenspel tussen excitatie en elektroporatie.

Figuur 1: De opstelling, golfvorm en S-HEK-cellen. (A) Het beeld van de kamer op de microscooptafel. (B) Voorbeeld van de golfvorm van een puls die in het onderzoek is gebruikt (spanning (U) in de tijd). (C, D) De afbeelding van S-HEK-cellen ((C): helderveld, (D): fluorescentie), schaalbalk: 100 μm. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: Toepassing van data-analyse. (A) Het beeld van de applicatie-interface - drempelwaarde. (B) De grafiek van het ruwe en gecorrigeerde signaal van fluorescentieverandering. (C) De afbeelding van de applicatie-interface - geëxtraheerde gegevens. (D) Handmatige correctie van de piekdetectie (verwijdering van een kleine piek die abnormaal werd gedetecteerd voordat de elektrische puls werd toegepast, gemarkeerd met een rode pijl). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3: Representatieve resultaten. (A, B) Triggerende veranderingen in TMV in (A) exciteerbare S-HEK en (B) niet-exciteerbare NS-HEK met 100 μs elektrische pulsen van verschillende amplitudes, resultaten van representatieve experimenten. Voor de duidelijkheid: alleen reacties op geselecteerde pulsen in de toegepaste pulssequentie worden weergegeven. (C) De parameters van TMV-responsen die worden geactiveerd door de pulsen van 100 μs met verschillende amplitudes: Voorbeeld toont het aantal pieken. De resultaten worden uitgedrukt als gemiddelde ± SE, aantal experimenten: N = 13. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
| Index | E-sterkte (V/cm) | Geen pieken (-) | MPPT (mevrouw) | MENEER (-) | TtFP (mevrouw) | Straat 25 (mevrouw) | T50 (mevrouw) | T75 (mevrouw) | T90 (mevrouw) |
| 1 | 0 | | | | | | | | |
| 2 | 126 | 9 | 224 | 0.104 | 360 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 3 | 150 | 6 | 354 | 0.097 | 108 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 4 | 176 | 2 | 144 | 0.089 | 36 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 5 | 200 | 1 | | 0.075 | 0 | 108 | 144 | 180 | 252 |
| 6 | 250 | 2 | 396 | 0.064 | 0 | 108 | 216 | 432 | 2052 |
| 7 | 300 | 1 | | 0.059 | 0 | 180 | 1188 | 2448 | |
| 8 | 350 | 1 | | 0.053 | 0 | 1008 | 2340 | | |
| 9 | 400 | 1 | | 0.047 | 0 | 1512 | | | |
Tabel 1: Parameters van TMV-responsen veroorzaakt door de 100 μs-pulsen met verschillende amplitudes.