$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. RSM: definities en behoefte
RSM's zijn hiërarchisch georganiseerd, met twee hoofdtypen: primaire en secundaire RSM's. Volgens ISO Guide 30 wordt een primaire standaard gedefinieerd als een "standaard die wordt aangeduid of algemeen erkend als bezittend van de hoogste metrologische kwaliteiten en waarvan de waarde wordt aanvaard zonder verwijzing naar andere normen van dezelfde hoeveelheid, binnen een gespecificeerde context". Zo kwalificeren RSM's van de United States Pharmacopeia (USP), European Pharmacopeia (Ph. Eur.), British Pharmacopeia (BP), enzovoort, die uitgebreid zijn gekarakteriseerd via multi-laboratoriumstudies, als primaire RSM. Individuele fabrikanten gebruiken deze primaire RSM's vervolgens om hun eigen gepatenteerde werkreferentiematerialen te kalibreren en te kwalificeren, die dienen als secundaire RSM's voor routinematige kwaliteitscontroletests12,15. ISO definieert een secundaire RSM dus als een "standaard waarvan de waarde wordt toegekend door vergelijking met een primaire standaard van dezelfde hoeveelheid". Deze hiërarchische aanpak zorgt voor traceerbaarheid: interne metingen zijn terug te voeren op primaire standaarden, die op hun beurt worden gekarakteriseerd met geavanceerde analytische methoden16. Het gebruik van RSM's biedt gemeenschappelijke benchmarks waarmee fabrikanten hun analysemethoden kunnen kalibreren en valideren op hetzelfde referentiepunt, wat leidt tot nauwkeurigere metingen. Regelgevende instanties moedigen daarom het gebruik van primaire RSM's aan om interne RSM's te kalibreren en testmethoden te valideren, waardoor de consistentie in de hele AAV-productieverbetert 17,18. Dit maakt standaardisatie mogelijk over verschillende analytische technieken, wat leidt tot een betere vergelijking van rAAV-karakteriseringsresultaten tussen laboratoria en verschillende producten17,19. De verbeterde vergelijkbaarheid vergroot het begrip van veiligheidsrisico's die mogelijk samenhangen met hoge doses of productgerelateerde onzuiverheden, zoals lege en gedeeltelijk gevulde capsiden. Uiteindelijk kunnen deze inzichten wetenschappelijk onderbouwde regelgevingsbeleidsvorming informeren, zoals een minimale drempel van volledige capsiden, analoog aan het criterium van ≥70% levensvatbare cellen voor somatische cellulaire therapieën, en dragen zo bij aan veiligere en betrouwbaardere gentherapieproducten 13,20,21.
Voor rAAV illustreren verschillende CQA's duidelijk de noodzaak van standaardisatie. De vector-genoomtiter bepaalt direct de patiëntdosis; Onnauwkeurige titers kunnen te weinig of te veel doseren. Kwantitatieve PCR (qPCR) en digitale PCR (dPCR) worden veel gebruikt om titer te meten, maar de resultaten kunnen voor dezelfde steekproef verschillen als er verschillende interne standaardcurvekalibers of protocollen worden gebruikt11. Capsidinhoud (de verhouding van volle, gedeeltelijk gevulde en lege capsiden) is een andere cruciale CQA, aangezien lege en gedeeltelijk gevulde capsiden kunnen bijdragen aan immunogeniteit of de effectiviteit kunnen verminderen6. Meer dan tien verschillende technieken worden gebruikt om capside-inhoud te meten, waaronder analytische ultracentrifugatie (AUC), grootte-uitsluitingschromatografie gekoppeld aan multi-angle lichtverstrooiing (SEC-MALS), massafotometrie (MP), ladingsdetectie massaspectrometrie (CDMS), elektronenmicroscopie (EM), anionenuitwisselingschromatografie (AEX), capillaire iso-elektrische focussering (cIEF), ultraviolet-zichtbare spectroscopie (UV/Vis), enzovoort. Daarnaast wordt capside-inhoud vaak indirect geschat met behulp van de verhouding van vectorgenoomtiter tot virale deeltjestiter, bepaald door qPCR of dPCR en ELISA respectievelijk (PCR/ELISA)22. Elke techniek meet verschillende fysieke eigenschappen en kan verschillende capside-inhoudswaarden rapporteren voor dezelfde monsters. Een recente interlaboratoriumstudie van NIST, waarin UV/Vis, AUC, SEC-MALS en PCR/ELISA werden vergeleken, toonde aanzienlijke variabiliteit tussen methoden en laboratorium aan, waarbij PCR/ELISA bijzonder slechte reproduceerbaarheid vertoonde en AUC significante divergentie tussen laboratoriums vertoonde, ondanks dat het algemeen werd beschouwd als referentiemethode8. Deze bevindingen geven aan dat het verminderen van variabiliteit in AAV-analyse zowel gedeelde RSM's als geharmoniseerde analytische workflows vereist, zoals besproken in Sectie 5.
2. rAAV RSM-landschap
Pogingen om RSM's voor AAV op te zetten hebben geleid tot twee bronnen die primaire AAV RSM's leveren. Onder de farmacopeale bronnen is de USP momenteel de enige aanbieder van primaire AAV RSM. Naast USP zijn er ook primaire AAV-RSM's beschikbaar via de American Type Culture Collection (ATCC). Er is ook een groeiend aanbod van commerciële secundaire RSM's voor meerdere serotypen beschikbaar, wat de voortdurende inspanningen van de gemeenschap weerspiegelt om het gebrek aan standaardisatie inherent aan AAV-karakterisering aan te pakken. Tabel 1 vat de momenteel beschikbare AAV RSM-materialen en hun belangrijkste kenmerken samen.
- ATCC-standaarden
De eerste internationale poging om RSM's voor rAAV op te stellen begon in 2010 toen de AAV Reference Standard Working Group (AAVRSWG) primaire RSM's voor rAAV2 produceerde, gevolgd door rAAV8 in 2014. Deze vrijwilligersorganisatie bestond uit leden van vijf industriële organisaties, 13 universiteiten, de Food and Drug Administration (FDA), het National Institute of Health (NIH) en de Williamsburg Bioprocessing Foundation (WilBio), die vier landen vertegenwoordigden: de VS, Frankrijk, Duitsland en Japan. De primaire RSM's waren bedoeld als gemeenschapsbrede standaarden om de interlaboratoriumvergelijking van doses tussen niet-klinische en klinische studies te vergemakkelijken. Onderzoekers worden aangemoedigd om titers te rapporteren in relatie tot deze primaire RSM bij het publiceren of indienen van gegevens bij gezondheidsautoriteiten. De productie had als doel een eindtiter van 1 × 1012-vectorgenoom per milliliter (vg·mL-1) te bereiken en ongeveer 5.000–10.000 flesjes te leveren die elk 0,5 mLbevatten. De materialen werden gekarakteriseerd voor vectorgenoomtiter (qPCR), deeltjestiter (ELISA), transducerende titer (fluorescentiemicroscopie), infectieuze deeltjestiter (TCID50), zuiverheid (natriumdodecylsulfaat-polyacrylamide gelelektroforese (SDS-PAGE)) en vectoridentiteit (gelelektroforese) via een multilaboratoriumstudie met 16 laboratoria wereldwijd. Daarnaast werden mycoplasma, biolast, steriliteit en endotoxine geëvalueerd om productveiligheid te waarborgen 23,24,25. Een diepgaand overzicht van AAV-analytische karakterisering, inclusief de belangrijkste assays en de informatie die elke assay levert, wordt gepresenteerd in Sectie 4.
Hoewel ATCC RSM's baanbrekende materialen waren op het gebied van AAV, wordt hun bruikbaarheid beperkt doordat ze meer dan tien jaar geleden zijn geproduceerd, voordat veel huidige analytische benaderingen voor AAV-karakterisering breed werden toegepast. Zo bevatte de oorspronkelijke karakterisering geen lege/volledige capsidprofilering, wat hun directe toepasbaarheid voor standaardisatie van capsid-inhoudsanalyse beperkt, wat nu wordt beschouwd als een belangrijke CQA voor rAAV. Daarnaast werd aanzienlijke variabiliteit tussen laboratoriums gerapporteerd voor vectorgenoomtiter, capsidtiter en infectieuze titer, ondanks het gebruik van gedeelde protocollen en reagentia, wat onderstreept dat gemeenschappelijke materialen alleen niet geharmoniseerd zijn en dat meer volwassen assays met gedetailleerde SOP's even belangrijk zijn. Volgens de huidige leveranciersinformatie is de beschikbaarheid van deze materialen ook beperkt, wat de bredere implementatieverder kan beperken. Volgens de huidige productinformatie van de leverancier is de beschikbaarheid van deze materialen beperkt tot 3 flesjes per klant per jaar voor AAV2 (ATCC VR-1616), waarbij de levering als in afwachting van aanvulling wordt genoteerd, en 12 flesjes per klant per jaar voor AAV8 (ATCC VR-1816). Deze beperkingen beperken noodzakelijkerwijs het bredere en routinematige gebruik van deze materialen als gemeenschapsbrede RSM's26,27.
- USP-standaarden
Wat betreft farmacopeale initiatieven is de USP momenteel de enige organisatie die primaire RSM's voor AAF heeft geproduceerd. De volgende karakteriseringsgegevens zijn gebaseerd op USP application notes 28,29,30. In 2025 bracht de USP AAV8 RSM uit voor volledige en lege capsides in een poging capsid-inhoudsanalyse te standaardiseren. Om dit te bereiken stelde de USP RSM's op met hoge concentraties (> 3,0E+12 virale deeltjestiter per milliliter (vp·mL-1)) en aanzienlijke volumes (300 μL), waardoor hun toepassing mogelijk werd op verschillende capsid-inhoudanalysemethoden. Er werd een uitgebreide multi-laboratorium samenwerkingsstudie uitgevoerd om de USP AAV RSM volledig te evalueren en de nauwkeurigheid en precisie van de meting te waarborgen. Deze studie betrof vijf onafhankelijke laboratoria en maakte gebruik van verschillende capsid-inhoudsanalysetechnieken: AUC, SEC-MALS, CD-MS, MP en UV/Vis. Aanvullende biofysische karakteriseringsmethoden werden toegepast op de AAV-monsters, waaronder peptidemapping, next-generation sequencing (NGS), dPCR en capillaire gelelektroforese (CGE), wat verdere deeltjeskarakteriseringsgegevensleverde 28.
Daarnaast ontwikkelde USP een op AAV5 gebaseerde kwantitatieve PCR-controle met cytomegalovirus (CMV) enhancer, chicken β-actine (CBA) promotor, groen fluorescerende eiwit (GFP), simian virus 40 (SV40) polyadenylatiesignaal, bedoeld voor gebruik als standaard curvekaliber of assaycontrole bij genoomtitermetingen. De capside-inhoud werd bepaald door SEC-MALS, terwijl de virale genoomtiter werd gekwantificeerd door dPCR gericht op meerdere sequenties. Een multilaboratorium dPCR-studie, inclusief 4 laboratoria, toonde aan dat het richten op SV40 lagere interlaboratoriumvariabiliteit opleverde (CV 11,2%) vergeleken met ITR-targeting (CV 36,1%), waarschijnlijk door interferentie in de ITR-secundaire structuur. Bijgevolg is de toegewezen referentiewaarde gebaseerd op SV40 gerichte titer en is gelijk aan 7 x 1010 vg·mL-1,32. Wat betreft referentiematerialen voor capsidtiter-assays, levert USP capsid-titerreferentiematerialen voor AAV1, AAV5, AAV8 en AAV9. Deze materialen, gekarakteriseerd door SEC-MALS voor absolute kwantificatie van capsiddeeltjes en variërend van 1x1011 tot 1x1012 vg·mL-1, kunnen dienen als standaard krommekalibers of positieve controles in kapsidtiterassays30.
- Commerciële standaarden
Verschillende commerciële bedrijven bieden AAV volledige en lege RSM's aan voor meerdere serotypen, bijvoorbeeld PROGEN, AAVnergene en Revvity; De volgende karakteriseringsgegevens en productspecificaties zijn gebaseerd op door leveranciers verstrekte informatie, waaronder productbladen en toepassingsnotities 31,32,33,34,35. Als secundaire RSM's worden deze materialen vaak vergeleken met ATCC RSM's. In vergelijking met farmacopeale RSM's bestrijken deze RSM's een breder scala aan serotypen, waarbij bepaalde leveranciers AAV1–13 en gemodificeerde varianten leveren. Commerciële RSM's worden doorgaans gekarakteriseerd op basis kwaliteitsattributen zoals capsidtiter (door ELISA of SEC-MALS), vectorgenoomtiter (door qPCR of dPCR) en capsidinhoud (vaak door één analytische methode).
Sommige van deze commerciële materialen zijn echter slechts in kleine hoeveelheden beschikbaar, waardoor hun gebruik beperkt wordt voor uitgebreide methodeontwikkeling van verschillende assays of multi-site studies. Bovendien ontbreekt een uitgebreide karakterisering via een multilaboratorium samenwerkingsstudie met meerdere orthogonale technieken, waaronder stabiliteitsbeoordeling, waardoor het vertrouwen in toegewezen waarden en interlaboratorium toepasbaarheid beperkt wordt. Ondanks deze beperkingen spelen commerciële RSM's een belangrijke rol bij assay-ontwikkeling, validatie en procesoptimalisatie, en kunnen ze dienen als tijdelijke RSM's wanneer primaire RSM's niet beschikbaar zijn voor specifieke serotypen.
Sommige leveranciers werken aan strengere karakteriseringsprotocollen en meer transparantie om de bruikbaarheid van hun RSM-aanbod te vergroten36,37.
- Interne standaarden
Individuele laboratoria kunnen ook interne RSM's ontwikkelen, een strategie die vaak wordt toegepast voor unieke AAV-producten, zoals capsid-engineered serotypen of specifieke virale genoomconstructies. Interne RSM's kunnen ook worden geprefereerd om kosten te verlagen, aangezien primaire en commerciële secundaire referentiematerialen duur kunnen zijn. Waar mogelijk moeten deze interne RSM's worden vergeleken met primaire RSM's om vervolgens te worden gebruikt voor assay-ontwikkeling, validatie, routinematige tests tijdens de productie of kwaliteitscontrole. Verschillende belangrijke overwegingen gelden bij het gebruik van interne RSM's: deze materialen moeten grondig worden gekarakteriseerd, voldoende hoeveelheden moeten worden gereserveerd en protocollen moeten worden opgesteld om de stabiliteit in de loop van de tijd te monitoren. Bovendien is planning voor de productie van nieuwe RSM-batches cruciaal, inclusief het behouden van voldoende materiaal uit de vorige batch om metingen te overbruggen en continuïteit te waarborgen gedurende de productontwikkeling20. In sectie 3 wordt een gedetailleerd overzicht gegeven van strategieën voor interne RSM-productie, inclusief upstream en downstream processen evenals analytische karakterisering. Samen bieden deze benaderingen een praktisch kader voor het genereren van interne RSM's.
3. RSM-productiestrategieën:
Het produceren van hoogzuivere AAV-RSM's brengt inherente uitdagingen met zich mee. Het bereiken van 100% lege capsidepreparaten wordt bemoeilijkt doordat "lege" capsiden mogelijk restmateriaal van genetisch materiaal bevatten. Evenzo blijkt het verkrijgen van pure volledige capsidepreparaten moeilijk omdat lege en gedeeltelijk gevulde capsiden vergelijkbare fysieke kenmerken delen en co-purificeren met volledige capsiden tijdens scheidingsprocessen10. Ondanks deze uitdagingen maken aanzienlijke vooruitgang in productietechnologie nu de verrijking mogelijk van voornamelijk volle of overwegend lege capsidepopulaties. De volgende sectie geeft een uitgebreid overzicht van de huidige productie- en scheidingstechnologieën, evenals karakteriseringsmethoden en formuleringsvoorwaarden die kunnen worden gebruikt voor het produceren, karakteriseren en opslaan van AAV-RSM's.
- Upstream verwerking
rAAV, net als andere biotherapeutica, moet worden geproduceerd in levende cellen, meestal via transiënte transfection of virusinfectie-gebaseerde platforms. De dominante benadering voor klinisch materiaal is triple-plasmid transiënte transfectie in HEK293-suspensiecellen, waarbij drie afzonderlijke plasmiden worden gebruikt voor het ITR-geflankeerde transgen, de rep/cap-genen en helperfuncties; Dit flexibele, hulpvaardige virusvrije systeem ondersteunt snelle uitwisselbaarheid van serotype en transgen en wordt gebruikt voor de meeste klinische programma's en goedgekeurde producten38. De kosten van plasmid-DNA stijgen echter aanzienlijk naarmate de productie toeneemt, wat een aanzienlijk nadeel vertegenwoordigt. Om de grondstofkosten te verlagen, zijn productiesystemen gestroomlijnd van drie plasmiden naar ofwel twee (rep/cap/helper-genen op het ene plasmide, transgeen op een andere) of één (met alle genen op één plasmide)39,40. HEK293-cellen kunnen worden gekweekt in adherente of suspensieformaten met vergelijkbare productiviteit, hoewel suspensiekweek de voorkeur heeft vanwege de schaalbaarheid41.
Alternatieve productieplatforms zijn onder andere het Baculovirus Expression Vector System (BEVS) in Sf9- of andere insectencellen, stabiele producercellijnen, systemen gebaseerd op het herpes simplex-virus en induceerbare expressiesystemen. Opvallend is dat verschillende productieplatforms aanzienlijk verschillende lege/vol-ratio's kunnen opleveren, zelfs voor hetzelfde serotype, met een gerapporteerde %vol die varieert van 8% tot meer dan 39%, afhankelijk van het platform en het specifieke AAV-serotype dat wordt gebruikt42.
Het kiezen van het juiste productieplatform en het optimaliseren van upstream condities voor RSM-generatie vereist zorgvuldige overweging van de beoogde capsidpopulatie. Met betrekking tot HEK293 transiënte transfectie, het meest gebruikte productiesysteem voor klinisch materiaal en momenteel beschikbare RSM's (Tabel 1), kunnen verschillende procesparameters worden geoptimaliseerd om zowel de opbrengst als de lege/volle capsidverhouding te verbeteren. Voor volledige capside-RSM's is upstream procesoptimalisatie gericht op het maximaliseren van opbrengst en genoomverpakkingsefficiëntie om de vorming van partiële of lege capsiden te minimaliseren, aangezien de initiële lege/volledige/volledige verhouding in ruwe lysaat direct invloed heeft op de downstream leeg/volledige/volledige verhouding. Belangrijke parameters zijn celdichtheid bij transfectie, plasmidmolaire verhoudingen, de verhouding van transfectiereagens tot DNA, oogsttiming, kleine molecuuladditieven (bijv. celcyclusarrestmiddelen) en transgencassette-ontwerp 40,43,44,45,46.
Lege capside-RSM's worden doorgaans geproduceerd door het transgeenplasmide tijdens transfectie weg te laten, waardoor DNA-verpakking na capsidassemblage wordt voorkomen. In de praktijk bevatten deze "lege" preparaten echter vaak nog steeds besmettend DNA, waardoor ze compositiematig heterogeen zijn en de noodzaak van grondige analytische karakterisering benadrukt47,48.
- Downstream verwerking
Het downstreamproces (DSP) omvat het oogsten, klaren en zuiveren van de vector om een zeer zuiver AAV-product te verkrijgen, terwijl zowel een hoge vectoropbrengst als een optimale leeg/vol-verhouding wordt gegarandeerd. De downstreamverwerking begint 72 uur na transfectie met cellyse om intracellulaire rAAV's terug te winnen49. Hoewel virale uitstroming per serotype varieert, zorgt cellyse voor een volledig intracellulair herstel50. Lysis wordt mechanisch bereikt via vries-dooicycli of chemisch met detergent-gebaseerde buffers (bijv. Triton X-100, Tween-20/80, CHAPS), waarbij chemische methoden worden geprefereerd voor betere schaalbaarheid49,51. Nucleasebehandeling (bijv. Benzonase) tijdens de lysis breekt niet-kapsideerde vectorgenomen af en besmet plasmide-DNA, waardoor bias in genoomtitratie voorkomt en de viscositeit van het DNA vermindert voor verdere DSP-stappen. Een veelgebruikte lysisbuffer voor HEK293-afgeleide rAAV is 50 mM Tris-HCl (pH 8,0), 150 mM NaCl, 0,1% Triton X-100, Benzonase 25–50 U.mL-1,51. Het lysaat wordt vervolgens gezuiverd door dieptefiltratie of centrifugatie om cellulair afval te verwijderen. Tangentiële stromingsfiltratie (TFF) concentreert vervolgens de oogst en wisselt de buffer uit voor downstream zuivering, hoewel deze stap kan worden weggelaten als de downstream zuiveringsstap grote volumes kan verwerken. Verdere zuivering verloopt via ultracentrifugatie (UC) of chromatografie-gebaseerde methoden52.
Gradiëntdichtheid UC, meestal via cesiumchloride (CsCl) gradiënt of jodixanol, wordt traditioneel gebruikt voor rAAV-zuivering, wat zorgt voor een hoge opbrengst en effectieve scheiding van volledige capsiden van proces- en productgerelateerde onzuiverheden53. Hoewel UC serotype-onafhankelijkheid en hoge zuiverheid biedt, heeft het aanzienlijke tekortkomingen, waaronder handmatige behandeling, beperkte schaalbaarheid voor grote volumes en arbeidsintensieve verwerking. Kolomchromatografie is een voorkeursalternatief geworden, met schaalbaarheid, snellere verwerkingstijden en automatiseringsmogelijkheden, en is met succes toegepast voor de productie van klinisch rAAV en rAAV RSM. Kolomchromatografie voor rAAV wordt doorgaans uitgevoerd in twee opeenvolgende stappen: capture en polishing52,54.
Affiniteitschromatografie dient als de primaire vangststap, waarbij geïmmobiliseerde liganden op harsen worden gebruikt om AAV-capsiden te binden en de meeste procesgerelateerde onzuiverheden te verwijderen. Enkelvoudige antilichaamfragmenten (VHH) zijn recentelijk de voorkeurskeuze voor ligand geworden vanwege hun veelzijdigheid tussen serotypen en hoge specificiteit. Veelgebruikte antilichaam-gebaseerde kolommen zijn onder andere POROS CaptureSelect AAVX, AVB Sepharose High Performance en Capto AVB51. POROS CaptureSelect AAVX biedt de breedste specificiteit, met bindende AAV1–9, rAAV-10 en geengineerde varianten, waardoor het geschikt is voor serotype-agnostische zuivering55. Het wordt vaak gebruikt voor de meeste commerciële rAAV RSM-zuiveringen (Tabel 1). Omdat affiniteitskolommen geen onderscheid kunnen maken tussen volledige en lege capsiden, aangezien de epitopen op beide varianten aanwezig zijn, wordt een verdere polijststap toegepast. De polijststap maakt doorgaans gebruik van anionenwisselingschromatografie (AEX) om volledige en lege kapsiden te scheiden. Deze methode maakt gebruik van het lichte iso-elektrische punt (pI) verschil tussen volledige (~5,9) en lege (~6,3) capsidpopulaties52. Er zijn commercieel drie stationaire faseformaten beschikbaar: packed ressins, monolieten en membraankolommen53. De vergelijkende prestatiegegevens voor AAV over alle drie de formaten zijn beperkt. Monolieten en membraankolommen ondersteunen echter hogere convectieve debietsnelheden, waardoor ze op grotere schaal worden verkozen waar een verminderde verwerkingstijd cruciaal is. Volgepakte harsen zijn afhankelijk van diffusie-beperkte massaoverdracht en hogere tegendruk, wat de debietsnelheden beperkt56,57. Een lijst van commercieel verkrijgbare AEX-columns is te vinden in een recensie van Jungbauer et al.51. Voor elusie worden stapgewijze zoutgradiënten steeds meer verkozen boven ondiepe, continue zoutgradiënten, omdat vaste zoutstappen minder gevoelig zijn voor instrumentele variaties (pompmenging, debietsnelheid) dan continu veranderende gradiënten, wat de reproduceerbaarheid verbetert en het bufferverbruik vermindert52. Geoptimaliseerde AEX-protocollen kunnen >90% volledige capsidzuiverheid bereiken over meerdere serotypen heen.58. In tegenstelling tot UC heeft AEX echter nog geen betrouwbare scheiding van gedeeltelijk gevulde capsiden aangetoond, en elk serotype vereist optimalisatie omdat het ladingsprofiel per serotype varieert51. Opvallend is dat de meeste commerciële RSM-zuiveringsprocessen affiniteitsvangstchromatografie combineren met UC (jodixanol of CsCl) als polijststap, waarbij de hoge zuiverheidsvoordelen van UC worden benut na de initiële affiniteitsgebaseerde verwijdering van onzuiverheden (Tabel 1).
- Formulering
AAV-formuleringsoptimalisatie is belangrijk om de stabiliteit van RSM en de houdbaarheid ervan te waarborgen. Het formuleringontwerp omvat selectie van hulpstoffen, osmolariteitsregulatie, buffer, selectie van oppervlakteactieve stoffen en controle van ionensterkte om aggregatie te minimaliseren. De meest voorkomende buffersystemen zijn fosfaat-gebaseerde, tris, acetaat, citraat en lactaat, die doorgaans opereren binnen een pH-bereik van 7,4 ± 0,3 bij verschillende serotypen. Hulpstoffen zijn stabiliserende middelen die vaak voorkomen in AAV-formuleringen, waaronder NaCl, KCl, poloxamer 188 (Px188), MgCl₂, CaCl₂, sucrose, PS20, sorbitol, mannitol, glycerol en humaan serumalbumine. Px188 met ~0,001% wordt vaak gebruikt om de interfaciale en mechanische spanning te verminderen, waardoor kapsidruptuur en titerverlies tijdens het hanteren en vriesdooi59 worden beperkt. Osmolariteit is een belangrijke overweging bij toediening op mensen, maar minder relevant voor onderzoeksniveau RSM's60. De meeste commerciële RSM's gebruiken PBS-gebaseerde buffers, die af en toe worden aangevuld met extra zouten. Leveranciers raden aan om opslag te houden bij -80 °C en meerdere vries-dooicycli te vermijden, omdat dit kapsidebreuk bij ijs-watergrensen kan bevorderen, wat kan leiden tot verlies in titer 34,61.
4. Analytische karakterisering: Het definiëren van de standaard
Zodra de RSM is geproduceerd, gezuiverd en geformuleerd, wordt een uitgebreide analytische karakterisering uitgevoerd. Deze stap waarborgt de kwaliteit van de RSM en de toepasbaarheid ervan als referentie over verschillende analysemethoden. Het toepassen van orthogonale analytische technieken om dezelfde kwaliteitskenmerken te beoordelen is bijzonder belangrijk om robuustheid te waarborgen en wordt daarom sterk aanbevolen. De belangrijkste kwaliteitsattributen specifiek voor AAV RSM kunnen worden onderverdeeld in drie categorieën: titer, identiteit en zuiverheid, zoals vermeld in Tabel 2.
- Titer
RSM-karakterisering omvat het meten van titer, gekwantificeerd als vectorgenoomtiter en capsiddeeltjestiter, en geeft informatie over het aantal aanwezige vectorgenomen en capsiden. Genoomtiter wordt doorgaans gemeten met qPCR of dPCR, gericht op het transgen, ITR's of andere transgene cassette-elementen, waarbij het ontwerp van de assay en de plaatsing van primer/probe de resultaten significant beïnvloeden. ITR-gebaseerde assays zijn serotype-onafhankelijk en breed toepasbaar, maar de haarspeldstructuur van ITR's kan primerbinding belemmeren, en dergelijke assays kunnen titers overschatten wanneer gedeeltelijk gevulde capsiden die ITR-sequenties vasthouden aanwezig zijn; Van ITR-targeting qPCR is aangetoond dat ze genoontiters voor AAV2- en AAV8-RSM's overschatten ten opzichte van expression cassette-targeting assays11. Een verdere bron van bias in qPCR is het gebruik van dubbelstrengs plasmide-DNA-kalibers, die een andere amplificatiekinetiek vertonen dan enkelstrengs rAAV-genomen29.
dPCR pakt beide beperkingen aan door absolute kwantificatie via Poisson-statistiek, waarbij standaardcurve-afhankelijkheid wordt geëlimineerd en minder gevoelig is voor ITR-secundaire structuurinterferentie62. Opmerkelijk is dat qPCR een vergelijkbare nauwkeurigheid kan bereiken wanneer het wordt gekalibreerd tegen een rAAV-gebaseerd in plaats van plasmid-gebaseerd kalibeurt, wat een kosteneffectiever alternatief63 biedt. Een geschikte voorbehandeling voor het monster is even belangrijk. De behandeling met DNase verwijdert extern DNA om ervoor te zorgen dat alleen ingekapselde genomen worden gekwantificeerd, en moet gevolgd worden door inactivatie vóór capside-verstooring, met behulp van proteïnase K of warmtebehandeling 64,65,66. Een geoptimaliseerd en gevalideerd protocol voor ddPCR-gebaseerde genoomkwantificatie in gezuiverde vectormonsters is gepubliceerd door onze onderzoeksgroep67.
De capsidedeeltjestiter wordt meestal bepaald met een ELISA of SEC-MALS. ELISA biedt hoge specificiteit en robuustheid voor matrixeffecten, maar is serotype-specifiek, standaardcurve-afhankelijk en arbeidsintensief. SEC-MALS is serotype-onafhankelijk en sneller, maar vereist gespecialiseerde instrumentatie22.
- Identiteit
De beoordeling van identiteit heeft als doel te bevestigen dat de geproduceerde AAV voldoet aan het beoogde serotype en de genomische sequentie, waarbij onbedoelde veranderingen op zowel eiwit- als DNA-niveau worden uitgesloten. Capsideiwitidentiteit verwijst naar serotype-identificatie. Veelvoorkomende methoden zijn ELISA en western blot (WB) met behulp van serotype-specifieke antilichamen. Meer recentelijk is massaspectrometrie gekoppeld aan high-performance vloeistofchromatografie (LC-MS) naar voren gekomen als een hogere-orde, complementaire benadering voor serotype-identificatie en capside-samenstellingsanalyse vanwege de hoge reproduceerbaarheid, nauwkeurigheid en robuustheid, hoewel het doorgaans niet wordt gebruikt voor routinematige interne RSM-karakterisering 6,22. De identiteit van het vectorgenoom kan worden beoordeeld met sequencingmethoden, zoals nanoporesequencing. Deze aanpak biedt een lange leesdekking van volledige AAV-genomen, waardoor een nauwkeurige bepaling van sequentie-identiteit22 mogelijk is.
- Zuiverheid
Een derde belangrijke kwaliteitsparameter voor AAV RSM's is zuiverheid, waaronder eiwitzuiverheid, integriteit van capsiden en genoomen, capside-inhoud en aggregatie. Capsidintegriteit wordt geëvalueerd door VP-stoichiometrie (VP1:VP2:VP3 ≈ 1:1:10) te verifiëren met behulp van Sodium Dodecyl Sulfate-Polyacrylamide Gel Electrophorese (SDS-PAGE), Capillary Electrophorese Sodium Dodecyl Sulfate (CE-SDS), of WB, waarbij WB daarnaast capsideproteïne-identiteitsbevestiging22 levert.
De integriteit van het genoom, of het transgeen nu volledig of afgeknott is, kan worden beoordeeld met Agarose Gel Elektroforese (AGE), multiplex ddPCR, of sequencing-gebaseerde benaderingen zoals nanoporesequencing. Hoewel AGE eenvoudig is, biedt het beperkte resolutie en specificiteit. Multiplex ddPCR levert kwantitatieve, regio-specifieke gegevens die gel-gebaseerde methoden niet kunnen, zij het ten koste van een uitgebreidere assayontwikkeling22,68.
Het capsidgehalte wordt vaak geschat door de genoomtiter te delen door de capsidtiter; dit is echter afhankelijk van twee onafhankelijke assays, wat extra variabiliteit kan veroorzaken en daarom niet wordt aanbevolen voor RSM-karakterisering. Geschiktere technieken voor deze eigenschap met lagere variabiliteit zijn AUC, SEC-MALS, MP, CD-MS en UV/Vis 8,69,70,71,72,73. Recente ontwikkelingen hebben de waarde van AUC en SEC-MALS als multi-attribuut methoden verder verhoogd. In het bijzonder maakt multi-wavelength AUC (MWL-AUC) niet alleen het onderscheiden van lege, gedeeltelijk gevulde en volledige capsiden mogelijk, maar ook beoordeling van genoomtiter, capsidtiter en aggregatie71,74. Evenzo kan SEC-MALS binnen één enkele assay informatie leveren over capsidtiter, genoomtiter, zuiverheid, aggregatie en volledige tot lege capsidverhoudingen73,75. Aggregatie kan ook worden gemonitord met dynamische lichtverstrooiing (DLS). Opmerkelijk is dat alleen AUC, MP en CDMS traditioneel voldoende resolutie boden om gedeeltelijk gevulde capsiden te kwantificeren. Onlangs is echter een verbeterde TEM-methode ontwikkeld, die ook gedeeltelijk gevulde capsiden nauwkeurig kan kwantificeren in vergelijking met SV-AUC en MP76. Omdat geen enkele methode tot gouden standaard voor capside-inhoud is geworden en deze technieken gebaseerd zijn op verschillende analytische principes, wordt het gebruik van meerdere complementaire benaderingen aanbevolen om een uitgebreide beoordeling van de algehele zuiverheid10 te verkrijgen.
- Stabiliteit
Langdurige stabiliteit is cruciaal voor RSM's, omdat referentiewaarden constant moeten blijven om betrouwbare kalibratie over de tijd te garanderen. AAV-RSM's worden doorgaans opgeslagen bij ≤ -70 °C om de integriteit van capside en genoom te behouden. Een multilaboratorium stabiliteitsstudie van AAV8 RSM (ATCC VR-1816) toonde stabiele vectorgenoomtiter, infectieuze titer en capsidtiter aan gedurende minstens twee jaar bij < -70 °C77. Procedures voor stabiliteitstesten kunnen de richtlijnen van ICH Q1A volgen, waarbij belangrijke eigenschappen op bepaalde intervallen worden beoordeeld: elke 3 maanden (jaar 1), elke 6 maanden (jaar 2) en daarna jaarlijks 78. Kortetermijnstabiliteit bij versnelde opslagcondities (2–8 °C) wordt doorgaans geëvalueerd na 1, 2 en 4 weken79. Kritieke stabiliteitsindicerende eigenschappen zijn onder andere genoomtiter, capsidtiter, capsidinhoud, capsideiwitintegriteit en aggregatie. RSM's moeten ook worden geëvalueerd op vries-dooi gevoeligheid80.
5. Geharmoniseerde SOP's als tweede pijler van AAV-analytische standaardisatie
Naast de beschikbaarheid van goed gekarakteriseerde RSM's vereist betekenisvolle standaardisatie in AAV-analyse ook geharmoniseerde, voldoende gedetailleerde SOP's. Zelfs wanneer dezelfde analytische methode wordt toegepast, kunnen de resultaten aanzienlijk verschillen tussen laboratoria vanwege verschillen in monstervoorbehandeling, instrumentele instellingen, kalibratiestrategie, gegevensverwerking en interpretatiecriteria, factoren waarvan is aangetoond dat ze bijdragen aan interlaboratoriumvariabiliteit onafhankelijk van het analytische platformzelf 8,9.
Dit wordt geïllustreerd door een samenwerkingsstudie tussen NIST, het National Institute for Innovation in Manufacturing Biopharmaceuticals (NIIMBL) en USP, waarin zes laboratoria dezelfde AAV5- en AAV8-monsters evalueerden op capsidinhoud met vier methoden. Optische methoden, waaronder SEC-MALS en UV/Vis, vertoonden de sterkste interlaboratoriumovereenkomst, terwijl PCR-ELISA een slechte reproduceerbaarheid vertoonde en als ongeschikt werd beschouwd voor kwantitatief gebruik zonder verdere harmonisatie. Hoewel SV-AUC algemeen wordt beschouwd als een goudstandaardmethode, toonde het een grotere interlaboratoriumvariabiliteit dan SEC-MALS, en vervolginspanningen om gestandaardiseerde SV-AUC-procedures te ontwikkelen zijn als een belangrijke volgende stap geïdentificeerd 8,81.
Een vergelijkbare conclusie is gekomen voor het bepalen van genoomtiters door dPCR, waarbij voorbehandeling van het monster, extractiestrategie, instrumentplatform, verdunningscondities, timing van capsidelyse en de geschiedenis van vries-ontdooi allemaal invloed kunnen hebben op gerapporteerde waarden. Belangrijk is dat striktere procedurele controle de variabiliteit aanzienlijk verminderde, wat de waarde van geharmoniseerde SOP's9 verder onderstreept.
RSM's en SOP's moeten daarom worden gezien als complementaire pijlers van AAV-analytische standaardisatie. RSM's bieden het meetanker dat nodig is voor traceerbaarheid en kalibratie, terwijl SOP's procedurele variabiliteit verminderen en helpen ervoor te zorgen dat toegewezen waarden consistent worden weergegeven tussen analisten, instrumenten en laboratoria.