Om het proces te illustreren dat wordt gevolgd voor de validatie van het protocol, hebben we drie antigenen geselecteerd die drie families van arbovirussen vertegenwoordigen: Flavivirussen (DENV1 NS1-eiwit), Alfavirussen (CHIKV VLP-eiwit) en Bunyavirussen (RVFV NP). De antigenen werden getest op een standaardpool van een pre-blootgestelde populatie (ORPAL), Franse (niet-blootgestelde) populatiesera en twee cohorten uit Afrika (Senegal en Madagaskar).
Verdunningslineariteit van antilichaamrespons
De concentratie van antigenen voor gebruik voor kraalkoppeling werd bepaald met behulp van seriële verdunningen van de ORPAL-pool. De optimale concentratie werd geselecteerd als de laagste concentratie waarbij een lineaire standaardcurve werd verkregen (gegevens niet weergegeven). Figuur 1 toont de lineariteit van geselecteerde arbovirusantigenen bij optimale concentratie voor elk antigeen. Voor de kwaliteitscontrole van de koppeling werd elke batch gekoppelde korrels getest op verdunningslineariteit op de ORPAL-standaardpool met behulp van de vooraf geselecteerde concentratie.
Vergelijkbaarheid met de standaard handmatige koppelingstest
Om de vergelijkbaarheid te beoordelen van gegevens die zijn verkregen met behulp van het nieuwe geautomatiseerde protocol met de gevestigde handmatige koppeling, hebben we standaardcurven vergeleken die zijn gegenereerd op basis van resultaten verkregen met handmatige versus geautomatiseerde koppeling. Figuur 2 toont de parallelle lineariteit voor beide testen. MFI-waarden variëren per antigeen.
Batchvariatie voor kraalkoppeling
De variatie in de koppelingsbatch, waarbij de reproduceerbaarheid van tests van dezelfde koppelingsbatch werd beoordeeld, werd beoordeeld aan de hand van de Levey-Jennings-grafiek18. De representatieve antigenen en BSA-gekoppelde controlekorrels werden gebruikt en getest op de ORPAL-standaardpool. Figuur 3 toont MFI's van 19 verschillende platen, getest op verschillende dagen voor elk antigeen. De resulterende MFI's vallen binnen het bereik van het gemiddelde ± 3 SD voor de drie antigenen en de controle.
Effect van multiplexing op MFI
Om de prestaties van de test verder te beoordelen, hebben we getest of multiplexing van verschillende antigenen de gemeten antilichaamrespons beïnvloedde. De respons werd vergeleken met een enkel antigeen (of single-plex bead) met behulp van de ORPAL-standaardpool. Figuur 4 toont een sterke correlatie (R = 0,99, p < 2,2e-16) tussen de resultaten die werden verkregen wanneer MFI's werden gemeten op enkelvoudige antigenen of van een premix die 50 antigenen bevatte.
Antilichaamresponsen van menselijke serummonsters in Afrikaanse populaties
Om de toepasbaarheid van de test op monsters uit verschillende cohorten te evalueren, vergeleken we antilichaamresponsen in menselijke serummonsters van Afrikaanse populaties, die een grote kans hebben op blootstelling aan arbovirussen, met die van een Frans cohort dat vermoedelijk een lagere blootstelling aan deze virussen heeft. In totaal werden 1.596 monsters getest voor Madagaskar, 1.428 voor Senegal en 84 uit het Franse cohort. Figuur 5 toont dichtheidsgrafieken voor de verschillende cohorten. Voor het Senegalese cohort wordt een duidelijke bimodale verdeling van gegevens waargenomen voor de responsen op CHIKV VLP, wat wijst op twee verschillende responsen op CHIKV in de populatie. Een subtiele bimodale staart wordt ook waargenomen voor DENV1 NS1 en RVFV NP in het Senegalese cohort, terwijl er geen verschil is tussen de Franse en Madagaskar cohorten.

Figuur 1: Lineariteit van de antilichaamrespons getest op de ORPAL-standaardpool. Geselecteerde arbovirusantigenen worden als voorbeeld getoond. Mediane fluorescentie-intensiteiten (MFI) worden weergegeven op de y-as (logschaal) en seriële verdunning van de standaardpool op de x-as. Alle antigenen in het panel werden vooraf getest op de standaardpool voorafgaand aan bulktests op monsters. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: Parallelle lineariteit van de antilichaamrespons door koppelingsmethoden. Log van MFI (y-as) van representatieve antigenen (facet) getest op seriële verdunningen van de ORPAL-standaardpool (x-as). De kleuren staan voor verschillende koppelingsmethoden: automatisering (rood, groen, blauw) en handmatig (paars). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3: Variatie van plaat tot bord. Levey_Jennings grafieken voor BSA, gekoppelde kraal (controle), DENV1, NS1, CHIKV VLP en RVFV worden weergegeven voor ORPAL-standaardpool met een concentratie van 1:400. De resultaten vertegenwoordigen 19 platen die op verschillende dagen worden uitgevoerd. MFI's worden weergegeven op de y-as, het aantal tests staat op de x-as. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4: Correlatie van de antilichaamrespons op mono- en multiplextest. Het standaardbad werd verdund tot een eindconcentratie van 1:400 en getest op een voormengsel dat de 50-plex-antigenen bevatte, parallel aan enkelvoudig antigeen-gecoate kralen. Pearson-correlatie werd gebruikt voor analyse. Als voorbeeld worden drie representatieve antigenen getoond. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 5: Toepassing van de test op het endemische en niet-endemische cohort van monsters. De test werd getest op monsters uit Madagaskar (groen), Senegal (blauw) en Frankrijk (rood). De monsters werden verdund tot een eindconcentratie van 1:400. De X-as vertegenwoordigt genormaliseerde MFI's (nMFI's), berekend als een verhouding van voorbeeld-MFI tot standaardpool-MFI bij dezelfde concentratie (1:400). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Aanvullende figuur 1: Voorbeeld representatief beeld van kralenaggregatie. Paneel (A) toont niet-geaggregeerde kralen en paneel (B) toont kralenaggregaten. Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullende tabel 1: Tabel met buffers. Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullende tabel 2: KingFisher Apex kralen koppelingsprotocolinstellingen. Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullende tabel 3: Voorbeeld voor de berekening van het parelvolume voor voormengsels. Klik hier om dit bestand te downloaden.