Name: Gebruik van Kristalviolet om visueel cytopathisch effectgebaseerd lezen voor virale titratie te verbeteren met behulp van TCID50-testen (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2022-02-12T14:45:00.000+00:00
Duration: 4 min 6 s
Description: Leer een nauwkeurige methode voor virale titratie met kristalvioletkleuring in een 96-well plaat. Dit protocol verbetert de betrouwbaarheid van viruskwantificering voor virologisch onderzoek.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Auteurs willen graag Dr. Frank Scholle bedanken voor zijn nuttige opmerkingen in het manuscript, Chloe Mariant voor haar hulp bij de microscopiebeelden en Teresa M. Tiedge voor haar behulpzame Engelse revisie.

1. Titratieprotocol
OPMERKING: Gebruik een cytopathisch virus dat hechtende cellen infecteert. Voor deze demonstratie werden Influenza A Virus (IAV) van varkensoorsprong (A/California/07/2009/(H1N1)) en Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus (PRRSV) Type 2, stam NC 1-7-4 gebruikt.
<ol><li>Titreer deze virussen in 96 putplaten gedurende 7 dagen in een bioveiligheidskast in een Biosafety Level 2 (BSL-2) laboratorium.<ol>
<li>Om deze titraties uit te voeren, zaait u 96 putplaten met de vereiste cellijn. Gebruik voor PRRSV de MA-104-cellijn en voor IAV mdck-cellijn. Gebruik voor de celkweek DMEM-medium aangevuld met 10% FBS, L-Glutamine en Penicilline-Streptomycine en laat de cellen samenvloeien.</li>
		<li>Was de cellen vóór infectie met 200 μL PBS.</li>
		<li>Verdun de virusvoorraden met behulp van 10-voudige verdunningenreeksen door 900 μL media en 100 μL virus te mengen. Zorg ervoor dat u de buis goed vortext om een goede menging van het medium en het virus te garanderen en om verdunningsfouten te voorkomen.</li>
		<li>Markeer de lay-out van de plaat op het deksel. Was de putjes met 1x fosfaat zoutoplossing buffer (PBS). Voeg 50 μL van het entmateriaal toe in de overeenkomstige putjes volgens eerder beschreven titratiemethoden2,3.</li>
		<li>Incubeer bij 37 °C in een 5% CO2-incubator gedurende 7 dagen.</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. Cytopathische effect (CPE) beoordeling via microscopie
<ol><li>Was na de incubatie van 7 dagen alle putjes tweemaal met 200 μL 1x PBS.</li>
	<li>Beoordeel alle putten van de plaat onder een lichtmicroscoop om CPE visueel te detecteren. In het geval van zowel PRRSV als IAV bestaat hun CPE uit celdood en daaropvolgende loslating van de plaat, wat leidt tot monolaagverstoring. Andere virussen kunnen echter verschillende soorten CPE vertonen.</li>
</ol>3. Kleuringsprotocol
OPMERKING: Cytopathisch effect (CPE) werd beoordeeld via kristalviolette kleuring.
<ol><li>Was na de incubatie van 7 dagen alle putjes tweemaal met 200 μL 1x PBS.</li>
	<li>Fixeer de cellen door 50 μL/putje van 4% paraformaldehyde (PFA) toe te voegen in 1x PBS en incubaleer gedurende 15 minuten bij kamertemperatuur (RT).</li>
	<li>Was de cellen na incubatie tweemaal met 200 μL 1x PBS. Voeg vervolgens 50 μL /put kristalviolet verdund tot 4% toe in water en incubeer gedurende 5 minuten bij RT. OPMERKING: Kristalviolette chemische kleurt de cellen die op het moment van fixatie aan de plaat blijven vastzitten, waardoor de delen van de put waar de cellen loskomen als onbevlekt blijven.</li>
	<li>Zuig ten slotte kristalviolet uit de putten en laat de platen eventueel 2-5 minuten aan de lucht drogen bij RT of was de plaat met 200 μL water om overtollige vlekken te verwijderen voorafgaand aan visualisatie.</li>
	<li>Gebruik eerder beschreven methoden om de titer wiskundig te berekenen. Hier werden karberformule en muench-formule toegepast voor respectievelijk PRRSV en IAV2,3. Details van deze vergelijkingen worden gepresenteerd in de sectie representatieve resultaten.</li>
</ol>4. Immunocytochemische (ICC) etikettering
OPMERKING: Immunocytochemische etikettering voor beide virussen werd uitgevoerd volgens eerder beschreven methoden9,10,11.
<ol><li>Na de 7-daagse incubatie van de titratie, fixeert u de cellen met behulp van PFA zoals beschreven in stap 3.2.</li>
	<li>Was de platen met een oplossing bestaande uit 100 ml 1 M Tris-hydrochloride, 1 g saponine en 8,5 g NaCl in 900 ml H2O. Voltooi vervolgens twee extra wasbeurten met een mengsel van 1x PBS en 5% Foetaal Runderserum (FBS) en incubeer met die Tris-Saponin-NaCl-oplossing bij kamertemperatuur (RT) gedurende 20 minuten.</li>
	<li>Incubeer alle putjes met het primaire antilichaam gedurende 2 uur bij RT. OPMERKING: Het volume primaire antilichamen voor elk virus was 100 μL en werd bereid met een verdunning van 1:300 van 2% FBS in 1x PBS.</li>
	<li>Was de cellen tweemaal met de Tris-, Saponine- en NaCl-oplossing die in stap 4.2 is bereid.</li>
	<li>Incubeer alle putjes met het secundaire antilichaam gedurende 1 uur bij RT. OPMERKING: Het volume secundair antilichaam was 100 μL en werd bereid met een 1:250 verdunning van 2% FBS in 1x PBS.</li>
	<li>Was de cellen met de Verdunning van Tris, Saponine en NaCl zoals beschreven in stap 4.2.</li>
	<li>Zuig de vorige verdunning op en incubeer de platen met 200 μL/put aminoethylcarbide (AEC)-oplossing bij een eindverdunning van 1:50 in water volgens de aanwijzingen van de fabrikant gedurende 30 minuten bij RT.</li>
	<li>Gooi na incubatie de AEC-oplossing weg en voeg 100 μL/putje van 1x PBS toe voor beeldvorming via microscopie.</li>
	<li>Leid de titer wiskundig af zoals beschreven in stap 3.5.</li>
</ol>

<ol><li>Kärber, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Contribution+to+the+collective+treatment+of+pharmacological+series+experiments%5BTitle%5D)+AND+%22Naunyn-Schmiedeberg%27s+Archive+for+Experimental+Pathology+and+Pharmacology%22%5BJournal%5D)">Contribution to the collective treatment of pharmacological series experiments.</a> Naunyn-Schmiedeberg's Archive for Experimental Pathology and Pharmacology. 162 (4), 480-483 (1931).</li>
<li>Ramakrishnan, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Determination+of+50%25+endpoint+titer+using+a+simple+formula%5BTitle%5D)+AND+%22World+Journal+of+Virology%22%5BJournal%5D)">Determination of 50% endpoint titer using a simple formula.</a> World Journal of Virology. 5 (2), 85-86 (2016).</li>
<li>Reed, L. J., Muench, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+method+of+estimating+fifty+per+cent+endpoints%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Epidemiology%22%5BJournal%5D)">A simple method of estimating fifty per cent endpoints.</a> American Journal of Epidemiology. 27 (3), 493-497 (1938).</li>
<li>Spearman, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+method+of+right+and+wrong+cases+%28constant+stimuli%29+without+Gauss%27s+formulae%5BTitle%5D)+AND+%22British+Journal+of+Psychology%22%5BJournal%5D)">The method of right and wrong cases (constant stimuli) without Gauss's formulae.</a> British Journal of Psychology. 2 (3), 227(1908).</li>
<li>Darling, A. J., Boose, J. A., Spaltro, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Virus+assay+methods%3A+accuracy+and+validation%5BTitle%5D)+AND+%22Biologicals%22%5BJournal%5D)">Virus assay methods: accuracy and validation.</a> Biologicals. 26 (2), 105-110 (1998).</li>
<li>Kim, J., Chae, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comparison+of+virus+isolation%2C+polymerase+chain+reaction%2C+immunohistochemistry%2C+and+in+situ+hybridization+for+the+detection+of+porcine+circovirus+2+and+porcine+parvovirus+in+experimentally+and+naturally+coinfected+pigs%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Veterinary+Diagnostic+Investigation%22%5BJournal%5D)">A comparison of virus isolation, polymerase chain reaction, immunohistochemistry, and in situ hybridization for the detection of porcine circovirus 2 and porcine parvovirus in experimentally and naturally coinfected pigs.</a> Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. 16 (1), 45-50 (2004).</li>
<li>Suchman, E., Blair, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cytopathic+effects+of+viruses+protocols%5BTitle%5D)+AND+%22American+Society+of+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Cytopathic effects of viruses protocols.</a> American Society of Microbiology. , (2007).</li>
<li>Karakus, U., Crameri, M., Lanz, C., Yángüez, E. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aKarakus%2C+U+%22Influenza+Virus%22">Influenza Virus</a>. , Springer. 59-88 (2018).</li>
<li>Tingstedt, J. -E., Nielsen, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cellular+immune+responses+in+the+lungs+of+pigs+infected+in+utero+with+PRRSV%3A+an+immunohistochemical+study%5BTitle%5D)+AND+%22Viral+Immunology%22%5BJournal%5D)">Cellular immune responses in the lungs of pigs infected in utero with PRRSV: an immunohistochemical study.</a> Viral Immunology. 17 (4), 558-564 (2004).</li>
<li>Guarner, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Immunohistochemical+and+in+situ+hybridization+studies+of+influenza+A+virus+infection+in+human+lungs%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Clinical+Pathology%22%5BJournal%5D)">Immunohistochemical and in situ hybridization studies of influenza A virus infection in human lungs.</a> American Journal of Clinical Pathology. 114 (2), 227-233 (2000).</li>
<li>Nicholls, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+highly+pathogenic+influenza+and+pandemic+influenza+virus+in+formalin+fixed+tissues+by+immunohistochemical+methods%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Virological+Methods%22%5BJournal%5D)">Detection of highly pathogenic influenza and pandemic influenza virus in formalin fixed tissues by immunohistochemical methods.</a> Journal of Virological Methods. 179 (2), 409-413 (2012).</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te onthullen.

Virale titraties worden routinematig gebruikt in virologisch onderzoek, met PFU-detectie en TCID50-assays die het meest worden gebruikt1,2,3,4. Beide methoden zijn gebaseerd op de detectie van CPE in geïnfecteerde cellen, en hoewel ze visueel kunnen worden beoordeeld via microscopie, wordt een kleuring meestal toegepast om een objectiever resultaat te verkrijgen of zelfs de incubatieti...

Virale titratie via TCID50-test is een veelgebruikte techniek in onderzoek naar infectieziekten1. Hoewel variaties op de wiskunde achter deze methode in de loop van de tijd zijn voorgesteld1,2,3,4, zijn de momenteel toegepaste methoden voor infectiedetectie afhankelijk van visuele bevestiging door de aanwezigheid van cytopathisch effect (CPE) met behulp van microscopie5. Om CPE-visualisatie objectiever te bevestigen op TCID50-assays, is immunocytochemische (ICC) intracellulaire kleuring gericht op de eiwitten van het virus een van de meest gebruikte methoden6, omdat verschillende virussen verschillende vormen van CPE kunnen produceren. In ons geval zijn de celmorfologische veranderingen vergelijkbaar wanneer ze zijn geïnfecteerd met zowel influenza A-virus (IAV) als porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV), waarbij geïnfecteerde cellen worden afgerond en loskomen van de plaat. In het geval van PRRSV veroorzaakt het een CPE die bekend staat als "totale vernietiging", waarbij alle cellen uiteindelijk loskomen van de put. IAV daarentegen kan zowel totale vernietiging als een extra CPE presenteren die bekend staat als "subtotale vernietiging" waarbij een klein aantal cellen niet loskomt na infectie7. Deze techniek is echter tijdrovend om uit te voeren en vereist het gebruik van relatief dure reagentia. Het is belangrijk op te merken dat ICC cpe niet labelt, maar eerder het aantal cellen dat met succes door het virus is geïnfecteerd. Dit impliceert dat de cellen die aan het einde van de incubatie met succes zijn geïnfecteerd, als positief worden beschouwd, zelfs als de infectie nog geen CPE heeft veroorzaakt, en dus wordt een hoger percentage ICC-positieve cellen in vergelijking met CPE verwacht. Om die reden beschrijven we in deze studie een complementaire methode van visuele detectie van CPE in een TCID50-assay op basis van kristalviolet, een chemische stof met een positieve lading die zich hecht aan celmembranen en wordt gebruikt om aanhangende cellen te kleuren. Kristalviolet wordt vaak gebruikt in virologisch onderzoek om plaquevormende eenheden te meten, onder andere8.
In deze studie vergelijken we de gevoeligheid van niet-gekleurde microscopie CPE-detectie met kristalviolette kleuring en immunocytochemische kleuring op basis van virale eiwitherkenning, waarvan bekend is dat deze objectiever is vanwege de hoge gevoeligheid. Deze studie toont aan dat zowel kristalviolet als immunocytochemische kleuring nauwkeuriger zijn dan op visuele microscopie gebaseerde CPE-detectie en kan worden gebruikt om geïnfecteerde putten objectief te identificeren in een TCID50-titratie. Gezien hun vermogen om bijna identiek niveau van nauwkeurigheid te bereiken op de cytopathische virussen die in cellijnen zijn getest, wordt kristalviolet gepresenteerd als een snellere en meer betaalbare manier om virale titraties te bepalen op een TCID50-test. De voorgestelde methode met kristalvioletkleuring duurt een totale tijd van 40 minuten om uit te voeren, met 15 minuten voor paraformaldehyde (PFA) incubatie, 5 minuten voor kristalviolette incubatie en maximaal 15 minuten voor materiaalvoorbereiding, bufferwassingen en drogen. Het immunocytochemische protocol dat wordt toegepast voor vergelijking duurt een gemiddelde tijd van 4 h 30 min en werd uitgevoerd zoals eerder beschreven9,10. De voorgestelde methode is bedoeld om een voltooide virale titratie te helpen visualiseren. Infectie- en incubatietijden kunnen worden uitgevoerd met verschillende lay-outs, afhankelijk van het virus. Hier testten we twee RNA-virussen met cytopathisch effect op cellijnen.

<table><tbody><tr><td>96-well cell culture plates</td><td>Genesee</td><td>25-221</td><td>Helder, platte bodem</td></tr><tr><td>AEC-oplossing</td><td>Thermo Fisher</td><td>1122</td><td></td></tr><tr><td>Kristalviolet</td><td>Thermo Fisher</td><td>C581-25; C581-100</td><td></td></tr><tr><td>DMEM</td><td>Corning</td><td>10-017-CV</td><td></td></tr><tr><td>Foetaal runder serum</td><td>BioWest</td><td>S1480</td><td></td></tr><tr><td>Paraformaldehyde</td><td>Thermo Fisher</td><td>J19943</td><td></td></tr><tr><td>Primair influenza antilichaam</td><td>Bioss</td><td>BS-0344R</td><td></td></tr><tr><td>Primair PRRSV antilichaam</td><td>Bioss</td><td>BS-10043R</td><td></td></tr><tr><td>Saponine</td><td>Thermo Scientific</td><td>AAA1882014</td><td></td></tr><tr><td>Secundair antilichaam</td><td>Invitrogen</td><td>31460</td><td></td></tr><tr><td>Tris Hydrochloride</td><td>Thermo Scientific</td><td>AM9856</td><td></td></tr></tbody></table>

gebruik van kristalviolet om visueel cytopathisch effectgebaseerd lezen voor virale titratie te verbeteren met behulp van tcid50-testen

Use of Crystal Violet to Improve Visual Cytopathic Effect-based Reading for Viral Titration using TCID50 Assays

Virale titratie is een belangrijke test voor virologisch onderzoek. De detectie van cytopathisch effect (CPE) via TCID50-assays en plaquevormende eenheden (PFU) -assays zijn de twee belangrijkste methoden om de titer van een virusvoorraad te berekenen en zijn vaak gebaseerd op microscopiedetectie of celkleuring voor visualisatie. In het geval van de TCID50-test is objectieve visualisatie gewoonlijk gebaseerd op immunocytochemische (ICC) kleuring van intracellulair virus om titers te berekenen in combinatie met visuele CPE-detectie via microscopie. ICC-kleuring is echter kostbaar en tijdrovend. In deze studie vergeleken we visuele CPE-observatie via microscopie, ICC-kleuring en kristalvioletkleuring om de titers van twee CPE-vormende virussen te bepalen, Influenza A-virus (IAV) van varkensoorsprong en Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome-virus (PRRSV). We laten zien dat zowel kristalviolet- als ICC-kleuring nauwkeuriger zijn dan visuele CPE-detectie, met bijna identieke precisieniveaus op zowel IAV als PRRSV. Om deze reden presenteren we hier kristalvioletkleuring als een snellere en meer betaalbare manier om virale titraties te bepalen op een TCID50-test voor CPE-vormende virussen getitreerd in cellijnen.

De vergelijkingen die worden gebruikt voor het wiskundig berekenen van de titer werden eerder beschreven2,3.
Kortom, voor PRRSV passen we de Karber-methode toe:
Titer (TCID50) = 10 T + 1,3 waarbij:
<img alt="Equation 1" src="/files/ftp_upload/63063/63063eq01.jpg">
In deze formule d = negatief logboek van de laatste verdunning met volledige po...

Dit protocol toont een nauwkeurige en objectieve benadering om virale titraties te visualiseren met behulp van kristalviolet, door het te vergelijken met optische microscopie en immunocytochemische kleuring.

Gebruik van Kristalviolet om visueel cytopathisch effectgebaseerd lezen voor virale titratie te verbeteren met behulp van TCID50-testen

Viral titration is a key assay for virology research. The detection of cytopathic effect (CPE) via TCID50 assays and plaque-forming units (PFU) assays are ...

Het doel van dit protocol is om een virusvoorraadtitratie te produceren en deze te visualiseren met behulp van kristalvioletkleuring. Om dat te doen, zal een algemene virale titratie worden aangetoond, gevolgd door de kleuring. Deze titratie wordt uitgevoerd in een 96-well plaat gedurende een periode van zeven dagen in een bioveiligheidskast binnen een bioveiligheidsniveau 2 laboratorium.Om dit te doen, zal een 96-well plaat van de gewenste cellijn worden gezaaid met behulp van de overeenkomstige media en laten groeien tot confluent. De virusvoorraad wordt verdund met behulp van tienvoudige verdunningen, door 900 microliter media en 100 microliter virus te mengen, of de bijbehorende verdunning. Zorg ervoor dat u elke buis vortext om een goede menging van de media en het virus te garanderen en fouten in de verdunningen te voorkomen.Schrijf de lay-out van uw bord in het lood en elke verdunning om te helpen tijdens het infectieproces. Vóór infectie, wassen met 200 microliter PBS. Voeg 50 microliter van uw entmateriaal toe in de bijbehorende putjes.Incubeer vervolgens zeven dagen bij 37 graden celsius in een 5% CO2-incubator. Na de incubatie van zeven dagen, wassen met 200 microliter PBS. Fixeer de cellen door 50 microliter per put PFA toe te voegen bij 4% in PBS en incubaleer gedurende 15 minuten bij kamertemperatuur.Was de cellen na de incubatie nogmaals tweemaal met 200 microliter PBS voorafgaand aan de toevoeging van 50 microliter per put kristalviolet in water en incubeer gedurende vijf minuten bij kamertemperatuur. Zuig ten slotte kristalviolet uit de putten en laat de platen optioneel twee tot vijf minuten aan de lucht drogen bij kamertemperatuur of was het met 200 microliter water om overmatige vlekken te verwijderen voordat u ze visualiseert. Als gevolg hiervan zullen negatieve cellen na het opnieuw kleuren worden gekleurd.Positieve putten zullen worden opgeruimd. Deze informatie wordt gebruikt in een van de twee beschreven formules om uw uiteindelijke virale titer te berekenen. Toen de titer die met elke methode werd verkregen, werd vergeleken, bleek dat in de monocytochemie kleuring in sommige gevallen extra positieve putten kon detecteren in vergelijking met kristalviolet, en dat beide kleuringsmethoden ook meer positieve putten konden detecteren dan visuele evaluatie via microscopie.

use-crystal-violet-to-improve-visual-cytopathic-effect-based-reading

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Immunologie en Infectie

Te maken lentivirussen, zijn DNA-vectoren getransfecteerd in humane 293 cellen. Na de oogst en het concentreren van de supernatant, is virustiter bepaald door fluorescentie expressie met een flowcytometer.

Lentivirus Productie

De test beschrijft een snelle wijze te vroeg biofilmvorming in bacteriën en schimmels te meten. Deze methode maakt gebruik van een microtiterplaat als substraat voor microbiële biofilm en de vorming van biofilm wordt gevisualiseerd met behulp van kristalviolet stam. De test geeft zowel een kwalitatieve of kwantitatieve test voor de vroege biofilmvorming.

Microtiter Dish biofilm vorming Assay

In this video, we demonstrate a cell viability assay using a crystal violet staining procedure for chemotherapeutic drug-resistant cancer cells.

Crystal Violet Staining: A Technique to Visualize Drug-Resistant Cancer Cells Using Colony Formation Assays

Deze methode beschrijft het gebruik van klikchemie op veranderingen in gastheercel transcriptie meten na infectie met het Rift Valley fever virus (RVFV) stam MP-12. De resultaten kunnen worden gevisualiseerd kwalitatief via fluorescentie microscopie of verkregen kwantitatief via flowcytometrie. Deze methode kan worden aangepast voor gebruik met andere virussen.

Met Click Chemie aan het effect van de virale infectie Meet op Host-cel RNA Synthese

Drie assays, zoals de cytopathische effect (CPE) gebaseerde bepaling, dosis-respons assay en tijd-van-toevoeging (ToA) assay ontwikkeld, geoptimaliseerd, gevalideerd en toegepast op nieuwe antivirale middelen tegen Bluetongue virus (BTV) identificeren alsmede zoals het bepalen van de mogelijke mechanisme-van-actie (MoA) voor nieuw geïdentificeerde antivirale middelen.

Testsystemen voor de identificatie van nieuwe antivirale middelen tegen Bluetongue virus

Plaque-assays zijn de gouden standaard voor virale kwantificering, waarbij overdekken met gevangenisoverlagen op hostcellulaire monolagen worden gebruikt om virale titers te bepalen. Hoewel traditioneel verschillende semi-solide overlagen zijn gebruikt, tonen we hier plaque-technieken die semi-solide overlagen vergelijken met een nieuwe vloeibare microkristallijne cellulose onder verschillende families van virussen.

Virale Concentratie Bepaling Door Plaque Testen: met behulp van traditionele en Novel Overlay System

Beschrijven we een methode voor het genereren van en sturen genetisch gemodificeerde respiratoir syncytieel virussen (RSVs) en een geoptimaliseerde plaque assay voor RSVs. We illustreren dit protocol door het creëren van twee recombinante virussen die respectievelijk toestaan kwantificering van RSV replicatie en live analyse van RSV opneming organen en integratie-organen-geassocieerde korrels dynamiek.

Generatie, versterking en titratie van recombinante respiratoir syncytieel virussen

Het doel van het protocol is het illustreren van de verschillende assays met betrekking tot virale vermelding die kan worden gebruikt om kandidaat-virale invoer remmers te identificeren.

Gebruik van virale vermelding testen en moleculaire docking analyse voor de identificatie van antivirale kandidaten tegen Coxsackievirus A16

Het huidige protocol beschrijft de verspreiding van het Zika-virus (ZIKV) in niercellen van Vero Afrikaanse groene apen en de kwantificering van ZIKV met behulp van celgebaseerde colorimetrische immunodetectiemethoden in formaten met 24 wells en 96 wells (hoge doorvoer).

Virusvoortplanting en celgebaseerde colorimetrische kwantificering

De hier gerapporteerde TCID50-assay maakt gebruik van labelvrije realtime impedantiemetingen en de Virologiemodule van het systeem om objectief virus-geïnduceerde cytopathische effecten (CPE) in realtime te monitoren. Deze gestroomlijnde assay vermindert de hands-on tijd aanzienlijk, ondersteunt hoog-doorvoer, kwantitatieve kinetische CPE-metingen en maakt geautomatiseerde, realtime TCID50-berekeningen mogelijk.

Een gestroomlijnde, labelvrije realtime 50% weefselcultuur infectieuze dosis (TCID50) assay met impedantie voor geautomatiseerde kwantificatie van virale titers

Hier presenteren we een protocol om potentiële anti-tuberculose-geneesmiddelkandidaten te identificeren via fenotypische screening, waaronder de chemische synthese van een 4-aminoquinolineverbinding, het bepalen van de minimale remmende concentratie tegen Mycobacterium tuberculosis en de beoordeling van de cytotoxiciteit in zoogdiercellijnen.

Identificatie van potentiële anti-TB-kandidaten: Een stapsgewijze gids voor synthese, MIC-bepaling en cytotoxiciteitsbeoordeling in zoogdiercellen

Leer een nauwkeurige methode voor virale titratie met kristalvioletkleuring in een 96-well plaat. Dit protocol verbetert de betrouwbaarheid van viruskwantificering voor virologisch onderzoek.

Gebruik van Kristalviolet om visueel cytopathisch effectgebaseerd lezen voor virale titratie te verbeteren met behulp van TCID50-testen (Video) | JoVE Journal

Gebruik van Kristalviolet om visueel cytopathisch effectgebaseerd lezen voor virale titratie te verbeteren met behulp van TCID50-testen

Meer video's verkennen