Name: Gedrags Tracking en Neuromast beeldvorming van Mexicaanse Cavefish (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-04-06T14:00:00.000+00:00
Duration: 14 min 58 s
Description: Leer gedragsanalyse en neuromast-beeldvorming van Mexicaanse holvis voor evolutionair en biomedisch onderzoek. Deze methode gebruikt vibratiestimuli en gratis software voor kosteneffectieve studies.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Wij danken alle leden van de Yoshizawa lab met inbegrip van N. Cetraro, N. Simon C. Valdez, C. Macapac, J. Choi, L. Lu, J. Nguyen, S. Podhorzer, H. Hernandes, J. Fong, J. Kato en I. Lord voor vis verzorging op de experimentele vis gebruikt in dit manuscript. Wij danken ook A. Keene lab leden met inbegrip van P. Mašek om te trainen mijn te monteren IR CCD-camera. Tot slot bedank we het Media Lab - College voor sociale wetenschappen - School of Communications aan de Universiteit van Hawaï Mānoa voor hun onschatbare hulp bij het maken van de video, vooral B. Smith, J. Lam en S. White. Dit werk werd gesteund door Hawaiian Gemeenschap Foundation (16CON-78919 en 18CON-90818) en nationaal instituut van gezondheid NIGMS (P20GM125508) geeft aan MY.

<ol><li>Keene, A. C., Yoshizawa, M., McGaugh, S. E. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aKeene%2C+AC+%22Biology+and+Evolution+of+the+Mexican+Cavefish.+Biology+and+Evolution+of+the+Mexican+Cavefish%22">Biology and Evolution of the Mexican Cavefish. Biology and Evolution of the Mexican Cavefish</a>. , Elsevier Inc. Amsterdam. (2015).</li>
<li>Mitchell, R. W., Russell, W. H., Elliott, W. R. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMitchell%2C+RW+%22Mexican+eyeless+characin+fishes%2C+genus+Astyanax%3A+Environment%2C+distribution%2C+and+evolution.Special+publications+the+museum+Texas+Tech+University%22">Mexican eyeless characin fishes, genus Astyanax: Environment, distribution, and evolution.Special publications the museum Texas Tech University</a>. (12), Texas Tech Press. Texas. (1977).</li>
<li>Wilkens, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolution+and+genetics+of+epigean+and+cave+Astyanax-fasciatus+%28Characidae%2C+Pisces%29+-+Support+for+the+neutral+mutation+theory%5BTitle%5D)+AND+%22Evolutionary+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolution and genetics of epigean and cave Astyanax-fasciatus (Characidae, Pisces) - Support for the neutral mutation theory.</a> Evolutionary Biology. 23, 271-367 (1988).</li>
<li>Fumey, J., Hinaux, H., Noirot, C., Thermes, C., Rétaux, S., Casane, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+for+late+Pleistocene+origin+of+Astyanax+mexicanus+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Evolutionary+Biology%22%5BJournal%5D)">Evidence for late Pleistocene origin of Astyanax mexicanus cavefish.</a> BMC Evolutionary Biology. 18 (1), 1-19 (2018).</li>
<li>Yoshizawa, M., Gorički, S., Soares, D., Jeffery, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolution+of+a+behavioral+shift+mediated+by+superficial+neuromasts+helps+cavefish+find+food+in+darkness%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolution of a behavioral shift mediated by superficial neuromasts helps cavefish find food in darkness.</a> Current Biology. 20 (18), 1631-1636 (2010).</li>
<li>Moran, D., Softley, R., Warrant, E. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Eyeless+Mexican+cavefish+save+energy+by+eliminating+the+circadian+rhythm+in+metabolism%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+One%22%5BJournal%5D)">Eyeless Mexican cavefish save energy by eliminating the circadian rhythm in metabolism.</a> PloS One. 9 (9), e107877(2014).</li>
<li>Moran, D., Softley, R., Warrant, E. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+energetic+cost+of+vision+and+the+evolution+of+eyeless+Mexican+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22Science+Advances%22%5BJournal%5D)">The energetic cost of vision and the evolution of eyeless Mexican cavefish.</a> Science Advances. 1 (8), e1500363(2015).</li>
<li>Yoshizawa, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Evolution+of+a+Series+of+Behavioral+Traits+is+associated+with+Autism-Risk+Genes+in+Cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Evolutionary+Biology%22%5BJournal%5D)">The Evolution of a Series of Behavioral Traits is associated with Autism-Risk Genes in Cavefish.</a> BMC Evolutionary Biology. 18 (1), 89(2018).</li>
<li>Riddle, M. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Insulin+resistance+in+cavefish+as+an+adaptation+to+a+nutrient-limited+environment%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Insulin resistance in cavefish as an adaptation to a nutrient-limited environment.</a> Nature. 555 (7698), 647-651 (2018).</li>
<li>Protas, M. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetic+analysis+of+cavefish+reveals+molecular+convergence+in+the+evolution+of+albinism%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Genetics%22%5BJournal%5D)">Genetic analysis of cavefish reveals molecular convergence in the evolution of albinism.</a> Nature Genetics. 38 (1), 107-111 (2006).</li>
<li>Yoshizawa, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Distinct+genetic+architecture+underlies+the+emergence+of+sleep+loss+and+prey-seeking+behavior+in+the+Mexican+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Biology%22%5BJournal%5D)">Distinct genetic architecture underlies the emergence of sleep loss and prey-seeking behavior in the Mexican cavefish.</a> BMC Biology. 13 (1), 15(2015).</li>
<li>Duboué, E. R., Keene, A. C., Borowsky, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolutionary+convergence+on+sleep+loss+in+cavefish+populations%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolutionary convergence on sleep loss in cavefish populations.</a> Current Biology. 21 (8), 671-676 (2011).</li>
<li>Fernandes, V. F. L., Macaspac, C., Lu, L., Yoshizawa, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolution+of+the+developmental+plasticity+and+a+coupling+between+left+mechanosensory+neuromasts+and+an+adaptive+foraging+behavior%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolution of the developmental plasticity and a coupling between left mechanosensory neuromasts and an adaptive foraging behavior.</a> Developmental Biology. 441 (2), 262-271 (2018).</li>
<li>Pérez-Escudero, A., Vicente-Page, J., Hinz, R. C., Arganda, S., de Polavieja, G. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((idTracker%3A+tracking+individuals+in+a+group+by+automatic+identification+of+unmarked+animals%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">idTracker: tracking individuals in a group by automatic identification of unmarked animals.</a> Nature Methods. 11, 743(2014).</li>
<li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6 (6), 451-457 (2009).</li>
<li>Yoshizawa, M., Jeffery, W. R., Van Netten, S. M., McHenry, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+sensitivity+of+lateral+line+receptors+and+their+role+in+the+behavior+of+Mexican+blind+cavefish+%28Astyanax+mexicanus%29%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Experimental+Biology%22%5BJournal%5D)">The sensitivity of lateral line receptors and their role in the behavior of Mexican blind cavefish (Astyanax mexicanus).</a> Journal of Experimental Biology. 217 (6), (2014).</li>
<li>Lee, A. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aLee%2C+A+%22Virtualdub%22">Virtualdub</a>. , http://www.virtualdub.org/ (2014).</li>
<li>Schneider, C. A., Rasband, W. S., Eliceiri, K. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((NIH+Image+to+ImageJ%3A+25+years+of+image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis.</a> Nature Methods. 9 (7), 671-675 (2012).</li>
<li>Cavallari, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+blind+circadian+clock+in+cavefish+reveals+that+opsins+mediate+peripheral+clock+photoreception%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biology%22%5BJournal%5D)">A blind circadian clock in cavefish reveals that opsins mediate peripheral clock photoreception.</a> PLoS Biology. 9 (9), e1001142(2011).</li>
<li>Swimmer, B., Lang, H. H. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSwimmer%2C+B+%22Surface+Wave+Discrimination+between+Prey+and+Nonprey+by+the+Back+Swimmer+Notonecta+glauca+L.+%28Hemiptera+%2C+Heteroptera+%29%22">Surface Wave Discrimination between Prey and Nonprey by the Back Swimmer Notonecta glauca L. (Hemiptera , Heteroptera )</a>. 6 (3), Springer Stable. https://www.jstor.org/stable/4599284 233-246 (1980).</li>
<li>Montgomery, J. C., Macdonald, J. A. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMontgomery%2C+JC+%22Sensory+Tuning+of+Lateral+Line+Receptors+in+Antarctic+Fish+to+the+Movements+of+Planktonic+Prey%22">Sensory Tuning of Lateral Line Receptors in Antarctic Fish to the Movements of Planktonic Prey</a>. 235 (4785), American Association for the Advancement of Science Stable. https://www.jstor.org/stable/1698962 195-196 (1987).</li>
<li>Prober, D. A., Rihel, J., Onah, A. A., Sung, R. J., Schier, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hypocretin%2Forexin+overexpression+induces+an+insomnia-like+phenotype+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Neuroscience%22%5BJournal%5D)">Hypocretin/orexin overexpression induces an insomnia-like phenotype in zebrafish.</a> The Journal of Neuroscience. 26 (51), 13400-13410 (2006).</li>
<li>Zhdanova, I. V., Wang, S. Y., Leclair, O. U., Danilova, N. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Melatonin+promotes+sleep-like+state+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Brain+Research%22%5BJournal%5D)">Melatonin promotes sleep-like state in zebrafish.</a> Brain Research. 903 (1-2), 263-268 (2001).</li>
<li>Nussbaum-Krammer, C. I., Neto, M. F., Brielmann, R. M., Pedersen, J. S., Morimoto, R. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Investigating+the+Spreading+and+Toxicity+of+Prion-like+Proteins+Using+the+Metazoan+Model+Organism+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Investigating the Spreading and Toxicity of Prion-like Proteins Using the Metazoan Model Organism C. elegans.</a> Journal of Visualized Experiments. (95), e52321(2015).</li>
<li>Rasband, W. S. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aRasband%2C+WS+%22Object+Tracker%22">Object Tracker</a>. , https://imagej.nih.gov/ij/plugins/tracker.html (2000).</li>
<li>Ferreira, T., Rasband, W. Create Shortcuts. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aFerreira%2C+T+%22ImageJ+User+Guide%22">ImageJ User Guide</a>. , https://imagej.nih.gov/ij/docs/guide/146-31.html#sub:Create-Shortcuts... (2012).</li>
<li>Lochmatter, T., Roduit, P., Cianci, C., Correll, N., Jacot, J., Martinoli, A. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aLochmatter%2C+T+%22SwisTrack%22">SwisTrack</a>. , https://en.wikibooks.org/wiki/SwisTrack (2008).</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

Deze voorgestelde methoden zijn gemakkelijk te bereiken maar kunnen ingewikkeld om uit te voeren vanwege de aard van zijn freeware oorsprong. Daarom is het sterk aanbevolen om het proces testen en analyses voor een werkelijke experimenten uit te voeren.
Het tarief van gegevens generatie kunnen snelle zodra het experimentele en analytische kader worden vastgesteld. Zodra vastgesteld, is het mogelijk record twee vis in 7 min voor de VAB-assay, 30 vis in 24 uur voor de activiteit/slaap assay en é...

De Mexicaanse tetra, Astyanax mexicanus (Teleostei: Characidae), is uniek onder de vissen voor het feit dat twee radicaal verschillende alternatieve morphs - een morph slechtzienden, oppervlakte-woning en een blinde, grot-woning morph bestaat uit verschillende afzonderlijke bevolking:1. Hoewel verschillend in de morfologie en fysiologie, zijn ze nog steeds interfertile2,3. Deze interfertile morphs lijken te snel (~ 20.000 jaar)4, waardoor ze een ideale modelsysteem voor de studie van snelle aanpassing geëvolueerd. Cavefish is bekend dat er een suite van uiteenlopende morfologische en gedrags eigenschappen met inbegrip van grotere dichtheid van de smaakpapillen, toegenomen aantal mechanosensors, foerageren gedrag afgestemd op een bepaalde frequentie van een trillend stimulus, hyperactiviteit, en slapeloosheid. Veel van deze problemen waarschijnlijk geëvolueerd gelijktijdig, waarvan sommige hebben gesuggereerd gunstig in de duisternis van de grotten voor foerageren5 en behoud van energie in de donkere en voedsel-sparse omgevingen6,7.
In vele evolutionaire modelsystemen is het moeilijk te verwerven van geïntegreerde kennis over hoe dieren morfologie en gedrag veranderen in antwoord op het milieu, omdat de meeste soorten zijn verdeeld over een continu verloop in complexe omgevingen. Het schril contrast tussen de grot en de oppervlakte morph Astyanax die geëvolueerd in zeer uiteenlopende omgevingen afgebakend door een scherpe ecotone heeft echter geleid tot Astyanax ontpopt zich als een uitstekend model om dierlijke evolutie te begrijpen. Dit maakt het mogelijk maken gemakkelijker genen en ontwikkelings processen met adaptieve karaktertrekken en selectie in de omgeving. Bovendien heeft de recente biomedisch onderzoek van deze eigenschappen in Astyanax aangetoond dat deze eigenschappen kunnen parallel menselijke symptomen8,9,10. Bijvoorbeeld zijn verlies van socialiteit en slaap, en aanwinst van hyperactiviteit, repetitief gedrag en cortisol niveau vergelijkbaar met wat is waargenomen bij de mens met autisme spectrum stoornis8.
Om aan te pakken de complexe Co-evolutie van veel gedragingen en morfologische kenmerken, is het voordelig om velen van hen wil onderliggende genetische en moleculaire pathways assay. Hierin gepresenteerd zijn methoden voor het karakteriseren van de mate van grot-type gedrags fenotypes van oppervlak, grot, en hybride morphs van Astyanax. De focal gedrag geanalyseerd om te karakteriseren fenotype zijn grot-aangepast foerageren gedrag (attractie trillingsgedrag, genoemd voortaan VAB) en hyperactiviteit/slaap duur11,12. Ook gepresenteerd, is een imaging methode voor het zintuigstelsel VAB13zijn gekoppeld. Onlangs, zijn veel open-source tracking software voor het uitvoeren van gedrags assays beschikbaar14,15geworden. Deze werken heel goed voor korte video's, op minder dan 10 minuten lang. Nochtans, wordt het problematisch als de video langer vanwege de tijd van de intensief berekening/bijhouden is. Staat verkrijgbare software kunnen duur zijn. De methoden gepresenteerd hoofdzakelijk gebruik van freeware en daarom worden beschouwd als kosteneffectieve en high-throughput methoden. Ook inbegrepen zijn representatieve resultaten op basis van deze methoden.

<table><tbody><tr><td>4-Di-1-ASP (4-(4-(dimethylaminostyryl)-1-methylpyridinium iodide)</td><td>MilliporeSigma</td><td>D3418</td><td></td></tr><tr><td>880 nm wave length black light</td><td>Advanced Illumination</td><td>BL41192-880</td><td></td></tr><tr><td>avfs</td><td>freeware</td><td>Versie 1.0.0.6</td><td>http://turtlewar.org/avfs/</td></tr><tr><td>Avisynth</td><td>freeware</td><td>Versie 2.6.0</td><td>http://avisynth.nl/index.php/Main_Page</td></tr><tr><td>Cygwin</td><td>freeware</td><td>Versie 2.11.0</td><td>https://www.cygwin.com/</td></tr><tr><td>Cilindrische testkamer (Pyrex 325 ml glazen schaal)</td><td>Corning</td><td>3140-100</td><td>10 cm diameter 5 cm hoog</td></tr><tr><td>Ethovision XT</td><td>Noldus Information&nbsp; Technology, Wageningen, Nederland</td><td>Versie 14</td><td>https://www.noldus.com/animal-behavior-research/products/ethovision-xt</td></tr><tr><td>Vis Aquarium Cilinder Zachte Spons Steen Waterfilter, Zwart</td><td>Jardin (via Amazon.com)</td><td>NA</td><td>Sponzenfilter voor slaap/hyperactiviteitsrecordersysteem</td></tr><tr><td>Grade A pekelgarnaal eieren</td><td>Pekelgarnaal direct</td><td>BSEA16Z</td><td></td></tr><tr><td>ImageJ</td><td>freeware</td><td>Versie 1.52e</td><td>https://imagej.nih.gov/ij/</td></tr><tr><td>macro 1.8/12.5-75mm C-mount zoomlens</td><td>Toyo</td><td>NA</td><td>Aansluiten op USB webcam door c-mount te gebruiken, die is geprint in 3-D printer</td></tr><tr><td>Neutrale regulator</td><td>Seachem</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>Optische gegoten kunststof IR lange-doorlaatfilter</td><td>Edmund optics</td><td>43-948</td><td>Snijden in een klein stuk om in de CCD van USB webcam te passen</td></tr><tr><td>pfmap</td><td>freeware</td><td>Build 178</td><td>http://pismotec.com/download/ (bij &ldquo;Download Archive&rdquo; link onderaan)</td></tr><tr><td>Reef Crystals Reef Zout</td><td>Instant Ocean</td><td>RC15-10</td><td></td></tr><tr><td>SwisTrack</td><td>freeware</td><td>Versie 4</td><td>https://en.wikibooks.org/wiki/SwisTrack</td></tr><tr><td>USB webcam (LifeCam Studio 1080p HD Webcam)</td><td>Microsoft</td><td>Q2F-00013</td><td>Snijden 2-2,5 cm van de voorkant</td></tr><tr><td>WinAutomation</td><td>freeware</td><td>Versie 8</td><td>https://www.winautomation.com/ (gratis standalone app voor deze procedure)</td></tr><tr><td>Windows besturingssysteem</td><td>Microsoft</td><td>7, 8 of 10</td><td>https://www.microsoft.com/en-us/windows</td></tr><tr><td>x264vfw</td><td>freeware</td><td>NA</td><td>https://sourceforge.net/projects/x264vfw/</td></tr></tbody></table>

gedrags tracking en neuromast beeldvorming van mexicaanse cavefish

Behavioral Tracking and Neuromast Imaging of Mexican Cavefish

Grot-woning dieren geëvolueerd uit een reeks van morfologische en gedrags eigenschappen aan te passen aan hun permanent donker en voedsel-sparse omgevingen. Onder deze eigenschappen is foerageren gedrag een van de nuttige windows in functionele voordelen van gedrags trait evolutie. Hierin gepresenteerd zijn bijgewerkte methoden voor het analyseren van de attractie trillingsgedrag (VAB: een adaptieve foerageren gedrag) en imaging van bijbehorende mechanosensors van grot-aangepast tetra, Astyanax mexicanus. Daarnaast zijn methoden voor high-throughput bijhouden van een aantal extra cavefish gedrag met inbegrip van hyperactiviteit en slaap-verlies gepresenteerd. Cavefish Toon ook asocialiteit, repetitief gedrag en hogere angst. Daarom, cavefish dienen als een dierlijk model voor geëvolueerd gedrag. Deze methoden maken gebruik van vrije-software en op maat gemaakte scripts die kunnen worden toegepast op andere soorten gedrag. Deze methoden praktisch en kostenbesparend alternatieven bieden voor verkrijgbare opsporingssoftware.

De hier vermelde resultaten zijn representatieve voorbeelden van wat kan worden verkregen met de gepresenteerde methoden. Resultaten kunnen daarom afwijken iets van degene die hier gepresenteerd voor zowel cavefish en oppervlakte vissen afhankelijk van de experimentele omstandigheden.
Attractie trillingsgedrag
Representatieve resultaten voor VAB kunnen...

Hier presenteren we methoden voor high-throughput onderzoek naar een reeks van de Mexicaanse cavefish gedrag en vitale kleuring van een mechanosensory systeem. Deze methoden maken gebruik van vrije-software en op maat gemaakte scripts, bieden een praktische en kosteneffectieve methode voor de studie van gedrag.

Gedrags Tracking en Neuromast beeldvorming van Mexicaanse Cavefish

Cave-dwelling animals have evolved a series of morphological and behavioral traits to adapt to their perpetually dark and food-sparse environments. Among ...

Cavefish is het verhogen van als een fantastische dierlijke muurschildering om evolutie en biomedische processen te begrijpen. We zijn nu bezig met biomedisch onderzoek met behulp van deze eigenschap als een parallel van een menselijke symptomen. Hier tonen we de batterij van de gedragstest en het analysesysteem dat kan worden gebruikt voor zowel evolutionaire als biomedische studies.Om trillingen te testen trekt en gedrag, een trillende glazen staaf wordt ingevoegd in een glazen kom met een vis in het donker. Vissen worden vier dagen voor de test in geconditioneerd water geacclimatiseren met een 12, 12 lichte, donkere cyclus. De dag voorafgaand aan de dag van de test na drie dagen acclimatiseren, vervang water in de testkamer door vers geconditioneerd water.Op de dag van de test worden vissen verstoken van voedsel tot nadat de test is voltooid, omdat stopzetting hun reactie op trillingen zal veranderen. Bereid trillingsgevende apparaten voor door af te stemmen op 40 Hertz. Stel de juiste opnameparameters, voorraadvoorwaarden en doelbestand in.Plaats de testcilinder op het opnamepodium, verlicht met infrarood achtergrondverlichting in een donkere kamer, en laat vissen drie minuten

behavioral-tracking-and-neuromast-imaging-of-mexican-cavefish

Research

JoVE Journal

Behavior

Gedrag

We beschrijven een set van technieken voor het bestuderen van spontaan gedrag van vrij zwemmen zwak elektrische vissen over een langere periode van tijd, door synchroon meten van elektrische orgel ontlading timing van het dier, lichaamshouding en houding zowel nauwkeurig en betrouwbaar in een speciaal ontworpen aquarium tank in een zintuiglijke isolatiekamer.

Langdurige Behavioral Tracking van Vrij Zwemmen Zwak Electric Fish

In dit protocol, we laten zien hoe fokken Astyanax mexicanus volwassenen, verhogen van de larven en geheel-mount immunohistochemistry op post larvale vissen te vergelijken van de fenotypen van oppervlak en grot morphotypes uitvoeren.

De Mexicaanse Tetra Astyanax mexicanus in te zamelen voor de analyse van de fenotypen van de Post-larval en geheel-mount Immunohistochemistry

We beschrijven benaderingen voor het manipuleren van genen in het evolutionair modelsysteem Astyanax mexicanus. Drie verschillende technieken worden beschreven: Tol2-gemedieerde Transgenese, gerichte manipulatie van het genoom met behulp van CRISPR/Cas9 en knockdown van meningsuiting met behulp van morpholinos. Deze hulpmiddelen moeten vergemakkelijken het directe onderzoek van genen die ten grondslag liggen aan de variatie tussen oppervlak - en grot-woning vormen.

Manipulatie van de genfunctie in Mexicaanse Cavefish

Visualisatie van de expressie van genen in embryonale Astyanax cavefish kunnen dit protocol. Deze aanpak is ontwikkeld met als doel het maximaliseren van gen expressie signaal, terwijl het minimaliseren van aspecifieke achtergrondkleuring.

Wholemount In Situ hybridisatie voor Astyanax embryo 's

Dit protocol detailleert de methodologie voor het kwantificeren van locomotor gedrag en slaap in de Mexicaanse cavefish. Eerdere analyses worden verlengd voor het meten van deze gedragingen in sociaal-gehuisvest vis. Dit systeem kan algemeen worden toegepast om te bestuderen van slaap en activiteit in andere vissoorten.

Automatische metingen van slaap en motorische activiteit in Mexicaanse Cavefish

In vitro fertilisatie is een veelgebruikte techniek met een verscheidenheid aan model organismen om labpopulaties te behouden en gesynchroniseerde embryo's te produceren voor downstreamtoepassingen. Hier presenteren we een protocol dat deze techniek implementeert voor verschillende populaties van de Mexicaanse Tetra vissen, Astyanax mexicanus.

Gamete collectie en in vitro fertilisatie van Astyanax mexicanus

Dit artikel beschrijft de basis laboratoriumomstandigheden en protocollen voor een incrementeel temperatuurregime om maximale spawning te stimuleren in de Mexicaanse tetra Astyanax mexicanus, een opkomend model voor ontwikkelings- en evolutionaire studies.

Incrementele temperatuurveranderingen voor maximale fokkerij en spawning in Astyanax mexicanus

Langdurige en uitgebreide monitoring van muizen in een home-kooi-omgeving biedt een dieper begrip van afwijkend gedrag in muismodellen van hersenziekten. Dit artikel beschrijft de Integrated Behavioral Station (INBEST) als de belangrijkste component van de hedendaagse gedragsanalyse.

Behavioral Fenotypering van Muriene Disease Modellen met de Integrated Behavioral Station (INBEST)

Dit protocol is bedoeld om onderzoekers in staat te stellen experimenten uit te voeren die zijn ontworpen om deze aspecten van verslaving te testen met behulp van de geconditioneerde plaatsvoorkeur en het gedragsmatige sensitisatie-assays van de locomotor.

Evaluatie van cocaïne geïnduceerde sensitisatie en geconditioneerd Place Preference in Muizen

Een rat versie van het menselijk Psychomotorische Waakzaamheid Test (PVT) wordt beschreven dat de aspecten van de aandacht vergelijkbaar met die gemeten met de menselijke PVT, met inbegrip van aspecten van de menselijke waakzaamheid zoals nauwkeurigheid prestaties, snelheid van de motor, voorbarig reageren, en vervalt in de aandacht meet.

De knaagdieren Psychomotorische Waakzaamheid Test (rPVT): Een methode voor het beoordelen van Neurobehavioral bij ratten en muizen

Leer gedragsanalyse en neuromast-beeldvorming van Mexicaanse holvis voor evolutionair en biomedisch onderzoek. Deze methode gebruikt vibratiestimuli en gratis software voor kosteneffectieve studies.

Gedrags Tracking en Neuromast beeldvorming van Mexicaanse Cavefish

Meer video's verkennen