Name: Xenopus laevis als een model te identificeren Vertaling Impairment (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2015-09-27T14:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 24 s
Description: Leer een protocol om mutaties in translatie-initiatiefactoren te evalueren met Xenopus laevis oocyten. Deze methode analyseert de vertaling van het mos-transcript om eiwit-synthesestoornissen te begrijpen.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Dit onderzoek werd ondersteund door een subsidie van INSERM, de Universiteit van Lille 1, de Universiteit van Lille 2, Regionaal Ziekenhuiscentrum van Lille (CHR de Lille). MCCH erkent de steun van de Fondation de France en wil IRCL, Pr. Sonenberg bedanken voor de gift van de V5-plasmiden, Dr. Dissous (Pasteur Institute, Lille) voor de gift van anti-GFP-antilichamen, UMS 3387 (Universiteit van Rennes) waar Xenopus eicellen worden gekocht en Dr Taymans (JPArc, Lille) voor het kritisch lezen van de manuscripttekst.

Alle Xenopus experimenten werden uitgevoerd op het dier faciliteit van de Lille 1 universiteit volgens de regels van de richtsnoeren van de Europese Gemeenschap van de Raad (86/609 / EEG) voor laboratorium dierproeven. Het dier protocol werd goedgekeurd door de lokale institutionele review board (Comité d&#39;Ethique en Experimenteren Animale Nord-Pas-de-Calais, CEEA 07/2010). 1. Eicel Handling <ol><li> Bereid de verdoving oplossing: los 1 g tricaïne methaansulfonaat poeder in een 1 liter steriel water. </li><li> Plunge vrouwelijke Xenopus laevis in deze oplossing, hebben betrekking op de beker om ontsnapping te voorkomen en te wachten ongeveer 45 minuten voor het dier volledig verdoofd te worden (zonder enige reactie op een been knijpen). </li><li> Was de kikker met zeep en spoel af met leidingwater en plaats het dier op zijn rug op schone aluminiumfolie. </li><li> Klem de huid van de zijkant van de buik en de eierstokken niveau tang.Maak een incisie van ongeveer 1 cm met een schaar vooraf gereinigd met ethanol 70%. Zorg ervoor dat het deel diep genoeg is en de onderliggende buikwand excisie van ovariële weefsel waarin meerdere eicellen in verschillende stadia van ontwikkeling bevinden kon plaatsvinden. </li><li> Ontleden eierstok lobben, was ze 4 keer in een petrischaal (50 mm) met een ND96 medium (96 mM NaCl, 2 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1,8 mM CaCl2, 5 mM HEPES pH 7,4 met NaOH, aangevuld met 50 ug / ml streptomycine / penicilline, 225 ug / ml natriumpyruvaat, 30 pg / ml sojaboontrypsineremmer, 1 ul / ml tetracycline) om alle sporen van bloed en vuil te verwijderen. Opmerking: Tetracycline kan een optimaal behoud en een goed herstel na micro-injectie behandeling. </li><li> Bewaar ze in een overdekte petrischaal ondergedompeld in het medium bij 14 ° C, waardoor de bewaring voor een week. </li><li> Steek de buikwand en de huid met dierenarts absorbeerbare thread en een hechten naald (3 of 4 hechtingen nodig zal zijn). </li><li> Plaats het dier in een bekerglas zonder water en vochtiger de huid met kraanwater totdat de kikker weer beweegt. Dek het bekerglas om ontsnapping te voorkomen. </li><li> Scheid voorzichtig de eierstok lobben in het medium in groepen van 5-10 oöcyten met 2 paren pincetten onder een stereomicroscoop met een 10-voudige vergroting. Kies eicellen in fase VI. Ze kunnen worden herkend door i) hun vorm en kleur met een bruine gepigmenteerde animale pool en gele vegetatieve paal gescheiden door een duidelijke band ii) de grootte beter dan 1,2 mm in diameter 10. </li><li> Incubeer de geselecteerde eicellen in een collagenase oplossing (1 mg / ml collagenase A van Clostridium histolyticum, opgelost in ND96 zonder tetracycline) in een petrischaal onder voorzichtig roeren gedurende 45 min aan de eicel defolliculation vergemakkelijken (collagenase verteert oöcyt / folliculaire verbindingen). Spoel de eicellen 3 of 4 maal met ND96 medium bij 14 bewaard° C. Let op: niet de eicellen minder of meer dan 45 min vanwege het risico van de eicel oppervlakte-eiwitten te vernietigen en het veroorzaken van een slechte levensvatbaarheid uitbroeden. Collagenase behandeling kan spontaan GVBD induceren. </li><li> Incubeer eicellen in het medium voor 3-4 uur. Verwijder folliculaire cellen met fijne pincet onder verrekijker vergrootglas en houd ze bij 19 ° C in ND96 medium. </li></ol> 2. Bereiding van mRNA synthese <ol><li> Lineariseren 5 pg van de volgende plasmiden door enzymatische digestie behulp Pmel enzym. OPMERKING: pcDNA6.2 / V5-DEST met daarin een 1599 aminozuren eIF4G1 cDNA wild-type (eIF4G1-WT, NM_198241), pcDNA6.2 / V5-DEST daarin een eIF4G1 dominant negatieve cDNA (eIF4G1-DN) met mutaties c.2105T &gt; G c.2106A&gt; C, c.2120-&gt; G, c.2122T&gt; A, 2125T&gt; - en c.2126T&gt; G regio interactie tussen eIF4G1 en eIF4E op positie 612-618 van de overeenkomstige proteïne storen interactie betwenl eIF4G1 en eIF4E 8, pcDNA6.2 / C-EmGFP bevatten chlooramfenicolacetyltransferase (GFP). Bereid 2 mengsels van elk van de plasmiden 3: namelijk enerzijds Pmel enzym en de tweede zonder enzym als controle. </li><li> Precipiteren van plasmide-DNA met een klassieke procedure ethanol en opnieuw in suspensie in 20 ul nuclease-vrij H2O </li><li> Bepaal de concentratie met behulp van een spectrofotometer. De concentratie moet superieur aan 150 ng / ul transcriberen cRNA. </li><li> Run 1 pl monsters en hun controles met 5 gl laadbuffer op een 0,8% agarose gel om het plasmide linearisatie controleren. </li><li> Gebruik van een kit voor in vitro transcriptie en cRNA zuivering volgens de instructies van de fabrikant. De getranscribeerde cRNA worden opnieuw gesuspendeerd in 20 ul nuclease-vrij H2O Monsters kunnen worden opgeslagen bij -80 ° C indien nodig. </li><li> Bereid de 10X MOPS migratie buffer met 0,2 M MOPS (pH 7,0), 20 mM natriumacetaat en 10 mM EDTA (pH 8,0). Steriliseer oplossing met een 0,45 urn filter. Voorraad van de oplossing beschermd tegen het licht aan RT oplossing oxidatie te voorkomen. </li><li> Reinig de elektroforese tank achtereenvolgens met NaOH, HCl en grondig gespoeld met dubbel gefilterd water voor een O / N om RNase te vermijden en te voorkomen dat RNA degradatie. </li><li> Zet een 1,5% agarosegel met MOPS en formaldehyde. Warm tot volledige agarose oplossing en laat het afkoelen tot 55 ° C. Onder zuurkast, voeg 0,1 volume van 10X MOPS, 6,6% formaldehyde en 4 ug ethidiumbromide (10 mg / ml). Giet de gel onder de zuurkast en wacht ongeveer 1 uur voor de gel uit te harden. Opmerking: Formaldehyde en ethidiumbromide zijn giftig. </li><li> Bereid monsters voor migratie in een 0,2 ml buis met 1 pl cRNA, 8,8% formaldehyde, 60% formamide en 0,1 volume van 10X MOPS. Incubeer 3 min bij 70 ° C en zet de buizen op ijs gedurende 10 min. Centrifuge monsters enkele seconden op5000 x g. Voeg 2 pl gelbeladingsbuffer. Opmerking: Formamide is giftig. </li><li> Run monsters gedurende 20 minuten bij 90V. Week de gel in nuclease-vrij H 2 OO / N om de gel destain voordat analyseren aan de cRNA kwaliteit te controleren. </li><li> Bepaal cRNA concentratie met behulp van een spectrofotometer en bewaar ze bij -80 ° C. </li></ol> 3. Micro-injectie gesynthetiseerde RNA en Eicellen rijping Stimulatie <ol><li> Bereid de benodigde apparatuur voor eicellen micro-injectie. Gebruik een micropipet trekker om kleine glazen capillaire trekken. Onder stereomicroscoop, breek het uiteinde van de capillair met de pincet om een ​​stomp uiteinde te maken. Vul het capillair micropipet met minerale olie met behulp van een injectiespuit 1 ml met een Millipore 0,45 urn filter aan het tegenoverliggende uiteinde. Monteer de micropipet op de micro-injectie pipet. Kies een accurate micropipet gekalibreerd door de fabrikant om een ​​goede nauwkeurigheid te geven in combinatie met de juiste glazen capillaire. </li><li> Voer microinjectie 1-2 uur na defolliculation noodzakelijk vertraging eicel terugwinning van oöcyten bij 14 ° C gehouden. Gebruik Petri gerechten met de bodem geschraapt met een tang op een zelfklevende oppervlak voor eicellen te creëren en vul ze met ND96 medium. </li><li> Regelen oöcyten langs een geschraapt laan in een petrischaal zodat een opeenvolgende injectie van oöcyten met de capillaire micropipet onder een hoek van 45 ° C. </li><li> Injecteer in de eicel equatoriale zone onder het gepigmenteerde dier gebied voor een optimale verspreiding van monsters in het cytoplasma. Steek alleen het dunste deel van capillaire tip over ongeveer 150-200 urn van diepte. </li><li> Injecteer 30 ng cRNA respectievelijk verkregen uit de verschillende plasmiden in een volume van 60 nl in een eerste eicel. Na injectie, wacht 5-10 seconden voordat u de capillaire tip om het monster te ontsnappen (Figuur 2A) te vermijden. Opmerking: Niet meer dan 120 nl. Injecteren zo langzaam als je kunt. Een regeling met gedestilleerd water aanbevolen. </li><li> Verplaats handmatig de petrischaal naar de volgende eicel te injecteren. Opmerking: Zorg ervoor dat de punt niet verstopt is door het genereren van een kleine puls uit het bad oplossing na 2-3 micro-injecties. </li><li> Transfer geïnjecteerde eicellen in 24 wells kweekplaten (10 eicellen / putje) gevuld met 3 ml vers medium ND96 en laat ze bij 19 ° C. </li><li> Incubeer de eicellen in ND96 met progesteron (PG) (2 ug / ml) tot meiotische rijping (GVBD) veroorzaken bij 19 ° C, 15 uur of 4 uur na micro-injectie van gepolyadenyleerde cRNA&#39;s respectievelijk verkregen uit pcDNA6.2 / V5-DESTeIF4G1 en pcDNA6 0,2 / C-EmGFP gebruikt als controle (figuur 2A). Opmerking: Co-injectie van fluorescente merker met cRNA is een handig hulpmiddel opdat de cRNA werd geïnjecteerd en bleef in de eicel. Het uitvoeren van een dergelijke voorlopige experimenten met behulp van een cRNA van belang met een GFP-tag. </li><li> Microinject volgens # 3,5 verschillende verhoudingen (1: 3, 2: 2, 3: 1) van gepolyadenyleerde eIF4G1-WT en eIF4G1 DN-cRNA&#39;s om Tést het translatie-effect van eIF4G1-WT cRNA op de mutant fenotype (Figuur 2D). </li></ol> 4. Germinal Vesicle Breakdown Bepaling <ol><li> Tel het aantal rijpe oöcyten PG na stimulatie door het observeren van de aanwezigheid van een witte vlek op zwart dier paal met een stereomicroscoop. Herhaal het tellen elk uur tot vierentwintig uur (Figuur 2B, 2C). </li></ol> 5. Western Blot (WB) Analyse <ol><li> Homogeniseer de groep van 10 eicellen per heen en weer bewegingen met een micropipet tip, bij 4 ° C in 200 gl in de volgende buffer: 50 mM Hepes, pH 7,4, 500 mM NaCl, 0,05% SDS, 5 mM MgCl2, 1 mg / ml runderserumalbumine, 10 mg / ml leupeptine, 10 mg / ml aprotinine, 10 mg / ml sojaboon trypsine inhibitor, 10 mg / ml benzamidine, 1 mM PMSF, 1 mM natriumvanadaat. </li><li> Centrifugeer monsters 15 min bij 10.000 xg het lipide (bovenste fase) en het membraan (onderste fase) f verwijderractions. Verzamel de cytoplasmatische fractie, slaan een hoeveelheid aan eiwitconcentratie te bepalen en voltooi de resterende met Laemmli of Bis-Tris-monsterbuffer (1: 1). Opmerking: Bis-Tris gels en beladingsbuffer een meer neutrale pH dat eiwitten beschermt tegen hydrolyse </li><li> Verwarm 20 ug monster bij 95 ° C gedurende 10 min. Plaats elk monster in de putjes van de acrylamide gel. Plaats de gel in een tank met geschikte buffer. </li><li> Uitvoeren van een elektroforese gedurende 1 uur bij 200 V. </li><li> Realiseer een WB in TBS pH 8,0 (Tris-HCl 15 mM, NaCl 150 mM, Tween 0,1%, bevattende 10% runderserumalbumine) met een geit anti-Aurora A / EG2 (1: 3000, 2 uur) of met een konijn anti -Aurora A / EG2-P (1: 1000, O / N bij 4 ° C), muis anti-ERK2 (1: 3000, 2 uur), geit anti-ERK2-P (Tyr204) (1: 3000, 2 hr ), konijn anti-mos (1: 5000, 4 uur), konijn anti-GFP (1: 3000, 2 uur) antibodies.Use antilichamen muizen anti-V5 (1: 10.000, 2 uur) en konijn anti-Rsk (1 : 1000, 2 uur) (het laden controles). </li><li> Wassenhet membraan 3 maal gedurende 10 minuten in TBS-Tween en incubeer 1 uur met ofwel een anti-muis of anti-konijn of anti-geit (IgM) mierikswortel-peroxidase gemerkt secundair antilichaam bij verdunningen van 1: 5000, 1: 7500 en 1 : 5000 respectievelijk. </li><li> Het uitvoeren van 3 wasbeurten van 10 min in TBS-Tween en opsporen van het antigeen-antilichamen complexen met de Advanced ECL Detection systeem. </li></ol> 6. Polyadenylatie Assay <ol><li> Steekproef 5 eicellen per aandoening in een 1,5 ml. Was ze met 1 ml Nuclease-vrij PBS 1X (pH 7,4). De volgende stappen zullen worden gemaakt onder zuurkast. </li><li> Extraheren RNA met behulp van een klassieke biologische procedure (zie de instructies van de fabrikant). </li><li> Herstel RNA door centrifugatie (10.000 x g) gedurende 5 min bij 4 ° C. Verwijder supernatant en de lucht drogen RNA gedurende 10 min. </li><li> Resuspendeer RNA pellet in 30 ul nuclease-vrij H2O </li><li> Neem 15 pi van de monsters in een nieuwe buis en voeg 85 ul Nuclease-vrij H 2 O. Het schoonmaken van dese monsters om hun kwaliteit te verbeteren silica kolom volgens de instructies van de fabrikant. Elueer het RNA via 30 ul nuclease-vrij H2O </li><li> Run 1 ui monsters met 5 gl laadbuffer op een 0,8% agarose gel om het RNA integriteit controleren. </li><li> Bepaal de RNA-concentratie met behulp van een spectrofotometer. </li><li> Bereid 2 ligatiemengsels per conditie (dwz eIF4G1-WT, eIF4G1-DN en H 2 O controle) met de volgende reagentia: 10 U RNA-ligase, 0,1 volume van 10X buffer, 1 mM ATP, 10% van PEG8000 50% , 0,1 ug primer P1 (5&#39;-P-GGTCACCTTGATCTGAAGC-NH2-3) 11 en breng het uiteindelijke volume op 10 ui met Nuclease-vrij H2O Voeg in de eerste mengsel RNA verkregen uit oöcyten zonder PG stimulatie en in het tweede mengsel RNA verkregen uit gestimuleerde PG oöcyten. </li><li> Incubeer gedurende 1 uur bij 37 ° C daarna gedurende 20 minuten bij 65 ° C om het enzym te inactiveren. </li><li> Onsea cDNA reverse transcriptie (RT) kit. Bereid de RT mengsel per buis: 0,1 volume 10X RT buffer, 0,1 ug primer P2 (5&#39;-GCTTCAGATCAAGGTGACCTTTTT) 10, 4 mM dNTP mengsel, 50 U van reverse transcriptase en compleet met Nuclease-vrij H 2 O tot de uiteindelijke volume van 10 pl. Voeg 10 ul van ligatiereactie eerder verkregen. Voer de kamertemperatuur onder door de fabrikant beschreven omstandigheden. </li><li> Bereid Polymerase Chain Reaction (PCR) mengsel per buis: 0,1 volume buffer 10X, 1,5 mM MgCl2, 133 uM dNTP mengsel, 0,2 pM specifieke primer, 0,2 uM primer P2, 0,025 U Taq polymerase, 1 ui cDNA en voorzien nuclease-vrij H2O eindvolume van 50 pl. Voer de PCR onder de volgende omstandigheden: 50 ° C gedurende 2 min, 95 ° C gedurende 10 min, [95 ° C gedurende 1 min, 56 ° C gedurende 30 sec, 72 ° C gedurende 30 sec] * 40 cycli, 72 ° C gedurende 10 min 9. De specifieke primers zijn: mos, GTTGCATTGCTGTTTAAGTGGTAA Histon-achtige B4, AGTGACAAACTAGGCTGATATACT; Cycline A1, CATTGAACTGCTTCATTTTCCCAG; Cycline B1: GTGGCATTCCAATTGTGTATTGTT 9. </li><li> Bereid een 3% agarosegel. Voeg in elke PCR producten 10 gl laadbuffer. Voer de gel met 10 pl monsters bij 110 V voor een optimale migratie. Analyse van de gel na 10 en 20 minuten om een ​​verandering van maat die de lengte van de staart poly (A) RNA en daarmee de rijping hetgeen een eerste vereiste voor de vertaling observeren. </li></ol>

<ol><li>Jackson, R. J., Hellen, C. U., Pestova, T. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+mechanism+of+eukaryotic+translation+initiation+and+principles+of+its+regulation%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">The mechanism of eukaryotic translation initiation and principles of its regulation.</a> Nat Rev Mol Cell Biol. 11 (2), 113-127 (2010).</li>
<li>Holcik, M., Sonenberg, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Translational+control+in+stress+and+apoptosis%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Mol+Cell+Bio%22%5BJournal%5D)">Translational control in stress and apoptosis.</a> Nat Rev Mol Cell Bio. 6 (4), 318-327 (2005).</li>
<li>Lopez-Lastra, M., Rivas, A., Barria, M. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+synthesis+in+eukaryotes%3A+the+growing+biological+relevance+of+cap-independent+translation+initiation%5BTitle%5D)+AND+%22Biol+Res%22%5BJournal%5D)">Protein synthesis in eukaryotes: the growing biological relevance of cap-independent translation initiation.</a> Biol Res. 38 (2-3), 121-146 (2005).</li>
<li>Terenin, I. M., Andreev, D. E., Dmitriev, S. E., Shatsky, I. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel+mechanism+of+eukaryotic+translation+initiation+that+is+neither+m7G-cap-%2C+nor+IRES-dependent%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">A novel mechanism of eukaryotic translation initiation that is neither m7G-cap-, nor IRES-dependent.</a> Nucleic Acids Res. 41 (3), 1807-1816 (2013).</li>
<li>Sonenberg, N., Hinnebusch, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+of+translation+initiation+in+eukaryotes%3A+mechanisms+and+biological+targets%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Regulation of translation initiation in eukaryotes: mechanisms and biological targets.</a> Cell. 136 (4), 731-745 (2009).</li>
<li>Van der Knaap, M. S., Leegwater, P. A., Könst, A. A., Visser, A., Naidu, S., Oudejans, C. B., Schutgens, R. B., Pronk, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mutations+in+each+of+the+five+subunits+of+translation+initiation+factor+eIF2B+can+cause+leukoencephalopathy+with+vanishing+white+matter%5BTitle%5D)+AND+%22Ann+Neurol%22%5BJournal%5D)">Mutations in each of the five subunits of translation initiation factor eIF2B can cause leukoencephalopathy with vanishing white matter.</a> Ann Neurol. 51 (2), 264-270 (2002).</li>
<li>Senée, V., Vattem, K. M., Delépine, M., Rainbow, L. A., Haton, C., Lecoq, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Wolcott-Rallison+Syndrome%3A+clinical%2C+genetic%2C+and+functional+study+of+EIF2AK3+mutations+and+suggestion+of+genetic+heterogeneity%5BTitle%5D)+AND+%22Diabetes%22%5BJournal%5D)">Wolcott-Rallison Syndrome: clinical, genetic, and functional study of EIF2AK3 mutations and suggestion of genetic heterogeneity.</a> Diabetes. 53 (7), 1876-1883 (2004).</li>
<li>Chartier-Harlin, M. C., Dachsel, J. C., Vilariño-Güell, C., Lincoln, S. J., Leprêtre, F., Hulihan, M. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Translation+initiator+EIF4G1+mutations+in+familial+Parkinson+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Hum+Genet%22%5BJournal%5D)">Translation initiator EIF4G1 mutations in familial Parkinson disease.</a> Am J Hum Genet. 89 (3), 398-406 (2011).</li>
<li>Charlesworth, A., Cox, L. L., MacNicol, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cytoplasmic+polyadenylation+Element+%28CPE%29-+and+CPE-binding+Protein+%28CPEB%29-independent+mechanisms+regulate+early+class+maternal+mRNA+translational+activation+in+Xenopus+oocytes%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Cytoplasmic polyadenylation Element (CPE)- and CPE-binding Protein (CPEB)-independent mechanisms regulate early class maternal mRNA translational activation in Xenopus oocytes.</a> J Biol Chem. 279 (17), 17650-17659 (2004).</li>
<li>Dumont, J. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oogenesis+in+Xenopus+laevis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Morphol%22%5BJournal%5D)">Oogenesis in Xenopus laevis.</a> J Morphol. 136, 153-180 (1972).</li>
<li>Rassa, J. C., Wilson, G. M., Brewer, G. A., Parks, G. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spacing+constraints+on+reinitiation+of+paramyxovirus+transcription%3A+the+gene+end+U+tract+acts+as+a+spacer+to+separate+gene+end+from+gene+start+sites%5BTitle%5D)+AND+%22Virology%22%5BJournal%5D)">Spacing constraints on reinitiation of paramyxovirus transcription: the gene end U tract acts as a spacer to separate gene end from gene start sites.</a> Virology. 274, 438-449 (2000).</li>
<li>Lin, W., Wadlington, N. L., Chen, L., Zhuang, X., Brorson, J. R., Kang, U. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Loss+of+PINK1+attenuates+HIF-1%CE%B1+induction+by+preventing+4E-BP1-dependent+switch+in+protein+translation+under+hypoxia%5BTitle%5D)+AND+%22J+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Loss of PINK1 attenuates HIF-1α induction by preventing 4E-BP1-dependent switch in protein translation under hypoxia.</a> J Neurosci. 34 (8), 3079-3089 (2014).</li>
<li>Martin, I., Kim, J. W., Lee, B. D., Kang, H. C., Xu, J. C., Jia, H. 2, Stankowski, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ribosomal+protein+s15+phosphorylation+mediates+LRRK2+neurodegeneration+in+Parkinson%27s+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Ribosomal protein s15 phosphorylation mediates LRRK2 neurodegeneration in Parkinson's disease.</a> Cell. 57 (2), 472-485 (2014).</li>
<li>Cohen, S., Au, S., Panté, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microinjection+of+Xenopus+laevis+oocytes%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Microinjection of Xenopus laevis oocytes.</a> J Vis Exp. (24), (2009).</li>
<li>Willis, J., DeStephanis, D., Patel, Y., Gowda, V., Yan, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Study+of+the+DNA+damage+checkpoint+using+Xenopus+egg+extracts%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Study of the DNA damage checkpoint using Xenopus egg extracts.</a> J Vis Exp. (69), e4449(2012).</li>
<li>Keiper, B. D., Rhoads, R. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Translational+recruitment+of+Xenopus+maternal+mRNAs+in+response+to+poly%28A%29+elongation+requires+initiation+factor+eIF4G-1%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Translational recruitment of Xenopus maternal mRNAs in response to poly(A) elongation requires initiation factor eIF4G-1.</a> Dev Biol. 206 (1), 1-14 (1999).</li>
<li>Wakiyama, M., Imataka, H., Sonenberg, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interaction+of+eIF4G+with+poly%28A%29-binding+protein+stimulates+translation+and+is+critical+for+Xenopus.oocyte+maturation%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Interaction of eIF4G with poly(A)-binding protein stimulates translation and is critical for Xenopus.oocyte maturation.</a> Curr Biol. 10 (18), 1147-1150 (2000).</li>
<li>Sheets, M. D., Wu, M., Wickens, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Polyadenylation+of+c-mos+mRNA+as+a+control+point+in+Xenopus+meiotic+maturation%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Polyadenylation of c-mos mRNA as a control point in Xenopus meiotic maturation.</a> Nature. 374 (6522), 511-516 (1995).</li>
<li>Gebauer, F., Richter, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthesis+and+function+of+Mos%3A+the+control+switch+of+vertebrate+oocyte+meiosis%5BTitle%5D)+AND+%22Bioessays%22%5BJournal%5D)">Synthesis and function of Mos: the control switch of vertebrate oocyte meiosis.</a> Bioessays. 19 (1), 23-28 (1997).</li>
<li>Le Sommer, C., Lerivray, H., Lesimple, M., Hardy, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Xenopus+as+a+model+to+study+alternative+splicing+in+vivo%5BTitle%5D)+AND+%22Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">Xenopus as a model to study alternative splicing in vivo.</a> Biol Cell. 99 (1), 55-65 (2007).</li>
<li>Au, S., Cohen, S., Panté, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microinjection+of+Xenopus+laevis.oocytes+as+a+system+for+studying+nuclear+transport+of+viruses%5BTitle%5D)+AND+%22Methods%22%5BJournal%5D)">Microinjection of Xenopus laevis.oocytes as a system for studying nuclear transport of viruses.</a> Methods. 51 (1), 114-120 (2010).</li>
<li>Gotoh, T., Villa, L. M., Capelluto, D. G., Finkielstein, C. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulatory+pathways+coordinating+cell+cycle+progression+in+early+Xenopus+development%5BTitle%5D)+AND+%22Results+Probl+Cell+Differ%22%5BJournal%5D)">Regulatory pathways coordinating cell cycle progression in early Xenopus development.</a> Results Probl Cell Differ. 53, 171-199 (2011).</li>
<li>Schmidt, E. K., Clavarino, G., Ceppi, M., Pierre, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((SUnSET%2C+a+nonradioactive+method+to+monitor+protein+synthesis%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">SUnSET, a nonradioactive method to monitor protein synthesis.</a> Nat Methods. 6 (4), 275-277 (2009).</li>
<li>Moreno, J. A., Halliday, M., Molloy, C., Radford, H., Verity, N., Axten, J. M., et al. Oral treatment targeting the unfolded protein response prevents neurodegeneration and clinical disease in prion-infected mice. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMoreno%2C+JA+%22Sci+Transl+Med%22">Sci Transl Med</a>. 5 (206), 206ra138(2013).</li>
<li>Doyle, K. M., Kennedy, D., Gorman, A. M., Gupta, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Unfolded+proteins+and+endoplasmic+reticulum+stress+in+neurodegenerative+disorders%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Mol+Med%22%5BJournal%5D)">Unfolded proteins and endoplasmic reticulum stress in neurodegenerative disorders.</a> J Cell Mol Med. 15 (10), 2025-2039 (2011).</li>
<li>Gandin, V., Sikström, K., Alain, T., Morita, M., McLaughlan, S., Larsson, O., Topisirovic, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Polysome+fractionation+and+analysis+of+mammalian+translatomes+on+a+genome-wide+scale%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Polysome fractionation and analysis of mammalian translatomes on a genome-wide scale.</a> J Vis Exp. (87), e51455(2014).</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

Vertaling is een mechanisme betrokken bij de pathofysiologie van talrijke humane ziekten waaronder verscheidene neurodegeneratieve ziekten. Bijvoorbeeld in de ziekte van Parkinson verschillende rapporten stelde de bijzondere waardevermindering in de vertaling in verband met erfelijke mutaties 8,12,13. Verschillende cellulaire modellen zijn beschikbaar voor taalstudie. Hier, teneinde de translatie gevolgen van een mutatie in eIF4G1 dat als dominant negatieve mutatie verminderen van...

Eiwitten zijn essentiële onderdelen van cellulaire leven en derhalve op grotere schaal van het organisme. Zij zorgen voor de meeste cellulaire functies waaronder de structuur, transport reactie katalyse, regulering, genexpressie etc. Hun expressie is het resultaat van een complex mechanisme van translatie voor de conversie van een mRNA in eiwit. De vertaling wordt onderworpen aan diverse controles aan te passen en om genexpressie te reguleren volgens de cel nodig, tijdens de ontwikkeling en differentiatie, veroudering, fysiologische stress of pathologische verschijnselen. Vertaling is verdeeld in 3 fasen (initiatie, verlenging en beëindiging) en presenteert 3 initiatie vertaling systemen om in te spelen op deze behoeften: cap-afhankelijke, cap-onafhankelijke via interne Ribosoom Entry Segment (IRES) structuren en cap-onafhankelijke Vertaling Enhancers ( CITE). De meeste eukaryote mRNA wordt vertaald in een cap-dependent wijze via de 7-methylguanosine 5&#39;-trifosfaat cap die dient als een erkenning waarde tijdens eiwitsynthese. Deze kap eIF4E bindt aan een component van eIF4F complex met eIF4G1 en eIF4A. Geassocieerd met andere partners zoals poly (A) Binding Protein (PABP), eIF2-GTP-Met-tRNA Met deze translatie initiatie factoren laten circulariseren mRNA en verbetering van de toegankelijkheid formulieren 43S complex tot augustus initiatiecodon erkenning 1. Deze gebeurtenis geeft het einde van de translatie initiatie dwz de eerste stap van de vertaling. Cap-onafhankelijke translatie wordt door mRNA coderen voor essentiële proteïnen onder stressomstandigheden dat induceren bijvoorbeeld celproliferatie en apoptose. Het mechanisme omvat secundaire structuren in mRNA 5&#39;-onvertaalde gebied (UTR) genoemd IRES, de carboxy-eindstandige uiteinde van eIF4G1 geassocieerd met eIF4A en 43S complex. De binding van deze 43S pre-initiatie complex aan IRES initieert de dop onafhankelijke vertaling zonder de noodzaak voor eIF4E factor 2,3. Tot slot, een andere vertaling mechanisme nog niet goed begrepen ondersteunt deze cap-onafhankelijke vertaling activiteit onder benadrukt omstandigheden via CITE structuren zich binnen mRNA UTR 4. Door deze verschillende wijzen van translatie verschillen hun initiatie stappen translatie speelt een cruciale rol in de cellulaire homeostase en een verandering in één van deze processen zou dus invloed het organisme met kleine tot grote gevolgen. Inderdaad, de initiatie is een snelheidsbeperkende stap voor de juiste vertaling processen van mRNA in eiwitten en is daarmee het doelwit van tal van controles en regelgeving 5 punten. Of het aan de laatste of onderdelen van deze processen, wanneer men blijkt vertoont, zal het vastgestelde evenwicht in de cel verstoren en aldus kunnen leiden tot pathologische condigen. In deze context hebben mutaties in vertaling factoren die betrokken zijn geweest bij verschillende aandoeningen, waaronder neurodegeneratieve aandoeningen zoals `leuko-encefalopathie met vanishing white matter&#39; (eIF2B1-5 subunit) 6, in Walcott-Rallison syndroom (EIF2AK3 gen dat codeert voor PERK) 7, potentieel in ziekte van Parkinson (eIF4G1 p.R1205H) 8. Het is daarom belangrijk om cellulaire en moleculaire studies van deze mutante proteïnen voeren om onze kennis te vergroten op ontwikkeling van de ziekte en de algemene werkwijze van translatie initiatie. Om deze studies uit te voeren, is het noodzakelijk om de meest geschikte modellen kiezen om de gevolgen van deze mutaties in acht Xenopus laevis oöcyten zijn bijzonder geschikt vanwege hun fysiologische en biochemische eigenschappen. Fysiologische synchroniciteit (geblokkeerd in fase G2 van de celcyclus) , hoge capaciteit van de eiwitsynthese (200-400 ng / dag / eicel), hoog aantal gewonnen OOCYtes uit hetzelfde dier (800-1000 eicellen / vrouw) en de grootte cel (1,2-1,4 mm diameter), die hun manipulatie vergemakkelijkt. Micro-injectie van Xenopus oöcyten met gesynthetiseerde mRNA kan gemakkelijk worden uitgevoerd om vertalingsstappen ontleden. In deze visie presenteert andere voordelen. Gezien de snelheid van de meiose en progressie van de vertaling na mRNA micro-injectie (~ 24 uur), Xenopus eicel is een snel systeem in vergelijking met opgeloste cellulaire systemen (gewonnen uit E. coli, tarwekiemen of konijn reticulocyten ...) waarin een mRNA is vertaald met een verminderde vertaling tarief en op een lagere snelheid. Zo zullen de effecten van een mutatie geïntroduceerd in een mRNA snel en gemakkelijk waarneembaar bestudeerd in verschillende oöcyten. Een ander voordeel van Xenopus oöcyten is dat moeders mRNA&#39;s zijn latent en eiwit vertaling wordt geblokkeerd voordat progesteron stimulatie. Toevoeging van progesteron is dus een goede manier van reguleren van de translatie inductie. Cytoplasmatische polyadenylation niet optreden tijdens oögenese. Het begint tijdens maturatie van progesteron-gestimuleerde oöcyten in een tijdsvolgorde en blijft gedurende de vroege ontwikkeling en kan worden gebruikt om de verschillende stappen van taalstudie. De polyadenylatie van mos mRNA is een van de eerste die zich voordoen en het behoort met Aurora A / EG2, Histon-Like B4 mRNA tot de klasse van de &quot;vroege rijping&quot; genen, zoals gedefinieerd in Charlesworth et al. (2004) 9. De translationele inductie van &quot;late&quot; mRNA zoals Cycline A1 en cycline B1 optreedt ten tijde van germinal vesicle afbraak (GVBD). Mos mRNA codeert voor een serine / threonine-proteïne kinase. De vertaling is van cruciaal belang, omdat het leidt tot het MAP-kinase cascade die indirect activeert de eicel rijping. Inderdaad, in reactie op progesteron, polyadenylatie van mos mRNA versterkt via werkwijzen waarbij Aurora A / EG2 regulerende eiwitten en andere RNA-bindende eiwitten met the 3&#39;UTR van mos mRNA. Deze verhoogde polyadenylatie van mRNA mos leidt tot een toename van mos eiwitgehalte, dat op zijn beurt activeert MEK1. Dit proces medieert de activering van het extracellulaire signalen gereguleerde kinase 2 (ERK2) (Figuur 1). Deze signalerende cascade kan dan leiden tot de maturatie M-fase-bevorderende factoren, een complex gevormd door Cycline B Cdc2 kinase, en resulteert uiteindelijk in meiotische hervatting. Daarom in Xenopus laevis oocyten, kan het onderzoek van maternale mRNA zoals mos gemakkelijk worden gebruikt om de vertaalbaarheid testen met verscheidene eindpunten van de efficiënte polyadenylatie translatie van verscheidene MOS signaleringscomponenten, waaronder ook het bepalen van de GVBD rate. Dit systeem is dus interessant om de eerste gevolgen van mutaties in translatie initiatie elementen te beoordelen zonder tussenkomst van nieuw getranscribeerde mRNA of transfectie efficiëntie problemen vaak optreedt bij eukaryotic cel studies. Hier wordt een protocol opgesteld waarin eIF4G1 mutant mRNA&#39;s micro-injectie in Xenopus laevis oocyten De vertaling van maternale mRNA getest. In de aanwezigheid van een defect in GVBD progressie, MOS mRNA polyadenylatie die essentieel is voor voortgang door de oöcyt meiose celcyclus en de daaropvolgende omzetting van de vroege en late klasse mRNA wordt vastgesteld. De fosforylatie Aurora A / EG2 en ERK is eveneens bestudeerd om de gevolgen van mos deregulation.Thus bevestigen Xenopus oöcyten vormen een eenvoudige manier om verschillende stappen van mRNA translatie te analyseren.

<table><tbody><tr><td>Tricaine methane sulphonate</td><td>Sandoz</td><td>MS-222</td><td>oocytes handling</td></tr><tr><td>Forceps</td><td>Moria</td><td>Dumont MC40</td><td></td></tr><tr><td>Streptomycin/penicillin</td><td>Sigma</td><td>781</td><td></td></tr><tr><td>Sodium pyruvate</td><td>Sigma</td><td>P2256</td><td></td></tr><tr><td>Soybean trypsin inhibitor</td><td>Sigma</td><td>T9128</td><td></td></tr><tr><td>Tetracyclin</td><td>Sigma</td><td>T7660</td><td></td></tr><tr><td>Veterinarian absorbable Vicryl thread</td><td>Johnson&amp;Johson Intl</td><td>JV1205</td><td></td></tr><tr><td>Collagenase A</td><td>Roche diagnostics</td><td>10103586001</td><td></td></tr><tr><td>PmeI</td><td>New England Biolabs</td><td>R0560S</td><td>Preparation of synthetic mRNA</td></tr><tr><td>DNAse/RNAse free H2O</td><td>Life Technologies</td><td>10977</td><td></td></tr><tr><td>Sodium Acetate</td><td>Merck</td><td>6268</td><td></td></tr><tr><td>Absolute ethanol</td><td>Sigma</td><td>02854</td><td></td></tr><tr><td>Nano Drop</td><td>Thermo Scientific</td><td></td><td></td></tr><tr><td>TBE 10X</td><td>Eppendorf</td><td>0032006.507</td><td></td></tr><tr><td>Ethidium bromide 10 mg/ml</td><td>Life Technologies</td><td>15585-011</td><td></td></tr><tr><td>mMESSAGE mMACHINE Kit</td><td>Ambion by Life Technologies</td><td>AM1344</td><td></td></tr><tr><td>MOPS</td><td>Sigma</td><td>M1254</td><td></td></tr><tr><td>EDTA</td><td>Fluka</td><td>03609</td><td></td></tr><tr><td>Agarose</td><td>Life Technologies</td><td>16500-500</td><td></td></tr><tr><td>Formaldehyde 37%</td><td>Merck</td><td>1.04003.1000</td><td></td></tr><tr><td>Formamide</td><td>Fluka</td><td>47671</td><td></td></tr><tr><td>Gel Doc Imager</td><td>Biorad</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Oocyte Pipet with 100 8" Glass Capillaries</td><td>Drummond Scientific Company</td><td>3-000-510-X</td><td>microinjection</td></tr><tr><td>Replacement Glass 8"</td><td>Drummond Scientific Company</td><td>3-000-210-G8</td><td></td></tr><tr><td>0.45 &micro;m filter</td><td>Millipore</td><td>SLHA025NB</td><td></td></tr><tr><td>Progesterone</td><td>Sigma</td><td>P0130</td><td></td></tr><tr><td>Hepes</td><td>Sigma</td><td>H3375</td><td>Western Blot</td></tr><tr><td>NaCl</td><td>Sigma</td><td>S5886</td><td></td></tr><tr><td>SDS</td><td>Biorad</td><td>161-0301</td><td></td></tr><tr><td>MgCl2</td><td>Sigma</td><td>A3294</td><td></td></tr><tr><td>Bovine serum albumin</td><td>Sigma</td><td>A4612</td><td></td></tr><tr><td>leupeptin</td><td>Sigma</td><td>L8511</td><td></td></tr><tr><td>aprotinin</td><td>Sigma</td><td>A1153</td><td></td></tr><tr><td>benzamidine</td><td>Sigma</td><td>B6506</td><td></td></tr><tr><td>PMSF</td><td>Sigma</td><td>P7626</td><td></td></tr><tr><td>sodium vanadate</td><td>Sigma</td><td>S6508</td><td></td></tr><tr><td>Laemmli buffer</td><td>Biorad</td><td>161-0737</td><td></td></tr><tr><td>NuPAGE Novex 4-12% Bis-Tris Protein Gels, 1.0 mm, 15 well</td><td>Life Technologies</td><td>NP0323BOX</td><td></td></tr><tr><td>SDS-PAGE electrophoresis, mini-Protean TGX</td><td>Biorad</td><td>456-1036 and -1096</td><td></td></tr><tr><td>horizontal semi-dry blotting system</td><td>W.E.P. Compagny</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Glycine</td><td>Biorad</td><td>161-0718</td><td></td></tr><tr><td>Tris-HCl</td><td>Biorad</td><td>161-0719</td><td></td></tr><tr><td>Hybond ECL Membrane</td><td>Amersham Life Science</td><td>10401180</td><td></td></tr><tr><td>Methanol</td><td>VWR</td><td>20846-292</td><td></td></tr><tr><td>Ponceau Red (0.5%)</td><td>Sigma</td><td>P3504</td><td></td></tr><tr><td>Tween 20</td><td>Sigma</td><td>P2287</td><td></td></tr><tr><td>anti-GFP</td><td>Life Technologies</td><td>A11122</td><td></td></tr><tr><td>anti-V5</td><td>Santa Cruz Biotechnology</td><td>sc-58052</td><td></td></tr><tr><td>anti-Eg2</td><td>Santa Cruz Biotechnology</td><td>sc-27884</td><td></td></tr><tr><td>anti-Eg2-P</td><td>Cell Signaling</td><td>C39D8</td><td></td></tr><tr><td>anti-ERK2</td><td>Santa Cruz Biotechnology</td><td>sc-1647</td><td></td></tr><tr><td>anti-ERK2-P (Tyr204)</td><td>Santa Cruz Biotechnology</td><td>sc-7976</td><td></td></tr><tr><td>anti-Rsk</td><td>Santa Cruz Biotechnology</td><td>sc-231</td><td></td></tr><tr><td>anti-mos</td><td>Santa Cruz Biotechnology</td><td>sc-86</td><td></td></tr><tr><td>anti-mouse horseradish peroxidase labeled secondary antibody</td><td>Santa Cruz Biotechnology</td><td>sc-2005</td><td></td></tr><tr><td>anti-rabbit horseradish peroxidase labeled secondary antibody</td><td>Santa Cruz Biotechnology</td><td>sc-2812</td><td></td></tr><tr><td>anti-goat horseradish peroxidase labeled secondary antibody</td><td>Santa Cruz Biotechnology</td><td>sc-2378</td><td></td></tr><tr><td>Advanced ECL Detection System</td><td>Amershan Life Science</td><td>RPN2135</td><td></td></tr><tr><td>PBS 1x</td><td>Sigma</td><td>P4417</td><td>polyadenylation assay</td></tr><tr><td>TRIZOL (Qiazol Lysis Reagent)</td><td>Qiagen</td><td>79306</td><td></td></tr><tr><td>Chloroform</td><td>Sigma</td><td>31998-8</td><td></td></tr><tr><td>Isopropanol</td><td>Sigma</td><td>278475-1L</td><td></td></tr><tr><td>RNeasy mini kit</td><td>Qiagen</td><td>74106</td><td></td></tr><tr><td>RTL buffer&nbsp;</td><td>Qiagen</td><td>79216</td><td></td></tr><tr><td>RNAse free DNAse set</td><td>Qiagen</td><td>79254</td><td></td></tr><tr><td>Primers</td><td>Eurogentec</td><td></td><td></td></tr><tr><td>T4 RNA ligase 1&nbsp;</td><td>New England Biolabs</td><td>M0204S</td><td></td></tr><tr><td>High capacity c-DNA Reverse Transcription kit</td><td>Applied Biosystems, Life Technologies</td><td>4368813</td><td></td></tr><tr><td>Taq polymerase</td><td>Life Technologies</td><td>10342020</td><td></td></tr></tbody></table>

xenopus laevis als een model te identificeren vertaling impairment

Xenopus laevis as a Model to Identify Translation Impairment

Eiwitsynthese is een fundamenteel proces om genexpressie beïnvloeden diverse biologische processen name aanpassing aan de omgevingsomstandigheden. De initiatiestap, waarbij het samenstel van de ribosomale subeenheden van het mRNA initiatiecodon, betrokken initiatiefactor inclusief eIF4G1 gaat. Defecten in deze snelheidsbeperkende stap van de vertaling zijn gekoppeld aan diverse stoornissen. Om de mogelijke gevolgen van een dergelijke deregulering studeren, Xenopus laevis oöcyten vormen een aantrekkelijk model met een hoge mate van bescherming van de essentiële cellulaire en moleculaire mechanismen met menselijke. Bovendien, tijdens de meiose rijping, eicellen worden transcriptioneel onderdrukt en alle benodigde eiwitten worden vertaald uit het reeds bestaande, maternale mRNA&#39;s. Deze goedkope model stelt exogeen mRNA perfect geïntegreerd met een effectieve vertaling geworden. Hier wordt beschreven een protocol voor de beoordeling van vertalingen met een factor van belang (hier eIF4G1) met behulp van stored maternale mRNA die het eerst worden gepolyadenyleerde en omgezet in eicelrijping als fysiologische uitlezing. Aanvankelijk mRNA gesynthetiseerd door in vitro transcriptie van plasmiden van belang (hier eIF4G1) geïnjecteerd in oöcyten en kinetiek van eicelrijping door kiemblaasje Breakdown detectie bepaald. De bestudeerde maternale mRNA doel de serine / threonine-proteïne-kinase mos. De polyadenylatie en de latere vertalingen worden onderzocht samen met de expressie en fosforylering van eiwitten van de mos signaleringscascade betrokken bij eicelrijping. Variaties van het huidige protocol naar voren translationeel defecten worden ook voorgesteld om de algemene toepasbaarheid benadrukken zetten. Gezien wordend bewijs dat afwijkende eiwitsynthese betrokken kan zijn bij de pathogenese van neurologische aandoeningen, zoals een model biedt de mogelijkheid om deze uitholling gemakkelijk evalueren en nieuwe targets.

Kinetische rijping van Xenopus oöcyten en de bepaling van het percentage eicel GVBD na 24 uur van de PG stimulatie (Figuren 2B, 2C): Om de gevolgen van het translationele eIF4G1-DN mutatie studie, de reactie op PG in Xenopus laevis oocyten micro-geïnjecteerd met cRNA eIF4G1-DN vergeleken met eIF4G1-WT en andere controle omstandigheden (H 2 O, GFP). De controles mogelijk om de incidentie van oöcyt micro-injectie beoordelen ongeacht de aar...

Controle van eiwitsynthese vindt voornamelijk plaats tijdens de initiatiefase van translatie, waarvan tekortkomingen zijn gekoppeld aan verschillende aandoeningen. Om de etiologie beter te begrijpen, beschreven we hier een protocol met Xenopus laevis eicellen dat de translatie van het mos-transcript beoordeelt in aanwezigheid van een mutant van translatie-initiatiefactor eIF4G1.

Xenopus laevis als een model te identificeren Vertaling Impairment

Protein synthesis is a fundamental process to gene expression impacting diverse biological processes notably adaptation to environmental conditions. The ...

Het algemene doel van deze procedure is om de eerste gevolgen van mutaties in translatie-initiatiefactoren te evalueren zonder interferentie van nieuw getranscribeerd mRNA of problemen met de transfectie-efficiëntie die vaak voorkomen bij studies met eukaryote cellen. Dit wordt bereikt door eerst mutant wild-type en controle- mRNA, of GFP-mRNA te synthetiseren vanuit de overeenkomstige plasmiden. Vervolgens wordt het gesynthetiseerde RNA gemicro-injecteerd in XUS Lavis-cyten in stadium zes, waarna hun rijping wordt gestimuleerd met progesteron.Vervolgens wordt de rijping van de cyten geëvalueerd door visualisatie van de afbraak van het kiemblaasje en worden enkele componenten van de MA-kinasekcascade, waarvan de activatie afhankelijk is van de expressie van mos-eiwit, geanalyseerd via western blot. Ten slotte wordt de mRNA-polyadenylering van mos en andere mRNA's die noodzakelijk zijn voor het herstel van de meiose in XPO-cyten bestudeerd. Uiteindelijk wordt de kinetiek van de cytenrijping bepaald.Western blot- en polyadenylatie-analyses worden gebruikt om een potentiële impact op de eiwitexpressie aan te tonen wanneer een translatie-initiatiefactor is gemuteerd. Het belangrijkste voordeel van deze techniek ten opzichte van onze bestaande methoden of gereconstitueerde cellulaire systemen, geëxtraheerd uit respectievelijk kiemen of konijnenreticulocyten, is dat de effecten van een mutatie geïntroduceerd in een mRNA snel waarneembaar zullen zijn en eenvoudig bestudeerd kunnen worden in verschillende celtypen in het algemeen.Dit model heeft de voordelen van eenvoud vanwege de enkele gigantische cellen, en het gebruik ervan levert een aanzienlijke hoeveelheid materiaal op voor biochemische experimenten. Dit proces is bovendien tijdsefficiënter in vergelijking met het genereren van stabiele cellijnen. Dit miso kan helpen bij het beantwoorden van kernvragen in translationele studies, zoals het beter begrijpen van de rol van specifieke domeinen van ation-factoren of het bestuderen van de splicing van deze factoren.We hebben dit idee voor deze methode oorspronkelijk ontwikkeld toen we de impact van een gemuteerde translatie-initiatiefactor op de eiwitsynthese wilden bestuderen zonder interferentie van transcriptie. Op deze manier vermijden we potentiële feedbackloops tussen deze twee om-mechanismen. Inderdaad worden transcripten van het materiaal opgeslagen en geplaatst.Translatie kan worden geïnduceerd met progesteron. Na het defeceren, het wassen van de cytocyten en het voorbereiden van CRN volgens het tekstprotocol, gebruik 10 x mops en 6,6% formaldehyde om een 1,5% AROS-gel te gieten. Bereid monsters voor in een 0,2 milliliter buisje met 8,8% formaldehyde, 60% voor AMIDE, 0,1 volumes 10 x mops en één microliter CRNA; incubeer bij 70 °C gedurende drie minuten en zet de buisjes 10 minuten op ijs. Centrifugeer de monsters bij 5.000 ×g gedurende enkele seconden voordat twee microliters gel-laadbuffer worden toegevoegd.Voer de monsters 20 minuten lang uit bij 90 volt om de gel te kleuren. Week de gel gedurende de nacht in nucleasevrij water. Analyseer deze vervolgens om de kwaliteit van het CNA te controleren.Gebruik een spectrofotometer om de CNA-concentratie te bepalen en bewaar de monsters bij min 80 graden Celsius om micro-injectie van RNA uit te voeren. Gebruik ND 96-medium om een bekrast Petrischaaltje één tot twee uur na defoliatie te vullen. Plaats de cytes langs een bekraste baan in het schaaltje.Gebruik vervolgens een capillaire micropipet met een afgebroken tip die onder een hoek van 45 graden is geplaatst. Steek de capillaire tip ongeveer 150 tot 200 microns diep in de equatoriale zone onder het gepigmenteerde dierlijke gebied. Injecteer 30 nanogram CRNA in 60 nanoliters in de eerste oocyclus.Wacht vervolgens vijf tot 10 seconden voordat u de capillaire tip verwijdert om te voorkomen dat het monster uitlekt. Verplaats het schaaltje handmatig om de volgende cyt te injecteren. Breng de geïnjecteerde cytes over naar 24-wells cultuurplaten gevuld met drie milliliters ND 96-medium en laat deze bij 19 °C om de mitotische rijping te triggeren.Incubeer de oocyten in ND 96 met twee µg/mL progesteron of PG bij 19 °C gedurende 15 uur. Test het translationele effect van wild-type EIF 4G one CRNAs op het mutante fenotype volgens het tekstprotocol. Bepaal de mate van breakdown van het kiemblaasje onder een stereomicroscoop.Tel het aantal rijpe cytes na PG-stimulatie aan de hand van een wit vlekje bij de zwarte dierpool. Herhaal het tellen elk uur tot het 24e uur om een western-bloedanalyse uit te voeren. Gebruik de heen-en-weergaande bewegingen van een micropipetpunt bij vier graden Celsius om 10 cytes te homogeniseren in 200 microliters van de hier getoonde buffer.Centrifugeer de monsters bij 10 000 ×g gedurende 15 minuten om de cytoplasmatische fractie in het midden te extraheren. De bovenste fractie komt overeen met lipiden en de onderste met celresidu. Verzamel de cytoplasmatische fractie en bewaar een aliquot om de eiwitconcentratie te bepalen.Combineer de overgebleven monsters in een één-op-één verhouding met laemly- of Biss-monsterbuffer voordat u SDS-PAGE en western blotting uitvoert, volgens het tekstprotocol. Om een poly-ventilatie-assay uit te voeren, plaatst u vijf cellen per conditie in 1,5 milliliter microcentrifugebuisjes met één milliliter nucleasevrij 1X PBS en was de cellen.Gebruik vervolgens onder de zuurkast een RNA-extractiekit volgens de instructies van de fabrikant om het RNA te isoleren. Na het controleren van de integriteit van het RNA en het bepalen van de concentratie, worden per CRNA-conditie twee ligatiemengsels voorbereid met de volgende reagentia in het eerste mengsel. Voeg RNA toe van cytes die niet met pg zijn gestimuleerd aan het tweede mengsel.Voeg RNA van PG-gestimuleerde oocyten toe. Incubeer gedurende één uur bij 37 °C en vervolgens 20 minuten bij 65 °C om het enzym te inactiveren met behulp van een cDNA-omgekeerde transcriptiekit.Bereid voor elk monster het hier vermelde RT-mengsel voor. Voeg 10 µL van de eerder bereide ligatiereactie toe en voer de RT uit volgens de instructies van de fabrikant. Voer vervolgens een PCR uit met het volgende reactiemengsel en de volgende condities. Voeg aan elke reactie vier µL laadbuffer toe en breng 10 µL van elk monster aan op een 3% agarosegel bij 110 V. Analyseer de gel ten slotte na 10 en 20 minuten om een verandering in grootte waar te nemen die de lengte van de polyA-staart en daarmee de RNA-rijping weerspiegelt, wat een voorwaarde is voor hun translatie.Zoals hier wordt getoond, is de kinetische rijping van oocyten die onder controlecondities zijn gemicro-injecteerd vergelijkbaar met het wildtype, met soortgelijke aantallen die GVBD ondergaan op 12 en 24 uur na PG-stimulatie, 24 uur na PG-stimulatie. Het percentage oocyten dat rijping bereikt is vergelijkbaar voor het wildtype als voor de met water en GFP geïnjecteerde controles, wat aangeeft dat micro-injectie met water, controle of EIF 4G one CRNA's weinig effect had op de oocyt-meiose. Micro-injectie met de dominant-negatieve EIF 4G one resulteerde echter in een dramatische afname van GVBD, zelfs na PG-stimulatie. Deze figuur laat zien dat het rijpingsdefect kan worden hersteld door de wildtype CRNA naarmate de ratio van wildtype ten opzichte van dominant-negatieve EIF 4G one CRNA toeneemt.Zo ook het percentage cellen dat de verwachte rijping ondergaat. Er wordt geen endogene moss-expressie gedetecteerd in afwezigheid van PG-stimulatie, en overexpressie van EIF 4G one dominant negatief heeft weinig invloed op endogeen moss, wat in overeenstemming is met eerdere resultaten. Daarnaast vertoont Aurora AEEG twee, dat stroomopwaarts van de moss-inductie werkt, geen bewijs van eiwitderegulatie of van de gefosforyleerde vorm die na PG-stimulatie wordt geïnduceerd.Omgekeerd wordt de fosforylering van irk twee, die door moss wordt geïnduceerd, geremd in de aanwezigheid van het dominant-negatieve EIF 4G één. Eenmaal beheerst, kan deze techniek in vijf dagen worden voltooid indien deze correct wordt uitgevoerd. Tijdens het uitvoeren van deze procedure is het belangrijk om erop te letten dat er niet meer dan 120 nanoliters CNA met een concentratie onder bepaalde nanogrammen wordt gebruikt na deze procedure.Hoewel methoden zoals polysoomprofielanalyse kunnen worden uitgevoerd om aanvullende vragen te beantwoorden, zoals het bepalen welke RNA's mogelijk slecht of juist sterk vertaald worden.

xenopus-laevis-as-a-model-to-identify-translation-impairment

Research

JoVE Journal

Biology

Biologie

Xenopus embryonale epitheel is een ideaal modelsysteem om cel gedrag, zoals polariteit ontwikkeling en vorm veranderen tijdens epitheliale morfogenese bestuderen. Traditionele histologie van vaste monsters wordt in toenemende mate aangevuld door live-cell imaging confocale. Hier laten we zien methoden om de kikker weefsel te isoleren en te visualiseren live-epitheliale cellen en hun cytoskelet met behulp van live-cell confocale microscopie.

Live-cell imaging en kwantitatieve analyse van de embryonale epitheelcellen in Xenopus laevis</em

Hier presenteren we een systematische aanpak voor het ontwikkelen van fysiologisch relevante, gevoelige en...

In vivo modellering van de Morbid Human Genome behulp Danio rerio

Productie van<em&gt; Xenopus tropicalis</em&gt; Egg Extracten aan microtubuli-geassocieerde RNA&#39;s identificeren

Dit artikel een gemakkelijke en snelle werkwijze voor het visualiseren van verschillende neuronale celpopulaties in het centrale zenuwstelsel van embryonale ontwikkeling middels immunofluorescentiekleuring op de afdelingen.

Het beoordelen van Primary neurogenese in<em&gt; Xenopus</em&gt; Embryo&#39;s met behulp van Immunokleuring

Dit manuscript beschrijft een methode om te visualiseren en te kwantificeren van gelokaliseerde vertaling gebeurtenissen in subcellular compartimenten. De in dit manuscript voorgestelde benadering is vereist van een basissysteem voor confocal beeldvorming en reagentia en snelle en kostenefficiënte.

Kwantitatieve immunofluorescentie te meten Global gelokaliseerd vertaling

Xenopus kikkervisjes bieden een uniek platform voor het onderzoek naar de functie van het zenuwstelsel in vivo. We beschrijven methodologieën voor evaluatie van de verwerking van olfactorische informatie in levende Xenopus larven bij fokken normaal of na blessure.

Functionele evaluatie van olfactorische trajecten in levende Xenopus kikkervisjes

In dit artikel presenteren we twee complementaire methoden voor het meten van specifieke tarieven van translationele fout en verkeerde vertaling in het model Mycobacterium, Mycobacterium smegmatis, met behulp van gain-of-functie reporter systemen. De methoden kunnen worden gebruikt om nauwkeurige foutenpercentages in lage doorvoer of relatieve foutenpercentages in een meer high-throughput instelling te meten.

Meting van specifieke mycobacteriële verkeerde vertaaltarieven met winst-van-functie reporter systemen

Dit protocol is bedoeld om te laten zien hoe een DNA/DOTAP mengsel microinjecteert in de eyebuds van een dag oude Xenopus laevis embryo's, en hoe te beeld en reconstrueren individuele groene fluorescerende eiwitten (GFP) uitdrukken optische axonale Arbors in tectal midbrains van intact, levende Xenopus tadpoles.

Micro injectie van DNA in de Oogtoppen van Xenopus laevis embryo's en beeldvorming van GFP dat optische axonale Arbors uitdrukt in intact, levend Xenopus tadpoles

Dit protocol beschrijft een reportertest om de regulatie van mRNA-vertaling in enkelvoudige oöcyten tijdens in vitro rijping te bestuderen.

Het programma van maternale mRNA-vertaling definiëren tijdens in vitro rijping met behulp van een enkele oöcytreportertest

De ontwikkeling van het zoogdierbrein vereist een goede controle van genexpressie op het niveau van vertaling. Hier beschrijven we een polysoomprofileringssysteem met een eenvoudig te assembleren sucrose gradiëntvormings- en fractioneringsplatform om de translationele status van mRNAs in de zich ontwikkelende hersenen te beoordelen.

Analyse van vertaling in de zich ontwikkelende muishersenen met behulp van polysoomprofilering

Hier wordt een effectief protocol voor snelle bloedperfusie gepresenteerd om weefselmonsters van Afrikaanse klauwkikkers voor te bereiden voor transcriptomics- en proteomics-studies.

Effectieve snelle bloedperfusie bij xenopus

Leer een protocol om mutaties in translatie-initiatiefactoren te evalueren met Xenopus laevis oocyten. Deze methode analyseert de vertaling van het mos-transcript om eiwit-synthesestoornissen te begrijpen.

Xenopus laevis als een model te identificeren Vertaling Impairment

Meer video's verkennen