Een bibliometrische en gevisualiseerde analyse van mitochondriaal onderzoek bij diabetische nefropathie

Samenvatting

Deze bibliometrische analyse schetst het landschap van mitochondriaal onderzoek bij diabetische nefropathie (DN) en vat belangrijke thematische veranderingen en opkomende onderwerpen samen.

Samenvatting

Deze bibliometrische studie brengt systematisch het wereldwijde landschap van mitochondriaal onderzoek in DN in kaart van 2016 tot 2025. Om consistent te blijven met de studietitel en zoekfocus, wordt DN als primaire term gebruikt, terwijl diabetische nierziekte (DKD) alleen wordt behouden bij het beschrijven van zoektermen, screeningscriteria of oorspronkelijke auteurszoekwoorden. In totaal werden 1.342 publicaties opgehaald uit de Science Citation Index Expanded (SCI-EXPANDED) en Social Sciences Citation Index (SSCI) binnen de Web of Science Core Collection (WoSCC) en geanalyseerd met CiteSpace, VOSviewer en Scimago Graphica. De jaarlijkse publicatieproductie steeg bijna vier keer van 63 in 2016 tot 239 in 2025, en de site-zichtbaarheid op datasetniveau nam ook toe. China leidde in publicatievolume, terwijl Australië en de Verenigde Staten hogere gemiddelde citaties per artikel lieten zien, wat wijst op een verschil tussen output en citatie-gebaseerde zichtbaarheid. Central South University stond op de eerste plaats in institutionele output en totaal aantal citaties onder de getoonde instellingen, maar de samenwerkingsverbindelijkheid was lager dan die van Shanghai Jiao Tong University en Zhejiang University. Sleutelwoord- en referentieanalyses toonden een temporele uitbreiding van door hoge glucose veroorzaakte oxidatieve stress en apoptose naar mitofage, ferroptose, mitochondriale dynamiek, mitochondriën-geassocieerde endoplasmatische reticulummembranen (MAMA's) en het NLRP3-inflammasoom. Interventiegerelateerde en methodologiegerelateerde onderwerpen, waaronder SGLT2-remmers, MitoQ, caloriebeperking, Mendeliaanse randomisatie en metabolomics, werden ook geïdentificeerd. Over het algemeen is het mitochondriaal onderzoek in DN verbreed naar mitochondriale kwaliteitscontrole, gereguleerde celdood, multi-omics benaderingen en interventiegerelateerde onderwerpen. Deze bibliometrische patronen geven de prominente rol van het onderwerp en de zichtbaarheid van citaties aan, in plaats van direct mechanistisch of klinisch bewijs, en kunnen helpen richtingen te identificeren die verdere validatie vereisen.

Inleiding

DN is een van de ernstigste microvasculaire complicaties van diabetes mellitus en een van de belangrijkste oorzaken van eindstadium nierziekte wereldwijd ^1,2. Ondanks aanzienlijke vooruitgang in glucosecontrole, bloeddrukbeheer en de blokkade van het renin-angiotensine systeem, blijft het incident van DN stijgen en ontwikkelt een aanzienlijk deel van de patiënten nog steeds onomkeerbaar nierfalen³. Deze onvervulde klinische behoefte heeft geleid tot een intensieve zoektocht naar nieuwe pathofysiologische mechanismen en therapeutische doelen. Mitochondriën dienen als centrale centra van cellulaire energiemetabolisme, redoxhomeostase en apoptose, en zijn uitgegroeid tot cruciale knooppunten in de pathogenese van DN ^4,5. Studies van de afgelopen twee decennia hebben aangetoond dat door hyperglykemie veroorzaakte mitochondriale disfunctie direct bijdraagt aan podocytletselschade, schade aan tububulaire epitheelcellen, mesangiale expansie en interstitiële fibrose ^6,7. Deze disfunctie wordt gekenmerkt door overmatige productie van reactieve zuurstofsoorten, verminderde oxidatieve fosforylering, mitochondriale fragmentatie, defecte mitofagie en ontregelde mitochondriale biogenese ^8,9. Daardoor zijn mitochondriën-gerelateerde signaalroutes met SIRT3, PGC1α, Drp1, PINK1, Parkin en het NLRP3-inflammasoom belangrijke onderzoeksfocussen^10,11 geworden. Recentelijk hebben opkomende concepten zoals ferroptose, MAMA's en mitochondriale metabole herprogrammering het mechanistische landschap van DN 12,13,14 verder uitgebreid. Het aantal publicaties over mitochondriaal onderzoek in DN is aanzienlijk toegenomen, wat een rijke, maar steeds complexere en gefragmenteerdere kennisbasis heeft opgeleverd.

Gezien de snelle verspreiding van literatuur zijn traditionele narratieve overzichten onvoldoende om systematisch het veranderende intellectuele landschap, samenwerkingsnetwerken en opkomende grenzen van^{dit vakgebied} te vangen. Bibliometrische analyse, een kwantitatieve en visualisatiegebaseerde benadering, biedt een objectieve manier om wetenschappelijke output in kaart te brengen, invloedrijke artikelen, auteurs, instellingen en landen te identificeren, en de dynamiek van onderzoeksonderwerpen in de tijd te detecteren 16,17,18,19,20. Verschillende bibliometrische studies hebben diabetische nefropathie, DKD, mitochondriën-gerelateerde nieronderzoeken of onderwerpen gerelateerd aan oxidatieve stress^onderzocht 21,22,23,24. Desalniettemin kan een geactualiseerde, themagerichte bibliometrische synthese van mitochondriaal onderzoek in DN nog steeds helpen om recente onderzoeksactiviteiten, samenwerkingspatronen, thematische evolutie en opkomende onderwerpen in dit specifieke vakgebied te verduidelijken. In deze studie werden alle relevante publicaties gehaald uit de SCI-EXPANDED en SSCI binnen de WoSCC, die de periode van 2016 tot 2025 beslaan. CiteSpace, VOSviewer en Scimago Graphica werden ingezet om een systematische bibliometrische en visualisatie-analyse uit te voeren. Deze studie schetst het huidige onderzoekslandschap en vat de evolutie samen van belangrijke onderwerpen, waaronder mitofagie, ferroptose, mitochondriale dynamiek en interventiegerelateerd onderzoek, en biedt daarmee een bibliometrische basis om richtingen te identificeren die verdere experimentele en klinische validatie rechtvaardigen.

Protocol

Gegevensverzameling en zoekstrategie

Alle bibliometrische records zijn op 30 april 2026 opgehaald van de SCI-EXPANDED en SSCI binnen de WoSCC. SCI-EXPANDED werd gebruikt om biomedische en levenswetenschappelijke literatuur vast te leggen, terwijl SSCI werd behouden om mogelijk relevante interdisciplinaire archieven op te nemen. De zoekstrategie is opgesteld met verwijzing naar de Medical Subject Headings (MeSH)-database. "Diabetische nefropathieën" en "Mitochondriën" werden afzonderlijk gezocht in MeSH, en de bijbehorende MeSH-termen, instaptermen en gerelateerde subkoppen werden beoordeeld om de trefwoordselectie en synoniemuitbreiding te begeleiden. Omdat Web of Science niet direct MeSH-indexering gebruikt, werden de door MeSH afgeleide termen vertaald naar zoektermen voor onderwerpvelden. De laatste zoekopdracht werd uitgevoerd met de volgende Booleaanse expressie: TS=(("diabetische nefropathie" OF "diabetische nefropathieën" OF "diabetische nierziekte" OF "diabetische nierziekten" OF "diabetische nier" OF "diabetische nier") EN (mitochondriën* OF mitochondriaal* OF mitofagie OF "mitochondriale disfunctie" OF "mitochondriale dynamiek" OF "mitochondriale splijting" OF "mitochondriale fusie" OF "mitochondriale biogenese" OF "mitochondriale kwaliteitscontrole")). Documenttypes waren beperkt tot artikelen en overzichtsartikelen, en de publicatieperiode was vastgesteld van 1 januari 2016 tot 31 december 2025. Deze periode werd gekozen omdat het het meest recente volledige 10-jaar interval was dat beschikbaar was op het moment van de opsporing, waardoor de analyse zich kon richten op hedendaagse ontwikkelingen in mitochondriaal onderzoek in DN, zonder mogelijke bias door een onvolledig publicatiejaar 2026 te vermijden.

Alle records werden geëxporteerd in platte tekst met de optie "Volledig Record en Cited References" geselecteerd. Om de opname van irrelevante records die mogelijk via Keywords Plus worden opgehaald te verminderen, werden de titels, samenvattingen en auteurstrefwoorden van alle opgehaalde records handmatig gescreend. Alleen gegevens die inhoudelijk gerelateerd waren aan mitochondriaal onderzoek in DN of DKD werden bewaard. Publicaties werden uitgesloten als DN of DKD alleen werd genoemd als een van de verschillende diabetische complicaties of als achtergrondinformatie, zonder niergerelateerde uitkomsten, niercelmodellen, nierweefselbewijs, nefropathie-specifieke mechanismen of een primaire focus op DKD. Na het verwijderen van dubbele exemplaren en handmatige screening volgens de vooraf gedefinieerde inclusie- en exclusiecriteria werden 1.342 in aanmerking komende publicaties opgenomen in de eindanalyse.

Analytische tools en mappingworkflow

Basisstatistische analyses en conventionele grafieken, waaronder staafdiagrammen, lijndiagrammen, taartdiagrammen en bubbeldiagrammen, werden gegenereerd met WPS Excel 2023 en GraphPad Prism 10.1. De jaarlijkse publicatieproductie werd samengevat per publicatiejaar. Dataset-niveau jaarlijkse Times Cited-tellingen werden verkregen uit het WoSCC-citatierapport en gedefinieerd als citaties die in elk kalenderjaar door alle 1.342 opgenomen records worden ontvangen, in plaats van citaties van hetzelfde jaar aan jaarlijkse publicatiecohorten of veldbrede jaarlijkse citatietotalen. Voor analyses op land- en regioniveau werden de gemiddelde citaties per artikel berekend door het totale aantal citaties te delen door het aantal publicaties per land/regio. Deze maatstaf werd geïnterpreteerd als een niet-aangepaste beschrijvende indicator van citatiezichtbaarheid binnen de opgehaalde dataset. Het werd niet beschouwd als een directe maatstaf voor nationale onderzoekskwaliteit of academische invloed, omdat citatieaantallen kunnen worden beïnvloed door publicatiejaar, citatievenster, tijdschriftplatform, artikeltype, onderzoeksontwerp en vakgebiedsspecifieke citatiepraktijken.

Kennismapping werd uitgevoerd met VOSviewer 1.6.19, CiteSpace 6.4.R1 en Scimago Graphica 1.0.25. De databases, software en online bronnen die worden gebruikt voor literatuuropvraging, bibliometrische analyse, visualisatie en het ophalen van tijdschriftmetrieken zijn vermeld in de Materiaallijst. Netwerkanalyses werden uitgevoerd met behulp van de volledige telmethode. De WoSCC-platte tekstbestanden werden geïmporteerd in VOSviewer om co-auteurschapsnetwerken op het niveau van land/regio, instelling en auteur op te bouwen, evenals netwerken voor trefwoordco-occuratie en co-citatie in tijdschriften. Voor geografische visualisatie werd het co-auteurschapsnetwerk dat in VOSviewer werd gegenereerd, geëxporteerd als een Graph Modeling Language (GML)-bestand en geïmporteerd in Scimago Graphica, waar een geografische lay-out werd toegepast met een wereldkaart als achtergrond. In deze kaart vertegenwoordigde de knoopgrootte het publicatievolume, en de linkdikte gaf de intensiteit van samenwerking aan. Dezelfde WoSCC-dataset werd geïmporteerd in CiteSpace voor clustering van keyword-tijdlijnen, referentieco-citatieclustering en citatieburstdetectie om de temporele evolutie en intellectuele structuur van het vakgebied te karakteriseren.

Parameterconfiguratie in CiteSpace en VOSviewer

In CiteSpace werd de tijdsperiode vastgesteld van 2016 tot 2025, waarbij elke tijdsperiode op 1 jaar werd gezet, wat in totaal 10 slices opleverde. Knooptypes werden geselecteerd op basis van het analytische doel, waarbij Keyword werd gebruikt voor zoekwoordtijdlijn- en burstanalyses, en Reference voor referentieco-citatie en burst-analyses. Het knooppuntselectiecriterium werd ingesteld op de g-index met een schaalfactor van k = 10, in plaats van een vaste Top N of Top N% drempel, zodat knooppuntselectie zich kon aanpassen aan jaarlijkse citatie- of voorkomsverdelingen, terwijl een interpreteerbare netwerkgrootte^{van 25,26} behouden bleef. Pathfinder snoeien werd toegepast op de tijdsgesneden netwerken en het samengevoegde netwerk, terwijl het Minimum Spanning Tree-algoritme niet werd gebruikt. Voor burstdetectie werd de decay-factor γ ingesteld op 0,5. In de referentie-co-citatieclusteranalyse werden modulariteit Q en gewogen gemiddelde silhouetwaarden berekend om de algehele structuur en clusterconsistentie van het gesnoeide netwerk te beschrijven.

In VOSviewer 1.6.19 werden alle WoSCC-platte tekstbestanden geïmporteerd door te kiezen op "Maak een kaart gebaseerd op bibliografische gegevens" en "Lees gegevens uit bibliografische databasebestanden," waarbij het bestandstype werd gespecificeerd als Web of Science. De volledige telmethode werd gebruikt. Voor co-auteurschapsnetwerken werd de minimale publicatiedrempel vastgesteld op 5 voor landen/regio's en instellingen op 3 voor auteurs.

Voor analyses op institutioneel niveau werden institutionele namen handmatig gecontroleerd en geharmoniseerd volgens de WoSCC-affiliatierecords vóór de netwerkbouw. Het citatieaantal voor elke instelling werd gedefinieerd als het totale WoSCC Times Cited-aantal publicaties dat aan die instelling werd toegeschreven binnen de opgehaalde dataset. Afgekorte nodelabels die in VOSviewer werden gegenereerd, werden verder gecontroleerd aan de hand van de bijbehorende volledige institutionele namen om ambiguïteit te voorkomen. Voor land-/regio-analyse werd het WoSCC land-/regioadresveld gebruikt. Land- en regionamen werden handmatig geharmoniseerd voor spellingvarianten en afkortingen. Engeland, Schotland, Wales en Noord-Ierland werden samengevoegd tot het Verenigd Koninkrijk, en de Volksrepubliek China werd ingekort tot China. Vasteland China werd als China gerapporteerd, terwijl de Speciale Administratieve Regio Hongkong (Hong Kong SAR), Macao SAR en Taiwan als aparte regio's werden behouden als ze afzonderlijk door WoSCC werden geïndexeerd; Er werd geen post-hoc samenvoeging uitgevoerd voor netwerkanalyse op land- of regioniveau. Voor keyword co-occurrence analyse werd de analyse-eenheid ingesteld om trefwoorden te schrijven die uit de WoSCC-records waren gehaald, en de minimale incidentiedrempel werd ingesteld op 5; Bij deze drempel voldeden 89 trefwoorden aan de criteria. Voor de netwerkgeneratie werden synonieme termen en afkortingen die in de auteur-trefwoordenlijst werden geïdentificeerd, handmatig gestandaardiseerd; bijvoorbeeld, afkortingen voor DN en reactieve zuurstofsoorten werden omgezet in hun volledige termen. Voor co-citatieanalyse van tijdschriften werden geciteerde bronnen als analyse-eenheid gebruikt en werd een citatiedrempel toegepast om een interpreteerbaar netwerk van 53 tijdschriften te behouden. De lay-out was ingesteld op LinLog/modulariteit, met Attraction op 2 en Repulsion op -1. De knoopgrootte werd gewogen op basis van het aantal publicaties, citatiefrequentie, het voorkomen van trefwoorden of de co-citatiesterkte volgens de specifieke analyse. Alle netwerkgeneratieprocedures werden onafhankelijk tweemaal onafhankelijk uitgevoerd door de eerste en tweede auteur, met dezelfde dataset en parameterinstellingen om de stabiliteit van de resultaten te verifiëren. In gevallen van opvallende afwijkingen werden de ruwe gegevens en parameterinstellingen opnieuw gecontroleerd voordat de heranalyse werd hergebruikt.

Resultaten

Jaarlijkse publicatietrends en siteringszichtbaarheid op datasetniveau

Van 2016 tot 2025 steeg het jaarlijkse aantal publicaties over mitochondriaal onderzoek in DN van 63 naar 239. Het jaarlijkse aantal Times Cited-tellingen op datasetniveau voor de vaste dataset steeg van 49 in 2016 tot 12.516 in 2025. Deze maatstaf vertegenwoordigt citaties die in elk kalenderjaar door alle opgenomen records zijn ontvangen, in plaats van citaties van hetzel...

Discussie

Deze bibliometrische studie biedt een systematisch overzicht van het wereldwijde onderzoekslandschap en de thematische evolutie van mitochondriaal onderzoek in DN van 2016 tot 2025. De resultaten tonen aan dat de onderzoeksactiviteit op dit gebied in het afgelopen decennium is toegenomen, vooral na 2021. In deze periode breidde de onderzoeksfocus zich geleidelijk uit van oxidatieve stress en mitochondriale disfunctie naar mitochondriale kwaliteitscontrole, metabole aanpassing, gereguleer...

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel

Naam	Bedrijf	Catalogusnummer	Opmerkingen
Web of Science Core Collection	Clarivate	https://www.webofscience.com/	Not applicable
VOSviewer	Leiden University	https://www.vosviewer.com/	1.6.19
CiteSpace	Drexel University	https://citespace.podia.com/	6.4.R1
Scimago Graphica	Scimago Laboratory	https://www.scimagographica.org/	1.0.25
WPS Excel	Kingsoft Corporation	https://www.wps.com/	2023
GraphPad Prism	GraphPad Software	https://www.graphpad.com/	10.1
Journal Citation Reports	Clarivate	https://jcr.clarivate.com/	Not applicable
Medical Subject Headings database	National Library of Medicine	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/	Not applicable