Name: Sublimatie van DAN Matrix voor de detectie en Visualisatie van gangliosiden in Rat Brain Tissue voor MALDI Imaging Mass Spectrometry (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-03-23T13:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 36 s
Description: Leer een sublimatieprotocol voor de detectie van gangliosiden in rattenhersenweefsel met MALDI-beeldmassaspectrometrie. Deze methode biedt inzicht in de anatomische verdeling en functie van lipiden in gezonde en pathologische hersenen.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

We willen de technische assistentie van Kristina Jurcic in het University of Western Ontario MALDI MS-faciliteit erkennen, evenals de National Sciences and Engineering Council (NSERC) voor het financieren van dit werk. De auteurs willen ook de Caprioli-groep (Vanderbilt University, TN) en Chaurand-groep (Université de Montreal, QC) danken voor hun advies bij het optimaliseren van de sublimatietechniek die in dit manuscript wordt gepresenteerd.

Alle handling dier procedures beschreven onder zich te houden aan de University of Western Ontario&#39;s dierverzorging comité (2016-014). 1. Tissue Voorbereiding en Sectioning <ol><li> Uittreksel hersenweefsel van de rat door middel van een proces dat bekend staat als &quot;Fresh Frozen Extraction&quot; (FFE). <ol><li> Euthanaseren de rat met een overdosis natriumpentobarbital en bewaken reflexen in de ledematen. Zodra alle reflexen hebben opgehouden, sever het hoofd van de rat met behulp van een guillotine. </li><li> Zorgvuldig scheiden de spieren en andere weefsels van de schedel met behulp van een scalpel. Gebruik bot snijden tang om de schedel te breken naar de hersenen bloot vanaf de basis van de schedel (foramen magnum) aan het voorste gedeelte. </li><li> Zodra de hersenen wordt blootgesteld, schep het uit met een chirurgische spatel en onmiddellijk te plaatsen op gemalen droog ijs voor Snelkoeling. NB: De hersenen zal zeer kneedbaar zijn. Neem daarom uiterst voorzichtig bij het plaatsen van de hersenen opdroog ijs. Als de hersenen gebroken of tegen een oppervlak gedrukt, zal het zijn vorm veranderen en bevriezen die positie. </li></ol></li><li> Verwijder vers ingevroren weefsel (niet doorbloed met formaldehyde of ingesloten in oktober) van - 80 ° C vriezer en leg ze op droog ijs. </li><li> Plaats enkele druppels water op een cryostaat houder en plaats op zowel droog ijs of cryostaat bevriezen bar. Druk weefsel lichtjes op cryostaat houder als het begint te bevriezen en vasthouden tot water bevriest rond de basis van het weefsel en verankert deze op zijn plaats. Voeg extra water aan het weefsel verder te verzekeren dat de houder indien nodig. OPMERKING: Water wordt gebruikt in plaats van oktober media voor montage weefsel om verontreiniging van het weefsel met verbindingen die de detectie van het gewenste signaal kan beïnvloeden vermijden. </li><li> Positie weefsel in cryostaat. Sectie weefsel tot de gewenste anatomische locatie. Zorg ervoor dat de scherpe dikte tussen 8-12 urn. LET OP: bij het snijden van weefsel in de gemeenschappelijke cryostaatapparaten, is het noodzakelijk dat afzonderlijke materialen zoals bladen, borstels, stabilisatorstangen en houders worden gebruikt om verontreiniging met inbedding verbindingen voorkomen. De binnenkant van de cryostaat moet worden gereinigd grondig met ethanol voor gebruik. </li><li> Met behulp van de cryostaat anti-roll bar, langzaam gedeelte afgevlakt weefselcoupes. Gaten of markeringen op het weefsel kan optreden als de roll bar plaatsing is onjuist of mes is saai. Verplaats het weefsel naar het centrum van het snijden platform met schoon penselen. </li><li> Montage <ol><li> Freeze geleidend dia&#39;s of metalen platen door ze te plaatsen in de cryostaat, terwijl het snijden. Wanneer de schuif volledig bevroren is, zorgvuldig het doorgesneden weefsel verplaatsen naar het geleidende oppervlak van de schuif met schoon penselen. Zodra alle weefselcoupes correct geplaatst zijn op de dia, plaatst u een vinger onder de dia, tegenover het weefsel, en drukt u op totdat de sectie ontdooit. LET OP: Secties kunnen vouwen of krullen tijdens het ontdooien proces bijmet behulp van deze montage methode. Dit kan worden verminderd door het houden van de schuif in de cryostaat bij ontdooien van het weefsel. Als deze problemen problematisch worden, een alternatief, warm-mount methode is hieronder vermeld. </li><li> U kunt ook een kamertemperatuur indium-tinoxide (ITO) slide (of metalen plaat) en licht aandrukken op bevroren weefsel hoofdstuk over het snijden platform oppervlak, geleidende kant naar beneden. Dit leidt tot de weefselsectie ontdooien gelijkmatig op het oppervlak van de dia met kleine krullen of vouwen van het weefsel. LET OP: Condensatie kan verschijnen onder het gedeelte bij het monteren van het gebruik van deze methode, die kan leiden tot verlies van bepaalde eiwitten en lipiden. </li></ol></li><li> Plaats de glaasjes met weefsel in een exsiccator gedurende 5-10 min. </li></ol> 2. sublimator Apparatuur Set-up OPMERKING: Voer deze stappen in een zuurkast. <ol><li> Plaats een zandbad in een aluminium container op een hete plaat, met de hete plaat op een metalen schaarliftvan geschikte oppervlak (dat wil zeggen groter dan de hete plaat). Zet op de hete plaat en de temperatuur tot 140 ° C. Opmerking: Het smeltpunt van DAN matrix tussen 187-190 ° C. Neem niet meer dan deze temperatuur op de kookplaat. <ol><li> Wanneer de verwarmingsplaat is uitgerust met een temperatuurfeedback sonde gebruiken om zand Temperatuursensor gedurende het experiment en zorgen temperatuurconstantheid. Deze functie kan helpen met het experiment reproduceerbaarheid over verschillende sublimatie experimenten. OPMERKING: De zandbad moet worden opgenomen in een aluminium container als een glascontainer kan breken bij hoge temperaturen. </li></ol></li><li> Plaats 300 mg DAN matrix op het bodemoppervlak van sublimatie inrichting. Plaats de matrix in het midden van de inrichting en verspreid in een gelijkmatige laag heeft van ongeveer breedte en lengte van de schuif wordt gesublimeerd. LET OP: DAN matrix is ​​giftig. Daarom is het belangrijk handschoenen dragen, maskers en veiligheidbril te allen tijde bij het hanteren van de gepoederde matrix. DAN moeten worden opgeslagen in het donker is lichtgevoelig. </li><li> Tape een metaalplaat op het binnenoppervlak van de inrichting met de plaat direct contact met de bodem van de condensor, om gelijkmatige temperatuurver- koeling over het gehele oppervlak van de slede tijdens sublimatie waarborgen. Alternatief zand de bodem van de condensor een plat oppervlak te verkrijgen. <ol><li> Plaats de band langs de buitenranden van de plaat en zich aan de zijkanten van de binnenste glaswerk. Als de band onder de plaat is geplaatst en zich aan de onderzijde van het binnenste glasoppervlak, kan de temperatuurverdeling niet eens zijn en kan resulteren in ongelijkmatige verdeling over de matrix van het glaasje. </li><li> Tape een blanco (test) schuift diagonaal over het oppervlak van de metalen plaat met de band opnieuw op de buitenranden van de schuif geplaatst. </li></ol></li><li> Sluit de bovenste en onderste gedeelten van de inrichting, wet een rubberen O-ring in het midden om een ​​volledige afdichting te garanderen. </li><li> Plaats een metalen U-joint rond het centrum van de inrichting en draai sten tot de bovenste en onderste helft van de inrichting stevig tegen elkaar zijn afgedicht. Plaats de metalen O-ring boven het zandbad. </li><li> Neem een ​​handvol gemalen ijs en plaats het in de condensor. Vul condensor ¼ tot ½ vol met koud water om ijs slush creëren. Het ijs slush zal de metalen plaat afkoelen op de binnenkant van het apparaat en vervolgens de schuif gehecht aan. Wacht tenminste 5 minuten voor de temperatuur tot een steady state te bereiken. </li><li> Giet 300 ml ethanol in de koude val houder en zet het glaswerk in de houder. Drop 2-3 kleine stukjes droog ijs in de ethanol in de bodem van de koude val container. De koude val ingang heeft een glazen buis die naar de bodem van de cilinder, terwijl de uitvoer niet. </li><li> Sluit de vacuümpomp aan de koude val uitvoer via rubber slangen. Gebruik een ander stukje rubberslang aan de koude val-ingang aan de sublimatie inrichting. Zorg ervoor dat de slang stevig vast met behulp van metalen klemmen indien beschikbaar. </li><li> Gebruik de vacuümpomp een vacuüm van 30 te leveren - 50 mT. Laat de pomp zijn voor ten minste 5 minuten voor drukevenwicht. Sten op U-ring van sublimatie inrichting mogelijk opnieuw worden aangedraaid nadat de vacuümpomp wordt aangezet door verlaagde druk in de inrichting. Opmerking: Het is sterk aanbevolen dat een vacuümmeter worden bevestigd aan de pomp om de druk van het vacuüm moeten gedurende het experiment om te testen op lekken in de druk om de hoogst mogelijke reproduceerbaarheid tussen experimenten te bereiken. Echter, de meeste pompen ontworpen om een ​​constante druk te handhaven, dan kan de meter niet essentieel is voor ervaren gebruikers. Bovendien kan vacuümverpakking vet worden gebruikt om te helpen handhaven onderdruk. </li></ol> 3. Sublimatie <ol><li> Zorg ervoor dat de zandbad temperatuur heeft stabilized bij 140 ° C en dat de inrichting is vastgezet in de metalen O-ring boven het zandbad met slangen verbonden en het vacuüm ingeschakeld. </li><li> Stel timer voor 7 min, maar niet beginnen timer. Langzaam verhogen van de schaarlift en zandbad tot de sublimatie apparaat tot de U-gewricht van de sublimator is ruim boven de metalen O-ring. Deze extra ruimte maakt aanpassing van de inrichting op het zand. <ol><li> Snel op de sublimator zachtjes op het zand oppervlak zodat de inrichting gelijkmatig op het zand, en geeft de timer te starten. </li></ol></li><li> Als de timer afgaat, schakelt u de vacuümpomp en kantel de schaarlift totdat de sublimator niet meer aanraken van het zandbad en stevig zitten in de metalen O-ring. <ol><li> Draai langzaam de micro-ontluchtingsklep om de druk in de inrichting. Maak de metalen klem rond de rubber slang van de sublimatie apparatuur en langzaam beginnen aan de buis los te maken. Zodra de rubber buis is enigszins los, buig de buis naar één kant te laten aanwezige druk kan ontsnappen. </li><li> Bij omgevingsdruk terugkeert, verwijder voorzichtig de rubber slang van de sublimatie apparaat. </li></ol></li><li> Draai de ondeugden van de U-gewricht van de apparatuur en te verwijderen. scheiden voorzichtig de twee helften van de sublimatie apparaat en trek de schuif van de bovenkant van de binnenste glaswerk. Onderzoek dia matrix distributie bevestigen zelfs. Opmerking: Als matrix ongelijkmatig, kan de poedervormige matrix in de bodem van de sublimator worden verplaatst of sublimator inrichting kan worden verplaatst in het zand voor de volgende dia. De sublimatie kan enkele malen met dezelfde matrix worden herhaald, echter de matrix uiteindelijk donkerder herhaalde blootstelling aan hitte en de hoeveelheid poeder zal worden zodat de sublimatie tijd zal enigszins worden aangepast ter compensatie verlagen. Daarom is het belangrijk om de hoeveelheid matrix bei bewakenng gesublimeerd na elk experiment om de consistentie in de matrix afzetting tussen de dia&#39;s te verzekeren </li><li> Als de verspreiding hoeveelheid matrix gesublimeerde volstaat tape een nieuwe dia met weefsel aan de binnenkant van de sublimator en herhaal sectie 3. Opmerking: Voor kwaliteitscontrole (QC) doeleinden kan de hoeveelheid matrix gesublimeerde na elk experiment gemeten door weging van de schuif voor en na sublimatie en het gewicht van gesublimeerde matrijs met het oppervlak van de schuif 2 verdelen, moet worden opgemerkt dat door de onnauwkeurigheid van de meeste schalen dan 4 decimalen en variabiliteit tussen schalen, deze metingen worden alleen gebruikt leidraad voor optimale matrixafzetting in tegenstelling tot een geheel worden berekend middels QC tenzij een precisiebalans wordt gebruikt (zie figuur 3). </li></ol> 4. Tissue Opslag / Rehydratatie <ol><li> Na de sublimatie, op te slaan dia&#39;s in een afgesloten container of een kleine cassette in verzegelde plastic zak. </li><li> Incubeer dia&#39;s in -20 ° C vriezer gedurende 2 uur of &#39;s nachts. Opmerking: Het doel van het invriesproces is om als rehydratatie stap voor de desorptie van weefsel materialen in de matrix. Het vriesproces werd ook aangetoond dat de afbraak van lipide signalen voor maximaal 1 week voorkomen wanneer bewaard bij -80 ° C 12. Daarom kan de hoeveelheid tijd die de monsters in de vriezer opgeslagen worden gevarieerd om een ​​zekere mate aan de behoeften van de onderzoeker te passen zonder noemenswaardige verandering signaaldetectie (zoals waargenomen in ons laboratorium). We hebben echter enige verkleuring matrix opgemerkt wanneer monsters worden ingevroren langer dan 24 uur bij -20 ° C. Zo adviseren we de beeldvorming van de gesublimeerde weefsel vóór die tijd of het opslaan van weefsel bij -80 ° C voor langere periodes incubatie. </li><li> Verwijder dia&#39;s uit diepvries (en container) en plaats in een exsiccator voor 5-10 min. </li></ol> 5. Imaging en ANALYSE <ol><li> Verwijder dia&#39;s uit exsiccator en instrument normen van toepassing zijn op de nauwkeurigheid van massa van MALDI instrument te garanderen tijdens de beeldvorming. Het type normen variabel instrumentatie. Normen zijn over het algemeen gelijkmatig over de gehele slide, omringende weefsel af te beelden (Figuur 3D). </li><li> Plaats dia in MALDI instrument en volg de instructies van de fabrikant voor de beeldvorming experimenten (instrument methoden moeten worden geoptimaliseerd voor een 1000 - 2000 massabereik). Representatief resultaat (figuur 4) werd overgenomen in reflectron negatieve modus met een 70 micrometer raster en 20 shots / spectrum (acquisitie tijd ~ 2 uur). </li></ol>

<ol><li>Hankin, J. A., Barkley, R. M., Murphy, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sublimation+as+a+method+of+matrix+application+for+mass+spectrometric+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Am.+Soc.+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">Sublimation as a method of matrix application for mass spectrometric imaging.</a> J. Am. Soc. Mass Spectrom. 18, 1646-1652 (2007).</li>
<li>Thomas, A., Charbonneau, J. L., Fournaise, E., Chaurand, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sublimation+of+new+matrix+candidates+for+high+spatial+resolution+imaging+mass+spectrometry+of+lipids%3A+enhanced+information+in+both+positive+and+negative+polarities+after+1%2C5-diaminonapthalene+deposition%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Chem%22%5BJournal%5D)">Sublimation of new matrix candidates for high spatial resolution imaging mass spectrometry of lipids: enhanced information in both positive and negative polarities after 1,5-diaminonapthalene deposition.</a> Anal. Chem. 84, 2048-2054 (2012).</li>
<li>Caughlin, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Increased+Expression+of+Simple+Ganglioside+Species+GM2+and+GM3+Detected+by+MALDI+Imaging+Mass+Spectrometry+in+a+Combined+Rat+Model+of+A%CE%B2+Toxicity+and+Stroke%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Increased Expression of Simple Ganglioside Species GM2 and GM3 Detected by MALDI Imaging Mass Spectrometry in a Combined Rat Model of Aβ Toxicity and Stroke.</a> PLoS ONE. 10, 0130364(2015).</li>
<li>Weishaupt, N., Caughlin, S., Yeung, K., Whitehead, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Differential+Anatomical+Expression+of+Ganglioside+GM1+Species+Containing+d18%3A1+or+d20%3A1+Sphingosine+Detected+by+MALDI+Imaging+Mass+Spectrometry+in+Mature+Rat+Brain%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Neuroanatomy%22%5BJournal%5D)">Differential Anatomical Expression of Ganglioside GM1 Species Containing d18:1 or d20:1 Sphingosine Detected by MALDI Imaging Mass Spectrometry in Mature Rat Brain.</a> Front Neuroanatomy. 9 (155), (2015).</li>
<li>Whitehead, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+Mass+Spectrometry+Detection+of+Gangliosides+Species+in+the+Mouse+Brain+following+Transient+Focal+Cerebral+Ischemia+and+Long-Term+Recovery%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Imaging Mass Spectrometry Detection of Gangliosides Species in the Mouse Brain following Transient Focal Cerebral Ischemia and Long-Term Recovery.</a> PLoS ONE. 6 (6), 20808(2011).</li>
<li>Fuchs, B., Süß, R., Schiller, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+update+of+MALDI-TOF+mass+spectrometry+in+lipid+research%5BTitle%5D)+AND+%22Progress+in+Lipid+Research%22%5BJournal%5D)">An update of MALDI-TOF mass spectrometry in lipid research.</a> Progress in Lipid Research. 49, 450-475 (2010).</li>
<li>Barceló-Coblijn, G., Fernández, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mass+spectrometry+coupled+to+imaging+techniques%3A+the+better+the+view+the+greater+the+challenge%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Physiol%22%5BJournal%5D)">Mass spectrometry coupled to imaging techniques: the better the view the greater the challenge.</a> Front Physiol. 6 (3), 1-5 (2015).</li>
<li>Angel, P. M., Spraggins, J. M., Baldwin, H. S., Caprioli, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Enhanced+sensitivity+for+high+spatial+resolution+lipid+analysis+by+negative+ion+mode+matrix+assisted+laser+desorption+ionization+imaging+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Chem%22%5BJournal%5D)">Enhanced sensitivity for high spatial resolution lipid analysis by negative ion mode matrix assisted laser desorption ionization imaging mass spectrometry.</a> Anal. Chem. 84, 1557-1564 (2012).</li>
<li>Murphy, R. C., Hankin, J. A., Barkley, R. M., Zemski Berry, K. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MALDI+imaging+of+lipids+after+matrix+sublimation%2Fdeposition%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim.+Biophys.+Acta%22%5BJournal%5D)">MALDI imaging of lipids after matrix sublimation/deposition.</a> Biochim. Biophys. Acta. 1811, 970-975 (2011).</li>
<li>Jaskolla, T. W., Karas, M., Roth, U., Steinert, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+between+vacuum+sublimed+matrices+and+conventional+dried+droplet+preparation+in+MALDI-TOF+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Am.+Soc.+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">Comparison between vacuum sublimed matrices and conventional dried droplet preparation in MALDI-TOF mass spectrometry.</a> J. Am. Soc. Mass Spectrom. 20, 1104-1115 (2009).</li>
<li>O'Rourke, M. B., Raymond, B. B., Djordjevic, S. P., Padula, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+versatile+cost-effective+method+for+the+analysis+of+fresh+frozen+tissue+sections+via+matrix-assisted+laser+desorption%2Fionisation+imaging+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Rapid+Commun.+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">A versatile cost-effective method for the analysis of fresh frozen tissue sections via matrix-assisted laser desorption/ionisation imaging mass spectrometry.</a> Rapid Commun. Mass Spectrom. 29, 637-644 (2015).</li>
<li>Patterson, N. H., Thomas, A., Chaurand, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Monitoring+time-dependent+degradation+of+phospholipids+in+sectioned+tissues+by+MALDI+imaging+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">Monitoring time-dependent degradation of phospholipids in sectioned tissues by MALDI imaging mass spectrometry.</a> J Mass Spectrom. 49, 622-627 (2014).</li>
<li>Cheng, H., Sun, G., Yang, K., Gross, R. W., Han, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Selective+desorption%2Fionization+of+sulfatides+by+MALDI-MS+facilitated+using+9-aminoacridine+as+matrix%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Lipid+Res%22%5BJournal%5D)">Selective desorption/ionization of sulfatides by MALDI-MS facilitated using 9-aminoacridine as matrix.</a> J. Lipid Res. 51, 1599-1609 (2010).</li>
<li>Puolitaival, S. M., Burnum, K. E., Cornett, D. S., Caprioli, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Solvent-free+matrix+dry-coating+for+MALDI+imaging+of+phospholipids%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Am.+Soc.+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">Solvent-free matrix dry-coating for MALDI imaging of phospholipids.</a> J. Am. Soc. Mass Spectrom. 19, 882-886 (2008).</li>
<li>Chaurand, P., Cornett, D., Angel, P., Caprioli, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((From+Whole-body+Sections+Down+to+Cellular+Level%2C+Multiscale+Imaging+of+Phospholipids+by+MALDI+Mass+Spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Proteomics%22%5BJournal%5D)">From Whole-body Sections Down to Cellular Level, Multiscale Imaging of Phospholipids by MALDI Mass Spectrometry.</a> Mol Cell Proteomics. 10, (2011).</li>
<li>Grove, K. J., Frappier, S. L., Caprioli, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Matrix+pre-coated+MALDI+MS+targets+for+small+molecule+imaging+in+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Am.+Soc.+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">Matrix pre-coated MALDI MS targets for small molecule imaging in tissues.</a> J. Am. Soc. Mass Spectrom. 22, 192-195 (2011).</li>
<li>Yang, J., Caprioli, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Matrix+precoated+targets+for+direct+lipid+analysis+and+imaging+of+tissue%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Chem%22%5BJournal%5D)">Matrix precoated targets for direct lipid analysis and imaging of tissue.</a> Anal. Chem. 85, 2907-2912 (2013).</li>
<li>Gemperline, E., Rawson, S., Li, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimization+and+comparison+of+multiple+MALDI+matrix+application+methods+for+small+molecule+mass+spectrometric+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Chem%22%5BJournal%5D)">Optimization and comparison of multiple MALDI matrix application methods for small molecule mass spectrometric imaging.</a> Anal. Chem. 86, 10030-10035 (2014).</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

Dit werk Gegevens een gestandaardiseerd protocol matrix sublimatie op weefsel voor het detecteren van negatief geladen lipiden, zoals gangliosiden, in MALDI IMS experimenten. Monstervoorbereiding voor MALDI IMS is zeer variabel en worden aangepast aan de unieke eigenschappen van het analyt te passen. De toepassing van de matrix op weefselmonster oppervlak een cruciaal aspect van de monstervoorbereiding proces met betrekking tot de kwaliteit van de resultaten in IMS. Bijzondere aandacht dient te worden genomen bij het se...

Matrix-geassisteerde laserdesorptie / ionisatie (MALDI) Imaging Mass Spectrometry (IMS) is steeds een zeer gewilde techniek voor visualisatie van de ruimtelijke verdeling van lipiden, peptiden en eiwitten over intact monster oppervlakken. MALDI IMS werd voorheen een analytische techniek voor pre-gezuiverde analyten, maar de laatste jaren, is de aandacht in vele disciplines vanwege de mogelijkheid om de nauwkeurigheid van massaspectrometrie in combinatie met hoge resolutie visuele / anatomische referentiepunten zonder behoefte aan externe labeling. De wetenschappelijke onderzoekerswereld gebruik van deze techniek blijft groeien, is er meer behoefte aan gestandaardiseerde, gemakkelijk te volgen protocollen om te helpen bij de ontwikkeling en optimalisatie van IMS experimenten. Gangliosiden, een groep van membraanlipiden veel voorkomt in het centrale zenuwstelsel, zijn geschikt voor MALDI IMS experimenten hun locatie, ingebed in het membraan zorgt ervoor species onmogelijk op te sporen met behulp van conventionele Immuno-labeling. Bovendien hebben we aangetoond, middels MALDI IMS, dat deze lipiden, die functioneren als modulatoren van celsignalering, onder andere, hebben unieke anatomische verspreidingspatroon in de gezonde knaagdierhersenen die gewijzigd na hersenletsel 3, 4, 5. Gangliosiden worden bij een hogere massabereik vergelijking met de meeste soorten lipiden, en dus best overeenstemt met de MALDI imaging platform. <img alt="Figuur 1" src="/files/ftp_upload/55254/55254fig1.jpg" /> Figuur 1: Workflow van MALDI IMS Experiment. Diagram van de algemene workflow van een MALDI IMS experiment met behulp van sublimatie. Weefsel ingevroren bij -80 ° C is verdeeld in een cryostaat en 10 urn secties zijn ontdooien gemonteerd op geleidende ITO slides. Het objectglaasje wordt vervolgens in een exsiccator tot sublimatie. Slides worden in de sublimatie-inrichting en een gelijkmatige laag matrix wordt toegepast op het weefsel monsteroppervlak. De monsters worden gedurende de nacht ingevroren in een -20 ° C vriezer daarna in een exsiccator geplaatst gedurende 10 min. Zodra normen zijn toegepast, worden de monsters ingebracht in de MALDI instrument waarbij een laser is gericht aan de overkant van het weefsel veroorzaakt gedesorbeerde moleculen in de matrix te ioniseren. De ionen reizen naar beneden een vlucht buis en apart op basis van hun massa (time-of-flight / TOF) totdat ze de detector bereiken. De gegevens over de ionische overvloed van analyten binnen een vooraf bepaalde massa-tot-lading (m / z) bereik wordt als zowel een molecuulgewicht beeld en massaspectrum. Deze gegevens kunnen worden gebruikt om zowel visualiseren en kwantificeren van de ionische overvloed van de analyt van belang in het afgebeelde weefsel. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55254/55254fig1large.jpg" target="_blank">Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.</a> monstervoorbereidingvoor MALDI IMS is zeer variabel als elke stap van het proces moet worden aangepast aan de analyten. Het kenmerk van MALDI-gebaseerde experimenten is het gebruik van een matrix bekleding op het monsteroppervlak vóór de analyse afgezet. Naast de rol absorberen en overdragen stralingsenergie van de laser gedurende het ablatieproces, de matrix dient ook om diverse analyten te isoleren van het monster, waardoor de analyse van de van belang zijnde verbindingen 6, 7 vergemakkelijkt. Homogene toepassing van de matrix op het monsteroppervlak is de meest cruciale stap in het monster bereidingsproces. Onjuiste matrixafzetting kan leiden tot grote heterogene matrix kristalformaties en de ontwikkeling van artefacten, lage ion-signaal en slechte reproduceerbaarheid 7. Door de affiniteit van bepaalde matrices specifieke analyten te isoleren, het type matrix gekozen voor een experiment kanaanzienlijke verandering van de uitkomst. De matrices voor beeldvorming van eiwitten en peptiden dikwijls verschillen van die welke voor de beeldvorming lipiden en het proces wordt verder bemoeilijkt door de behoefte aan aanvullende procedures zoals wassen en rehydratatie stappen om signalen uit weefsel succesvol detecteren. Hoewel wasstappen aanwezig voor de verhoging van lipide signalen 8, zij geen voorwaarde voor het detecteren van de meeste soorten lipiden. Bij het selecteren van een matrijs voor een lipide imagingexperiment, is het belangrijk om de polariteit van het lipide van belang, omdat dit gegeven moment het bereik van geschikte matrices beperken. Bijvoorbeeld gangliosiden bevatten siaalzuurresten waardoor ze een algemene negatieve polariteit geven. Er zijn een aantal matrices die effectief kan desorberen en ioniseren gangliosiden uit weefsel; evenwel moeten factoren als matrix afgeleide pieken in het spectrum en de stabiliteit van de matrix onder vacuüm behandeling genomen. 1,5-diaminonapthalene (DAN) matrix voldoende stabiel onder vacuüm instrument voor de meeste beeldvormende toepassingen en heeft een hoge mate van gevoeligheid voor lipide desorptie aangetoond en kan worden gebruikt voor de analyse van lipiden in zowel positieve als negatieve ion modus 2. DAN matrix, in vergelijking met andere negatieve lipide affiniteitsmatrices zoals dihydroxybenzoëzuur (DHB), 9-aminoacridine (9-AA) en 5-chloor-2-mercaptobenzothiazol (CMBT), kon gangliosiden uit rattenhersenen meest efficiënt desorberen weefsel in negatieve ionen-modus (manuscript in voorbereiding). Het selecteren van de juiste methode van matrix afzetting is van even groot belang voor de keuze van de matrix zelf. Natte matrixafzetting methoden waarbij de vaste matrix wordt opgelost in een organisch oplosmiddel, en afgezet door pneumatische of geautomatiseerde sproeiers of spotters, zijn bijzonder effectief voor de desorptie van eiwitten en peptiden als de vloeistof doordringt het monster mogelijk te maken extractie van verbindingen en co-kristallisatie met de matrix. Hoewel deze technieken ook kunnen worden gebruikt voor lipide toepassingen analyt delocalisatie en onregelmatige matrix kristalformaties gemeenschappelijk gebeurtenissen vanwege de hoge dichtheid en oplosbaarheid van lipiden in oplosmiddelen, met name in weefsel 2, 9. Omdat lipiden gemakkelijk geïoniseerd uit weefsel, droge matrix depositietechnieken, zoals sublimatie, bieden een eenvoudige, kosteneffectief alternatief voor spuitmachines te omzeilen vele nadeel van deze technieken. Het succes van sublimatie in MALDI IMS experimenten wordt toegeschreven aan functies zoals microkristallijne matrix morfologie met een oppervlakte van matrix-bindende analyt verhoogt, verhoogde zuiverheid matrix en homogeen matrixafzetting leidt tot verhoogde reproduceerbaarheid in vergelijking met natte matrix technieken 1, 10. sublimatie involves het verwarmen van een poedervormig matrix onder vacuüm onmiddellijk onder een gekoelde monster oppervlak resulteert in een vaste stof naar gas-fase-overgang van de gepoederde matrix gevolgd door afzetting op het weefselmonster oppervlak. Tijdens sublimatie kan matrixafzetting worden geregeld door factoren zoals tijd, temperatuur en druk zeer reproduceerbare resultaten opleveren. Eén sublimatie experiment kan variëren van 5 tot 20 minuten afhankelijk van het type matrix gekozen, die kan worden hergebruikt meerdere malen voor verwijdering. De inrichting kan commercieel worden gekocht bij een fractie van de prijs van automatische sproeiers en gemakkelijk uit elkaar gehaald voor reiniging en onderhoud. De lage kosten en relatieve eenvoud van deze matrix depositie techniek maakt het ideaal voor onderzoekers beginnen of uit te breiden op lipide imaging toepassingen in MALDI IMS. Hoewel de informatie detaillering protocollen voor sublimatie van weefsels voor IMS zijn gemeld 11, enkele gestandaardiseerde protocollen bestaan which focus op de basiswerkstroom betrokken bij het uitvoeren van een experiment voor het afbeelden sublimatie hoogmis lipiden in de negatieve ion modus, waardoor het moeilijk om de techniek te vestigen zonder uitgebreide trial and error. Het volgende is een experimentele protocol als doel om die kloof voor de sublimatie van DAN matrix op hersenen van de rat secties voor hoge resolutie beeldvorming en detectie van gangliosiden vullen. <img alt="Figuur 2" src="/files/ftp_upload/55254/55254fig2.jpg" /> Figuur 2: de sublimatie Apparatuur. Foto (A) en schema (B) van de sublimatie-inrichting. De vacuümpomp is verbonden met rubberen slang aan een koude val gevuld met 300 ml ethanol. De koude val wordt dan verbonden met rubberen slang aan op de sublimatie apparaat. De inrichting bestaat uit twee afzonderlijke stukken glaswerk die aan elkaar afgedicht met een metalen U-joint. De bovenste helft van het sublimatorbevat de condensator die is gevuld met ijs slush. De monsterplaat wordt geplakt op de bodem van de condensor, in het afgesloten glazen inrichting. De onderste helft van de sublimatie apparaat bevat de DAN matrix, verspreid gelijkmatig tegenover het monster plaat. Tijdens sublimatie, wordt het glaswerk geplaatst op een zandbad verwarmd tot 140 ° C door een hete plaat eronder. De temperatuursensor helpt om een ​​stabiele temperatuur in de sublimatie experiment door middel van feedback van de zand badtemperatuur vergeleken met de ingestelde temperatuur voor het experiment. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55254/55254fig2large.jpg" target="_blank">Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.</a>

<table><tbody><tr><td>Sublimator</td><td>Chemglass Life Sciences</td><td>CG3038-01</td><td></td></tr><tr><td>1,5-Diaminonaftaleen (DAN) matrix</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>D21200&nbsp;</td><td>100 G</td></tr><tr><td>Cryostat</td><td>Thermo-Fisher Scientific</td><td></td><td>CryoStar NX50</td></tr><tr><td>Verwarmingsplaat met temperatuurfeedback</td><td>Thermo-Fisher Scientific</td><td>HP88857290</td><td>Isotemp ADVD 7x7 HP 100 - 120 V</td></tr><tr><td>Roestvrijstalen aansluiting</td><td>Thermo-Fisher Scientific</td><td>2216479</td><td>10x10</td></tr><tr><td>Koudval</td><td></td><td></td><td>Op locatie gebouwd op maat</td></tr><tr><td>Vacuumpomp</td><td>Franklin Electric</td><td>1102180403</td><td>Savant VP100 Tweedeurs</td></tr><tr><td>Indium-tin-oxide (ITO) platen</td><td>Hudson Surface Technology</td><td>PSI 1111000</td><td>type II, 1,1 mm/25 stuks</td></tr><tr><td>MALDI TOF/TOF 5800 Instrument</td><td>AB Sciex</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Exsiccator</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>D2797</td><td>tafelexsiccator</td></tr></tbody></table>

sublimatie van dan matrix voor de detectie en visualisatie van gangliosiden in rat brain tissue voor maldi imaging mass spectrometry

Sublimation of DAN Matrix for the Detection and Visualization of Gangliosides in Rat Brain Tissue for MALDI Imaging Mass Spectrometry

Steekproef voorbereiding is essentieel voor een optimale detectie en visualisatie van analyten in matrix-geassisteerde laserdesorptie / ionisatie (MALDI) Imaging Mass Spectrometry (IMS) experimenten. Het bepalen van de juiste protocol te volgen door het monster bereidingswerkwijze kan moeilijk zijn omdat elke stap moet worden geoptimaliseerd om te voldoen aan de unieke eigenschappen van de analyten. Dit proces omvat niet alleen het vinden van een compatibele matrix die kunnen desorberen en efficiënt ioniseren van de moleculen van belang, maar ook het selecteren van de geschikte matrix depositietechniek. Bijvoorbeeld, een natte matrixafzetting techniek, die inhoudt het oplossen van een matrix oplosmiddel superieur voor desorptie van de meeste eiwitten en peptiden, terwijl droge matrixafzetting technieken zijn bijzonder effectief voor ionisatie van lipiden. Sublimatie is gerapporteerd als een zeer efficiënte droge matrixafzetting voor de detectie van lipiden in weefsel door MALDI IMS vanwege de homogeneity van matrix kristallen afzetting en minimale analyseren delokalisatie in vergelijking met veel natte depositie methoden 1, 2. Algemeen gaat het om een ​​monster en gepoederde matrix in een vacuüm afgedichte kamer met gedrukt tegen een koud oppervlak monsters. De inrichting wordt vervolgens neergelaten in een verwarmd bad (zand of olie), waardoor sublimatie poedervormig matrix op het gekoelde oppervlak weefselmonster. Hier beschrijven we een sublimatie protocol via 1,5-diaminonaftaleen (DAN) matrix voor de detectie en visualisatie van gangliosiden in de rattenhersenen middels MALDI IMS.

Na voltooiing van de sublimatie experiment worden de twee helften van het glaswerk gescheiden in de zuurkast en de slede met plakband aan de condensor kan worden verwijderd (figuur 3A). Op dit punt moet de schuif worden onderzocht op ongelijke verdeling matrix en de tijd, temperatuur, of plaatsing van de inrichting in het zandbad kunnen moeten worden aangepast voor de volgende dia. Een succesvolle DAN sublimatie experiment resulteert in een gelijkmatige laag van grijze /...

Een protocol voor de sublimatie van de DAN-matrix op rattenhersenweefsel voor de detectie van gangliosiden met behulp van MALDI Imaging Mass Spectrometry wordt gepresenteerd.

Sublimatie van DAN Matrix voor de detectie en Visualisatie van gangliosiden in Rat Brain Tissue voor MALDI Imaging Mass Spectrometry

Sample preparation is key for optimal detection and visualization of analytes in Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization (MALDI) Imaging Mass ...

Het algemene doel van dit sublimatieprotocol is om een gedetailleerd en eenvoudig te volgen proces voor monstervoorbereiding te bieden voor de detectie van gangliosiden in MALDI-imaging massaspectrometrie-experimenten. Deze methode kan helpen bij het beantwoorden van belangrijke vragen binnen het veld van de neurobiologie, waaronder de anatomische distributie en functie van gangliosiden, zowel in het gezonde brein als bij hersenpathologie. Het belangrijkste voordeel van deze techniek is dat deze met enkele wijzigingen in het protocol kan worden aangepast voor hoogwaardige imaging van vele lipidensoorten.Om deze procedure te starten, extraheert u het hersenweefsel van de rat en bereidt u dit voor op cryostatisch snijden zoals beschreven in het tekstprotocol. Plaats vervolgens het weefsel in de cryostaat. Snijd het weefsel tot de gewenste anatomische locatie.Zorg ervoor dat de snijdikte tussen 8 en 12 micron ligt. Gebruik de anti-rolstang van de cryostaat om de vlakke weefselcoupe langzaam in secties te snijden. Gaten of markeringen in het weefsel kunnen ontstaan als de rolstang onjuist is geplaatst of als het mes bot is.Verplaats het weefsel met schone schilderskwasten naar het midden van het snijplatform. Om het weefsel in kaart te brengen, worden geleidende objectglazen of metalen platen bevroren door deze tijdens het snijden in de cryostaat te plaatsen. Wanneer het objectglas volledig bevroren is, wordt de weefselcoupe voorzichtig met schone schilderskwasten naar het geleidende oppervlak van het objectglas verplaatst.Zodra alle weefselcoupes correct op het objectglas zijn gepositioneerd, plaatst u een vinger onder het objectglas tegenover het weefsel en drukt u dit aan totdat de coupe is ontdooid. Plaats de objectglazen met weefsel vervolgens gedurende vijf tot 10 minuten in een desiccator. Gebruik alternatief een warm objectglas en druk dit lichtjes, met de geleidende zijde naar beneden, tegen de platgedrukte weefselcoupes aan.Plaats, werkend in de zuurkast, een zandbad in een aluminium bak op een warmteplaat. De warmteplaat moet op een metalen schaarlift met een passend oppervlak staan. Zet de warmteplaat aan en stel de temperatuur in op 140 °C.Gebruik de temperatuurfeedbacksonde om de zandtemperatuur gedurende het gehele experiment te bewaken en een consistente temperatuur te garanderen. Plaats vervolgens 300 milligram DAN-matrix op het bodemoppervlak van het sublimatieapparaat. Verspreid de matrix in een gelijkmatige laag in het midden van het apparaat, met een breedte en lengte die ongeveer overeenkomen met die van de objectglas dat wordt gesublimeerd.Plaats een metalen plaat op het binnenoppervlak van het apparaat, waarbij de plaat direct contact maakt met de bodem van de condensor. Plak een blanco objectglas diagonaal over het oppervlak van de metalen plaat, met tape op de buitenranden van het glas. Verbind de boven- en onderdelen van het apparaat met een rubberen O-ring in het midden om een volledige afdichting te garanderen.Plaats een metalen U-koppeling rond het midden van de opstelling en draai de klemmen aan totdat de bovenste en onderste helft van de opstelling stevig op elkaar zijn afgesloten. Plaats de opstelling vervolgens in de metalen O-ring rond het zandbad. Plaats daarna een handvol gebroken ijs in de condensor.Vul de condensor voor een kwart tot de helft met koud water om ijsbrij te maken. De ijsbrij koelt de metalen plaat aan de binnenzijde van het apparaat af, en vervolgens het objectglas dat eraan vastzit. Wacht ten minste vijf minuten tot de temperatuur een stationaire toestand heeft bereikt.Giet vervolgens 300 mL methanol in de container van de koudeval en plaats het glaswerk in de container. Verbind de vacuumpomp met de uitgang van de koudeval met behulp van rubberen slang. Gebruik een ander stuk rubberen slang om de ingang van de koudeval met het sublimatieapparaat te verbinden.Zorg ervoor dat de slang stevig is vastgezet met metalen klemmen. Gebruik de vacuümpomp om een vacuüm van 30 tot 50 millitorr te creëren. Laat de pompen ten minste vijf minuten draaien voor drukstabilisatie.Voeg twee tot drie kleine stukjes droogijs toe aan de ethanol, onderin de container van de koudeval. De koudeval helpt te voorkomen dat matrixdeeltjes zich ophopen in de vacuümpomp. De klemmen op de U-ring van het sublimatieapparaat moeten mogelijk worden aangedraaid zodra de vacuümpomp is ingeschakeld, vanwege de afname van de druk in het apparaat.Zorg ervoor dat de temperatuur van het zandbad is gestabiliseerd op 140 °C. Controleer daarnaast of het vacuüm is ingeschakeld en of de apparatus is vastgezet in de metalen O-ring boven het zandbad, waarbij alle slangen zijn aangesloten. Stel de timer in op zeven minuten, maar start de timer nog niet.Til de schaarhef en het zandbad langzaam op tot aan het sublimatieapparaat, totdat de U-koppeling van de sublimator zich ruim boven de metalen O-ring bevindt. Deze extra ruimte maakt het mogelijk om het apparaat op het zand af te stellen. Druk de sublimator vervolgens snel en voorzichtig op het zandoppervlak om er zeker van te zijn dat het apparaat gelijkmatig op het zand rust.Start daarna onmiddellijk de timer. Wanneer de timer afgaat, schakelt u de vacuümpomp uit en laat u de schaarlift voorzichtig zakken tot de sublimator het zandbad niet meer raakt en stevig in de metalen O-ring rust. Draai het microventiel langzaam open om de druk in de apparatus te laten ontsnappen.Draai de metalen klem rond de rubberen slang van het sublimatieapparaat los en begin de slang langzaam los te maken. Zodra de rubberen slang enigszins is losgekomen, buig dan de slang naar één kant om de resterende druk te laten ontsnappen. Wanneer de omgevingsdruk is hersteld, verwijdert u voorzichtig de rubberen slang van het sublimatieapparaat.Draai vervolgens de klemmen op de U-verbinding van de apparatus los en verwijder deze. Scheid voorzichtig de twee helften van de sublimatieapparaat en trek het glaasje van de bovenkant van het binnenste glaswerk af. Inspecteer het glaasje om te bevestigen dat de matrix gelijkmatig is verdeeld.Indien de distributie en de hoeveelheid gesublimeerde matrix voldoende zijn, plak dan een nieuwe objectglas met weefsel aan de binnenzijde van de sublimator en herhaal het sublimatieproces. Ga vervolgens over tot beeldvorming en analyse zoals beschreven in het tekstprotocol. Het massaspectrum toont de ionenovervloed van anolieten binnen een massa-bereik van 1000 tot 2000.De belangrijkste gangliosiden van de A-serie zijn langs het spectrum gelabeld. Hier wordt het corresponderende moleculaire beeld van gangliosiden in de rattenhersenen getoond. Het moleculaire beeld laat de anatomische distributie van verschillende gangliosidesoorten zien via kleurcodering, die zijn over elkaar heen gelegd en gepseudokleurd met ImageJ-software.Over het algemeen kunnen personen die onbekend zijn met deze methode problemen ervaren, aangezien er in het proces van monstervoorbereiding veel variabelen zijn die de kwaliteit van de IMS-resultaten kunnen beïnvloeden en die vaak worden weggelaten in gerapporteerde protocollen. Bij het uitvoeren van deze procedure is het belangrijk om de hoeveelheid gesublimeerde matrix na elk experiment te bewaken en de sublimatietijd voor het objectglas dienovereenkomstig aan te passen. Na de ontwikkeling van deze techniek werd de weg vrijgemaakt voor onderzoekers om de rol van membraanlipiden, zoals gangliosiden, te onderzoeken na hersenletsel, bij de ziekte van neuronen en tijdens het natuurlijke verouderingsproces.Hoewel deze methode inzicht kan bieden in de abundantie en anatomische distributie van lipiden in de hersenen, kan deze ook worden toegepast op andere systemen, waaronder weefsels buiten de hersenen en zelfs planten- en insectmodellen. Het werken met beschadigde wortels kan uiterst gevaarlijk zijn; voorzorgsmaatregelen zoals het gebruik van handschoenen, maskers en oogbescherming moeten altijd worden getroffen bij het uitvoeren van deze procedure.

sublimation-dan-matrix-for-detection-visualization-gangliosides-rat

Research

JoVE Journal

Neuroscience

Neurowetenschap

Dopamine vervanging farmacotherapie met L-dopa is de meest gebruikte symptomatische behandeling van Parkinson, maar gaat gepaard met bijwerkingen zoals onwillekeurige abnormale bewegingen, genoemd...

MALDI massaspectrometrie Imaging van neuropeptiden bij de ziekte van Parkinson

Een specifieke en gevoelige methode om inzicht te krijgen in de expressie profiel van glycosfingolipiden antigenen in het immuunsysteem organen en cellen wordt beschreven. De methode maakt gebruik van de ion trap massaspectrometrie waardoor stapsgewijze versnippering van glycosfingolipiden moleculen voor structurele analyse in vergelijking met chemisch gesynthetiseerde standaard.

Massaspectrometrische analyse van glycosfingolipiden antigenen

Dithranol (DT, 1,8-dihydroxy-9 ,10-dihydroanthracen-9-on) is eerder gerapporteerd als een MALDI matrix voor weefsel beeldvorming van kleine moleculen, protocollen voor het gebruik van DT voor de MALDI beeldvorming van endogene lipiden op de oppervlak van het weefsel secties door positieve-ion MALDI-MS op een ultrahoge resolutie quadrupool-FTICR instrument worden hier gegeven.

Dithranol als een matrix voor Matrix Assisted Laser desorptie / ionisatie Imaging op een Fourier transform ion cyclotron resonantie spectrometrie

Een massaspectrometrie-beeldvormingsbron (MSI) die op atmosferische druk werkte, werd ontwikkeld door mid-infrarood laserdesorbentie te koppelen met post-ionisatie door middel van elektrospray. Exogeen ijsmatrix werd gebruikt als de energieabsorberende matrix om resonante desorbentie van weefselgerelateerd materiaal te vergemakkelijken. Dit manuscript biedt een stapsgewijs protocol voor het uitvoeren van IR-MALDESI MSI van een neonatale muis in zijn geheel.

Whole-body massaspectrometrie Imaging door Infrared Matrix-geassisteerde laser desorptie electrospray ionisatie (IR-MALDESI)

Moleculaire beeldvorming met laser matrix-bijgewoonde desorptie/ionisatie gebaseerde imaging massaspectrometrie (MALDI-IMS) kan de gelijktijdige koppeling van meerdere analyten in biologische monsters. Hier presenteren we een protocol voor de detectie en de visualisatie van amyloïde β eiwit op weefsels van de hersenen van Alzheimer en Cerebrale amyloïde angiopathie monsters met behulp van MALDI-IMS.

Visualisatie van amyloïde β-deposito's in de menselijke hersenen met Laser Matrix-bijgewoonde desorptie/ionisatie massaspectrometrie Imaging

Het doel van dit protocol is om gedetailleerde richtlijnen te geven over de monstervoorbereiding bij het plannen van experimenten met MALDI MSI om metabole en moleculaire detectie in biologische monsters te maximaliseren.

Monstervoorbereiding voor metabole profilering met behulp van MALDI massaspectrometrie beeldvorming

Gangliosiden zijn siaalzuurhoudende glycosfingolipiden die bijzonder overvloedig aanwezig zijn in de hersenen. Hun amfipathische aard vereist organische /waterige extractie- en zuiveringstechnieken om optimaal herstel en nauwkeurige analyses te garanderen. Dit artikel biedt een overzicht van analytische en preparatieve schaal ganglioside extractie, zuivering en dunne laag chromatografie analyse.

Ganglioside extractie, zuivering en profilering

Er is een geavanceerde methode ontwikkeld voor massaspectrometriebeeldvorming (MSI) van hersenorganoïden die het mogelijk maakt om metabolietverdelingen binnen deze modellen in kaart te brengen. Deze technologie biedt inzicht in metabole routes van de hersenen en metabolietsignaturen tijdens de vroege ontwikkeling en bij ziekte, en belooft een beter begrip van de menselijke hersenfunctie.

Moleculaire beeldvorming van organoïden van het menselijk brein met behulp van massaspectrometrie 

Dit protocol schetst het gebruik van microMS voor fluorescentiegeleide, eencellige MALDI-2-massaspectrometrie, waardoor verbeterde moleculaire profilering van primaire neuronale cellen van ratten mogelijk is.

Fluorescentiegeleide matrix-geassisteerde laserdesorptie/ionisatie met lasergeïnduceerde postionisatiemassaspectrometrie van individuele neurale cellen van ratten

Dit protocol beschrijft de belangrijkste stappen om rigoureuze en reproduceerbare metingen van zowel glycogeen- als N-gekoppelde glycanen mogelijk te maken met behulp van massaspectrometriebeeldvorming.

Ruimtelijke moleculaire beeldvorming van het glyaom met behulp van massaspectrometrie

Leer een sublimatieprotocol voor de detectie van gangliosiden in rattenhersenweefsel met MALDI-beeldmassaspectrometrie. Deze methode biedt inzicht in de anatomische verdeling en functie van lipiden in gezonde en pathologische hersenen.

Sublimatie van DAN Matrix voor de detectie en Visualisatie van gangliosiden in Rat Brain Tissue voor MALDI Imaging Mass Spectrometry (Video) | JoVE Journal

Sublimatie van DAN Matrix voor de detectie en Visualisatie van gangliosiden in Rat Brain Tissue voor MALDI Imaging Mass Spectrometry

Meer video's verkennen