Name: Zuivering van Biotinylated Cell Surface Proteins uit Rhipicephalus microplus Epitheliale darmcellen (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-07-23T14:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 3 s
Description: Leer een gemodificeerde Percoll-gradiëntmethode om epitheelcellen te isoleren uit de darm van Rhipicephalus microplus. Biotinyleer oppervlakte-eiwitten en zuiver deze met streptavidine magnetische kralen voor verdere analyses.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

De auteurs willen de Biosecurity Tick Colony (Queensland Department of Agriculture &amp; Fisheries, Australië) bedanken voor de levering van Rhipicephalus microplus- ticks die voor deze studie werden gebruikt, en Lucas Karbanowicz voor assistentie bij videofilms.

1. Dissectie van de Gut Epithelium van R. microplus <ol><li> Verzamel semi-engorged bosluizen van vee op de dag van het experiment. Dissect fluitjes binnen 24 uur na verwijdering van de gastheer. </li><li> Houd een strip tape vast aan de bodem van de 92 mm x 16 mm Petri-schotel. Voeg een druppel superlijm aan de band toe. Plaats de vinkje, de ventrale zijde van de superlijm, laat het gedurende 2 minuten drogen. </li><li> Giet 100 ml fosfaatgebufferde zoutoplossing (PBS) in de petrischaal, of tot de vinkje helemaal ondergedompeld is. </li><li> Gebruik een maat 11 scalpel, snijd van de bovenkant van de ogen naar de bodemfeestjes, aan weerszijden van de tik. </li><li> Verwijder met behulp van steriele tang de scutum en alloscutum volledig om de inwendige organen bloot te stellen. </li><li> Verwijder de fijne witte draadachtige organen (trachea) en andere membranen om vervuiling te voorkomen. </li><li> Verwijder de darm met behulp van pincet, door het bovenste gebied te knijpen en te trekken van dekarkas. Verwijder eventuele resterende darmweefsels, zodat er geen andere weefsels zijn gescheiden. </li><li> Bewaar de darm in ijskoude Hank&#39;s Gebalanceerde Zoutoplossing (HBSS) zonder calciumchloride en magnesiumsulfaat met proteïne-inhibitorcocktail (PIC). Vries de darm in droogijs en houd deze bij -20 ° C op. Opmerking: Om te helpen bij de darmdissectie en de details van de inwendige organen, raadpleeg hoofdstuk 3.1 van D. Sonenshine, &quot;Biology of Ticks&quot; 19 . </li></ol> 2. Epitheliale celdissociatie <ol><li> Giet de gedissende darm op een 70 μm celzeef in een 50 ml buis. </li><li> Spoel het darmweefsel met 50 ml ijskoude HBSS met PIC tot de oplossing helder loopt, en de darm neemt een witte / heldere uitstraling op. </li><li> Rein suspenderen in 30 ml ijskoude HBSS met PIC, meng zachtjes en centrifugeer bij 500 xg bij 4 ° C gedurende 10 minuten om de darm te pelletiseren. Verwijder de supernatant en herhaal het wasproces drie keer. </li><lI&gt; Om epitheliale darmcellen los te maken, zet de darm opnieuw op in 10 ml celkweekmedium Dulbecco&#39;s gemodificeerde arendmedium (DMEM), 2% foetaal kalfserum (FCS), 0,5 mM ethyleendiaminetetraazijnzuur (EDTA), 1 mM Tris (2 -carboxyethyl) fosfine (TCEP), PIC en incuberen gedurende 60 minuten bij 37 ° C onder langzame rotatie onder gebruikmaking van een roller bij 6 rpm. </li><li> Filter de suspensie door een 250 μm celsilinder, vortex de doorstroming en filter door een 70 μm celsilinder die de resterende doorstroming verzamelt. </li><li> Centrifugeer de suspensie bij 500 xg bij 4 ° C gedurende 20 minuten om de enkele cellen te pelletiseren. </li></ol> 3. Isolatie van enkele epitheelcellen met behulp van een dichtheidscentrifugatiegradiënt <ol><li> Bereid de dichtheidscentrifugatiegradiënt ( bijv . Percoll) door door een AP15 voorfilterpapier te filteren. Bereid 40% en 20% Percoll in MqH 2 0 (v / v) en afkoel 1 uur voor 4 uur bij 4 ° C voordat het gradiënt wordt gelegd. </li><li> Gebruik van een peristalticumPomp ingesteld op de laagste snelheid, laag 3 ml 40% dichtheidscentrifugatiegradiënt in een 16 ml ultracentrifugebuis, waardoor het gedurende 15 minuten op ijs kan liggen. Snelheid van de pomp moet leiden tot een &lt;1 mL per min flow rate. </li><li> Gebruik de peristaltische pomp om de buis naar een hoek van 45 ° te kantelen om de 20% dichtheidscentrifugatiegradiënt op de 40% laag te laten lagen. Snelheid van de pomp moet leiden tot &lt;1 mL per min flow rate. Laat de lagen gedurende 15 minuten op ijs zetten. </li><li> Gebruik de peristaltische pomp bij &lt;1 ml per minuut stromingssnelheid naar laag 3 ml DMEM-medium dat tikgootcellen bevat over de 20-40% dichtheidscentrifugatiegradiënt. </li><li> Programmeer de centrifuge voor maximale versnelling en minimale vertraging. Centrifuge bij 600 xg gedurende 10 minuten. Verzamel tussenfasen tussen de DMEM: 20% dichtheidscentrifugatiegradiënt en de 20%: 40% dichtheidscentrifugatiegradiënten om epitheliale enkele cellen te isoleren. Bewaar verzamelde interfasen bij 4 ° C voor latere analyses. </li></ol><html> 4. Beoordeling van celisolatie <ol><li> hemacytometer <ol><li> Maak de hemacytometer glijbaan schoon met alcohol. </li><li> Schakel de cellen op door de cellen op en neer zachtjes te pipetteren. Pipette 100 μL van de cel suspensie en plaats in een 1,5 ml microcentrifuge buis. </li><li> Voeg 400 μl 0,4% Trypan Blue toe. Meng het voorzichtig door de buis te flikkeren. </li><li> Pipet 100 μL van de Trypan Blue-behandelde cel suspensie om beide kamers van de hemocytometer langzaam te vullen. </li><li> Plaats de hemocytometer onder een lichtmicroscoop, met de nadruk op de roosterlijnen van de hemocytometer met een 10X-doelstelling. </li><li> Met behulp van een handtekeningsteller tellen u de levende niet-gestippelde cellen in een set van 16 vierkanten. Tabel de blauwe dode cellen in hetzelfde vierkant. Ga door met tellen tot vier sets van 16 vierkanten worden geteld. </li><li> Bereken de totale cellen per ml met behulp van de formule: 47eq1.jpg &quot;/&gt; </li><li> Bereken het percentage levensvatbaarheid van de cel door de formule te gebruiken: <img alt="Vergelijking 2" src="/files/ftp_upload/55747/55747eq2.jpg" /></li></ol></li><li> Cellisolatie Visualisatie <ol><li> Verdun 1 μl van de geïsoleerde cellen in 9 μl HBSS in een 1,5 ml microcentrifugebuis. Flip de microcentrifugebuis voorzichtig om te mengen. </li><li> Pipetteer 5 μL geïsoleerde cellen in HBSS in het midden van een glazen glijbaan. Breng drie druppels monteringsmedium aan met 4 &#39;, 6-diamidino-2-fenylindool (DAPI). </li><li> Incubeer de dia bij kamertemperatuur gedurende 5 minuten. Plaats voorzichtig een deklaag over het preparaat, vermijd luchtbellen. </li><li> Visualiseer cellen gemarkeerd met DAPI bij excitatie 360 ​​nm en emissie bij 460 nm onder een fluorescerende microscoop. </li></ol></li></ol> 5. Biotinylatie van de celoppervlakteproteïne <ol><li> Biotinylaat 100 μL epitheelcellen met een cel met behulp van Biotin (Type A) ConjugatieKit, bij een molverhouding van 1: 1 oppervlakte-eiwit om te conjugeren, volgens de instructies van de fabrikant </li><li> Voor cellysis, voeg 100 μl PBS, 1% Triton X-100, 10% glycerol, 100 μM geoxideerde glutathion en PIC aan de biotinyleerde cellen toe. Incubeer op ijs gedurende 1 uur met zacht mengend elke 10 minuten. </li><li> Centrifugeer de biotinyleerde cellen bij 20.000 xg bij 4 ° C gedurende 20 minuten om onoplosbaar materiaal te pelletiseren. Verzamel de supernatant die cytoplasmatische, en biotinyleerde membraaneiwitten bevat. </li><li> Bepaal de eiwitconcentratie met behulp van de Bradford-test. </li></ol> 6. Isolatie van Biotinyleerde Oppervlakte Proteïnen <ol><li> Voeg 50 μL Streptavidin Magnetische Kralen in een 1,5 ml microcentrifugebuis. </li><li> Plaats de buis in een magnetische stand, waarbij de kralen tegen de zijde van de buis worden verzameld. Verwijder en wis de supernatant. </li><li> Voeg 1000 μl TBS, 0,1% Tween-20 aan de buis toe. Meng het voorzichtig en verzamel de kralen met de magnetische stand. Verwijder en wis de supernatant. </li><li> Combineer 40 μg biotinyleerde celoppervlakte-eiwitten, verdund tot 300 μl in 1x PBS met gewassen magnetische kralen. Incubeer gedurende 2 uur bij kamertemperatuur onder roeren. </li><li> Verzamel de kralen met een magnetische stand, verwijder en wis de supernatant. </li><li> Voeg 300 μL TBS, 0,1% Tween-20 aan de buis toe, meng zachtjes om de kralen opnieuw op te schudden. Verzamel kralen, verwijder en verwijder de supernatant. Herhaal deze wasstap twee keer. </li><li> Voeg 100 μl van de 0,1 M glycine pH 2,0 aan de magnetische kralen toe en incubeer bij kamertemperatuur gedurende 5 minuten. Verzamel kralen en verwijder supernatant die geëlueerde biotinyleerde oppervlakte-eiwitten bevat. </li><li> Visualiseer geïsoleerde oppervlak eiwitten op een 4-20% Tris-MOPS SDS-PAGE gel. </li></ol> 7. Beoordeling van biotinylated oppervlakteproteïne <ol><li> Dot Blot <ol><li> Knip een 7 cm x 3 cm strip nitrocellulose membraan. </li><li> Breng 10 μg totaal tick tick aanT inhoud (vanaf 1.8 hierboven) en 10 μg biotinylated oppervlakte-eiwit aan het membraan. Laat drogen gedurende 15 minuten bij kamertemperatuur. </li><li> Overbrengen naar een container en onderdompelen in 100 ml blokkerende buffer. Incubeer bij kamertemperatuur onder roeren gedurende een uur. Wis blokkerende buffer weg. </li><li> Was nitrocellulosemembraan in 100 μL PBS, 0,05% Tween-20 gedurende 5 minuten met roeren. Gooi de wasbuffer weg en herhaal de was driemaal. </li><li> Incubeer in 1/5000 Streptavidine-Peperwortelperoxidase (HRP) in 100 μL PBS, 0,05% Tween-20 gedurende 2 uur onder roeren bij kamertemperatuur en wis eventuele resterende oplossing. </li><li> Was nitrocellulosemembraan in 100 μl PBS, 0,05% Tween-20 gedurende 5 minuten met roeren. Gooi de wasbuffer weg en herhaal de was driemaal. </li><li> Ontleed 1 tablet 4-chloor-1-nafthol in 10 ml ijskoude methanol voor detectie. Voeg 4 ml methanol voorraad toe aan 20 ml TBS. Voeg 10 μL vers 30% waterstofperoxide en immedia toeToepasselijk op nitrocellulose membraan. </li><li> Incubeer met roering bij kamertemperatuur tot het substraat een onoplosbaar blauw eindproduct produceert. Dit kan tussen 2-15 minuten duren. </li><li> Gooi detectieoplossing en was het membraan driemaal in 100 pl MQH 2 O. </li></ol></li><li> ELISA-analyse <ol><li> Verdun 200 ng van elk monster met 400 μl 100 mM carbonaatcoatingbuffer en laag 2 lanen van de eerste rij (A #) van de ELISA-plaat (platte boorputjes) </li><li> Voeg 100 μl 100 mM carbonaat coating buffer toe aan alle andere corresponderende putten in rijen (BH). </li><li> Bereid de seriële verdunningen van elk monster door 100 μL van elke put in rij A te pipetteren en over te zetten in rij B. Meng zachtjes door pipetten en vermijd bellen produceren. Herhaal de verdunningen onder elke rij, waarbij de laatste 100 μL van elke put in rij H. wordt verwijderd. </li><li> Bedek de plaat met parafilm en incubeer overnacht bij 4 ° C. </li><li> Was de platE met 200 μl PBS, 0,05% Tween-20 per putje drie keer. </li><li> Voeg 200 μL blokkerende buffer toe aan de gecoate putten, bedek met Parafilm en incubeer overnacht bij 4 ° C. </li><li> Verdun 1 / 15.000 Streptavidine-HRP in blokkerende buffer en voeg 100 μL toe aan elke putje van de plaat. Bedek met parafilm en incubeer overnacht bij 4 ° C. </li><li> Was de plaat vijf keer in 200 μl PBS, 0,05% Tween-20 per putje. </li><li> Om op te sporen, voeg 100 μL TMB-reagens per put toe. Na voldoende kleurontwikkeling, meestal tussen 10-15 minuten, voeg 100 μL 1 M fosforzuur toe om de reactie te stoppen. </li><li> Lees de absorptie van elke bron bij λ = 450 nm. </li></ol></li></ol>

<ol><li>Rodriguez-Valle, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficacy+of+Rhipicephalus+%28Boophilus%29+microplus+Bm86+against+Hyalomma+dromedarii+and+Amblyomma+cajennense+tick+infestations+in+camels+and+cattle%5BTitle%5D)+AND+%22Vaccine%22%5BJournal%5D)">Efficacy of Rhipicephalus (Boophilus) microplus Bm86 against Hyalomma dromedarii and Amblyomma cajennense tick infestations in camels and cattle.</a> Vaccine. 30, 3453-3458 (2012).</li>
<li>De Rose, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bm86+antigen+induces+a+protective+immune-response+against+Boophilus+microplus+following+DNA+and+protein+vaccination+in+sheep%5BTitle%5D)+AND+%22Vet.+Immunol.+Immunopathol%22%5BJournal%5D)">Bm86 antigen induces a protective immune-response against Boophilus microplus following DNA and protein vaccination in sheep.</a> Vet. Immunol. Immunopathol. 71, 151-160 (1999).</li>
<li>García-García, J. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sequence+variations+in+the+Boophilus+microplus+Bm86+locus+and+implications+for+immunoprotection+in+cattle+vaccinated+with+this+antigen%5BTitle%5D)+AND+%22Exp.+Appl.+Acarol%22%5BJournal%5D)">Sequence variations in the Boophilus microplus Bm86 locus and implications for immunoprotection in cattle vaccinated with this antigen.</a> Exp. Appl. Acarol. 23, 883-895 (1999).</li>
<li>Abbas, R. Z., Zaman, M. A., Colwell, D. D., Gilleard, J., Iqbal, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Acaricide+resistance+in+cattle+ticks+and+approaches+to+its+management%3A+The+state+of+play%5BTitle%5D)+AND+%22Vet.+Parasitol%22%5BJournal%5D)">Acaricide resistance in cattle ticks and approaches to its management: The state of play.</a> Vet. Parasitol. 203, 6-20 (2014).</li>
<li>Kearney, S. <a target="_blank" href="https://dpir.nt.gov.au/__data/assets/pdf_file/0007/233269/845.pdf">Acaricide (chemical) resistance in cattle ticks</a>. , AgNote No. K58. (2013).</li>
<li>Foil, L. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Factors+that+influence+the+prevalence+of+acaricide+resistance+and+tick-borne+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22Vet.+Parasitol%22%5BJournal%5D)">Factors that influence the prevalence of acaricide resistance and tick-borne diseases.</a> Vet. Parasitol. 125, 163-181 (2004).</li>
<li>Rodriguez, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+level+expression+of+the+B.+microplus+Bm86+antigen+in+the+yeast+Pichia+pastoris+forming+highly+immunogenic+particles+for+cattle%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">High level expression of the B. microplus Bm86 antigen in the yeast Pichia pastoris forming highly immunogenic particles for cattle.</a> J Biotechnol. 33, 135-146 (1994).</li>
<li>Rodriguez, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+vaccination+with+a+recombinant+Bm86+antigen+preparation+on+natural+infestations+of+Boophilus+microplus+in+grazing+dairy+and+beef+pure+and+cross-bred+cattle+in+Brazil%5BTitle%5D)+AND+%22Vaccine%22%5BJournal%5D)">Effect of vaccination with a recombinant Bm86 antigen preparation on natural infestations of Boophilus microplus in grazing dairy and beef pure and cross-bred cattle in Brazil.</a> Vaccine. 13 (18), 1804-1808 (1995).</li>
<li>Lew-Tabor, A. E., Rodriguez Valle, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+review+of+reverse+vaccinology+approaches+for+the+development+of+vaccines+against+ticks+and+tick+borne+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22Ticks+Tick+Borne+Dis%22%5BJournal%5D)">A review of reverse vaccinology approaches for the development of vaccines against ticks and tick borne diseases.</a> Ticks Tick Borne Dis. 7, 573-585 (2016).</li>
<li>Capella, A. N., Terra, W. R., Ribeiro, A. F., Ferreira, C. <a target="_blank" href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0965174897000611">Cytoskeleton removal and characterization of the microvillar membranes isolated from two midgut regions of Spodoptera frugiperda (Lepidoptera).</a> Insect Biochem. Mol. Biol. 27, 793-801 (1997).</li>
<li>Cioffi, M., Wolfersberger, M. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+of+separate+apical%2C+lateral+and+basal+plasma+membrane+from+cells+of+an+insect+epithelium.+A+procedure+based+on+tissue+organization+and+ultrastructure%5BTitle%5D)+AND+%22Tissue+Cell%22%5BJournal%5D)">Isolation of separate apical, lateral and basal plasma membrane from cells of an insect epithelium. A procedure based on tissue organization and ultrastructure.</a> Tissue Cell. 15, 781-803 (1983).</li>
<li>Koefoed, B. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+mechanical+method+to+isolate+the+basal+lamina+of+insect+midgut+epithelial+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Tissue+Cell%22%5BJournal%5D)">A simple mechanical method to isolate the basal lamina of insect midgut epithelial cells.</a> Tissue Cell. 17, 763-768 (1985).</li>
<li>Roche, J. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+of+a+purified+epithelial+cell+population+from+human+colon%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol.+Med%22%5BJournal%5D)">Isolation of a purified epithelial cell population from human colon.</a> Methods Mol. Med. 50, 15-20 (2001).</li>
<li>Terra, W. R., Costa, R. H., Ferreira, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plasma+membranes+from+insect+midgut+cells%5BTitle%5D)+AND+%22An.+Acad.+Bras.+Ci%C3%AAnc%22%5BJournal%5D)">Plasma membranes from insect midgut cells.</a> An. Acad. Bras. Ciênc. 78, 255-269 (2006).</li>
<li>Vargas, A. E., Markoski, M. M., Cañedo, A. D., Helena, F., Nardi, N. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification%2C+isolation+and+culture+of+intestinal+epithelial+stem+cells+from+murine+intestine%5BTitle%5D)+AND+%22Stem+Cells%22%5BJournal%5D)">Identification, isolation and culture of intestinal epithelial stem cells from murine intestine.</a> Stem Cells. 879, 479-490 (2012).</li>
<li>Autengruber, A., Gereke, M., Hansen, G., Hennig, C., Bruder, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Impact+of+enzymatic+tissue+disintegration+on+the+level+of+surface+molecule+expression+and+immune+cell+function%5BTitle%5D)+AND+%22Eur.+J.+Microbiol.+Immunol%22%5BJournal%5D)">Impact of enzymatic tissue disintegration on the level of surface molecule expression and immune cell function.</a> Eur. J. Microbiol. Immunol. 2, 112-120 (2012).</li>
<li>Karhemo, P. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+optimized+isolation+of+biotinylated+cell+surface+proteins+reveals+novel+players+in+cancer+metastasis%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Proteomics%22%5BJournal%5D)">An optimized isolation of biotinylated cell surface proteins reveals novel players in cancer metastasis.</a> J. Proteomics. 77, 87-100 (2012).</li>
<li>Obenchain, F. R., Galun, R. Physiology of Ticks. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aObenchain%2C+FR+%22Current+Themes+in+Tropical+Science+Volume+1%22">Current Themes in Tropical Science Volume 1</a>. , Pergamon Press. 201-205 (1982).</li>
<li>Sonenshine, D., Roe, R. Chapter 3.1. <a target="_blank" href="https://books.google.com/books?id=ucg4AAAAQBAJ&source=gbs_book_similarbooks">&#34;Biology of Ticks&#34</a>. 1, Two, Oxford University Press. (2014).</li>
<li>Raikhel, A. S., Balashov, Y. S. <a target="_blank" href="http://search.library.utoronto.ca/details?296351&uuid=a608221a-1254-44a3-8e22-b81b799145f5">&#34;An Atlas of Ixodid Tick Ultrastructure&#34 (English Translation)</a>. , Entomology Society of America Entomological Society of America. (1983).</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

Veebesmettingen zijn een belangrijk probleem voor de veeindustrie in tropische en subtropische gebieden van de wereld, met de meest voorkomende methode van controle afhankelijk van het gebruik van acariciden 1 , 4 . Bm86 werd eerder geïdentificeerd binnen het epitheelvlak van de tikgut als beschermend antigeen tegen R. microplus infestatie 10 , met beperkt succes als een vaccinestrategie door Bm86 geografische sequentievariatie e...

Rhipicephalus microplus , de veestok, is de meest significante ectoparasiet in termen van economische impact op de veeindustrie van tropische en subtropische regio&#39;s, aangezien het vectoren boviene tik koorts (babesiosis), anaplasmose en paardenpiroplasmosis 1 , 2 , 3 , 4 is . Er zijn inspanningen gedaan voor veestokcontrole om het schadelijke effect te verminderen, maar conventionele methoden zoals het gebruik van chemische acariciden hebben impliciete nadelen, zoals de aanwezigheid van chemische residuen in melk en vlees, en de toename van de prevalentie van chemisch resistente tegels 5 , 6 , 7 . Bijgevolg is de ontwikkeling van alternatieve methoden voor tikbesturing onderzocht, zoals het gebruik van natuurlijk resistentiebeest, biologische bestrijding (biopesticiden) en vaccinInen 4 , 5 , 6 , 7 , 8 , 9 . In het nastreven van eiwitten die kunnen worden gebruikt als vaccin kandidaten, is het huidige onderzoek gericht op de tikgut. De midgutmuur is gebouwd uit een enkele laag epitheliale cellen die op een dunne basale lamina rusten, waarbij de buitenkant van de basale lamina een netwerk van spieren vormt. Licht- en elektronmicroscoopwaarnemingen wijzen erop dat de midgut bestaat uit drie typen cellen: reserve (ongedifferentieerd), secretie en spijsvertering. Het aantal celtypes varieert aanzienlijk afhankelijk van de fysiologische fase. Secretory en spijsverteringscellen zijn afkomstig van reservecellen 18 , 19 , 20 . De constructie van cDNA bibliothekenOm de samenstelling van de tikgoot te onderzoeken heeft geleid tot de identificatie van antigeen eiwitten, zoals Bm86, als potentiële vaccin kandidaten 2 , 3 , 4 . Het glycoproteïne Bm86 is gelokaliseerd op het oppervlak van bosluiscellen en veroorzaakt een beschermende immuunrespons tegen de veekenteken ( R. microplus ) bij gevaccineerde vee. Anti-Bm86 IgG&#39;s die worden geproduceerd door de geïmmuniseerde gastheer worden ingehaald door de tik, herken dit antigeen op het oppervlak van tikgutcellen, en versteur vervolgens de tikweefselfunctie en integriteit. Vaccins op basis van Bm86 antigenen hebben effectieve controle van R. microplus en Rhipicephalus annulatus getoond , door het aantal, gewicht en voortplantingscapaciteit van ingewikkelde vrouwtjes te verminderen, wat resulteert in een verminderde larve-besmetting in daaropvolgende tikgeneraties 4 . Bm86-gebaseerde vaccins zijn echter niet effectief tegen alle tikstadia en hebbenHeeft onbevredigende effectiviteit aangetoond tegen sommige geografische stammen van R. microplus , waardoor de rundvlees- en zuivelindustrie deze vaccins 2 , 4 slecht heeft aangenomen. Het vermogen om epitheelcellen uit de tikgut te isoleren is een belangrijke innovatie die de voortgang van het onderzoek mogelijk maakt om eiwitmembraansamenstelling te bepalen, waaronder morfologie en fysiologie onder verschillende omgevingsomstandigheden. De hier beschreven werkwijze maakt gebruik van het chelaatmiddel ethylendiaminetetraazijnzuur (EDTA) en het reductiemiddel tris (2-carboxyethyl) fosfine (TCEP) om het epithelium uit zijn subepitheelondersteunende weefsels 10 te ontlasten. Het epithelium wordt hersteld na mechanische verstoring van de weefsels door schudden, gevolgd door discontinuous gradient centrifugatie in Percoll. Dit papier beschrijft een haalbare en nieuwe techniek voor het isoleren van tikgut epiTheliale cellen. Biotinyleerde celoppervlakte-eiwitten, geïsoleerd uit het oppervlak van deze epitheliale cellen kunnen vervolgens worden geanalyseerd in downstream toepassingen, zoals FACS en / of LC-MS / MS-analyse.

<table><tbody><tr><td>0.4% Trypan Blue</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>15250061</td><td></td></tr><tr><td>1.5 mL microcentrifuge tube</td><td>Eppendorf</td><td>3322</td><td></td></tr><tr><td>100mM Carbonate Buffer</td><td></td><td></td><td>3.03 g Na2CO3, 6.0 g NaHCO3 1000 ml distilled water pH 9.6</td></tr><tr><td>16 mL centrifuge tubes with sealing cap</td><td>Thermo Scientific</td><td>3138-0016</td><td>Koel in ijs voorafgaand aan gradiënt</td></tr><tr><td>250 &micro;M cell strainer</td><td>Thermo Fisher</td><td>87791</td><td></td></tr><tr><td>3,3&prime;,5,5&prime;-Tetramethylbenzidine (TMB) Liquid Substrate System for ELISA</td><td>Sigma</td><td>T0440</td><td>Opgeslagen bij 4C</td></tr><tr><td>30% Hydrogen Peroxide</td><td>Labscene</td><td>BSPA5.500</td><td></td></tr><tr><td>4-20% Tris-MOPS Gel</td><td>Gen Script</td><td>M42015</td><td></td></tr><tr><td>4-Chloro-1-naphthol tablet</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C6788</td><td></td></tr><tr><td>50 mL Falcon Tube</td><td>Corning Blue</td><td></td><td>30 x 115mm stijl. Polypropyleen conische buis.</td></tr><tr><td>70 &micro;M cell strainer</td><td>BD Falcon</td><td>352350</td><td></td></tr><tr><td>AP15 filter paper</td><td>Millipore</td><td>AO1504200</td><td></td></tr><tr><td>Biotin (Type A) Conjugation Kit</td><td>Abcam</td><td>Ab102865</td><td></td></tr><tr><td>Dissection microscope</td><td>Olympus</td><td>SZX7</td><td></td></tr><tr><td>DP Manager&nbsp;</td><td>Olympus</td><td>2.2.1.195</td><td>Cell imagery software</td></tr><tr><td>Duct Tape</td><td>Home Handyman</td><td></td><td>48mm x 25mm Duct Tape</td></tr><tr><td>Dulbecco&rsquo;s Modified Eagle Medium</td><td>Gibco</td><td>11995-065</td><td>DMEM - ijskoud voor protocol</td></tr><tr><td>EDTA</td><td>Amresco</td><td>0105-500G</td><td></td></tr><tr><td>F96 Maxisorp Immuno Plate</td><td>Nunc</td><td>439454</td><td></td></tr><tr><td>Fetal Bovine Serum</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>12003C</td><td>FCS</td></tr><tr><td>Fluorescence microscope&nbsp;</td><td>&nbsp;Olympus&nbsp;</td><td>BX51</td><td></td></tr><tr><td>Fluoroshield with DAPI</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>F6057-20ML</td><td>DAPI</td></tr><tr><td>Forceps</td><td>Dumont</td><td></td><td>#9 Dumont - Zwitserland</td></tr><tr><td>Glycerol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G5516</td><td>Glycerol voor moleculaire biologie >99%</td></tr><tr><td>Glycine</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>410225</td><td></td></tr><tr><td>Hand-Held Counter</td><td>Officeworks</td><td>JA0376230</td><td></td></tr><tr><td>Hank&rsquo;s Balanced Salt Solution</td><td>Sigma Life Sciences</td><td>H9394</td><td>HBSS &ndash; ijskoud voor protocol</td></tr><tr><td>Hemacytometer</td><td>Optik Lakor</td><td>-</td><td>-</td></tr><tr><td>L-Glutathione oxidized</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G4376</td><td></td></tr><tr><td>Magnetic Separation Stand</td><td>Novagen</td><td>-</td><td>4-buis magnetische scheidingsrek</td></tr><tr><td>Methanol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>179337</td><td></td></tr><tr><td>Milli-Q Water</td><td>Millipore</td><td>ZRXQ003WW</td><td>Integraal waterzuiveringssysteem voor ultrapuur water</td></tr><tr><td>Nitrocellulose Membrane</td><td>Life Sciences</td><td>66485</td><td>30cm x 3M pure nitrocellulose membraan</td></tr><tr><td>PageRuler Prestained protein Ladder</td><td>Thermo-Fisher</td><td>SM0671</td><td></td></tr><tr><td>PBS</td><td></td><td></td><td>1.16 g Na2HPO4, 0.1 g KCl, 0.1 g K3PO4, 4.0 g NaCl (500 ml gedistilleerd water) pH 7.4</td></tr><tr><td>Percoll</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P1644-500ML</td><td></td></tr><tr><td>Peristaltic Pump</td><td>Masterflex</td><td>7518-10</td><td></td></tr><tr><td>Phosphoric Acid</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P6560</td><td></td></tr><tr><td>Pierce Protein-Free T20 PBS Blocking Buffer</td><td>Thermo-Scientific</td><td>37573</td><td>Opgeslagen bij 4C. Blocking Buffer</td></tr><tr><td>Protease Inhibitor Cocktail</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P8215-5ML</td><td>PIC &ndash; opgeslagen bij -20 &deg;C</td></tr><tr><td>Quick Start Bradford Dye Reagent 1x</td><td>Biorad</td><td>500-0205</td><td>Voor Bradford Assay</td></tr><tr><td>Quick Start BSA Standards</td><td>Biorad</td><td>500-0207</td><td>BSA standaarden voor Bradford Assay</td></tr><tr><td>Scalpel</td><td>Lab. Co</td><td></td><td>Maat 11 scalpel</td></tr><tr><td>SilverQuest TM Staining Kit</td><td>Invitrogen</td><td>LC6070</td><td></td></tr><tr><td>Simply Blue TM Safe Stain&nbsp;</td><td>Invitrogen</td><td>LC6060</td><td></td></tr><tr><td>Sorvall C6+ Ultracentrifuge</td><td>Thermo Scientific</td><td>46910</td><td></td></tr><tr><td>Streptavidin (HRP)</td><td>Abcam</td><td>AB7403</td><td></td></tr><tr><td>Streptavidin Magnetic Beads</td><td>New England Biolabs</td><td>S1420S</td><td></td></tr><tr><td>Super Glue - Ultra Fast Mini</td><td>UHU</td><td></td><td>UHU Super Glue 1mg. Ultra Fast mini</td></tr><tr><td>Table-top Centrifuge</td><td>Eppendorf</td><td>22331</td><td></td></tr><tr><td>TCEP</td><td>Thermo Fisher</td><td>20490</td><td></td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>Biorad</td><td>161-0407</td><td></td></tr><tr><td>Tween-20</td><td>Sigma</td><td>P2287-500ML</td><td></td></tr><tr><td>Vortex Mixer</td><td>Ratek</td><td>VM1</td><td></td></tr><tr><td>Water Bath</td><td>Grant</td><td>GD100</td><td></td></tr></tbody></table>

zuivering van biotinylated cell surface proteins uit<em&gt; rhipicephalus microplus</em&gt; epitheliale darmcellen

Purification of Biotinylated Cell Surface Proteins from Rhipicephalus microplus Epithelial Gut Cells

Rhipicephalus microplus - de veestok - is de belangrijkste ectoparasiet in termen van economische impact op vee als vector van verschillende pathogenen. Er is gewerkt aan de veestokcontrole om de schadelijke effecten ervan te verminderen, met de nadruk op de ontdekking van vaccinekandidaten, zoals BM86, gelegen op het oppervlak van de epitheelcellen. Huidig ​​onderzoek richt zich op het gebruik van cDNA en genomische bibliotheken, om te screenen voor andere vaccin kandidaten. De isolatie van tikgutcellen vormt een belangrijk voordeel bij het onderzoeken van de samenstelling van oppervlakte-eiwitten op het membraan van de tikkeldarmcellen. Dit papier vormt een nieuwe en haalbare methode voor het isoleren van epitheliale cellen, uit de tikgutinhoud van halfgegraveerde R. microplus. Dit protocol maakt gebruik van TCEP en EDTA om de epitheelcellen uit de subepitheliale ondersteunende weefsels te ontlasten en een discontinuous density centrifugatiegradieNt om epitheelcellen van andere celsoorten te scheiden. Cel-oppervlakte-eiwitten werden biotinyleerd en geïsoleerd uit de epitheelcellen van de tikgut, met behulp van streptavidine-gekoppelde magnetische kralen, die toestaan ​​voor downstream toepassingen in FACS of LC-MS / MS-analyse.

Epitheelcellen werden geïsoleerd uit de darmweefsels van R. microplus volgens de schematische voorstelling in Figuur 1 . Representatieve fluorescentiemicroscopiebeelden van epitheelcellen van tikgut, bereid met gebruikmaking van dit protocol, worden getoond in Figuur 2A En 2B. Aangezien de celisolatie wordt uitgevoerd op halfgegraveerde R. mic...

Een gemodificeerde dichtheidscentrifugatiegradient gebaseerde methodologie werd gebruikt om epitheelcellen van Rhipicephalus microplus gutweefsel te isoleren. Oppervlakte gebonden eiwitten werden biotinyleerd en gezuiverd door streptavidine magnetische kralen voor gebruik in downstream toepassingen.

Zuivering van Biotinylated Cell Surface Proteins uit<em&gt; Rhipicephalus microplus</em&gt; Epitheliale darmcellen

Rhipicephalus microplus &#8211; the cattle tick &#8211; is the most significant ectoparasite in terms of economic impact on livestock as a vector of ...

Zuivering van gebiotinyleerde celoppervlakte-eiwitten uit epitheelcellen van de darm van Rhipicephalus microplus. In deze studie werd een aangepaste methodologie op basis van een Percoll-gradiënt gebruikt om individuele epitheelcellen te isoleren uit darmweefsel van Rhipicephalus microplus. Oppervlaktegebonden eiwitten werden gebiotinyleerd en gezuiverd met streptavidine-magnetische kralen voor gebruik in downstream-toepassingen.Dissectie van het darmepitheel van semi-verzadigde Rhipicephalus microplus. U heeft de volgende materialen nodig. Plak een strip ducttape op de bodem van een Petrischaal.Voeg een druppel Super Glue toe aan de tape. Plaats de teek met de ventrale zijde naar beneden op de Super Glue en laat dit drogen. Dompel de teek volledig onder in 100 mL PBS.Snijd met een scalpel maat 11 vanaf de bovenkant van de ogen tot aan de onderste festons aan beide zijden van de teek. Verwijder met steriele pincetten het scutum en alloscutum volledig om de inwendige organen bloot te leggen. Verwijder de fijne witte draadvormige organen en andere membranen.Verwijder de darm met een pincet. Bewaar de darm in ijskoude HBSS en PIC. Dissociatie van epitheelcellen.U heeft de volgende materialen nodig. Giet de gedissecteerde darm door een cellenzeef van 70 micron in een Falcon-buis van 50 mL. Omdat er een vacuüm in de Falcon-buis kan ontstaan, dient u het filter op te tillen om luchtcirculatie mogelijk te maken.Spoel het darmweefsel met 50 mL ijskoud HBSS met PIC. Resuspendeer de darmen in 30 mL ijskoud HBSS met PIC. Gebruik indien nodig een steriele schraper om de resuspensie van de darmen te ondersteunen.Centrifugeer bij 500 g. Verwijder het supernatant en herhaal het wasproces drie keer. Resuspendeer de darmcellen in 10 mL DMEM, 2% FCS, 5 millimol EDTA, één millimol TCEP en PIC.Meng voorzichtig. Incubeer gedurende 60 minuten bij 37 °C onder langzame rotatie met gebruik van een roller. Filtreer de suspensie door een celzeef van 250 micron.Vortex de doorstroom. Filtreer deze vervolgens door een cellenzeef van 70 micron en verzamel de resterende doorstroom. Centrifugeer de suspensie.Isolatie van enkele epitheelcellen met behulp van een Percoll-gradiënt. U heeft de volgende materialen nodig. Bereid 40% en 20% Percoll in Milli-Q water door te filteren via AP15 voorfilterpapier.Vul een steriele spuit met de Percoll-oplossing. Breng deze aan op de filteropstelling en laat de Percoll langzaam uitstromen. Koel gedurende een uur bij vier graden Celsius voordat de gradiënt wordt aangebracht.Stel de peristaltische pomp in zoals getoond. Gebruik een peristaltische pomp ingesteld op de laagste snelheid om drie mL 40% Percoll in een 16 mL ultracentrifugebuis te layereden. Laat dit 15 minuten op ijs bezinken.De snelheid van de pomp moet leiden tot een stroomsnelheid van minder dan 1 mL per minuut. Kantel de buis in een hoek van 45 graden en gebruik de peristaltische pomp om de 20% Percoll bovenop de 40%-laag aan te brengen. Zorg ervoor dat de uitlaatbuis tegen de centrifugebuis rust om te voorkomen dat druppels zich mengen met de lagere lagen.De snelheid van de pomp moet leiden tot een stroomsnelheid van minder dan one mL per minuut. Laat de lagen 15 minuten op ijs bezinken. Gebruik de peristaltische pomp met een stroomsnelheid van minder dan one mL per minuut om drie mL DMEM-oplossing met de geïsoleerde epitheelcellen over de 20 tot 40% Percoll-gradiënt te layeren.Zorg ervoor dat de opvangbuis tegen de centrifugebuis rust om te voorkomen dat druppels zich mengen met de onderste lagen, wat de gradiënt zou verstoren. Centrifugeer bij 600 g gedurende 10 minuten. Verzamel de interfases tussen het DMEM, de 20%Percoll-gradiënt en de 20%40%Percoll-gradiënten om epitheliale enkelcellen te isoleren.Biotinylering van celoppervlakte-eiwitten en de isolatie van gebiotinyleerde oppervlakte-eiwitten. U heeft de volgende materialen nodig. Biotinyleer 100 µL enkelvoudige epitheelcellen met behulp van de Biotin Type A Conjugation Kit volgens de instructies van de fabrikant.Voeg 100 µL PBS, 1% Triton X-100, 10% glycerol, 100 µM geoxideerd glutathion en PIC toe aan de gebiotinyleerde cellen. Incubeer gedurende een uur op ijs met voorzichtig mengen om de 10 minuten. Centrifugeer het celextract bij 20,000 g bij 4 °C gedurende 20 minuten en zet dit apart.Bereid 50 µL streptavidine magnetische kraaltjes voor door deze te wassen met 1 000 µL TBS 1% Tween-20. Meng voorzichtig door met de vinger tegen de zijkant van de buis te tikken. Plaats de buis in een magnetische houder, zodat de kraaltjes zich tegen de wand van de buis verzamelen.Verwijder en gooi het supernatant weg. Meng 300 µL gebiotinyleerde celoppervlakte-eiwitten met gewassen magnetische beads. Incubeer gedurende twee uur bij kamertemperatuur onder agitatie.Verzamel de kraaltjes met het magnetische rekje, verwijder het supernatant en gooi dit weg. Voeg 300 microliters TBS 1%Tween-20 toe aan de buis en meng voorzichtig om de kraaltjes opnieuw te suspenderen. Verzamel de kraaltjes, verwijder het supernatant en gooi dit weg.Herhaal deze wasstap twee keer. Voeg 100 µL van de 1 M glycine pH 2 toe aan de magnetische beads. En incubeer gedurende vijf minuten bij kamertemperatuur.Verzamel de beads en verwijder het supernatant dat de geëlueerde gebiotinyleerde oppervlakte-eiwitten bevat. Figuur één is een weergave van het protocol dat is gebruikt om epitheelcellen en hun oppervlakte-eiwitten uit een hele teek te isoleren. Met dit protocol kunnen ongeveer 1,2 x 10⁷ cellen per mL met een levensvatbaarheid van 75 tot 80% en 20 tot 24 µg gezuiverde gebiotinyleerde oppervlakte-eiwitten worden gezuiverd uit een initiële dissectie van 50 teken.Representatieve fluorescentiemicroscopiebeelden van teek-darmepitheelcellen die volgens dit protocol zijn klaargemaakt, worden getoond in figuur 2A en 2B. De cellen vertonen een enkelvoudige, sferische morfologie met een glad oppervlak en een consistente grootte in het gehele monster. Bij onvoldoende isolatie is te zien dat de individuele epitheelcellen onvolledig zijn gedissocieerd, waarbij verschillende celpopulaties kunnen worden geïdentificeerd aan de hand van de variërende celgroottes en morfologieën.Kruiscontaminatie door gastheerproteïnen, figuur 3A, kan worden geminimaliseerd door de darmen van de teek voldoende te spoelen om een witte of heldere Percoll-gradiënt te verkrijgen, figuur 3B. Vergelijking van proteïnen via SDS-PAGE, figuur 4A, zilverkleuring, figuur 4B, dot blot, figuur vijf, en ELISA, figuur zes, geeft aan dat de beschreven methodologieën succesvol biotinyleerde oppervlakteproteïnen hebben gezuiverd uit individuele epitheelcellen die zijn geïsoleerd uit de darmen van Rhipicephalus microplus teken. Concluderend hebben de in deze studie gebruikte methoden succesvol individuele epitheelcellen geïsoleerd uit de gehele darm van Rhipicephalus microplus.Eiwitten van het oppervlak van epitheelcellen van Rhipicephalus microplus werden verkregen voor verdere analyses en studies. Ten slotte heeft het ontwikkelde protocol de potentiële opbrengst van individuele epitheelcellen uit de darm van de teek en de efficiëntie van gebiotinyleerde oppervlakte-eiwitten van de cel aangetoond. Het ontwikkelde protocol kan worden toegepast bij elke teeksoort van economisch belang in een poging om teek-gastheerinteracties te onderzoeken door de membraaneiwitsamenstelling van de darm te bestuderen.

purification-biotinylated-cell-surface-proteins-from-rhipicephalus

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Biochemie

Gereglementeerde endocytose regelt de cel oppervlakte-expressie niveaus van de meerderheid van de membraaneiwitten. Hier maken wij gebruik van herleidbaar, membraan impermeant biotinylatie reagentia aan de endocytische koers van de dopamine transporter (DAT), een membraaneiwit polytopic te meten. De methode maakt een directe benadering van het meten van de endocytische snelheid van de meeste plasma-membraan eiwitten.

Het meten van plasma membraaneiwit endocytische de tarieven door Omkeerbare biotinylatie

This video demonstrates a method to assess target protein internalization in the mouse cortical astrocytes using biotinylation, followed by cell lysis, streptavidin-based protein extraction, denaturation, and Western blot analysis to confirm successful internalization.

Assessing the Internalization of  Target Surface Proteins Using a Biotin Derivative

Membraantransport omvat het transport van eiwitten van het plasmamembraan naar het celinterieur (d.w.z. endocytose) gevolgd door transport naar lysosomen voor afbraak of naar het plasmamembraan voor recycling. De methoden die in dit artikel worden beschreven, zijn ontworpen om endocytose en recycling van plasmamembraaneiwitten te bestuderen.

De op cellen gebaseerde L-glutathionebeschermingstests om endocytose en recycling van plasmamembraaneiwitten te bestuderen

Een werkwijze wordt beschreven voor een efficiënte zuivering van twin-Strep-gemerkte fusie-eiwitten en hun specifieke complexen van gemodificeerde streptavidine (Strep-Tactin) hars covalent verknoopt met Bis (sulfosuccinimidyl) suberaat (BS3). De methode heeft de voordelen van hoge snelheid, goede doeleiwit terugwinning en hoge zuiverheid, en is compatibel met daaropvolgende analyse door massaspectrometrie.

Een stap Zuivering van Twin-Strep-gelabeld eiwitten en hun complexen op Strep-Tactin Resin Cross-linked met bis (sulfosuccinimidyl) suberaat (BS3)

We bieden een methode om gelijktijdig een bibliotheek van antilichaamfragmenten te screenen op bindingsaffiniteit en cytoplasmatische oplosbaarheid door gebruik te maken van de Escherichia coli twin-arginine translocatieroute, die een inherente kwaliteitscontrolemechanisme heeft voor intracellulaire eiwitvouwing, om de antilichaamfragmenten op het binnenmembraan weer te geven.

Bacteriële Inner-membraan Display voor het screenen van een bibliotheek van antilichaamfragmenten

Twee biotinylatie-gebaseerde methoden, ontworpen voor het bepalen van de expressie van de celoppervlak en de endocytische snelheid van eiwitten uitgedrukt in het plasmamembraan, worden in dit rapport weergegeven.

Bepaling van de expressie van de celoppervlakte en de endocytische snelheid van eiwitten in primaire astrocytekulturen met behulp van biotinylering

Hier presenteren we een gewijzigd CLIP-seq protocol genaamd FbioCLIP-seq met FLAG-biotine tandem zuivering om de RNA doelen van RNA-bindende eiwitten (RBPs) in zoogdiercellen te bepalen.

Transcriptome-Wide Profilering van Protein-RNA Interacties door Cross-Linking en Immunoprecipitatie Gemedieerd door FLAG-Biotine Tandem Purification

Dit manuscript beschrijft een genoom-schaal celgebaseerde screening benadering om extracellulaire receptor-ligand interacties te identificeren.

Celoppervlakreceptoridentificatie met genoomschaal CRISPR/Cas9 genetische schermen

AviTag-specifieke locatie-beperkte verlichtingsversterkte biotinylatie (ALIBi) is een nieuwe optogenetisch geactiveerde methode ontwikkeld voor het labelen en affiniteitszuiveren van subcellulaire populaties van ribosomen voor downstream sequencing en proteomische analyse.

Isolatie van subcellulaire ribosoomsubpopulaties op basis van recombinante peptide-tag-specifieke locatie-beperkte verlichtingsversterkte biotinylering

Het protocol presenteert een methode voor in vivo covalente hechting van biotine aan eiwitten op basis van hun nabijheid tot een biotineligase die is gefuseerd met een interessant eiwit. Deze modificatie maakt een selectieve verrijking van de eiwitten mogelijk met behulp van streptavidinekorrels als dat nodig is in eiwitinteractiestudies.

In vivo Nabijheidsbiotinylering voor onderzoek naar eiwitinteractie in Paramecium tetraurelia

Leer een gemodificeerde Percoll-gradiëntmethode om epitheelcellen te isoleren uit de darm van Rhipicephalus microplus. Biotinyleer oppervlakte-eiwitten en zuiver deze met streptavidine magnetische kralen voor verdere analyses.

Zuivering van Biotinylated Cell Surface Proteins uit

Meer video's verkennen