Dit protocol geeft instructies voor intranasale toediening van IAV en downstream-analyse van longbeschadiging bij muizen en bijbehorende transcriptionele veranderingen in longceltypen.
Methodenartikel
Dit protocol geeft instructies voor intranasale toediening van IAV en downstream-analyse van longbeschadiging bij muizen en bijbehorende transcriptionele veranderingen in longceltypen.
Virale infectie veroorzaakt zowel acute als langdurige schade aan de longblaasjes, de gespecialiseerde weefselstructuur die verantwoordelijk is voor de gasuitwisseling tussen het cardiovasculaire systeem en de externe omgeving. Influenza A-virus (IAV)-infectie bij muizen vertegenwoordigt een translationeel model voor de reactie van de menselijke long op virale infectie en induceert zowel voorbijgaande als aanhoudende veranderingen in de celtoestand in de longblaasjes. In sommige gevallen kunnen afwijkende celtoestanden veroorzaakt door viraal letsel die na verloop van tijd niet worden opgelost, de kritieke gasuitwisselingsfunctie van de long permanent aantasten. Dit artikel demonstreert methoden voor intranasale infectie van muizen met A/PR/8/34 IAV en karakterisering van voorbijgaande en langdurige veranderingen in de cellulaire samenstelling en weefselstructuur van beschadigde longen. Dit model maakt een gedetailleerd onderzoek mogelijk naar de moleculaire en cellulaire mechanismen die ten grondslag liggen aan longherstel en chronische disfunctie. Deze benadering biedt ook een platform voor het evalueren van therapeutische interventies die gericht zijn op het bevorderen van effectieve longregeneratie en het herstellen van de ademhalingsfunctie na viraal letsel.
De longen spelen een cruciale rol bij de toevoer van zuurstof en voedingsstoffen naar lokale weefsels. Endotheelcellen (EC's) die kleine capillaire bloedvaten van de longen bevolken, zijn essentieel voor de goede werking van het longweefsel, het behoud van de vasculaire integriteit en efficiënte gasuitwisseling1. EC's vormen de vasculaire niche en wisselen elkaar samen met andere cellen zoals epitheelcellen, immuuncellen en mesenchymale cellen. Dit draagt bij aan de regulatie van de longontwikkeling en van weefselherstel als reactie op letsel of ziekte2.
H1N1 Influenza A-virusinfectie is een wereldwijd probleem3. Patiënten met een H1N1-infectie worden vaak gediagnosticeerd met exsudatieve diffuse alveolaire schade (DAD)4. Infectie met H1N1 kan leiden tot ernstige longschade en ernstige gevolgen, waaronder longontsteking, ernstig acuut longletsel (ALI) en acuut respiratoir distress syndroom (ARDS)5. De schade komt voornamelijk voort uit het virus dat longepitheelcellen infecteert, wat een overmatige immuunrespons veroorzaakt, wat resulteert in ontsteking, weefselbeschadiging en vochtophoping in de longen. De epitheelcellen langs de luchtwegen en longblaasjes, die verantwoordelijk zijn voor gasuitwisseling, worden dus direct beschadigd door het H1N1-virus, wat leidt tot verstoring van de normale structuur van de long 6,7. Het is duidelijk geworden dat andere celtypen, hoewel niet direct geïnfecteerd door IAV, beschadigd kunnen raken als reactie op infectie 8,9. Weefselbeschadiging na griepinfectie tast daarom alle cellulaire compartimenten van de long aan, en onlangs is aangetoond dat IAV-infectie zowel voorbijgaande als aanhoudende veranderingen in de celtoestand in meerdere cellulaire compartimenten veroorzaakt9. Deze celplasticiteit als reactie op ziekte kan nuttig of schadelijk zijn voor succesvol weefselherstel en rechtvaardigt verder onderzoek.
Het meest gebruikte experimentele model voor het bestuderen van influenza en de pathogenese ervan is intranasale infectie van muizen met influenzavirus A/PR/8/3410. Het is een belangrijke techniek die het mogelijk maakt om de ernst van de ziekte, mortaliteit en virale besmettelijkheid te bestuderen. Intranasale infectie van muizen bootst de natuurlijke infectieroute bij mensen na en maakt de studie van zowel adaptieve als aangeboren immuunresponsen tegen het virus mogelijk. In 1934 werd een specifieke stam van het Influenza A-virus "A/PR/8/34" geïsoleerd uit een patiënt in Puerto Rico11. Deze stam van het griepvirus is nu aangepast aan de muis en infecteert mensen niet langer productief. Vanwege de overeenkomsten in het immuunsysteem van muizen en mensen zijn muizen het meest populaire diermodel voor IAV-onderzoek12. Bij deze methode wordt de A/PR/8/34 H1N1-stam rechtstreeks via de neusgaten aan muizen toegediend, waardoor een natuurlijke infectie wordt nagebootst13. Het is een gemakkelijke, kosteneffectieve en handige methode om de effecten van virale infectie op het longweefsel van de gastheer te bestuderen in zowel wildtype (WT) als knock-out (KO) omstandigheden. Alternatieve technieken hebben voor- en nadelen ten opzichte van het intranasale model. Intratracheale (IT) inoculatie maakt nauwkeurige afgifte van het virus in de longen mogelijk, maar deze techniek bootst infectie door inademing niet volledig na en geeft geen informatie over toxiciteit in de bovenste luchtwegen. IT-inoculatie vereist ook grote vaardigheid om het risico op tracheale beschadiging te verminderen13,14. Inhalatie van aerosolinhalatie (AR) bootst de natuurlijke infectieroute na en creëert een meer uniforme longpathologie in vergelijking met intranasale infectie, maar het kan moeilijk zijn om een uniforme virusconcentratie in de aerosol te behouden en om een nauwkeurige afgifte van virale aerosol te bereiken. Veiligheid is ook een belangrijk aandachtspunt van de AR-inoculatiemethode10. Daarom is de intranasale inoculatietechniek van IAV-toediening een cruciale benadering van pulmonaal gericht onderzoek naar de stroomafwaartse effecten van virale infectie op weefselbeschadiging en -herstel. In tegenstelling tot chemische of mechanische modellen, biedt het een meer realistische en minder invasieve manier om door griep veroorzaakte longschade en interacties tussen gastheer en pathogeen te bestuderen.
Hier stellen we een reproduceerbare methode vast voor intranasale infectie van muizen met het Influenza A-virus (A/PR/8/34) en voor het karakteriseren van zowel de cellulaire en structurele veranderingen op korte als op lange termijn in de longblaasjes die het gevolg zijn van virale schade. Studies met behulp van deze methode kunnen helpen bij het ontdekken van mechanismen van longweefselbeschadiging en -herstel om nieuwe therapeutische doelen voor longziekten te identificeren.
Het werken met het influenza A-virus in een diermodel wordt beschouwd als bioveiligheidsniveau 2 (BSL2) en dierbioveiligheidsniveau 2 (ABSL2). Alle dierprocedures die worden gebruikt om deze gegevens te genereren, zijn goedgekeurd door het Animal Care and Use Committee van het Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health (Protocol #24-452). Dit protocol is ook goedgekeurd door het Institutional Biosafety Committee van het Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health. Alvorens met dit protocol te beginnen, wordt aanbevolen dat gebruikers goedkeuring vragen aan hun institutionele commissie voor dierenverzorging en -gebruik en institutionele bioveiligheidscommissie.
1. Voorbereiding van de werkvoorraad
OPMERKING: Alle werkzaamheden met het griepvirus moeten op ijs in een bioveiligheidskast worden uitgevoerd. Werp tips en al het andere dat in contact komt met het virus uit in een container met 10% bleekmiddel. IJsemmers, pipetten en tipdozen moeten worden besproeid met 10% bleekoplossing in plaats van ondergedompeld. Incubeer minimaal 30 minuten bij kamertemperatuur. Gooi vast afval weg in een afvalcontainer voor biologisch gevaarlijk afval en gooi vloeibaar afval weg in de gootsteen, spoelend met water.
2. Verdunnen van aliquots van het virus voor gebruik in experimenten met intranasale infecties
3. Transport van virale aliquots naar dierenfaciliteiten
4. Toediening van IAV aan muizen
OPMERKING: Voor het werken met het griepvirus in de dierenfaciliteit is een ABSL2-veiligheidsniveaufaciliteit vereist. Standaard PBM omvatten scrubs, een wegwerplaboratoriumjas, twee haarmutsen, dubbele nitrilhandschoenen, dubbele schoenovertrekken, veiligheidsbrillen (veiligheidsbrillen) en een masker. Het verdunde influenzavirus moet gedurende het hele toedieningsprotocol op ijs worden bewaard om verlies van besmettelijkheid te voorkomen.
5. Vervoer terug naar het lab
6. Monitoring van muizen en aanvullende experimentele procedures
7. Oogsten van longweefsel voor stroomafwaartse benaderingen
In vergelijking met niet-geïnfecteerde, met PBS behandelde muizen zullen IAV-geïnfecteerde muizen heterogene weefselbeschadiging vertonen (Figuur 1A). Weefselschade kan worden gekwantificeerd met behulp van een k-means clustering-algoritme in MATLAB20 (Figuur 1B). IAV-geïnfecteerde muizen beginnen tussen 3-4 dagen na infectie af te vallen. Bij een ideale titer verliezen muizen tussen de 20-30% van hun oorspronkelijke lichaamsgewicht, waarbij het maximale gewichtsverlies 8-10 dagen na infectie (dpi) optreedt (Figuur 1C). Tegen 11-12 dpi zouden muizen moeten beginnen aan te komen en zouden ze tegen 14 dpi binnen 10-15% van hun oorspronkelijke lichaamsgewicht moeten zijn. Voor onderzoek naar regeneratie is het nuttig als de meeste muizen in het experiment afvallen en weefselbeschadiging ervaren, maar niet sterven. Vanwege de heterogeniteit in weefselbeschadiging (Figuur 1A,B) en de mogelijke variabiliteit in intranasale toediening, is het echter normaal dat meerdere muizen in een experiment niet afvallen of weefselbeschadiging ervaren en dat meerdere muizen >30% lichaamsgewicht verliezen, wat resulteert in euthanasie (Figuur 1D). Experimenten die proberen een verschil in overleving en gewichtsverlies te bepalen tussen bijvoorbeeld muizen met KO van een bepaald gen en hun WT-controles, moeten mogelijk de titer en dosering van IAV aanpassen en zullen een powerberekening moeten uitvoeren om de steekproefomvang te bepalen die nodig is om een dergelijk verschil in deze twee parameters te detecteren.
Naast veranderingen in de algehele weefselstructuur en de gezondheid van muizen, treden transcriptionele veranderingen in alle cellulaire compartimenten van de longen op in de loop van de reactie van het weefsel op schade. Dit omvat zowel voorbijgaande celtoestanden die uiteindelijk verdwijnen als het weefsel wordt gerepareerd, inclusief overgangs- of intermediaire epitheelceltoestanden en myeloïde immuunceltoestanden, als persistente celtoestanden die niet bijdragen aan functioneel herstel, waaronder Krt5+-epitheelcellen en TrkB+-endotheelcellen9. In het capillaire endotheel van de muizenlong ontstaat bijvoorbeeld een voorbijgaande interferon-gestimuleerde endotheelceltoestand bij 6 dpi, gekenmerkt door hoge expressie van interferon-gestimuleerde genen (Figuur 2A). Deze toestand wordt opgelost met 11-19 dpi (Figuur 2A). Een door letsel geïnduceerde capillaire endotheliale (iCAP) toestand ontstaat bij 11 dpi, gekenmerkt door hoge expressie van Ntrk2 (TRKB), Sparcl1 en Bnip3 (Figuur 2B). In tegenstelling tot de interferon-gestimuleerde endotheelceltoestand, blijft de iCAP-endotheelceltoestand dan bestaan in gebieden met ernstig beschadigd weefsel en is deze een jaar na infectie nog steeds aanwezig (Figuur 2C). Voorbijgaande alveolaire epitheelceltoestanden, waaronder alveolaire overgangscellen en onrijpe alveolaire type I epitheelceltoestanden (AT1), ontstaan ook na infectie (Figuur 2D). Ten slotte resulteert infectie in verlies van veel endogene alveolaire macrofagen (aMAC_a) en hun reconstitutie van zowel inflammatoire monocyten (iMON) als endogene aMAC's. Alveolaire macrofagen 1 jaar na infectie hebben verschillende transcriptietoestanden (aMAC_a en aMAC_b), afhankelijk van hun oorsprong (Figuur 2E)9. Voorbijgaande en aanhoudende celtoestanden die ontstaan na acuut longletsel rechtvaardigen verder onderzoek, aangezien hun abnormale gedrag binnen de niche productief of negatief kan bijdragen aan succesvol weefselherstel en de daaropvolgende weefselfunctie. Single-cell RNA-sequencinggegevens zijn eerder gepubliceerd9 en worden gedeponeerd in de Gene Expression Omnibus als GEO: GSE262927.

Figuur 1: Monitoring van longbeschadiging en diergezondheid. (A) Hematoxyline- en eosine (HE)-kleuring van longweefselsecties van een nagebootste (PBS-behandelde) long aan de linkerkant en een IAV-geïnfecteerde long aan de rechterkant. Vergeleken met de niet-beschadigde long vertoont de IAV-geïnfecteerde long heterogene weefselschade. Schaalbalken, 1 mm. (B) Met behulp van een k-means clustering-algoritme in MATLAB20 kan weefselbeschadiging worden gekarakteriseerd als ernstig (rood), beschadigd (groen) of normaal (blauw). Het is belangrijk op te merken dat in de met PBS behandelde longkwab aan de linkerkant de luchtwegstructuren worden geclassificeerd als "ernstig" vanwege de dichtheid en kleuringsintensiteit van luchtwegepitheelcellen. Het is echter nog steeds mogelijk om gemakkelijk het verschil te onderscheiden tussen met PBS behandelde en met griep geïnfecteerde longen, gegeven deze basislijn. Schaalbalken, 1 mm. (C) Voorbeeld van een afslankcurve van een representatief IAV-infectie-experiment waarbij 13 dagen na infectie (dpi) muizenlongen werden verzameld. De curve bevat gegevens van zes wild-type muizen en punten geven het gemiddelde aan, terwijl foutbalken de standaardfout van het gemiddelde vertegenwoordigen. (D) Voorbeeld overlevingscurve van een representatief IAV-infectie-experiment waarbij muizenlongen werden verzameld 14 dagen na infectie (dpi). De curve bevat gegevens van zeven wildtype muizen. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: Monitoring van veranderingen in de toestand van capillaire endotheelcellen na IAV-infectie. (A) Een interferon-gestimuleerde EC-toestand ontstaat bij 6 dpi die wordt opgelost tussen 11-19 dpi. Heranalyse van gepubliceerde eencellige RNA-sequencinggegevens van muizenlongen op verschillende tijdstippen na griepinfectie toont aan dat de interferonmodulescore in alle capillaire endotheelceltypen het hoogst is met 6 dpi. Gegevens werden opnieuw geanalyseerd met behulp van R en de interferonmodulescore is gebaseerd op de expressie van 87 interferon-gestimuleerde genen binnen elk celtype. CAP1, capillaire type 1 endotheelcel; iCAP, door letsel geïnduceerde endotheelcel; CAP2, capillaire type 2 endotheelcel; EC, endotheelcel. (B) Daarentegen ontstaat een door letsel geïnduceerde EC-toestand die wordt gekenmerkt door expressie van Ntrk2 (TRKB) bij 11 dpi en houdt aan tot een jaar na infectie. Schaalbalk, 500 μm. (C) Transcriptionele gegevens van eencellige RNA-sequencing van longcapillaire endotheelcellen na griepinfectie tonen de dynamische aard van de capillaire endotheelceltoestand tijdens weefselherstel aan. (D) Alveolaire epitheelcellen ervaren ook celplasticiteit na een griepinfectie. Een alveolair overgangsceltype ontstaat tussen 6-11 dpi en wordt opgelost door 19 dpi. Een onrijpe AT1-celtoestand (AT1_c) ontstaat bij 11 dpi en houdt aan tot 90 dpi. (E) Na infectie gaan veel bestaande alveolaire macrofagen (aMAC_a) verloren en wordt een instroom van inflammatoire monocyten (iMON) gezien bij 6 dpi. De alveolaire macrofaagpopulatie wordt gereconstitueerd door zowel bestaande aMAC's om de aMAC_a populatie te regenereren, als door inflammatoire monocyten, waardoor de aMAC_b populatie ontstaat. Hoewel beide een alveolaire macrofaagtoestand vertegenwoordigen, kunnen de resulterende aMAC's transcriptioneel worden onderscheiden. Grafieken in (C-E) geven het percentage cellen in elke populatie aan op elk tijdstip in de longitudinale influenza-infectiedataset en zijn gegenereerd met behulp van R. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Aanvullend bestand 1: Voorbeeldlogboek voor verwondingen, gewichtslogboeken en logboeken voor de lichaamsconditiescore (BCS) voor het monitoren van dieren na een griepinfectie. Klik hier om dit bestand te downloaden.
Hier hebben we een handige methode gerapporteerd om het griepvirus in muizen over te brengen om snelle en effectieve schade aan de longen van muizen te initiëren en mechanismen van zowel succesvolle regeneratie als dysplastisch herstel te bestuderen. We tonen aan dat intranasale inoculatie van A/PR/8/34 IAV een stressvrije techniek kan zijn. Het duurt minder dan 2 minuten per muis om de inoculatie te voltooien na isofluraan-anesthesie. Het is een eenvoudige en niet-invasieve techniek van virale inoculatie die de natuurlijke infectieroute volgt en het mogelijk maakt om de reactie van zowel het weefsel als het immuunsysteem op een meer fysiologisch relevante manier te bestuderen. Virus dat via de neusgaten van de muis wordt geïnoculeerd, kan zowel mucosale als systemische immuniteit induceren21. Wat nog belangrijker is, de schade veroorzaakt door virale infectie is duidelijk zichtbaar in plakjes longweefsel die zijn gekleurd met hematoxyline en eosine (HE) kleuring22 (Figuur 1). Een volledige tijdlijn van verwachte transcriptionele veranderingen in longceltypen in elk compartiment van de long is eerder gepubliceerd9. Hier hebben we een subset van deze gegevens opnieuw geanalyseerd om aan te tonen dat in de capillaire endotheel-, alveolaire epitheel- en myeloïde immuuncompartimenten van de muizenlongen voorbijgaande en aanhoudende transcriptieveranderingen optreden in de loop van de respons op griepinfectie van niet-geïnfecteerde muizen tot een jaar na infectie (Figuur 2).
Er zijn verschillende kritieke stappen in dit protocol en de juiste probleemoplossing van deze stappen zal een succesvol experiment opleveren. A/PR/8/34 influenzavirus is een aan muizen aangepaste griepstam die mensen niet productief infecteert23, maar het is altijd belangrijk om tijdens het experiment alle aangegeven veiligheidsprocedures te volgen om elke mogelijkheid van infectie van laboratoriumpersoneel te voorkomen. Toediening van isofluraan-anesthesie is een cruciale stap om de succesvolle toediening van het virus te garanderen, aangezien muizen het virus niet goed zullen inademen als ze wakker zijn. Controleer de ademhaling en controleer de bewegingen van de muiskop tijdens de procedure om er zeker van te zijn dat het virus in beide neusgaten wordt ingeënt. Als muizen niet volledig verdoofd zijn, kunnen er belletjes ontstaan, die zowel de inademing van het virus beperken als aerosolen genereren. Beide uitkomsten moeten worden vermeden en muizen moeten terug op de isofluraan-neuskegel worden geplaatst als niezen of luchtbellen in de neusgaten worden waargenomen. Monitoring na infectie, zoals het meten van gewichtsverlies, lichaamsconditiescore en gezondheidstoestand, evenals het verstrekken van een herstelvoedingssupplement, is ook een belangrijk onderdeel van dit experiment. Als wordt waargenomen dat muizen niet voldoende gewicht verliezen of niet de verwachte hoeveelheid weefselbeschadiging hebben (Figuur 1), is het mogelijk dat de dosis te laag is; Aan de andere kant, als veel muizen het eindpunt van 30% gewichtsverlies bereiken, is het mogelijk dat de dosis te hoog is. In beide gevallen is het het beste om de juiste dosis te bepalen door middel van een empirische titer van de partij virus met behulp van een cohort C57BL/6-muizen zoals we hier beschrijven.
Aangezien griepinfectie wereldwijd nog steeds voorkomt, ernstige aandoeningen van de luchtwegen veroorzaakt en dodelijk kan zijn, is het van het grootste belang om het proces van virale infectiviteit en de cellulaire reactie op infectie en weefselbeschadiging in de longen te begrijpen. De intranasale infectiemethode die in deze studie wordt beschreven, kan daarom helpen bij de identificatie van belangrijke regulerende mechanismen en de ontwikkeling van nieuwe therapeutische benaderingen voor longziekten. Bovendien zouden toekomstige toepassingen van de techniek een andere stam van het aan de muis aangepaste influenzavirus, zoals X31, kunnen gebruiken om de effecten op de structuur en functie van het longweefsel te bepalen in het geval van herhaalde luchtweginfecties. Aangezien veel mensen tijdens hun leven te maken krijgen met meerdere luchtweginfecties, kan een dergelijke uitbreiding van dit model belangrijke implicaties hebben voor de studie van de regeneratie van longweefsel en dus voor de volksgezondheid.
De auteurs hebben niets te onthullen.
Dit onderzoek werd ondersteund door het Intramural Research Program van de Amerikaanse National Institutes of Health (NIH), National Cancer Institute, Center for Cancer Research.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| 1.5 mL tube | Fisher Scientific | 02-682-557 | |
| 100 µm celstrainer | Falcon | 352360 | |
| 15 mL conische buis | Falcon | 352196 | |
| 1x PBS | Gibc0 | 10010-023 | |
| 40 µm celstrainer | Falcon | 352340 | |
| 5 mL buis | Globe | 6101C | |
| 50 mL conische buis | Falcon | 352098 | |
| A/PR/8/34 Influenza Virus stock | ATCC | VR-95PQ | Verschillende partijen hebben een verschillend virustiter |
| ACK Lysis Buffer | Quality Biological | 118-156-101 | |
| Anti-TRKB Antilichaam | R&D Systems | AF1494 | |
| Bleekmiddel | Clorox | 10% Bleekmiddel | |
| Bovine Serum Albumine | Sigma Aldrich | A8022 | |
| CO2 Anesthesie Inductie Kamer | Elke | N/A | |
| Collagenase Type I | Gibco | 17100017 | |
| DAPI | Milipore Sigma | 28718-90-3 | |
| Dispase | Corning | CB-40235 | |
| Dissectiegereedschap: schaar, gebogen pincet, recht pincet | Elke | N/A | |
| Dnase | Sigma Aldrich | 4716728001 | |
| D-PBS | Corning | 21-031-CM | |
| Ethanol | Pharmco | 111000200 | |
| Glazen flesjes | DWK Life Sciences | 986562 | |
| IJsemmer | Elke | N/A | |
| Isofluraan | Covetrus | 29404 | |
| Naalden, 21–23 G | Elke | N/A | |
| P20/P200 pipet | Pipetman | F144056M/F144058M, | |
| P20/P200 pipettips | Thomas Scientific | 1159M43/1159M40 | |
| Paraformaldehyd (PFA) | Thermo Scientific | J19943-k2 | 2%PFA |
| Pipetman | Elke | N/A | |
| Kunststof of kartonnen vriesdozen | Elke | N/A | |
| Veiligheidsmes | Elke | N/A | |
| Ring Stand | Elke | N/A | |
| Serologische pipetten, 5 mL | Falcon | 357543 | |
| Slide Top Inductie Muis Isofluraan Kamer | Somni Scientific | ||
| Hechtdraad | Fisher Scientific | NC9422522 | |
| Spuitbuis en luer-locks | Elke | N/A | |
| Spuit, 10 mL | Elke | N/A | |
| Bureauanesthesie Machine Isofluraan | Ohmeda | Ohmeda Isotec- 4 | De stroomsnelheid moet 2.5–3% zijn |
| Ultra-lage smeltpunt agarose | Sigma Aldrich | A5030-1G | |
| Weegschaal | OHAUS | CS200 |