Name: Ontwikkeling van compendium voor plaveiselcelcarcinoom van de slokdarm (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2024-04-12T12:50:00.000+00:00
Duration: 3 min 36 s
Description: Ontdek bio-informatica-analyse van differentieel tot expressie gebrachte genen in plaveiselcelcarcinoom van de slokdarm met GEO 2R. Deze methode helpt onderzoekers bij het identificeren van moleculaire veranderingen voor nieuwe diagnostische en therapeutische strategieën.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<meta charset="utf8"></head><body>Pijplijn voor het analyseren van microarray-gegevens in onderzoek naar slokdarmkanker

<table><tbody><tr><td>NCBI-PUBMED</td><td>NCBI</td><td>https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed</td><td>Verwijzend naar sectie 1. vereist voor het zoeken in de literatuur</td></tr><tr><td>Een laptop/macbook of pc met internetfaciliteit en een webbrowser.</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>g:Profiler</td><td>ELIXIR-infrastructuur</td><td>https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost</td><td>Verwijzend naar sectie 4.10. vereist voor verrijking van GO:MF, GO:BP en GO:CC</td></tr><tr><td>Gene expression omnibus</td><td>NCBI</td><td>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/</td><td>Verwijzend naar sectie 3.1. vereist voor het zoeken in de microarray-studiedatabase</td></tr><tr><td>GEO2R</td><td>NCBI</td><td>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/</td><td>Verwijzend naar sectie 3.2. vereist voor het analyseren van de gegevens met behulp van de GEO2R-tool</td></tr><tr><td>Google</td><td>Google</td><td>https://www.google.com</td><td>Verwijzend naar sectie 1.1. vereist voor het zoeken in de literatuur</td></tr><tr><td>HGNC</td><td>HGNC is een commissie van de Human Genome Organisation (HUGO)</td><td>https://www.genenames.org</td><td>Verwijzend naar sectie 6.1 vereist om het officiële gensymbool van de DEG's te kennen</td></tr><tr><td>HPRD</td><td>Institute of Bioinformatics, Bangluru</td><td>&nbsp;http://hprd.org</td><td>Verwijzend naar sectie 5.1 vereist voor informatie over eiwitarchitectuur</td></tr><tr><td>OMIM</td><td>&nbsp;Johns Hopkins University, Baltimore</td><td>http://www.omim.org/entry</td><td>Verwijzend naar sectie 8.1 vereist om de OMIM ID van een specifiek gen / DEG te kennen</td></tr><tr><td>Pangloss Program</td><td>Ontwikkeld door Chris Seidel</td><td>http://www.pangloss.com/seidel/Protocols/venn.cgi</td><td>Verwijzend naar sectie 4.9. vereist voor het genereren van de Venn-diagram</td></tr><tr><td>PANTHER</td><td>Thomas lab aan de University of Southern California</td><td>http://www.pantherdb.org/geneListAnalysis.do</td><td>Verwijzend naar sectie 4.10. vereist voor verrijking van GO:MF, GO:BP en GO:CC</td></tr><tr><td>ShinyGO&nbsp;</td><td>South Dakota State University</td><td>http://bioinformatics.sdstate.edu/go</td><td>Verwijzend naar sectie 4.10. vereist voor toewijzing van DEG's op de chromosomen</td></tr></tbody></table>

ontwikkeling van compendium voor plaveiselcelcarcinoom van de slokdarm

Development of Compendium for Esophageal Squamous Cell Carcinoma

Ontwikkeling van compendium voor plaveiselcelcarcinoom van de slokdarm

Esophageal cancer (EC) ranks as the 8th most aggressive malignancy, and its treatment remains challenging due to the lack of biomarkers facilitating early ...

development-of-compendium-for-esophageal-squamous-cell-carcinoma

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Kankeronderzoek

Er is duidelijk een behoefte aan betere informatie over de moleculaire bestuurders van Barrett-slokdarm. Immunofluorescentie kleuring is een nuttige techniek voor het begrijpen van de effecten van celsignalen op celmorfologie. Wij presenteren een eenvoudig, efficiënt protocol voor het gebruik van immunofluorescentie kleuring therapeutische behandeling van Barrett-slokdarm cellen bepalen.

Een Immunofluorescent methode voor de karakterisering van Barrett&#39;s slokdarm Cellen

Deze studie meldt een succesvolle methode van endoscopische vetweefsel afgeleide stromale cellen (ADSC)-plaat transplantatie voor oesofageale vernauwing preventie na een verlengde endoscopische submucosale dissectie (ESD) in een varkens model.

ADSC-sheet transplantatie ter voorkoming Strictuur na Extended slokdarmkanker Endoscopische Submucosale Dissection

Laparoscopie-endoscopie coöperatieve chirurgie is geschikt voor de behandeling van maag gastro-intestinale stromale tumoren kleiner dan 5 cm groot. Het kan de respectieve voordelen van endoscopische en laparoscopische operaties bereiken terwijl hun nadelen worden vermeden.

Laparoscopie-endoscopie Coöperatieve Chirurgie voor de behandeling van maag gastro-intestinale stromale tumoren

Dit protocol beschrijft de methoden van subcultuur en cryopreservatie van oesofageale adenocarcinoom organoïden met en zonder eencellige vertering om onderzoekers in staat te stellen geschikte strategieën te kiezen op basis van hun experimentele ontwerp.

Subcultuur en cryopreservatie van oesofageaal adenocarcinoom organoïden: voor- en nadelen voor eencellige spijsvertering

Dit protocol beschrijft de belangrijkste stappen voor het genereren en karakteriseren van muriene orale-oesofageale 3D-organoïden die normale, preneoplastische en plaveiselcelcarcinoomlaesies vertegenwoordigen die worden geïnduceerd via chemische carcinogenese.

Modellering van oraal-oesofageaal plaveiselcelcarcinoom in 3D-organoïden

Het huidige protocol beschrijft de opstelling en histologische analyse van slokdarmorganoïdemodellen die verschillende stadia van tumorprogressie vertegenwoordigen. Deze methode stelt onderzoekers in staat om veranderingen in cellulaire morfologie, ruimtelijke organisatie en moleculaire markerexpressiepatronen te bestuderen tijdens de overgang van normale naar kankerweefsels.

Oprichting en histologische analyse van slokdarmorganoïden die de progressie van normale naar kankerachtige weefsels modelleren

Dit protocol beschrijft een methode om kankerorganoïden, carcinoma-geassocieerde fibroblasten (AF's) en niet-tumor-geassocieerde fibroblasten (CF's) gelijktijdig te isoleren van dezelfde patiënt met slokdarmplaveiselcelcarcinoom (ESCC). Het gebruik van deze patiënt-gematchte materialen zou problemen door interpatibulaire variabiliteit kunnen voorkomen en een passend experimenteel platform bieden voor ESCC-onderzoek.

Vestiging van tumororganoïden, carcinoom-geassocieerde fibroblasten en tegenhangende fibroblasten van dezelfde slokdarmkankerpatiënt

Het meerstaps proces van peritoneale verspreiding van ovariumcarcinoom verduidelijken de huidige studie beschrijft een murine experimenteel model van originele tumorontwikkeling en metastase via orthotope peritoneale inoculatie met deze tumorcellen.

Murine Experimental Model van de oorspronkelijke tumor Ontwikkeling en peritoneale metastase<em&gt; via</em&gt; Orthotope Inenting met ovariumcarcinoom Cells

Perineurale invasie (PNI) is een veel voorkomend kenmerk van plaveiselcellencarcinoom in het hoofd-halsgebied (HNSCC), wat lagere overlevingspercentages tot gevolg heeft. De mechanismen ervan zijn slecht begrepen. Door gebruik te maken van neurites die gegenereerd zijn uit muisdorsale wortelganglia beperkt tot een semi-solide matrix, kunnen de paden die betrokken zijn bij de PNI van HNSCC-cellijnen worden onderzocht.

Een Model voor perineurale invasie in hoofd en nek plaveiselcelcarcinoom

Implementatie van een orthotope model niercelcarcinoom in immunocompetente muizen levert de onderzoeker een klinisch relevante systeem gedefinieerd door de aanwezigheid van een primaire niertumor en longmetastasen in hetzelfde dier. Dit systeem kan worden gebruikt om een verscheidenheid aan behandelingen in vivo preklinisch testen.

Een Syngenische muismodel van gemetastaseerd niercelcarcinoom voor Kwantitatieve en Longitudinale Evaluatie van de preklinische therapieën

Ontdek bio-informatica-analyse van differentieel tot expressie gebrachte genen in plaveiselcelcarcinoom van de slokdarm met GEO 2R. Deze methode helpt onderzoekers bij het identificeren van moleculaire veranderingen voor nieuwe diagnostische en therapeutische strategieën.

Ontwikkeling van compendium voor plaveiselcelcarcinoom van de slokdarm

Meer video's verkennen