De studie werd goedgekeurd door de ethische commissie van het Hefei BOE Hospital (goedkeuringsnummer 2021–1), en van alle deelnemers werd voorafgaand aan de inclusie schriftelijke geïnformeerde toestemming verkregen.
Patiënten en monsters
Voor deze studie werden 135 patiënten met RA (gediagnosticeerd volgens de 2010 ACR/EULAR-classificatiecriteria) geworven vanuit de afdeling Reumatologie en Immunologie van het Hefei BOE-ziekenhuis, 130 patiënten met OA vanuit de afdeling Orthopedie (gediagnosticeerd volgens de 2018 OA-diagnostische criteria van de Chinese Medical Association), en 125 op leeftijd en geslacht afgestemde gezonde controles uit het medisch onderzoekscentrum van hetzelfde ziekenhuis. De deelnemers waren tussen de 30 en 80 jaar oud. Bij de gezonde controles werd door middel van een uitgebreide anamnese, lichamelijk onderzoek en laboratoriumtests bevestigd dat er geen sprake was van auto-immuunziekten, gewrichtsaandoeningen of acute infecties. Deelnemers werden uitgesloten indien zij leden aan comorbide auto-immuunziekten, een voorgeschiedenis van infectie of trauma in de afgelopen 3 maanden hadden, een maligniteit hadden, of zwanger waren of borstvoeding gaven.
Bemonstering en preparatie
Er werd nuchter veneus bloed afgenomen bij alle studieonderwerpen. Na stolling bij kamertemperatuur gedurende 30 min werden serummonsters geïsoleerd door centrifugatie bij 1500 × g gedurende 15 min. Het serum werd bewaard bij -80°C tot aan verdere analyse.
Detectie van klinische en serologische markers
Om de ziektestatus en inflammatoire activiteit uitgebreid te evalueren, werden klinische en serologische biomarkers gemeten met gestandaardiseerde klinische laboratoriummethoden. De BSE werd gemeten met de Westergren-methode om aspecifieke systemische inflammatie te beoordelen. CRP werd gekwantificeerd met een immunoturbidimetrische assay (normale referentiewaarde: <10 mg/L) om de acute-fase-inflammatoire respons te evalueren. RF werd gemeten met een enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) met een normale referentiewaarde van ≤20 IU/mL. Anti-CCP-antilichamen werden gemeten met een ELISA van de tweede generatie om serologisch bewijs te leveren voor de diagnose van RA.
Cellijnen en kweek
Menselijke fibroblast-achtige synoviocyten beïnvloed door RA (HFLS-RA) cellen werden gekweekt in Dulbecco's Modified Medium (DMEM) aangevuld met 10% foetaal runderserum (FBS) en 1% penicilline-streptomycine. De cellen werden bewaard in een incubator bij 37 °C met 5% CO₂, en cellen tussen de derde en zesde passage werden gebruikt voor alle experimenten.
RNA-extractie en kwantitatieve real-time RT-PCR
Totaal RNA werd geëxtraheerd uit serummonsters met behulp van een RNA-extractiereagens. Reverse transcriptie werd uitgevoerd met een miRNA first-strand synthesekit voor miRNA's en een reverse transcriptiekit voor messenger RNA (mRNA) doelgenen volgens de instructies van de fabrikant. Kwantitatieve real-time-polymerasekettingreactie (RT-qPCR) werd uitgevoerd met een real-time PCR-systeem met een op SYBR Green gebaseerde PCR-mastermix. Het thermocycle-programma werd ingesteld op 95 °C pre-denaturatie gedurende 30 s, gevolgd door 40 cycli van amplificatie (95 °C denaturatie gedurende 5 s en 60 °C annealing/extensie gedurende 30 s). Elk monster werd in triplo geanalyseerd. U6 small nuclear RNA (U6 snRNA) en glyceraldehyde-3-fosfaatdehydrogenase (GAPDH) dienden respectievelijk als endogene referentiegenen voor de normalisatie van miRNA en mRNA. De primersequenties zijn samengevat in Supplementary Table 1. De relatieve expressieniveaus van miR-488-3p en de bijbehorende doelgenen werden berekend met de 2−ΔΔCt methode. De veranderingen in de mRNA-niveaus van doelgenen na overexpressie of inhibitie van miR-488-3p werden eveneens geanalyseerd om hun regulatoire relaties te verifiëren.
Celtransfectie
HFLS-RA-cellen werden gezaaid in 6-wells platen met een dichtheid van 5 × 105 cellen/well. De cellen werden getransfecteerd met een liposoom-gebaseerd transfectiereagens volgens de instructies van de fabrikant. De transfectiegroepen bestonden uit groepen met enkelvoudige transfectie en co-transfectie. De enkelvoudige transfectiegroepen waren: 1) controle—niet-getransfecteerde cellen; 2) mimic negatieve controle (NC)—cellen getransfecteerd met de negatieve controle van de miR-488-3p mimic; 3) miR-488-3p mimic—cellen getransfecteerd met de miR-488-3p mimic; 4) inhibitor NC—cellen getransfecteerd met de negatieve controle van de miR-488-3p inhibitor; 5) miR-488-3p inhibitor—cellen getransfecteerd met de miR-488-3p inhibitor. De co-transfectiegroepen waren: 1) miR-488-3p mimic + overexpressie-NC (oe-NC)—cellen co-getransfecteerd met de miR-488-3p mimic en de negatieve controle van de ROCK1-overexpressievectoren; 2) miR-488-3p mimic + oe-ROCK1—cellen co-getransfecteerd met de miR-488-3p mimic en ROCK1-overexpressievectoren. Alle transfectiesequenties zijn samengevat in Aanvullende Tabel 1. De overexpressievector van ROCK1 werd gemaakt door de coderende sequentie (CDS) regio te kloneren in het pcDNA 3.1-plasmide. De getransfecteerde cellen waren 48 u na de celtransfectie beschikbaar voor de volgende experimenten.
Celfunctieanalyse
Celproliferatie-assay (Cell Counting Kit-8 [CCK-8]): Getransfecteerde HFLS-RA-cellen werden geënt in 96-wells platen met 5 × 103 cellen/well, met drie replicate wells per groep. Op 0, 24, 48 en 72 u na transfectie werd 10 µL CCK-8-oplossing aan elke well toegevoegd, gevolgd door incubatie bij 37 °C gedurende 2 u. De absorbentie werd gemeten bij 450 nm (detectiegolflengte) en 630 nm (referentiegolflengte) met een microplate reader. De relatieve proliferatiesnelheid werd berekend met 0 u als baseline.
Detectie van apoptose (flowcytometrie): Apoptose werd beoordeeld door analyse met een Annexine V-fluoresceïne-isothiocyanaat (FITC)/propidiumjodide (PI) apoptose-assay. Cellen werden getransfecteerd met de juiste plasmiden en vervolgens verzameld na trypsinisatie. De apoptosegraad werd bepaald via flowcytometrie.
Bepaling van ontstekingsfactoren (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay [ELISA]): HFLS-RA-cellen werden gezaaid in 24-wells platen en gedurende 48 u getransfecteerd met de aangegeven miR-488-3p-mimic, miR-488-3p-inhibitor of de overeenkomstige negatieve controles. De concentraties van interleukine-6 (IL-6), tumornecrosefactor-α (TNF-α) en interleukine-1β (IL-1β) in de supernatanten van de celculturen werden gekwantificeerd met behulp van ELISA-kits.
Targetvalidatie
Voorspelling van het doelwit: Met behulp van de TargetScan-database26 werd voorspeld dat ROCK1 een downstream doelwit is van miR-488-3p. De voorspelde bindingsplaatsen tussen miR-488-3p en de 3′-niet-vertaalde regio (3′UTR) van ROCK1 werden eveneens geïdentificeerd.
Dual-Luciferase Reporter Gene Assay: Het wild-type of gemuteerde 3′UTR van ROCK1 werd gekloond in het pGL3-plasmide. De voorspelde bindings- en mutatieplaatsen worden weergegeven in Figuur 4. HEK-293T-cellen werden co-getransfecteerd met miR-488-3p mimic of inhibitor samen met de geconstrueerde vectoren27. De luciferase-activiteit werd gemeten 48 u na transfectie met miR-488-3p mimic of inhibitor.
RNA-immunoprecipitatie (RIP): HFLS-RA-cellen werden geïncubeerd met een anti-Argonaute 2 (Ago2) antilichaam (RRID: AB_2882071, verdunning 1:200) of een immunoglobuline G (IgG) controle-antilichaam (RRID: AB_2819160, verdunning 1:5000), gevolgd door RNA-extractie en kwantitatieve PCR (qPCR) voor de verrijking van ROCK1 mRNA zoals hierboven beschreven.
Statistische analyse
De studie werd statistisch geanalyseerd met SPSS 23.0 (RRID: SCR_002865) en GraphPad Prism 9.0 (RRID: SCR_002798). Meetgegevens werden uitgedrukt als gemiddelde ± standaarddeviatie (SD). Alle experimenten werden uitgevoerd met drie biologische replica's, waarbij elke biologische replica in triplo werd geanalyseerd. De ruwe gegevens zijn toegevoegd in het aanvullende materiaal. De gegevens werden geëvalueerd met een normale waarschijnlijkheidsplot (P-P plot) voorafgaand aan de parametrische statistische toetsen. De t-toets voor onafhankelijke steekproeven werd gebruikt om continue basisvariabelen (bijv. leeftijd, body mass index [BMI], etc.) te vergelijken en de chi-kwadraattoets werd gebruikt voor categorische variabelen (bijv. geslacht, etc.). Genexpressieniveaus werden vergeleken met een t-toets voor onafhankelijke steekproeven. Veranderingen in celproliferatie op verschillende tijdstippen werden geanalyseerd met een variantieanalyse (ANOVA) met herhaalde metingen, terwijl een eenweg-ANOVA werd gebruikt om apoptosepercentages bepaald via flowcytometrie te vergelijken. Correlatieanalyse werd uitgevoerd met Spearman (voor variabelen die niet aan de normale verdeling voldeden) en Pearson (voor variabelen die aan de normale verdeling voldeden). De diagnostische prestaties werden geëvalueerd met een receiver operating characteristic (ROC) curve-analyse. De optimale afkapwaarde, sensitiviteit en specificiteit werden bepaald met de maximale Youden-index. Alle statistische toetsen waren tweezijdig en p < 0,05 werd beschouwd als statistisch significant.