Histochemische analyse van resistente en gevoelige katoengenotypes
Histochemisch onderzoek van dwarsdoorsneden van wortels en stengels in het stadium van het eerste echte blad onthulde visuele verschillen tussen resistente en vatbare genotypen, zoals aangetoond in Figuur 4, Figuur 5 en Aanvullende Figuur 1 (dwarsdoorsneden van de stengel). Hogere vergrotingen (100x–300x) boden gedetailleerde beelden van deze verschillen (Figuur 4A–C en Figuur 5A–C voor resistente genotypen en Figuur 4D–F en Figuur 5D–F voor vatbare genotypen). Ligninekleuringspatronen verschilden per weefseltype: resistente genotypen vertoonden lagere of vergelijkbare ligninekleuringspatronen in de stengels, terwijl vatbare genotypen visueel een relatief hogere lignificatie van de stengel vertoonden (Aanvullende Figuur 1A–D).
Kwantitatieve beeldanalyse van ligninekleuring
Deltapine 16, een vatbare cultivar die in deze studie is opgenomen, vertoonde een lagere ligninekleuring (Figuur 6A–C) met waarden voor het percentage gekleurd oppervlak van 12, 17,8 en 16,3 (Figuur 6D). Het vatbare genotype A2-40 had waarden voor het percentage gekleurd oppervlak van 25,2, 19,9 en 28,75, terwijl het resistente genotype, A2-995, waarden voor het percentage gekleurd oppervlak vertoonde van 54,95, 58,71 en 69,85 (Figuur 7). A2-20 had echter waarden voor het percentage gekleurd oppervlak van 16,6, 21,3 en 20,4, terwijl A2-514 waarden voor het percentage gekleurd oppervlak vertoonde van 49,8, 34,1 en 43,38 (Figuur 8). De vergelijking leverde een p-waarde op van 0,06. Omdat deze waarden werden gegenereerd met verschillende drempelwaarden, werd een ImageJ-analyse met uniforme drempelwaarden uitgevoerd met identieke drempels voor kleurtoon, verzadiging en helderheid om de reproduceerbaarheid over de replicaten te waarborgen. Het resistente genotype (A2-514) vertoonde een relatief sterkere kleuring dan het vatbare genotype (A2-20). Het percentage gekleurd oppervlak werd berekend als de verhouding tussen lignine-positieve pixels en het totaal aantal weefselpixels binnen de sectie. De kwantitatieve vergelijking met uniforme drempelwaarden van het vatbare genotype A2-20 en het resistente genotype A2-514 wordt getoond in Figuur 9. Over het algemeen demonstreert de analyse met uniforme drempelwaarden dat er genotype-specifieke verschillen in lignificatie bestaan tussen deze genotypen.
DATABESCHIKBAARHEID:
De ruwe gegevens zijn toegevoegd als een aanvullend bestand.

Figuur 1: Microscopisch beeld van niervormige nematoden die zich voeden met katoenwortels. Niervormige nematoden die zich voeden met katoenwortels worden getoond bij een 50x vergroting na kleuring met rode voedselkleurstof. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: Voorbereiding van plantmateriaal voor histochemische lignineanalyse. De workflow bestaat uit de volgende stappen: (1) week katoenzaad in water; (2) plaats de zaden op natte papieren handdoeken in een gelabelde steriele Petrischaal; (3) laat de zaden 2 dagen kiemen en verplaats de zaailingen naar gelabelde potten met grond; (4) laat de zaailingen groeien tot het cotyledonstadium; (5) laat de planten verder groeien tot het stadium van de echte bladeren en bereid dwarsdoorsneden van de stengels en wortels voor; en (6) kleur de verzamelde weefselcoupes en observeer deze onder een microscoop. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3: Verzameling en kleuring van doorsneden van katoenwortels en -stengels met phloroglucinol-HCl. De workflow bestaat uit de volgende stappen: (1) kweek drie biologische replica's tot het stadium van de echte bladeren; (2) verwijder de planten voorzichtig uit de bodem, was ze met water en bereid ze voor op het maken van doorsneden; (3) gebruik een steriel mesje om transversale stengeldorsneden te maken; (4) gebruik een steriel mesje om transversale worteldorsneden te maken; (5) kleur de stengeldorsneden met 3% phloroglucinol-HCl, spoel af met water en observeer onder een microscoop; (6) kleur de worteldorsneden met 3% phloroglucinol-HCl, spoel af met water en observeer onder een microscoop; en (7) observeer de gekleurde doorsneden onder een microscoop om verschillen in phloroglucinol-kleuring te visualiseren en leg afbeeldingen vast. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4: Ligninekleuring in transversale wortelsecties van katoengenotypes A2-514 en A2-20. Ligninegekleurde transversale wortelsecties van het resistente genotype A2-514 bij (A) 100x, (B) 200x en (C) 300x vergroting. Ligninegekleurde transversale wortelsecties van het gevoelige genotype A2–20 bij (D) 100x, (E) 200x en (F) 300x vergroting. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 5: Ligninekleuring in transversale worteldwarsdoorsneden van katoengenotypes A2-995 en A2-40. Ligninegekleurde transversale worteldwarsdoorsneden van het resistente genotype A2-995 bij (A) 100x, (B) 200x, en (C) 300x vergroting. Ligninegekleurde transversale worteldwarsdoorsneden van het vatbare genotype A2-40 bij (D) 100x, (E) 200x, en (F) 300x vergroting. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 6: Ligninekleuring en kwantitatieve analyse van transversale worteldwarsdoorsneden van Deltapine 16. Met lignine gekleurde transversale worteldwarsdoorsneden van drie biologische replica's van de vatbare cultivar Deltapine 16 bij 100x vergroting: (A) biologische replica 1, (B) biologische replica 2, en (C) biologische replica 3. (D) Percentage gekleurd oppervlak voor de drie biologische replica's, bepaald via kwantitatieve ImageJ-analyse. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 7: Kwantitatieve analyse van ligninekleuring in katoengenotypes A2-40 en A2-995. Percentage gekleurd oppervlak bepaald door ImageJ-analyse voor drie biologische replica's van het vatbare genotype A2-40 en het resistente genotype A2-995. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 8: Kwantitatieve analyse van ligninekleuring in katoengenotypen A2-20 en A2-514. Percentage gekleurd oppervlak bepaald door ImageJ-analyse voor drie biologische replica's van het vatbare genotype A2-20 en het resistente genotype A2-514. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 9: Kwantificering van ligninekleuring via een uniforme drempelwaarde in katoengenotypes A2-20 en A2-514. Percentage gekleurd areaal in het vatbare genotype A2-20 en het resistente genotype A2-514 na beeldanalyse met een uniforme drempelwaarde. De statistische vergelijking is uitgevoerd met de t-toets van Welch (t = −1.52, p = 0.267). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 10: Visualisatie van ligninekleuring in verschillende wortelregio's. Representatieve afbeeldingen die de ligninekleuring laten zien in de wortelrijpingszone, de wortelstrekkingszone en de wortelpuntregio. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Aanvullende Figuur 1: Ligninekleuring in transversale stengeldoorsneden van resistente en gevoelige katoengenotypes. Lignine-gekleurde transversale stengeldoorsneden bij een vergroting van 100x van (A) gevoelige A2-20, (B) resistente A2-514, (C) gevoelige A2-40, en (D) resistente A2-995. Klik hier om dit bestand te downloaden.