De procedures waarbij dieren betrokken waren, werden uitgevoerd in overeenstemming met de wetten van de Verenigde Staten en de voorschriften van het ministerie van landbouw. Alle experimenten met dieren werden uitgevoerd volgens protocollen die zijn goedgekeurd door de Animal and Care and Use Committee van het National Eye Institute van de National Institutes of Health. Mannelijke en vrouwelijke 13-lijnige grondeekhoorns (leeftijd 6-8 maanden) die in deze studie werden gebruikt, werden gekocht van de Oshkosh Squirrel Colony van de Universiteit van Wisconsin. Muizen (rd10: 1 maand, CX3CR1GFP/+: 6,5 maanden) die in dit onderzoek zijn gebruikt, zijn gefokt in onze dierfaciliteit. Dieren en hun kooien werden willekeurig geselecteerd en toegewezen aan experimentele groepen.
1. Voorbereiding van het prototype platform en aangepaste behandelingstunnel
OPMERKING: Ronde platte platforms worden vaak gebruikt in systemen die zijn ontworpen om de optomotorische respons13 te meten. Hyperactieve knaagdiermodellen, zoals eekhoorns, hebben echter vaak moeite om de stabiliteit op deze platforms te behouden. Dit ontwerp biedt een semi-afgesloten ruimte, waardoor de dieren snel wennen en angstachtig gedrag wordt verminderd. Deze verbetering verbetert het vermogen van het dier om zich te concentreren en minimaliseert gevallen van onbalans of vallen tijdens opnames.
- Ontwerp in CAD-tekensoftware (bijv. OpenSCAD of FreeCAD) het platform (grijs) en de behuizing (rood) zoals weergegeven in afbeelding 1.
- Zorg ervoor dat de belangrijkste afmetingen voor het eekhoornplatform behouden blijven, zoals de lengte en breedte (L x B): 129 mm x 81 mm, de dikte: 7 mm en de hoogte van de muur die zich rond de omtrek uitstrekt: 8 mm. Gebruik het meegeleverde gratis CAD-standaarddocumentbestand voor het prototypeplatform (eekhoorn) dat in deze proof-of-concept-studie is gebruikt (aanvullend coderingsbestand 1).
- Zorg ervoor dat de belangrijkste afmetingen voor de verwijderbare bovenbehuizing (van boven naar beneden) behouden blijven, zoals de lengte (119.5 cm) en breedte (76.2 cm), de hoogte van de zijkanten (50.8 mm) en de dikte van het onderdeel (3 mm). Gebruik het meegeleverde gratis CAD-standaarddocumentbestand om de verwijderbare bovenbehuizing (eekhoorn) te repliceren die in deze proof-of-concept-studie is gebruikt (aanvullend coderingsbestand 2).
- Pas de diameter van het doorlopende gat in de basis van het platform indien nodig aan om te passen op het voetstuk dat wordt gebruikt om het platform omhoog te brengen. De afgebeelde diameter is 40 mm.
- Print het platform met een wit ondoorzichtig filament. Dit zorgt voor een maximaal contrast voor de camera, waardoor de trackingsoftware de contouren van het dier op het platform correct kan detecteren.
- Print de verwijderbare bovenbehuizing met ondoorzichtig donker filament (bijv. rood). Dit geeft een gevoel van beschutting voor de knaagdieren, wat het gemakkelijker maakt om ze de tunnel in te leiden voordat ze worden opgetild en naar de arena worden overgebracht.
- Laat een machinist de met acryl geëxtrudeerde doorzichtige vierkante buis met een tafelzaag snijden zodat het lange uiteinde ~ 101,6 mm lang is. Zorg ervoor dat u een oogbescherming en een duwstok gebruikt om het acryl door het mes te leiden en uw handen te beschermen tegen mogelijk letsel.
- Verwijder met behulp van de tafelzaag of een handbediend roterend gereedschap dat is uitgerust met een slijpschijf een van de lange rechthoekige vlakken. Hierdoor ontstaat een open bovenkant waardoor de hierboven gemonteerde camera een onbelemmerd zicht heeft op de positie en hoofdbewegingen van het dier.
- Maak alle randen schoon met een handvijl of schuurpapier. Monteer de aangepaste behandelingstunnel met behulp van de Acrylic Extruded Clear Square Tube die op lengte is gesneden met de 3D-geprinte verwijderbare bovenbehuizing door de behuizing op het open oppervlak te plaatsen.
2. Het opzetten van de OMR-arena
- Desinfecteer het platform en de vierkante buisbehuizing met een reinigingsmiddel/ontsmettingsmiddel voor en tussen de dieren om ongewenste olfactorische signalen te verwijderen.
OPMERKING: Hoewel leren handschoenen worden gebruikt om de dieren vast te pakken en in direct contact met hen te komen, worden ze niet gedragen tijdens de opnames en veroorzaken ze geen blijvende of waarneembare verstorende effecten.
- Scheur een klein stukje keukenpapier van ongeveer 50 mm x 50 mm en vouw het om het bovenoppervlak van het voetstuk te bedekken. Plaats het 3D-geprinte platform op het voetstuk (14 inch hoog) met het stuk keukenpapier op zijn plaats.
OPMERKING: Het papier past de perspassing van het platform aan, voorkomt onbedoelde beweging, zorgt voor een uniforme witte achtergrond voor beeldvorming (als het oppervlak van het voetstuk niet wit is) en fungeert als een absorberende laag voor het geval het dier tijdens de opname plast, waardoor wordt voorkomen dat het platform glad wordt.
- Draag leren werkhandschoenen en leid het dier voorzichtig in de vierkante buisbehuizing.
- Breng het dier over naar de arena door de omheining op het platform te plaatsen (Figuur 1J).
- Maak voorzichtig de verwijderbare bovenbehuizing los en laat het dier in de met acryl geëxtrudeerde, doorzichtige vierkante buis op het platform. Sluit de deur naar het OMR-systeem
3. Instellen van de OMR-softwareparameters
OPMERKING: Het afgebeelde OMR-systeem maakt gebruik van een compacte industriële camera met een IR-gevoelige 1/3" CMOS-sensor met een globale sluiter van 25 frames per seconde (fps). De camera is uitgerust met een F1.6 groothoeklens, waardoor een volledig bovenaanzicht van de arena mogelijk is. Voorlopige gezichtsscherptetests uitgevoerd op eekhoorns met behulp van de standaard 100% contrastinstelling toonden aan dat de gezichtsscherpte van de eekhoorns de resolutielimieten van de hardware overschreed. De 23,8" full HD In-Plane Switching-schermen die in de opstelling zijn gebruikt, hebben een resolutie van slechts 1920 pixels breed en de software is daarom hardgecodeerd met een maximale ruimtelijke frequentie van 2 cyc/°. Ter vergelijking: de gezichtsscherpte van C57Bl/6-muizen is ongeveer 0,3-0,5 cyc/°. Bij 2 cyc/° is elke streep gemiddeld 5,3 pixels breed. Met een rotatiesnelheid van 12°/s en een framesnelheid van 60 frames per seconde verschuift het patroon met 0,2° per frame, wat overeenkomt met 4,2 pixels per frame, uitgaande van een uniforme pixelsnelheid. Bij ruimtelijke frequenties in de buurt van 2 cyc/° nadert het streeppatroon de resolutielimiet waar aliasing kan optreden, waardoor het patroon lijkt alsof het achteruit beweegt. Om dit artefact te voorkomen, is de software hard gecodeerd om de ruimtelijke frequentie te beperken tot 2 cyc/°.
Daarom hebben we voor eekhoorns een protocol bedacht waarbij we de scherptetest uitvoeren, maar met een veel lager contrast. We kozen een contrastinstelling (12,78%) waarbij de eekhoorns het gestreepte patroon niet konden zien bij 2 cycli/°.
- Zorg er in het live videopaneel voor dat het dier zich goed aanpast aan de nieuwe omgeving en minder begint te bewegen en kalmeert.
- Bij 2 cyc/° is elke streep gemiddeld 5,3 pixels breed. Stel de rotatiesnelheid in op 12°/s en een framesnelheid van 60 frames per seconde; Het patroon verschuift met 0,2° per frame, wat overeenkomt met 4,2 pixels per frame, uitgaande van een uniforme pixelsnelheid. Stel de ruimtelijke frequenties in op 2 cyc/°, zodat het streeppatroon de resolutielimiet nadert waar aliasing kan voorkomen, waardoor het patroon lijkt alsof het achteruit beweegt. Om dit artefact te voorkomen, codeert u de software hard om de ruimtelijke frequentie te beperken tot 2 cyc/°.
LET OP: Voor eekhoorns hebben we een protocol bedacht waarbij we de scherptetest uitvoeren, maar met een veel lager contrast. We kozen een contrastinstelling (12,78%) waarbij de eekhoorns het gestreepte patroon niet konden zien bij 2 cycli/°.
- Download aanvullend coderingsbestand 3. Open de OptoDrum-software.
- Klik op het tabblad Instellingen op Instellingen importeren. Laad het aanvullende coderingsbestand 3.
- Stel op het tabblad Instellingen de verschuiving van de achtergronddrempel in op 17, de minimale diergrootte [px] op 30 en de maximale staartbreedte [% van de grootte] op 1.
- Laat onder camera-instellingen Video omkeren en Handmatige camerabediening uitgeschakeld en IR-licht uit.
- Verbreed de positie en grootte van het interessegebied voor tracking om de eekhoorn te huisvesten als deze buiten de opening van de buis leunt. De voorgestelde waarden zijn Positie: X: 359, Y: 237, Maat: X: 570, Y: 455. Verleng de ROI niet over het Stimuli-scherm, omdat dit kan leiden tot valse positieven.
- Selecteer Sessieconfiguratie in het bovenpaneel (Afbeelding 2A).
- Stel voor de trap de geschatte ruimtelijke scherpte als volgt in. Stel de verwachte scherpte in op 1.800 cyc/° (648 cycli); stel de optimale stimulusresolutie in op 0,5 cyc/° (180 cycli); Stel de meetresolutie in op 0,100 cyc/° (36 cycli).
- Stel voor de trap het aantal benodigde bevestigingen als volgt in. Ingesteld voor mislukte proeven op 3; ingesteld voor succesvolle proeven tot 2.
OPMERKING: Het aantal succesvolle onderzoeken kan worden verhoogd om het aantal vals-positieve bevestigingen verder te verminderen. Met het gebruik van dit platform en de aangepaste afhandelingstunnel blijft het foutenpercentage echter acceptabel laag. Dit is voornamelijk te wijten aan de relatieve stilte van de eekhoorns en de onregelmatige beweging van het hoofd, afgezien van de bewegingen die worden uitgelokt door visueel opgeroepen stimuli.
- Stel onder het tabblad Trap (Afbeelding 2B) antialiasing in op breedte op 3 px en laat sinusvormig uitgeschakeld.
- Vergrendel voor de testcriteria het contrast op 12.78% en vergrendel de rotatiesnelheid op 12 °/s.
OPMERKING: Bij de contrastinstelling van 12,78% is de ruimtelijke scherpte van de eekhoorns beperkt tot ongeveer 1,5-1,8 cyc/°. Deze configuratie overschrijdt de maximale hardware-instellingen niet langer en maakt het mogelijk om de ruimtelijke scherpte te beoordelen als reactie op ziekte of letsel.
- Zodra twee van de drie parameters zijn vergrendeld, wordt de optie Automatisch de parameters instellen actief (niet langer grijs). Vink het vakje aan naast Parameters automatisch instellen.
- Stel de draairichting in afhankelijk van of er een visuele beperking wordt verwacht in één of beide ogen. Merk op dat voor elk oog alleen beweging in de temporale tot nasale richting tracking uitlokt. Beoordeel daarom letsel aan het linkeroog met behulp van stimulatie met de klok mee (CW), aangezien stimulatie tegen de klok in (CCW) naar verwachting normale reacties zal uitlokken. Voor degeneratie of letsel dat in beide ogen wordt verwacht, kan rotatie van de stimulus in beide richtingen worden gebruikt.
- Klik op Proef starten om de presentatie van de stimulus te starten. De camera hierboven begint met het registreren en volgen van de hoofdbewegingen van de dieren. Terwijl de stimulus wordt gepresenteerd, klikt u op het tabblad Analyse voor real-time weergave van de parameters Hoeksnelheden (hoofdrotatie), Trackkwaliteit en Score. Aan het einde van elke stimuluspresentatie zal de software automatisch bepalen of er moet worden overgegaan (aangegeven door het groene vinkje) naar de volgende Cyc/°, de proef moet worden herhaald of de Cyc/° moet worden verlaagd (aangegeven door de rode X).
- Als de trackingsoftware tijdens de opname de neus- (rode) en staartmarkeringen (groen) ten onrechte omdraait, drukt u op Ctrl op het toetsenbord om handmatige override toe te staan om de kop-staartoriëntatie te corrigeren.
- Als het dier van het platform valt, pauzeer je de proef door op Evaluatie pauzeren te drukken of op de spatiebalk te klikken. Verwijder de behandelingstunnel van het platform en gebruik deze met het deksel voor een veilige hantering van het dier om het terug op het platform te plaatsen. Zodra het dier klaar is, klikt u op Evaluatie hervatten om de proef voort te zetten.
- Zodra alle onderzoeken zijn voltooid, klikt u op het tabblad Samenvatting om de succesvolle onderzoeken in het groen en de niet-succesvolle onderzoeken in het rood weer te geven. De groen omcirkelde proef geeft de gezichtsscherptedrempel voor de eekhoorn aan met een contrast van 12,78%. Breng het dier voorzichtig terug naar zijn thuiskooi.