Name: Visualiseren Clathrine-gemedieerde endocytose van G-proteïne gekoppelde receptoren bij Single-event resolutie via TIRF Microscopie (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-10-20T13:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 40 s
Description: Leer clathrine-gemedieerde endocytose van G-proteïne gekoppelde receptoren visualiseren met TIRF-microscopie. Deze methode kwantificeert dynamiek van individuele clathrine-coated pits in levende cellen.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

De auteurs willen Dr. C. Szalinski, H. Teng en M. Bruchez bedanken voor hun hulp met Imaris, R. Vistein en D. Shiwarski voor technische hulp en advies, en Dr. M von Zastrow, Dr. T Kirchhausen, Dr. D Drubin en Dr. W Almers voor reagentia en nuttige discussie. Financiering verstrekt door T32-subsidie NS007433 aan SLB en NIH DA024698 en DA036086 aan MAP.

1 Expressie van fluorescent label CME Components in gekweekte cellen HEK293 cellen zijn bruikbaar model cellen die uitgebreid zijn gebruikt om GPCR biologie en endocytose studeren, en daarom worden gebruikt als modellen in dit protocol. Gebruik een transfectieprotocol verstrekken van eenduidige uitstraling zonder overexpressie en lage cytotoxiciteit. <ol><li> Behandel alle celcultuur in een steriele laminaire stroming kap. Vul 4 putjes van een 12-well plaat met 1 ml Dulbecco&#39;s Modified Essential Media (DMEM) met 10% foetaal runderserum (FBS). Van een samenvloeiing T25 fles van HEK293 cellen verdunnen 1:50, 1:25, 1:16, 1:10, respectievelijk in elk van de 4 putten. <ol><li> Alternatief zaadcellen om een ​​multi-well plaat van gewenste grootte, volgens instructies van de fabrikant. Seed 0,4-2 x 10 4 cellen in een 12-well plaat. Groeien de cellen gedurende de nacht in een steriele 37 ° C met 5% CO2 en 95% vochtigheid. NB: Gezien het feit dat de groei rates variëren, afhankelijk van de omstandigheden en cellijnen, is het misschien beter om meerdere bronnen te zaaien om te zorgen ideaal samenvloeiing voor transfectie de volgende dag of de mogelijkheid van het uitvoeren van transfecties in tweevoud. </li></ol></li><li> De volgende ochtend, selecteer een goed dat ~ 70% confluent voor transfectie (zie figuur 1B). Als er geen goed deze staat heeft bereikt, wacht nog een dag. NB: 70% samenvloeiing is ideaal voor HEK293 cellen. Transfecteren van cellen die schaarser resultaten in celdood en toxiciteit. Transfecteren over-confluente cellen resulteert in slechte expressie. </li><li> Voeg 60 ul buffer EC (bij transfectie kit), 400 ng van plasmiden die gelabeld GPCR en / of componenten van de clathrine machines, en 2,4 pl van Enhancer in 1,5 ml microcentrifugebuis, zoals beschreven in het protocol van de fabrikant. Vortex 2 seconden voldoende menging en draaien in een microcentrifuge bij 2000 xg gedurende 2 seconden om de vloeistof onderin verzamelen. </li><li> Toevoegen6 pl Effectene zoals beschreven in het protocol van de fabrikant. Vortex 2 seconden en rotatie bij 2000 xg gedurende 2 seconden in een microfuge om de vloeistof onderin verzamelen. Wacht 20 minuten om voor vorming van transfectie complexe micellen. </li><li> Zuig media uit de put te worden getransfecteerd. Voeg voorzichtig 0,8 ml van DMEM met 10% FBS aan de transfectie reagentia mengsel en meng door pipetteren en langzaam te verminderen breken van de micellen. Voeg de media en transfectie mengsel aan de put langzaam vanaf de zijkant. Commentaar resterende transfectie mengsel uit de microcentrifugebuis het goed om met een micropipettor. OPMERKING: Eventueel een extra 0,5 ml DMEM met 10% FBS aan de getransfecteerde cellen goed aan de extra voeding resulteert in zachtere transfectie en onderste tijdelijke expressie geven. </li><li> Zet de cellen om de 37 ° C incubator gedurende 5 uur. </li><li> Zuig medium dat de transfectie mengsel. Te vervangen door 1 ml DMEM met 10% FBS. Toestaande cellen een nacht groeien. </li><li> De volgende dag voorbij de cellen ongecoate dekglaasjes, gesteriliseerde autoclaaf. <ol><li> Voeg 0,5 ml fosfaat gebufferde zoutoplossing (PBS) met 1 mM EDTA aan elk putje. U kunt ook 0,5 ml van 0,05% trypsine-EDTA. Laat in de incubator gedurende 1 minuut. </li><li> Plaats 3 ronde, steriele 25 mm dekglaasjes in afzonderlijke putjes van een 6-wells plaat. Vul elk putje met 2 ml medium. Duw de dekglaasje naar de bodem van de put te voorkomen dat cellen groeien op de bodem van het dekglaasje. </li><li> Handmatig schudden de put te heffen van de cellen van de bodem van de put. Voeg 1 ml van DMEM met 10% FBS te mengen. Verdeel de opgeheven cellen van 1 putje van een 12-well plaat gelijkmatig over de 3 dekglaasjes. Als alternatief, plaat cellen op 3 glazen bodem gerechten. </li></ol></li><li> Laat de cellen groeien op dekglaasjes gedurende ten minste 48 uur voor de beeldvorming. Ervoor zorgen dat cellen worden verspreid en plat. </li></ol> 2.Imaging CCP en Cargo Dynamics behulp TIRFM <ol><li> Conjugaat M1 anti-FLAG antilichamen met Alexa kleurstoffen met Alexa Fluor Protein Labeling Kit volgens het protocol van de fabrikant. Als alternatief kan pre-geconjugeerde antilichamen worden gekocht. </li><li> Pre-incubeer cellen met de antilichamen bij een 1: 1000 verdunning in 1 ml voorverwarmde Leibovitz medium met 10% FBS of Opti-MEM met 50 mM HEPES pH 7,4 en 10% FBS gedurende 10 minuten bij 37 ° C (imaging medium), om-FLAG gelabeld GPCR label op het celoppervlak. Door deze stappen als genetisch gecodeerde fluorescerende eiwitten zoals GFP, worden gebruikt als tags (zie bespreking voor details). </li><li> Breng de dekglaasje om een ​​live-cell imaging kamer. Als alternatief voor de glazen bodem gerechten, aspireren antilichaam-etikettering media en voeg 700 ul van voorverwarmde beeldvorming medium. <ol><li> Gebruik een pincet en buig het uiteinde van een 25 gauge naald in een haak. </li><li> Houd een pincet in de dominante hand. Houd de gebogen naald in de otheh. Draai de naald totdat de haak bochten naar beneden richting het glas. Sleep voorzichtig de naald, haak naar beneden, over de bodem van een 6-well plaat totdat het haakt op het dekglaasje. Let erop dat u geen krassen op het oppervlak van het dekglaasje, zoals cellen los. Til het dekglaasje van de bodem van de put. De balans van de dekglaasje tegen wand van de put voor ondersteuning. </li><li> Gebruik de tang te vatten in de buurt van de rand van het dekglaasje en beweeg het dekglaasje cel kant tot aan de beeldvorming kamer, en monteer de kamer. Voeg 700 ul (of juiste hoeveelheid) van voorverwarmde beeldvorming medium. Behandel de dekglaasjes voorzichtig zonder druk om te voorkomen dat scheuren of breken. </li></ol></li><li> Breng de kamer op de microscoop en houd de temperatuur van de cellen bij 37 ° C met een thermostaatbad of een afgesloten incubator. </li><li> Breng cellen in beeld met behulp van een 100X of 60X TIRF olie-immersie objectief (1.45 NA of hoger). Afbeelding van de cellen in conventionele epifluorescentie of confocale vormen van verlichting (dus niet TIRFM) aan cellen die de juiste constructies te identificeren. Out-of-focus cellen zijn bijna onzichtbaar in de dunne diepte van TIRF verlichting waardoor het moeilijk is om de focal plane en cellen te vinden. OPMERKING: Sommige systemen maken gebruik van dezelfde lasers voor TIRFM op de foto om in conventionele epifluorescentie, door het verplaatsen van de invalshoek van de laser boven de kritische hoek. Als een belangrijke veiligheidsmaatregel, altijd op de hoogte van de hoek van de laserstraal en richt deze altijd uit de buurt van de waarnemer. </li><li> Focus naar het bodemoppervlak van een cel tot expressie totdat de omtrek van plasmamembraan rond de cel verdwijnt en het centrum van de cel weergegeven. Dit is het duidelijkst bij een plasmamembraan gelokaliseerde lading eiwit zoals de μ-opioid receptor (zie Figuur 2A). </li><li> Schakel over naar TIRF beeldvorming. <ol><li> Bij gebruik van dezelfde lasers voor beeldvorming in conventionele epifluorescentie, verhoging van de invalshoek van delaser tot out-of-focus fluorescentie in het inwendige van de cel verdwijnt, en geen overzicht van plasmamembraan rond de cel waargenomen. (Vergelijk figuur 2C figuren 2A en 2B) OPMERKING: In TIRFM, het verplaatsen van de focal plane zorgt ervoor dat de afbeelding om volledig uit te gaan van de focus en / of dimmen, en de totale fluorescentie niveau daalt als gevolg van de kleinere diepte van verlichting. Daarom is een alternatieve methode om naar TIRFM verlichting is eerst gericht op het midden van de cel confocale / conventionele epifluorescentie, verhoog de invalshoek totdat grootste verlies van de fluorescentie en dan richten naar de plasmamembraan. </li><li> Eenmaal in TIRFM, zorgen voor de excitatie laser reflecteert terug door de objectieve en niet zichtbaar is boven de doelstelling. Bevestig deze door te controleren of de laserspot zichtbaar. OPMERKING: In conventionele epifluorescentie of confocale modes, de laser verlichting is zichtbaar boven de doelstelling,zoals aan het plafond. </li><li> Verfijn de focus om een ​​scherp beeld te krijgen. De belangrijkste componenten van de endocytische machine, zoals clathrine, zichtbaar in puncta wordt. Pas de focus op fijne, zodat de puncta zijn zo rond mogelijk. OPMERKING: Voor-gelokaliseerde lading, past u de fijne scherpstelling totdat de filopodia verschijnen verschillend. </li><li> Gebruik een overname programma om alle beeldvormende parameters zoals spiegels en TIRF hoek slaan. Doe dit voor alle noodzakelijke golflengten. </li></ol></li><li> Scan rond dekglaasje aan cellen die alle gewenste endocytische markers voorbeeld: de μ-opioïde receptor en de adapter β-arrestin in het in figuur 3A voorbeeld. Selecteer cellen die expressie maar niet overexpressie. Zie bespreking voor details. </li><li> Eenmaal geïdentificeerd zijn, krijgen beelden elke 3 seconden voor 10 minuten. Dit is voldoende om de levensduur van een CCP vangen, aangezien de gemiddelde levensduur van een CCP in HEK293 cellen afgebeeld onder deze omstandigheden around 40 sec 10-11. Hierdoor kan ongeveer 12-14 frames om de CCP te observeren. Zo zie Film 1. Herhaal alle stappen op de foto om bijkomende cellen. </li></ol> 3 Analyse van Endocytische Dynamics door Manual Verification Hoewel de handmatige controle van de CCP levens wordt sterk beperkt door het aantal CCP&#39;s die kunnen worden gedetecteerd, blijft het nog steeds een accurate wijze van opsporing zich niet afschrikken door de wereldwijde veranderingen in het beeld en detectie artefacten. Zie bespreking voor details. <ol><li> Open het bestand in ImageJ. Beelden worden opgeslagen als een enkele stapel van tiff-bestanden met interleaved kanalen. Afbeeldingen converteren naar hyperstacks. Ga naar Afbeelding&gt; Hyperstacks&gt; Stapel aan HyperStack. Voer het aantal kanalen verworven (dwz als beeldvorming β-arrestine en de μ-opioïde receptor, voer 2), toets een 1 voor Z-stack (TIRFM is een enkel vlak), en het aantal frames van de film (dat wil zeggen een 10 minuten film 1 beeld per 3 sec is 200) in het pop-up venster. </li><li> De HyperStack formaat levert een venster met twee schuifbalken. Gebruik de bovenste balk om door de kanalen en de bodem om door de tijd. Naar het kanaal van de proteïne waarvan levens worden getest. </li><li> Verplaatsen naar het frame 10 of 15 van de film aan het opnemen van reeds bestaande centrale tegenpartijen wiens gehele duur niet zichtbaar verminderen. Teken een ROI kader rond een plek willekeurig gekozen. </li><li> Tel het aantal frames een vlek zichtbaar. OPMERKING: Zie Figuur 3B en 3C naar voorbeelden van drie morfologische categorieën endocytisch gebeurtenissen 10,11,16-19. </li></ol> 4 Analyse van Endocytische Dynamics doelstelling Recognition Doelstelling herkenning maakt detectie van vrijwel alle CCP afgebeeld in een cel, maar kan gevoelig voor fouten als gevolg van valse detectie van foutieve structuren. Zie bespreking voor details het afwegen van de voor-en nadelen van each methode. Verschillende programma, zoals op maat gemaakte algoritmes kunnen worden gebruikt om objectief detecteren CCP. Dit protocol beschrijft objectieve erkenning van ctp gebruik Imaris, een beeld-analyse software (zie ook Materiaal). <ol><li> Om te beginnen, opent u het rauwe beeldbestand in het beeld-analyse software. Standaard wordt het een samengevoegde kleur. Gebruik het venster &quot;Weergave aanpassen&quot; om de helderheid van een kanaal aan te passen. Klik op de naam van een kanaal om de getoonde kleuren te wijzigen. Schakel het selectievakje naast het kanaal om het display te voorkomen (zie figuur 4A). </li><li> Creëren &quot;Spots&quot; door te klikken op het icoon met oranje vlekken. Zie Figuur 4B. Selecteer een regio of Interest (ROI) rond de cel. Zie Figuur 4C. Gebruik een ROI om gebieden die ten onrechte heldere voorste randen en plaques zal detecteren sluiten. Analyseer meerdere cellen met verschillende expressie niveaus afzonderlijk. </li><li> Meet de diameter van een plek om te bepade eerste ramingen voor het algoritme. Schakel over naar &quot;Slice&quot;-modus, en klik op de polaire uiteinden van een plek om de diameter te meten. Zie figuur 4E. Doe dit voor 4 of 5 ronde vlekken die kunnen wijzen op een CCP kijken naar de hoogte van de stabiliteit, na de vorming en vóór splitsing. Gebruik deze metingen om de gemiddelde diameter te berekenen tot op het dichtstbijzijnde tiende van een micron. </li><li> Detecteren Spots. Ga terug naar &quot;Overtref&quot; modus. Kies het juiste kanaal voor de detectie. Voer de gemiddelde gemeten diameter, meestal 0,3 of 0,4 micrometer. Klik op de blauwe pijl vooruit naar de Spots kwantificeren. Zie figuur 4E. Indien de diameter van Locaties onderschat zal valse punten van fluorescentie worden geïdentificeerd als spots. Als de diameter te groot is, zal waar Locaties genegeerd. Als niet zeker weet, schatten een beetje lager, en filteren op de onjuiste detecties later. </li><li> Filter Spots door Quality. Pas de filter om zo veel Spots mogelijk vast te leggen, zonder teruggrond. De kwaliteit filter is standaard geselecteerd 20. Zie Figuur 4F. <ol><li> Gebruik de &quot;Kwaliteit&quot; curve als een gids voor een passende drempel. Verplaats de onderste drempel van het filter met de linker muisknop om deze eerste duik in de curve. Dit is een goed uitgangspunt voor het filter, als deze positie verfijnt meestal detectie om alleen toegankelijk Spots. Zie Figuur 4F. </li><li> Gedetecteerd Spots op de film als bollen of centrum pixels. Via het tabblad &quot;Kleuren&quot;, past de kleur van de vlekken van een contrasterende kleur om het gemakkelijker maken om ze te zien. Blader door de film te herzien de Spots in elk frame. Het doel is om zo veel Spots mogelijk te ontdekken voor het geheel van hun leven. </li><li> Elimineer dimmer Spots of handmatig sluit ze in continue tracks later op, omdat ze niet goed in de loop van hun leven worden ontdekt. </li><li> Verwijder heldere plaques met een &quot;Intensity&quot; filter, indien nodig. Klik op het groene plusteken om een ​​nieuw filter toe te voegen. Zie Figuur 4F. Maak een Intensity filter te filteren in of uit Spots van een bepaalde fluorescentie signalen. Gebruik de gegenereerde intensiteit curve, (analoog aan Quality Curve besproken in 4.5) om de drempel. Gebruik de linker muisknop om de uiterste linkerkant van de curve die de helderste Spots vertegenwoordigt verwijderen. OPMERKING: Large plaque structuren behoren gewoonlijk tot de helderste elementen in de cel, en ze zijn gemakkelijk uitgesloten met dit filter. </li><li> Doorloop de film zodat de CCP worden gedetecteerd als Locaties en helderste plaques worden niet meer waargenomen. Figuur 3D toont een cel waar detectie van CCP (aangeduid met witte gebieden) werd geoptimaliseerd met de kwaliteit filter en plaques werden uitgesloten van de kwaliteit filter. </li><li> Verminder heldere celranden de kwaliteit filter. Bright voorwerpen kunnen nog steeds handmatig worden verwijderd bij de volgende stap. Ga verder met de blauwearrow. </li><li> Verwijder afwijkende Spots in het scherm Spots Bewerken. Schakel over naar &quot;Select&quot;-modus. Klik op de plek. Het wordt geel. Klik op &quot;Verwijderen&quot;. Klik op de blauwe pijl om verder te gaan bouwen van het algoritme. Zie Figuur 4G. </li></ol></li><li> Maatregel tracks. Stel tracks &quot;Brownse beweging. &#39;De CCP mag vertonen alle gerichte beweging slechts minimale drifting over het plasmamembraan. Dit algoritme is het meest geschikt voor die beweging. Zie figuur 4H. <ol><li> Zet de Max Afstand tot een kleine waarde, zoals 0,7 micrometer. Zie figuur 4H. OPMERKING: een kleine afstand instellen minimaliseert aansluiting van aangrenzende Spots en nog steeds zorgt voor een voortdurende opvolging van een cel spot door CCP of cel beweging. </li><li> Stel Max Gap Size tot 1 Hiermee track blijven als er slechts een lijst ontbreekt elkaar. Klik op de blauwe pijl om tracks te berekenen. Zie figuur 4H. OPMERKING: Gap maten van meer dan 3 oorzaken verschillende tracks worden niet correct met elkaar verbonden. </li><li> Schakelaar spoor bekijken op &quot;Dragon Tail.&quot; Scroll door de film het observeren van de detectie kwaliteit. Als aangrenzende Spots zijn verbonden, verlaagt de Max Afstand minder dan 0,7 micrometer. Als Spots worden opgebroken te gemakkelijk, verhogen het Max Gap Size. Klik op de blauwe pijl om tracks te maken. Dit leidt tot het gaasfilter tracks. Zie figuur 4H. </li></ol></li><li> Tracks filter en exporteren van gegevens. Gebruik een &quot;Intensity&quot; filter om extra heldere plaques te verwijderen. Gebruik een &quot;Verplaatsing&quot; filter om endosomes dat het veld TIRF gaan verwijderen. Wees voorzichtig, als langere Spots langere verplaatsingen zal hebben ook. Klik op de groene dubbele pijl om het protocol te voltooien. Zie Figuur 4I. <ol><li> Gebruik het tabblad Bewerken Tracks, met het pictogram potlood, om vals-positieve detecties van nummers die niet konden worden verwijderd door filters te verwijderen. Controleer op discontinuities of valse verbindingen. Op de twee sporen aan te sluiten, selecteert u ze met behulp van Ctrl-Links-klik, klik dan op &quot;Connect&quot; in het vak Bewerken Tracks. Tracks in afzonderlijke plekken verbreken, selecteert u een track en klik op &quot;Disconnect&quot;. Selecteer meerdere Spots met Ctrl + Links-klik en klik op &quot;Connect&quot; om een ​​nieuwe track te maken. De methode is hetzelfde voor Spots bewerken, in 4.5.7 beschreven. Zie Figuur 4J. </li><li> Om gegevens te exporteren, gaat u naar het tabblad statistieken. Klik op het diskette icoon enkel om de geselecteerde statistiek exporteren. Klik op het pictogram dat lijkt op een reeks diskettes om alle statistieken te exporteren. De &quot;Tijdsduur&quot; statistiek bevat de lengte van de endocytische tracks. Zie Figuur 4K. </li></ol></li></ol>

<ol><li>McMahon, H. T., Boucrot, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+mechanism+and+physiological+functions+of+clathrin-mediated+endocytosis%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Reviews+Molecular+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Molecular mechanism and physiological functions of clathrin-mediated endocytosis.</a> Nature Reviews Molecular Cell Biology. 12 (8), 517-533 (2011).</li>
<li>Kaksonen, M., Toret, C. P., Drubin, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Modular+Design+for+the+Clathrin-+and+Actin-Mediated+Endocytosis+Machinery%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">A Modular Design for the Clathrin- and Actin-Mediated Endocytosis Machinery.</a> Cell. 123 (2), (2005).</li>
<li>Taylor, M. J., Perrais, D., Merrifield, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+High+Precision+Survey+of+the+Molecular+Dynamics+of+Mammalian+Clathrin-Mediated+Endocytosis%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biology%22%5BJournal%5D)">A High Precision Survey of the Molecular Dynamics of Mammalian Clathrin-Mediated Endocytosis.</a> PLoS Biology. 9 (3), (2011).</li>
<li>Ungewickell, E., Branton, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assembly+units+of+clathrin+coats%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Assembly units of clathrin coats.</a> Nature. 289 (5796), 420-422 (1981).</li>
<li>Bliek, A. M., Meyerowrtz, E. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamin-like+protein+encoded+by+the+Drosophila+shibire+gene+associated+with+vesicular+traffic%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Dynamin-like protein encoded by the Drosophila shibire gene associated with vesicular traffic.</a> Nature. 351 (6325), (1991).</li>
<li>Hinshaw, J. E., Schmid, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamin+self-assembles+into+rings+suggesting+a+mechanism+for+coated+vesicle+budding%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Dynamin self-assembles into rings suggesting a mechanism for coated vesicle budding.</a> Nature. 374 (6518), (1995).</li>
<li>Merrifield, C. J., Perrais, D., Zenisek, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Coupling+between+Clathrin-Coated-Pit+Invagination%2C+Cortactin+Recruitment%2C+and+Membrane+Scission+Observed+in+Live+Cells%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Coupling between Clathrin-Coated-Pit Invagination, Cortactin Recruitment, and Membrane Scission Observed in Live Cells.</a> Cell. 121 (4), 593-606 (2005).</li>
<li>Grabs, D., Slepnev, V. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+SH3+domain+of+amphiphysin+binds+the+proline-rich+domain+of+dynamin+at+a+single+site+that+defines+a+new+SH3+binding+consensus+sequence%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+biological+chemistry%22%5BJournal%5D)">The SH3 domain of amphiphysin binds the proline-rich domain of dynamin at a single site that defines a new SH3 binding consensus sequence.</a> The Journal of biological chemistry. 272 (20), 13419-13425 (1997).</li>
<li>Tosoni, D., Puri, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((TTP+Specifically+Regulates+the+Internalization+of+the+Transferrin+Receptor%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">TTP Specifically Regulates the Internalization of the Transferrin Receptor.</a> Cell. 123 (5), 875-888 (2005).</li>
<li>Puthenveedu, M. A., von Zastrow, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cargo+Regulates+Clathrin-Coated+Pit+Dynamics%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Cargo Regulates Clathrin-Coated Pit Dynamics.</a> Cell. 127 (1), 113-124 (2006).</li>
<li>Soohoo, A. L., Puthenveedu, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Divergent+modes+for+cargo-mediated+control+of+clathrin-coated+pit+dynamics%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Biology+of+the+Cell%22%5BJournal%5D)">Divergent modes for cargo-mediated control of clathrin-coated pit dynamics.</a> Molecular Biology of the Cell. 24 (11), 1725-1734 (2013).</li>
<li>Posor, Y., Eichhorn-Gruenig, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatiotemporal+control+of+endocytosis+by+phosphatidylinositol-3%2C4-bisphosphate%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Spatiotemporal control of endocytosis by phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate.</a> Nature. 10, (2013).</li>
<li>Mettlen, M., Stoeber, M., Loerke, D., Antonescu, C. N., Danuser, G., Schmid, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Endocytic+accessory+proteins+are+functionally+distinguished+by+their+differential+effects+on+the+maturation+of+clathrin-coated+pits%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Biology+of+the+Cell%22%5BJournal%5D)">Endocytic accessory proteins are functionally distinguished by their differential effects on the maturation of clathrin-coated pits.</a> Molecular Biology of the Cell. 20 (14), 3251-3260 (2009).</li>
<li>Loerke, D., Mettlen, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cargo+and+dynamin+regulate+clathrin-coated+pit+maturation%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biology%22%5BJournal%5D)">Cargo and dynamin regulate clathrin-coated pit maturation.</a> PLoS Biology. 7 (3), (2009).</li>
<li>Axelrod, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell-substrate+contacts+illuminated+by+total+internal+reflection+fluorescence%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Cell-substrate contacts illuminated by total internal reflection fluorescence.</a> The Journal of Cell Biology. 89 (1), 141-145 (1981).</li>
<li>Merrifield, C. J., Feldman, M. E., Wan, L., Almers, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+actin+and+dynamin+recruitment+during+invagination+of+single+clathrin-coated+pits%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Imaging actin and dynamin recruitment during invagination of single clathrin-coated pits.</a> Nature Cell Biology. 4 (9), 691-698 (2002).</li>
<li>Ehrlich, M., Boll, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Endocytosis+by+random+initiation+and+stabilization+of+clathrin-coated+pits%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Endocytosis by random initiation and stabilization of clathrin-coated pits.</a> Cell. 118 (5), 591-605 (2004).</li>
<li>Yarar, D., Waterman-Storer, C. M., Schmid, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+dynamic+actin+cytoskeleton+functions+at+multiple+stages+of+clathrin-mediated+endocytosis%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Biology+of+the+Cell%22%5BJournal%5D)">A dynamic actin cytoskeleton functions at multiple stages of clathrin-mediated endocytosis.</a> Molecular Biology of the Cell. 16 (2), 964-975 (2005).</li>
<li>Rappoport, J. Z., Kemal, S., Benmerah, A., Simon, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamics+of+clathrin+and+adaptor+proteins+during+endocytosis%5BTitle%5D)+AND+%22American+journal+of+physiology.+Cell+physiology%22%5BJournal%5D)">Dynamics of clathrin and adaptor proteins during endocytosis.</a> American journal of physiology. Cell physiology. 291 (5), (2006).</li>
<li>Doyon, J. B., Zeitler, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+and+efficient+clathrin-mediated+endocytosis+revealed+in+genome-edited+mammalian+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Rapid and efficient clathrin-mediated endocytosis revealed in genome-edited mammalian cells.</a> Nature Cell Biology. 13 (3), 331-337 (2011).</li>
<li>Hopp, T. P., Prickett, K. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Short+Polypeptide+Marker+Sequence+Useful+for+Recombinant+Protein+Identification+and+Purification%5BTitle%5D)+AND+%22Bio%2FTechnology%22%5BJournal%5D)">A Short Polypeptide Marker Sequence Useful for Recombinant Protein Identification and Purification.</a> Bio/Technology. 6 (10), 1204-1210 (1988).</li>
<li>Miesenböck, G., De Angelis, D. A., Rothman, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualizing+secretion+and+synaptic+transmission+with+pH-sensitive+green+fluorescent+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Visualizing secretion and synaptic transmission with pH-sensitive green fluorescent proteins.</a> Nature. 394 (6689), 192-195 (1998).</li>
<li>Saffarian, S., Cocucci, E., Kirchhausen, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Distinct+Dynamics+of+Endocytic+Clathrin-Coated+Pits+and+Coated+Plaques%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biology%22%5BJournal%5D)">Distinct Dynamics of Endocytic Clathrin-Coated Pits and Coated Plaques.</a> PLoS Biology. 7 (9), (2009).</li>
<li>Yudowski, G., Puthenveedu, M., Henry, A., von Zastrow, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cargo-Mediated+Regulation+of+a+Rapid+Rab4-Dependent+Recycling+Pathway%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Biology+of+the+Cell%22%5BJournal%5D)">Cargo-Mediated Regulation of a Rapid Rab4-Dependent Recycling Pathway.</a> Molecular Biology of the Cell. 1, 1-11 (2009).</li>
<li>Batchelder, E. M., Yarar, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Differential+Requirements+for+Clathrin-dependent+Endocytosis+at+Sites+of+Cell-Substrate+Adhesion%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Biology+of+the+Cell%22%5BJournal%5D)">Differential Requirements for Clathrin-dependent Endocytosis at Sites of Cell-Substrate Adhesion.</a> Molecular Biology of the Cell. 21 (17), 3070-3079 (2010).</li>
<li>Mattheyses, A. L., Atkinson, C. E., Simon, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+Single+Endocytic+Events+Reveals+Diversity+in+Clathrin%2C+Dynamin+and+Vesicle+Dynamics%5BTitle%5D)+AND+%22Traffic%22%5BJournal%5D)">Imaging Single Endocytic Events Reveals Diversity in Clathrin, Dynamin and Vesicle Dynamics.</a> Traffic. 12 (10), 1394-1406 (2011).</li>
<li>Aguet, F., Antonescu, C. N., Mettlen, M., Schmid, S. L., Danuser, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+analysis+of+low+signal-to-noise+images+link+dynamin+and+AP2+to+the+functions+of+an+endocytic+checkpoint%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Cell%22%5BJournal%5D)">Advances in analysis of low signal-to-noise images link dynamin and AP2 to the functions of an endocytic checkpoint.</a> Dev Cell. 26 (3), 279-291 (2013).</li>
<li>Boucrot, E., Howes, M. T., Kirchhausen, T., Parton, R. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Redistribution+of+caveolae+during+mitosis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">Redistribution of caveolae during mitosis.</a> J Cell Sci. 124, 1965-1972 (2011).</li>
<li>Bhaya, D., Davison, M., Barrangou, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas+systems+in+bacteria+and+archaea%3A+versatile+small+RNAs+for+adaptive+defense+and+regulation%5BTitle%5D)+AND+%22Annual+review+of+genetics%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas systems in bacteria and archaea: versatile small RNAs for adaptive defense and regulation.</a> Annual review of genetics. 45, 273-297 (2011).</li>
<li>Boch, J., Scholze, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Breaking+the+Code+of+DNA+Binding+Specificity+of+TAL-Type%5BTitle%5D)+AND+%22III+Effectors.+Science%22%5BJournal%5D)">Breaking the Code of DNA Binding Specificity of TAL-Type.</a> III Effectors. Science. 326 (5959), 1509-1512 (2009).</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

Hier beschrijven we het gebruik van TIRFM naar clathrine gemedieerde endocytose (CME) op het niveau van individuele CCP visualiseren in levende cellen in real time. CME is een snelle en zeer dynamische evenement gemedieerd door het cumulatieve effect van de vele ruimte en tijd gescheiden individuele gebeurtenissen. De meeste tests die momenteel worden gebruikt, zoals biochemische meting van opname middels oppervlak biotinylering of ligand binding, stroomcytometrie of gefixeerde cellen assays meten hoeveelheid geïnternal...

Het proces van clathrine gemedieerde endocytose (CME) is afhankelijk van de tijdige aankomst van de vele componenten van de clathrine gemedieerde endocytotische machines lading verzamelen en manipuleren van het plasmamembraan in de vesicles 1-3. CME is een initiatief van membraan vervorming en vracht-adapter eiwitten die bij ontluikende locaties van endocytose 1 bij elkaar komen. Deze eiwitten werven de manteleiwitgen clathrin, die assembleert in een kooi-achtige structuur die de clathrin coated pit (CCP) 4 vormt. Zodra de CCP volledig is geassembleerd in een bolvorm, membraan splitsing, voornamelijk door middel van acties van de grote GTPase, dynamin, genereert free-clathrin gecoate blaasjes (CCV) 5,6. Deze internalisatie veroorzaakt snelle demontage van de clathrine laag, waardoor de componenten worden hergebruikt voor meerdere ronden van CME. De ontdekking en karakterisering van de bij CME eiwitten is geworteld in de traditionele Biochemical, genetische en microscopische technieken 4-6,8. Deze testen zijn de rol en de interactie punten van deze endocytisch componenten toegelicht. Hoewel zeer nuttig voor het definiëren essentiële onderdelen van handel machines, zijn deze bepalingen zeer beperkt vastleggen van het dynamisch gedrag van CME onderdelen of lading concentratie. Dit is een kritieke beperking, aangezien CME wordt door de choreografie samenstellen van sets van proteïne modules in gedefinieerde stappen, en aangezien kleine veranderingen in de dynamiek van afzonderlijke gebeurtenissen endocytotische grote cumulatieve gevolgen endocytose hebben. Verder recente gegevens blijkt dat individuele CCP kunnen verschillen zowel in samenstelling als in gedrag, wat suggereert dat de fysiologische regulering van deze taak zeer ruimtelijk en temporeel beperkt 9-14. Visualiseren individuele endocytische gebeurtenissen is dus essentieel om te begrijpen waarom er meerdere redundante eiwitten betrokken bij CME en hoe deze eiwitten kunnen worden gecontroleerd by fysiologische signalen om vracht internalisatie reguleren. Hier beschrijven we het gebruik van totale interne reflectie fluorescentiemicroscopie (TIRFM) CME observeren op het niveau van de dynamiek van individuele CCP in levende cellen. TIRFM berust op het verschil in brekingsindex tussen de glazen dekglaasje en vloeibare omgeving cellen 15,16. Wanneer het excitatie licht naar de cellen op dan de kritische hoek, wordt intern gereflecteerd, waardoor een verdwijnende golf die een dunne gebied van verlichting zich ongeveer 100 nm boven het dekglaasje handhaaft. Dit zorgt ervoor dat alleen de fluorescerende moleculen binnen deze smalle veld zijn enthousiast. Praktisch, dit maakt de excitatie van fluorescerende moleculen op of nabij het plasmamembraan en minimaliseert fluorescentie van de inwendige delen van de cel. Dit verschaft een aanzienlijk hogere signaal-ruisverhouding en z-as resolutie gebeurtenissen in de plasmamembraan, co visualiserenmpared meer algemeen gebruikte modi zoals conventionele epifluorescentie of confocale fluorescentie microscopie. We beschrijven ook op een inleidend en praktijk, het gebruik van een algemeen gebruikte beeldanalyse platform te analyseren en kwantificeren eenvoudige morfologische kenmerken en dynamica van individuele lading endocytische events.

<table><tbody><tr><td>DMEM/High Glucose with L-glutamine and sodium pyruvate</td><td>Fisher Scientific&nbsp;</td><td>SH3024301</td><td></td></tr><tr><td>Dulbecco's Phosphate Buffered Saline (DPBS), no calcium, no magnesium</td><td>Gibco, by Life Technologies</td><td>21600-010</td><td></td></tr><tr><td>EDTA Free Acid</td><td>Amresco</td><td>0322-500G</td><td></td></tr><tr><td>Fetal Bovine Serum</td><td>Gibco, by Life Technologies</td><td>10437-028</td><td></td></tr><tr><td>Leibovitz's L-15 Medium, no phenol red</td><td>Gibco, by Life Technologies</td><td>21083-027</td><td></td></tr><tr><td>Opti-MEM</td><td>Gibco, by Life Technologies</td><td></td><td></td></tr><tr><td>HEPES</td><td>CellPURE by Fisher Scientific</td><td>BP2937-100</td><td></td></tr><tr><td>Effectene</td><td>Qiagen</td><td>301425</td><td>Transfectiereagens</td></tr><tr><td>25 mm coverglass</td><td>Fisher Scientific</td><td>12-545-86</td><td></td></tr><tr><td>Corning cell culture treated flasks, 25 cm2</td><td>Fisher Scientific</td><td>10-126-28</td><td></td></tr><tr><td>Cell culture 6-well plate</td><td>Greiner Bio-One, by VWR</td><td>82050-896</td><td></td></tr><tr><td>Monoclonal ANTI-FLAG M1</td><td>Sigma Aldrich</td><td>F3040-5MG</td><td></td></tr><tr><td>[D-Ala2, N-Me-Phe4, Gly5-ol]-Enkephalin acetate salt (DAMGO)</td><td>Sigma Aldrich</td><td>E7384-5MG</td><td></td></tr><tr><td>Alexa Fluor 647 Protein Labeling Kit</td><td>Life Technologies</td><td>A20173</td><td></td></tr><tr><td>ImageJ</td><td>NIH</td><td></td><td>http://rsb.info.nih.gov/ij/</td></tr><tr><td>Imaris Image analysis software</td><td>BitPLane</td><td></td><td>http://www.bitplane.com/imaris/imaris, voor geautomatiseerde analyse</td></tr><tr><td>Nikon Eclipse Ti inverted microscope and required accessories including filter cubes and filters</td><td>Nikon</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Nikon TIRF arm with required adapters for Nikon Eclipse Ti</td><td>Nikon</td><td></td><td>Voor het aanpassen van de invalshoek</td></tr><tr><td>iXon+ EMCCD camera and adapters</td><td>Andor</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

visualiseren clathrine-gemedieerde endocytose van g-proteïne gekoppelde receptoren bij single-event resolutie via tirf microscopie

Visualizing Clathrin-mediated Endocytosis of G Protein-coupled Receptors at Single-event Resolution via TIRF Microscopy

Veel belangrijke signaalreceptoren worden geïnternaliseerd via het goed bestudeerde proces van clathrine-gemedieerde endocytose (CME). Traditionele celbiologische assays, die globale veranderingen in endocytose meten, hebben meer dan 30 bekende componenten geïdentificeerd die deelnemen aan CME, en biochemische studies hebben een interactiekaart opgesteld van veel van deze componenten. Het wordt echter steeds duidelijker dat CME een zeer dynamisch proces is waarvan de regulatie complex en delicaat is. In dit manuscript beschrijven we het gebruik van Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) microscopie om de dynamica van componenten van de clathrine-gemedieerde endocytische machinerie direct te visualiseren, in realtime in levende cellen, op het niveau van individuele gebeurtenissen die dit proces mediëren. Deze benadering is essentieel om de subtiele veranderingen te verduidelijken die endocytose kunnen veranderen zonder deze globaal te blokkeren, zoals gezien wordt bij fysiologische regulatie. We zullen ons concentreren op het gebruik van deze techniek om een gebied van opkomend belang te analyseren, de rol van de samenstelling van het transportmiddel bij het moduleren van de dynamica van verschillende clathrine-gecoate putjes (CCP's). Dit protocol is compatibel met een verscheidenheid aan wijd beschikbare fluorescentie sondes, en kan worden toegepast op het visualiseren van de dynamica van veel transportmiddelmoleculen die vanaf het celoppervlak worden geïnternaliseerd.

Met behulp van levende cellen TIRF Microscopie we de endocytische dynamiek van de μ-opioïde-receptor (MOR) hebt opgenomen, een G-eiwit-gekoppelde receptor (GPCR) en haar endocytisch adapter eiwit β-arrestine. De β-arrestin construct werd transiënt getransfecteerd in een stabiele wijze MOR cellijn die het protocol geschetst in figuur 1, en ​​afgebeeld 96 uur later. De MOR in de stabiele cellijn N-terminaal gelabeld met een pH-gevoelige GFP. Dit fluorescerend eiwit fluoresceert alleen in de neutrale extra...

Clathrine-gemedieerde endocytose, een snel en zeer dynamisch proces, internaliseert veel eiwitten, inclusief signaalreceptoren. Het hier beschreven protocol visualiseert direct de kinetiek van individuele endocytische gebeurtenissen. Dit is essentieel om te begrijpen hoe kernleden van de endocytische machinerie met elkaar coördineren en hoe eiwitlading dit proces beïnvloedt.

Visualiseren Clathrine-gemedieerde endocytose van G-proteïne gekoppelde receptoren bij Single-event resolutie via TIRF Microscopie

Many important signaling receptors are internalized through the well-studied process of clathrin-mediated endocytosis (CME). Traditional cell biological ...

Het algemene doel van deze procedure is om de dynamica van individuele clathrine-gecoate putjes in levende cellen te visualiseren en te kwantificeren. Dit wordt bereikt door eerst fluorescent gelabelde endocytische en vrachteiwitten in een adherentie-cellijn te transfecteren. De volgende stap is om de cellen af te beelden met totale interne reflectie, fluorescentie of turf-microscopie.De levensduur van kleine sets clathrine-gecoate putjes wordt vervolgens handmatig gekwantificeerd met behulp van een beeldverwerkings- en analyseprogramma. De laatste stap is om de levensduur van clathrine-gecoate putjes te kwantificeren door middel van objectieve geautomatiseerde detectie en analyse. Uiteindelijk wordt turf-microscopie gebruikt om de dynamica van individuele clathrine-gecoate putjes met enkele gebeurtenisresolutie te kwantificeren om clathrine-gemedieerde endocytose van G-proteïnegekoppelde receptoren te onderzoeken.Deze methode kan helpen bij het beantwoorden van belangrijke vragen in het gebied van membraantransport, zoals hoe de assemblage en de dynamica van endocytose kunnen veranderen op basis van de verschillende endocytische eiwitten en vrachteiwitten die aanwezig zijn. Om te beginnen transfecteer HEC 2 93-cellen met plasmiden die coderen voor tag G-proteïnegekoppelde receptoren of GPCR's en/of componenten van de Claro-machinerie. In een 12-wellplaat zoals beschreven in het tekstprotocol, voeg de dag na transfectie 0,5 milliliter fosfaatgebufferd serum of PBS met één millimolar EDTA toe aan elk wel.Plaats vervolgens drie ronde steriele 25 millimeter dekglasjes in afzonderlijke wells van een zes. Vul elk wel met twee milliliter media. Duw het dekglas voorzichtig naar de bodem van het wel om te voorkomen dat cellen op de onderkant van het dekglas groeien.Agiteer vervolgens handmatig een wel van de 12-wellplaat om de cellen van de bodem van het wel te tillen. Voeg een milliliter DM EM met 10%FBS toe om te reseden. Verdeel vervolgens de getilde cellen van één wel gelijkmatig over de drie dekglasjes.Laat de cellen minimaal 48 uur op de dekglasjes groeien voordat je gaat afbeelden. Zorg er ook voor dat de cellen verspreid en plat zijn voor het afbeelden van de dynamica van clathrine-gecoate putjes en vracht. Incubeer de cellen eerst vooraf met antilichamen zoals beschreven in het tekstprotocol.Bereid vervolgens de overdracht van het dekglas naar een live-cel-afbeeldingskamer voor door een paar pincetten en een 25 gauge naald die bij de punt in een haak gebogen is te gebruiken. Houd de pincetten in de dominante hand. Houd de gebogen naald in de andere hand.Draai de naald tot de haak naar beneden gebogen is richting het glas. Trek voorzichtig de haakzijde van de naald over de bodem van een zes-wellplaat tot deze aan het dekglas haakt. Zorg ervoor dat je het oppervlak van het dekglas niet krabt, omdat dit cellen zal losmaken.Til het dekglas voorzichtig op vanaf de bodem van het wel. Balans het dekglas tegen de wand van het wel voor ondersteuning. Gebruik de pincetten om het dekglas bij de rand vast te grijpen en beweeg het dekglas met de celkant omhoog naar de afbeeldingskamer.Monteer de kamer en voeg 700 microliter voorverwarmd afbeeldingsmedium toe. Breng de cellen scherp nadat de kamer op de microscoop is geplaatst, gebruik een turf olie-immersie objectief om de cellen in conventionele epi, fluorescentie of confocale verlichtingsmodi af te beelden om cellen te identificeren die de juiste constructen tot expressie brengen als een belangrijke veiligheidsmaatregel. Wees altijd bewust van de hoek van de laserstraal en richt deze altijd weg van de waarnemer.Focus vervolgens naar de bodemoppervlakte van een expresserende cel totdat de omtrek van de plasmamembraan rond de cel verdwijnt en het bodemoppervlak van de cel zichtbaar wordt. Dit is het meest duidelijk bij een plasmamembraan-gelocaliseerde vrachteiwit zoals de mu-opioïde receptor. Als je dezelfde lasers gebruikt voor afbeelding in conventionele epi-fluorescentie, verhoog dan de invalshoek van de laser tot deze buiten focus is.Fluorescentie in het binnenste van de cel verdwijnt en er is geen omtrek van plasmamembraan rond de cel zichtbaar. Zorg ervoor dat de excitatielaser terugkaatst door het objectief en niet zichtbaar is boven het objectief. Door te controleren of de laservlek zichtbaar is, verfijn je de focus om een scherp beeld te krijgen.Zodra cellen zijn geïdentificeerd, verzamel afbeeldingen minstens elke drie seconden gedurende 10 minuten. Herhaal alle stappen om aanvullende cellen af te beelden. Om te beginnen met de analyse van endocytische dynamica, open het bestand in image J. Afbeeldingen worden opgeslagen als een enkele stapel TIFF-bestanden.Met interleaf kanalen. Converteer de afbeeldingen naar hyper stapels door image hyper stapels en stapel naar hyper stapel in het pop-upvenster te selecteren. Voer het aantal verkregen kanalen in.Voer één in voor Zack en voer het aantal filmframes in. Het hyper stapelformaat levert een venster op met twee schuifbalken. Gebruik de bovenste balk om door de kanalen te bewegen en de onderste balk om door de tijd te bewegen.Scrol naar het kanaal van het eiwit waarvan de levensduur wordt bepaald. Ga verder dan het eerste frame van de film om de inbedding van reeds bestaande clathrine-gecoate putjes of CCP's, waarvan de volledige duur niet zichtbaar is, te verminderen. Teken een gebied van belang of ROI rond een willekeurig gekozen plekje.Tel het aantal frames waarin een plekje zichtbaar is. Om te beginnen met analyse met objectherkenning, open het ruwe afbeeldingsbestand in de beeldanalysesoftware door standaard emerged. Een kleurafbeelding verschijnt.Gebruik het venster voor beeldaanpassing om de helderheid van een kanaal aan te passen. Klik op de naam van een kanaal om de weergegeven kleur te wijzigen. Schakel het vakje naast het kanaal uit om de weergave ervan te voorkomen.Maak plekjes aan door op het pictogram met oranje plekjes te klikken. Selecteer een ROI rond de cel en gebruik

visualizing-clathrin-mediated-endocytosis-g-protein-coupled-receptors

Research

JoVE Journal

Biology

Biologie

De compartimentering van eiwitten, hetzij binnen het plasma membraan of in de intracellulaire locaties is een regulerend mechanisme die sterk kunnen beïnvloeden signalering resultaten, vandaar dat te begrijpen signalering is het van belang het bestuderen van de ruimtelijke en temporele gedrag van de betrokken eiwitten. We beschrijven hier een TIRF microscopie gebaseerde systeem om signaaltransductie in T-cellen te bestuderen, maar is breed toepasbaar.

Een TIRF Microscopie Techniek voor Real-time, gelijktijdige beeldvorming van de TCR en de bijbehorende signaaleiwitten

Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) microscopie is een krachtige aanpak van de structuren te observeren in de buurt van het celoppervlak bij hoge contrast en temporele resolutie. We laten zien hoe TIRF kan worden gebruikt om eiwitten dynamiek te studeren aan de cortex van de celwand-ingesloten bacteriën en schimmels cellen.

Visualisatie van Cortex Organisatie en Dynamiek in Micro-organismen, met behulp van Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy

This video describes TIRF, a total internal reflection microscopy-based technique to visualize actin and microtubule polymerization dynamics. The method allows the high-resolution imaging of actin and microtubule coupling dynamics in real-time, which is essential for understanding cellular crosstalks.

TIRF Microscopy to Visualize Actin and Microtubule Coupling Dynamics

This video demonstrates a high-resolution total internal reflection fluorescence (TIRF) microscopy technique for real-time visualization of phagosome formation and closure during macrophage-mediated phagocytosis of IgG-opsonized red blood cells (RBCs) attached to the surface of a glass bottom dish. The macrophages extend pseudopodia around the RBCs and engulf them inside the phagosomes, detaching them from the glass surface.

TIRF Microscopy-Based Visualization of Phagosome Formation and Closure

Source: Winkle, C. C., et al. Utilizing Combined Methodologies to Define the Role of Plasma Membrane Delivery During Axon Branching and Neuronal Morphogenesis. J. Vis. Exp. (2016)This video demonstrates total internal reflection fluorescence (TIRF) microscopy for visualizing exocytic events in cortical neurons. A pH-sensitive green fluorescent protein (GFP) marker fluoresces upon vesicle fusion, with selective TIRF excitation capturing membrane-proximal exocytosis in time-lapse imaging.

Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy for Visualization of Exocytic Events 

Dit protocol beschrijft hoe totale interne reflectiefluorescentiemicroscopie te gebruiken om enkele receptoren op het oppervlak van levende cellen te visualiseren en te volgen en daarmee de laterale mobiliteit van receptoren, de grootte van receptorcomplexen te analyseren, evenals om voorbijgaande receptor-receptorinteracties te visualiseren. Dit protocol kan worden uitgebreid tot andere membraaneiwitten.

Hoge-resolutie Spatiotemporal Analyse van Receptor Dynamics door Single-molecule fluorescentie microscopie

Dit artikel beschrijft een methode voor het onderzoeken van de dynamica van neurotransmittervesicles in neuroblastoomcellen, met behulp van een synaptobrevin2-pHluorine construct en Total Internal Reflection Fluorescence Microscopie. De strategie die ontwikkeld is voor beeldverwerking en gegevensanalyse wordt ook gerapporteerd.

TIRFM en pH-gevoelige GFP-sondes naar Neurotransmitter Vesicle Dynamics Evalueer in SH-SY5Y Neuroblastoom Cellen: cell imaging en data-analyse

We beschrijven een experimentele opstelling om fagosoombevorming en -afsluiting in drie dimensies in levende macrofagen met ongekend hoge resolutie te visualiseren, met behulp van total internal reflection fluorescentiemicroscopie. Het maakt het mogelijk om de basis van de fagocytische cup, de uitbreidende pseudopoden, evenals de precieze plaats van fagosooombaan te monitoren.

&quot;Phagosome Closure Assay&quot; naar phagosome Formatie Visualiseer in drie dimensies behulp van totale interne reflectie fluorescentiemicroscopie (TIRFM)

Labelen van de extracellulaire domein van een membraaneiwit met een pH-gevoelige fluorofoor, superecliptic pHluorin (SEP), maakt lokalisatie, expressie en mensenhandel worden bepaald. Imaging september-gemerkte eiwitten met totale interne reflectie fluorescentie microscopie (TIRFM) maakt de kwantificering van eiwitniveaus in de perifere ER en plasmamembraan.

Gebruik makend van pHluorin-gelabeld receptoren Monitor subcellulaire lokalisatie en handel

We presenteren een protocol voor het implementeren van interferentie-reflectiemicroscopie en totaal-interne-reflectie-fluorescentiemicroscopie voor de gelijktijdige beeldvorming van dynamische microtubuli en fluorescerend gelabelde microtubuli-geassocieerde eiwitten.

Gelijktijdige interferentiereflectie en totale interne reflectie fluorescentiemicroscopie voor beeldvorming van dynamische microtubuli en bijbehorende eiwitten

Dit protocol is een gids voor het visualiseren van dynamische actine en microtubuli met behulp van een in vitro total internal fluorescence (TIRF) microscopie assay.

Visualisatie van actine en microtubulikoppelingsdynamiek in vitro door total internal reflection fluorescence (TIRF) microscopie

Leer clathrine-gemedieerde endocytose van G-proteïne gekoppelde receptoren visualiseren met TIRF-microscopie. Deze methode kwantificeert dynamiek van individuele clathrine-coated pits in levende cellen.

Visualiseren Clathrine-gemedieerde endocytose van G-proteïne gekoppelde receptoren bij Single-event resolutie via TIRF Microscopie (Video) | JoVE Journal

Visualiseren Clathrine-gemedieerde endocytose van G-proteïne gekoppelde receptoren bij Single-event resolutie via TIRF Microscopie

Meer video's verkennen