Driedimensionale (3D) co-cultuur is een snel evoluerende techniek voor onderzoekers die cel-celinteracties nauwkeurig willen bestuderen met behulp van in vitro experimenten. De beperkingen van monolaagcelkweek, waaronder beperkte interacties tussen de cellulaire en extracellulaire omgeving en verstoorde celmorfologie, worden aangepakt door het simuleren van de in vivo cellulaire omgeving. Met behulp van een steiger om structurele ondersteuning te bieden en biologisch actieve extracellulaire matrixcomponenten te bevatten, vertonen 3D-culturen gedragingen en morfologieën die meer overeenkomen met weefsel. Het integreren van meerdere celtypen in dit soort 3D-omgeving maakt het mogelijk om cel-celinteracties binnen een biomimetisch modelsysteem te bestuderen. Er is een breed scala aan 3D-cocultuurtechnologieën ontstaan, elk met zijn eigen voordelen en uitdagingen. Vaak vereisen deze technologieën gespecialiseerde apparatuur, een complexe opstelling of specifieke technische kennis. Daarnaast bestaan er enkele gestandaardiseerde methoden om indirecte cel-celinteracties te bestuderen tussen twee celtypen die gescheiden zijn door een gereconstitueerd basalmembraan. Hier beschrijven we een 3D-co-cultuurmethode die slechts fundamentele technische vaardigheden vereist en die breder toepasbare materialen gebruikt om indirecte cel-celinteracties over een basalmembraan succesvol te reproduceren. Een monolaag van cellen wordt bedekt met een laag extracellulaire matrix, in de vorm van matrigel, en een tweede celtype wordt erbovenop geplaatst. De resulterende co-kweek wordt vijf dagen gehandhaafd, waarna cellen worden geanalyseerd op morfologische veranderingen door immunofluorescentie of uit de co-kweek worden gehaald voor meer gedetailleerde genomische, transcriptomische of proteomische analyses. Dit protocol is ideaal om de impact van cel-cel communicatie op celgedrag te bestuderen wanneer fysiek contact wordt verboden door een basalmembraan. Naarmate onderzoekers blijven kiezen voor meer in vivo-relevante celkweekmethoden, is een gestroomlijnde aanpak noodzakelijk om hoge toegangsdrempels te vermijden.