Menselijke darmorganoïden gebruiken om het epitheel van de dunne darm te begrijpen op transcriptioneel niveau van één cel

We integreren single-cell transcriptomics en organoïdetechnologie om de biologie van de dunne darm beter te begrijpen. Deze technologieën geven ons een dieper inzicht in de cellulaire heterogeniteit die in dat weefsel bestaat. De tools die de doorvoer, gevoeligheid en de resoluties verbeteren, zijn de sleutels die het onderzoek in het veld vooruit helpen.

Enkele voorbeelden zijn verbeterde rekenmethoden en de technologische innovaties. Kostenreductie is ook een belangrijk aandachtspunt. Het proces van het voorbereiden en rangschikken van de bibliotheken met monsters kan transcriptievariaties veroorzaken, wat een uitdaging is.

Voor organoïden zijn specifieke uitdagingen onder meer een beperkte ruimtelijke context of informatie over temporele dynamiek. Eencellige analyse van de menselijke darmorganoïden levert voorheen onbereikbare informatie op over de celtypen waaruit het darmepitheel bestaat. Dit opent daarmee het venster naar het transcriptionele landschap van die cellen.

We gebruiken deze technologieën om biomarkers en mechanismen van menselijke darmziekten te identificeren. Deze biomarkers en mechanismen zullen ons vermogen vergroten om gepersonaliseerde, op geneeskunde gebaseerde benaderingen te gebruiken om menselijke ziekten te behandelen en de menselijke gezondheid in het algemeen te verbeteren.