Basiskenmerken
In totaal werden 8.218 deelnemers van NHANES 2011–2018 geïncludeerd, van wie 623 werden geclassificeerd als zijnde DKD en 7.595 als Non-DKD. Significante verschillen tussen de DKD- en Non-DKD-groepen werden waargenomen in leeftijd, geslacht, ras/etniciteit, burgerlijke staat, opleidingsniveau, PIR, BMI, bloeddruk, hypertensie, alcoholconsumptie, rookstatus, vitamine B12inname en dieetinname (alle p < 0,05). Significante verschillen werden ook waargenomen in ACR, eGFR, Scr, BUN, TC en TG (Tabel 1).
Significante verschillen tussen de kwartielen van de vitamine B12-inname werden waargenomen in het opleidingsniveau, hypertensie, DKD-status en energie-inname. In tegenstelling hiermee werden geen significante verschillen tussen de kwartielen waargenomen voor leeftijd, burgerlijke staat, BMI, bloeddruk, alcoholconsumptie, eGFR, ACR, serumurinezuur, Scr of TG (Tabel 2).
Associatie tussen vitamine B12 en DKD
De inname van vitamine B12 werd ingedeeld in kwartielen (Q1–Q4), en de resultaten van de multivariabele logistische regressieanalyses worden gepresenteerd in Tabel 3. In het volledig gecorrigeerde Model 3 hadden deelnemers in het hoogste kwartiel van de vitamine B12-inname (Q4) significant lagere kansen op DKD dan deelnemers in het laagste kwartiel (Q1) (OR = 0,70, 95% BI: 0,50–0,97, p = 0,034), terwijl er geen significante associaties werden waargenomen voor Q2 (OR = 1,14, 95% BI: 0,85–1,53, p = 0,386) of Q3 (OR = 0,94, 95% BI: 0,69–1,28, p = 0,684). Bovendien bereikte de lineaire trend in het volledig gecorrigeerde model geen statistische significantie (p voor trend = 0,086), hoewel de algemene richting van de associatie invers was. Deze bevindingen suggereren dat een hogere vitamine B12-inname, in het bijzonder in het hoogste kwartiel, geassocieerd was met lagere kansen op DKD, maar de resultaten ondersteunen geen stabiele lineaire dosis-responshorelatie tussen de inname van vitamine B12 en DKD.
Subgroepanalyses van de associatie tussen vitamine B12 en DKD
Subgroepanalyses werden uitgevoerd om te onderzoeken of de associatie tussen vitamine B12-inname en DKD consistent was over verschillende kenmerken van de deelnemers. In Model 1 hadden deelnemers in het hoogste kwartiel van vitamine B12-inname (Q4) significant lagere kansen op DKD dan deelnemers in Q1, zowel in de subgroep van mannen als in die van vrouwen (p < 0,05; Tabel 4). De associaties over de ACR-subgroepen waren heterogener. Bij deelnemers met een ACR < 30 mg/g werden significante associaties waargenomen voor enkele tussenliggende kwartielen van vitamine B12-inname, terwijl dit patroon werd afgezwakt na stratificatie naar hogere ACR-niveaus. Er werden geen significante associaties waargenomen over de eGFR-subgroepen.
Niet-lineaire relatie tussen vitamine B12 en DKD
De volledig bijgestelde RCS-analyse toonde een significante niet-lineaire associatie aan tussen vitamine B12-inname en DKD (Figuur 2, p voor niet-lineariteit = 0,037). Het RCS-model maakte gebruik van vier knooppunten (knots) gesitueerd bij het 5e, 35e, 65e en 95e percentiel van de distributie van de vitamine B12-inname, waarbij 3,24 μg/dag als referentiewaarde werd gehanteerd. Een daaropvolgende breakpoint-analyse identificeerde twee datagestuurde breekpunten bij 3,24 μg/dag (95% BI: 2,86–3,62) en 8,36 μg/dag (95% BI: 7,52–9,20), waardoor de vitamine B12-inname in drie bereiken werd onderverdeeld. Voor een vitamine B12-inname < 3,24 μg/dag werd geen significante associatie met DKD waargenomen (OR = 1,07, p = 0,575). Binnen het bereik van 3,24–8,36 μg/dag was de vitamine B12-inname omgekeerd geassocieerd met DKD (OR = 0,87, p = 0,025). Voor een inname > 8,36 μg/dag werd geen significante associatie waargenomen (OR = 1,00, p = 0,995) (Tabel 5). Deze bevindingen waren consistent met een niet-lineair patroon, waarbij een significante omgekeerde associatie alleen werd waargenomen binnen het gemiddelde innamebereik. Om de robuustheid van deze bevindingen te beoordelen, werden sensitiviteitsanalyses uitgevoerd met alternatieve RCS-specificaties van drie en vijf knooppunten. Vergelijkbare algemene associatiepatronen werden waargenomen, met statistisch significante algemene associaties over Modellen 1–3 bij beide knooppuntspecificaties, terwijl de modellen met vijf knooppunten een niet-lineaire relatie verder ondersteunden (Supplemetaire Figuur 1).
Identificatie van kandidaatgenen gerelateerd aan vitamine B12 bij DKD
In de GSE30528-dataset identificeerden we 493 DEG's tussen DKD- en normale monsters, bestaande uit 126 upgereguleerde en 367 downgereguleerde genen (|log₂FC| > 1, FDR < 0,05; Figuur 3A,B, Aanvullende Tabel 1). KEGG-pathwayanalyse onthulde een significante verrijking van deze DEG's in pathways voor extracellulaire matrix (ECM)-receptorinteractie, focale adhesie, integrinesignalering en regulatie van het actinecytoskelet (Figuur 3C, Aanvullende Tabel 2). GO-verrijkingsanalyse wees verder uit dat DEG's voornamelijk geassocieerd waren met collageenhoudende ECM, glomerulusontwikkeling, focale adhesie en nefronontwikkeling (Figuur 3D, Aanvullende Tabel 2).
De intersectieanalyse van de DEGs en de genenset gerelateerd aan vitamine B12 identificeerde 20 overlappende kandidaatgenen (Figuur 3E). Deze genen werden vervolgens gebruikt om een PPI-netwerk te construeren met behulp van de STRING-database, waarbij interacties werden gefilterd op een minimale betrouwnesscore van 0,4. Het resulterende netwerk bestond uit 11 knooppunten en 20 randen, die respectievelijk proteïnen en hun interacties vertegenwoordigen (Figuur 3F). De relaties tussen de 20 kandidaatgenen werden verder gevisualiseerd met GeneMANIA (Figuur 3G).
Exploratieve karakterisering van P2RY14 als kandidaat vitamine B12-gerelateerd gen bij DKD
Op basis van de waargenomen associatie tussen de inname van vitamine B12 en de DKD-status hebben we vervolgens getracht via transcriptoomanalyse belangrijke vitamine B12-gerelateerde genen te identificeren die betrokken zijn bij de pathogenese van DKD. Van de 20 overlappende kandidaatgenen hebben we verder hun expressiepatronen vergeleken over verschillende DKD-datasets. In de datasets GSE30528 en GSE30529 was de expressie van P2RY14 significant verhoogd in DKD-monsters vergeleken met normale controles (Figuur 4A,B). P2RY14 codeert voor een G-eiwitgekoppelde receptor en is volgens rapportages betrokken bij chemotaxis van immuuncellen, cytoskeletale reorganisatie, ontstekingsreacties en oxidatieve stress28,29. De rol ervan bij DKD is echter nog niet direct onderzocht. Gezien de consistente upregulatie in onafhankelijke DKD-datasets en de potentiële biologische relevantie, kreeg P2RY14 prioriteit voor verdere validatie en functionele analyses. Vervolgens is een ROC-curve-analyse uitgevoerd om het onderscheidend vermogen van P2RY14 voorlopig te evalueren. In de discovery-dataset GSE30528 was de AUC 0,923 (95% BI: 0,807–1,000), terwijl de AUC in de preliminaire externe validatiedataset GSE30529 0,883 was (95% BI: 0,744–1,000). In de aanvullende validatiedataset GSE142025 was de AUC 0,663 (95% BI: 0,478–0,847), wat wijst op een beperkt onderscheidend vermogen (Figuur 4C–E). Samen leveren deze bevindingen voorlopig bewijs voor de potentiële onderscheidende waarde van P2RY14, hoewel de diagnostische prestaties verdere validatie in grotere onafhankelijke cohorten vereisen.
Om de biologische functies en signaalpaden te onderzoeken die geassocieerd zijn met P2RY14-expressie bij DKD, werden de GSE30528-monsters verdeeld in P2RY14-hoge en P2RY14-lage groepen op basis van het mediane expressieniveau van P2RY14. Er werd een differentieel-expressieanalyse uitgevoerd tussen de twee groepen. Vervolgens werden GO- en KEGG-verrijkingsanalyses uitgevoerd om de biologische functies en signaalpaden geassocieerd met P2RY14-expressie te karakteriseren. De GO-verrijkingsanalyse onthulde dat P2RY14 geassocieerd was met collageenbevattende ECM, glomerulusontwikkeling, ECM structurele componenten en nierontwikkeling (Figuur 4F, Aanvullende Tabel 3). De KEGG-analyse wees P2RY14 verder aan als betrokken bij ECM-receptorinteractie, focale adhesie en complement- en coagulatiecascades (Figuur 4G, Aanvullende Tabel 3).
Daarnaast liet GSEA zien dat de NF-κB-signaleringsroute en de TNF-signaleringsroute significant verrijkt waren in de groep met een hoge expressie van P2RY14 , wat suggereert dat een hoge P2RY14-expressie geassocieerd kan zijn met inflammatoire signalering bij DKD (Figuur 4H, Aanvullende Tabel 3).
Exploratieve moleculaire docking van MC-1 met P2RY14
Vijf kandidaatverbindingen geassocieerd met P2RY14 werden geïdentificeerd via screening met GeneCards en DGIdb, waarbij MC-1 werd geselecteerd voor exploratieve moleculaire docking-analyse (Figuur 5A superheroes). Met MC-1 als ligand en P2RY14 als receptor voorspelde de docking-analyse een potentiële bindingspositie van MC-1 binnen een kandidaatpocket van P2RY14, met een Vina-score van −6.0 kcal/mol. De voorspelde positie omvatte interacties met Tyr-, Lys-, Asn-, Asp- en Glu-residuen en de vorming van zeven waterstofbruggen (Figuur 5B–D).
Verklaring over gegevensbeschikbaarheid
De in deze studie gebruikte gegevens zijn openbaar beschikbaar. NHANES-gegevens uit de surveycycli van 2011–2018 zijn verkrijgbaar via het National Center for Health Statistics. De transcriptomische datasets GSE30528, GSE142025 en GSE30529 zijn openbaar beschikbaar in de Gene Expression Omnibus (GEO)-database. De in deze studie gegenereerde bewerkte resultaten voor differentiële expressie, functionele verrijking en GSEA zijn opgenomen in de aanvullende bestanden.

Figuur 1Stroomschema van de selectie van deelnemers voor de NHANES-analyse. Het stroomschema toont de sequentiële exclusiecriteria die zijn toegepast op deelnemers van de NHANES-cycli 2011–2018 en de uiteindelijke studiepopulatie die in de analyse is opgenomen. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: Niet-lineair verband tussen vitamine B12-inname en DKD met behulp van een restricted cubic spline-model. De doorgetrokken lijn vertegenwoordigt de geschatte odds ratio voor DKD over de dieetinname van vitamine B12, en het gearceerde gebied vertegenwoordigt het 95% betrouwbaarheidsinterval. Het model is gecorrigeerd met behulp van de covariabelen die in Model 3 zijn opgenomen. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3: Identificatie van kandidaatgenen gerelateerd aan vitamine B12 bij DKD. (A,B) Volcano plot en heatmap die de expressieprofielen van DEGs laten zien tussen diabetische nefropathie (DKD) en normale monsters in de GSE30528-dataset. (C,D) Top 15 verrijkte KEGG-paden en GO-termen van DEGs. (E) Kruisanalyse tussen DEGs en vitamine B12-gerelateerde genen. (F) Protein-protein interaction (PPI) netwerk. (G) GeneMANIA-netwerk van de 20 vitamine B12‑gerelateerde genen. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4: Exploratieve karakterisering van P2RY14 als kandidaat vitamine B12-gerelateerd gen bij DKD. (A,B) Boxplots die de expressieniveaus van de overlappende kandidaatgenen tonen in DKD-monsters en normale controles in respectievelijk de datasets GSE30528 en GSE30529. (C–E) Receiver operating characteristic (ROC)-curve analyses van P2RY14 in respectievelijk de datasets GSE30528, GSE30529 en GSE142025. (F) Gene Ontology (GO) verrijkingsanalyse. (G) Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway verrijkingsanalyse. (H) GSEA van de P2RY14-hoge en P2RY14-lage groepen die verrijking van de NF-κB en TNF signaleringspaden tonen in GSE30528. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 5: Drug-target screening en verkennende moleculaire docking-analyse van P2RY14. (A) Interactienetwerk tussen geneesmiddelen en targets van P2RY14-geassocieerde medicijnen. (B–D) Moleculaire docking van MC-1 met het P2RY14-eiwit. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Tabel 1: Basiskenmerken van de studiepopulatie. Demografische, klinische, biochemische en dieetkenmerken van deelnemers volgens DKD-status worden gepresenteerd. Continue en categorische variabelen zijn samengevat met behulp van survey-gewogen analyse. Klik hier om deze tabel te downloaden.
Tabel 2: Basiskenmerken van deelnemers naar kwartielen van de vitamine B12-inname. Demografische, klinische, biochemische en dieetkenmerken van de studiepopulatie worden gepresenteerd over de kwartielen van de dieetmatige vitamine B12-inname. Klik hier om deze tabel te downloaden.
Tabel 3: Associatie tussen vitamine B12-inname en DKD-status bij volwassenen in de V.S.Odds ratio's (OR's) en 95% betrouwbaarheidsintervallen (BI's) voor de associatie tussen dieetvitamine B12-inname en DKD-status worden gepresenteerd over opeenvolgend aangepaste logistische regressiemodellen, met het laagste kwartiel van vitamine B12-inname (Q1) als referentiegroep. Klik hier om deze tabel te downloaden.
Tabel 4: Associatie tussen vitamine B12-inname en DKD-status in subgroepanalyses. Odds ratio's (OR's) en 95% betrouwbaarheidsintervallen (BI's) voor DKD worden weergegeven over kwartielen van de vitamine B12-inname, gestratificeerd naar subgroepen voor leeftijd, geslacht, BMI, eGFR, ACR, hypertensie en hyperlipidemie, en gecorrigeerd voor de gespecificeerde modellen. Klik hier om deze tabel te downloaden.
Tabel 5: Drie-segment stuksgewijze regressieanalyse van de associatie tussen vitamine B12-inname en DKD. Associaties tussen dieetvitamine B12-inname en DKD worden gepresenteerd voor de drie innamebereiken gedefinieerd door de twee datagestuurde breekpunten op 3,24 en 8,36 μg/dag. Klik hier om deze tabel te downloaden.
Aanvullende figuur 1: Gevoeligheidsanalyses van de associatie tussen dieetinname van vitamine B12 en DKD met behulp van restricted cubic spline-modellen. (A–C) Modellen met drie knopen. (D–F) Modellen met vijf knopen. De ononderbroken lijn vertegenwoordigt de geschatte OR, het gearceerde gebied vertegenwoordigt het 95% BI en de gestreepte lijn geeft OR = 1 aan. De p-waarden voor de algemene associatie en niet-lineariteit worden in elk paneel weergegeven.Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullende Tabel 1: Differentieel tot expressie gekomen genen tussen diabetische nieraandoening (DKD) en normale monsters in de GSE30528-dataset. Resultaten van differentiële expressie voor genen geïdentificeerd met |log₂FC| > 1 en FDR < 0.05 worden gepresenteerd naast de cobalamine-gerelateerde genenset die is gebruikt voor de screening van kandidaatgenen.Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullende Tabel 2: Functionele verrijkingsanalyse van differentieel tot expressie gebrachte genen bij DKD. De resultaten van de Gene Ontology (GO) en Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) verrijking voor de differentieel tot expressie gebrachte genen die in de GSE30528-dataset zijn geïdentificeerd, worden gepresenteerd.Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullende Tabel 3: Resultaten van functionele verrijking en gene set enrichment-analyse geassocieerd met P2RY14 in de GSE30528-dataset. GO-, KEGG- en GSEA-resultaten gebruikt om P2RY14-geassocieerde biologische functies en pathways te karakteriseren, worden gepresenteerd.Klik hier om dit bestand te downloaden.