Detectie van het SARS-CoV-2-virus door reverse transcriptie-lus-gemedieerde isotherme amplificatie

Ons onderzoek is gericht op het standaardiseren van LAMP als een prediagnostische test, geschikt voor veld- of eerstelijnszorginstellingen zonder geavanceerde laboratoriuminfrastructuur. We streven ernaar het gebruik van lokaal produceerbare buffers en alternatieve kleurstoffen te bevorderen, waardoor we minder afhankelijk worden van geïmporteerde commerciële kits. Momenteel is CRISPR-Cas een efficiënt systeem dat wordt gebruikt bij de ontwikkeling van snelle, specifieke en gevoelige diagnostische methoden voor ziekteverwekkers.

Nu heeft dit systeem een breed scala aan en supplementen om RNA- of DNA-doelen te detecteren in verschillende interessante monsters. De huidige experimentele uitdagingen hebben betrekking op het voorkomen van niet-doelwitamplificatie als gevolg van ampliconbesmetting en primaire cel, vooral bij lange primers die vatbaar zijn voor dimeervorming. Daarnaast streven we ernaar om optimale reactieomstandigheden te bepalen om een visueel waarneembare kleurverandering in de kleurstof te bereiken.

Zodra deze methode is gestandaardiseerd en volledig gevalideerd, kan deze eenvoudig worden geïmplementeerd en binnen 60 minuten worden aangepast aan elk laboratorium of zorgpunt, tegen lage kosten en met behulp van goedkope apparatuur, om bijna elke ziekteverwekker te detecteren. Het kan dus mogelijk worden gebruikt in eerstelijnszorgcentra om tijdige, epidemiologische surveillance uit te voeren. Onze multidisciplinaire groep richt zich op de ontdekking van moleculen van inheemse Colombiaanse planten en probeert het potentieel te identificeren om de replicatie van virussen zoals dengue, Zika of SARS-COVID-2 te remmen.

Daarnaast voeren we studies uit om moleculaire diagnostische methoden voor deze virussen te ontwikkelen.