Name: Microinjection van CRISPR/Cas9 eiwit in Channel Catfish, Ictalurus punctatus, embryos voor Gene Editing (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-01-20T13:00:00.000+00:00
Duration: 16 min 8 s
Description: Leer micro-injectie van CRISPR/Cas9 in Ictalurus punctatus embryo's voor genbewerking. Dit protocol valideert genetische modificatie van immuun-genen en ondersteunt functioneel genomisch onderzoek in aquacultuur.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Dit onderzoek werd gefinancierd door de USDA-NIFA award 2015-67015-23488 naar Roger Cone. De auteurs bedanken Dr. Ronald Phelps voor de beschrijving van brood voorraad selectiecriteria in de video. Ahmed Elaswad en Karim Khalil bedank de Egyptische culturele en educatieve Bureau in Washington DC voor de financiering van hun doctoraatsonderzoek.

Dit experiment werd uitgevoerd op de vis Genetics Research Unit, E. W. Shell Fisheries Research Center, Auburn University, AL. Alle experimentele protocollen die worden gebruikt in dit experiment werden goedgekeurd door de Auburn University institutionele Animal Care en gebruik Comité (AU-IACUC), voordat het experiment werd gestart. Een lijst van de apparatuur en benodigdheden gebruikt in dit experiment kan worden gevonden in de tabel van de materialen. De volgende zijn de stappen en procedures voor de voorbereiding en microinjection van kanaal meerval one-cel embryo's zoals geïllustreerd in Figuur 1.
1. broeden Stock selectie en kuitschieten
<ol><li>Kies gezond channel catfish brood voorraad uit de stam of de genetische lijn van belang. Channel catfish mannetjes en vrouwtjes moeten goede secundaire geslachtskenmerken vertonen.</li>
	<li>Mannetjes hebben een brede gespierde hoofd dat breder is dan de rest van hun lichaam met goed ontwikkelde genitale papil selecteren Donkere kleur, littekens en wonden van territoriale vechten zijn ook tekenen van seksuele bereidheid. Selecteer vrouwtjes hebben hoofden die smaller dan de rest van hun lichaam zijn en hebben zachte, voelbaar, goed-rond gemaakte buik. Voor nauwkeurigheid en te vermijden benadrukt de vis tijdens de initiële behandeling, stop voederen de vrouwtjes 2-3 dagen alvorens hun bereidheid voor het kuitschieten.</li>
	<li>Vis verwerking snel, maar zorgvuldig uit te voeren. Verklein behandeling stress en uitvoeren van alle procedures waarvoor behandeling vrouwtjes terwijl vis in de paaitijd zakken (32 mm grootte mesh).</li>
	<li>Meten net voor hormoon injectie voor het opwekken van de eisprong, het lichaamsgewicht van de vrouwtjes.</li>
	<li>Hang de paaitijd zakken met vrouwtjes binnen in een stroom door een tank met een continue waterstroming en voldoende beluchting.</li>
	<li>Aseptisch, laden de implanter die heeft een 14 G naald met 85 µg/kg luteïniserend hormoon releasing hormoon analoge (LHRHa) prothese. Spoel de injectieplaats (dorsale spieren) met steriele zoutoplossing 0,9% vóór de injectie. Plaats de implanter in een hoek van 45° en vrijgeven van het implantaat. Trekken de naald en swipe de injectieplaats met een katoenen bal eerder gedrenkt in 70% ethanol.</li>
	<li>Plaats de paaitijd tas in de holdingstank zodat de vis wordt volledig ondergedompeld in water 15-20 cm onder het wateroppervlak. Voldoende beluchting (boven 5 ppm opgeloste zuurstof) en goede waterkwaliteit zijn belangrijk voor de ovulatie van hoge kwaliteit eieren.</li>
	<li>De tijd van de ovulatie op basis van de temperatuur van het water met behulp van de graad-uur (h) relatie35voorspellen. Mate-h responstijd = tijd tussen inspuiting van het hormoon en ovulatie (h) * watertemperaturen (° C). Bijvoorbeeld, voor een graad-h responstijd van 900-1000, een vrouw naar verwachting paaien 36-40 uur uit hormoon injectie tijd bij 25 ° C. Meestal gebeurt de eerste controle voor eieren ongeveer 36 uur na inspuiting van het hormoon en vervolgens 4 uur tussenpoos.</li>
	<li>Om te controleren voor de ovulatie, til voorzichtig de paaitijd zak boven het wateroppervlak terwijl u zoekt op de eieren die zijn aangesloten in de paaitijd zak. Het zien van ten minste 10 eieren geeft aan deze vrouw eisprong en klaar voor het strippen van de hand.</li>
</ol>2. zaadcellen voorbereiding
Opmerking: Sperma kan bereid worden een paar uur voor de verwachte eisprong.
<ol><li>Euthanaseren mannetjes door een percussieve klap op het hoofd zonder verdoving, omdat de verdoving kan een negatief effect hebben op de beweeglijkheid van de zaadcellen.</li>
	<li>Verzamelen van de teelballen in een pannetje wegende verwijderen elk weefsel en wassen met 50 mL van 0,9% zout te verwijderen van bloed, indien nodig. Goed ontwikkelde teelballen zijn wit met vele villiform projecties ( Figuur 2).</li>
	<li>Het bepalen van het gewicht van de teelballen.</li>
	<li>Ter voorbereiding van het sperma-oplossing van ei bevruchting, overdracht van de teelballen naar het midden van een 100 cm2 100 µm gaas met pincet. Vouw het gaas met de testes binnen, crush de teelballen en filtreer het sperma in een tube van 50 mL collectie. Dit kan gebeuren door het toepassen van druk op de testes binnen het net tegen de rand van de buis van de collectie via de duim. Gebruik de zoutoplossing 0,9% te wassen van het sperma van de mazen in de buis van de collectie. Zoutoplossing kan tot 10 mL/g van teelballen worden toegevoegd.</li>
	<li>Bepaal de concentratie van de zaadcellen, de beweeglijkheid en de levensvatbaarheid controleren. Opmerking: Concentratie kan worden bepaald door het tellen van de zaadcellen in een bekende hoeveelheid verdunde milt met behulp van een hemocytometer. Als alternatief, de dichtheid van sperma kan worden geraamd door de beoordeling van de extinctie van de milt met behulp van een spectrofotometer. Bij deze methode wordt de absorptie bij 505 nm golflengte vergeleken met een besturingselement grafiek die eerder is opgesteld voor de absorptie van verschillende concentraties van sperma36. De beweeglijkheid van sperma kan onder de Microscoop worden gecontroleerd als het moment van activering van de zaadcellen tot stopzetting van sperma beweging (genaamd motiliteit duur)37. De levensvatbaarheid van sperma kan worden bepaald door de kleuring van het sperma met selectieve kleurstoffen zoals trypan blauw, die alleen niet-levensvatbare zaadcellen, vlekken zal terwijl levensvatbare zaadcellen onbevlekt zal blijven. Voor deze procedures van microinjection is dit echter niet nodig als de teelballen zijn goed ontwikkeld.</li>
	<li>Opslaan van sperma in een 0,9% zoutoplossing uit stap 2.5 bij 4 ° C en gebruiken binnen de 24u na bereiding.</li>
</ol>3. ei collectie en bevruchting
<ol><li>Toepassing van een zeer dun laagje plantaardige verkorting met een schone, droge kuitschieten pan diameter van 20 cm.</li>
	<li>Plaats het vrouwtje in de verdoving oplossing met 100 ppm van gebufferde tricaïne methaan sulfonaat met natriumbicarbonaat (pH van definitieve oplossing moet 7.0) totdat de vis volledig narcose38 is. Let op: Tricaïne methaan sulfonaat mogelijk irriterend als geïnhaleerd, ingenomen of geabsorbeerd door de huid.</li>
	<li>Zorgvuldig, haal de vis uit de paaitijd zakje en dompel het in een 0,9% zoutoplossing te wassen van de verdoving oplossing. Droog de vis af volledig met behulp van een schone handdoek, het vermijden van de verwijdering van de laag slijm op het lichaamsoppervlak van de vis.</li>
	<li>Plantaardige verkorting toepassen in het gebied rond de vent, met inbegrip van de pelvic fins, om te voorkomen dat beslag op de eieren tijdens het strippen van de hand.</li>
	<li>Hand strip de eieren in de ingevette paai pan door een zachte druk uit te oefenen op de eierstokken. Goede eieren verkeer, goudgeel van kleur, en met een minimale of geen klontjes of bloedstolsels (Figuur 2). Vermijd contact tussen de eieren en water vóór bevruchting, zoals water micropyle sluiting kan stimuleren.</li>
	<li>Om te bevruchten de eieren voor microinjection, door 200-300 eieren te overbrengen in een ingevette paai pan. Ingevet plastic plant etiketten kunnen worden gebruikt als een lepel overbrengen van eieren naar de ingevette paai pan. Voeg 1-2 mL van de oplossing van de zaadcellen (uit stap 2.5) op de eieren en meng voorzichtig. De verhouding van sperma aan egg moet ongeveer 11.000 sperma/ei.</li>
	<li>Zoetwater op de eieren te activeren van het sperma en de eieren toevoegen. Voeg genoeg water om licht de eieren. Swirl zachtjes de eieren voor 30 s. bevruchting in 1 – 2 min plaatsvinden moet. Het is belangrijk om te bevruchten eieren die zijn gerangschikt in een enkele laag. Meerval eieren voldoen aan elkaar waardoor het moeilijk te microinject van meerdere lagen van embryo's.</li>
	<li>Voeg meer zoet water op de bevruchte eieren en laat de eieren om te harden voor 10-15 min.</li>
	<li>Dekking van de paaitijd pan de resterende onbevruchte eieren bevattende een natte handdoek om te voorkomen dat het drogen en bemesten over een paar uur. Bemesting kan worden gedaan op een gefaseerde wijze, bijvoorbeeld, een partij van 200-300 eieren kunnen worden bevrucht elke 30-60 min om te zorgen voor een continue aanvoer van embryo's in het stadium van één cel voor microinjection en controle niet-ingespoten embryo's. Vermijd contact tussen de natte handdoek en de eieren als de eieren kunnen houden aan de natte handdoek waardoor het moeilijk is om ze te verwijderen. In dit protocol, eieren bevrucht binnen 2-3 uur na het strippen werden efficiënt microinjected en had soortgelijk succes als eieren bevrucht onmiddellijk na het strippen.</li>
</ol>4. de naald trekken en laden
<ol><li>Trek een 1,0 mm OD borosilicaatglas capillaire in 2 naalden (Figuur 3). Bewaar de naalden in een doos papier met een stukje spons waarin verscheidene insnijdingen zijn aangebracht. Te voorkomen dat het breken van de naald, moet de diameter van de spons kleiner is dan de lengte van de stengel van de naald.</li>
	<li>Open de tip van de naald door het breken van een klein stukje van de naald de dunste regio met behulp van een scherp voorwerp. Ook het openen van de naald door knijpen uit de dunste regio van het uiteinde met een tang onder de Microscoop.</li>
	<li>Bereid de injectie-oplossing door het mengen van gRNA(s) met Cas9 eiwit. Andere typen RNA of eiwit kunnen ook worden geïnjecteerd met dezelfde procedure. In dit protocol, waren de gRNAs ontworpen aan doel twee van de channel catfish immuun verwante genen, tol/interleukine 1 receptor domein-bevattende adapter molecuul (TICAM1) gen en rhamnose bindend lectine (RBL) gen en voorbereid volgens Shah et al.. met het gebruik van een high-fidelity Taq polymerase32,39. De genomische doelstellingen inzake gRNAs waren 5' GGA GGT GAA GCA CGT CGA GGA 3' voor TICAM 1 gen (Figuur 4) en 5' GGA CTT TGA GTC GGA GAA GTG G 3' voor exon 1 van RBL gen met protospacer aangrenzende motief (PAM) volgnummer onderstreepte (Figuur 6).<ol>
<li>BLAST gids RNA doelstellingen tegen het genoom channel catfish volgnummer en selecteer degenen met geen potentiële af-target sites.</li>
		<li>Fenol rood aan kleur de gRNA/Cas9-eiwit mengen tot een derde van het totale volume toevoegen.</li>
		<li>De uiteindelijke concentratie van gRNA/Cas9 eiwit mix met nuclease gratis water zodanig aanpassen dat elk embryo wordt geïnjecteerd met 50 nL met ongeveer 2,5 ng gRNA en 7.5 ng Cas9 eiwit. Incubeer het mengsel gedurende 10 minuten op ijs vóór gebruik.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Met een microloader, 5-10 µL van het mengsel van gRNA/Cas9 in laadt de injectie naald door het invoegen van de microloader in de naald stengel en uitzetting van het mengsel langzaam terwijl het intrekken van de microloader tip (Figuur 3). Voorkom overvulling luchtbellen binnen.</li>
	<li>De naald hechten aan de houder van de micropipet en zorgen voor een strakke verbinding, en vervolgens de houder aan de micromanipulator koppelen. Vrije stabiele verkeer te waarborgen. Oefen druk uit voor microinjection door de stikstof cilinder openen en de drukregelaar aan te passen. Opmerking: Het volume van injectie kan beïnvloed worden door de druk, de diameter van het diafragma van de naald en de duur van injectie. Om het volume aan injecteren injecteren een druppel van minerale olie op een hemocytometer geplaatst. Indien nodig, kan de druk, de duur van de injectie en de diameter van de naald worden aangepast verhoogt of verlaagt het volume van de injectie. Meerdere keren te injecteren in de minerale olieresten consistent volume wordt gewaarborgd.</li>
</ol>5. microinjection van Catfish embryo 's
<ol><li>Breng een zeer dunne laag van plantaardige verkorting aan een schone petrischaal van 100 mm.</li>
	<li>Met behulp van een ingevet plastic plant-label, 50 – 100 eieren uit de bevruchting pan overbrengen in de petrischaal en bestrijk ze met de Holtfreter van oplossing (materialen tabel). Hiermee lijnt u de eieren tegen elkaar opnemen in een enkele laag. Deze afstemming moet de eieren op zijn plaats houden tijdens het proces van microinjection.</li>
	<li>Plaats de petrischaal met de eieren in het werkgebied van de Microscoop en houd met een hand. Verlaag de naald met de andere hand (Figuur 3) totdat het doorboort het chorion en de dooier in één vloeiende beweging. De tip van de naald moet zo dicht mogelijk bij de blastodiscus voor het leveren van het materiaal van de injectie.<ol>
<li>Druk op de pedaal te leveren van het materiaal van de injectie in de dooier. Als de blastodiscus niet duidelijk zichtbaar is, kan dan de injectie-materiaal in verschillende locaties in de dooier worden gespreid. Om dat te doen, de naald wordt ingevoegd aan het einde van de dooier en het pedaal deprimerend of intrekking van de naald tegelijkertijd worden gedaan om het verspreiden van het materiaal van de injectie door de verschillende gebieden van de dooier. Tot 50 nanoliters kan worden geïnjecteerd in de dooier van channel catfish embryo's, echter, de hoeveelheid gRNA/Cas9 eiwit moet worden geoptimaliseerd voor elk gen te bereiken de beste resultaten voor mutatie tarief en embryo overleving32.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Intrekken van de naald soepel om niet te beschadigen het ei. Verplaats de petrischaal te injecteren een ander ei met dezelfde procedure. Vermijd beweging van de petrischaal tijdens de injectie proces zoals dit kan het ei beschadigen of breken van de naald. Verwijderen van eieren die zijn gescheurd of beschadigd als gevolg van microinjection. Injectie kan worden gestart op 15 – 20 minuten na de bevruchting en blijven zolang de embryo's zijn nog in het stadium van één cel (tot ongeveer 60-90 minuten na de bevruchting).</li>
	<li>Plaats ingespoten embryo's terug in de Holtfreter oplossing met 10 ppm van doxycycline en continu zachte beluchting voor 6-7 dagen tot40broedeieren. De oplossing dagelijks veranderen en verwijderen van dode embryo's.</li>
</ol>6. mutatie detectie
<ol><li>Willekeurig, verzamelen van verschillende ingespoten embryo's op 72 h post bevruchting, verwijder de dooier en uittreksel genomic DNA. 3 – 5 niet-ingespoten embryo's als een besturingselement bevatten. Opmerking: Genomic DNA kan worden geëxtraheerd uit embryo's na verwijdering van eierschalen en dooier materiaal via proteïnase K spijsvertering en ethanol neerslag32.</li>
	<li>Een DNA-segment flankerend de genomic doelstellingen voor gRNA van elk gen, waar mutaties naar verwachting optreden, met behulp van een high-fidelity Taq polymerase32versterken. Voor TICAM 1, de inleidingen 5' GCTGCTGAATGTCTGATTATG 3' (in voorwaartse richting) en 5' GTCCTCCACACTCCTGAAG 3' (omgekeerde) werden gebruikt voor het versterken van een 750 bp terwijl voor RBL, de inleidingen 5' TCATTATTTCCTGGTACTCAGTA 3' (in voorwaartse richting) en 5' AGAGATTAGTCACACATCATTATT 3' (omgekeerde) werden gebruikt om versterken een 375 bp segment van het RBL-gen.<ol>
<li>Gebruik de volgende PCR reactie: maximaal 20 µL PCR rang water; 1 x HiFi Taq enzym reactie buffer met MgCl2, 0,2 mM dNTP mix, 0.4 µM voor elk van de voorwaartse en omgekeerde primer van dezelfde set, 100-300 ng genomic DNA en 1,25 eenheden van high-fidelity Taq enzyme blend. Uitvoeren van PCR fietsen voorwaarden: eerste denaturatie bij 94 ° C gedurende 3 minuten; 35 cycli van denaturatie bij 94 ° C voor 30 s, gloeien bij 60 ° C gedurende 55 s voor TICAM, en 40 s voor RBL, uitbreiding bij 72 ° C gedurende 1 min/kb; en laatste uitbreiding bij 72 ° C gedurende 10 minuten.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Detecteren van de mutant embryo met een mutatie detectiemethode, zoals de sequencing van gezuiverde PCR producten, landmeter mutatie detectie assay, heteroduplex mobility assay, verlies van restrictie-enzym erkenning site, of een andere mutatie detectiemethode die is geschikt voor het doel. Detecteren mutant embryo's met behulp van landmeter mutatie detectie assay voor TICAM 1 en verlies van restrictie-enzym die SAPI site gesneden evenals rangschikken van gezuiverde PCR producten voor RBL gene in dit protocol.</li>
	<li>Voor de identificatie van mutant allelen zijn klonen PCR producten en volgorde vectoren uit afzonderlijke kolonies. De mutant allelen gepresenteerd in Figuur 4 en Figuur 6 kwam uit ingespoten embryo's. PCR producten van zes microinjected en 3 controle embryo's voor elk gen werden gebundeld in twee afzonderlijke buizen, één voor microinjected embryo's en de andere voor controle embryo's, snel gekloond en 86 vectoren voor TICAM 1 en 48 vectoren voor RBL gene sequenced, waarvan 8 reacties van 3 controle niet-ingespoten embryo's voor elk gen sequencing.</li>
	<li>Vergelijk de sequenties van mutant embryo's in het wild type reeks hulpprogramma elke DNA sequentie uitlijning zoals BLAST of T-COFFEE voor de identificatie van verschillende mutant allelen zijn.</li>
</ol>

De auteurs verklaren dat zij geen conflict van belang hebben.

Een gedetailleerd protocol voor microinjection van channel catfish embryo's te bereiken van gen knock-out werd gepresenteerd. Injectie van CRISPR/Cas9 eiwitten in de dooier is veel eenvoudiger, bespaart u tijd en vereist geen uitgebreide opleiding in vergelijking met de microinjecting van de blastodiscus van het embryo één-cel, die de gemeenschappelijke techniek voor de meeste genenoverdracht en gene bewerken met vis 30 , 42. het huidige protocol bewezen succesvo...

Microinjection is een gemeenschappelijk laboratorium techniek gebruikt voor het leveren van een kleine hoeveelheid van een stof zoals DNA, RNA, eiwitten en andere macromoleculen in cellen of embryo's via een glazen capillaire1. Microinjection wordt uitgevoerd met behulp van speciale apparatuur installatie met inbegrip van een microinjector, micromanipulator en een Microscoop2. De techniek is gebruikt door onderzoekers genetisch wijzigen vele organismen door middel van de generatie van transgenics, gene uitsparingen en gentherapie, met als doel inzicht in de dynamiek van intracellulaire componenten3,4 , 5.
De channel catfish (Ictalurus punctatus) is de meest populaire meerval soorten in de aquacultuur en recreatieve visserij-activiteiten in de Verenigde Staten. Er is een toenemende behoefte aan de studie van functionele genomica in channel catfish, en sequentiebepaling van het volledige genoom van channel catfish verbetert het nut van de recente vooruitgang in genoom editing tools6,7. Begrip van de genfunctie zou niet alleen het verrijken van het onderzoek dat wordt gevoerd op meerval, maar kan ook leiden tot meer effectieve genetische verbetering programma's ter verbetering van de meerval industrie. Als kritische genen voor een bepaalde eigenschap van belang worden geïdentificeerd, kunnen zij worden gebruikt genetisch meerval om productie te verbeteren door het genoom bewerken voor het genereren van positieve allelen, selectie voor deze allelen, het onderdrukken van de schadelijk allelen, overbrengen het gunstige allel via Transgenese, of een combinatie van deze opties. Combineren de beste genen voor verschillende commercieel gunstige eigenschappen van verschillende soorten in één vis zou de productiviteit en winstgevendheid van vis productie operaties8, aanzienlijk verbeteren.
Gene knock-out is een directe methode om te studeren gene functies in vivo. Mutaties op DNA niveau zal worden overgenomen door toekomstige generaties die de studie van hun effecten in verschillende generaties zal vergemakkelijken. Verschillende genoom bewerkingshulpmiddelen zijn ontwikkelde inclusief zink vinger nucleasen (ZFNs), transcriptie activator-achtige effector nucleasen (TALENs), en geclusterde regelmatig interspaced korte palindromische herhalingen/CRISPR-geassocieerde proteïne 9 (CRISPR/Cas9 ) systeem9,10,11,12.
Het systeem van CRISPR/Cas9 is een krachtige en efficiënte tool die is gebruikt voor het bewerken van genomic DNA-sequenties, met inbegrip van gene knock-out in vis door RNA-geleide site-specific DNA decollete5,13. Het systeem bestaat uit een gids-RNA (gRNA), die de gerichte volgorde in het genoom en een DNA endonuclease enzym, Cas9 bepaalt. De CRISPR/Cas9-systeem kan worden ontworpen om het richten van een willekeurige tekenreeks in het genoom met verschillende voordelen ten opzichte van ZFNs en TALENs: (1) lager kosten (2) gemakkelijker engineering (3) meer specifieke binding van RNA gids in de reeks van de doelgroep, en verminderd af-target mutaties (4) meerdere reeksen kunnen worden gericht met verschillende gRNA hetzelfde tempo tijd (5) hoge mutagenese in genen die kon niet worden gemuteerd door TALENs, en (6) verbeterde germline transmissiesnelheid van mutaties voor tot 6-fold in vergelijking met ZFNs en TALENs14, 15,16,17,18.
De belangrijkste alternatieve methode voor microinjection is electroporation, waarin elektrische impulsen worden toegepast op embryo's of cellen membraan permeabiliteit en de opname van biologische moleculen19,20te verhogen. Verschillende transgene vis waren gegenereerd met behulp van electroporation zoals medaka (Oryzias latipes), zebravissen (Danio rerio), chinook zalm (Oncorhynchus tshawytscha), channel catfish, zeebrasem (Sparus sarba), en gemeenschappelijke carp (Cyprinus carpio)21,22,23,24,25,26.
Electroporation is gebruikt voor het leveren van de plasmide DNA, RNA en Cas9 eiwitten voor gene knock-out. In de cellen van zoogdieren, Cas9/gRNA plasmide DNA, Cas9 mRNA/gRNA, en Cas9 eiwit/gRNA complexen werden geleverd met behulp van electroporation en de mutagenese tarieven waren hoogste met behulp van Cas9 eiwit/gRNA complexen voor meeste electroporation voorwaarden getest27. TALENs uiten constructies werden in de ascidian chordate (Ciona intestinalis), electroporated in bevruchte eieren voor het opwekken van knockout van meerdere genen28. ZFNs uiten plasmide constructies waren electroporated om knock-out luteïniserend hormoon in channel catfish29. Echter zodra ingevoerd in de cel, plasmide constructies zal moeten worden herschreven als RNA en vertaald naar functionele eiwitten voordat ze kunnen richten op de gewenste opeenvolging van DNA, die zou waarschijnlijk het vertragen van de tijd van de mutagenese ten opzichte van microinjection van RNA / eiwit. Als een embryo ontwikkelt zich, stijgt vertraagde mutagenese de mozaïcisme van ingespoten oprichters. Transgene expressie is daarnaast onwaarschijnlijk om de expressie niveau mogelijk met microinjection, verlagen de mutagenese efficiëntie te bereiken.
Als een middel voor de invoering van genoom bewerkingsgereedschappen in cellen, heeft microinjection diverse voordelen ten opzichte van electroporation. Genoom bewerken van moleculen kan betrouwbaar worden ingevoerd in cellen of embryo's door middel van microinjection30. Minder materiaal injectie nodig is. Het is gemakkelijk om te bepalen van de hoeveelheid materiaal geïnjecteerd. Hogere mutatie tarieven met lage mozaïcisme in de oprichter vis kunnen worden bereikt die germline transmissie van mutaties op F1zou verbeteren. Minder oprichter vis moet worden geanalyseerd om te produceren van de eerste generatie, als gevolg van het hogere tarief van de mutatie. Electroporation moeten meer oprichter vis worden geanalyseerd die kosten zal verhogen. Het voortbestaan van channel catfish microinjected embryo's is echter lager dan electroporated ones, hoewel dit kan worden overwonnen door het injecteren van meer embryo's31,32. In channel catfish, voortbestaan van embryo's varieerden van 16 tot 55%, afhankelijk van de genen gericht dooier-microinjected en de dosering van gRNA/Cas9 eiwit32.
Regelmatige microinjection van meerval embryo's is technisch veeleisend en tijdrovend, een snelle en efficiënte CRISPR/Cas9 eiwit protocollen protocol wordt echter gepresenteerd voor channel catfish embryo's. Dit protocol vereist minder tijd en deskundigheid, aangezien de CRISPR/Cas9 eiwit oplossing wordt geïnjecteerd in de dooier van één cel embryo's. Honderden bevruchte eieren kunnen worden geïnjecteerd in 1 h (ongeveer de tijd die nodig is voor de eerste celdeling te voorkomen). Voor het valideren van het protocol, werden twee ziekte gevoeligheid-gerelateerde genen gevloerd in channel catfish, de tol/interleukine 1 receptor domein-bevattende adapter molecuul (TICAM1) gen en het rhamnose bindend lectine (RBL) gen. TICAM 1 is betrokken bij de signalering traject gestart door toll-like receptor (TLR) 3. In channel catfish was TICAM 1 dramatisch upregulated na bacteriële challenge met Edwardsiella ictaluri, terwijl het was werden in blue catfish, een tot en met E. ictaluri33resistente soorten. RBL speelt een belangrijke rol in de vroege infectie met Flavobacterium columnare, de verwekker van de ziekte van de columnaris, waar acute en robuuste opregulatie werd opgenomen in een columnaris-gevoelige channel catfish stam in vergelijking met een columnaris-resistente stam34.

<table><tbody><tr><td>Reproboost implant</td><td>Center of Marine Biotechnology</td><td></td><td>Luteïniserend hormoon afgifte hormoon analoog (LHRHa) voor het induceren van ovulatie bij vrouwelijke kanaalkatvis</td></tr><tr><td>TRICAINE-S</td><td>Western Chemical. Inc.</td><td></td><td>Voor sedatie van broedvis tijdens hormooninjectie en eitjes verwijderen.&nbsp;</td></tr><tr><td>Fenol rood</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P0290</td><td>0,5%, steriel gefilterd</td></tr><tr><td>Stereomicroscoop</td><td>Olympus</td><td>213709</td><td>Voor het visualiseren van de eieren tijdens micro-injectie</td></tr><tr><td>Microinjector</td><td>ASI-Applied Scientific Instrumentation&nbsp;</td><td>Model MPPI-3</td><td>Voor het aanbrengen van de injectiemateriaal in de embryo's</td></tr><tr><td>Micromanipulator</td><td>ASI-Applied Scientific Instrumentation&nbsp;</td><td>Model MM33&nbsp;</td><td>Voor het vasthouden en controleren van de beweging van de injectienaald.&nbsp;</td></tr><tr><td>Eppendorf Microloader</td><td>Eppendorf</td><td>5242956.003</td><td>Voor het laden van injectieoplossing in micro-injectienaalden.</td></tr><tr><td>Verticale naaldtrekker</td><td>David Kopf Instruments</td><td>Model 720</td><td>Voor het trekken van micro-injectienaalden</td></tr><tr><td>Cas9-eiwit</td><td>PNA Bio Inc.&nbsp;</td><td>CP01</td><td>Recombinant Cas9-eiwit uit Streptococcus pyrogenes.</td></tr><tr><td>Expand High FidelityPLUS PCR Systeem</td><td>&nbsp;Roche Diagnostics, USA</td><td></td><td>Voor PCR en amplificatie van DNA-sjablonen die gebruikt worden in gRNA-voorbereiding</td></tr><tr><td>Borosilicaat glas capillairen</td><td>Fisher Scientific</td><td></td><td>1 mm buitendiameter (OD), voor het maken van micro-injectienaalden.</td></tr><tr><td>Petrischaal</td><td>VWR</td><td>25384-302</td><td>Voor het vasthouden van de embryo's tijdens de micro-injectie.</td></tr><tr><td>Crisco</td><td>The J.M. Smucker Company</td><td></td><td>Plantaardige bakboter voor het coaten van kuiltjes en petrischalen.&nbsp;</td></tr><tr><td>Holtfreter`s oplossing</td><td>Zelf gemaakt</td><td></td><td>59 mM NaCl, 0,67 mM KCl, 2,4 mM NaHCO3, 0,76 mM CaCl2, 1,67 mM MgSO4 om de gemicro-injecteerde embryo's te incuberen tot het uitkomen.&nbsp;</td></tr><tr><td>Doxycyclinehyclaat USP (monohydraat)</td><td>Letco Medical</td><td>690904</td><td>Antibioticum toegevoegd aan Holtfreter's oplossing tot 10 ppm om bacteriële infecties te voorkomen.</td></tr></tbody></table>

microinjection van crispr/cas9 eiwit in channel catfish, ictalurus punctatus, embryo's voor gene editing

Microinjection of CRISPR/Cas9 Protein into Channel Catfish, Ictalurus punctatus, Embryos for Gene Editing

Het volledige genoom van de channel catfish, Ictalurus punctatus, heeft sequenced, wat leidt tot meer kansen voor de studie van channel catfish genfunctie. Gene knock-out is gebruikt voor het bestuderen van deze gene functies in vivo. De geclusterde regelmatig interspaced korte palindromische herhalingen/CRISPR geassocieerde eiwit 9 (CRISPR/Cas9) systeem is een krachtig hulpmiddel gebruikt voor het bewerken van genomic opeenvolgingen van DNA om te veranderen van de genfunctie. Terwijl de traditionele benadering is geweest om CRISPR/Cas9 mRNA in de eencellige embryo's door middel van microinjection, kan dit een langzaam en inefficiënt proces in meerval. Hier, wordt een gedetailleerd protocol voor microinjection van channel catfish embryo's met CRISPR/Cas9 eiwit beschreven. Kort, eieren en sperma werden verzameld en dan kunstmatige bevruchting uitgevoerd. Bevruchte eieren werden overgedragen aan een petrischaal met Holtfreter de oplossing. Geïnjecteerd volume was gekalibreerd en vervolgens begeleiden RNAs/Cas9 gericht op de tol/interleukine 1 receptor domein-bevattende adapter molecuul (TICAM 1) gen en rhamnose bindend lectine (RBL) gen werden microinjected in de dooier van één-cel embryo's. Het gen raakeffect was succesvol want microdeleties werden bevestigd door DNA sequentiebepaling. De voorspelde eiwit sequentie wijzigingen als gevolg van deze mutaties frameshift opgenomen en afgekapt eiwit vanwege voortijdige stop codonen.

Om aan te tonen van de efficiëntie van het protocol van microinjection, werden ontworpen om te richten van de channel catfish tol/interleukine 1 receptor domein-bevattende adapter molecuul (TICAM1) gen en rhamnose bindend lectine (RBL) gen gRNAs microinjected.
TICAM 1 DNA sequencing van vectoren uit afzonderlijke kolonies van samengevoegd, gekloonde PCR producten bleek de indel mutaties, geïnduceerde in TICAM...

Een eenvoudige en efficiënte microinjection protocol voor het bewerken van het gen in channel catfish embryo's met behulp van de CRISPR/Cas9-systeem wordt gepresenteerd. In dit protocol, begeleiden RNAs en Cas9 eiwit in de dooier van één-cel embryo's waren microinjected. Dit protocol is gevalideerd door kloppen uit twee channel catfish immuun-gerelateerde genen.

Microinjection van CRISPR/Cas9 eiwit in Channel Catfish, Ictalurus punctatus, embryo's voor Gene Editing

The complete genome of the channel catfish, Ictalurus punctatus, has been sequenced, leading to greater opportunities for studying channel catfish gene ...

Micro-injectie van CRISPR/Cas9-eiwit in kanalenmeerval, Ictalurus punctatus embryo's voor genbewerking. De ontwikkeling van een betrouwbaar en efficiënt protocol voor gerichte genbewerking bij kanalenmeervallen is cruciaal voor het bestuderen van functionele genomics. Vooral nadat de genomische bronnen zijn verrijkt door de sequencing van het genoom van de kanaalmeerval.Hier presenteren we een gedetailleerd protocol voor CRISPR/Cas9 genoombewerking bij kanaalmeervallen. Dit protocol is ontwikkeld en gevalideerd door twee immuungerelateerde genen van de kanaalmeerval te targeten. De Toll/interleukine-1 receptor domein bevattende adaptermolecuul, of TICAM1 gen, en de rhamnose-bindende lectin of RBL gen.Alle procedures werden uitgevoerd in de visgenetica onderzoekseenheid van het EW Shell Fisheries Research Center aan de Auburn University in Alabama. Selectie van broedbestand en paaien. Kies gezonde kanaalmeerval broedbestand uit een stam of genetische lijn die u wilt bewerken.Kanaalmeervallen mannetjes en vrouwtjes moeten goede secundaire geslachtskenmerken vertonen. Kies mannetjes met een brede spierachtige kop die breder is dan de rest van hun lichaam met een goed ontwikkelde genit

microinjection-crisprcas9-protein-into-channel-catfish-ictalurus

Research

JoVE Journal

Genetics

Genetica

Transgene manipulaties en genoom editing zijn van cruciaal belang voor het functioneel testen van de rol van genen en cis van regelgevende elementen. Hier kunt u een gedetailleerde micro-injectie protocol voor het genereren van genomische modificaties (inclusief Tol2-gemedieerde fluorescerende reporter transgene constructen, Talens en CRISPRs) wordt gepresenteerd voor de opkomende model vis, de driedoornige stekelbaars.

Micro-injectie voor Transgenese en Genome Bewerken in Threespine Stekelbaarzen

Gerichte genoom bewerken in het modelsysteem Danio rerio (zebravis) is sterk bevorderd door de opkomst van de CRISPR gebaseerde benaderingen. Hierin beschrijven we een gestroomlijnde, robuust protocol voor generatie en van onzin CRISPR afkomstige allelen waarin de heteroduplex mobility assay en identificatie van mutaties met behulp van de volgende generatie sequencing.

Efficiënte productie en identificatie van CRISPR/Cas9-gegenereerd Gene uitsparingen in de modelsysteem Danio rerio

We beschrijven benaderingen voor het manipuleren van genen in het evolutionair modelsysteem Astyanax mexicanus. Drie verschillende technieken worden beschreven: Tol2-gemedieerde Transgenese, gerichte manipulatie van het genoom met behulp van CRISPR/Cas9 en knockdown van meningsuiting met behulp van morpholinos. Deze hulpmiddelen moeten vergemakkelijken het directe onderzoek van genen die ten grondslag liggen aan de variatie tussen oppervlak - en grot-woning vormen.

Manipulatie van de genfunctie in Mexicaanse Cavefish

Hier gepresenteerd is een protocol voor efficiënte SCHERPEr/Cas9 ribonucleoproteã-gemedieerde gen bewerken in zoogdiercellen met behulp van buis Electroporation.

SCHERPEr/Cas9 Ribonucleoproteã-gemedieerde nauwkeurige Gene bewerking door buis Electroporation

Hier wordt een protocol gepresenteerd voor de productie en de achterste CRISPR/Cas9 genoom Knockout elektrische vissen. Gedetailleerd beschreven zijn de vereiste moleculaire biologie-, fok-en veeteelt vereisten voor zowel een gymnotitievorm als een mormyrid, en injectietechnieken om Cas9-geïnduceerde Indel F0 -larven te produceren.

Uitschakeling van de vonk: CRISPR/Cas9 genoom bewerken in zwak elektrische vis

Dit protocol beschrijft micro-injectieprocedures voor Culex quinquefasciatus embryo's die zijn geoptimaliseerd om te werken met CRISPR/Cas9 genbewerkingstools. Deze techniek kan efficiënt site-specifieke, erfelijke, kiembaanmutaties genereren die kunnen worden gebruikt voor het bouwen van genetische technologieën in deze onderbelichte ziektevector.

Embryo micro-injection technieken voor efficiënte site-specifieke mutagenese in Culex quinquefasciatus

Vroege ontwikkeling is afhankelijk van moederlijk overgeërfde producten en de rol van veel van deze producten is momenteel onbekend. Hierin beschreven we een protocol dat CRISPR-Cas9 gebruikt om fenotypen met maternale effecten in een enkele generatie te identificeren.

Het bepalen van de rol van maternale tot expressie gebrachte genen in de vroege ontwikkeling met maternale crispants

Dit protocol beschrijft een aanpak om nauwkeurige knock-in bewerkingen in zebravisembryo's te vergemakkelijken met behulp van CRISPR-Cas9-technologie. Een fenotyperingspijplijn wordt gepresenteerd om de toepasbaarheid van deze technieken aan te tonen om een long QT-syndroom-geassocieerde genvariant te modelleren.

CRISPR-Cas9-gemedieerde nauwkeurige knock-in bewerkingen in zebravisharten

Hier beschrijven we een eenvoudige techniek die bedoeld is voor de efficiënte generatie van genetisch gemodificeerde muizen, CRISPR RNP Electroporation of Zygotes (CRISPR-EZ). Deze methode levert bewerkingsreagentia door elektroporatie in embryo's met een efficiëntie van bijna 100%. Dit protocol is effectief voor puntmutaties, kleine genomische inserties en deleties in zoogdierembryo's.

Efficiënte genoombewerking van muizen door CRISPR-elektroporatie van zygoten

CRISPR-Cas-technologieën hebben een revolutie teweeggebracht op het gebied van genoombewerking. Het vinden en isoleren van de gewenste kiembaanbewerking blijft echter een groot knelpunt. Daarom beschrijft dit protocol een robuuste methode voor het snel screenen van F0 CRISPR-geïnjecteerd zebravissperma op kiembaanbewerkingen met behulp van standaard PCR-, restrictieverterings- en gelelektroforesetechnieken.

Screening van sperma op de snelle isolatie van kiembaanbewerkingen bij zebravissen

Dit protocol presenteert een geoptimaliseerde aanpak voor het produceren van genetisch gemodificeerde rattenmodellen. Adeno-geassocieerd virus (AAV) wordt gebruikt om een DNA-reparatiesjabloon af te leveren, en elektroporatie wordt gebruikt om CRISPR-Cas9-reagentia af te leveren om het genoombewerkingsproces in een 2-cellig embryo te voltooien.

CRISPR-Cas9 Genoombewerking van rattenembryo's met behulp van adeno-geassocieerd virus (AAV) en elektroporatie van 2-celembryo's

Leer micro-injectie van CRISPR/Cas9 in Ictalurus punctatus embryo's voor genbewerking. Dit protocol valideert genetische modificatie van immuun-genen en ondersteunt functioneel genomisch onderzoek in aquacultuur.

Microinjection van CRISPR/Cas9 eiwit in Channel Catfish, Ictalurus punctatus, embryo's voor Gene Editing

Meer video's verkennen