Name: Oprichting van virale infectie en analyse van Host-Virus interactie bij Drosophila Melanogaster (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-03-14T13:30:00.000+00:00
Duration: 9 min 57 s
Description: Leer virale infectie opzetten en virus-gastheerinteracties analyseren bij Drosophila melanogaster met behulp van nanoinjectie. Deze methode biedt precieze controle over de infectiedosis en toepasbaarheid voor andere pathogenen.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

We zouden graag bedanken de hele Pan lab in IPS. CAS. Wij danken Dr. Lanfeng Wang (IPS, CAS) voor de ondersteuning van de experimentele en Dr. Gonalo Cordova Steger (Springer natuur), Dr. Jessica VARGAS (IPS, Parijs) en Dr. Seng Zhu (IPS, Parijs) voor opmerkingen. Dit werk werd gesteund door subsidies van de strategische prioriteit Research Program van de Chinese Academie van Wetenschappen aan L.P (XDA13010500) en H.T (XDB29030300), de nationale Natural Science Foundation van China tot L.P (31870887 en 31570897) en J.Y (31670909). L.P is een fellow van CAS jeugd innovatie promotie Association (2012083).

Opmerking: Voordat u begint experiment, de cellijnen en vliegen voorraden gebruikt mag niet verontreinigd zijn door andere ziekteverwekkers, met name voor virussen zoals DCV, FHV, Drosophila X virus (DXV), en aviaire nefritis virus (ANV). Idealiter worden RNA sequencing of een eenvoudiger PCR-gebaseerde identificatie gebruikt voor het detecteren van de besmetting10,45. Als er besmetting optreedt, de cellijnen en vliegen voorraden dient niet meer totdat zij zijn ontsmet volledig46.
1. virus en vliegen voorbereiding
<ol><li>Vermeerdering van het virus en collectie Opmerking: Drosophila S2 * cellen worden gebruikt voor DCV propagatie en titratie. De S2 *-cellijn is afgeleid van een primaire cultuur van late fase D. melanogaster embryo's. Deze cellijn geweest goed47eerder is beschreven.<ol>
<li>S2 * cellen in Schneiders Drosophila Medium bij 25 ° C zonder extra CO2, groeien als een losse, semi-aanhangend enkelgelaagde in een 10 cm cel cultuur schotel, bij een dichtheid van 1 x 107 levensvatbare cellen/mL. Gebruik volledige medium voor S2 * cellen: Schneiders Drosophila opslagmedium met 10% warmte geïnactiveerd FBS, 100 eenheden/mL penicilline en 100 μg/mL streptomycine. Opmerking: Gezonde cellen moeten tonen een ronde vorm en homogene grootte vertonen.</li>
		<li>Snel ontdooien de DCV voorraad van-80 ° C in een bad van 25 ° C water. S2 * cellen met DCV op MOI infecteren = 0,01 onmiddellijk door direct het toevoegen van 1 mL van de oplossing van het virus aan de cel cultuur gerechten (Groeigebied: 55 cm2) met 10 mL van volledige medium voor S2 * cellen.</li>
		<li>Incubeer de cellen bij 25 ° C gedurende 3 tot 5 dagen. Wanneer het virus klaar voor de verzameling is, de morfologie van de cel is abnormale (cel vorm ziet er vervagen) en het kweekmedium zit vol zwarte deeltjes indicatieve van cel puin.</li>
		<li>Verzamelen van de hele celcultuur in een tube van 15 mL door omhoog en omlaag pipetteren en bevriezen bij-80 ° C (voor maximaal een jaar). Opmerking: DCV kan worden opgeslagen voor langdurig van tijd bij-80 ° C met minimaal verlies van infectiviteit, voor maximaal één jaar.</li>
		<li>Ontdooi de celcultuur in een bad van 25 ° C water met constante schudden en vervolgens Centrifugeer bij 6.000 x g, voor 15 min bij 4 ° C. Het verzamelen van de bovendrijvende substantie in een tube steriele 15 mL en vortex. Aliquot tot 200 μL van virus oplossing per buis. Opmerking: Virus aliquots kunnen worden opgeslagen voor een korte periode van maximaal 3 dagen bij 4 ° C voor maximaal 1 jaar bij-80 ° C. Herhaalde bevriezen-ontdooien cycli moeten worden vermeden. Het is altijd beter om te gebruiken in een keer alle het afgepipetteerde deel.</li>
		<li>Kies 5 willekeurige virus-bevattende buizen om te bepalen van de gemiddelde virus weefselkweek infectieuze dosis (TCID50) door een cytopathogeen effect (CPE) assay (1 eenheid van TCID50= 0.7 plaque die eenheid [PFU] vormen). Opmerking: CPE verwijst naar structurele veranderingen in de cellen van de gastheer veroorzaakt door virale invasie. De infecteren virus veroorzaakt lysis van de gastheercel, of wanneer de cel sterft zonder lysis te wijten aan een onvermogen om te reproduceren van48.<ol>
<li>Op dag 1, verzamelen u bereid S2 * cellen door pipetteren. Het aantal cellen tellen Centrifugeer cellen voor 300 x g gedurende 4 minuten en verwijder het supernatant. Verdun de cellen met de dichtheid van 1 x 106 cellen/mL met volledige medium voor S2 * cellen zoals beschreven in stap 1.1.1.</li>
			<li>1 x 105 S2 zaad * cellen (100 μl) per putje aan de flat-96-goed-bodemplaat (~ 30% confluentie).</li>
			<li>Seriële 10-fold verdunningen van de DCV voorraad met volledige medium voor S2 * cellen uitvoeren. Voeg 50 µL verdunningen in de put. Voeg 50 µL cultuurmedium zonder virus aan het putje goed ingedeeld als de negatieve controle. Opmerking: Voor elke verdunning tarief, 8 putten werden gebruikt. Zoals de typisch DCV-opbrengst ongeveer 108-109 PFU/mL is, is de verdunning dient ten minste ~ 10-5-10-10.</li>
			<li>Op dag 4, observeren CPE met een helder-veld microscoop met een 20 X of 40 X doelstelling. Een goed waarin de cellen wazig kijken classificeren en het medium is vol met fragmenten als een "positieve", en een goed waarin de morfologie van de cel is normaal als "negatieve Nou".</li>
			<li>Mark CPE-positieve of negatieve putjes met + of –, respectievelijk. Bereken het virus TCID50 door de Reed en Muench methode49.</li>
		</ol>
</li>
		<li>Beschikken over alle verontreinigde materialen en handschoenen in de decontaminatie pan. Als het virus niet kan van de gewenste TCID50 bereiken, concentreren 100 mL virus oplossing door centrifugatie bij 68.000 x g gedurende 1 uur bij 4 ° C. Opmerking: afhankelijk van het doel van het experiment, een aantal doses van 102 tot 106 TCID50 eenheden kunnen worden gebruikt voor virusinfectie. Meestal gebruiken we 3 x 106 TCID50 eenheden.</li>
		<li>Verwijder het supernatant en resuspendeer in 1 mL van Tris-HCl buffer (10 mM, pH 7,2). Aliquot 20 μL van virus oplossing per buis en winkel bij-80 ° C. Kies 5 willekeurige buizen om te bepalen van het gemiddelde virus TCID50 weer.</li>
	</ol></li>
	<li>Voorbereiding voor infectie vliegen Opmerking: Symbiotische bacterie Wolbachia kunnen onderdrukken vele soorten RNA-virusinfectie in insecten30,31,32,33,41. Het is dus essentieel voor het zuiveren van Wolbachia van vliegen studeerde host-virus infectie in vivo33.<ol>
<li>Bereiden van vliegen eten met tetracycline door toevoeging van 400 μL van 50 µg Mo/mL tetracycline (in 70% ethanol) tot en met 4 g van vliegen voedsel vers standaard maïsmeel (1 L voor voedsel bevat 77.7 g maïsmeel, 32.19 g gist, 10,6 g agar, 0.726 g CaCl2 31.62 g van sacharose, glucose, 2 g van kaliumsorbaat en 15 mL 5% C8H8O363.3 g). Meng grondig en plaats het voedsel bij 4 ° C's nachts te verdampen van ethanol. Opmerking: Een hoge dosis van ethanol kan invloed op de vlieg vruchtbaarheid, dus doen niet het weglaten van deze stap.</li>
		<li>Warm het voedsel op kamertemperatuur en zet nieuwe eclosed volwassen vliegen (20 vrouwen en 10 mannen) in het flesje. Het fokken van de vliegen bij 25 ° C, 60% vochtigheid onder een normale licht/donker cyclus. Opmerking: Normaal gesproken duurt 3-4 dagen voor de vliegen om voldoende eieren te leggen. Teveel eieren remmen de ontwikkeling van het larven en tetracycline efficiëntie verlagen.</li>
		<li>Nieuw eclosed volwassen vliegen verzamelen (binnen 3 ~ 5 dagen) onder een lichte stroom van CO2, en herhaal stap ~ 1.2.1-1.2.2. Minstens 3 generaties zijn meestal nodig voor het volledig uitbannen van Wolbachia.</li>
		<li>Na 3 generaties met tetracycline behandeling, verzamelen 5 vliegen onder een lichte stroom van CO2 voor de Wolbachia infectie test. Slijpen vliegen voor 1 min met 250 μL van tweemaal gedestilleerd water (ddH2van O) en een paar 0.5 mm steriele keramische kralen in een 1,5 mL-buis met behulp van een homogenizer. Voeg een andere 250 μL van 2 x A buffer (0,2 M Tris-HCl, pH 9.0; 0.2 M EDTA; 2% SDS) aan het monster en de vortex. Opmerking: Aangezien SDS de kraal verkeer belemmeren zal, 1 x A buffer kan niet direct gebruikt worden om te slijpen vliegen. Als de vliegen rode ogen hebben, verwijderen hoofden voor slijpen, aangezien dit een invloed op de kleur van het product van DNA hebben kan.</li>
		<li>Het bevriezen van de monsters bij-80 ° C (houden voor maximaal één jaar). Snel ontdooien de het monster van-80 ° C in een bad van 25 ° C water tot het is opgelost. Incubeer de monsters bij 70 ° C gedurende 30 minuten.</li>
		<li>Voeg 190 l 5 M KOAc, vortex en broeden op het ijs 15 min of langer.</li>
		<li>Centrifugeer steekproeven bij 13.000 x g gedurende 5 minuten bij kamertemperatuur, verzamelen het supernatant en deze overbrengen naar nieuwe buizen.</li>
		<li>Herhaal stap 1.2.7 DNA met een betere kwaliteit te verkrijgen.</li>
		<li>750 μL van isopropanol toevoegen aan elk monster en voorzichtig het omkeren van een paar keer met de hand. Incubeer bij kamertemperatuur gedurende 5 minuten.</li>
		<li>Centrifugeer steekproeven bij 13.000 x g gedurende 5 minuten bij kamertemperatuur en verwijder het supernatant. De witte genomic DNA pellet blijft aan de onderkant van de buis.</li>
		<li>Voeg 1 mL 70% ethanol tot de pellets, centrifuge op 13.000 x g gedurende 5 minuten, en verwijder het supernatant. Het DNA drogen totdat het wordt transparant.</li>
		<li>Los van DNA in 100 μl van ddH2O, Titreer DNA concentratie door UV-Vis absorptiespectrofotometrie en vul het DNA aan 100 ng/μL.</li>
		<li>Gebruik 200 ng van DNA voor de PCR reactie (Zie de Tabel van materialenin een systeem 20 μL). PCR uitvoeren door het volgende programma: 95 ° C gedurende 15 minuten; 36 cyclus van 95 ° C voor 45 s, 50 ° C voor 45 s, en 72 ° C gedurende 1 min; en een laatste uitbreiding stap (72 ° C gedurende 1 min) in een thermische cycler. Opmerking: Gebaseerd op de Wolbachia 16S rRNA, gebruiken de volgende inleidingen: 5' TGAGGAAGATAATGACGG 3' (in voorwaartse richting) en 5' CCTCTATCCTCTTTCAACC 3' (omgekeerde). Voor wsp, waren de inleidingen 5' CATTGGTGTTGGTGTTGGTG 3' (in voorwaartse richting) en 5' ACCGAAATAACGAGCTCCAG 3' (omgekeerde).</li>
		<li>Het analyseren van PCR producten met 1% agarose gelelektroforese. De grootte van het PCR product van Wolbachia 16S rRNA en wsp is ongeveer 200 bp en 600 bp, respectievelijk.</li>
		<li>Achterste Wolbachia gratis vliegen op voorraad standaard maïsmeel vliegen voedsel. Verzamelen 3-5 dagen nieuw eclosed mannetje vliegt voor infectie. Opmerking: Tetracycline behandeling kan ook invloed hebben op intestinale microbiota samenstelling, die vervolgens invloed antivirale reacties in de host. Het is raadzaam dat alle vliegen de dezelfde tetracycline behandelingen krijgen. Houd Wolbachia-gratis vliegen groeien onder standaardvoorwaarden voor ten minste 3 generaties om te herstellen van de darmflora.</li>
	</ol></li>
	<li>Pastrel genotypering Opmerking: De aanwezigheid van het S of R-allel van het pst -gen in de genetische achtergrond heeft gemeld DCV infectie in Drosophila34,35te beïnvloeden. Het is noodzakelijk om te controleren de pst -genotype, vooral voor DCV infectie. Er zijn een paar SNPs in pst die virusinfectie kunnen beïnvloeden, de grote SNP is 512 C/T. Het temperatuurverloop tijdens PCR is een snelle methode om te identificeren pst genotype.<ol>
<li>Uittreksel vliegen genomic DNA zoals hierboven (stap 1.2.4 - 1.2.15) beschreven.</li>
		<li>Gebruik 100 ng van DNA als de sjabloon, de 512C primer, 5' CAGCATGGTGTCCATGAAGTC 3' (in voorwaartse richting) en 5' ACGTGATCAATGCTGAAAGT 3' (omgekeerde) te detecteren het R-allel, de 512T primer, 5' CAGCATGGTGTCCATGAAGTT 3' (in voorwaartse richting) en 5' ACGTGATCAATGCTGAAAGT 3' (omgekeerde) op te sporen de S-allel.</li>
		<li>Stel de Tm (smelttemperatuur) verlopen als volgt: 54 ° C, 54.7 ° C, 55.5 ° C, 58 ° C, 59.7 ° C, 62.2 ° C, 63.7 ° C en 64 ° C (45 s bij elke temperatuur). Opmerking: 30 cycli van PCR de kettingreactie worden aanbevolen (20 μL systeem).</li>
		<li>Het PCR-product van 100-bp visualiseren door 2% agarose gelelektroforese.</li>
	</ol></li>
</ol>2. virale infectie in Drosophila
<ol><li>
Infecteren vliegen door nano-injectie en overleving testen uit te voeren.
	<ol>
<li>Trek de haarvaten te bereiden injectie naalden, rug-Vul de injectie nld met olie en monteren van de injector50zoals hiervoor is beschreven.</li>
		<li>Anaesthetize vliegen op het pad onder een lichte stroom van CO2. Inoculeer vliegen door intra-thoracale injectie44 van 50,6 nL van virus-oplossing (100 PFU, verdund met Tris-HCl buffer, pH 7,2). Injecteren van ten minste 3 flesjes van vliegen (20 vliegen per flacon). Opmerking: De injectie is tijdrovend (over het algemeen 100 vliegt per uur) en DCV replicatie is zeer snel, dus het is zeer belangrijk om te noteren van de exacte tijd op de buis eenmaal afwerking elk flesje (20 vliegen). Buffer enige injectie is ingesteld als een mock besturingselement. Mannelijke volwassen vliegen hebben meestal de voorkeur, zoals resultaten zijn stabieler en reproduceerbare dan met vrouwtjes omdat hormonale variaties tijdens de paring en voortplanting invloed op de uitlezing van vrouwtjes51 hebben kunnen.</li>
		<li>Groeien de ingespoten vliegen bij 25 ° C, 60% vochtigheid onder een normale licht/donker cyclus. Vliegen met vers voedsel dagelijks leveren en registreren het aantal dode ﬂies.</li>
		<li>Voer ten minste 3 biologische replicatieonderzoeken en uitzetten van de curve van de overleving.</li>
		<li>Genereren voor de statistische analyse van gegevens van de overleving, Kaplan-Meier overleving curven door statistische software. Het uitvoeren van log-rank test om de P-waarden te berekenen. Geef op de tabel van de overleving, informatie voor elk onderwerp. De software vervolgens berekent percentage overleven op elk moment, en plots een Kaplan-Meier overleving plot. Opmerking: Voeg geen extra gist in de flacon. Vergeleken met mock besturingselementen, DCV-geïnfecteerde vliegt af en toe hebben ascites en zijn onhandig, waardoor ze kwetsbaar zijn voor de kleverige gist. Het is beter om meer tijd punten opnemen in het voorontwerp experiment om erachter te komen een tijdsbestek waartegen de massale dood voor geïnfecteerde vliegen gebeuren zal. In het algemeen, sterven de besmette vliegen zelden binnen de eerste twee dagen, zelfs voor de Dcr-2 mutant lijnen. Voor de Wolbachia gratis w1118 (Bloomington 5905) vlieg besmet met 100 PFU van DCV, is het venster van deze tijd ongeveer 3-5 dagen post infectie. Fruitvliegjes dat binnen 0,5 h post injectie uur sterven wilt niet meetellen als een fataliteit omdat ze kunnen worden gedood door naald schade niet door virale infectie.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
DCV laden maatregel door CPE assay Opmerking: Virale lading wordt ook gemeten met de titratie van de virus-voorraad (stap 1.1.6) maar vereist extra monstervoorbereiding (2.2.1-2.2.4 stap).<ol>
<li>Op dag 1, infecteren mannelijke vliegen zoals beschreven in stap 2.1.1-2.1.2. Groep ingespoten vliegen in groepen van 20 en houd ze groeien op vers vliegen voedsel voor het gewenste tijdstip (typisch voor 24 h of 3 dagen). Leveren dagelijks vliegen met vers voedsel.</li>
		<li>Op dag 2, seed Drosophila S2 * cellen in een 10 cm cel cultuur schotel tot en met de dichtheid van ongeveer 5 x106 tot en met 1 x 107 cellen/mL zoals beschreven in stap 1.1.1.</li>
		<li>Op dag 3, verzamelen 5 vliegen (onder een lichte stroom van CO2) en ze vermalen in een centrifugebuis 1,5 mL voor 30 s met 200 μL van Tris buffer en keramische kralen met behulp van homogenizer. Opslaan van de monsters bij-80 ° C of onmiddellijk overgaan tot de volgende stap.</li>
		<li>Grondig vortex het monster. Gebruik een spuit van 1 mL en 0.22 μm datumfilter voor het supernatant tot een nieuwe 1,5 mL koker. Ga verder met de titratie, zoals beschreven in stappen 1.1.6.1-1.1.6.5.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
DCV belasting gemeten door qRT-PCR
	<ol>
<li>Op dag 1, infecteren vliegen zoals hierboven beschreven. Groep ingespoten mannetje vliegt (20 vliegen/groep) en groeien op vers vliegen voedsel voor gewenste tijdstip, meestal voor 24 h of 3 dagen. Leveren dagelijks vliegen met vers voedsel.</li>
		<li>Op dag 3, verzamelen 5 vliegen onder een lichte stroom van CO2 in een 1,5 mL-buis met 200 μL van lysis-buffermengsel en 20 keramische kralen (diameter = 0,5 mm), de monsters door homogenizer met hoge snelheid voor 30 s. toevoegen 800 μL van extra lysis-buffermengsel aan elke buis te slijpen en opslaan van de s meer bij-80 ° C of onmiddellijk voeren RNA extractie en qRT-PCR.</li>
		<li>Bereiden RNase gratis tips, buizen en gedeïoniseerd, diethylpyrocarbonate (DEPC) behandeld en 0,22 µm membraan gefiltreerd water. Toevoegen van 200 μL van chloroform (≥99.5%) in de steekproef en krachtig schudden voor de 15 s met de hand. Incubeer gedurende 5 minuten of langer bij kamertemperatuur totdat de waterfase en de organische fase duidelijk gescheiden zijn. Opmerking: Chloroform is uiterst gevaarlijk en moet met zorg worden behandeld. Doen niet vortex het monster, waardoor het risico van besmetting van het DNA.</li>
		<li>Centrifugeer steekproeven bij 13.000 x g gedurende 15 min bij 4 ° C.</li>
		<li>400 μL van de bovendrijvende substantie verzamelen en overbrengen van het supernatant naar nieuwe buizen. Meng met de dezelfde volumedelen isopropanol (≥ 99,5%) voorzichtig het omkeren van de monsters voor 20 keer met de hand en vervolgens neerslag gedurende 10 minuten of langer bij kamertemperatuur. Opmerking: Neerslag bij-20 ° C zal RNA rendement verhogen.</li>
		<li>Centrifugeer steekproeven bij 13.000 x g gedurende 10 minuten bij 4 ° C. Wit RNA pellets zijn zichtbaar aan de onderkant van de buis.</li>
		<li>Verwijder het supernatant en voeg 1 mL 70% ethanol (ethanol in DEPC water) en paar keer te wassen de RNA omkeren.</li>
		<li>Centrifugeer steekproeven bij 13.000 x g gedurende 5 min bij 4 ° C. Gooi het supernatant en droge RNA voor 5-10 min; RNA moet transparant worden.</li>
		<li>50 μl van DEPC water aan de steekproef, het pipet toevoegen voor paar keer en vortex.</li>
		<li>Neem 3 μL van RNA voor titrating de RNA-concentratie. Kwantificeren van het RNA op 260 nm. Normaal gesproken, is de concentratie van de RNA gehaald door dit protocol ongeveer 100-500 μg/μl, geschikt voor cDNA synthese.</li>
		<li>Gebruik 2 μg RNA voor cDNA synthese. Verdunnen van het monster, tot 100 μl met ddH2O en winkel bij-20 ° C.</li>
		<li>Uitvoeren van qRT-PCR volgens de instructies van de fabrikant en voer qRT-PCR. Opmerking: Voor cDNA synthese van DCV, willekeurige inleidingen werkte veel beter dan Poly A primer in onze handen. DCV mRNA uitdrukking is genormaliseerd naar endogene ribosomal eiwit 49 (rp49) mRNA. Oligonucleotide inleidingen gebruikt in dit deel: rp49 5' AGATCGTGAAGAAGCGCACCAAG 3' (in voorwaartse richting) en 5' CACCAGGAACTTCTTGAATCCGG 3' (omgekeerde); DCV, 5' TCATCGGTATGCACATTGCT 3' (in voorwaartse richting) en 5' CGCATAACCATGCTCTTCTG 3' (omgekeerde); Vago, 5' TGCAACTCTGGGAGGATAGC 3' (in voorwaartse richting) en 5' AATTGCCCTGCGTCAGTTT 3' (omgekeerde); virus-geïnduceerde RNA 1 (vir-1) 5-' GATCCCAATTTTCCCATCAA 3' (in voorwaartse richting) en 5' GATTACAGCTGGGTGCACAA 3' (omgekeerde).</li>
	</ol>
</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

In dit artikel presenteren we een gedetailleerde procedure op hoe een systeem te zetten virale infectieziekten bij volwassen Drosophila melanogaster gebruik nano-injectie. De protocollen zijn de voorbereiding van de passende vliegen lijnen en virus voorraad, infectie technieken, de evaluatie van besmettelijke indicatoren en het meten van de antivirale reactie. Hoewel DCV wordt gebruikt als een voorbeeld van een virale ziekteverwekker, zijn tientallen verschillende soorten virus met succes toegepast voor studie i...

Virale infecties, met name door arboviruses, zoals het Chikungunya virus1, opkomende het Dengue-virus, het gele koorts virus2 en de Zikavirus3, zijn een enorme bedreiging voor de volksgezondheid door het veroorzaken van pandemieën 4. zo een beter begrip van virus-gastheer interactie is steeds belangrijker geworden voor epidemische controle en behandeling van virale ziekten bij de mens. Voor dit doel, worden meer passende en efficiënte modellen vastgesteld om de onderzoeken van de mechanismen die ten grondslag liggen aan de virusinfectie.
De fruitvlieg, Drosophilamelanogaster (D. melanogaster), biedt een krachtig systeem om te onderzoeken van virus-gastheer interactie5,6 en heeft bewezen een van de meest efficiënte modellen om te studeren ziekten bij de mens virale7 , 8 , 9. zeer geconserveerde antiviral signalering trajecten en onvergelijkbare genetische hulpmiddelen maken vliegt een groot model te produceren aanzienlijke resultaten met echte gevolgen voor menselijke antivirale studies. Bovendien vliegen zijn gemakkelijk en goedkoop te onderhouden in het laboratorium en zijn geschikt voor grootschalig onderzoek voor nieuwe regelgevende factoren6,10 in het virus en de host tijdens de infectie.
Vier grote zeer geconserveerde antivirale trajecten (bijv., de RNA-interferentie (RNAi) traject11, de JAK-STAT traject12, de NF-recombination pathway en de autophagy traject13) zijn goed bestudeerd in Drosophila in recente jaar6. Het RNAi-traject is een brede antivirale mechanisme dat de meeste soorten virus infectie6,14kan onderdrukken. Verstoring van dit traject door mutatie in genen zoals Dicer-2 (Dcr-2) of Argonaute 2 (AGO2) kan leiden tot verhoogde virus titer en gastheer mortaliteit15,16,17. De JAK-STAT-traject heeft zijn betrokken bij de controle van infectie door een virus uit de familie van de Dicistroviridae en de Flavivirus -familie in insecten, bijv., Drosophila-C-virus (DCV) in vliegen16 en West-Nijlvirus (WNV) en Dengue Virus in mug18,19. De Drosophila tol (homoloog aan de menselijke NF-recombination pathway) en Immune deficiency (IMD) trajecten (vergelijkbaar met de menselijke NF-recombination en TNF pathway) zijn beiden betrokken bij de verdediging van virus invasie20,21, 22. autophagy is een ander geconserveerde mechanisme die betrokken zijn bij de regulering van virale infectie, die ook in Drosophila23,24 gekenmerkt is. Dus, de identificatie van nieuwe regelgevende factoren van deze trajecten en ontleden Overspraak tussen deze antivirale signalering en andere biologische studierichtingen, zoals de stofwisseling, veroudering, neurale reactie, enzovoort, kunnen eenvoudig worden ingesteld in de Drosophila systeem.
Hoewel meest gevestigde virale besmettelijke modellen in Drosophila zijn geïnduceerd door RNA virussen, besmetting door de ongewervelde iriserende Virus 6I (IV-6) en Kallithea virussen hebben getoond voor het potentieel voor studie van DNA-virussen vliegen25, 26. Bovendien, het virus kan ook zodanig gewijzigd dat besmetting van Drosophila, zoals het influenzavirus9. Dit is de toepassing van het platform van de screening Drosophila sterk uitgebreid. In deze procedure gebruiken we DCV als voorbeeld om te beschrijven hoe een virale besmettelijke systeem in Drosophilate ontwikkelen. DCV is een positieve-zin één gestrande RNA virus van ongeveer 9300 nucleotiden, 9 eiwitten27-codering. Als een natuurlijke ziekteverwekker van D. melanogaster, wordt DCV gezien als een geschikte virus bestuderen host fysiologische, gedragsmatige en basale immuunrespons tijdens interactie en Co-evolutie van de host-virus28. Bovendien maakt zijn snelle sterftecijfer na infectie in wild type vliegen DCV bruikbaar aan het scherm voor resistente of gevoelig genen in de host-29.
Echter, er zijn verschillende aspecten van zorg bij de studie van virale infecties in Drosophila. Bijvoorbeeld, hebben symbiotische bacterie Wolbachia een mogelijkheid om een breed spectra van RNA-virus verspreiding in Drosophila en mug30,31,32. Recente gegevens blijkt een mogelijk mechanisme in welke Wolbachia blokken Sindbis (SINV) virusbesmetting via de opregulatie van methyltransferase DT2 expressie in de host-33. Bovendien is de genetische achtergrond van insecten is ook essentieel voor virale infectie. De natuurlijke polymorfisme in het gen, pastrel (pst), bepaalt bijvoorbeeld de gevoeligheid voor DCV infectie in Drosophila34,35, terwijl de loci van Ubc-E2H en CG8492 betrokken zijn bij Cricket verlamming virus (CrPV) en Flock huis (FHV) virusinfectie, respectievelijk36.
De bijzondere manieren vast te stellen van de virus-gastheer interactie in vliegen, moet worden gekozen op basis van onderzoeksdoeleinden zoals een high-throughput scherm voor host cellulaire componenten in Drosophila cel lijnen37,38, mondelinge infectie te bestuderen gut-specifieke antivirale antwoord22,39,40, naald prikken41,42 of nano-injectie door het passeren van epitheliale belemmeringen voor het stimuleren van systemische immuun reacties. Nano-injectie kan exact bepalen de virale dosis om de reactie van een gecontroleerde antivirale en een fysiologische laesie43, aldus garanderen hoge experimentele reproduceerbaarheid44. In deze studie beschrijven we een nano-injectie methode om te studeren van virus-gastheer interacties in Drosophila, het belang van het vliegen achtergrond effecten.

<table><tbody><tr><td>0.22um filter</td><td>Millipore</td><td>SLGP033RS</td><td></td></tr><tr><td>1.5 ml Microcentrifuge tubes</td><td>Brand</td><td>352070</td><td></td></tr><tr><td>1.5 ml RNase free Microcentrifuge tubes</td><td>Axygen</td><td>MCT-150-C</td><td></td></tr><tr><td>10 cm cell culture dish</td><td>Sigma</td><td>CLS430167</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>100 Replacement tubes</td><td>Drummond Scientific</td><td>3-000-203-G/X</td><td></td></tr><tr><td>15 ml tube</td><td>Corning</td><td>352096</td><td></td></tr><tr><td>ABI 7500 qPCR systeem</td><td>ABI</td><td>7500</td><td>qPCR</td></tr><tr><td>Cel Incubatieapparaat</td><td>Sanyo</td><td>MIR-553</td><td></td></tr><tr><td>Centrifuge</td><td>Eppendof</td><td>5810R</td><td></td></tr><tr><td>Centrifuge</td><td>Eppendof</td><td>5424R</td><td></td></tr><tr><td>Chloroform</td><td>Sigma</td><td>151858</td><td>RNA extractie</td></tr><tr><td>DEPC water</td><td>Sigma</td><td>95284-100ML</td><td>RNA extractie</td></tr><tr><td>Drosophila Incubator</td><td>Percival</td><td>I-41NL</td><td>Drosophila fokken</td></tr><tr><td>FBS</td><td>Invitrogen</td><td>12657-029</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>platte bodem 96-wellplaat</td><td>Sigma</td><td>CLS3922</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>Fluorescentiemicroscoop</td><td>Olympus</td><td>DP73</td><td></td></tr><tr><td>Isopropylalcohol</td><td>Sigma</td><td>I9516</td><td>RNA extractie</td></tr><tr><td>Lyse buffer (RNA extractie)</td><td>Thermo Fisher</td><td>15596026</td><td>TRIzol Reagens</td></tr><tr><td>Lyse buffer (vloeibare monster RNA extractie)</td><td>Thermo Fisher</td><td>10296028</td><td>TRIzol LS Reagens</td></tr><tr><td>Microscoop</td><td>Olympus</td><td>CKX41</td><td></td></tr><tr><td>Nanoject II Auto-Nanoliter Injector</td><td>Drummond Scientific</td><td>3-000-204</td><td>Nanoject II Variabel Volume (2,3 tot 69 nL) Automatisch Injector met glazen capillairen (110V)</td></tr><tr><td>Optische kleeffolie</td><td>ABI</td><td>4360954</td><td>qPCR</td></tr><tr><td>Penicilline-Streptomycine, vloeibaar</td><td>Invitrogen</td><td>15140-122</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>qPCR plaat</td><td>ABI</td><td>A32811</td><td>qPCR</td></tr><tr><td>Schneider&rsquo;s Insect Medium</td><td>Sigma</td><td>S9895</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>statistisch software</td><td>GraphPad Prism 7</td><td></td><td></td></tr><tr><td>TransScript Fly First-Strand cDNA Synthese SuperMix</td><td>TransScript</td><td>AT301</td><td>RNA extractie</td></tr><tr><td>Vortex</td><td>IKA</td><td>VORTEX 3</td><td>RNA extractie</td></tr></tbody></table>

oprichting van virale infectie en analyse van host-virus interactie bij drosophila melanogaster

Establishment of Viral Infection and Analysis of Host-Virus Interaction in Drosophila Melanogaster

Verspreiding van het virus is een belangrijke oorzaak van epidemische ziekten. Inzicht in de interactie tussen het virus en de host is dus heel belangrijk om uit te breiden onze kennis van preventie en behandeling van virale infectie. De fruitvlieg Drosophila melanogaster heeft bewezen als een van de meest efficiënte en productieve modelorganismen scherm voor antivirale factoren te onderzoeken van virus-gastheer interactie, als gevolg van krachtige genetische hulpmiddelen en zeer geconserveerde aangeboren immuun Signaalroutes. De hier beschreven procedure toont een nano-injectie methode om te zetten virale infectie en induceren systemische antivirale reacties in volwassen vliegen. De nauwkeurige controle van de virale injectie dosis bij deze methode kan hoge experimentele reproduceerbaarheid. Protocollen die zijn beschreven in deze studie zijn de voorbereiding van vliegen en het virus, de injectie methode overleving tarief analyse, de meting van de lading virus en eenbeoordeling van de antivirale traject. De effecten van de invloed van virale infectie door het vliegen achtergrond werden hier vermeld. Deze infectiemethode is gemakkelijk uit te voeren en kwantitatief herhaalbare; het kan worden toegepast op het scherm voor host/virale factoren betrokken bij virus-gastheer interactie en ontleden de Overspraak tussen aangeboren immuun signalering en andere biologische trajecten in reactie op virale infectie.

Resultaten van deze afdeling worden verkregen na DCV infectie van D. melanogaster. Figuur 1 toont het stroomschema van virale infectie in Drosophila. Vliegen tijdens thoracically worden ingespoten, en vervolgens de monsters worden genomen voor de meting van de virale TCID50 en het genoom RNA niveau (Figuur 1). Virusinfectie kan veroorzaken lysis van de cel en CPE is waargenomen bij 3 dagen post infectie (figuur 2A). De virus belasting gemeten...

Dit protocol wordt beschreven hoe om virale infectie in vivo bij Drosophila melanogaster met behulp van de methode van de nano-injectie en de basistechnieken voor het analyseren van virus-gastheer interactie.

Oprichting van virale infectie en analyse van Host-Virus interactie bij Drosophila Melanogaster

Virus spreading is a major cause of epidemic diseases. Thus, understanding the interaction between the virus and the host is very important to extend our ...

Deze methode kan helpen bij het beantwoorden van belangrijke vragen in het virus-host interactie veld over hoe effectief vast te stellen een virale infectie in Drosophila melanogaster. Deze nanoinjectiemethode maakt een nauwkeurige controle van de infectiedosis van het virus mogelijk en kan gemakkelijk worden toegepast op infecties met andere microbiële pathogenen. Begin met het kweken van een keer 10 tot de zevende levensvatbare S2-stercellen per milliliter als losse, semi-aanhangende monolaag in een 10 centimeter celkweekschotel met 10 milliliter complete Schneiders Drosophila Medium zonder extra kooldioxide bij 25 graden Celsius gedurende een uur.Tijdens de incubatie, resuspend vers ontdooid Drosophila C Virus of DCV tot een veelheid van infectie van 0,01 in een milliliter van compleet medium en virus oplossing toe te voegen aan de celkweek gerechten. Breng de plaat vervolgens drie tot vijf dagen terug naar de 25 graden Celsius incubator. Het virus is klaar voor verzameling wanneer de celmorfologie ziet er wazig en de cultuur medium is vol met zwarte deeltjes indicatief voor celpuin.Meng de supernatant door pipetting een paar keer voor de overdracht van de hele celcultuur naar een 15 milliliter buis voor lyse van de gastheer cellen op min 80 graden Celsius. Om werkconcentraties van het virus te genereren, ontdooit u de celsuspensie in een waterbad van 25 graden Celsius met constant schudden voordat het celpuin wordt gepeld door centrifugatie. Breng vervolgens de supernatant over in een nieuwe steriele buis van 15 milliliter voor vortexen en aliquot tot 200 microliter virusoplossing per buis.Om de gemiddelde virusweefselkweek te bepalen, eerste zaad een keer 10 tot de vijf S2-sterrencellen in 100 microliter van compleet medium in acht putten per kolom in 12 rijen van een 96 putplaat. Breng de plaat vervolgens terug naar de 25 graden Celsius incubator. Selecteer willekeurig vijf buisjes virus uit min 80 graden Celsius opslag.Terwijl de cellen zich vestigen, vul 10 steriele 1,5 milliliter microcentrifugebuizen met 450 microliter van steriel compleet medium en voeg 50 microliter virusvoorraad toe aan de eerste 1,5 milliliter buis met 450 microliter van steriel compleet medium dat de suspensies 10 keer per stap verdunt tot de 12e put. Voeg aan het einde van de incubatie 50 microliters van elke verdunning toe aan de juiste put in elke kolom voor die buis van het virus en voeg 50 microliters cultuurmedium zonder virus toe aan één put per kolom als de negatieve controle goed. Plaats vervolgens de plaat in de 25 graden Celsius incubator voor drie dagen en beoordeel het cytopathische effect van elk virus voorraad onder een Brightfield microscoop op een 20X vergroting per dag.Classificeer een put waarin de cellen er wazig uitzien en het medium vol fragmenten zit als een positieve put en een put waarin de celmorfologie normaal is als negatieve put. Meng voor het fokken grondig 400 microliter van 50 microgram per milliliter Tetracycline met vier gram verse standaard maïsmeelvliegvoedsel en plaats het voedsel 's nachts op vier graden Celsius om de ethanol te verdampen. De volgende ochtend, warm het voedsel op kamertemperatuur en plaats het voedsel en plaats het voedsel en 20 vrouwelijke en 10 mannelijke nieuw afgeschermde volwassen vliegt in een broedfuit voor een drie tot vier dagen fokken incubatie bij 25 graden Celsius en 60% vochtigheid onder een normale licht / donkere cyclus.Wanneer er genoeg eieren zijn gelegd, verzamel de nieuw afgeschermde volwassen vliegen onder een lichte stroom van kooldioxide en ras de Drosophila weer twee keer zoals net aangetoond. Na drie generaties van Tetracycline behandeling, verzamel vijf vliegen onder een lichte stroom van kooldioxide en homogeniseren de vliegen met 250 microliters van dubbel gedestilleerd water en een paar 0,5 millimeter steriele keramische kralen. Voeg na een minuut 250 microliter 2x buffer A toe aan het monster voor vortexing voordat u de monsters bij min 80 graden Celsius bevriest.Vervolgens snel ontdooien monsters van min 80 graden Celsius opslag in een 25 graden Celsius waterbad, gevolgd door een 30-minuten incubatie in een 70 graden Celsius waterbad voor het extraheren van de genomische DNA en het versterken van het DNA door polymerase kettingreactie volgens standaard protocollen. Bevestig de afwezigheid van Wolbachia 16 kleine RNA en wsp in elke vlieg homogenaat door gel elektroforese volgens standaard protocollen. Dan achter de Wolbachia-vrije vlieg voorraad op standaard maïsmeel vlieg voedsel zoals aangetoond.Voor virale infectie, eerst gebruik maken van een stereomicroscoop en dunne tangen om het puntje van een glas capillaire naald te breken om de juiste diameter voor nanoinjectie. Om de injector te monteren, plaats de plafond O-ring en een witte spacer op de metalen zuiger van de injector met de grote kuil naar buiten gericht. Gebruik een spuit uitgerust met een 30-meter naald om de glazen naald te vullen met minerale olie en plaats de naald door de kraag.Plaats de grotere O-ring rond de basis van de kraag ongeveer een millimeter van het stompe uiteinde van de naald en monteer de naald op de zuiger van de injector. Zet de naald op de zuiger en druk op de lege knop om de zuiger van de microinjector uit te breiden tot er een hoorbaar signaal wordt gehoord. Druk nu op fill om de zuiger vijf millimeter in te trekken en dompel de naald in een 100 plaque-vormende eenheid virale suspensie.Schud voorzichtig een of ten minste drie flesjes van 20 Wolbachia-vrije mannelijke Drosophila op de injectieschaal. Mannelijke begiftigde vliegen hebben de voorkeur tijdens de paring en reproductie kan vrouwen beïnvloeden. Injecteer vervolgens de thorax van elke vlieg met 50,6 nanoliters van virusoplossing in het iets lichter gekleurde gebied tussen de mesopleura en de pteropleura en meet de DCV-belasting door cytopathische effecttest en kwantitatieve RT PCR van grondvliegen zoals net aangetoond.Breng na de injectie de vliegen voorzichtig over naar een verse flacon en plaats de flacon in een horizontale positie om te voorkomen dat de vliegen aan het medium blijven plakken terwijl ze herstellen van de anesthesie. De injectie is tijdrovend, maar de DCV replicatie is zeer snel, dus het is erg belangrijk om op te schrijven de exacte tijd op de buis zodra alle van de vliegen van elke flacon zijn geïnjecteerd. Virusinfectie kan leiden tot cellyse en cytopathische effecten worden waargenomen op drie dagen na infectie.Wolbachia 16s rRNA en wsp primers kunnen worden gebruikt om de aanwezigheid van Wolbachia en Drosophila te detecteren zoals aangetoond. Wolbachia-vrije vliegen vertonen een aanzienlijk verminderde overlevingskans na dcv-infectie en op een dosis-afhankelijke manier. DCV activeert antivirale signaleringstrajecten in de gastheer die van cruciaal belang zijn voor antivirale infectie in Drosophila, zoals blijkt uit de verminderde overlevingskans en verhoogde virale belasting in Dicer-2 mutantvliegen.Tijdens een poging tot deze procedure, is het belangrijk om te onthouden dat besmetting met Wolbachia genotype de gevoeligheid van de Drosophila melanogaster vliegt naar de DCV-infectie kan beïnvloeden. Na deze procedure kunnen andere methoden zoals een genetisch scherm op grotere schaal worden uitgevoerd om aanvullende vragen te beantwoorden over onder gedefinieerde gastheergenen die nodig zijn voor virale infectie of antivirale reacties. Na de ontwikkeling ervan maakte deze techniek de weg vrij voor onderzoekers op het gebied van menselijke virale ziekte om de mechanismen te onderzoeken die ten grondslag liggen aan uitbraken van endemische menselijke virale infecties in het Melanogaster-model van Drosophila.Vergeet niet dat het werken met het virus zeer gevaarlijk kan zijn en dat voorzorgsmaatregelen zoals het dragen van de juiste beschermingsmiddelen altijd moeten worden genomen tijdens het uitvoeren van deze procedure.

establishment-viral-infection-analysis-host-virus-interaction

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Immunologie en Infectie

Drosophila hemocytes verspreiden over het geheel van de zich ontwikkelende embryo. Dit protocol laat zien hoe te monteren en het imago van deze migraties met behulp van embryo's met fluorescent gelabelde hemocytes.

Live-beeldvorming van Drosophila melanogaster Embryonale Hemocyte Migraties

Nieuwe gastheer factoren die betrokken zijn bij virale infectie kan worden geïdentificeerd door middel van cel-gebaseerde genoom-brede verlies van functie RNAi screening.

RNAi Screening voor Host factoren die betrokken zijn in Vaccinia Virus infectie met behulp van Drosophila Cellen

Source: Siva-Jothy, J. A., et al. Oral Bacterial Infection and Shedding in Drosophila melanogaster. J. Vis. Exp. (2018)The video demonstrates the oral infection of Drosophila melanogaster with pathogenic bacteria. It includes the preparation of infection vials and the transfer of starved flies to enable bacterial ingestion. The procedure captures gut colonization, followed by surface sterilization and homogenization of flies. Finally, it shows quantification of internal bacterial load through...

Oral Infection of Drosophila melanogaster with Pathogenic Bacteria

Source: Hiroyasu, A., D et. al., Extraction of Hemocytes from Drosophila melanogaster Larvae for Microbial Infection and Analysis. J. Vis. Exp. (2018)This video demonstrates the procedure for establishing a bacterial infection in Drosophila larvae by placing them into a bacterial droplet and pricking them with a tungsten needle. The larvae are then incubated on a grooved, nutrient-rich agar plate to study host-pathogen interactions.

Establishing Bacterial Infection in Drosophila Larvae

In this video, we describe a procedure to perform a nano-injection of a positive-sense, single-stranded RNA virus into adult male Drosophila flies and subsequently study the antiviral responses initiated due to the infection. Polymerase chain reaction analysis identifies the upregulation of specific genes in the infected flies that indicate the activation of immune response pathways including RNA interference and JAK/STAT signaling.

Intrathoracic Viral Nano-Injection to Study Host-Virus Interactions in Adult Flies

In this video, we demonstrate the cytopathic effect assay to determine the tissue culture infective viral dose of Drosophila C virus on Drosophila S2* cells. A range of viral concentrations are used to infect the cultured cells. The proportion of cells exhibiting structural changes is determined, and this data is used to calculate the tissue culture infective dose.

Assay to Determine the Virus Infectious Dose of Drosophila C Virus in Cultured Insect Cells

Drosophila melanogaster is een uitstekend modelorganisme voor het bestuderen van aangeboren immuunsystemen en de fysiologische gevolgen van infectie en ziekte. Dit protocol beschrijft hoe robuuste en kwantitatief herhaalbare bacteriële infecties aan D. melanogaster kunnen worden toegediend, en hoe vervolgens de ernst van de infectie kan worden gemeten en de immuunrespons van de gastheer kan worden gekwantificeerd.

Systemische bacteriële infectie en afweer Phenotypes in<em&gt; Drosophila melanogaster</em

Deze methode laat zien hoe om te visualiseren pathogen invasie in insect cellen met driedimensionale (3D) modellen. Hemocytes van Drosophila larven waren besmet met virale of bacteriële pathogenen, ex vivo of in vivo. Besmette hemocytes werden vervolgens vast en gekleurd voor imaging met een confocal microscoop en de daaropvolgende 3D cellulaire wederopbouw.

Winning van Hemocytes van Drosophila melanogaster larven voor microbiële infectie en analyse

Dit protocol wordt beschreven methoden om mondeling bloot en de fruitvlieg Drosophila melanogaster met bacteriële pathogenen infecteren, en voor het meten van het aantal infectieuze bacteriën schuur na infectie van de darm. Verder beschrijven we het effect van immuun mutanten op vliegen overleving na mondelinge bacteriële infectie.

Mondelinge bacteriële infectie en Shedding bij Drosophila melanogaster

Hier presenteren we de protocollen om te identificeren 1) virus-gecodeerde immunomodulators ter bevordering van arbovirus replicatie en 2) eukaryotische gastheer factoren die arbovirus replicatie beperken. Deze fluorescentie - en luminescentie gebaseerde methoden toestaan onderzoekers snel verkrijgen van kwantitatieve uitlezingen van arbovirus replicatie in simplistische testen met lage signaal-ruis verhouding.

Arbovirus infecties als Screening van hulpmiddelen voor de identificatie van de virale Immunomodulators en Host antivirale factoren

Dit protocol beschrijft een in vivo fagocytose assay in volwassen Drosophila melanogaster te kwantificeren fagocytensysteem erkenning en goedkeuring van de microbiële infecties.

Beoordeling van de cellulaire immuunrespons van de fruitvlieg, Drosophila melanogaster, met behulp van een In Vivo fagocytose Assay

Leer virale infectie opzetten en virus-gastheerinteracties analyseren bij Drosophila melanogaster met behulp van nanoinjectie. Deze methode biedt precieze controle over de infectiedosis en toepasbaarheid voor andere pathogenen.

Oprichting van virale infectie en analyse van Host-Virus interactie bij Drosophila Melanogaster

Meer video's verkennen