Amfifiele blokcopolymeren kunnen zichzelf assembleren in waterige oplossing tot membranen, die spontaan krommen en sluiten om bolvormige, membraanomheinde compartimenten te vormen die bekend staan als polymersomen (polymeerblaasjes). In vergelijking met lipidemembranen bieden polymeergebaseerde compartimenten een grotere chemische veelzijdigheid en verbeterde chemische1 en mechanische stabiliteit2, waardoor ze zeer aantrekkelijk zijn voor toepassingen zoals medicijnafgifte, nano- en microreactoren, en de bouw van duurzame kunstcellen. Zowel onze groep als anderen hebben polymeermembranen gefunctionaliseerd door membraaneiwitten in te brengen om kunstmatige organellen en cellente creëren 1,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15 . Polymeren met een poly(dimethylsiloxaan) (PDMS) hydrofobe kern zijn bijzonder geschikt voor de incorporatie van membraaneiwitten vanwege de hoge ketenflexibiliteit en de mogelijkheid om de hydrofobe dikte van het membraan beter aan te passen bij het transmembraandomein5 van het eiwit. Hoewel ons laboratorium zich voornamelijk heeft gericht op het graft copolymeer poly(dimethylsiloxaan)-graft-poly(ethyleenoxide) (PDMS-g-PEO), dat zeer dynamische membranen vormt 4,16,17 die zachter zijn dan conventionele lipide-dubbellagen en een dikte van ongeveer 5,3 nm1 vertonen, hebben andere groepen met succes PDMS-gebaseerde triblokcopolymeren zoals PMOXA-b-PDMS-b-PMOXA5 toegepast,6,7,8,9,10,11 en PEtOz-b-PDMS-b-PEtOz12 voor membraaneiwitreconstitutie. Zelfs relatief rigide diblokcopolymeren zoals PBD-b-PEO, vooral in hybride systemen gemengd met lipiden, zijn gebruikt voor succesvolle eiwitopname13. Deze voorbeelden benadrukken de veelzijdigheid van polymeergebaseerde membranen als reconstitutieplatforms, die bovendien een verbeterde chemische stabiliteit1 en een verlengde functionele levensduur14 kunnen bieden voor geïntegreerde membraaneiwitten. Hoewel polymeer/lipidehybride membranen niet altijd de chemische stabiliteit van zuivere polymeersystemen1 evenaren, bieden ze een aantrekkelijk compromis door de mechanische robuustheid van polymeren te combineren met de biologische relevantie van lipiden. Dit resulteert in een membraanomgeving die beter lijkt op inheemse biologische membranen, terwijl de belangrijkste voordelen van synthetische materialen behouden blijven. Dergelijke hybride architecturen kunnen extra voordelen bieden, waaronder een verminderde protonpermeabiliteit die ontstaat door nanoschaalherschikking1 en domeinvorming binnen het membraan15.
Er bestaan verschillende technieken om membraaneiwitten te reconstitueren tot nanogrote blaasjes (LUV's), waaronder organisch-oplosmiddelgemedieerde reconstitutie (bijv. reverse-fase verdamping, rehydratatie van lipide-eiwitfilms), mechanische benaderingen (bijv. sonicatie, French press, vries-dooi) en detergent-gemedieerde reconstitutie (via detergentverwijdering, verdunning of directe inbouw)18, en recentere strategieën zoals directe overdracht van styreen-maleïnezuur copolymeer-nanodiscs19. Porines zijn met succes opgenomen in polymeer-LUV's via directe insertie, bijvoorbeeld door het eiwit aan de polymeerfilm toe te voegen tijdens rehydratatie8. Deze aanpak resulteert over het algemeen in een lage insertie-efficiëntie voor grotere of complexere membraaneiwitten en leidt vaak tot willekeurige eiwitoriëntatie. Daarom blijft detergent-gemedieerde reconstitutie, waarbij gecontroleerd wasmiddel wordt toegevoegd gevolgd door het verwijderen, de meest gebruikte methode. Het is ook de voorkeursstrategie om grotere membraaneiwitten in polymeer-gebaseerde LUV's te integreren, vooral voor asymmetrische eiwitten waarbij gecontroleerde oriëntatie cruciaal is voor de functie. Bij deze benadering worden membranen van blaasjes eerst verzadigd met het gewenste detergent (de verzadigde detergentconcentratie wordt aangeduid als Rsat), gedeeltelijk opgelost (co-existentie van blaasjes en micellen), of volledig opgelost, d.w.z. afgebroken tot micellen (detergentconcentratie wordt aangeduid als Rsol). Deze eerste membraanbehandeling wordt gevolgd door eiwittoevoeging, incubatie en detergentverwijdering18. Dit laatste kan worden bereikt via dialyse, grootte-uitsluitingschromatografie of adsorptie op hydrofobe polystyreenkralen (bijv. Bio-Beads). De keuze van detergent, concentratie en verwijderingsmethode zijn geoptimaliseerd voor elk membraantype en eiwit om de incorporatie-efficiëntie te maximaliseren en de eiwitoriëntatiete beheersen.
Hoewel LUV's goed geschikt zijn voor bulkactiviteitenmetingen, vereisen enkelblaasstudies en analyses op basis van optische microscopie dat membraaneiwitten worden gereconstitueerd tot gigantische unilamellaire blaasjes (GUV's). Vijf hoofdbenaderingen worden gebruikt voor eiwitincorporatie in GUV's: coformatie in aanwezigheid van eiwit en organisch oplosmiddel21, coformatie in aanwezigheid van detergent22, invoeging in voorgevormde GUV's via detergentverdunning23, invoeging via membraanfusie met proteo-LUV's16,24, en fusie-elektroformatie25. Hoewel deze benaderingen met succes zijn toegepast op lipide GUV's, is hun overdracht naar polymeer- of polymeer/lipidehybride GUV's vaak uitdagend. In het bijzonder leiden co-formatie- en detergent-verdunningsmethoden vaak tot lage insertie-efficiënties in polymeermembranen of zijn ze onverenigbaar met bepaalde polymeersamenstellingen15. Fusie-gebaseerde strategieën 4,16,24,26,27 die afhankelijk zijn van extra fusogene middelen kunnen ook problematisch zijn, aangezien synthetische kationische lipiden/polymeren of fusogene peptiden de stabiliteit van membraaneiwitten kunnen aantasten, de membraaneigenschappen kunnen veranderen of de incorporatie-efficiëntie van het doeleiwit kunnen verminderen. Fusie-elektroformatie overwint veel van deze beperkingen en is bewezen een robuuste en efficiënte methode te zijn om membraaneiwitten te integreren in polymeer- en polymeer/lipidehybride GUV's 1,5,15. Deze aanpak maakt gecontroleerde eiwitopname mogelijk, terwijl membraanintegriteit en eiwitfunctionaliteit behouden blijven, waardoor het bijzonder geschikt is voor de generatie van eiwitgefunctionaliseerde polymeer-GUV's.
Het reconstitueren van protonpompen in polymeer-gebaseerde blaasjes is essentieel voor het construeren van duurzame kunstcellen, omdat het de generatie van transmembrane protongradiënten mogelijk maakt—de fundamentele energie-eenheid van levende systemen. Door chemiosmotische energieconversie te recreëren in een gecontroleerde minimale membraanomgeving28, kunnen deze blaasjes ATP-synthese, actief transport en metabole reacties aansturen, waarmee de energetische basis wordt gelegd die nodig is voor autonome, levensechte functionaliteit. Een representatieve protonpomp die in dergelijke systemen wordt gebruikt, is cytochroom bo3 oxidase uit E. coli, een terminale respiratoire enzym die zuurstofreductie koppelt aan protontranslocatie over het membraan. Omdat elektronenoverdracht en protonpompen nauw gekoppeld zijn, kan hun activiteit in synthetische blaasjes kwantitatief worden gemonitord, hetzij door zuurstofverbruik 1,20 of door het volgen van protongradiëntvorming1.
In dit protocol presenteren we een gedetailleerde workflow voor de voorbereiding van PDMS-g-PEO-gebaseerde LUV's, inclusief pure polymeer- en polymeer/lipidehybride membranen, hun functionalisatie met membraaneiwitten, opschaling naar GUV's en activiteitsmetingen van de gereconstitueerde protonpomp cytochroom bo3 oxidase via zowel bulk-zuurstofverbruiksassays als single-vesikel-protonpompmetingen.