Name: Een celvrij Assay met behulp van Xenopus laevis Embryo Extracten om te studeren mechanismen van Nuclear Size Verordening (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-08-08T14:00:00.000+00:00
Duration: 14 min 27 s
Description: Leer een celvrij assay met Xenopus laevis embryo-extracten om nucleaire grootteregulatie te bestuderen. Deze methode maakt manipulatie van extractsamenstelling mogelijk voor inzicht in nucleaire dynamica.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Leden van de Levy en Gatlin labs, evenals collega's in de afdeling Moleculaire Biologie, boden nuttige adviezen en discussies. Rebecca Heald verleende ondersteuning in de vroege stadia van het ontwikkelen van dit protocol. Dit werk werd ondersteund door de NIH/NIGMS (R15GM106318) en de American Cancer Society (RSG-15-035-01-DDC).

Alle Xenopus procedures en studies werden uitgevoerd in overeenstemming met de NRC Gids voor de Zorg en gebruik van proefdieren 8ste editie. Protocollen werden goedgekeurd door de Universiteit van Wyoming Institutional Animal Care en gebruik Comite (Assurance # A-3216-01). 1. Bereiding van X. laevis Egg Extract (aangepast van 27,28) <ol><li> Prime vrouwelijke X. laevis kikkers minimaal drie dagen en ten hoogste twee weken voor eierverzameling met een enkele 100 IE injectie van drachtige merrie serum gonadotropine (PMSG). </li><li> Een dag voor het experiment, injecteren gegronde kikkers met 800 IE humaan choriongonadotrofine (HCG) en plaats bij 16 ° C in 1 liter per kikker van 1 / 3x Marc&#39;s gemodificeerde Ringers (MMR). Zie tabel 1 voor buffer samenstellingen. Opmerking: Sommige kikkers zal geen eieren leggen of zal leggen slechte kwaliteit eieren. Typisch 2-3 kikkers geïnjecteerd ten minste een kikker zal sufficien leggen waarborgent aantallen van goede kwaliteit eieren. De gemiddelde kikker zal leggen genoeg eieren om ten minste 1 ml ei extract te produceren. </li><li> Bereid 1 L 1 / 3x MMR met koud gedestilleerd gedemineraliseerd water (DDH 2 O), 500 ml buffer B, 1 L buffer C, 500 ml buffer D, en 100 ml buffer E. </li><li> Transfer eieren gelegd om een ​​glas kristalliserende schotel (150 x 75 mm). Met behulp van een plastic Pasteur pipet met de punt afgesneden, boerderij uit witte gezwollen geactiveerd eieren of gelyseerd eieren. Alleen behouden eieren met duidelijke en gelijke donkere dier palen en witte plantaardige polen. </li><li> Bereid 13 x 51 mm centrifugebuisjes met 1 ml buffer E gesupplementeerd met 355 uM cytochalasine D toegevoegd juist voor gebruik in stap 1,7. </li><li> Dejelly en was de eieren. <ol><li> Wassen eieren kort met koud 1 / 3x MMR in een geschikt formaat beker, het veranderen van de buffer 3-4 keer. </li><li> Verwijder de gelei jassen uit de eieren door incubatie met Buffer B. Dit zal overal 3-10 min. Zoals de bewolkte gelei jassen zijn vrijgelaten uit het eis, veranderen de buffer. Opmerking: Dejellying is voltooid wanneer de eieren stevig verpakt weergegeven in de hoek van het schaaltje gekanteld en plantaardig polen neerwaarts georiënteerd. Eieren zijn veel kwetsbaarder na dejellying, dus geen eieren met buffer B broeden langer dan nodig en de daaropvolgende wast moet zeer zorgvuldig worden uitgevoerd. </li><li> Was de eieren kort met 3-4 veranderingen van Buffer C. </li><li> Was de eieren kort met 2 veranderingen van Buffer D. </li><li> Was de eieren kort met 2 veranderingen van Buffer E. </li></ol></li><li> Vul centrifugebuizen met eieren met behulp van een breed boring glazen pipet of plastic druppelaar. Aspireren overtollige buffer. De eieren verpakken en verwijder zoveel buffer mogelijk centrifuge swinging bucket rotor bij 212 xg gedurende 60 seconden en vervolgens bij 478 g gedurende 30 sec. Aspireren overtollige buffer. Opmerking: Het is belangrijk om zoveel overtollige buffer mogelijk te verwijderen bij deze stap te zorgen voor ei extract nagenoeg pure. </li><li> In een swingende<html> bucket rotor ultracentrifuge onder vacuüm gedurende 15 min bij 12.000 xg en 4 ° C om eieren breken open en scheiden in aparte lagen, met het cytoplasma wordt het oranje-gekleurde laag in het midden. Verwijder centrifuge buizen en plaats onmiddellijk op ijs. </li><li> Vang het extract. <ol><li> Met behulp van een 18 gauge naald en spuit, doorboren de centrifugebuis net boven het donker gepigmenteerde laag op de bodem van de buis en verwijder het midden amberkleurige cytoplasmatische laag. Voer een van de top lipidelaag verzamelen. Verzamel het cytoplasma in een geschikt formaat buis. Let op: In het algemeen, 1 kikker produceert ten minste 1 ml extract. </li><li> Supplement cytoplasma met 1/1000 het volume van 19,7 mM cytochalasine D, 1/1000 de hoeveelheid LPC voorraad en 1/50 volume van 50x energiemix. Keer de buis te mengen. Niet overdreven pipet het extract. </li><li> Houd het extract op ijs en gebruik het binnen 3 uur van de voorbereiding voor het beste resultaat. </li></ol></li></ol>_title &quot;&gt; 2. Voorbereiding van Demembranated X. laevis Sperma (aangepast van 29) Opmerking: De procedure volumes hier gepresenteerde zijn voor maximaal 8 testes. <ol><li> Verwijder 0,05% benzocaïne (10% benzocaïne stock bereid in ethanol en verdund tot 0,05% in kikker tankwater) van 4 ° C en opwarmen tot kamertemperatuur. Verdoven en te offeren mannelijke X. laevis kikkers benzocaïne oplossing bij kamertemperatuur gedurende 20 - 30 min. Verzekeren dood door geen hartslag via onderzoek en gevoel van de borst, door gebrek aan respons op mechanische stimulering, en / of door onthoofding. </li><li> Een U-vormige insnijding aan de buik. Verwijder de tubulated massa van gele vetten lichamen. Bovenaan de nieren, zoekt de testes, die ovaalvormige lichtroze massa ongeveer 1 cm lang 29 zijn. Accijnzen de testes en rol ze op vloeipapier om bloed en ander weefsel te verwijderen. </li><li> Was de testikels in Buffer T. Gebruik een nauwsluitende stamper om testes met 1 ml buffer gehaktT in een 1,5 ml buis tot homogene toestand (10 beroertes of meer). Centrifuge 5-10 seconden in een mini centrifuge en de bovenstaande vloeistof, het verwijderen van grote stukken weefsel. Centrifugeer nogmaals weer en verzamel de bovenstaande vloeistof. </li><li> Breng de sperma bevattende oplossing een 15 ml plastic buis. Verhoog het volume tot een totaal van 2 ml met buffer T. Centrifugeer bij 1411 xg gedurende 10 min bij 16 ° C om het sperma pellet. </li><li> Verwijder het supernatant en resuspendeer de pellet in 500 pl buffer T. Centrifugeer bij 1411 xg gedurende 10 min bij 16 ° C. Herhaal deze stap of twee keer als nodig is om de pellet somatische en rode bloedcellen te reinigen. </li><li> Resuspendeer de pellet in 100 pl buffer T en 300 pl Buffer S. Incubeer bij kamertemperatuur gedurende 5 min. Opmerking: Buffer S bevat lysolecithine, dat verantwoordelijk is voor demembranation. </li><li> Voeg drie volumes buffer R (vers bereid voor gebruik). Omkeren buis precies één keer. Centrifugeer bij 1411 xg gedurende 15 min bij 16 &amp;# 176; C. </li><li> Resuspendeer de pellet in 400 pl Buffer R en voeg nog eens 2 ml buffer R. Centrifugeer bij 1411 xg gedurende 15 min bij 16 ° C. </li><li> Resuspendeer de pellet in 50 gl buffer T. </li><li> Verdun 1 pi demembranated sperma kernen met 9 ul buffer T. Breng deze verdunning een hemocytometer. Tel het aantal dunne S-vormige spermakernen in een grote 4 x 4 raster en vermenigvuldig dat getal met 100 om de concentratie van het bestand verkrijgen spermakernen per pl. </li><li> Verdun de voorraad tot 100.000 sperma kernen per il met buffer T, wat resulteert in een 200x voorraad. Bereid 3-5 ul aliquots. Flash bevriezen in vloeibare stikstof en bewaar bij -80 ° C. </li></ol> 3. Nucleaire Assembly <ol><li> Supplement 100 ui ei extract met 1,5 gl 35,5 mM cycloheximide (eindconcentratie ~ 0,5 mM), 6 pl 20x calciumvoorraadoplossing (eindconcentratie ~ 0,6 mM) en 0,7 pl 200x zaadcellen (eindconcentratie ~ 700spermakernen / ul). Schaal de reactie volume omhoog of omlaag als dat nodig is. Omkeren of tik voorzichtig te mengen. Opmerking: Extract gefietst van metafase naar interfase zorgt voor een meer robuust en betrouwbaar platform voor nucleaire montage. </li><li> Incubeer in een waterbad bij 16 - 20 ° C gedurende 90 min. Meng door zachtjes te tikken om de 15 minuten om ervoor te zorgen kernen blijven in het extract opgeschort. </li><li> De voortgang van de nucleaire combinatie 45 min door het opstellen van een squash als volgt. <ol><li> Pipet 2 pi van het extract op een glasplaatje en voeg 2 pl nucleus fix. </li><li> Bedekken met een 22 mm 2 dekglaasje. Beeld op een epifluorescentiemicroscoop met behulp van water, olie, of door de lucht 20 - 100X doelstellingen en een DAPI filter. Opmerking: De kernen kunnen worden gevisualiseerd door bright-field imaging, maar zijn veel gemakkelijker te visualiseren door middel van fluorescentie. </li><li> Gebruik kernen direct of flash-freeze monsters in vloeibare stikstof en bewaar bij -80 ° C. Opmerking: Het toevoegen van 4% glycerol om de kernen prIOR bevriezing kunnen helpen om hun integriteit. Frozen kernen zijn over het algemeen nog steeds levensvatbaar is en in staat om nucleaire import, maar de bevriezing proces kan leiden tot een verstoorde of meer structureel kwetsbare kernen. Kernen tot een jaar na bevriezing kan worden gebruikt. </li></ol></li></ol> 4. Voorbereiding van X. laevis Embryo Extract <ol><li> Induceren vrouwelijke X. laevis kikkers om eieren te leggen, zoals beschreven in 1.1 en 1.2. </li><li> Isoleer testes van mannelijke X. laevis kikkers zoals beschreven in 2.2. Onderdompelen testes in L15 medium aangevuld met 50 IU / ml penicilline en streptomycine in een glazen 35 x 10 mm petrischaal. Bewaren bij 4 ° C gedurende maximaal twee weken. </li><li> Verzamelen en bevruchten eieren. <ol><li> Verzamel vers gelegde eieren door het houden van kikkers over een glas herbruikbare petrischaal en het bevorderen van het leggen van eieren door het toepassen van lichte druk op de onderrug in de buurt van de cloaca. Knijpen de kikker te hard kan leiden tot letsel, wat leidt tot een opgeblazen buik en requiring euthanasie 29. </li><li> Prop het gerecht bij een geschatte hoek van 45 °, laat de eieren te verzamelen in de rand van de schotel, verwijder alle overtollige buffer, en voeg genoeg 1 / 3x MMR nauwelijks dekking van de eieren. Bevruchten eieren binnen 15 min van de collectie. </li><li> Gebruik een strak ingerichte stamper om maceraat en homogeniseren 1/4 van een testis in een 1,5 ml buis met 500 ul van een hoog zoutgehalte gewijzigd Barth&#39;s zoutoplossing (High Salt MBS). Voeg gemacereerde testes de eieren en laat voor de bevruchting plaatsvindt bij kamertemperatuur gedurende 15 - 20 min, vervolgens overstroming eieren met 1 / 3x MMR. Noot: Effectiviteit van testes af met opslagduur, daardoor testes weefsel vereist voor succesvolle bevruchting bij gebruik testes die zijn opgeslagen gedurende meer dan één week. </li><li> Bevestig bevruchting door te controleren op contractie van de donkere gepigmenteerde animale pool en door rotatie van de embryo&#39;s met hun dierlijke polen naar boven, gewoonlijk ongeveer 20 - 30 min na toevoeging van gemalen testes. Verwachten dat de eerste cel splitsing voor te komen binnen 90 min. </li><li> Met behulp van een breed boring glazen pipet ijverig verwijderen dode (wit en gezwollen of ongelijke verdeling van de dooier en pigment), gelyseerd, of onbevruchte eieren (dat wil zeggen, niet gesplitst), omdat ze snel de dood in het naburige embryo&#39;s zal leiden. </li><li> Anywhere 1-2,5 uur na de bevruchting, dejelly embryo&#39;s in 2-3% cysteïne opgelost in 1/3 x MMR en op pH 7,9 met 10 N KOH. Voer twee buffer veranderingen die elk 3-4 min. Grondig de embryo&#39;s met 6-10 korte veranderingen van 1 / 3x MMR om alle sporen van cysteïne te verwijderen. Opmerking: Dejellied embryo&#39;s hebben een vitelline membraan en zijn niet zo kwetsbaar is als dejellied eieren. </li></ol></li><li> Met een wijde boring glazen pipet gezonde bevruchte (dwz gesplitst) embryo een petrischaal met vers 1 / 3x MMR en laten ontwikkelen tot het gewenste stadium bij kamertemperatuur of, indien langzamere ontwikkeling voorkeur, 16 ° C. Doorgaan met dode of ly verwijderensed embryo&#39;s aangegeven door het ontbreken van de eerste divisie en witte gezwollen uiterlijk. </li><li> Controleer het stadium van de embryo&#39;s door te controleren op nagenoeg volledige afsluiting van de blastopore en vergelijken met tekeningen van gefaseerde embryo in referentiematerialen 24. Let op: Embryo&#39;s gekweekt bij 16 ° C zal stadium te bereiken 11,5-12 in ongeveer 12 uur. </li><li> Incubeer fase 11,5-12 embryo in vers 1 / 3x MMR aangevuld met 0,5 mM cycloheximide gedurende 1 uur bij KT, embryo&#39;s arrestatie eind interfase. </li><li> Breng met wijde boring glas of plastic pipet minste 15 (bij voorkeur 30 of meer)-interfase aangehouden&#39;s naar een microcentrifugebuis. Opmerking: 15 embryo&#39;s kunnen dan ca. 20 ui extract. Opschalen als dat nodig is. </li><li> Voeg 1 ml ei lysisbuffer (ELB), aangevuld met 1 pl van LPC voorraad. Voorzichtig omkeren om embryo&#39;s te wassen, laat embryo&#39;s vallen op de bodem van de buis, en verwijder de buffer. Herhaal deze wasstap twee keer. &lt;/ Li&gt; <li> Resuspendeer embryo&#39;s in 500 pi van ELB plus 0,5 ul van LPC voorraad, 5 pl 19,7 mM cycloheximide, en 5 ul van 35,5 mM cytochalasine D (tot actine polymerisatie te remmen). Centrifugeer bij 200 xg gedurende 1 min in een tafelmodel microcentrifuge. </li><li> Verwijder overtollig buffer en gebruik een stamper grondig te verpletteren de embryo&#39;s. Centrifugeer in een swinging bucket rotor gedurende 10 min bij 10.000 xg en 16 ° C. </li><li> Prik de lipide laag van de top met een 200 ul pipet tip. Met een schone 200 ul pipet tip, verwijder de middelste cytoplasma-oranje gekleurde laag om een ​​geschikt formaat buis. </li><li> Supplement embryo extract met 1/50 volume van 50x energiemix (als ATP regeneratie systeem), 1/100 volume van 35,5 mM cyclohexamide, 1/500 volume van 19,7 mM cytochalasine D en 1/1000 van het volume LPC voorraad. </li><li> Bereid een squash, zoals beschreven in 3,3 tot endogene embryonale kernen in het extract te visualiseren. Let op: Embryo extract kan worden ingevroren met<html> de endogene kernen op dit punt. Hoeveelheid hiervan vries / dooicycli en opslag te verminderen bij -80 ° C. </li><li> Kernen uit het embryo extract te verwijderen, het extract verdund met een gelijk volume van ELB met 1/50 volume van 50x energiemix 1/100 volume van 35,5 mM cyclohexamide, 1/500 volume van 19,7 mM cytochalasine D, en 1/1000 het volume van LPC voorraad. Centrifugeer in een swinging bucket rotor bij 17.000 xg gedurende 15 min bij 16 ° C. </li><li> Verzamel de supernatant en voorzichtig om alle resterende lipiden aan de top te vermijden. Mis gepelleteerde kernen niet storen bij de bodem van de buis. Bereid een pompoen zoals beschreven in 3.3 opdat meeste kernen zijn verwijderd. Gebruik het extract vers of hoeveelheid en bewaar bij -80 ° C. </li><li> Verwarmen inactiveren embryo-extract voor controle-experimenten, warmte 30-100 gl aliquots extract bij 56 ° C gedurende 30 min met behulp van een thermische cycler. Zodat de warmte geïnactiveerd extract op kamertemperatuur vóór gebruik. </li></ol>_title &quot;&gt; 5. Nuclear Krimpende Assay en immunofluorescentie <ol><li> Isoleer kernen geassembleerd in ei extract door verdunning van 25-150 gl voorgemonteerde kernen in 1 ml ELB in een 1,5 ml buis. Centrifugeer bij 1600 xg gedurende 3 min bij 4 ° C in een tafelmodel microcentrifuge. Verwijderen buffer, let de fragiele kernen pellet te verstoren op de bodem van de buis. </li><li> Resuspendeer kernen in een hoeveelheid embryo extract gelijk aan het oorspronkelijke volume van ei extract gebruikt 5,1. Gebruik ELB of warmte geïnactiveerd extract voor de controle reacties, voor zover van toepassing. </li><li> Tik voorzichtig de buis te breken van de pellet en resuspendeer de kernen. Incubeer bij kamertemperatuur gedurende 90 min voorzichtig de buis elke 15 mengen drukken - 30 min. Opmerking: De meeste nucleaire krimpen plaatsvindt binnen de eerste 30 min. </li><li> De voortgang van de nucleaire krimpen door het opstellen van een squash. <ol><li> Pipet 2 pi van het extract op een glasplaatje en voeg 2 pl nucleus fix. </li><li> Overlay met een 22 mm 2 </sup&gt; dekglaasje. Beeld op epifluorescentie microscoop. </li></ol></li><li> Raak de buis naar de kernen juist voor het toevoegen van 500 pi fixatief bestaande uit ELB, 15% glycerol en 2,6% paraformaldehyde mengen. Inverteer onmiddellijk en plaats de buis op een rotator gedurende 15 minuten bij kamertemperatuur. </li><li> Bereid spin down buizen door de afbouw van 15 ml ronde bodem glazen buizen met ronde bodem kunststof inzetstukken (ontwerp en schema&#39;s beschikbaar op aanvraag). Voeg 5 ml van de nucleaire kussen buffer. Laat een 12 mm ronde dekglaasje in de buis, waarbij zeker dat het vlak ligt op de top van de plastic insert. </li><li> Voorzichtig laag de oplossing die vaste kernen bovenop de nucleaire kussen met een grote boring pipet tip. Centrifugeer in een swinging bucket rotor gedurende 15 min bij 1000 x g en 16 ° C. </li><li> Gebruik een aspirator om alle buffer eruit te halen de kunststof insert naar de top van de buis. Verwijder de dekglaasje met een paar fijne tang, let daarbij goed op de zijkant van de begeleidende notaslip waarop de kernen werden afgedraaid. Post-fix in koude methanol (bewaard bij -20 ° C) gedurende 5 minuten bij kamertemperatuur. </li><li> Breng de dekglaasje kern kant naar boven op een vel plastic paraffine folie voering een grote plastic petrischaal. Plaats vochtige wegwerpdoekjes langs de kant van de schaal om uitdroging te voorkomen. </li><li> Rehydrateren kernen op het dekglaasje met 500 pl PBS-NP40 (1x PBS plus 0,1% NP40) en zuig na 5-10 sec. </li><li> laag zorgvuldig 75 pl PBS-3% runderserumalbumine (BSA) op het dekglaasje. Laat 1 uur bij kamertemperatuur of overnacht bij 4 ° C geblokkeerd. </li><li> Verwijderen blokkeeroplossing en incubeer met primair antilichaam (bijvoorbeeld mAb414 tegen de nucleaire porie complex, 1: 1000) verdund in PBS-3% BSA gedurende 1 uur bij kamertemperatuur of overnacht bij 4 ° C. Wassen met vijf onmiddellijke veranderingen van PBS-NP40. </li><li> Incubeer met tweede antilichaam verdund in PBS-3% BSA gedurende 1 uur bij KT. Wassen met vijf onmiddellijke veranderingen van PBS-NP40. </li><li> Incuberenmet 10 ug / ml Hoechst verdund in PBS-3% BSA gedurende 5 minuten bij kamertemperatuur. Was vijfmaal met PBS-NP40. Verwijder alle overtollige buffer. </li><li> Monteer de dekglaasje op een dia met 5 ul antifade montage medium. Seal met duidelijke nagellak. Afbeelding onmiddellijk met een epifluorescentie microscoop met 20 - 100x doelstellingen en bewaar bij 4 ° C voor latere beeldvorming. Opmerking: Voer kwantificering zoals eerder beschreven 23. </li></ol>

<ol><li>Conklin, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+size+and+nuclear+size%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Exp.+Embryol%22%5BJournal%5D)">Cell size and nuclear size.</a> J. Exp. Embryol. 12, 1-98 (1912).</li>
<li>Wilson, E. B. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aWilson%2C+EB+%22The+Cell+in+Development+and+Heredity%22">The Cell in Development and Heredity</a>. , The Macmillan Company. 727-733 (1925).</li>
<li>Levy, D. L., Heald, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nuclear+size+is+regulated+by+importin+alpha+and+Ntf2+in+Xenopus%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Nuclear size is regulated by importin alpha and Ntf2 in Xenopus.</a> Cell. 143 (2), 288-298 (2010).</li>
<li>Chan, Y. H., Marshall, W. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scaling+properties+of+cell+and+organelle+size%5BTitle%5D)+AND+%22Organogenesis%22%5BJournal%5D)">Scaling properties of cell and organelle size.</a> Organogenesis. 6 (2), 88-96 (2010).</li>
<li>Walters, A. D., Bommakanti, A., Cohen-Fix, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Shaping+the+nucleus%3A+Factors+and+forces%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biochem%22%5BJournal%5D)">Shaping the nucleus: Factors and forces.</a> J Cell Biochem. 113 (9), 2813-2821 (2012).</li>
<li>Webster, M., Witkin, K. L., Cohen-Fix, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sizing+up+the+nucleus%3A+nuclear+shape%2C+size+and+nuclear-envelope+assembly%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">Sizing up the nucleus: nuclear shape, size and nuclear-envelope assembly.</a> J Cell Sci. 122 (Pt 10), 1477-1486 (2009).</li>
<li>Edens, L. J., White, K. H., Jevtic, P., Li, X., Levy, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nuclear+size+regulation%3A+from+single+cells+to+development+and+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Nuclear size regulation: from single cells to development and disease.</a> Trends Cell Biol. 23 (4), 151-159 (2013).</li>
<li>Jevtic, P., Edens, L. J., Vukovic, L. D., Levy, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sizing+and+shaping+the+nucleus%3A+mechanisms+and+significance%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Sizing and shaping the nucleus: mechanisms and significance.</a> Curr Opin Cell Biol. 28, 16-27 (2014).</li>
<li>Levy, D. L., Heald, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanisms+of+intracellular+scaling%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Cell+Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Mechanisms of intracellular scaling.</a> Annu Rev Cell Dev Biol. 28, 113-135 (2012).</li>
<li>Vukovic, L. D., Jevtic, P., Edens, L. J., Levy, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((New+insights+into+the+mechanisms+and+functions+of+nuclear+size+regulation%5BTitle%5D)+AND+%22Int+Rev+Cell+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">New insights into the mechanisms and functions of nuclear size regulation.</a> Int Rev Cell Mol Biol. 322, 1-59 (2016).</li>
<li>Jevtic, P., Levy, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nuclear+size+scaling+during+Xenopus+early+development+contributes+to+midblastula+transition+timing%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Nuclear size scaling during Xenopus early development contributes to midblastula transition timing.</a> Curr Biol. 25 (1), 45-52 (2015).</li>
<li>Hara, Y., Iwabuchi, M., Ohsumi, K., Kimura, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intranuclear+DNA+density+affects+chromosome+condensation+in+metazoans%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">Intranuclear DNA density affects chromosome condensation in metazoans.</a> Mol Biol Cell. 24 (15), 2442-2453 (2013).</li>
<li>Zink, D., Fischer, A. H., Nickerson, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nuclear+structure+in+cancer+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Cancer%22%5BJournal%5D)">Nuclear structure in cancer cells.</a> Nat Rev Cancer. 4 (9), 677-687 (2004).</li>
<li>Jevtic, P., Levy, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanisms+of+nuclear+size+regulation+in+model+systems+and+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Exp+Med+Biol%22%5BJournal%5D)">Mechanisms of nuclear size regulation in model systems and cancer.</a> Adv Exp Med Biol. 773, 537-569 (2014).</li>
<li>Chow, K. H., Factor, R. E., Ullman, K. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+nuclear+envelope+environment+and+its+cancer+connections%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Cancer%22%5BJournal%5D)">The nuclear envelope environment and its cancer connections.</a> Nat Rev Cancer. 12 (3), 196-209 (2012).</li>
<li>Blom, J. H., Ten Kate, F. J., Schroeder, F. H., van der Heul, R. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morphometrically+estimated+variation+in+nuclear+size.+A+useful+tool+in+grading+prostatic+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Urol+Res%22%5BJournal%5D)">Morphometrically estimated variation in nuclear size. A useful tool in grading prostatic cancer.</a> Urol Res. 18 (2), 93-99 (1990).</li>
<li>Dey, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cancer+nucleus%3A+morphology+and+beyond%5BTitle%5D)+AND+%22Diagn+Cytopathol%22%5BJournal%5D)">Cancer nucleus: morphology and beyond.</a> Diagn Cytopathol. 38 (5), 382-390 (2010).</li>
<li>Cross, M. K., Powers, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Learning+about+cancer+from+frogs%3A+analysis+of+mitotic+spindles+in+Xenopus+egg+extracts%5BTitle%5D)+AND+%22Dis+Model+Mech%22%5BJournal%5D)">Learning about cancer from frogs: analysis of mitotic spindles in Xenopus egg extracts.</a> Dis Model Mech. 2 (11-12), 541-547 (2009).</li>
<li>Voeltz, G. K., Prinz, W. A., Shibata, Y., Rist, J. M., Rapoport, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+class+of+membrane+proteins+shaping+the+tubular+endoplasmic+reticulum%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">A class of membrane proteins shaping the tubular endoplasmic reticulum.</a> Cell. 124 (3), 573-586 (2006).</li>
<li>Chan, R. C., Forbes, D. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+study+of+nuclear+assembly+and+nuclear+import+using+Xenopus+egg+extracts%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">In vitro study of nuclear assembly and nuclear import using Xenopus egg extracts.</a> Methods Mol Biol. 322, 289-300 (2006).</li>
<li>Edens, L. J., Levy, D. L. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aEdens%2C+LJ+%22Xenopus+Development%22">Xenopus Development</a>. Kloc, M., Kubiak, J. Z. , John Wiley & Sons, Inc. 325-345 (2014).</li>
<li>Levy, D. L., Heald, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biological+Scaling+Problems+and+Solutions+in+Amphibians%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harb+Perspect+Biol%22%5BJournal%5D)">Biological Scaling Problems and Solutions in Amphibians.</a> Cold Spring Harb Perspect Biol. 8 (1), a019166(2016).</li>
<li>Edens, L. J., Levy, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((cPKC+regulates+interphase+nuclear+size+during+Xenopus+development%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">cPKC regulates interphase nuclear size during Xenopus development.</a> J Cell Biol. 206 (4), 473-483 (2014).</li>
<li>Nieuwkoop, P. D., Faber, J. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aNieuwkoop%2C+PD+%22Normal+Table+of+Xenopus+laevis+%28Daudin%29%22">Normal Table of Xenopus laevis (Daudin)</a>. , 2nd edn, North-Holland Publishing Company. (1967).</li>
<li>Newport, J., Kirschner, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+major+developmental+transition+in+early+Xenopus+embryos%3A+II.+Control+of+the+onset+of+transcription%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">A major developmental transition in early Xenopus embryos: II. Control of the onset of transcription.</a> Cell. 30 (3), 687-696 (1982).</li>
<li>Newport, J., Kirschner, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+major+developmental+transition+in+early+Xenopus+embryos%3A+I.+characterization+and+timing+of+cellular+changes+at+the+midblastula+stage%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">A major developmental transition in early Xenopus embryos: I. characterization and timing of cellular changes at the midblastula stage.</a> Cell. 30 (3), 675-686 (1982).</li>
<li>Maresca, T. J., Heald, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Methods+for+studying+spindle+assembly+and+chromosome+condensation+in+Xenopus+egg+extracts%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Methods for studying spindle assembly and chromosome condensation in Xenopus egg extracts.</a> Methods Mol Biol. 322, 459-474 (2006).</li>
<li>Hannak, E., Heald, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Investigating+mitotic+spindle+assembly+and+function+in+vitro+using+Xenopus+laevis+egg+extracts%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Investigating mitotic spindle assembly and function in vitro using Xenopus laevis egg extracts.</a> Nat Protoc. 1 (5), 2305-2314 (2006).</li>
<li>Murray, A. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+cycle+extracts%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Cell cycle extracts.</a> Methods Cell Biol. 36, 581-605 (1991).</li>
<li>Khan, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+alterations+in+nuclear+structure+predict+prostate+carcinoma+distant+metastasis+and+death+in+men+with+biochemical+recurrence+after+radical+prostatectomy%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer%22%5BJournal%5D)">Quantitative alterations in nuclear structure predict prostate carcinoma distant metastasis and death in men with biochemical recurrence after radical prostatectomy.</a> Cancer. 98 (12), 2583-2591 (2003).</li>
<li>Tan, P. H., Goh, B. B., Chiang, G., Bay, B. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Correlation+of+nuclear+morphometry+with+pathologic+parameters+in+ductal+carcinoma+in+situ+of+the+breast%5BTitle%5D)+AND+%22Mod+Pathol%22%5BJournal%5D)">Correlation of nuclear morphometry with pathologic parameters in ductal carcinoma in situ of the breast.</a> Mod Pathol. 14 (10), 937-941 (2001).</li>
<li>Zeimet, A. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+ploidy%2C+nuclear+size%2C+proliferation+index+and+DNA-hypomethylation+in+ovarian+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Gynecol+Oncol%22%5BJournal%5D)">DNA ploidy, nuclear size, proliferation index and DNA-hypomethylation in ovarian cancer.</a> Gynecol Oncol. 121 (1), 24-31 (2011).</li>
<li>Theerthagiri, G., Eisenhardt, N., Schwarz, H., Antonin, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+nucleoporin+Nup188+controls+passage+of+membrane+proteins+across+the+nuclear+pore+complex%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">The nucleoporin Nup188 controls passage of membrane proteins across the nuclear pore complex.</a> J Cell Biol. 189 (7), 1129-1142 (2010).</li>
<li>Wuhr, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+for+an+upper+limit+to+mitotic+spindle+length%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Evidence for an upper limit to mitotic spindle length.</a> Curr Biol. 18 (16), 1256-1261 (2008).</li>
<li>Loughlin, R., Wilbur, J. D., McNally, F. J., Nedelec, F. J., Heald, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Katanin+contributes+to+interspecies+spindle+length+scaling+in+Xenopus%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Katanin contributes to interspecies spindle length scaling in Xenopus.</a> Cell. 147 (6), 1397-1407 (2011).</li>
<li>Wilbur, J. D., Heald, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mitotic+spindle+scaling+during+Xenopus+development+by+kif2a+and+importin%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">Mitotic spindle scaling during Xenopus development by kif2a and importin.</a> eLife. 2, e00290(2013).</li>
<li>Kieserman, E. K., Heald, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mitotic+chromosome+size+scaling+in+Xenopus%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Cycle%22%5BJournal%5D)">Mitotic chromosome size scaling in Xenopus.</a> Cell Cycle. 10 (22), 3863-3870 (2011).</li>
<li>Maresca, T. J., Freedman, B. S., Heald, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histone+H1+is+essential+for+mitotic+chromosome+architecture+and+segregation+in+Xenopus+laevis+egg+extracts%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Histone H1 is essential for mitotic chromosome architecture and segregation in Xenopus laevis egg extracts.</a> J Cell Biol. 169 (6), 859-869 (2005).</li>
<li>MacCallum, D. E., Losada, A., Kobayashi, R., Hirano, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ISWI+remodeling+complexes+in+Xenopus+egg+extracts%3A+identification+as+major+chromosomal+components+that+are+regulated+by+INCENP-aurora+B%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">ISWI remodeling complexes in Xenopus egg extracts: identification as major chromosomal components that are regulated by INCENP-aurora B.</a> Mol Biol Cell. 13 (1), 25-39 (2002).</li>
<li>Goehring, N. W., Hyman, A. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Organelle+growth+control+through+limiting+pools+of+cytoplasmic+components%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Organelle growth control through limiting pools of cytoplasmic components.</a> Curr Biol. 22 (9), R330-R339 (2012).</li>
<li>Du Toit, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development%3A+Honey%2C+I+shrunk+the+nucleus%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Development: Honey, I shrunk the nucleus.</a> Nat Rev Mol Cell Biol. 15 (10), 633(2014).</li>
<li>Buchner, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+role+of+protein+kinase+C+in+the+regulation+of+cell+growth+and+in+signalling+to+the+cell+nucleus%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cancer+Res+Clin+Oncol%22%5BJournal%5D)">The role of protein kinase C in the regulation of cell growth and in signalling to the cell nucleus.</a> J Cancer Res Clin Oncol. 126 (1), 1-11 (2000).</li>
<li>Mochly-Rosen, D., Das, K., Grimes, K. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+kinase+C%2C+an+elusive+therapeutic+target%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Drug+Discov%22%5BJournal%5D)">Protein kinase C, an elusive therapeutic target.</a> Nat Rev Drug Discov. 11 (12), 937-957 (2012).</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

Hier wordt een nieuwe methode gepresenteerd om mechanismen van nucleaire grootteregulatie tijdens de ontwikkeling van X. laevis te bestuderen. De ontwikkelingsprogressie gaat gepaard met dramatische veranderingen in celfysiologie, metabolisme, delingssnelheden en migratie, evenals veranderingen in de grootte van cellen en intracellulaire structuren. Deze verschillende processen zijn complex en essentieel, dus het is moeilijk om slechts één van deze aspecten van ontwikkeling in een in vivo omgeving te be...

De afmetingen van cellulaire organellen typisch schalen met de grootte van de cel, en dit is wellicht het best beschreven voor de schaal van nucleaire grootte met celgrootte 1-10. Dit geldt met name tijdens embryogenese en celdifferentiatie bij dramatische vermindering van zowel de cel kerngrootte vaak waargenomen 11,12. Bovendien veranderde kerngrootte is een belangrijke parameter voor kanker diagnose en prognose 13-17. Mechanismen die bijdragen tot de grootte regelgeving nucleaire zijn grotendeels onbekend, voor een deel te wijten aan de complexiteit en de essentiële aard van de nucleaire structuur en functie. De hier beschreven methode werd ontwikkeld als een in vitro assay voor kerngrootte schalen die vatbaar is voor biochemische manipulatie en opheldering van mechanismen van regulatie nucleaire grootte. Xenopus laevis ei extract is een goed opgezet systeem te herhalen en te studeren complexe cellulaire processen in een in vitro </em&gt; Context. Deze extracten zijn nieuwe fundamentele informaties verscheidene cellulaire processen waaronder de aanmaak en functie van de mitotische spoel, endoplasmatisch reticulum en kern 18-22 geopenbaard. Een belangrijk voordeel van het extractiesysteem dat X. laevis ei extracten geven een nagenoeg onverdund cytoplasma waarvan de samenstelling is makkelijk te veranderen, bijvoorbeeld door toevoeging van recombinante eiwitten of immunodepletie. Verder is men in staat om essentiële processen te manipuleren door gebruik behandelingen die anderszins letale in een in vivo context. Wijzigingen van het ei extract procedure mogelijk maken voor de isolatie van uittreksels uit X. laevis embryo&#39;s in plaats van eieren, en deze embryo-extracten zijn even vatbaar voor biochemische manipulatie 23. Tijdens X. laevis ontwikkeling, de eencellige bevruchte embryo (~ 1 mm diameter) ondergaat een reeks van twaalf snelle celdelingen (stappen 1-8) genereren duizenden 50 μm diameter en kleinere cellen, het bereiken van een ontwikkelingsstadium aangeduid als de midblastula overgang (MBT) of stadium 24-26 augustus. De MBT wordt gekenmerkt door het begin van zygote transcriptie, celmigratie, asynchrone celdelingen, verwerving van gap fasen en vaststelling van nucleaire steady-state en zijn geen continue nucleaire expansie zoals in de pre-MBT embryo. Van stap 4 tot gastrulatie (stadia 10,5-12), het volume van individuele kernen daalt met meer dan 10-voudig 11. Hier is het doel om mechanismen die aan deze verlaging van nucleaire grootte tijdens ontwikkeling progressie identificeren. De aanpak is om eerst te assembleren kernen in X. laevis ei extract en die kernen uit het ei cytoplasma / extract te isoleren. Deze kernen worden vervolgens opnieuw gesuspendeerd in cytoplasma van eind gastrulastadium embryo&#39;s. Na een incubatieperiode, de kernen van ei extract kleiner worden in een vergevorderd stadium embryo extract. We redeneerden dat deze would een nuttige test voor het identificeren van cytoplasmatische componenten die aanwezig zijn in een vergevorderd stadium embryo&#39;s die bijdragen aan de ontwikkeling van nucleaire grootte schalen zijn. Gebruik van deze assay, in combinatie met in vivo validatie we aangetoond dat proteïne kinase C (PKC) draagt ​​ontwikkelingsstoornissen verlaging kerngrootte in X. laevis 23.

<table><tbody><tr><td>Alexa Fluor 568 Donkey anti-mouse IgG</td><td>Molecular Probes</td><td>A10037</td><td></td></tr><tr><td>ATP disodium salt</td><td>Sigma Aldrich</td><td>A2383</td><td></td></tr><tr><td>Benzocaine</td><td>Sigma Aldrich</td><td>E1501</td><td></td></tr><tr><td>Bovine Serum Albumin</td><td>Sigma Aldrich</td><td>A3059</td><td></td></tr><tr><td>CaCl2</td><td>Sigma Aldrich</td><td>C3306</td><td></td></tr><tr><td>Centrifuge</td><td>Beckman</td><td>J2-21M</td><td></td></tr><tr><td>Centrifuge rotor</td><td>Beckman</td><td>JS 13.1</td><td></td></tr><tr><td>chymostatin</td><td>Sigma Aldrich</td><td>C7268</td><td></td></tr><tr><td>creatine phosphate disodium</td><td>Calbiochem</td><td>2380</td><td></td></tr><tr><td>cycloheximide</td><td>Sigma Aldrich</td><td>C6255</td><td></td></tr><tr><td>cytochalasin D</td><td>Sigma Aldrich</td><td>C8273</td><td></td></tr><tr><td>disposable wipes (kimwipes)</td><td>Sigma Aldrich</td><td>Z188956</td><td></td></tr><tr><td>L-cysteine</td><td>Sigma Aldrich</td><td>W326306</td><td></td></tr><tr><td>EGTA</td><td>Sigma Aldrich</td><td>E4378</td><td></td></tr><tr><td>Formaldehyde</td><td>Sigma Aldrich</td><td>F8775</td><td></td></tr><tr><td>Glass crystallizing dish (150 x 75 mm)</td><td>VWR</td><td>89090-662</td><td></td></tr><tr><td>Glycerol</td><td>Macron</td><td>5094-16</td><td></td></tr><tr><td>HEPES</td><td>Sigma Aldrich</td><td>H4034</td><td></td></tr><tr><td>Hoechst - bisBenzimide H 33342 trihydrochloride</td><td>Sigma Aldrich</td><td>B2261</td><td></td></tr><tr><td>HCG - Human Chorionic Gonadotropin&nbsp;</td><td>Prospec</td><td>hor-250-c</td><td></td></tr><tr><td>L15 Media</td><td>Sigma Aldrich</td><td>L4386</td><td></td></tr><tr><td>leupeptin</td><td>Sigma Aldrich</td><td>L2884</td><td></td></tr><tr><td>Lysolecithin</td><td>Sigma Aldrich</td><td>L1381</td><td></td></tr><tr><td>mAb414</td><td>Abcam</td><td>ab24609</td><td></td></tr><tr><td>MgCl2</td><td>EMD</td><td>MX0045-2</td><td></td></tr><tr><td>MgSO4</td><td>Sigma Aldrich</td><td>M9397</td><td></td></tr><tr><td>Maltose</td><td>Sigma Aldrich</td><td>M5885</td><td></td></tr><tr><td>NP40</td><td>BDH</td><td>56009</td><td></td></tr><tr><td>Paraformaldehyde</td><td>Electron Microscopy Sciences</td><td>15710</td><td></td></tr><tr><td>Penicillin + Streptomycin</td><td>Sigma Aldrich</td><td>Pp0781</td><td></td></tr><tr><td>pepstatin</td><td>Sigma Aldrich</td><td>P5318</td><td></td></tr><tr><td>PIPES</td><td>Sigma Aldrich</td><td>P6757</td><td></td></tr><tr><td>Plastic paraffin film (parafilm)</td><td>Sigma Aldrich</td><td>P7793</td><td></td></tr><tr><td>KCl</td><td>Sigma Aldrich</td><td>P9541</td><td></td></tr><tr><td>KH2PO4</td><td>Mallinckrodt</td><td>70100</td><td></td></tr><tr><td>KOH</td><td>Baker</td><td>5 3140</td><td></td></tr><tr><td>PMSG - Pregnant Mare Serum Gonadotropin</td><td>Prospec</td><td>hor-272-a</td><td></td></tr><tr><td>NaCl</td><td>Sigma Aldrich</td><td>S3014</td><td></td></tr><tr><td>NaHCO3</td><td>Fisher</td><td>BP328</td><td></td></tr><tr><td>Na2HPO4</td><td>EMD</td><td>SX0720-1</td><td></td></tr><tr><td>NaOH</td><td>EMD</td><td>SX0590</td><td></td></tr><tr><td>Pestle</td><td>Thomas Scientific</td><td>3411D56</td><td></td></tr><tr><td>Round bottom glass tubes, 15 ml</td><td>Corex</td><td>8441</td><td></td></tr><tr><td>Secondary antibody (Alexa Fluor 568 donkey anti-mouse IgG)</td><td>ThermoFisher</td><td>A10037</td><td></td></tr><tr><td>sucrose</td><td>Calbiochem</td><td>8550</td><td></td></tr><tr><td>thermal cycler</td><td>Bio-Rad</td><td>T100</td><td></td></tr><tr><td>Ultracentrifuge</td><td>Beckman</td><td>L8-80M</td><td></td></tr><tr><td>Ultracentrifuge rotor</td><td>Beckman</td><td>SW 50.1</td><td></td></tr><tr><td>Vectashield (anti-fade mounting medium)</td><td>Vector</td><td>H-1000</td><td></td></tr></tbody></table>

een celvrij assay met behulp van<em&gt; xenopus laevis</em&gt; embryo extracten om te studeren mechanismen van nuclear size verordening

A Cell-Free Assay Using Xenopus laevis Embryo Extracts to Study Mechanisms of Nuclear Size Regulation

Een fundamentele vraag in de celbiologie is hoe cel en organel maten worden gereguleerd. Het is al lang bekend dat de grootte van de kern algemeen schalen met de grootte van de cel, met name tijdens embryogenese als dramatische daling van zowel cellen en nucleaire grootte voorkomen. Mechanismen van grootte regelgeving nucleaire zijn grotendeels onbekend en kunnen kanker relevant zijn waar veranderde nucleaire grootte is een belangrijke diagnostische en prognostische parameter. In vivo zal het identificeren van nucleaire grootte toezichthouders worden bemoeilijkt door de essentiële en complexe aard van de nucleaire functie. De in vitro benadering beschreven afmetingen control nucleaire studie maakt gebruik van de normale verlaging kerngrootte die tijdens Xenopus laevis ontwikkeling. Eerst worden kernen geassembleerd in X. laevis ei extract. Vervolgens worden deze kernen geïsoleerd en opnieuw gesuspendeerd in cytoplasma van embryo laat stadium. Na 30-90 min incubatieperiode nucleaire oppervlaktegebieddaalt met 20-60%, waardoor een bruikbare test om cytoplasmatische componenten aanwezig zijn in een vergevorderd stadium embryo&#39;s die bijdragen aan de ontwikkeling van nucleaire grootte schalen te identificeren. Een belangrijk voordeel van deze aanpak is het relatieve gemak waarmee de eieren en embryo-extracten biochemisch kan worden gemanipuleerd, waardoor de identificatie van nieuwe eiwitten en activiteiten die kerngrootte regelen. Zoals bij elke in vitro benadering van validatie resulteert in een in vivo systeem belangrijk is en micro-injectie van X. laevis embryo&#39;s is bijzonder geschikt voor deze studies.

Assemblage van Kernen in Egg Extract De eerste stappen van dit protocol zijn aan X. bereiden laevis ei extract (Protocol 1) en demembranated sperma kernen (Protocol 2). Deze reagentia worden vervolgens gebruikt om de kernen novo (protocol 3) monteren. Figuur 1 toont enkele representatieve gegevens. Toevoeging van calcium drijft de meiose gearresteerd ei extr...

Mechanismen van cellulaire en intracellulaire schaalverdeling blijven ongrijpbaar. Het gebruik van Xenopus embryo-extracten is steeds gebruikelijker geworden om mechanismen van orgaangrootte-regulatie te verduidelijken. Deze methode beschrijft de bereiding van embryo-extract en een nieuwe nucleaire schaalverdelingstest waardoor mechanismen van nucleaire grootte-regulatie kunnen worden geïdentificeerd.

Een celvrij Assay met behulp van<em&gt; Xenopus laevis</em&gt; Embryo Extracten om te studeren mechanismen van Nuclear Size Verordening

A fundamental question in cell biology is how cell and organelle sizes are regulated. It has long been recognized that the size of the nucleus generally ...

Het algemene doel van deze procedure is om extracten van Xenopus-eicellen en embryo's te gebruiken voor het opzetten van een assay waarin grote celkernen krimpen. Deze methode kan helpen bij het beantwoorden van kernvragen over de nucleaire celbiologie, zoals: wat zijn de mechanismen die de grootte van de kern reguleren? Het belangrijkste voordeel van deze techniek is dat de samenstelling en activiteiten van het celvrije Xenopus-extract eenvoudig kunnen worden gemanipuleerd om de feiten over de kerngrootte te beoordelen.Nadat de Xenopus-ielextracten, gedemembraneerde spermacellen en geassembleerde kernen zijn voorbereid volgens het tekstprotocol, worden vers gelegde eitjes verzameld door kikkers boven een glazen, herbruikbare Petrischaal te houden. Stimuleer de eiafzetting door voorzichtig druk uit te oefenen op de onderrug nabij de cloaca. Zet de schaal onder een hoek van ongeveer 45 graden om de eitjes langs de rand van de schaal te laten verzamelen.Verwijder vervolgens het overtollige buffer en voeg voldoende one-third X MMR toe om de eitjes net te bedekken. Verslijm en homogeniseer met een nauwsluitende stamper 1/4 van een testis in een 1,5 milliliter buisje met 500 microliters high-salt Modified Barth's Saline, of MBS. Voeg vervolgens de verslijmde testis toe aan de eitjes en laat de bevruchting 15 minuten lang plaatsvinden bij kamertemperatuur.Vul na de incubatie de eitjes aan met een derde X MMR. Controleer vervolgens na vijf tot 10 minuten of de bevruchting is geslaagd door te kijken naar de contractie van de donkergepigmenteerde animalpool en door de embryo's te roteren zodat hun animalpolen naar boven wijzen. Verwijder nauwgezet dode, gelyseerde of onbevruchte, niet-gedeelde eitjes met een plastic pipet met een wijde opening, aangezien deze snel de dood van naburige embryo's zullen veroorzaken.Verwijder de gelei van de embryo's tussen één en 2,5 uur na bevruchting in twee tot drie procent cysteïne opgelost in een derde X MMR, waarbij de pH is bijgesteld naar 7,9. Vóór het verwijderen van de gelei bevinden de embryo's zich in een relatief groot volume. Voer twee bufferwisselingen uit van telkens drie tot vier minuten.Was daarna de embryo's grondig met zes tot 10 korte spoelingen met een derde X MMR om alle resten cysteïne te verwijderen. Na het ontdoen van de gelei zitten de embryo's dicht op elkaar gepakt en nemen ze een relatief klein volume in. Breng vervolgens met een glazen pipet met een wijde opening de gezonde, bevruchte embryo's over naar een Petrischaal met verse een derde X MMR.Laat ze bij kamertemperatuur verder ontwikkelen tot het gewenste stadium. Verwijder doodgeslagen of gelyseerde embryo's, herkenbaar aan het uitblijven van de eerste deling of een wit, opgezwollen uiterlijk. Wanneer de embryo's stadium 11,5 tot 12 hebben bereikt, worden ze overgebracht naar vers een-derde X MMR aangevuld met 0,5 millimolair cycloheximide en worden de embryo's gedurende één uur bij kamertemperatuur geïncubeerd om ze in de late interfase te arresteren.Breng met een glazen of plastic pipet met een wijde opening minimaal 15 embryo's die in de interfase zijn gearresteerd over naar een microcentrifugebuisje. Voeg één milliliter ei-lysisbuffer, of ELB, aangevuld met één microliter LPC-stamoplossing, toe aan de embryo's. Keer het buisje voorzichtig om om de embryo's te wassen.Laat de embryo's vervolgens naar de bodem van de buis zakken. Voordat de buffer wordt verwijderd, wordt de wasstap nog twee keer herhaald. Resuspendeer de embryo's in 500 µL ELB, aangevuld met 0,5 µL LPC-stock, 5 µL 19,7 mM cycloheximide en 5 µL 35,5 mM cytochalasin D om actinpolymerisatie te remmen.Centrifugeer de monsters in een tafelcentrifuge bij 200 ×g gedurende één minuut, verwijder vervolgens de overtollige buffer en gebruik een vijzel om de embryo's grondig te verbrijzelen. Plaats de verbrijzelde monsters in een swing-out rotor en centrifugeer bij 10.000 ×g en 16 °C gedurende 10 minuten. Doorboor met een 200 µL pipetpunt de lipidenlaag aan de bovenzijde en verwijder met een schone pipetpunt de middelste, barnsteelkleurige cytoplasmatische laag naar een passende buis.Vul het embryo-extract aan met de volgende reagentia. Keer de buis vervolgens voorzichtig om om te mengen. Nadat de endogene embryonale kernen in het extract zijn gevisualiseerd door een squash-preparaat te maken volgens het tekstprotocol, worden de kernen uit het extract verwijderd door eerst een gelijk volume ELB toe te voegen dat de hier vermelde reagentia bevat.Keer de buis voorzichtig om om te mengen. Centrifugeer het monster in een swinging-bucket-rotor bij 17 000 xg bij 16 °C gedurende 15 minuten. Verzamel vervolgens het supernatant, waarbij u er zorg voor draagt om eventuele resterende lipiden aan de bovenkant te vermijden, en laat de gepelletteerde kernen onderin ongemoeid.Bereid een squash voor zoals beschreven in het tekstprotocol om er zeker van te zijn dat de meeste kernen zijn verwijderd. Gebruik vervolgens het verse extract, of verdeel het monster in aliquots en bewaar deze bij min 80 graden Celsius. Isoleer kernen die zijn samengesteld in eiextract door 25 tot 150 µL van de vooraf samengestelde kernen te verdunnen in 1 mL ELB in een 1,5 mL buis.Centrifugeer bij 1600 ×g en vier graden Celsius gedurende drie minuten. Verwijder vervolgens de buffer, waarbij u erop let dat de pellet niet wordt verstoord. Voeg aan de pellet een volume embryo-extract toe dat gelijk is aan het oorspronkelijke volume eiextract, en tik voorzichtig tegen de buis om de pellet op te breken en de kernen te resuspenderen.Incubeer gedurende 90 minuten bij kamertemperatuur en tik elke 15 tot 30 minuten voorzichtig tegen de buis om te mengen. Tik na de incubatie tegen de buis om de kernen opnieuw te suspenderen, vlak voordat u 500 µL ELB met 15% glycerol en 2,6% paraformaldehyde toevoegt. Keer de buis onmiddellijk om en plaats de buis gedurende 15 minuten op een rotator bij kamertemperatuur.Bereid spin-down buisjes voor door 15 milliliter rondeglazen buisjes te voorzien van plastic ronde inzetstukken. Voeg 5 milliliter kernkussenbuffer toe en laat vervolgens een cirkelvormig dekglas van 12 millimeter in het buisje vallen, waarbij u erop let dat dit plat op het plastic inzetstuk ligt. Breng met een pipetteertip met een wijde opening de gefixeerde kernoplossing voorzichtig in laagjes aan bovenop het kernkussen.Centrifugeer dit in een swinging-bucket-rotor bij 1.000 ×g en 16 °C gedurende 15 minuten. Gebruik vervolgens een aspirator om alle buffer te verwijderen en houd de plastic insert tegen de bovenkant van de buis. Verwijder daarna met een fijne pincet het dekglas, waarbij u er zorgvuldig op let aan welke zijde van het dekglas de kernen zijn neergesponnen.Fixeer het dekglas in koud methanol gedurende vijf minuten bij kamertemperatuur. Verplaats het dekglas met de kernzijde naar boven naar een vel plastic paraffinefolie dat een grote, plastic Petrischaal bekleedt. Plaats vervolgens natte, wegwerpbare doekjes langs de zijkant van de schaal om uitdroging te voorkomen.Rehydrateeer de kernen op het dekglas gedurende vijf tot 10 seconden met 500 µL PBS NP40 en aspireer dit vervolgens. Breng daarna voorzichtig 75 µL PBS 3%BSA aan op het dekglas en laat dit gedurende één uur bij kamertemperatuur, of overnacht bij vier graden Celsius, blokkeren. Verwijder de blokkeringsbuffer en incubeer met het primaire antilichaam verdund in PBS 3%BSA.Was de monsters vervolgens vijf keer achter elkaar met PBS NP40. Herhaal deze incubatie- en wasstappen met secundaire antilichamen. Incubeer vijf minuten bij kamertemperatuur met 10 micrograms per milliliter Hoechst, verdund in PBS 3%BSA.Was daarna vijf keer met PBS NP40 en verwijder alle overtollige buffer. Monteer tot slot het dekglas op een objectglas met vijf microliters anti-fade monteermedium. Gebruik transparante nagellak om het dekglas af te dichten en beeldvorm direct met een epifluorescentiemicroscoop of bewaar het bij 40 graden Celsius voor latere beeldvorming.Deze figuur toont de assemblage van kernen in eiextract. 30-45 minuten na het starten van de reactie zouden de dunne, S-vormige spermakernen moeten beginnen te verdikken tot slakvormige chromatinemassa's. Nadat de nucleaire assemblage heeft plaatsgevonden, zou de vorm van de kern ronder moeten worden en zou het kernvolume moeten toenemen naarmate de kernenvelope uitzet en kernproteïnen worden geïmporteerd.Zoals hier getoond, vertoont een met Hoechst gekleurd preparaat van een kleine aliquot van het embryo-extract veel gekleurde kernen, wat aangeeft dat de bereiding van het extract succesvol was. Na verwijdering van de kernen door centrifugatie zouden, in vergelijking met het eerste preparaat, zeer weinig kernen in het extract over moeten blijven, zoals in dit paneel te zien is, om ervoor te zorgen dat endogene kernen de daaropvolgende analyse niet verstoren. Als er nog steeds kernen aanwezig zijn, is een tweede ronde van centrifugatie vereist.In deze assay voor nucleaire krimp worden celkernen uit eiextract, resuspendeerd in embryo-extract van een laat stadium, na verloop van tijd succesvol kleiner. Celkernen die echter zijn geïncubeerd met hitte-geïnactiveerd embryo-extract vertonen dit proces niet. Het is belangrijk om het experiment meerdere keren te herhalen om rekening te houden met de inherente variabiliteit van de assay.Zodra de methode onder de knie is, kan het volledige protocol in twee dagen worden uitgevoerd, waarbij de eigenlijke assay voor nucleaire inkrimping ongeveer vier uur in beslag neemt. Tijdens deze procedure is het belangrijk om de eicellen en embryo's gedurende het proces kwaliteitsmatig te controleren en zeer voorzichtig te zijn om de pellet en lipidelaagen te vermijden bij het verzamelen van het cytoplasmatisch extract na centrifugatie. De resultaten die met deze procedure zijn behaald, dienen te worden gevalideerd.Bijvoorbeeld mijn embryo-microinjectie of celcultuurtransfectie. Bovendien kan deze methode worden gebruikt om de grootte-regulatie van andere organellen te onderzoeken. Na de ontwikkeling van deze techniek werd de weg vrijgemaakt voor onderzoekers in het veld van de nucleaire celbiologie om de regulatiemechanismen van de kerngrootte en de functionele rol van de kerngrootte bij ontwikkeling en carcinogenese te onderzoeken.Na het bekijken van deze video zou u een goed begrip moeten hebben van hoe u kernen uit Xenopus-eiextract assembleert en isoleert, Xenopus-embryo's en embryo-extract genereert, de nuclear shrinking assay uitvoert en de resultaten visualiseert.

a-cell-free-assay-using-xenopus-laevis-embryo-extracts-to-study

Research

JoVE Journal

Biology

Biologie

Kernmembraan assemblage is een essentiële stap in de celdeling-cyclus, dit proces kan worden gerepliceerd in de proefbuis door het combineren van Xenopus sperma chromatine, cytosol, en licht membraan fracties. Compleet kernen worden gevormd, met inbegrip van nucleaire membranen met poriën complexen, en deze gereconstitueerde kernen zijn in staat van normale nucleaire processen.

In Vitro Nuclear Assembly Met behulp van Gefractioneerde Xenopus Egg Extracten

Xenopus embryonale epitheel is een ideaal modelsysteem om cel gedrag, zoals polariteit ontwikkeling en vorm veranderen tijdens epitheliale morfogenese bestuderen. Traditionele histologie van vaste monsters wordt in toenemende mate aangevuld door live-cell imaging confocale. Hier laten we zien methoden om de kikker weefsel te isoleren en te visualiseren live-epitheliale cellen en hun cytoskelet met behulp van live-cell confocale microscopie.

Live-cell imaging en kwantitatieve analyse van de embryonale epitheelcellen in Xenopus laevis</em

Een protocol voor de voorbereiding van robuuste, kleinschalige HeLa nucleaire extracten wordt beschreven. Dit protocol is waardevol voor testen die het gebruik van kleine populaties van cellen, zoals cellen behandeld met medicijnen of RNAi vereisen. De methode moet voor diverse genexpressie assays en andere celtypes, die onder andere cellen.

Kleinschalige nucleaire extracten voor functionele testen van gen-expressie Machines

Productie van<em&gt; Xenopus tropicalis</em&gt; Egg Extracten aan microtubuli-geassocieerde RNA&#39;s identificeren

Het manuscript hier een eenvoudige set van methoden voor het analyseren van de afscheiding en de verspreiding van fluorescent gelabelde liganden in Xenopus. Dit verschaft een context voor het testen van het vermogen van andere eiwitten ligand distributie passen en waardoor experimenten inzicht in mechanismen reguleren morfogeen gradiënten kunnen leiden.

Met behulp van confocale Analyse<em&gt; Xenopus laevis</em&gt; Om Modulators van Wnt en Shh Morfogen Verlopen Onderzoek

De moleculaire mechanismen van de decondensatie van sterk gecompacteerde mitotische chromatine zijn slecht gedefinieerd. We presenteren een celvrije test op basis van mitotische chromatineclusters geïsoleerd uit HeLa-cellen en Xenopus laevis eierextract die het decondensatieproces in vitro getrouw reconstrueert.

Een Cell Gratis Assay om te studeren Chromatine decondensatie aan het eind van Mitosis

We worden stappen beschreven waarmee snel in situ bemonstering van een klein gedeelte van een afzonderlijke cel met hoge precisie en minimale invasie met behulp van capillaire gebaseerde micro-sampling, ter vergemakkelijking van chemische karakterisering van een momentopname van de metabole activiteit in levende embryo's met behulp van een custom-built eencellige capillaire elektroforese en massaspectrometrie platform.

Microprobe capillaire elektroforese massaspectrometrie voor eencellige metabolomica in Live kikker (Xenopus laevis) embryo 's

Door encapsulating ei extracten van Xenopus laevis in water-in-olie micro presenteren we een methode voor het genereren van in vitro zichzelf onderhoudende mitotische oscillaties op het niveau van eencellige.

Reconstructie van de celcyclus oscillaties in Micro van cel-vrije Xenopus ei extracten

We beschrijven een methode voor de bereiding en live beeldvorming van onverdunde cytoplasmatische extracten van Xenopus laevis-eieren .

Xenopus laevis | Voorbereiding van ei-extract en live beeldvormingsmethoden voor het visualiseren van dynamische cytoplasmatische organisatie

We beschrijven een fysieke constrictiemethode om mini-embryo's te maken van Xenopus laevis 1-cel embryo's.

Fysieke manipulatie om Xenopus mini-embryo's te genereren

We beschrijven een methode om losse cellen uit vroege embryo's van Xenopus laevis te isoleren en deze te sorteren op celgrootte.

Individuele cellen uit vroege embryo's van Xenopus isoleren en sorteren op grootte

Leer een celvrij assay met Xenopus laevis embryo-extracten om nucleaire grootteregulatie te bestuderen. Deze methode maakt manipulatie van extractsamenstelling mogelijk voor inzicht in nucleaire dynamica.

Een celvrij Assay met behulp van

Meer video's verkennen