Name: Kwantificerende vertakkingsdichtheid in Rat Mammary Gland Whole-mounts Met behulp van de Sholl Analyse Methode (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-07-12T13:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 2 s
Description: Leer de Sholl-analyse voor kwantitatieve beoordeling van vertakkingsdichtheid in mammaklieren van ratten. Deze methode met ImageJ biedt objectieve metingen voor ontwikkelingsbiologisch onderzoek.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

De auteurs willen graag Dr. Michael Easterling (Social and Scientific Systems, Inc., Durham, NC) erkennen voor zijn assistentie bij de validatie van deze methode en voor zijn voortdurende dr. Tiago Ferreira (McGill University, Montreal, Quebec, Canada). Hulp bij de Sholl-applicatie.

Alle dierengebruik en procedures voor deze studie werden goedgekeurd door het NIEHS Laboratory Animal Care and Use Committee en uitgevoerd in een Vereniging voor beoordeling en accreditatie van laboratorium dierenwelzijn geaccrediteerde faciliteit. 1. Accijnzen Mammary Glands <ol><li> Zet alle glijbanen op met een xyleenvrije methode (het potlood werkt het beste). Bedek ze met een montageoplossing aan het einde om het etiket te bewaren. </li><li> Euthanize het dier door een goedgekeurde methode van de Institusionele Dierverzorging en -gebruik. </li><li> Na euthanasie, plaats het dier op zijn rug op een dissectatieplank ( Figuur 1 ). Strek en pin al vier de ledematen vast, waarbij de achterste ledematen een omgekeerde V vormen (vastpennen of kleine gaugenaalden werken goed). </li><li> Spuit de buik liberaal met 70% ethanol om haar uit het mammariummonster te houden. </li><li> Trek de buikhuid op de middellijn met een pincet en maak een kleine snedeSchaar dissecteren, wees voorzichtig om het peritoneum niet te punkteren. <ol><li> Begin bij de incisie, snijd de huid tot aan de nek en dan distaal aan de voorste ledemaat. Knip naar het inguinale gebied en dan distaal naar de eerste gewricht van de achterste ledematen aan dezelfde kant; Deze incisie scheidt meestal de dikke klieren 5 en 6. Vermijd het peritoneum snijden. </li><li> Trek de huid terug met het bijgevoegde vetpasta met behulp van pincet, voorzichtig scheiden van het peritoneum met behulp van het stompe uiteinde van het dissecteren van een schaar. Onafhankelijke dorsaal zoveel mogelijk de 4de en 5de inguinale melkklieren volledig bloot aan de onderkant van de huid; Knijp de huid aan op het dissectorbord ( figuur 2 ). </li><li> Pak voorzichtig het borstweefsel van het 5e klier met de bolle kant van gebogen pincet en trimmen langzaam de klier van de huid, dat evenwel niet tot nick de klier of de huid. </li><li> Ga verder met trimmen,bewegende dorsaal tot de 4 e en 5 e klieren zijn volledig uit de huid opgeheven. Zorg ervoor dat het tepelgebied met de rest van de klier verwijderd wordt, aangezien dit dient als uitgangspunt voor de Sholl-analyse. Knip het mammary tissue weg van het lichaam waar het bij de klier is vastgemaakt 4. </li></ol></li><li> Zodra de klier uit het dier is verwijderd, verspreid het gelijkmatig op een elektrostatisch geladen, 25 mm x 75 mm x 1 mm microscopie glijbaan, met de kant die naast de huid naar beneden gericht was. OPMERKING: Voor kieren van oudere of lakterende dieren kan een 51 x 75 x 1 mm glijbaan nodig zijn. </li><li> Terwijl u handschoenen draagt, duw er voorzichtig luchtbellen uit. Bedek de klier met een plastic paraffine film en een andere microscoopglijbaan en druk de klier om het vast te houden aan de glijbaan. OPMERKING: een 50 ml conische buis gevuld met water dient als een geschikt gewicht. De hoeveelheid tijd die nodig is om aan de dia te houden, hangt af van de dikte van de klier. Dun, postnaTal dag (PND) 4 klieren moeten gedurende minimaal 30 minuten gecomprimeerd worden, terwijl dikker, volwassen klieren mogelijk zo veel als 2-5 uur nodig hebben. </li></ol> 2. Bereid Mammary Whole-Mounts <ol><li> Bereid de carmine aluin oplossing minstens 24 uur van tevoren, omdat het kookt en koelt. <ol><li> Los 1 g carminealuminium op en 2,5 g aluminiumkaliumsulfaat (AlK (SO 4 ) 2 · 12H 2 O) in 500 ml gedestilleerd water en kook 20 minuten in een 1-liter fles. Breng het uiteindelijke volume tot 500 ml met gedestilleerd water. </li><li> Filter de oplossing door middel van filterpapier onder een vacuüm en koel voor opslag. OPMERKING: Carmine alum oplossing kan hergebruikt worden maar moet weggegooid worden als de kleur begint te vervagen. </li></ol></li><li> Vóór de fixatie, schil de paraffinefilm van de klier af, wees voorzichtig om de klier niet uit de glijbaan te trekken. Plaats de glijbaan (s) in een glazen glijmiddel en dompel in fixatief (100% ethaanOl, chloroform en ijsazijn in een verhouding van 6: 3: 1) gedurende 12-48 uur, afhankelijk van de dikte van de klieren. </li><li> Giet de fixatie af en laat de klieren in 70% ethanol gedurende 15 minuten zacht worden. Rehydrate de klieren geleidelijk door 1/3 van de ethanoloplossing uit te gieten en met gedestilleerd water te vervangen. Week voor 5 minuten. Herhaal dit proces drie keer. </li><li> Na de laatste spoeling giet dan alle ethanol / wateroplossing af en vervang deze met 100% gedestilleerd water. Week de klieren gedurende 5 minuten. </li><li> Giet het gedistilleerde water af en doei de klieren in de carmine-aluinoplossing. Vlek de klieren gedurende 12-24 uur, afhankelijk van de dikte. OPMERKING: De klieren kunnen niet oververfd worden, maar de kleurtijd voor meerdere batches moet hetzelfde zijn, zodat de kleurintensiteit hetzelfde is. </li><li> Giet de carminealuminiumoplossing af en spoel de klieren in 100% gedestilleerd water gedurende 30 s. Geleidelijk dehydraten uitdrogen door ze gedurende 15 minuten, 70% ethanol gedurende 15 minuten, 95% ethanol gedurende 15 minuten te laten doven, a100% ethanol gedurende 20 minuten. </li><li> Verwijder de klieren van vet door ze gedurende 12-72 uur in xyleen te slikken, afhankelijk van de dikte. OPMERKING: De klieren moeten doorschijnend zijn (duidelijk). Als er ondoorzichtige (whitish) gebieden blijven, blijf doordrenken in xyleen tot doorschijnend. Als lachende of anderszins dikke klieren worden gekleurd en verwijderd, moet het xyleen eens vervangen worden om de klieren volledig te verwijderen. </li><li> Monteer de dia&#39;s met een xyleen-opbouwmedium door voldoende medium te pipetteren om de klier enkel te bedekken. Voeg een deklip toe, zodat er geen luchtbellen ontstaan. </li><li> Laat de dia&#39;s drogen. Naarmate het montagemedium droogt, komt het onder de deklap aan, en het kan nodig zijn om extra montagemedium toe te voegen. Zodra er geen extra medium nodig is, laat de dia&#39;s volledig drogen; Dit kan 2-3 weken duren. </li><li> Zodra de glijbanen helemaal droog zijn, kan elk restmonteringsmiddel verwijderd worden met een katoenen pootje en een kleine hoeveelheid xyleen. Wees voorzichtig om niet te gebruikenTe veel xyleen, omdat dit het montagemedium kan oplossen en de deksel losmaken. Als dit gebeurt en luchtbellen verzamelen onder de deklaag, moet de deklaag in xyleen worden verwijderd en moet het montageproces worden herhaald. </li></ol> 3. Bereid volledige foto&#39;s voor analyse <ol><li> Vang afbeeldingen van full-mounts ( afbeelding 3 ) met behulp van een macroscope of dissecteer microscoop en een digitale camera met de juiste software. OPMERKING: Terwijl een vergroting die het hele glandulaire epithel vastlegt, kan worden geselecteerd, is het absoluut noodzakelijk om alle full-mount afbeeldingen vast te leggen die met dezelfde vergroting met elkaar worden vergeleken. </li><li> Download ImageJ software (of FIJI software) 6 . </li><li> Open de volledige foto van de mammografie in ImageJ door op &quot;Bestand&quot; → &quot;Openen&quot; te klikken. Selecteer het Freehand-gereedschap en traceer rond het klierpithium. Selecteer &#39;Bewerken&#39; en #8594; &#39;Clear Outside&#39;. <ol><li> Verwijder de lymfeklieren door het knooppunt te traceren en gebruikmaken van het Freehand-gereedschap en &quot;Bewerken&quot; → &quot;Snijden&quot;. </li></ol></li><li> Scheid de kleurkanalen door &quot;Beeld&quot; → &quot;Kleur&quot; → &quot;Split-kanalen te selecteren.&quot; Selecteer het kanaal met het beste contrast, meestal het blauwe kanaal. OPMERKING: een RGB-afbeelding bestaat uit een stapel van de rode, groene en blauwe componenten van die afbeelding. Deze actie scheidt deze componenten in drie 8-bits grijstinten afbeeldingen. </li><li> Trek de achtergrond af door &quot;Proces&quot; → &quot;Achtergrond trekken&quot; te selecteren. Kies de gewenste parameters en klik vervolgens op &#39;Voorbeeld&#39; om de wijzigingen te bekijken. OPMERKING: &quot;Subtract Background&quot; verwijdert gladde, continue achtergronden. Bovendien kan &quot;Process&quot; → &quot;Filters&quot; → &quot;Unsharp Mask&quot; worden gebruikt om contrast te maken. </li><li> Kies een van de th<html> E volgende methoden voor het automatisch verwijderen van geluid: despeckle of remove outliers. OPMERKING: ImageJ biedt een derde methode voor automatische geluidsverwijdering: verwijder NaNs. Het verwijderde NaNs commando is echter niet van toepassing, aangezien het 32-bits beelden gebruikt, en de huidige methode maakt gebruik van 8-bits beelden. <ol><li> Verwijder geluid met behulp van het despeckle commando door &quot;Process&quot; → &quot;Noise&quot; → &quot;Despeckle&quot; te selecteren. OPMERKING: Dit komt overeen met het toevoegen van een median filter, dat elke pixel vervangt met de gemiddelde waarde in de 3 × 3 buurt. </li><li> Verwijder geluid met behulp van het commando Remove Outliers door &quot;Process&quot; → &quot;Noise&quot; → &quot;Remove Outliers&quot; te selecteren. OPMERKING: dit proces vervangt een pixel met de mediaan van de pixels in de directe omgeving als het afwijkt van de mediaan met meer dan een bepaalde waarde (de drempelwaarde). </li></ol></li><li> Verwijder eventueel nog resterende geluiden (Lass = &quot;xfig&quot;&gt; Afbeelding 4). <ol><li> Open een kopie van het originele beeld en gebruik dit als een gids voor wat is en wat is geen geluid. Klik op de dubbele rode pijlknop rechts van de werkbalk. Selecteer de tekeninstrumenten; De tekenbewerkingsknoppen worden nu in de werkbalk weergegeven. </li><li> Klik op het gereedschap Eraser. Stel de diameter van de gumdier in met de rechtermuisknop op de knop Eraser. Houd de linkermuisknop ingedrukt om geluid te wissen. OPMERKING: slechts één sessie van wissen kan ongedaan gemaakt worden. Zodra de linker muisknop is vrijgegeven en opnieuw geklikt, kan de vorige verwijdering niet ongedaan gemaakt worden. </li></ol></li><li> Stel de drempel aan door &quot;Beeld&quot; → &quot;Aanpassen&quot; → &quot;Drempel&quot; te selecteren. Verplaats de schuifregelaars om de minimale (bovenste schuifregelaar) en de maximale (onderste schuifregelaar) drempelwaarden aan te passen tot een adequate afbeelding van de klier is bereikt. OPMERKING: Stel de drempelwaarde-segmenten in grijstinten in eigenschappen van belang en achtergrond.<ol><li> Klik op Toepassen. Verwijder eventueel extra geluid op dit punt door de stappen 3.6.1 en 3.6.2 te volgen. </li></ol></li><li> Reconstructeer de delen van het klierpitheel dat verwijderd werden door drempel en geluidsverwijdering ( Figuur 5 ). <ol><li> Doe de beeldherstructurering zorgvuldig en minimaal om de integriteit van het originele beeld te behouden. Raadpleeg de originele afbeelding voor een verwijzing naar wat is en wat is geen epithelium. </li><li> Klik op het gereedschap Spray Can (op de werkbalk met de tekeninstrumenten). Stel de spuitdiameter en de snelheid aan door met de rechtermuisknop op de knop Spray Can te drukken. Vul de ontbrekende delen van de klier voorzichtig in door op de linkermuisknop te klikken of te houden. </li></ol></li><li> Maak een geraamd beeld van de klier voor het uitvoeren van de Sholl Analyse. Zorg ervoor dat het gedeprimeerde beeld binair is door &quot;Proces&quot; → &quot;Binair&quot; → &quot;B te selecteren<html> inary.&quot; <ol><li> Als de afbeelding op een zwarte achtergrond wit is, selecteer u &#39;Process&#39; → &#39;Binair&#39; → &#39;Opties&#39; en verwijder de optie &#39;Zwarte achtergrond&#39;. Skeletoniseer het beeld door &quot;Process&quot; → &quot;Binary&quot; → &quot;Skeletonize&quot; te selecteren. OPMERKING: dit herhaaldelijk verwijdert pixels van de randen van het binaire beeld totdat deze wordt verlaagd tot een enkele pixel-brede vorm. </li><li> Verf één keer de afbeelding door &quot;Process&quot; → &quot;Binary&quot; → &quot;Dilate&quot; te selecteren. OPMERKING: dit vult de leemten op die door de drempel en het skelet worden gemaakt door pixels aan de randen van het binaire beeld toe te voegen. </li></ol></li><li> Sla de afbeelding op door &quot;File&quot; → &quot;Save As&quot; te selecteren. Selecteer een afbeeldingstype (typisch jpeg), voer de bestandsnaam in en klik op &#39;OK&#39;. </li><li> Controleer de nauwkeurigheid van het skeletvormige beeld door het skeletonformeerde beeld over te leggen op het originele beeld (Ass = &quot;xfig&quot;&gt; afbeelding 6). <ol><li> Maak een overlay aan door zowel de originele afbeelding als de geraamde afbeelding te openen. Selecteer &quot;Afbeelding&quot; → &quot;Overlay&quot; → &quot;Afbeelding toevoegen&quot;. Selecteer in het dialoogvenster Afbeelding toevoegen de afbeeldingen van het skelet in het vervolgkeuzemenu &#39;Afbeelding aan toevoegen&#39; en stel de opaciteit op 30%. </li><li> Bewaar de afbeelding van het skeletbeeld dat op het origineel is overgelegd door &quot;File&quot; → &quot;Save As&quot; te selecteren. Selecteer een afbeeldingstype, voer de bestandsnaam in en klik op &#39;OK&#39;. </li></ol></li></ol> 4. Voer de Sholl Analyse uit <ol><li> Open een skeletbeeld en maak de afbeelding binair door &quot;Proces&quot; → &quot;Binair&quot; → &quot;Binair maken&quot; te selecteren. <ol><li> Voordat u de vergrotingsschaal instelt, meet u het aantal pixels / mm met behulp van een micrometer voor de vergroting waarbij de beelden werden vastgelegd. </li><li> Stel de gemeten vergroting s inCale door &quot;Analyse&quot; → &quot;Scale instellen&quot; te selecteren. Voer het aantal pixels / mm in. Stel de &#39;Bekende afstand&#39; en de &#39;Pixel Aspect Ratio&#39; in. Ga als volgt te werk: 1. Typ &quot;mm&quot; voor de &quot;Lengte eenheid&quot; en controleer &quot;Global&quot; (behoud dezelfde schaal voor elke afbeelding). </li></ol></li><li> Bepaal de eindradius (omhulling van de straal) voor de Sholl-analyse door een lijn te tekenen vanaf het begin van het primaire kanaal (centrum van de analyse) naar het meest distale punt van het klierpitheel ( Figuur 7 ). <ol><li> Gebruik het lijntekeningsgereedschap in de werkbalk om een ​​lijn tussen de bezienswaardigheden te trekken. Druk op de &quot;M&quot; toets om een ​​meting te maken en let op dat een resultaatvenster wordt geopend. OPMERKING: De waarde in de kolom &quot;Lengte&quot; is de lengte van de regel in mm. Deze waarde wordt automatisch ingevoerd als het eindradius bij het instellen van de Sholl-parameters. De Sholl plugin zal het startpunt gebruikenVan de lijn als het midden van de centrische ringen. </li></ol></li><li> De Sholl Analyse uitvoeren. <ol><li> Doe de analyse door &quot;Plugins&quot; te selecteren &quot;Advanced Sholl Analysis;&quot; Er verschijnt een parametervenster. </li><li> Stel de startradius in &quot;I. Definitie van schelpen&quot; in op 0,00 mm; De lengte van de lijn gemeten in stap 4.2 wordt automatisch ingevoerd als de &quot;eindradius&quot;. </li><li> Stel de &quot;Radius Step Size&quot; in op 0,1 mm. OPMERKING: De straalstrookgrootte bepaalt het aantal ringen (effectief het aantal iteraties); Een kleinere stapgrootte verhoogt het aantal ringen, terwijl een grotere stapgrootte het aantal ringen zal verlagen. De straal kan niet te klein worden ingesteld, hoewel een te kleine radius tot een onnodig groot aantal ringen zal leiden. Het kan echter te groot worden ingesteld, wat minder ringen zal veroorzaken en vervolgens het echte aantal kruispunten onderschatten. Zie Stanko et al.(2015) voor meer informatie over het bepalen van de stapgrootte. </li><li> Stel de &quot;# Monsters&quot; op 1 en de &quot;Integratie&quot; in &quot;Mean&quot; in &quot;II. Meerdere monsters per straal.&quot; </li><li> Stel de &quot;Afsluiting van de afsluiter&quot; in op 1 en controleer &quot;Afleiden van de startradius&quot; voor de &quot;# Primaire takken&quot; in &quot;III. Descriptors and Curve Fitting.&quot; OPMERKING: &quot;Fit profiel en bereken descriptors&quot; en &quot;Show fit details&quot; kunnen worden gecontroleerd naar wens. </li><li> Controleer &quot;Lineair&quot; en selecteer &quot;Best passende graad&quot; in &quot;Profielen zonder normalisatie;&quot; Kijk &#39;meest informatief&#39;. Selecteer &#39;Gebied voor genormaliseerde profielen&#39; in &#39;IV. Sholl-methoden&#39;. </li><li> Controleer &quot;Maskers maken in&quot; in &quot;V. Output-opties&quot; om een ​​hittekaart van de kruispunten te maken (optioneel). </li><li> Klik op &quot;Zie segmentatie&quot; om een ​​voorbeeldvenster van de afbeelding te genereren met ringen om het gebied te bevestigenVan analyse. </li></ol></li><li> Klik op &quot;OK&quot; om de analyse uit te voeren. </li></ol> 5. Meten van het MEA <ol><li> Meet het MEA door de kortste afstand rond de epitheliale boom te vinden ( Figuur 8 ). <ol><li> In ImageJ met het skeletbeeld van de klier open, klik op het Polygon tool. Klik op een punt op de omtrek van de epitheliale boom om de veelhoek te beginnen, rond de omtrek van de klier te bewegen en klik om een ​​lijnsegment toe te voegen. </li><li> Wanneer het gehele epitheliale gebied is omzeild, dubbelklik om de polygoon te sluiten. Druk op de &quot;M&quot; toets om een ​​resultatenvenster te openen; De waarde in de kolom &quot;Gebied&quot; is de MEA. </li></ol></li><li> In gevallen waarin het klierpitel zich buiten het lymfeknoop heeft verlengd, trekt u het lymfekliergebied (LNA) van het MEA af bij het berekenen van de vertakkingsdichtheid. <ol><li> Meet de LNA door het lymfeknoop in dezelfde man op te sporenEr als de epitheliale boom en druk op &quot;M.&quot; OPMERKING: De LNA moet in deze gevallen van de MEA worden afgetrokken omdat het lymfeknoop de analyse voorkomt door kruisingen in het LNA te tellen. Wanneer het epitheel niet het lymfeknoop heeft bereikt, is het LNA nul. </li></ol></li></ol> 6. Rapportering van gegevens <ol><li> Meld waarden voor de omsloten radius, MEA, N, k en vertakkingsdichtheid. OPMERKING: De omgevingsstraal wordt bepaald in stap 4.2 en het MEA wordt bepaald in stap 5.1. <ol><li> Voer de analyse uit om een ​​Sholl-resultatenvenster te genereren. OPMERKING: De gerapporteerde N is de waarde voor de som inters. De gerapporteerde k is de waarde voor de Sholl regressiecoëfficiënt (semi-log). De Sholl analyse zal een waarde voor k over elk gemeten gebied van het klierpitium terugkeren. Om een ​​nauwkeurige waarde voor k over het volledige epithel te verkrijgen, moeten de ductale uiteinden aanwezig zijn. </li><li> Wijzigen thE Sholl analyse voor de borstkanker door gebruik te maken van de output waarde voor N om de vertakkingsdichtheid te berekenen (het fundamentele eindpunt van deze methode). Bereken de vertakkingsdichtheid met de formule N / (MEA-LNA) en meld de waarde als N / mm 2 . </li></ol></li></ol>

<ol><li>Sholl, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dendritic+organization+of+the+neurons+in+the+visual+and+motor+cortices+of+the+cat%5BTitle%5D)+AND+%22J+Anat%22%5BJournal%5D)">Dendritic organization of the neurons in the visual and motor cortices of the cat.</a> J Anat. 87 (4), 387-406 (1953).</li>
<li>Ferreira, T. A., Iacono, L. L., Gross, C. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Serotonin+receptor+1A+modulates+actin+dynamics+and+restricts+dendritic+growth+in+hippocampal+neurons%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+J+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Serotonin receptor 1A modulates actin dynamics and restricts dendritic growth in hippocampal neurons.</a> Eur J Neurosci. 32 (1), 18-26 (2010).</li>
<li>Stanko, J. P., Easterling, M. R., Fenton, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+Sholl+analysis+to+quantify+changes+in+growth+and+development+in+rat+mammary+gland+whole+mounts%5BTitle%5D)+AND+%22Reprod+Toxicol%22%5BJournal%5D)">Application of Sholl analysis to quantify changes in growth and development in rat mammary gland whole mounts.</a> Reprod Toxicol. 54, 129-135 (2015).</li>
<li>Assis, S., Warri, A., Cruz, M. I., Hilakivi-Clarke, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Changes+in+Mammary+Gland+Morphology+and+Breast+Cancer+Risk+in+Rats%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Vis.+Exp%22%5BJournal%5D)">Changes in Mammary Gland Morphology and Breast Cancer Risk in Rats.</a> J. Vis. Exp. (44), e2260(2010).</li>
<li>Plante, I., Stewart, M. K., Laird, D. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+Mammary+Gland+Development+and+Function+in+Mouse+Models%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Vis.+Exp%22%5BJournal%5D)">Evaluation of Mammary Gland Development and Function in Mouse Models.</a> J. Vis. Exp. (53), e2828(2011).</li>
<li>Ferreira, T. Sholl Analysis. ImageJ. , Available from:
 <a target="_blank" href="http://imagej.net/Sholl_Analysis">http://imagej.net/Sholl_Analysis</a> (2012).</li>
<li>Ferreira, T., Rasband, W. ImageJ User Guide. IJ 1.46r. ImageJ. , Available from:
 <a target="_blank" href="https://imagej.nih.gov/ij/docs/guide/146.html">https://imagej.nih.gov/ij/docs/guide/146.html</a> (2012).</li>
<li>Tucker, D. K., Foley, J. F., Hayes-Bouknight, S. A., Fenton, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Preparation+of+High-quality+Hematoxylin+and+Eosin-stained+Sections+from+Rodent+Mammary+Gland+Whole+Mounts+for+Histopathologic+Review%5BTitle%5D)+AND+%22Toxicol+Pathol%22%5BJournal%5D)">Preparation of High-quality Hematoxylin and Eosin-stained Sections from Rodent Mammary Gland Whole Mounts for Histopathologic Review.</a> Toxicol Pathol. 44 (7), 1059-1064 (2016).</li>
<li>Fenton, S. E., Hamm, J. T., Birnbaum, L. S., Youngblood, G. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Persistent+abnormalities+in+the+rat+mammary+gland+following+gestational+and+lactational+exposure+to+2%2C3%2C7%2C8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin+%28TCDD%29%5BTitle%5D)+AND+%22Toxicol+Sci%22%5BJournal%5D)">Persistent abnormalities in the rat mammary gland following gestational and lactational exposure to 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD).</a> Toxicol Sci. 67 (1), 63-74 (2002).</li>
<li>Murray, T. J., Maffini, M. V., Ucci, A. A., Sonnenschein, C., Soto, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Induction+of+mammary+gland+ductal+hyperplasias+and+carcinoma+in+situ+following+fetal+bisphenol+A+exposure%5BTitle%5D)+AND+%22Reprod+Toxicol%22%5BJournal%5D)">Induction of mammary gland ductal hyperplasias and carcinoma in situ following fetal bisphenol A exposure.</a> Reprod Toxicol. 23 (3), 383-390 (2007).</li>
<li>Moral, R., Santucci-Pereira, J., Wang, R., Russo, I. H., Lamartiniere, C. A., Russo, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+utero+exposure+to+butyl+benzyl+phthalate+induces+modifications+in+the+morphology+and+the+gene+expression+profile+of+the+mammary+gland%3A+an+experimental+study+in+rats%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Health%22%5BJournal%5D)">In utero exposure to butyl benzyl phthalate induces modifications in the morphology and the gene expression profile of the mammary gland: an experimental study in rats.</a> Environ Health. 10 (1), 5(2011).</li>
<li>Johnson, M. D., Mueller, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three+dimensional+multiphoton+imaging+of+fresh+and+whole+mount+developing+mouse+mammary+glands%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Cancer%22%5BJournal%5D)">Three dimensional multiphoton imaging of fresh and whole mount developing mouse mammary glands.</a> BMC Cancer. 13, 373(2013).</li>
<li>Enoch, R. R., Stanko, J. P., Greiner, S. N., Youngblood, G. L., Rayner, J. L., Fenton, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mammary+gland+development+as+a+sensitive+end+point+after+acute+prenatal+exposure+to+an+atrazine+metabolite+mixture+in+female+Long-Evans+rats%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Health+Persp%22%5BJournal%5D)">Mammary gland development as a sensitive end point after acute prenatal exposure to an atrazine metabolite mixture in female Long-Evans rats.</a> Environ Health Persp. 115 (4), 541-547 (2007).</li>
<li>Hovey, R. C., Coder, P. S., Wolf, J. C., Sielken, R. L., Tisdel, M. O., Breckenridge, C. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+assessment+of+mammary+gland+development+in+female+Long+Evans+rats+following+in+utero+exposure+to+atrazine%5BTitle%5D)+AND+%22Toxicol+Sci%22%5BJournal%5D)">Quantitative assessment of mammary gland development in female Long Evans rats following in utero exposure to atrazine.</a> Toxicol Sci. 119 (2), 380-390 (2011).</li>
<li>Mandrup, K. R., Hass, U., Christiansen, S., Boberg, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Perinatal+ethinyl+oestradiol+alters+mammary+gland+development+in+male+and+female+Wistar+rats%5BTitle%5D)+AND+%22Inter+J+of+Androl%22%5BJournal%5D)">Perinatal ethinyl oestradiol alters mammary gland development in male and female Wistar rats.</a> Inter J of Androl. 35 (3), 385-396 (2012).</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

Van de geboorte tot de puberteit is de groei van de borstklier allometrisch. Na de puberteit ontwikkelt de borstkanker door middel van uitgebreide ductale vertakking en verlenging, die doorgaan tot het epitheel van het mammarium de hele vetpoot opneemt. Vertakkingseigenschappen zijn een belangrijk aspect van de ontwikkeling van de borstklier, en het vermogen om deze kenmerken objectief te kwantificeren kan zeer nuttig zijn voor het beoordelen van de normale ontwikkeling van de borst en voor het identificeren van abnorma...

Mammary gland branching is een kenmerk dat algemeen wordt beschouwd als een indicator van de ontwikkeling van de klier, maar het is moeilijk om objectief te kwantificeren. In 1953 beschreef Sholl 1 een methode voor het meten van neuronale dendritische arborisatie in de visuele en motorische cortices van de kat en een plugin voor deze techniek werd ontwikkeld door Ferriera et al. 2 . Omdat beide neuronen en mammeklieren een soortgelijke boomachtige structuur vertonen, werd de plugin gebruikt om de epitheliale vertakkingsdichtheden van de mammografische epitheel te kwantificeren in 2D beelden van de peripubertal-ratmembraan. De peripubertalfase werd gekozen voor analyse omdat het spenen is een levensfase die vaak wordt beoordeeld in academische laboratoria en testrichtlijnen. De Sholl analyse is een plugin verdeeld met FIJI, dat is het open source image processing pakket ImageJ, met extra plugins opgenomen. De plugin creëert een reeks concentrische ringen die een predef omringenIn het centrum (typisch de soma van een neuron of de oorsprong van het primaire kanaal van een borstkanker) en strekt zich uit naar het meest distale deel van het voorwerp (de omhullende radius). Het telt dan het aantal kruispunten (N) dat op elk van de ringen voorkomt. De plugin geeft ook een Sholl regressiecoëfficiënt ( k ), die een afmeting van de verval van epitheliale vertakkingen is. Met behulp van ImageJ wordt een geraamd beeld van een volledige membraan gecreëerd en wordt het mammale epitheliale gebied (MEA) gemeten. De afbeelding wordt geanalyseerd met behulp van de Sholl analyse plugin, en de waarden voor N en k , onder andere waarden die hier niet worden gebruikt, worden teruggestuurd. Mammary epithelial branching density wordt bepaald door N / MEA te berekenen. De mate waarin vertakking in de buitenste gebieden van het klierpithelium doorloopt, is de vertakkingscomplexiteit en is een indicator voor uniforme distale epitheliale groei. Omdat k een maat is van de distale afname in epithElial branching, het is een effectieve maatstaf voor de vertakkingscomplexiteit en een betrouwbare indicator voor de ontwikkeling van de borst. Dit protocol beschrijft een computer-geassisteerde methode voor het creëren van geraamiseerde beelden van volledige muizen van de membraan en kwantitatieve evaluatie van de vertakkingseigenschappen van de mammier in peripubertal mannelijke en vrouwelijke ratten. Deze methode is relatief snel en vereist geen gebruik van gespecialiseerde microscopie-apparatuur. Ontwikkeling en validatie van deze werkwijze zijn beschreven in Stanko et al. (2015) 3 . Dit rapport beschrijft ook de bereiding van ratmurgheelkunde hele = mounts. Soortgelijke procedures voor volledige monstering van de mammografie zijn beschreven in de Assis et al. (2010) 4 en Plante et al. (2011) 5 .

<table><tbody><tr><td>Dissectieplank</td><td>NA</td><td>NA</td><td>Een stuk piepschuim van ongeveer 10"x12" is geschikt.</td></tr><tr><td>Dissectie T-spelden</td><td>Daigger</td><td>EF7419A</td><td></td></tr><tr><td>Spuitfles met ethanol</td><td>NA</td><td>NA</td><td>70% ethanol is geschikt.</td></tr><tr><td>Gebogen dissectieschaart</td><td>Fine Science Tools</td><td>14569-09</td><td></td></tr><tr><td>Rechte dissectieschaart</td><td>Fine Science Tools</td><td>14568-09</td><td></td></tr><tr><td>Gebogen pincetten</td><td>Fine Science Tools</td><td>11003-12</td><td></td></tr><tr><td>Superfrost Plus 24 x 75 x 1 mm microscoopglazen</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>4951PLUS-001</td><td>Thermo Scientific Superfrost Plus &amp; Colorfrost Plus glazen houden weefselsecties permanent vast zonder de noodzaak voor dure coatings in IHC en Anatomische Pathologie toepassingen. Deze behandeling vermindert weefselverlies tijdens kleuring evenals uren van schuifvoorbereiding. Glazen trekken elektrostatisch bevroren weefselsecties en cytologie voorbereidingen aan en hebben een chemie vergelijkbaar met silane, hoewel geoptimaliseerd om de toepassingsprestaties te verbeteren. https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/4951PLUS4.&nbsp;</td></tr><tr><td>Fisherfinest Premium Dekglaas 24 x 60 x 1 mm</td><td>Fisher scientific</td><td>12-548-5P</td><td></td></tr><tr><td>Bemis Parafilm M Laboratoriumwikkelfolie</td><td>Fisher scientific</td><td>13-374-12</td><td></td></tr><tr><td>Chloroform</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C2432</td><td></td></tr><tr><td>Glazuur azijnzuur</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A9967</td><td></td></tr><tr><td>Ethanol absoluut, &ge;99,8% (GC)&nbsp;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>24102</td><td></td></tr><tr><td>XYleen</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>214736</td><td></td></tr><tr><td>Carmine alum&nbsp;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C1022</td><td></td></tr><tr><td>Aluminiumkaliumsulfaat&nbsp;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A6435</td><td></td></tr><tr><td>Permount montagemedium</td><td>Fisher Scientific</td><td>SP15</td><td></td></tr><tr><td>Macroscoop</td><td>Leica</td><td>Z16 APO&nbsp;</td><td>Dit is de hardware en software voor het vastleggen van beelden die in dit laboratorium wordt gebruikt.&nbsp; Aangezien er veel verschillende opties zijn, kunnen de methoden en toepassingen tussen laboratoria variëren.</td></tr><tr><td>Digitale camera</td><td>Leica</td><td>DFC295</td><td></td></tr><tr><td>Camera software</td><td>Leica</td><td>Leica Application Suite v3.1&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>ImageJ software</td><td>Open source</td><td>http://imagej.net/Welcome</td><td></td></tr><tr><td>Sholl analyse&nbsp;</td><td>Open source</td><td>http://imagej.net/Sholl_Analysis</td><td></td></tr></tbody></table>

kwantificerende vertakkingsdichtheid in rat mammary gland whole-mounts met behulp van de sholl analyse methode

Quantifying Branching Density in Rat Mammary Gland Whole-mounts Using the Sholl Analysis Method

Een toenemend aantal studies maakt gebruik van de knaagdier-klier als een eindpunt voor de beoordeling van de ontwikkelingstoxiciteit van een chemische blootstelling. De effecten die deze blootstellingen hebben op de ontwikkeling van de borstklier worden typisch geëvalueerd met behulp van basisdimensionale metingen of door morfologische kenmerken te scoren. Het brede scala van methoden voor het interpreteren van ontwikkelingsveranderingen kan echter leiden tot inconsistente vertalingen in laboratoria. Een gemeenschappelijke beoordelingsmethode is nodig, zodat er goede interpretaties kunnen worden gevormd uit gegevens die in vergelijking met studies worden vergeleken. De onderhavige studie beschrijft de toepassing van de Sholl analysemethode om de vertakkingseigenschappen van de borstklier te kwantificeren. De Sholl-methode werd oorspronkelijk ontwikkeld voor gebruik bij het kwantificeren van neuronale dendritische patronen. Door gebruik te maken van ImageJ, is een softwarepakket voor open-source beeldanalyse en een plugin ontwikkeld voor deze analyse, de vertakkingsdichtheid van de borstkanker en de complexiteit van amAmmerklier van een peripubertal vrouwelijke rat werden bepaald. De hier beschreven methoden maken het gebruik van de Sholl-analyse mogelijk als een effectief hulpmiddel om een ​​belangrijk kenmerk van de ontwikkeling van de borstklier te kwantificeren.

De waarden voor de gemeten afgesloten straal, MEA, N, k , en berekende vertakkingsdichtheid voor de borstkanker die in dit protocol worden geanalyseerd, worden vermeld in tabel 1 . De Sholl analyse genereert lineaire en semi-log plots van het aantal kruispunten bij elke straal ( Figuur 9 ) en, indien geselecteerd, een warmtekaart van de kruispunten ( Figuur 10 ). Minder ontwikkelde klieren vertoont mind...

Ontwikkeling van de mammageklier in het knaagdier is typisch geëvalueerd met behulp van beschrijvende beoordelingen of door het meten van basis fysieke attributen. Vertakingsdichtheid is een indicator van de ontwikkeling van de moeders die moeilijk is om objectief te kwantificeren. Dit protocol beschrijft een betrouwbare methode voor de kwantitatieve beoordeling van de vertakkingseigenschappen van de borstklier.

Kwantificerende vertakkingsdichtheid in Rat Mammary Gland Whole-mounts Met behulp van de Sholl Analyse Methode

An increasing number of studies are utilizing the rodent mammary gland as an endpoint for assessing the developmental toxicity of a chemical exposure. The ...

Het algemene doel van deze computerondersteunde methode is om de vertakkingsdichtheid en het vertakkingsverval van de melklier objectief te kwantificeren, twee belangrijke ontwikkelingsindicatoren bij knaagdieren, door een aangepaste Sholl-analyse toe te passen op whole-mount beelden van de melklier. Deze methode kan helpen bij het beantwoorden van vragen in het veld van de melklierbiologie, zoals de vraag hoe blootstelling aan chemicaliën de ontwikkeling van de melklier kan beïnvloeden. Het belangrijkste voordeel van deze techniek is dat er gebruik wordt gemaakt van opensourcesoftware om fundamentele kenmerken van de melklierontwikkeling objectief te kwantificeren.Zorg voor deze procedure over beelden van whole-mounts waarop het klierepitheel bij een vaste vergroting te zien is. Open eerst een afbeelding in ImageJ. Selecteer vervolgens de freehand tool.Trek een omtrek rond het klierepitheel en maak het omliggende gebied vrij. Trek vervolgens een omtrek rond de lymfeknoop en verwijder dit deel van de afbeelding met het knipcommando. Als de achtergrond van de afbeelding zwart is, moet deze worden omgezet naar wit.Klik op Bewerken, vervolgens op Opties en dan op Kleuren. Selecteer in

quantifying-branching-density-rat-mammary-gland-whole-mounts-using

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

Ontwikkelingsbiologie

Ons protocol wordt beschreven hoe u de rat buik borstklier ontleden en hoe de borstklier hele mounts voor te bereiden. Het beschrijft ook hoe borstklier morfologie met behulp van drie eindpunten (aantal terminale einde knoppen, epitheliale rek en differentiatie) te analyseren en om deze resultaten te gebruiken om borstkanker het risico te voorspellen bij ratten die werden blootgesteld aan de voeding...

Veranderingen in de borstklier Morfologie en het risico op borstkanker bij ratten

Deze methode beschrijft hoe te ontleden en te evalueren ontwikkeling van de borstklier en de functie van muizen. Weggesneden borstklieren zijn beoordeeld op de mate van ontwikkeling met behulp van ganse berg, terwijl melk ejectie is geëvalueerd met behulp van een oxytocine-based myo cel contractie assay.

Evaluatie van de ontwikkeling van de borstklier en functie in muismodellen

We presenteren een benadering voor beeldregistratie voor reconstructie van 3-dimensionale (3D) histologievolumes, die het onderzoek naar de veranderingen van een orgaan op het niveau van macrostructuren van cellen vergemakkelijkt. Met behulp van deze aanpak hebben we de 3D-veranderingen tussen wild-type en Igfbp7-null borstklier beoordeeld.

Reconstructie van 3-dimensionale Histologie Volume en de toepassing ervan te studeren Mouse borstklieren

Intercellulaire kruispunten zijn benodigdheden voor stadiumspecifieke functies en ontwikkeling van de borstklier. Dit manuscript biedt een gedetailleerd protocol voor de studie van eiwit-eiwit interacties (PPI's) en co-lokalisatie met behulp van muizenklinieken. Deze technieken maken het mogelijk om de dynamiek van de fysieke associatie tussen intercellulaire kruispunten in verschillende ontwikkelingsstadia te onderzoeken.

Analyse van eiwit-eiwitinteracties en co-lokalisatie tussen componenten van kloof-, strakke- en adherentie-knooppunten in muizenmammarysklieren

We ontwikkelden een methode om succesvol te verwijderen, verwerken, delen en vlek voor histopathologische evaluatie, mammariumweefsel dat oorspronkelijk op glijbanen was vastgezet als gehele mounts. Deze methode kan de verzameling en evaluatie van de hele membraan van de borstklier bevorderen in onderzoeken voor reproductieve en ontwikkelingstest.

Sectie Mammary Gland Whole Mounts voor Lesion Identificatie

Hier presenteren we een protocol voor de isolatie van geheel, intact muis borstklieren om te onderzoeken van de extracellulaire matrix (ECM) expressie en ductaal morfologie. Muis #4 abdominale klieren werden gehaald uit de 8-10 week oude vrouwelijke nullipaar muizen, vast in neutraal gebufferde formaline, gesegmenteerd en gekleurd met behulp van immunohistochemistry voor ECM eiwitten.

Isolatie van Intact, hele muis borstklieren p.a. van extracellulaire Matrix expressie en klier morfologie

We presenteren een vrij eenvoudige en gevoelige methode voor nauwkeurige kwantificering van de dichtheid van de gal duct in de lever van de muis. Deze methode kan helpen bij het bepalen van de effecten van genetische en omgevings modificatoren en de effectiviteit van mogelijke therapieën in muizen modellen van galziekten.

Bepaling van de Galkanaal dichtheid in de lever van de muis

Dit artikel beschrijft een transplantatiemethode om donorrattenborstepitheelcellen te transplanteren in het interscapulaire witte vetkussen van de ontvangende dieren. Deze methode kan worden gebruikt om gastheer- en/of donoreffecten op de ontwikkeling van borstepitheel te onderzoeken en elimineert de noodzaak van pre-clearing, waardoor het nut van deze techniek wordt uitgebreid.

Rat Mammary Epitheliale Celtransplantatie in de Interscapular White Fat Pad

Dit protocol beschrijft een nieuw mammabeeldvormingsvenster met een vervangbaar deksel (R.MIW). Intravitale microscopie na implantatie van de R.MIW maakt longitudinale en meerdaagse beeldvorming van de gezonde en zieke borstklier mogelijk met een cellulaire resolutie tijdens de verschillende ontwikkelingsstadia.

Longitudinale intravitale microscopie met behulp van een mammabeeldvormingsvenster met vervangbaar deksel

Een procedure voor de levering van een chemische ablatieve oplossing aan de borstkanaalboom van de rat voor beeldgeleide preventieve behandeling van borstkanker wordt beschreven. Borstepitheelcellen kunnen worden gericht met minimale collaterale weefselschade door cannulatie rechtstreeks in de tepelopening en intraductale infusie van een 70% op ethanol gebaseerde ablatieve oplossing.

Röntgenvisualisatie van intraductale op ethanol gebaseerde ablatieve behandeling voor de preventie van borstkanker in rattenmodellen

Hier beschrijven we een eenvoudig en economisch protocol om onbevooroordeelde kwantificering van de pulmonale microvasculaire dichtheid voor longweefsel van hele muizen uit te voeren met behulp van enkelvoudige kleuring van isolectine B4.

Kwantificering van pulmonale microvasculaire dichtheid bij muizen over lobben

Leer de Sholl-analyse voor kwantitatieve beoordeling van vertakkingsdichtheid in mammaklieren van ratten. Deze methode met ImageJ biedt objectieve metingen voor ontwikkelingsbiologisch onderzoek.

Kwantificerende vertakkingsdichtheid in Rat Mammary Gland Whole-mounts Met behulp van de Sholl Analyse Methode

Meer video's verkennen