Het huidige rapport beschrijft de procedure voor het uitvoeren van in vivo PET-beeldvorming van muizen met de BCAM-mallen en het analyseren van gegevens met de geautomatiseerde SaaS-tool. Er worden stapsgewijze instructies gegeven over het voorbereiden van muizen, het verzamelen van beeldvorming en gegevensverwerking. Deze automatiseringsworkflow leverde ook gegevens op die consistent waren met handmatige analyse. Hieronder worden enkele belangrijke technische overwegingen toegelicht.
Hoewel een tumor niet een van de organen is die door de OPM worden gedefinieerd, is een cruciale stap in dit protocol de juiste implantatie van onderhuidse tumoren om uiteindelijk te zorgen voor een optimale uitlijning van alle muizenorganen in de lichaamsholte en BCAM. De OPM kan alleen nauwkeurige gegevens produceren als de ruggengraat van een muis relatief recht is en de inwendige organen neutraal gepositioneerd zijn. Te grote of misplaatste tumoren kunnen de houding van de muis beïnvloeden en in zijn lichaamsholte drukken, waardoor de inwendige organen verschuiven. Deze verschuiving zal op zijn beurt de resulterende kwantitatieve analyse van het OPM-algoritme vertekenen. Anderen hebben de impact gemeld van een niet-rechte wervelkolom op de uitlijning van inwendige organen met behulp van verschillende beeldvormingsmodaliteiten en segmentatie-algoritmen13,14. Daarom is het van cruciaal belang om de sjabloon te gebruiken om de implantatie van tumoren te begeleiden en de tumorgroei nauwlettend te volgen om ervoor te zorgen dat de tumoren zowel goed gepositioneerd zijn als in het ideale groottebereik.
Een ander gebied van mogelijke afwijking is de selectie van een BCAM met de juiste grootte. BCAM's worden gemaakt in integralen van 2 g, met een bereik van 18-26 g. Aangezien muizen met verschillende lichaamssamenstellingen (bijv. meer spieren versus meer vet) hetzelfde lichaamsgewicht maar verschillende fysieke afmetingen kunnen hebben, is het echter belangrijk om de meest geschikte BCAM te kiezen terwijl u hun lichaamsgewicht als algemene referentie gebruikt. Ga met vallen en opstaan naar boven of naar beneden en houd er rekening mee dat een goede uitlijning van cruciaal belang is. Als u een BCAM kiest die te groot is, zullen de inwendige organen van de muis dichter bij de bodem van het bed 'zinken', wat met name van invloed zal zijn op de nauwkeurigheid van de analyse van de dorsale organen zoals de nieren en de wervelkolom. Daarentegen kan het plaatsen van een te kleine muis in BCAM op hun lichaamsholten drukken, de positie van organen scheef trekken en mogelijk ademhalingsmoeilijkheden veroorzaken. Het gebruik van tape om ervoor te zorgen dat ledematen op pootplatforms worden vastgezet, zal helpen bij het instellen en positioneren.
Hoewel deze gerapporteerde workflow gestandaardiseerde en geautomatiseerde PET-beeldanalyse mogelijk maakt, is het de moeite waard om erop te wijzen dat de huidige OPM is geconstrueerd op basis van de immunocompetente C57BL/6-muizenstam en gezonde muizen. Andere stammen en gezondheidsproblemen van muizen kunnen verschillende anatomische kenmerken vertonen die extra aanpassing, optimalisatie en validatie van het algoritme vereisen. Immuundeficiënte stammen zoals NSG of NCG hebben bijvoorbeeld kleinere milten. Evenzo kunnen muizen met orthotope tumorimplantaten verschillende maten, vormen en locaties van inwendige organen hebben, afhankelijk van hun ziektestatus. Een andere beperking van deze workflow is de algehele doorvoer tijdens de acquisitiefase van een experiment. Dit komt vooral door de extra tijd die nodig is om een muis goed in te stellen in de BCAM. Training en oefening kunnen de efficiëntie van de operator bij de juiste plaatsing verhogen. De toevoeging van een tweede dockingstation kan ook de algehele doorvoer verhogen, waarbij het ene dock kan dienen voor BCAM-installatie en het andere kan dienen voor het verwijderen van een muis naar een herstelkooi. Desalniettemin, zelfs met de langere tijd die nodig is voor de BCAM-installatie voorafgaand aan het scannen, loont de investering in tijd door tijd te besparen op het gebied van gegevensanalyse. In het huidige onderzoek duurde het bijvoorbeeld minder dan 10 minuten voordat de OPM tien afbeeldingen had geanalyseerd (met 4 ROI's), terwijl het 3-4 uur duurde voordat een zeer ervaren analist dezelfde set afbeeldingen en ROI's handmatig had gesegmenteerd en geanalyseerd. Een onervaren analist zou nog meer tijd nodig hebben voor handmatige analyse. Het SaaS-platform maakt de analyse van PET-scans in grote batches mogelijk, waarbij de volledige in vivo biodistributieanalyse binnen enkele minuten na het uploaden van de gegevens kan worden voltooid. Dit is een uiterst nuttige functie bij het verwerken van grote hoeveelheden gegevens uit meerdere groepen en/of over verschillende tijdstippen, zoals hieronder wordt besproken.
Handmatige segmentatie van organen voor een enkel onderwerp kan tijdrovend zijn en vereist meestal een aanzienlijke training vooraf van de operator. Zelfs met de juiste training hebben handmatige analyses onvermijdelijk te maken met variabiliteit tussen operators, wat de kwantitatieve resultaten kan vertekenen15,16. Geautomatiseerde segmentatie en gegevensanalyse daarentegen kunnen de algehele biodistributie van een radiotracer nauwkeurig en efficiënt bepalen en variabiliteit elimineren die zijn geworteld in menselijke operaties. Dergelijke voordelen van automatisering zijn zowel gezien bij de analyse van klinische beelden als in de preklinische ruimte. Sluis et al. toonden bijvoorbeeld aan dat een enkele scan 4 uur nodig had om de organen van belang te segmenteren, vergeleken met 30 minuten met AI-cloudgebaseerde methoden17. Een andere studie van Nazari et al. meldde ook dat op algoritmen gebaseerde analyse van de lever en de nieren nauwkeurige resultaten liet zien binnen 7,0% in vergelijking met twee menselijke medische fysici18. De gegevens in figuur 4 toonden ook duidelijk de betrouwbaarheid van de SaaS-gebaseerde workflow voor PET-beeldvormingsanalyse, en dat geautomatiseerde analyse consistente resultaten opleverde in vergelijking met handmatige analyse.
Samenvattend illustreert dit artikel de workflow van het gebruik van BCAM-mallen om gestandaardiseerde preklinische PET/CT-beeldacquisitie en SaaS-compatibele geautomatiseerde PET-gegevensanalyse mogelijk te maken. Het is aangetoond dat deze platformtechnologie relatief eenvoudig te gebruiken is en dat de kwaliteit van door automatisering gegenereerde gegevens consistent is met handmatige analyse, maar aanzienlijke tijdbesparende voordelen biedt. Daarom kan deze workflow onderzoekers honderden uren aan data-analysetijd besparen en helpen bij het standaardiseren en verminderen van de variabiliteit tussen operators. Deze procedure kan helpen bij de ontwikkeling van een groot aantal geneesmiddelen in verschillende modaliteiten en indicaties. Met name modaliteiten met grote moleculen, zoals therapeutische antilichamen, bispecifieke antilichaam-immuuncel-engagers, antilichaam-geneesmiddelconjugaten en zelfs nanodeeltjes, kunnen gemakkelijk worden gelabeld met radiometalen (bijv. Zr-89, Cu-64) om PET-beeldvorming-gemedieerde biodistributiebeoordeling mogelijk te maken19,20. Op dezelfde manier kan deze platformtechnologie helpen bij het bepalen van de dosimetrie van nieuwe radiotherapieën bij muizen21. De toepassing van deze procedure zal een grote toegevoegde waarde zijn voor de ontwikkeling van geneesmiddelen.