Name: VacuSIP, een verbeterde INEX Methode voor het In Situ Meten van Particulate en opgeloste componenten verwerkt door Active Suspension Voeders (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-08-03T11:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 57 s
Description: Leer de VacuSIP-methode voor het meten van partikels en opgeloste stoffen bij benthische suspension feeders. Deze techniek verzamelt geïnhaleerd en geëxhaleerd water zonder contaminatie.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Wij danken Manel Bolivar voor zijn hulp bij het veldwerk. We zijn dankbaar voor de &quot;Parc Natural del Montgrí, les Illes Medes i el Baix Ter&quot; voor hun steun aan ons onderzoek en bemonstering permissies. De onderwaterwereld manipulator is ontworpen door Ayelet Dadon-Pilosof en gefabriceerd door Mr. Pilosof. Dit werk werd ondersteund door de Spaanse regering project CSI-Coral [subsidie ​​aantal CGL2013-43106-R RC en MR] en door een FPU beurs van &quot;Ministerio de Educación, Cultura y Deporte (MECD)&quot; naar TM. Dit is een bijdrage van de Marine biogeochemie en Global Change onderzoeksgroep gefinancierd door de Catalaanse regering [subsidie ​​nummer 2014SGR1029] en ISF subsidie ​​1280-1213 en BSF subsidie ​​2.012.089 G. Yahel.

<ol><li>Gili, J. M., Coma, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Benthic+suspension+feeders%3A+their+paramount+role+in+littoral+marine+food+webs%5BTitle%5D)+AND+%22Trends.+Ecol.+Evol%22%5BJournal%5D)">Benthic suspension feeders: their paramount role in littoral marine food webs.</a> Trends. Ecol. Evol. 13 (8), 316-321 (1998).</li>
<li>Reiswig, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+pumping+activities+of+tropical+Demospongiae%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Bio%22%5BJournal%5D)">In situ pumping activities of tropical Demospongiae.</a> Mar. Bio. 9, 38-50 (1971).</li>
<li>McMurray, S., Pawlik, J., Finelli, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Trait-mediated+ecosystem+impacts%3A+how+morphology+and+size+affect+pumping+rates+of+the+Caribbean+giant+barrel+sponge%5BTitle%5D)+AND+%22Aquat.+Bio%22%5BJournal%5D)">Trait-mediated ecosystem impacts: how morphology and size affect pumping rates of the Caribbean giant barrel sponge.</a> Aquat. Bio. 23 (1), 1-13 (2014).</li>
<li>Pile, A. J., Young, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+natural+diet+of+a+hexactinellid+sponge%3A+benthic-pelagic+coupling+in+a+deep-sea+microbial+food+web%5BTitle%5D)+AND+%22Deep-Sea+Res.+Pt.+I%22%5BJournal%5D)">The natural diet of a hexactinellid sponge: benthic-pelagic coupling in a deep-sea microbial food web.</a> Deep-Sea Res. Pt. I. 53 (7), 1148-1156 (2006).</li>
<li>Nielsen, T., Maar, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+a+blue+mussel+Mytilus+edulis+bed+on+vertical+distribution+and+composition+of+the+pelagic+food+web%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Ecol.+Prog.+Ser%22%5BJournal%5D)">Effects of a blue mussel Mytilus edulis bed on vertical distribution and composition of the pelagic food web.</a> Mar. Ecol. Prog. Ser. 339, 185-198 (2007).</li>
<li>De Goeij, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Surviving+in+a+marine+desert%3A+the+sponge+loop+retains+resources+within+coral+reefs%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Surviving in a marine desert: the sponge loop retains resources within coral reefs.</a> Science. 342, 108-110 (2013).</li>
<li>Maldonado, M., Ribes, M., van Duyl, F. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nutrient+Fluxes+Through+Sponges.+Biology%2C+Budgets%2C+and+Ecological+Implications%5BTitle%5D)+AND+%22Advances+in+Marine+Biology%22%5BJournal%5D)">Nutrient Fluxes Through Sponges. Biology, Budgets, and Ecological Implications.</a> Advances in Marine Biology. 62, (2012).</li>
<li>Riisgård, H. U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((On+measurement+of+filtration+rates+in+bivalves+-+the+stony+road+to+reliable+data%3A+review+and+interpretation%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Ecol.+Prog.+Ser%22%5BJournal%5D)">On measurement of filtration rates in bivalves - the stony road to reliable data: review and interpretation.</a> Mar. Ecol. Prog. Ser. 211, 275-291 (2001).</li>
<li>Reiswig, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Water+transport%2C+respiration+and+energetics+of+three+tropical+marine+sponges%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Exp.+Mar.+Biol.+Ecol%22%5BJournal%5D)">Water transport, respiration and energetics of three tropical marine sponges.</a> J. Exp. Mar. Biol. Ecol. 14, 231-249 (1974).</li>
<li>Jiménez, E., Ribes, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sponges+as+a+source+of+dissolved+inorganic+nitrogen%3A+nitrification+mediated+by+temperate+sponges%5BTitle%5D)+AND+%22Limnol.+Oceanogr%22%5BJournal%5D)">Sponges as a source of dissolved inorganic nitrogen: nitrification mediated by temperate sponges.</a> Limnol. Oceanogr. 52 (3), 948-958 (2007).</li>
<li>Diaz, M. C., Ward, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sponge-mediated+nitrification+in+tropical+benthic+communities%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Ecol.+Prog.+Ser%22%5BJournal%5D)">Sponge-mediated nitrification in tropical benthic communities.</a> Mar. Ecol. Prog. Ser. 156, 97-107 (1997).</li>
<li>Ribes, M., Coma, R., Gili, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Natural+diet+and+grazing+rate+of+the+temperate+sponge+Dysidea+avara+%28Demospongiae%2C+Dendroceratida%29+throughout+an+annual+cycle%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Ecol.+Prog.+Ser%22%5BJournal%5D)">Natural diet and grazing rate of the temperate sponge Dysidea avara (Demospongiae, Dendroceratida) throughout an annual cycle.</a> Mar. Ecol. Prog. Ser. 176, 179-190 (1999).</li>
<li>Jiménez, E. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Nutrient+fluxes+in+marine+sponges%3A+methodology%2C+geographical+variability+and+the+role+of+associated+microorganisms%22">Nutrient fluxes in marine sponges: methodology, geographical variability and the role of associated microorganisms</a>. , Universitat Politècnica de Catalunya. Barcelona. PhD thesis (2011).</li>
<li>Reiswig, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Particle+feeding+in+natural+populations+of+three+marine+demosponges%5BTitle%5D)+AND+%22Biol.+Bull%22%5BJournal%5D)">Particle feeding in natural populations of three marine demosponges.</a> Biol. Bull. 141 (3), 568-591 (1971).</li>
<li>Reiswig, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+pumping+activities+of+tropical+Demospongiae%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Biol%22%5BJournal%5D)">In situ pumping activities of tropical Demospongiae.</a> Mar. Biol. 9 (1), 38-50 (1971).</li>
<li>Yahel, G., Marie, D., Genin, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((InEx+-+a+direct+in+situ+method+to+measure+filtration+rates%2C+nutrition%2C+and+metabolism+of+active+suspension+feeders%5BTitle%5D)+AND+%22Limnol.+Oceanogr-meth%22%5BJournal%5D)">InEx - a direct in situ method to measure filtration rates, nutrition, and metabolism of active suspension feeders.</a> Limnol. Oceanogr-meth. 3, 46-58 (2005).</li>
<li>Genin, A., Monismith, S. S. G., Reidenbach, M. A., Yahel, G., Koseff, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intense+benthic+grazing+of+phytoplankton+in+a+coral+reef%5BTitle%5D)+AND+%22Limnol.+Oceanogr%22%5BJournal%5D)">Intense benthic grazing of phytoplankton in a coral reef.</a> Limnol. Oceanogr. 54 (2), 938-951 (2009).</li>
<li>Yahel, G., Whitney, F., Reiswig, H. M., Leys, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+feeding+and+metabolism+of+glass+sponges+%28Hexactinellida+%2C+Porifera%29+studied+in+a+deep+temperate+fjord+with+a+remotely+operated+submersible%5BTitle%5D)+AND+%22Limnol.+Oceanogr%22%5BJournal%5D)">In situ feeding and metabolism of glass sponges (Hexactinellida , Porifera) studied in a deep temperate fjord with a remotely operated submersible.</a> Limnol. Oceanogr. 52 (1), 428-440 (2007).</li>
<li>Wright, S. H., Stephens, G. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Removal+of+amino+acid+during+a+single+passage+of+water+across+the+gill+of+marine+mussels%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Exp.+Zool%22%5BJournal%5D)">Removal of amino acid during a single passage of water across the gill of marine mussels.</a> J. Exp. Zool. 205, 337-352 (1978).</li>
<li>Møhlenberg, F., Riisgård, H. U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficiency+of+particle+retention+in+13+species+of+suspension+feeding+bivalves%5BTitle%5D)+AND+%22Ophelia%22%5BJournal%5D)">Efficiency of particle retention in 13 species of suspension feeding bivalves.</a> Ophelia. 17 (2), 239-246 (1978).</li>
<li>Mueller, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Natural+diet+of+coral-excavating+sponges+consists+mainly+of+dissolved+organic+carbon+%28DOC%29%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Natural diet of coral-excavating sponges consists mainly of dissolved organic carbon (DOC).</a> PLoS ONE. 9 (2), e90152(2014).</li>
<li>Gasol, J. M., Moran, X. A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+filtration+on+bacterial+activity+and+picoplankton+community+structure+as+assessed+by+flow+cytometry%5BTitle%5D)+AND+%22Aquat.+Microb.+Ecol%22%5BJournal%5D)">Effects of filtration on bacterial activity and picoplankton community structure as assessed by flow cytometry.</a> Aquat. Microb. Ecol. 16 (3), 251-264 (1999).</li>
<li>Koroleff, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Determination+of+reactive+silicate%5BTitle%5D)+AND+%22New+Baltic+Manual%2C+Cooperative+Research+Report+Series+A%22%5BJournal%5D)">Determination of reactive silicate.</a> New Baltic Manual, Cooperative Research Report Series A. 29, 87-90 (1972).</li>
<li>Murphy, J., Riley, J. P. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Modified+single+solution+method+for+the+determination+of+phosphate+in+in+natural+waters%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Chim.+Acta%22%5BJournal%5D)">Modified single solution method for the determination of phosphate in in natural waters.</a> Anal. Chim. Acta. 27, 31-36 (1962).</li>
<li>Shin, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Colorimetric+method+for+determination+of+nitrite%5BTitle%5D)+AND+%22Ind.Eng.Chem%22%5BJournal%5D)">Colorimetric method for determination of nitrite.</a> Ind.Eng.Chem. 13 (1), 33-35 (1941).</li>
<li>Wood, E. D., Armstrong, F. A. J., Richards, F. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Determination+of+nitrate+in+sea+water+by+cadmium-copper+reduction+to+nitrite%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Mar.+Biol.+Assoc.+U.+K%22%5BJournal%5D)">Determination of nitrate in sea water by cadmium-copper reduction to nitrite.</a> J. Mar. Biol. Assoc. U. K. 47 (1), 23-31 (1967).</li>
<li>Sharp, J. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+preliminary+methods+comparison+for+measurement+of+dissolved+organic+nitrogen+in+seawater%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Chem%22%5BJournal%5D)">A preliminary methods comparison for measurement of dissolved organic nitrogen in seawater.</a> Mar. Chem. 78 (4), 171-184 (2002).</li>
<li>Sharp, J. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Marine+dissolved+organic+carbon%3A+Are+the+older+values+correct%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Chem%22%5BJournal%5D)">Marine dissolved organic carbon: Are the older values correct.</a> Mar. Chem. 56 (3-4), 265-277 (1997).</li>
<li>Holmes, R. M., Aminot, A., Kerouel, R., Hooker, B. A., Peterson, B. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+and+precise+method+for+measuring+ammonium+in+marine+and+freshwater+ecosystems%5BTitle%5D)+AND+%22Can.+J.+Fish.+Aquat.+Sci%22%5BJournal%5D)">A simple and precise method for measuring ammonium in marine and freshwater ecosystems.</a> Can. J. Fish. Aquat. Sci. 56 (10), 1801-1808 (1999).</li>
<li>Degobbis, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((On+the+storage+of+seawater+samples+for+ammonia+determination%5BTitle%5D)+AND+%22Limnol.+Oceanogr%22%5BJournal%5D)">On the storage of seawater samples for ammonia determination.</a> Limnol. Oceanogr. 18 (1), 146-150 (1973).</li>
<li>Tupas, L. M., Popp, B. N., Karl, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dissolved+organic+carbon+in+oligotrophic+waters%3A+experiments+on+sample+preservation%2C+storage+and+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Chem%22%5BJournal%5D)">Dissolved organic carbon in oligotrophic waters: experiments on sample preservation, storage and analysis.</a> Mar. Chem. 45, 207-216 (1994).</li>
<li>Yoro, S. C., Panagiotopoulos, C., Sempéré, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dissolved+organic+carbon+contamination+induced+by+filters+and+storage+bottles%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Res%22%5BJournal%5D)">Dissolved organic carbon contamination induced by filters and storage bottles.</a> Water Res. 33 (8), 1956-1959 (1999).</li>
<li>Zhang, J. Z., Fischer, C. J., Ortner, P. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laboratory+glassware+as+a+contaminant+in+silicate+analysis+of+natural+water+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Res%22%5BJournal%5D)">Laboratory glassware as a contaminant in silicate analysis of natural water samples.</a> Water Res. 33 (12), 2879-2883 (1999).</li>
<li>Yoshimura, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Appropriate+bottles+for+storing+seawater+samples+for+dissolved+organic+phosphorus+%28DOP%29+analysis%3A+a+step+toward+the+development+of+DOP+reference+materials%5BTitle%5D)+AND+%22Limnol.+Oceanogr-meth%22%5BJournal%5D)">Appropriate bottles for storing seawater samples for dissolved organic phosphorus (DOP) analysis: a step toward the development of DOP reference materials.</a> Limnol. Oceanogr-meth. 11 (4), 239-246 (2013).</li>
<li>Strickland, J. D. H., Parsons, T. R. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aStrickland%2C+JDH+%22A+practical+handbook+of+seawater+analysis%22">A practical handbook of seawater analysis</a>. , Fisheries Research Board of Canada. Ottawa. (1968).</li>
<li>Eaton, A. D., Grant, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Freshwater+sorption+of+ammonium+by+glass+frits+and+filters%3A+implications+for+analyses+of+brackish+and+freshwater%5BTitle%5D)+AND+%22Limnol.+Oceanogr%22%5BJournal%5D)">Freshwater sorption of ammonium by glass frits and filters: implications for analyses of brackish and freshwater.</a> Limnol. Oceanogr. 24 (2), 397-399 (1979).</li>
<li>Norrman, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Filtration+of+water+samples+for+DOC+studies%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Chem%22%5BJournal%5D)">Filtration of water samples for DOC studies.</a> Mar. Chem. 41 (1-3), 239-242 (1993).</li>
<li>Carlson, C. A., Ducklow, H. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Growth+of+bacterioplankton+and+consumption+of+dissolved+organic+carbon+in+the+Sargasso+Sea%5BTitle%5D)+AND+%22Aquat.+Microb.+Ecol%22%5BJournal%5D)">Growth of bacterioplankton and consumption of dissolved organic carbon in the Sargasso Sea.</a> Aquat. Microb. Ecol. 10 (1), 69-85 (1996).</li>
<li>Grasshoff, K., Ehrhardt, M., Kremling, K. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aGrasshoff%2C+K+%22Methods+of+Seawater+Analysis.+Second%2C+Revised+and+Extended+Edition%22">Methods of Seawater Analysis. Second, Revised and Extended Edition</a>. , (1999).</li>
<li>Perea-Blázquez, A., Davy, S. K., Bell, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nutrient+utilisation+by+shallow+water+temperate+sponges+in+New+Zealand%5BTitle%5D)+AND+%22Hydrobiologia%22%5BJournal%5D)">Nutrient utilisation by shallow water temperate sponges in New Zealand.</a> Hydrobiologia. 687 (1), 237-250 (2012).</li>
<li>Perea-Blázquez, A., Davy, S. K., Bell, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Estimates+of+particulate+organic+carbon+flowing+from+the+pelagic+environment+to+the+benthos+through+sponge+assemblages%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Estimates of particulate organic carbon flowing from the pelagic environment to the benthos through sponge assemblages.</a> PLoS ONE. 7 (1), e29569(2012).</li>
<li>Pile, A. J., Patterson, M. R., Witman, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+grazing+on+plankton+%3C10+%C2%B5m+by+the+boreal+sponge+Mycale+lingua%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Ecol.+Prog.+Ser%22%5BJournal%5D)">In situ grazing on plankton <10 µm by the boreal sponge Mycale lingua.</a> Mar. Ecol. Prog. Ser. 141, 95-102 (1996).</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

voorbereidende stappen Collector flesjes voor DOM en nutriëntenanalyses Sinds collector schepen kunnen interageren met opgeloste micro-bestanddelen en de sampler muren kan een substraat voor de groei van bacteriën 30-34, verschillende flesjes voor DOM en voedingsstoffen collectie werden getest zijn. Borosilicate wordt niet aanbevolen voor silica kwantificering 33,35, omdat glazen flessen de aanvanke...

Benthische schorsing feeders spelen een essentiële rol in het functioneren van mariene ecosystemen 1. Door het filteren van grote hoeveelheden water 2,3, ze te verwijderen en scheiden deeltjes (plankton en detritus) en opgeloste verbindingen 1 (en referenties daarin) en zijn een belangrijk middel van benthische-pelagische koppeling 4,5 en voedselkringloop 6,7. Nauwkeurig meten van de deeltjes en opgeloste stoffen verwijderd en uitgescheiden door benthische schorsing feeders (zoals sponzen, ascidians, borstelwormen en tweekleppigen) is fundamenteel voor hun fysiologie, metabolisme en het voeden van de ecologie te begrijpen. Samen met pompsnelheid metingen, maar maakt het ook mogelijk een kwantificering van de nutriënten gemedieerd door deze organismen en de ecologische invloed op de kwaliteit van het water als op het ecosysteem grootschalige processen. Het kiezen van de juiste methode voor het meten van verwijdering en productiesnelheden van deeltjes en opgeloste compond door ophanging filter feeders is van cruciaal belang voor het verkrijgen van betrouwbare gegevens over hun voedselopname 8. Zoals opgemerkt door Riisgård en anderen, ongepast methodieken vooroordelen resultaten, vervormen experimentele omstandigheden, produceren onjuiste schattingen van de inname en uitscheiding van bepaalde stoffen, en kan leiden tot foutieve kwantificering van de nutriënten verwerkt door deze organismen. De twee meest gebruikte methoden om deeltjes en opgeloste nutriëntfluxen in filter feeders meten betrekken ofwel incubatie (indirecte technieken) of gelijktijdig verzamelen van omgevings- en uitgeademde water (directe technieken). Incubatie technieken zijn gebaseerd op het meten van de verandering in de concentratie van deeltjes en opgeloste voedingsstoffen in het water geïncubeerd, en het schatten productiesnelheden of verwijdering vergelijking aan afdoende 8. Echter, het omsluiten van een organisme in een incubatie kamer kan zijn feedin verandereng en pompen gedrag als gevolg van veranderingen in de natuurlijke stroming regime door een daling in zuurstof en / of voedselconcentratie of door accumulatie van verbindingen uitscheiding in de incubatie 7,9 water (en referenties daarin). Naast de effecten van de begrenzing en gewijzigd water, een grote voorspanning van incubatie technieken voort uit re-filtratie effecten (zie bijvoorbeeld 10). Hoewel sommige van deze methodologische problemen zijn overwonnen door de juiste omvang en vorm van het incubatievat 11 of de introductie van een recirculerend stolp systeem in situ 12, deze techniek vaak onderschat verwijdering en productiesnelheden. Kwantificeren van de stofwisseling van opgeloste stoffen zoals opgeloste organische stikstof (DON) en koolstof (DOC) of anorganische nutriënten, heeft bewezen bijzonder gevoelig voor vertekeningen veroorzaakt door incubatie technieken 13 worden. In de late jaren &#39;60 en vroege jaren &#39;70, Henry Reiswig9,14,15 een pionier in de toepassing van de rechtstreekse technieken om de verwijdering deeltjes te kwantificeren door reusachtige Caribbean sponzen, door afzonderlijk bemonstering van de water ingeademd en uitgeademd door de organismen in situ. Vanwege de moeilijkheid om Reiswig techniek toegepast bij kleinere suspensie feeders en meer uitdagende onderwater omstandigheden het grootste deel van het onderzoek op dit gebied was beperkt tot het laboratorium (in vitro) waarin de meeste indirecte technieken 16 incubatie. Yahel en collega&#39;s omgebouwd Reiswig directe in situ techniek om te werken in kleinere schaal omstandigheden. Hun methode, genaamd INEX 16, is gebaseerd op de gelijktijdige onderwater bemonstering van het water ingeademd (In) en uitgeademd (Ex) van ongestoorde organismen. De verschillende concentratie van een middel (bijvoorbeeld bacteriën) tussen twee monsters (INEX) een maat voor de retentie (of productie) van die stof door het dier. De Inex techniek maakt gebruik van een open einde buizen enafhankelijk van de excurrent straal door de pompende werking van het onderzochte organisme passief vervangen vaarwater in de verzamelbuis. Terwijl Yahel en collega succesvol deze techniek toegepast bij het ​​onderzoek van meer dan 15 verschillende suspensie feeders taxa (bijvoorbeeld 17), wordt de werkwijze beperkt door de hoge mate van oefening en ervaring nodig door de minuscule omvang van sommige excurrent openingen, en omstandigheden op zee. Om deze obstakels te overwinnen, ontwikkelden we een alternatieve techniek gebaseerd op gecontroleerde zuiging van de bemonsterde water door minuut buizen (uitwendige diameter van &lt;1,6 mm). Ons doel was om een eenvoudige, betrouwbare en goedkope apparaat dat schoon en gecontroleerd in situ water sampling uit een zeer specifiek punt, zou toelaten zoals de excurrent opening van bodemdieren schorsing feeders te creëren. Om effectief te zijn, heeft de werkwijze niet opdringerig zijn om te voorkomen dat de omgevingstemperatuur stromingsregiem beïnvloeden of wijzigen behavior van de bestudeerde organismen. Het apparaat hier gepresenteerd wordt genoemd VacuSIP. Het is een vereenvoudiging van het SIP is ontwikkeld door Yahel et al. (2007) 18 voor ROV-gebaseerde point sampling in de diepzee. De VacuSIP is aanzienlijk goedkoper dan de originele SIP en het is aangepast voor SCUBA-based werken. Het systeem is ontworpen volgens de principes gepresenteerd en getest door Wright en Stephens (1978) 19 en Møhlenberg en Riisgård (1978) 20 voor het laboratorium instellingen. Hoewel het VacuSIP systeem is ontworpen voor in situ studies van het metabolisme van benthische feeders suspensie kan ook worden gebruikt voor laboratoriumonderzoek en waar een gecontroleerde en schoon puntbronnen watermonster vereist. Het systeem is vooral handig wanneer de integratie gedurende langere perioden (min-uur) of in situ filtraties vereist. De VacuSIP is met succes gebruikt bij de Yahel lab sinds 2011, en ooktewerkgesteld in twee recente studies van nutriënten gemedieerd door het Caribisch gebied en de Middellandse Zee sponssoorten 21 (Morganti et al., ingediend). Het gebruik van specifieke samplers, de verlengde bemonstering, en het veld omstandigheden, waarin VacuSIP wordt toegepast, leiden tot een aantal afwijkingen van de standaard oceanografische protocollen voor het verzamelen, filteren, en het opslaan van monsters voor gevoelige analyten. Om het risico van besmetting te verminderen door het VacuSIP systeem of het risico van wijziging van de bemonsterde water door bacteriële activiteit na inzameling, testten we diverse in situ procedures filtratie en opslag. Verschillende filterinrichtingen, opvangbakken en opslaan procedures om de meest geschikte techniek voor het analyseren van opgeloste anorganische (PO 4 3- NO x -, NH4 +, SiO 4) bereiken onderzocht en organische (DOC + DON) verbindingen, en ultra-plankton (&lt;1081; m) en deeltjes organische (POC + PON) sampling. Om het risico van verontreiniging verder te verminderen, vooral onder veldomstandigheden, het aantal behandelingsstappen werd teruggebracht tot een minimum. De visueel formaat waarin de werkwijze wordt aangeboden is gericht op reproduceerbaarheid vergemakkelijken en de tijd die nodig is om de techniek efficiënt gehandeld. Systeem overzicht Monsters in situ gepompte water suspensie voeders met exhalant openingen van slechts 2 mm, wordt de pompactiviteit van elk monster eerst gevisualiseerd door het vrijgeven gefiltreerd fluoresceïne gekleurd zeewater naast de inhalatie-opening (en) en het observeren van de stroom vanaf de excurrent opening 16 (zie ook figuur 2B 18). Het water in- en uitgeademde door de studie monster (incurrent en excurrent) worden dan gelijktijdig bemonsterd met behulp van een paar minuten buizen op maat gemaakte manipulator geïnstalleerd of twee van de &quot;arms &quot;van een omgekeerde flexibele draagbare driepoot (figuur 1 en aanvullende Video 1). Het water ingeademd door de studie organisme wordt verzameld door nauwkeurig positioneren van het proximale uiteinde van een buis in of nabij de inhalatie opening van het onderzoek organisme. Een identiek buis wordt dan gepositioneerd binnen het excurrent opening. voor deze functie moet goede zorg contact of verstoring van het dier, bijvoorbeeld door sediment resuspensie voorkomen. de bemonstering beginnen een duiker doorboort een septum in het verzamelvat met een injectienaald aan de distale uiteinde van elke buis, zodat de uitwendige waterdruk in de steekproef er water in het vat door de monsterbuis. de zuiging wordt geïnitieerd door het vacuüm reeds gemaakt in de flacons en het drukverschil tussen de uitwendige water en afgevoerd monsterhouder . Om te zorgen voor een schone collectie van uitgeademde water en per ongeluk opzuigen van ambi voorkomenent water 16, het water sampling rate heeft op een aanzienlijk lager tarief (&lt;10%) dan de excurrent debiet te worden gehouden. De afzuiging wordt geregeld door de lengte van de buis en de inwendige diameter (ID). De kleine inwendige diameter zorgt ook voor een verwaarloosbaar dood volume (&lt;200 pi per meter buis). Bemonstering gedurende langere tijd (minuten tot uren) kan de inherente patchiness van de meeste stoffen plaats integreren. Opdat voldoende monsters worden bewaard in langdurige onderwater bemonsteringen en voor vervoer naar het laboratorium, een in situ filtratie wordt aanbevolen voor gevoelige analyten. De selectie van de bemonstering schepen, filtratie assemblage, en slangen worden gedicteerd door de studie organismen en de specifieke onderzoeksvraag. De hieronder beschreven protocol veronderstelt dat een volledige metabolisch profiel van belang (voor een overzicht zie figuur 2). Echter, het modulaire karakter van het protocol maakt fof eenvoudige modificatie eenvoudiger of zelfs heel andere bemonsteringsschema&#39;s tegemoet te komen. Voor een volledige metabole profiel, moet de sampling protocol omvatten de volgende stappen: (1) Flow visualisatie; (2) Sampling ultra-plankton voeding (plankton &lt;10 pm); (3) Steekproef anorganische voedingsstoffen opname en excretie (met behulp van in-line filters); (4) Sampling opgeloste organische opname en excretie (met behulp van in-line filters); (5) Particulate voeden en excretie (met behulp van in-line filters); (6) Herhaal stap 2 (ultra-plankton voeden als kwaliteitscontrole); (7) Flow visualisatie. Wanneer het logistiek mogelijk is, verdient het aanbeveling het metabolische metingen worden gecombineerd met pompsnelheid (bijvoorbeeld de kleurstof voorkant snelheid werkwijze, 16) en de ademhaling metingen. Deze metingen worden het best genomen bij het begin en einde van de sessiesteekproeven. Voor de ademhaling meten, onderwater optoden of micro-elektroden de voorkeur.

<table><tbody><tr><td>GorillaPod, Original</td><td>Joby</td><td>GP000001</td><td>flexible portable tripod&nbsp;</td></tr><tr><td>Flangeless Ferrule</td><td>IDEX Health &amp; Science&nbsp;</td><td>P-200X</td><td>1/16" in Blue/pk</td></tr><tr><td>Male Nut</td><td>IDEX Health &amp; Science</td><td>P-205X&nbsp;</td><td>1/16" in Green/10&nbsp;pk</td></tr><tr><td>Female to Female Luer</td><td>IDEX Health &amp; Science&nbsp;</td><td>P-658</td><td></td></tr><tr><td>Female-Male Luer</td><td>IDEX Health &amp; Science&nbsp;</td><td>P-655</td><td></td></tr><tr><td>Peek Tubing (254&nbsp;&micro;m ID)</td><td>IDEX Health &amp; Science&nbsp;</td><td>1531</td><td>1/16" OD x 0.01&nbsp;in ID x 5&nbsp;ft lengte. Alternatieve ID kan worden gebruikt.</td></tr><tr><td>Two component resin epoxy</td><td>IVEGOR</td><td>9257</td><td>Meng de twee componenten van de hars goed door elkaar voor gebruik</td></tr><tr><td>(TOC) EPA Vials</td><td>Cole -Parmer</td><td>03756-20</td><td>40 ml glazen flacons. Ook gemaakt door Thomas Scientific (referentienummer 9711F09).</td></tr><tr><td>HDPE Vials</td><td>Wheaton</td><td>986701 (E78620)</td><td>20 ml hoge dichtheid polyethyleen flacons</td></tr><tr><td>Vacuette Z no additive</td><td>Greiner bio-one</td><td>455001</td><td>Voorverlucht door de fabrikant&nbsp;</td></tr><tr><td>Septum Sample Bottles</td><td>Thomas Scientific</td><td>1755C01</td><td>250 ml glazen flessen&nbsp;</td></tr><tr><td>Septum Cap 1</td><td>Wheaton</td><td>W240844SP (E7865R)</td><td>22-400 voor HDPE flacons&nbsp;</td></tr><tr><td>Septum Cap 2</td><td>Wheaton</td><td>W240846 (1078-5553)</td><td>24-400 voor glazen flacons en flessen. Ook gemaakt door Thermo Scientific National (ref. 03-377-42).</td></tr><tr><td>In-line stainless steel Swinney Filter holders</td><td>Pall</td><td>516-9067</td><td>13 mm diameter</td></tr><tr><td>PTFE Seal Washer</td><td>Pall&nbsp;</td><td>516-8064</td><td>ring voor roestvrijstalen filterhouders</td></tr><tr><td>TCLP Glass Filters</td><td>Pall&nbsp;</td><td>516-9126</td><td>binder-vrije glasvezelfilters, 13&nbsp;mm diameter, poriëngrootte 0.7&nbsp;&micro;m</td></tr><tr><td>Polycarbonate Filter Holders</td><td>Cole -Parmer</td><td>17295</td><td>13 mm diameter</td></tr><tr><td>Isopore Membrane Filters</td><td>Millipore</td><td>GTTP01300</td><td>13&nbsp;mm diameter, poriëngrootte 0.2&nbsp;&micro;m</td></tr><tr><td>Contrad 70 Solution&nbsp;</td><td>Decon Labs</td><td>1002</td><td>zeer goed oplosbaar basismengsel van anionisch en niet-ionische oppervlakte-actieve stofoplossing&nbsp;</td></tr><tr><td>Sterile Syringe Filters</td><td>VWR International Eurolab S.L.</td><td>514-0061P</td><td>25&nbsp;mm diameter, poriëngrootte 0.2&nbsp;&micro;m</td></tr><tr><td>Fluorescein</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>(oude ref.28802) 46955-100G</td><td>100&nbsp;g</td></tr><tr><td>Holdex, disposable,sterile</td><td>Greiner bio-one</td><td>450263</td><td>steriele, wegwerpbuishouder met afgecentreerde luer voor Vacuette</td></tr><tr><td>Sterile Needles</td><td>IcoGammaPlus</td><td>5160</td><td>0.7&nbsp;mm x 30&nbsp;mm</td></tr><tr><td>Cryovials Nalgene</td><td>Nalgene</td><td>V5007(Cat. No.5000-0020)</td><td>2&nbsp;ml</td></tr><tr><td>Cryobox carton&nbsp;</td><td>Rubilabor</td><td>M-600</td><td>145x145x55&nbsp;mm p/microtube 1.5&nbsp;ml</td></tr><tr><td>Orthophosphoric Acid</td><td>Sigma</td><td>79617 of Gebruik alternatief Ultra-Pure Hydrochloorzuur, uiteindelijke concentratie 0,1%</td><td></td></tr><tr><td>Paraformaldehyde</td><td>Sigma</td><td>P6148</td><td>500&nbsp;g</td></tr><tr><td>Glutaraldehyde</td><td>Merck</td><td>8,206,031,000</td><td>25%, 1 L</td></tr><tr><td>Hand Vacuum Pump&nbsp;</td><td>B&uuml;rkle&nbsp;</td><td>5620-2181 of Gebruik alternatief standaard laboratoriumvacuümpomp</td><td></td></tr></tbody></table>

vacusip, een verbeterde inex methode voor het<em&gt; in situ</em&gt; meten van particulate en opgeloste componenten verwerkt door active suspension voeders

VacuSIP, an Improved InEx Method for In Situ Measurement of Particulate and Dissolved Compounds Processed by Active Suspension Feeders

Benthische suspensie-voeders spelen essentiële rollen in het functioneren van mariene ecosystemen. Door grote volumes water te filteren, plankton en detritus te verwijderen en deeltjes- en opgeloste verbindingen uit te scheiden, dienen ze als belangrijke agenten voor benthische-pelagische koppeling. Nauwkeurige meting van de verbindingen die door suspensie-voeders worden verwijderd en uitgescheiden (zoals sponzen, ascidiën, polychaeten, tweekleppigen) is cruciaal voor de studie van hun fysiologie, metabolisme en voedingsecologie, en is fundamenteel om de ecologische relevantie van de nutriëntenstroom gemedieerd door deze organismen te bepalen. Echter, de beoordeling van de snelheid waarmee suspensie-voeders deeltjes- en opgeloste verbindingen in de natuur verwerken, wordt beperkt door de beperkingen van de momenteel beschikbare methodologieën. Ons doel was om een eenvoudige, betrouwbare en niet-invasieve methode te ontwikkelen die schone en gecontroleerde watermonsters vanaf een specifiek punt zou toelaten, zoals de uitstroomopening van benthische suspensie-voeders, in situ. Onze methode maakt gelijktijdige bemonstering van ingeademde en uitgeademde water van het bestudeerde organisme mogelijk door gebruik te maken van kleine buisjes geïnstalleerd op een op maat gebouwd manipulatorapparaat en zorgvuldig gepositioneerd in de uitstroomopening van het bemonsterde organisme. Door een septum op het opvangvat met een spuitnaald te doorboren die aan het uiteinde van elke buis is bevestigd, kan de externe druk het bemonsterde water langzaam door de bemonsteringsbuis in het vat forceren. De langzame en gecontroleerde bemonsteringssnelheid maakt het mogelijk om de inherente ongelijkmatigheid in het water te integreren terwijl een bemonstering vrij van besmetting wordt gegarandeerd. We geven aanbevelingen voor de meest geschikte filterapparaten, opvangvat en opslagprocedures voor de analyse van verschillende deeltjes- en opgeloste verbindingen. Het VacuSIP-systeem biedt een betrouwbare methode voor de kwantificering van ongestoorde suspensie-voedermetabolisme in natuurlijke omstandigheden die goedkoop en gemakkelijk te leren en toe te passen is om de fysiologie en functionele rol van filters in verschillende ecosystemen te beoordelen.

Optimalisatie van zeewater collectie methoden Selectie van de collector flesjes en reiniging VacuSIP-compatibele opvangbakken zou een septum die het mogelijk maakt de bemonstering te worden geïnitieerd door piercing met een injectienaald te hebben. Ze moeten de verhoogde onderwater druk (2-3 bar bij typische scuba werkdiept...

We introduceren de VacuSIP, een eenvoudige, niet-invasieve en betrouwbare methode voor schoon en nauwkeurig puntsampling van water. Het systeem werd ontwikkeld en geëvalueerd voor de gelijktijdige verzameling van het water dat wordt ingeademd en uitgeademd door benthische suspensie-voeders in situ, om de verwijdering en uitscheiding van deeltjes en opgeloste verbindingen schoon op te meten.

VacuSIP, een verbeterde INEX Methode voor het<em&gt; In Situ</em&gt; Meten van Particulate en opgeloste componenten verwerkt door Active Suspension Voeders

Benthic suspension feeders play essential roles in the functioning of marine ecosystems. By filtering large volumes of water, removing plankton and ...

Het algemene doel van deze methode is het reinigen van de opvangbak van het water dat door benthische suspensievoeders onder natuurlijke omstandigheden is ingeademd en uitgeademd, zodat de partikelvormige en opgeloste verbindingen die zij hebben verwijderd en uitgescheiden kunnen worden gekwantificeerd. Gebruik bij het voorbereiden van opvangvaten voor de analyse van opgeloste organische stoffen en ammoniak nieuwe, vooraf gereinigde EPA-buisjes. Gebruik voor het bemonsteren van andere nutriënten EPA-glazen buisjes.Gebruik HDPE-buisjes voor silicaat. Spoel de buisjes en doppen met hoogwaardig dubbel gedestilleerd water. Vervang vervolgens doorboorde siliconen septa door nieuwe en week de buisjes en doppen gedurende ten minste drie dagen in 10% zoutzuur, gevolgd door drie spoelbeurten met hoogwaardig dubbel gedestilleerd water.Om de glazen vials verder voor te bereiden op de nutriënten, worden deze vier uur lang bij 450 °C verbrand en vervolgens in de oven afgekoeld. Plaats daarna de doppen en wikkel de vials in aluminiumfolie. Meng vervolgens DDW met een surfactant gefilterd door een 0,2 micron filter om de vijf procent oplossing te bereiden.Plaats nu een verbrand bindelmiddel-vrij

vacusip-an-improved-inex-method-for-situ-measurement-particulate

Research

JoVE Journal

Environment

Milieu

Dit protocol bevat instructies over hoe je een self-contained onder water velocimetry apparaten (SCUVA), die is ontworpen voor de kwantificering van de in situ dieren gegenereerde stroom te gebruiken. Daarnaast, dit protocol adressen uitdagingen van de veldomstandigheden, en omvat operator beweging, voorspellen positie van het dier, en oriëntatie van SCUVA.

Kwantitatief meten In situ Stromen met behulp van een self-contained Underwater Velocimetry Apparatus (SCUVA)

Hier presenteren we een elektrofysiologische methode gebaseerd op vaste drager membranen met de nadruk op de toepassing daarvan voor de karakterisering van elektrogene membraan transporters.

Inleiding tot de vaste Ondersteunde Membrane Gebaseerd Electrofysiologie

In dit werk wordt een praktische handleiding verstrekt waarin de verschillende stappen beschreven worden om de koppeling van SMPS en ICPMS systemen te bepalen en hoe ze te gebruiken. Drie beschrijvende voorbeelden worden voorgesteld.

Een praktische handleiding voor het koppelen van een scanningsmobiliteitsversterker en inductief gekoppelde plasma-massaspectrometer (SMPS-ICPMS)

Door in situ vloeistof Scanning elektronen microscopie presenteren we een procedure voor real-time beeldvorming en elementaire samenstelling analyse van böhmiet deeltjes in gedeïoniseerd water.

In Situ Karakterisering van böhmiet deeltjes in het Water met behulp van vloeibare SEM

Een doorstroom apparaat voor het gebruik van de biodeposition-methode te kwantificeren filtratie en voeding gedrag van tweekleppige weekdieren is bewerkt voor gebruik aan boord. Een tabel van de tweedimensionale gimbal gebouwd rond het apparaat isoleert het apparaat van de beweging van de boot, waardoor de nauwkeurige kwantificering van tweekleppige filtratie variabelen op offshore schelpdieren aquacultuurinstallaties.

Ontwerp en gebruik van een apparaat voor het kwantificeren van tweekleppige schorsing voeding op zee

Hier presenteren we een protocol te voeren draagbare cellulaire aërosol belichtingen en meten van de cellulaire reactie. De methode maakt gebruik van cellen, geteeld op de lucht-vloeistof-interface, het nabootsen van in vivo fysiologie. Cellulaire reactie op koperen nanoparticle aërosolen werd waargenomen als oxidatieve stress door middel van reactieve zuurstof soorten generatie en cytotoxiciteit als lactaat dehydrogenase release.

Een nieuwe draagbare In Vitro blootstelling Cassette voor aërosol bemonstering

Dit protocol beschrijft de extractie van vluchtige organische stoffen uit een biologisch monster met de vacuümondersteunde sorptiemiddelextractiemethode, gaschromatografie in combinatie met massaspectrometrie met behulp van de Entech Sample Preparation Rail en data-analyse. Het beschrijft ook de kweek van biologische monsters en stabiele isotooponderzoek.

Het vastleggen van actief geproduceerde microbiële vluchtige organische stoffen uit mens-geassocieerde monsters met vacuümondersteunde sorptie-extractie

Een hangende drop surface filmbalans geïmplementeerd met een multi-subfase uitwisseling, bijgenaamd de OCTOPUS, maakt het mogelijk om spijsverteringsproblemen na te bootsen door de sequentiële subfase-uitwisseling van de originele bulkoplossing met gesimuleerde gastro-intestinale vloeistoffen. De gesimuleerde in vitro vertering wordt gemonitord door in situ de interfaciale spanning van de verteerde interfaciale laag te registreren.

In vitro Vertering van emulsies in een enkele druppel via multi-subfase-uitwisseling van gesimuleerde gastro-intestinale vloeistoffen

Als analytische techniek lijdt nanoimpact-elektrochemie, een steeds belangrijkere benadering van het tellen en karakteriseren van elektro-inactieve deeltjes op nanometerschaal, aan slechte precisie als gevolg van de heterogene stroomverdelingen die voortvloeien uit het gebruik van ultramicro-elektroden. Hier wordt een algemene benadering beschreven, genaamd "elektrokatalytische onderbreking", die de precisie bij dergelijke metingen verbetert.

Nauwkeurige elektrochemische dimensionering van individuele elektro-inactieve deeltjes

EPA-methode 1615 gebruikt een elektropositieve filter om enterovirussen en norovirusessen te concentreren in milieu- en drinkwater. Dit manuscript beschrijft de procedure voor het verzamelen van monsters voor analyse volgens Methode 1615.

EPA Method 1615. Meting van Enterovirus en Norovirus Voorkomen in water per cultuur en RT-qPCR. I. Het verzamelen van Virus Samples

Leer de VacuSIP-methode voor het meten van partikels en opgeloste stoffen bij benthische suspension feeders. Deze techniek verzamelt geïnhaleerd en geëxhaleerd water zonder contaminatie.

VacuSIP, een verbeterde INEX Methode voor het In Situ Meten van Particulate en opgeloste componenten verwerkt door Active Suspension Voeders (Video) | JoVE Journal

VacuSIP, een verbeterde INEX Methode voor het

Meer video's verkennen