Name: Bouw en Systematische Symmetric Studies van een serie van Supramoleculaire Clusters met binaire of ternaire ammonium Triphenylacetates (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-02-15T13:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 35 s
Description: Ontdek de constructie van waterstofbrug-supramoleculaire clusters met primaire ammoniumtriphenylacetaat. Deze methode maakt systematische symmetriestudies mogelijk om supramoleculaire structuren te voorspellen.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Dit werk werd financieel ondersteund door Grant-in-Aid voor Wetenschappelijk Onderzoek B (24350072, 25288036) en Grant-in-Aid voor Wetenschappelijk Onderzoek op Innovatieve Gebieden (24108723) van MEXT en JSPS, Japan. T.S. erkent Grant-in-Aid voor JSPS Fellows (25763), het GCOE-programma van de Universiteit van Osaka en subsidies voor Excellente Graduate Schools, MEXT, Japan.

1. Voorbereiding van de Single Crystals Samengesteld uit Primary Ammonium Triphenylacetates <ol><li> Bereid organische zouten, primaire ammonium triphenylacetates (figuur 1a). <ol><li> Ontbinden trifenylazijnzuur zuur (TPAA, 0,10 g, 0,35 mmol) en primaire amine:-n-butylamine (n Bu, 2,5 x 10 -2 g, 0,35 mmol), isobutylamine (isoBu, 2,5 x 10 -2 g, 0,35 mmol), t butylamine (tBu, 2,5 x 10 -2 g, 0,35 mmol), of t -amylamine (t Am, 3,0 x 10 -2 g, 0,35 mmol), samen in methanol (20 ml) in TPAA: amine = 1: 1 molaire verhouding voor bereiding van binaire organische zouten. </li><li> Bij ternaire organische zouten lossen TPAA (0,10 g, 0,35 mmol) en twee soorten primaire aminen: n Bu (1,3 x 10 -2 g, 0,17 mmol) - tBu (1,3 x 10 -2 g, 0,17 mmol ), n Bu (1,3 x 10 -2 g, 0,17 mmol) - t Am (1,5 x 10 -2 g, 0,17 mmol), isoBu (1,3 x 10 -2 g, 0,17 mmol) - t bu (1,3 x 10 -2 g, 0,17 mmol), of isoBu (1,3 x 10 -2 g, 0,17 mmol) - t Am (1,5 x 10 -2 g , 0,17 mmol), samen in methanol (20 ml) in TPAA: amine-1: amine-2 = 2: 1: 1. </li><li> Damp alle oplossingen door roterende verdampers (40 ° C, 200 Torr), bieden organische zouten: TPAA- n Bu, TPAA-isoBu, TPAA- t Bu, TPAA- t Am, TPAA- n Bu- t Bu, TPAA- n Bu- t Am, TPAA-isoBu- t Bu en TPAA-isoBu- t Am. </li></ol></li><li> Bereid eenkristallen uit supramoleculaire clusters. <ol><li> Ontbinden elke organische zouten (5,0 mg) in een glazen flacon in tolueen (0,30 ml) als een niet-polair oplosmiddel goed, die werd geselecteerd omdat het supramoleculaire clusters voorkeur geconstrueerd apolaire omgeving. Voor de organische zouten TPAA- t Bu, TPAA- t Am, TPAA-isoBu- t Bu en TPAA-isoBu- t Am, warmte tolueen up to 40 ° C te ontbinden. </li><li> Voeg hexaan: 0,5 ml, 0,5 ml, 0,5 ml, 2 ml, 2 ml, 1 ml, en 0,5 ml, aan de oplossing van de organische zouten van TPAA- n Bu, TPAA-isoBu, TPAA- t Am, TPAA- n Bu- tBu, Bu TPAA- n - t Am, TPAA-isoBu- tBu en TPAA-isoBu- t Am respectievelijk een slecht oplosmiddel om de oplosbaarheid van het organische zout verlagen behalve de oplossing van het organische zout TPAA- tBu. </li><li> Bewaar de oplossing bij kamertemperatuur stabiel in het glazen flesje, bieden eenkristallen binnen een dag. </li></ol></li><li> Bevestig de vorming organisch zout door Fourier transform infrarood (FT-IR) spectra 35,36. <ol><li> Meng de eenkristallen van het organische zout met kaliumbromide (KBr) in 1: 100 gewichtsverhouding. </li><li> Maal het mengsel door een agaatvijzel totdat het homogeen mengsel in poedervorm. </li><li> Vul een ronde matrijs (diameter: 5 mm) met het poedermengsel en een pellet door pRessing het met een pellet pers. </li><li> Doe de pellet in een FT-IR spectrometer, en metingen uit te voeren (cumulatieve aantal: 16, resolutie: 1 cm -1). </li></ol></li></ol> 2. Kristallografische Studies <ol><li> Pick-up een hoge kwaliteit single crystal van het organisch zout TPAA- t Am van het glazen flesje in paraffine op een glasplaat. Het kristal uniform kijkt onder een stereomicroscoop, waardoor het kristal niet samenstellen van meerdere kristallen maar een monokristal en een kristalgrootte ongeveer 0,3 tot 1 mm zonder scheuren. </li><li> Zet de single crystal op een lus. </li><li> Stel de lus met de eenkristal in eenkristal röntgendiffractie-apparatuur. </li><li> Selecteer een collimator: 0,3, 0,5, 0,8 of 1 mm, afhankelijk van de maximale grootte van de eenkristal. </li><li> Start een voorbereidende meting van eenkristal röntgendiffractie X-ray diffractiepatronen 37,38 ophalen bij het ​​monokristal via het uniforme crystal röntgendiffractie-apparatuur (stralingsbron grafiet monochromated Cu K α (λ = 1,54187 A), blootstellingstijd: 30 sec (bepalen op basis van de kristalgrootte), detector: bijv beeldplaat, kristal naar detectorafstand: 127,40 mm, temperatuur: 213,1 K, aantal frames: 3). </li><li> Bepaal mogelijke kristal parameters en voorwaarden: belichtingstijd, hoeken van blootstelling aan X-ray: ω, χ, en φ, en het aantal frames, voor het volgen van de meting op basis van het resultaat van de bovengenoemde voorbereidende meting. </li><li> Start een regelmatige meting van eenkristal röntgendiffractie X-ray diffractiepatronen 37,38 verzamelen van eenkristallen met de eenkristal röntgendiffractie-apparatuur onder de voorwaarden (stralingsbron grafiet monochromated Cu K α (λ = 1,54187 Å), detector: bv beeldvorming plaat, kristal-to-detector distkomstig: 127,40 mm, temperatuur: 213,1 K). </li><li> Oplossen van een kristalstructuur van de diffractiepatronen van directe methoden, SIR2004 39 of SHELXS97 40 en verfijnen door een volledige matrix kleinste kwadraten procedure met gebruikmaking van alle waargenomen reflecties basis van F2. Verfijnen alle niet-waterstofatomen met anisotrope verplaatsing parameters en plaats de waterstofatomen in posities geïdealiseerde isotrope verplaatsing parameters ten opzichte van de verbinding niet-waterstofatomen en geraffineerd. Het uitvoeren van deze berekeningen met behulp van een software zoals de CrystalStructure 41. </li><li> Herhaal de procedures van stappen 2,1-2,8 met enkele wijzigingen van de voorwaarden: collimator grootte, belichtingstijd van X-ray voor voorbereidende metingen en regelmatige metingen, en de hoeken van blootstelling aan X-ray: ω, χ, en φ, en het aantal frames , voor de enkele kristallen van organische zouten: TPAA- n Bu- t Bu, TPAA- n Bu- &lt;em&gt; t Am, TPAA-isoBu- t Bu en TPAA-isoBu- t Am hun kristalstructuren te onthullen. </li><li> Ophalen kristalstructuren van de organische zouten: TPAA- n Bu (refcode: MIBTOH) 22, TPAA-isoBu (refcode: GIVFEX) 24, en TPAA- t Bu (refcode: GIVFIB) 23, uit Cambridge Structural Database 42 behulp van een software, Conquest 43, of een aanvraagformulier 44. </li><li> Onderzoek naar de supramoleculaire clusters in de kristalstructuren van computer graphics met behulp van software zoals Mercury 45-48 en PyMOL 49; Bepaal puntgroep symmetrieën van waterstofbinding patronen in de supramoleculaire clusters door vergelijking van de patronen verkregen met de eerder ingedeelde (figuur 1b) en chirale conformaties van de tritylgroepen zoals Λ of Δ (figuur 1a). </li><li> Karakteriseer polyhedral kenmerken van de supramoleculaire clusters in elk van de kristalstructurende organische zouten. <ol><li> Verwijder alle atomen in de supramoleculaire clusters behalve koolstof- en stikstofatomen van de component carboxylaat anionen en ammoniumkationen. </li><li> Maak bindingen tussen koolstof- en stikstofatomen originele carboxylaat en ammoniumkationen zijn verbonden door waterstofbindingen. </li><li> Meten van afstanden tussen koolstof-koolstof- en stikstof-stikstofatomen en grenzen om verdere banden (5,3 en 4,1 A van koolstof-koolstof- en stikstof-stikstof afstanden respectievelijk in deze studie). </li><li> Verdere verbindingen tussen koolstof-koolstof- en stikstof-stikstofatomen afstanden minder dan 5,4 en 4,2 A respectievelijk. </li><li> Bepaal de resulterende veelvlakken van de organische zouten: TPAA-isoBu, TPAA- t Bu, TPAA- t Am, TPAA-isoBu- t Bu en TPAA-isoBu- t Am, zoals trans -bicapped octaëder (t bo), driehoekige dodecaëder (td), td, td, en td respectievelijk door considering rotatieas (C 3 of C 2) en het aantal zijden van de veelvlakken. </li><li> Maak extra obligaties aan de resulterende veelvlakken van de organische zouten: TPAA- n Bu, TPAA- n Bu- t Bu en TPAA- n Bu- t Am, door te kijken naar het aantal zijden, symmetrie elementen en intermoleculaire interacties in de supramoleculaire clusters omdat ze minder kanten dan ideaal degenen: td, t bo, en vierkante antiprisma (sa). </li><li> Bepaal het veelvlak van de TPAA- n Bu zout zoals sa door het maken van twee naast obligaties als gevolg van de C2-symmetrie en 14 originele obligaties. Bepaal de andere veelvlakken van de organische zouten TPAA- n Bu- t Bu en TPAA- n Bu- t Am als td op basis van hun C2 symmetrie en &quot;banden&quot; van de trityl groepen over de supramoleculaire cluster. Namelijk de tritylgroepen in de supramoleculaire clusters van het ternaire organische zouten4; bands &quot;door elkaar grijpende hun drie fenylringen en het veelvlak td heeft kanten aansluiten vier zuren (figuur 1c (ii)), wat betekent dat ze hebben dezelfde structurele kenmerken. </li></ol></li></ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

Een aantal supramoleculaire clusters met gesloten waterstofbruggen netwerken werd succesvol geconstrueerd en gekarakteriseerd uit oogpunt van chiraliteit en polyhedral functiemenu met organische zouten van TPAA, waarbij een tritylgroep is, en verschillende soorten en combinaties van primaire aminen. In deze werkwijze is de kritische stappen invoering van een molecuul met een volumineuze tritylgroep en herkristallisatie van organische zouten uit het molecuul en tegenionen van niet-polaire oplosmiddelen. Dit komt omdat de...

Supramoleculen zijn fascinerend en belangrijk onderzoek doelstellingen vanwege hun unieke functies, zoals de bouw van supramoleculaire architecturen, het aftasten van ionen en / of moleculen en chirale scheidingen, afkomstig van hun moleculaire herkenning vaardigheden met behulp van flexibele niet-covalente bindingen 1-11. In erkenningen moleculaire symmetrie van supramoleculaire assemblages is een van de belangrijkste factoren. Ondanks het belang is het nog steeds moeilijk om supramoleculen ontwerpen met de gewenste symmetrie door flexibiliteit in aantallen en soorten componenten en hoeken en afstanden van niet-covalente bindingen. Verduidelijking van de correlaties tussen de symmetrieën van supramoleculen en hun componenten op basis van systematische studies is handig strategie om de bouw van de gewenste supramoleculen bereiken. Hiertoe werden supramoleculaire clusters geselecteerd als onderzoekdoelen omdat zij bestaan ​​beperkt aantal onderdelen eend zijn evalueerbare theoretisch 12-14. Anders dan metaalcomplexen, zijn er een beperkt aantal rapporten construeren supramoleculaire clusters vanwege de lage stabiliteit van niet-covalente bindingen voor het behoud van de supramoleculaire structuren 15,16. Deze lage stabiliteit wordt ook een probleem bij het verkrijgen van een reeks van supramoleculaire assemblages die dezelfde soort structuren. In deze studie, lading geassisteerde waterstofbindingen organische zouten, waarvan een van de meest robuuste niet-covalente bindingen 17-20 zijn voornamelijk gebruikt voor specifieke supramoleculaire assemblages voorkeur 21-32 construeren. Het is ook opmerkelijk dat organische zouten bestaan ​​uit zuren en basen, en dus verschillende soorten organische zouten worden gemakkelijk verkregen door gewoon mengen van verschillende combinaties van zuren en basen. Vooral organische zouten zijn nuttig voor systematisch onderzoek vanwege combinaties van een specifieke component met verschillende soorten tegenionen leiden tot dezelfde soort supramolecular assemblages. Daarom is het mogelijk om structurele verschillen van supramoleculaire assemblages basis van soorten tegenionen vergelijken. In vroegere werken supramoleculen met 0-dimensionale (0-D), 1-dimensionale (1-D) en 2-dimensionale (2-D) waterstofbinding netwerken primaire ammonium carboxylaten werden bevestigd en gekarakteriseerd uit een oogpunt van chiraliteit 32. Deze multi-dimensionale supramoleculen zijn belangrijk onderzoek doelen in hiërarchische Crystal Design 27 evenals toepassingen te profiteren van hun dimensionaliteit. Bovendien zou de karakterisering van waterstofbruggen netwerken belangrijke kennis over rollen van biologische moleculen omdat alle aminozuren die zijn ammonium en carboxylgroepen. Het verstrekken van richtlijnen om deze supramoleculen verkrijgen afzonderlijk geeft hen meer mogelijkheden in toepassingen. In deze supramoleculen, constructie van supramoleculaire clusters met 0-D waterstofbruggen netwerken relatively moeilijk als aangetoond in statistisch onderzoek 28. Echter, na klaring van de bij het ​​construeren van de supramoleculaire clusters zij selectief aangelegd, en een reeks van de supramoleculaire clusters verkregen 21-25,32. Deze werken maken het mogelijk om systematisch symmetrische studie te verrichten naar de supramoleculaire clusters om component-afhankelijke symmetrische kenmerken van de supramoleculaire clusters te verduidelijken. Daartoe de supramoleculaire clusters primaire ammonium triphenylacetates hebben interessante eigenschappen, dat wil zeggen, hun topologische variëteit waterstofbinding netwerken 24,32, die hun symmetrische functies en chirale conformaties van de component tritylgroepen (figuur 1a doet uitkomen en 1b). Hier methodologieën voor de bouw van een reeks van supramoleculaire clusters gebruik van primaire ammonium triphenylacetates en voor het karakteriseren van symmetrische kenmerken van de supramoleculaire clusters zijn demoneningedikt. Sleutels voor de bouw van de supramoleculaire clusters invoering van volumineuze tritylgroepen en herkristallisatie van het organische zouten van niet-polaire oplosmiddelen. Binaire en ternaire ammonium primaire triphenylacetates werden voor de constructie van de supramoleculaire clusters. Kristallografische studies uit oogpunt van topologieën van de waterstof-bonding netwerken 24,32, topografieën (conformaties) van tritylgroepen 33,34, en moleculaire regelingen analogen van octacoordinated veelvlakken 12 (figuur 1c) onthulde component-afhankelijke symmetrische kenmerken van de supramoleculaire clusters 25.

<table><tbody><tr><td>Trifenylazijnzuur</td><td>Aldrich</td><td>T81205-10G</td><td></td></tr><tr><td>n-Butylamine</td><td>TCI</td><td>B0707</td><td></td></tr><tr><td>Isobutylamine</td><td>TCI</td><td>I0095</td><td></td></tr><tr><td>tert-Butylamine</td><td>TCI</td><td>B0709</td><td></td></tr><tr><td>tert-Amylamine</td><td>TCI</td><td>A1002</td><td></td></tr><tr><td>Methanol</td><td>Wako</td><td>131-01826</td><td>gevaarlijke stof</td></tr><tr><td>Tolueen</td><td>Wako</td><td>204-01866</td><td>gevaarlijke stof</td></tr><tr><td>Hexaan</td><td>Wako</td><td>085-00416</td><td></td></tr><tr><td>KBr</td><td>Wako</td><td>165-17111</td><td></td></tr></tbody></table>

bouw en systematische symmetric studies van een serie van supramoleculaire clusters met binaire of ternaire ammonium triphenylacetates

Construction and Systematical Symmetric Studies of a Series of Supramolecular Clusters with Binary or Ternary Ammonium Triphenylacetates

Functies van clusters in nano of sub-nanoschaal sterk afhankelijk zijn van niet alleen allerlei onderdelen daarvan, maar ook arrangementen, of symmetrie, hun onderdelen. Daarom is de regeling in de clusters zijn nauwkeurig gekarakteriseerd, vooral voor metaalcomplexen. In tegenstelling hiermee karakteriseringen van moleculair regelingen supramoleculaire clusters bestaande uit organische moleculen zijn beperkt tot enkele gevallen. Dit komt omdat de constructie van supramoleculaire clusters, met name het verkrijgen van een reeks van het supramoleculaire clusters, is moeilijk vanwege de lage stabiliteit van niet-covalente bindingen te vergelijken covalente bindingen. Vanuit dit oogpunt, het gebruik van organische zouten is een van de meest bruikbare strategieën. Een reeks van de supramoleculen kunnen worden geconstrueerd door combinatie van een specifieke organische molecuul met verschillende tegenionen. Vooral primaire ammonium carboxylaten zijn geschikt als typische voorbeelden van supramoleculen vanwege verschillende soorten carbonzurenen primaire aminen zijn in de handel verkrijgbaar, en het is gemakkelijk om combinaties te veranderen. Eerder werd aangetoond dat primaire ammonium triphenylacetates met verschillende soorten primaire aminen specifiek construct supramoleculaire clusters, die bestaan ​​uit vier en vier ammonium triphenylacetates geassembleerd door ladingsgekoppelde ondersteunde waterstofbruggen, in kristallen verkregen uit niet-polaire oplosmiddelen. Deze studie toont een toepassing van de specifieke constructie van de supramoleculaire clusters als een strategie om systematisch symmetrische onderzoek uit te voeren om verduidelijking van correlaties tussen moleculaire regelingen supramoleculen en de soorten en aantallen van de onderdelen. Evenzo met binaire zouten uit triphenylacetates en één soort primaire ammoniums, ternaire organische zouten uit triphenylacetates en twee soorten ammonium construeren supramoleculaire clusters, bieden een reeks van de supramoleculaire clusters met verschillende soorten en aantallen van de componenten.

Organisch zout vorming van TPAA en primaire amines werden bevestigd door FT-IR metingen. Kristalstructuren van de organische zouten werden geanalyseerd met eenkristal röntgendiffractie metingen. Hierdoor hetzelfde soort de supramoleculaire clusters, die bestaan ​​uit vier ammonium en vier triphenylacetates door ladingsgekoppelde ondersteunde waterstofbindingen (figuur 1a), werden bevestigd in alle eenkristallen van de organische zouten ongeacht de soorten en aantallen de...

Dit artikel beschrijft de constructie van een reeks waterstofbruggende supramoleculaire clusters in kristallen met behulp van primaire ammoniumtrifenylacetaat, dat opnieuw wordt gekristalliseerd uit niet-polaire oplosmiddelen. Deze selectieve constructie van de supramoleculaire clusters leidt tot effectieve systematische symmetrische studies over een correlatie tussen de supramoleculaire clusters en hun componenten.

Bouw en Systematische Symmetric Studies van een serie van Supramoleculaire Clusters met binaire of ternaire ammonium Triphenylacetates

Functions of clusters in nano or sub-nano scale significantly depend on not only kinds of their components but also arrangements, or symmetry, of their ...

Het algemene doel van dit experiment is om selectief unieke supramoleculaire clusters te vormen en hun symmetrische kenmerken te karakteriseren. Deze methode kan helpen bij het beantwoorden van kernvragen binnen de supramoleculaire chemie, zoals het ontwerpen van supramoleculen met een specifieke symmetrie. Het belangrijkste voordeel van deze techniek is dat de structuren of de symmetrie van elk supramolecuul voorspelbaar zijn op basis van de structuren van hun componenten.Om binaire organische zouten te bereiden, lost u triphenylazijnzuur (TPAA) en het primaire amine, entweder n-butylamine, isobutylamine, t-butylamine of t-amylamine, samen op in 20 milliliter methanol in een molaire TPAA-tegenover-amine-verhouding van één op één. Raadpleeg het tekstprotocol voor de bereiding in het geval van ternaire organische zouten. Verdampt alle oplossingen met een rotatieverdamper om de organische zouten te verkrijgen.Om enkelkristallen bestaande uit supermoleculaire clusters te bereiden, lost u 5,0 mg van elk van de organische zouten in een glazen vial op in 0,30 mL toluene als apolair goed oplosmiddel. Toluene is gekozen omdat supermoleculaire clusters bij voorkeur worden gevormd in een apolaire omgeving. Verwarm de toluene voor de organische zouten tot 40 °C om deze op te lossen.Voeg hexaan toe aan de oplossing van de organische zouten als een slecht oplosmiddel om de oplosbaarheid van het organische zout te verlagen, behalve voor de oplossing van het organische zout, TPAA t-butylamine. Houd de oplossing stabiel bij kamertemperatuur in het glazen vials, waardoor binnen een dag enkelkristallen ontstaan. Meet Fourier-transform infraroodspectra om de vorming van het organische zout te bevestigen, zoals beschreven in het tekstprotocol.Selecteer een hoogwaardig enkelkristal van het organische zout TPAA t-amylamine met een grootte van ongeveer 0,3 tot 1 millimeter zonder barsten, dat onder een stereomicroscoop uniform oogt. Een uniform kristal bestaat niet uit samenstellingen van meerdere kristallen, maar is één enkel kristal. Verplaats het kristal vanuit het glazen vial naar paraffine op een glasplaat.Plaats het enkelkristal op een loop. Zet de loop met het enkelkristal in de apparatuur voor enkelkristal-röntgendiffractie. Start de voorbereidende meting van de enkelkristal-röntgendiffractie om röntgendiffractiepatronen te verzamelen met behulp van de enkelkristal-röntgendiffractieapparatuur, zoals beschreven in het tekstprotocol.Start vervolgens met de reguliere meting van enkelkristal-röntgendiffractie om op soortgelijke wijze röntgendiffractiepatronen te verzamelen met behulp van de enkelkristal-röntgendiffractieapparatuur, zoals beschreven in het tekstprotocol. Nadat de kristalstructuur is opgelost zoals beschreven in het tekstprotocol, worden de supermoleculaire clusters in de kristalstructuren onderzocht met computergrafieken via Mercury-software. Bepaal de puntgroepsymmetrieën van de waterstofbrugpatronen in de supermoleculaire clusters door de verkregen patronen te vergelijken met de eerder geclassificeerde patronen.Karakteriseer de polyhedrale kenmerken van de supermoleculaire clusters in elk van de kristalstructuren van de organische zouten. Verwijder eerst alle atomen in de supermoleculaire clusters, behalve de koolstof- en stikstofatomen van de component carboxylaat-anionen en ammonium-kationen. Maak vervolgens met behulp van Pimal Software bindingen aan tussen de koolstof- en stikstofatomen van de oorspronkelijk door waterstofbruggen verbonden carboxylaat- en ammonium-kationen.Meet de afstanden tussen koolstof-koolstofatomen en stikstof-stikstofatomen en stel grenzen vast voor het vormen van verdere bindingen. Vorm verdere bindingen tussen koolstof-koolstofatomen waarvan de afstanden minder dan 5,4 Å zijn en stikstof-stikstofatomen waarvan de afstanden minder dan 4,2 Å zijn. Bepaal de resulterende polyeders van de organische zouten door zowel de rotatie-as als het aantal zijden van het polyeder te beschouwen.Hier vormt TPAA-isobutylamine een trans bicapped octaëder, terwijl TPAA-t-butylamine, TPAA-amylamine, TPAA-isobutylamine-t-butylamine en TPAA-isobutylamine-t-amylamine triangulaire dodecaëders vormen. Voeg extra bindingen toe aan de resulterende polyheders van de organische zouten door rekening te houden met het aantal zijden, symmetrie-elementen en intermoleculaire interacties in de supermoleculaire clusters. Bepaal de polyheder van het TPAA-n-butylamine-zout als een vierkant antiprisma door twee extra bindingen toe te voegen vanwege de C-2 symmetrie en de 14 oorspronkelijke bindingen.Bepaal de overige polyeders van de organische zouten TPAA n-butylamine t-butylamine en TPAA n-butylamine t-amylamine als driehoekige dodecaëders op basis van hun C-2 symmetrie en banden van tritylgroepen rond het supermoleculaire cluster. Representatieve resultaten van enkelkristal röntgenanalyse worden hier getoond. Symmetrieanalyse van de supermoleculaire clusters onthult hun structurele kenmerken als analogen van octocoördineerde polyeders.Na het bekijken van deze video zou u een goed begrip moeten hebben van hoe supermoleculen vanuit het oogpunt van symmetrie kunnen worden gekarakteriseerd.

construction-systematical-symmetric-studies-series-supramolecular

Research

JoVE Journal

Chemistry

Scheikunde

Het doel van dit experiment is om vast te stellen en de grootte, vorm en stabiliteit van zelf-geassembleerde discotische amfifielen in het water te controleren. Voor waterige basis van supramoleculaire polymeren, mate van controle is erg moeilijk. Wij hanteren een strategie met behulp van zowel afstotend en aantrekkelijk interacties. De experimentele technieken toegepast om dit systeem te karakteriseren zijn breed toepasbaar.

Het beheersen van de grootte, vorm en stabiliteit van de supramoleculaire polymeren in water

Dit document beschrijft de vorming van sterk geordende peptide-gebaseerde structuren door het spontane proces van zelfassemblage. De werkwijze maakt gebruik van commercieel verkrijgbare peptiden en gemeenschappelijke laboratoriumapparatuur. Deze techniek kan worden toegepast op een grote verscheidenheid aan peptiden en kan leiden tot de ontdekking van nieuwe peptiden gebaseerde samenstellingen.

Vorming van Bestelde Biomoleculaire structuren door de zelf-assemblage van korte peptiden

Een protocol voor de synthese en karakterisering van colloïden bekleed met supramoleculaire delen wordt beschreven. Deze supramoleculaire colloïden ondergaan zelf-assemblage bij de activering van de waterstofbruggen tussen de aan het oppervlak verankerde moleculen door UV-licht.

Synthese en karakterisering van Supramoleculaire colloïden

Hier presenteren we een protocol voor te bereiden en te visualiseren secundaire structuren (bijvoorbeeld vezels, toroïdale architecturen en nano- bolletjes) verkregen uit schroeflijnvormige polycarbodiimides. De morfologie gekenmerkt door zowel atomaire kracht microscopie (AFM) en scanning elektronenmicroscopie (SEM) bleek afhankelijk moleculaire structuur, de concentratie en het oplosmiddel van keuze.

Zelf monteren van morfologieën Verkregen uit rechte polycarbodiimide copolymeren en hun triazoolderivaten

Een protocol voor de synthese van een nieuw soort mesogens, gebaseerd op de halogeen-gebonden supramoleculaire anion [CnF2n + 1-I··· I··· -CnF2n + 1]−, wordt gerapporteerd.

Van moleculen tot materialen: Engineering van nieuwe Ionische vloeibare kristallen door middel van halogeen Bonding

Structuren van supramoleculaire eiwit samenstellingen met atomaire resolutie zijn van groot belang vanwege hun cruciale rol in een verscheidenheid van biologische fenomenen. Hierin presenteren wij een protocol voor het uitvoeren van high-resolution structurele studies op onoplosbare en niet-kristallijne macromoleculaire eiwit samenstellen door magie-angle spinning solid-state nucleaire magnetische resonantie spectroscopie (MAS SSNMR).

Atoomschaal structurele Studies van macromoleculaire samenstellen door Solid-state nucleaire magnetische resonantie spectroscopie

Een protocol voor de synthese van een 1,2-dithiolane gemodificeerde peptide en de karakterisatie van de supramoleculaire structuren die voortvloeien uit de peptide zelf-assemblage.

Synthese en karakterisering van 1,2-Dithiolane gemodificeerde zelfassemblerende Peptides

Een protocol wordt gepresenteerd voor de synthese van informatie-gecodeerde peptoid oligomeren en voor de sequentie-gerichte zelfassemblage van deze peptoids in moleculaire ladders met behulp van amines en aldehyden als dynamische covalente reactant paren en Lewis zure zeldzame aarde metalen triflates als multi-role reagentia.

Synthese van informatiedragende Peptoids en hun reeks-geleide Dynamische Covalent Zelfassemblage

De atmosferische concentraties van zwak gebonden moleculaire clusters kunnen worden berekend op basis van de thermochemische eigenschappen van lage energiestructuren gevonden door middel van een multi-step configuratie bemonstering methodologie met behulp van een genetisch algoritme en semi-empirische en ab initio kwantumchemie.

Berekening van atmosferische concentraties van moleculaire clusters van ab initio Thermochemie

Dit artikel beschrijft een experimenteel protocol met behulp van elektrospray-ion mobiliteit-massaspectrometrie, semi-empirische kwantumberekeningen en energie-opgeloste drempelbotsing-geïnduceerde dissociatie om de relatieve thermochemie van de dissociatie van gerelateerde ternaire metaalcomplexen te meten.

Thermochemische studies van Ni (II) en Zn (II) Ternaire complexen met behulp van ionenmobiliteit-massaspectrometrie

We presenteren een protocol voor het bereiden van synthetische biomoleculaire condensaten bestaande uit amfifiele DNA-nanosterren uitgaande van hun samenstellende DNA-oligonucleotiden. Condensaten worden geproduceerd uit een enkele nanostercomponent of twee componenten en worden gemodificeerd om in vitro transcriptie van RNA van een ingebedde DNA-sjabloon te ondersteunen.

Synthetische condensaten en celachtige architecturen van amfifiele DNA-nanostructuren

Ontdek de constructie van waterstofbrug-supramoleculaire clusters met primaire ammoniumtriphenylacetaat. Deze methode maakt systematische symmetriestudies mogelijk om supramoleculaire structuren te voorspellen.

Bouw en Systematische Symmetric Studies van een serie van Supramoleculaire Clusters met binaire of ternaire ammonium Triphenylacetates (Video) | JoVE Journal

Bouw en Systematische Symmetric Studies van een serie van Supramoleculaire Clusters met binaire of ternaire ammonium Triphenylacetates

Meer video's verkennen