Name: Monstervoorbereiding voor eencellige massaspectrometrie Metabolomics-onderzoeken: gecombineerd cellenwassen, afschrikken, drogen en bewaren (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-09-16T14:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 7 s
Description: Leer protocollen voor het behoud van cellulaire metabolieten bij enkelcel-massaspectrometrie. Deze methode optimaliseert wassen, afschrikken met vloeibare stikstof en opslag om metabolietprofielen betrouwbaar te bewaren voor metabolomics-onderzoek.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<table><tbody><tr><td>-80 &deg;C vriezer</td><td>Eppendorf New Brunswick</td><td>U700</td><td>Monstervoorbereiding </td></tr><tr><td>Acetonitril</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>240744</td><td>SCMS experiment opzet</td></tr><tr><td>Ammoniumformiaat </td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>401152500</td><td>Monstervoorbereiding </td></tr><tr><td>Dekglas 18 mm</td><td>VMR micro dekglas</td><td>48380046</td><td>Celcultuur </td></tr><tr><td>Digitaal stereomicroscoop</td><td>Shenzhen D&amp;F Co.</td><td>Supereyes T004</td><td>Analyse</td></tr><tr><td>Kwartsbuis met dubbele boring, 1.120"x0.005"x12"</td><td>Friedrich &amp; Dimmock, Inc.</td><td>MBT-005-020-2Q</td><td>Eenvoudige sondefabriek</td></tr><tr><td>Epoxyhars</td><td>Devcon</td><td>Onderdeel nr. 20945</td><td>Eenvoudige sondefabriek</td></tr><tr><td>Mierenzuur</td><td>Ward's Science </td><td>470301-120 500mL</td><td>SCMS experiment opzet</td></tr><tr><td>Gefuzeerde silica capillair, ID: 40 &micro;m, OD: 100 &micro;m</td><td>Polymicro Technologies</td><td>TSP040105</td><td>Eenvoudige sondefabriek</td></tr><tr><td>Gefuzeerde silica capillair, ID: 50 &micro;m, OD: 150 &micro;m</td><td>Polymicro Technologies</td><td>1068150015</td><td>SCMS experiment opzet</td></tr><tr><td>Glazen dekglazen, 18mm</td><td>VWR </td><td>48380046</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>HyClone synthetisch serum (FBS)</td><td>Hyclone</td><td>SH3006603</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>Incubator </td><td>HeraCell (Heraeus)</td><td></td><td>Celcultuur </td></tr><tr><td>Laser puller</td><td>Sutter Instrument Co.</td><td>Model P-2000</td><td>Eenvoudige sondefabriek</td></tr><tr><td>LED UV-lamp</td><td>Foshan Liang Ya Dental Equipment</td><td>LY-C240</td><td>Eenvoudige sondefabriek</td></tr><tr><td>McCoy's 5A </td><td>Gibco </td><td>2537128</td><td>Celcultuur </td></tr><tr><td>Microunion</td><td>IDEX Health &amp; Science LLC</td><td>M-539</td><td>SCMS experiment opzet</td></tr><tr><td>Gewijzigde FAIMS pro interface </td><td>Thermo Fisher </td><td>98100-20046</td><td>Analyse </td></tr><tr><td>MycoAlert PLUS Mycoplasma Detectie Kit</td><td>Lonza</td><td>LT07-703</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>Optische board </td><td>Thorlabs Inc., Newton</td><td></td><td>Analyse </td></tr><tr><td>Optima LC/MS-kwaliteitswater (Fisher Chemical, USA)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>W6500</td><td>Monstervoorbereiding </td></tr><tr><td>Orbitrap Exploris 240 massaspectrometer </td><td>ThermoFisher Scientific</td><td></td><td>SCMS experiment opzet</td></tr><tr><td>Penicilline/Streptomycine</td><td>Gibco</td><td>15140-122</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>Fosfaatbufferoplossing (PBS)</td><td>VWR</td><td>0780-50L</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>SpeedVac Concentrator (Savant)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td> SPD111 V</td><td>Monstervoorbereiding </td></tr><tr><td>Spuitpomp (SKE10)</td><td>Chemyx Inc.</td><td>80561</td><td>SCMS experiment opzet</td></tr><tr><td>Spuit, 250 &micro;L</td><td>Hamilton</td><td>1725LTN250UL</td><td>SCMS experiment opzet</td></tr><tr><td>TC20 Automatisch Celteller</td><td>Bio-Rad Laboratories </td><td>1450102EDU</td><td>Celtelling</td></tr><tr><td>Weefselcultuurschaal, 100mm</td><td>Fisher scientific </td><td>FB012924</td><td>Celcultuur </td></tr><tr><td>Trypsine-EDTA</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>25200-072</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>USB digitaal microscoop ("Scorpio" 500 Zoom)</td><td>Chinavasion, Wholesale Ltd.</td><td></td><td>Analyse </td></tr><tr><td>UV-hardende hars</td><td>Prime Dental</td><td>Artikelnr. 006.030</td><td>Eenvoudige sondefabriek</td></tr><tr><td>Xcalibur software</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td></td><td></td></tr><tr><td>XYZ-stage (CONEX- MFACC)</td><td>Newport Corp.</td><td></td><td>Analyse </td></tr></tbody></table>

monstervoorbereiding voor eencellige massaspectrometrie metabolomics-onderzoeken: gecombineerd cellenwassen, afschrikken, drogen en bewaren

Sample Preparation for Single Cell Mass Spectrometry Metabolomics Studies: Combined Cell Washing, Quenching, Drying, and Storage

Monstervoorbereiding voor eencellige massaspectrometrie Metabolomics-onderzoeken: gecombineerd cellenwassen, afschrikken, drogen en bewaren

Single-cell mass spectrometry (SCMS) has become an indispensable tool for studying cellular metabolism. Owing to advancements in modern mass spectrometry ...

sample-preparation-for-single-cell-mass-spectrometry-metabolomics

Research

JoVE Journal

Chemistry

Scheikunde

Deze video beschrijft een techniek om borstkankercelmonsters voor te bereiden op metabolietprofilering. Borstkankercellen worden behandeld met estradiol, dat zich bindt aan de oestrogeenreceptor alfa en verandering veroorzaakt in de samenstelling van de metaboliet.

Monstervoorbereiding voor metabolomics: een methode om celmonsters voor te bereiden op metabolietprofilering

Ongerichte metabolomics biedt een hypothese genererende momentopname van een metabool profiel. Dit protocol zal de extractie en analyse van metabolieten uit cellen, serum of weefsel tonen. Een reeks van metabolieten worden onderzocht met behulp van vloeistof-vloeistof fase-extractie, microflow UltraPerformance vloeistofchromatografie / hoge-resolutie massaspectrometrie (UPLC-HRMS) gekoppeld aan differentiële analyse software.

Ongerichte Metabolomics uit biologische grondstoffen gebruiken UltraPerformance Liquid Chromatography-hoge resolutie massaspectrometrie (UPLC-HRMS)

Metaboliet profilering is waardevol geweest in de studie van het metabolisme in gezondheid en ziekte. Gebruik te maken van de normale fasen vloeistofchromatografie gekoppeld aan een hoge resolutie massaspectrometrie met polariteit schakelen en een snelle duty cycle, beschrijven we een protocol bij de polaire metabole samenstelling van biologisch materiaal met een hoge gevoeligheid, nauwkeurigheid en resolutie te analyseren.

Een strategie voor de gevoelige, Large Scale Quantitative Metabolomics

Dit artikel beschrijft de verzameling en verwerking van monsters voor massa-cytometrie-analyse.

Monstervoorbereiding Mass Cytometry Analysis

Dit artikel beschrijft een methode voor het bestuderen van cellulair metabolisme in complexe gemeenschappen van meerdere celtypen, met behulp van een combinatie van stabiel isotooptracering, celsortering om specifieke celtypen te isoleren en massaspectrometrie.

Een methode voor het meten Metabolisme in gesorteerde subpopulaties van Complex Cell Gemeenschappen Met behulp van stabiele isotoop Tracing

Het doel van dit artikel is een protocol voor extractie van waterige metabolieten van gekweekte aanhang cellen voor metabolomic analyse, in het bijzonder, capillaire elektroforese-massaspectrometrie te beschrijven.

Extractie van waterige metabolieten van gekweekte aanhang cellen voor Metabolomic analyse door capillaire elektroforese-massaspectrometrie

We presenteren een protocol voor de identificatie en kwantificering van belangrijke klassen van in water oplosbare metabolieten in de gist Saccharomyces cerevisiae. De beschreven methode is veelzijdig, robuust en gevoelig. Het maakt de scheiding van structurele isomeren en stereo-somerische vormen van in water oplosbare metabolieten van elkaar mogelijk.

Kwantitatieve metabolomica van Saccharomyces Cerevisiae met behulp van vloeistofchromatografie in combinatie met tandemmassaspectrometrie

Sfingolipiden zijn bioactieve metabolieten met gevestigde rollen bij menselijke ziekten. Het karakteriseren van veranderingen in weefsels met massaspectrometrie kan rollen in de ziekte-etiologie onthullen of therapeutische doelen identificeren. De OCT-verbinding die wordt gebruikt voor cryopreservatie in biorepositories interfereert echter met massaspectrometrie. We schetsen methoden om sfingolipiden in menselijke weefsels ingebed in OCT te analyseren met LC-ESI-MS / MS.

Voorbereiding van menselijke weefsels ingebed in optimale snijtemperatuurverbinding voor massaspectrometrie-analyse

In dit protocol presenteren we een geoptimaliseerde workflow, die een efficiënte en snelle monstervoorbereiding van veel monsters combineert. Daarnaast bieden we een stapsgewijze handleiding om analytische variaties te verminderen voor high-throughput evaluatie van metabole GWAS-studies.

Grootschalige multi-omics Genome-wide Association Studies (Mo-GWAS): richtlijnen voor monstervoorbereiding en normalisatie

Hier beschrijven we een op massaspectrometrie gebaseerde proteomische karakterisering van cellijnen met bekende weefsellotgevallen in het gewervelde Xenopus laevis-embryo .

Cel-Lineage geleide massaspectrometrie proteomics in het zich ontwikkelende (kikker) embryo

In dit protocol beschrijven we hoe zoogdiercellen kunnen worden voorbereid op eencellige proteomics-analyse via massaspectrometrie met behulp van in de handel verkrijgbare reagentia en apparatuur, met opties voor zowel handmatig als automatisch pipetteren.

Eencellige proteomics voorbereiding voor massaspectrometrie-analyse met behulp van freeze-heat lysis en een isobare drager

Leer protocollen voor het behoud van cellulaire metabolieten bij enkelcel-massaspectrometrie. Deze methode optimaliseert wassen, afschrikken met vloeibare stikstof en opslag om metabolietprofielen betrouwbaar te bewaren voor metabolomics-onderzoek.

Monstervoorbereiding voor eencellige massaspectrometrie Metabolomics-onderzoeken: gecombineerd cellenwassen, afschrikken, drogen en bewaren (Video) | JoVE Journal

Monstervoorbereiding voor eencellige massaspectrometrie Metabolomics-onderzoeken: gecombineerd cellenwassen, afschrikken, drogen en bewaren

Meer video's verkennen