$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Alle gevaarlijke chemicaliën (bijv. glutaraldehyde, natriumcacodylaatbuffer, hexamethyldisilazaan [HMDS] en ethanol) werden behandeld volgens institutionele Milieu- en Veiligheidsbeleid (EHS). De bereiding en het gebruik van vluchtige/giftige reagentia vonden plaats in een gecertificeerde chemische dampkap met geschikte persoonlijke beschermingsmiddelen (labjas, oogbescherming en chemisch resistente handschoenen), en brandbare oplosmiddelen werden uit de buurt van ontstekingsbronnen gehouden. Chemisch afval werd gescheiden en verzameld in correct gelabelde containers (inclusief speciaal arseenhoudend afval voor cacodylaat en oplosmiddelafval voor HMDS/ethanol) voor verwijdering via het institutionele programma voor gevaarlijk afval. Biogevaarlijke materialen (bacteriële culturen, besmette platen en wegwerpmaterialen) werden gedecontaminateerd volgens bioveiligheidsprocedures (bijv. autoclavering of goedgekeurde desinfectiemiddelen) vóór verwijdering, en elke ethyleenoxidesterilisatie werd uitgevoerd volgens gecertificeerde faciliteitsprotocollen en vereiste beluchtingspraktijken.
3D-geprinte modellen
De modellen werden ontworpen met behulp van gratis computerondersteunde ontwerpsoftware en geprint met een 3D-printer uitgerust met fused deposition modeling-technologie, met 1,75 mm (diameter) filamenten van polymelkzuur (PLA) en polytereltalaatglycol (PETG) (Materiaaltabel). De drukparameters die werden gebruikt voor het vervaardigen van de monsters waren als volgt: mondstuk (0,4 mm) bewegingssnelheid van 1800 mm/min; snelheid in de eerste laag van 300 mm/min; nozzle extrusietemperatuur van 220 °C (PLA) en 255 °C (PETG); bodemtemperatuur van 60 °C; laaghoogte van 0,08 mm; extrusiebreedte van 0,48 mm en; Invuldichtheid van 100% voor alle monsters. Geen van de monsters vereiste het gebruik van ondersteunende structuren. 3D-modellen bestonden uit schijven, platbodemplaten, het Calgary-biofilmapparaat (CBD) en het aangepaste Robbins-apparaat (MRD). De schijven waren ontworpen als een cilinder met een diameter van 6 mm x 6 mm (hoogte).
Voor het CBD werd een model gemaakt (Materiaaltabel). De CBD bestond uit twee delen: een basisplaat, een standaard 96-put microtiterplaat (ANSI/SLAS-formaat) en een deksel (peg plate): een polymeer (PLA of PETG) deksel met 96 cilindrische pennen met een diameter van 2 mm en 5 mm (hoogte). De MRD werd ontwikkeld met 4 mm (diameter en hoogte) pennen bevestigd in een schroefdraadmodel (materiaaltafel). Na het afronden van het printproces werden de modellen zorgvuldig van de bouwplaat verwijderd, visueel geïnspecteerd op eventuele vervormingen en vervolgens gesteriliseerd met ethyleenoxide.
Schijfmodel van statische biofilm
Deze methode werd gebruikt om biofilmvorming op PLA te induceren met behulp van de eerder beschreven 6 mm × 6 mm cilindrische schijven23 (Figuur 1).

Figuur 1: PLA- en PETG-schijven en een 24-wellplaat voor biofilmvorming op de modellen van deze schijven. (A) Representatieve 3D-geprinte PLA- en PETG-schijven vóór de bacteriële inoculatie en biofilmvorming. (B) PLA- en PETG-schijven gepositioneerd in een 24-wellplaat tijdens biofilminductie onder in vitrokweekomstandigheden . Afkortingen; PLA = polylactinezuur; PETG = polyethyleentereftalaatglycol gemodificeerd. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
S. aureus werd opgeslagen bij −80 °C in tryptische sojabouillon (TSB) aangevuld met 15% glycerol en werd voorafgaand aan elk experiment op bloedagar gekweekt en 24 uur geïncubeerd bij 37 °C. Een geïsoleerde kolonie werd opnieuw opgehangen in 10 mL TSB, aangevuld met 50 mM glucose, toegevoegd aan een 50 mL conische buis en 24 uur geïncubeerd bij 37 °C in een orbitale shaker bij 120 rpm. De resulterende cultuur werd 5 minuten gecentrifugeerd op 200 x g, waarna het supernatant werd afgevoerd. De pellet werd drie keer gewassen met 10 mL steriel 0,9% NaCl. In de laatste wasfase werd de pellet opnieuw opgehangen in 10 mL verse TSB om een bacteriële suspensie te verkrijgen met een troebelheid gelijk aan de 0,5 McFarland-standaard (ongeveer 1,5 × 108 CFU/mL), zoals bepaald door nephelometrie. De suspensie werd vervolgens verdund met 1:10 in 10 mL TSB in een 15 mL conische buis om een uiteindelijke bacteriële concentratie van 107CFU /mL te bereiken. Voor experimenten met schijven werd 2 mL van de vorige bacteriële suspensie toegevoegd aan elke put van steriele 24-wellplaten om elke groep schijven (PLA en PETG) gedurende 2 uur te bedekken om celadhesie mogelijk te maken. De schijven werden vervolgens aseptisch overgebracht met steriele pincet naar een nieuwe steriele 24-well plaat met 2 mL 0,9% NaCl om planktonische cellen te verwijderen. Verse 10 mL TSB werd aan de putten toegevoegd, en de platen werden 24 uur geïncubeerd bij 37 °C. Tijdens deze stap vormden cellen die aan de schijfoppervlakken hechtten een biofilm. Na de incubatie werd het kweekmedium geaspireerd en werden de schijven gewassen met 2 mL 0,9% NaCl om het resterende medium en niet-hechtende cellen te verwijderen. Een 24-well-plaat werd voorbereid met 1 mL vancomycineoplossing bij seriële verdunning (2–4.096 mg/L), en de schijven werden 24 uur ondergedompeld. Een controlegroep zonder vancomycine (NaCl 0,9%) werd opgenomen. Na 24 uur werden de schijven gewassen met 2 mL NaCl 0,9%.
Om de vastzittende bacteriën op de schijfjes te kwantificeren, werd elke schijf met een steriele pincet overgebracht naar een microbuis met 1 mL steriel 0,9% NaCl en 15 minuten in een ultrasoon bad op 40 kHz en 37 °C gesoniceerd om de vastgekleefde cellen los te maken. De microbuizen werden 60 seconden vortex om volledige ontmanteling van celclusters te garanderen. Aliquots van 100 μL van het onverdunde monster (10°) en 10⁻2 en 10⁻4 verdunning in steriel 0,9% NaCl werden op TSA geplateerd en 24 uur geïncubeerd bij 37 °C. Bacteriële groei werd gekwantificeerd door CFU op een plaat te tellen en uitgedrukt als CFU/mL.
24-put platplaten met platte bodem voor minimale biofilmverwijderingsconcentratie
Voor experimenten in platen met 24 putten werd 3 mL bacteriële suspensie (zoals hierboven beschreven) gedurende 2 uur aan elke put toegevoegd om voldoende celadhesie te garanderen. Daarna werd de bacteriële suspensie geaspireerd en werd 3 mL steriel 0,9% NaCl toegevoegd om planktonische cellen te verwijderen. Verse 3 ml TSB werd vervolgens toegevoegd en de platen werden 24 uur geïncubeerd bij 37 °C. Tijdens deze stap vormden cellen die aan de putoppervlakken hechten een biofilm. Na de incubatie werd de TSB geaspireerd en werden de putten gewassen met 3 mL van 0,9% NaCl om residueel medium en niet-hechtende cellen te verwijderen. 3 mL vancomycineoplossing bij seriële verdunning (2–4.096 mg/L) werd aan elke put toegevoegd. Een controlegroep zonder vancomycine (NaCl 0,9%) werd opgenomen.
Na 24 uur werd de oplossing verwijderd en werd elke put voorzichtig twee keer gewassen met 3 mL 0,9% NaCl. Drie milliliter van 0,9% NaCl werden aan elke put toegevoegd, de plaat werd afgesloten en afgesloten met parafilm, en vervolgens 15 minuten in een ultrasoon bad bij 40 kHz en 37 °C gesoniceerd om de vastzittende biofilm los te maken. Aliquots van 100 μL werden uit de putten verzameld, en het onverdunde monster (10°) en de 10⁻2- en 10⁻4-verdunningen, bereid in steriel 0,9% NaCl, werden op TSA geplateerd en 24 uur geïncubeerd bij 37 °C. De bacteriële groei werd vervolgens gekwantificeerd door CFU/mL te tellen. Alle experimenten werden in drievoud uitgevoerd. De minimale biofilm-verwijderingsconcentratie (MBEC) werd gedefinieerd als een reductie van ten minste 3 log10 in vergelijking met de controlegroep (Figuur 2).

Figuur 2: Gedrukte platen met 24 putten. (A) 24-wells platen gedrukt met PLA. (B) 24-well-platen bedrukt met PETG. Afkortingen; PLA = polylactinezuur; PETG = Polyethyleenterefthalaatglycol. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Het biofilmapparaat van Calgary
De CBD bestaat uit een microtiterplaat met 96 putten en een deksel met 96 pennen, elk ontworpen om precies in een put te passen wanneer het deksel op het bord wordt geplaatst. Om biofilmvorming te induceren, werd elke put van een steriele 96-put plaat gevuld met 200 μL van de bacteriële suspensie, waarna steriele pegdeksels op de plaat werden geplaatst. De gemonteerde platen werden 24 uur onder statische omstandigheden geïncubeerd bij 37 °C om biofilmontwikkeling op de pennen mogelijk te maken. Na de incubatie werden de pendeksels voorzichtig afgespoeld in een 96-wells plaat met 200 μL 0,9% NaCl om planktonische cellen te verwijderen. De plaat met de pennen werd ondergedompeld in een andere 96-wellplaat met vancomycine in progressieve concentraties (2–4.096 mg/L) en 24 uur geïncubeerd bij 37 °C onder statische omstandigheden.
De plaat met pennen werd gespoeld in een 96-well plaat met 200 μL van 0,9% NaCl, en de pennen werden zorgvuldig gestempeld in een 15 cm TSA-plaat en 24 uur geïncubeerd bij 37 °C. Bacteriële groei werd waargenomen en MBEC werd gedefinieerd als de laagste concentratie waarbij geen groei plaatsvond. Alle experimenten werden in drievoud uitgevoerd (Figuur 3).

Figuur 3: Calgary-apparaat en 96-wells platplaten met platte bodem gedrukt met PLA en PETG. (A) Calgary-apparaat gedrukt met PLA. (B) 96-wells platbodemplaten gedrukt met PLA. (C) Calgary-apparaat gedrukt met PETG. (D) 96-wells platplaten met platte bodem, gedrukt met PETG. Afkortingen; PLA = polylactinezuur; PETG = polyethyleentereftalaatglycol. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Een dynamisch systeem onder continue stromingsomstandigheden
Elke MRD bevat vijf individuele pennen die in een schroefschroefdraadmodel zijn bevestigd en lineair zijn gerangschikt langs een kanaal met een rechthoekige doorsnede. Het dynamische systeem bestond uit een kolf met 1 L oplossing, waarbij het te testen antibioticum via een siliconenbuis gekoppeld aan de MRD was aangesloten op een peristaltische pomp. De assemblage vond plaats in een laminaire luchtstroomkast om besmetting te voorkomen. De gemiddelde debiet bleef 1 mL/min en circuleerde 24 uur door het systeem. De vloeistof die door de MRD stroomt, wordt in een andere glazen fles geworpen (zonder recirculatie).
S. aureus-biofilms werden geïnduceerd op de pennen van een MRD, waarbij de pennen werden afgezet op 24-wellplaten met TSB van 3 mL bij een concentratie van 107 CFU/mL. De pennen werden voorzichtig afgespoeld door onderdompeling in een 24-wells plaat gevuld met 3 mL 0,9% NaCl-oplossing. De pennen werden zorgvuldig in de MRD geschroefd (n = 5). Vancomycineoplossing (40 mg/L) verdund in 0,9% NaCl werd via de MDR geïnfuseerd met de hierboven beschreven pomp gedurende 24 uur. Een controlegroep zonder antibiotica (0,9% NaCl) werd opgenomen. Deze concentratie werd gekozen op basis van de serumconcentratie die werd verkregen tijdens hoge doses intraveneuze vancomycine, zoals eerder beschreven24. De pinnen werden aseptisch uit de MRD verwijderd met een steriele pincet, na het wassen met 0,9% NaCl in microbuizen geplaatst met 1 mL steriel 0,9% NaCl, en 15 minuten in een ultrasoon bad op 40 kHz en 37 °C gesoniceerd om volledige loskoppeling van de biofilm te garanderen. De microbuizen werden 60 seconden vortex en de procedure werd drie keer herhaald om de resterende biofilmaggregaten te verstoren. Aliquots van 100 μL werden op TSA geplateerd, en de platen werden 24 uur geïncubeerd bij 37 °C. Bacteriële groei werd gekwantificeerd en uitgedrukt als CFU/mL (Figuur 4).

Figuur 4: Aangepast Robbins-apparaat met PETG en PLA en een foto van het dynamische systeem. (A) Gemodificeerd Robbins-apparaat gedrukt met PETG of PLA. (B) Foto van het dynamische systeem. Afkortingen; PLA = polylactinezuur; PETG = polyethyleentereftalaatglycol. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Scanning-elektronenmicroscopie
Om de morfologie en structuur van de biofilms te visualiseren, werd scanning electron microscopy (SEM) uitgevoerd op de schijven. Biofilm werd geïnduceerd op schijven zoals beschreven in de protocollen. De schijven werden voorzichtig van de plaat verwijderd met een steriele pincet en vastgezet met een oplossing (0,68 g sucrose, 0,42 g natriumcacodylaat, 0,6 mL 30% glutaraldehyde), met 19,4 ml gedeïoniseerd water, gedurende 45 minuten. Vervolgens werden de monsters 10 minuten overgebracht naar een bufferoplossing (0,68 g sacrose en 0,42 g natriumcacodylaat). De monsters werden vervolgens gedehydrateerd in een gegradeerde ethanolreeks (35%, 50%, 70% en 100%) gedurende elk 10 minuten. Daarna werden de monsters overgebracht naar een andere petrischaal en 100% hexamethyldisilazaan bedekt voor 100 minuten. Ten slotte werden de schijven met een sputter-coating gecoat met goud met een roterende pomp en gemonteerd op een metalen stomp voor observatie onder verschillende vergrotingen op een scanning-elektronenmicroscoop (Figuur 5).

Figuur 5: Scanning-elektronenmicroscopie van PLA- en PETG 3D-geprinte modellen met en zonder biofilm-inductie. (A) Scanning-elektronenmicroscopiefoto van PLA zonder biofilm. (B) Scanning elektronenmicroscopiefoto van PETG zonder biofilm. (C) Scanning elektronenmicroscopiefoto van biofilmvormende bacteriën op PLA-schijven. (D) Scanning elektronenmicroscopiefoto van biofilmvormende bacteriën op PETG-schijven. C en D vertonen typische kenmerken van biofilms: bacteriële organisatie in een 3D-structuur, hechting aan oppervlakken en de aanwezigheid van een extracellulaire matrix. Witte schaalbalk staat voor 10 μm. Afkortingen; PLA = polylactinezuur; PETG = Polyethyleentereftalaatglycol. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Statistische analyse
Sommige analyses waren beschrijvend. Voor kwantitatieve gegevens rechtvaardigde de steekproefgrootte het gebruik van de mediaan met het interkwartielbereik, met de Mann-Whitney-test voor statistische vergelijking. Een p-waarde < 0,05 werd als statistisch significant beschouwd.