15 april 2015
Eenvoudige tests voor het meten van ethanolgevoeligheid en snelle tolerantie bij Drosophila vergemakkelijken het gebruik van dit modelorganisme voor het onderzoeken van deze belangrijke ethanol-gerelateerde gedragingen. Hier wordt een relatief eenvoudige, schaalbare test beschreven voor het meten van ethanolgevoeligheid en snelle tolerantie bij vliegen.
Het algemene doel van het volgende experiment is om de gevoeligheid voor ethanol-sedatie bij fruitvliegen te beoordelen. Dit wordt bereikt door vliegen in vials te plaatsen en ze bloot te stellen aan ethanol-damp. De tweede stap is het bepalen van het aantal gesedeerde vliegen in elke vial op terugkerende tijdstippen, totdat alle vliegen gesedeerd zijn.
Vervolgens wordt het tijdstip geïnterpoleerd. Wanneer 50% van de vliegen in elk flacon is gesedateerd, tonen de resultaten een index van de tijd die nodig is om fruitvliegen met ethanol te sedateren; deze procedure zal vandaag worden gedemonstreerd door Simran Sindu, een student in mijn laboratorium. Om het experiment te starten, verzamel vliegen in flacons met vers voedsel in groepen van 11 van één enkel geslacht gedurende maximaal vijf minuten met CO2, en laat de vliegen gedurende de nacht herstellen in voedingsflacons in een omgevinggecontroleerde ruimte.
Bereid een ethanoloplossing door zuivere 100% ethanol te verdunnen in gezuiverd water tot een uiteindelijke concentratie van 85%. Laat de oplossing gedurende de nacht terugkeren naar kamertemperatuur. Bereid vóór de assay een schoon, leeg voedingsflesje voor, dat als testflesje zal dienen. Zorg voor een nieuwe plug van celluloseacetaat, een siliconen stop en één milliliter ethanoloplossing voor elk flesje vliegen dat getest moet worden. Stel de kamertemperatuur in op 20 tot 25 °C en de relatieve luchtvochtigheid op 55 tot 65%. Wijs een andere medewerker aan om een unieke code toe te kennen aan elke groep flesjes en noteer deze code voor later. Plaats de gecodeerde flesjes met vliegen enkele minuten in de testruimte om te acclimatiseren. Label vervolgens de lege testflesjes zodat deze overeenkomen met de codes op de vliegflesjes.
Maak een fysiek testlogboek door de codes in kolommen in een spreadsheet in te voeren, met één kolom per flacon. Gebruik het testlogboek als leidraad. Plaats de gecodeerde voedingsflacons met vliegen en de lege testflacons in overeenkomstige arrays in de testruimte en breng de vliegen één voor één over van de voedingsflacons naar de bijbehorende en gelabelde testflacons.
Plaats vervolgens onmiddellijk celluloseacetaatpluggen in de testbuisjes totdat de celluloseacetaatpluggen twee centimeter onder de bovenkant van de buisjes zitten. Voor de bepaling op tijdstip nul: houd elk buisje individueel vast met de duim en wijsvinger.
Tik drie keer zachtjes op de tafel om de vliegen naar de bodem van het buisje te schudden. Wacht 30 seconden en tel het aantal vliegen dat immobiel is en/of dood is. Noteer het aantal immobiele of dode vliegen voor elk buisje op dat tijdstip.
Noteer nul minuten in het papieren testlogboek. Start de timer bij tijd nul en voeg onmiddellijk één milliliter ethanol toe aan de celluloseacetaat. Meng in een cirkelvormige beweging met intervallen van vijf seconden voor de eerste set van vier vials in de volgorde.
Ze worden getest wanneer de ethanol aan alle vier de testbuisjes in de set is toegevoegd. Plaats in elk buisje een siliconen stop om deze af te sluiten na 1, 2, 3, 4 en vijf minuten. Voeg één milliliter ethanol toe aan de tweede, derde, vierde, vijfde en zesde sets van vier buisjes respectievelijk.
Ga door met het plaatsen van siliconen stoppen nadat ethanol aan elke set van vier vials LS is toegevoegd bij zes minuten. Test de eerste set van vier vials door elke vial met duim en wijsvinger vast te pakken en drie keer zachtjes op de tafel te tikken om de vliegen naar de bodem van de vial te doen vallen. Wacht 30 seconden, tel vervolgens het totale aantal gesedateerde vliegen en noteer dit.
Spoor vliegen als gesedeerd als ze óf op de bodem van het buisje staan maar niet lopen, óf op hun rug liggen met of zonder vleugelslaan. Behandel elk buisje binnen de set met intervallen van vijf seconden volgens dit schema op 7, 8, 9, 10 en 11 minuten.
Test de tweede, derde, vierde, vijfde en zesde set flacons respectievelijk op dezelfde wijze als voor de eerste set bij 12 minuten. Test de eerste set van vier flacons opnieuw en ga verder met het testen van de tweede, derde, vierde, vijfde en zesde set flacons bij respectievelijk 13, 14, 15, 16 en 17 minuten. Ga door met het testen van de vliegen totdat ze allemaal gesedeerd zijn.
Voer het totale aantal vliegen in elke vial in bij de test op papier. Registreer immobiele of dode vliegen op tijdstip nul als aftrek van het totale aantal vliegen. Ruwe gegevens uit de ethanol-sedatie-assay werden omgezet naar het percentage actieve vliegen als functie van de tijd.
De gevoeligheid voor ethanol-sedatie uit de primaire gegevens werd gekwantificeerd als sedatietijd 50 of ST 50. Dit is de tijd die nodig is voordat 50% van de vliegen gesedeerd raakt, of de oppervlakte onder de curve (AUC). De assay detecteert de effecten van RNAi tegen calnexin 14 D in het zenuwstelsel, wat de ethanolgevoeligheid verminderde ten opzichte van de controles; mutaties van scab en rouser verhoogden de gevoeligheid voor ethanol-sedatie, en mutaties van happy hour verminderden de gevoeligheid voor ethanol-sedatie in vergelijking met de controles zodra deze gewend waren.
Deze techniek kan in anderhalf uur worden voltooid indien deze correct wordt uitgevoerd.
Bekijk het volledige transcript en krijg toegang tot duizenden wetenschappelijke video's
Dit artikel beschrijft een eenvoudige assay voor het meten van ethanolgevoeligheid en snelle tolerantie bij Drosophila. De methode vergemakkelijkt het onderzoek naar ethanolgerelateerd gedrag in dit modelorganisme.
Deze assay biedt een schaalbare, kosteneffectieve gedragsmatige readout voor ethanolgevoeligheid en snelle tolerantie in Drosophila, waardoor high-throughput genetische screening mogelijk wordt om risico's bij de validatie van targets in onderzoek naar alcoholgebruiksstoornissen te beperken. Door de kinetiek van de sedatieve respons te kwantificeren, ondersteunt het de mechanistische risicoreductie van genetische hits en verbetert het het voorspellende vertrouwen in vroege discovery-pipelines. De eenvoud en reproduceerbaarheid van de methode faciliteren de cross-functionele afstemming tussen teams op het gebied van genetica, neurowetenschappen en translationeel onderzoek.
De assay past binnen het ontdekkingscontinuüm van target-hypothesetests tot lead-identificatie en biedt gedragsmatige validatie die genetische bevindingen verbindt met functionele uitkomsten in de neurofarmacologie.