ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Lawson, T., Blatt, M. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stomatal+size%2C+speed%2C+and+responsiveness+impact+on+photosynthesis+and+water+use+efficiency%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">Stomatal size, speed, and responsiveness impact on photosynthesis and water use efficiency.</a> Plant Physiol. 164 (4), 1556-1570 (2014).</li>
<li>Smith, E. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improving+photosynthetic+efficiency+toward+food+security%3A+Strategies%2C+advances%2C+and+perspectives%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant%22%5BJournal%5D)">Improving photosynthetic efficiency toward food security: Strategies, advances, and perspectives.</a> Mol Plant. 16 (10), 1547-1563 (2023).</li>
<li>Flexas, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((What+can+we+learn+from+the+ecophysiology+of+plants+inhabiting+extreme+environments%3F+from+%26%2334%3Bsherplants%26%2334%3B+to+%26%2334%3Bshercrops.%26%2334%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Botany%22%5BJournal%5D)">What can we learn from the ecophysiology of plants inhabiting extreme environments? from &#34;sherplants&#34; to &#34;shercrops.&#34.</a> J Exp Botany. 76 (17), 4831-4848 (2025).</li>
<li>Wu, S., Zhao, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Using+clear+nail+polish+to+make+Arabidopsis+epidermal+impressions+for+measuring+the+change+of+stomatal+aperture+size+in+immune+response%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Pattern+Recognit+Recept.%3A+Methods+Protoc%22%5BJournal%5D)">Using clear nail polish to make Arabidopsis epidermal impressions for measuring the change of stomatal aperture size in immune response.</a> Plant Pattern Recognit Recept.: Methods Protoc. 1578, 243-248 (2017).</li>
<li>Kübarsepp, L., Laanisto, L., Niinemets, Ü, Talts, E., Tosens, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Are+stomata+in+ferns+and+allies+sluggish%3F+Stomatal+responses+to+CO%2C+humidity+and+light+and+their+scaling+with+size+and+density%5BTitle%5D)+AND+%22New+Phytol%22%5BJournal%5D)">Are stomata in ferns and allies sluggish? Stomatal responses to CO, humidity and light and their scaling with size and density.</a> New Phytol. 225 (1), 183-195 (2020).</li>
<li>Pathoumthong, P., Zhang, Z., Roy, S. J., El Habti, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+non-destructive+method+to+phenotype+stomatal+traits%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Methods%22%5BJournal%5D)">Rapid non-destructive method to phenotype stomatal traits.</a> Plant Methods. 19 (1), 36(2023).</li>
<li>Warner, C. A., Biedrzycki, M. L., Jacobs, S. S., Wisser, R. J., Caplan, J. L., Sherrier, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+optical+clearing+technique+for+plant+tissues+allowing+deep+imaging+and+compatible+with+fluorescence+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">An optical clearing technique for plant tissues allowing deep imaging and compatible with fluorescence microscopy.</a> Plant Physiol. 166 (4), 1684-1687 (2014).</li>
<li>Petruzzellis, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plasticity+of+functional+traits+of+tree+of+heaven+is+higher+in+exotic+than+in+native+habitats%5BTitle%5D)+AND+%22Trees%22%5BJournal%5D)">Plasticity of functional traits of tree of heaven is higher in exotic than in native habitats.</a> Trees. 33 (2), 411-420 (2019).</li>
<li>Kurihara, D., Mizuta, Y., Nagahara, S., Sato, Y., Higashiyama, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optical+clearing+of+plant+tissues+for+fluorescence+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Optical clearing of plant tissues for fluorescence imaging.</a> J Vis Exp. (179), e63428(2022).</li>
<li>Hériché, M., Arnould, C., Wipf, D., Courty, P. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+plant+tissues%3A+advances+and+promising+clearing+practices%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">Imaging plant tissues: advances and promising clearing practices.</a> Trends Plant Sci. 27 (6), 601-615 (2022).</li>
<li>Ensikat, H. J., Malekhosseini, M., Rust, J., Weigend, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualisation+of+calcium+oxalate+crystal+macropatterns+in+plant+leaves+using+an+improved+fast+preparation+method%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microsc%22%5BJournal%5D)">Visualisation of calcium oxalate crystal macropatterns in plant leaves using an improved fast preparation method.</a> J Microsc. 290 (3), 168-177 (2023).</li>
<li>Li, Y. M., Fei, T., Zhang, H. X., Xie, Z. S., Li, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Observation+of+the+development+of+leaf+vein+and+stomata+and+identification+of+candidate+transcription+factors+related+to+vein%2Fstoma+development+in+grapevine+leaf+%28Vitis+vinifera+L.%29%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Hortic%22%5BJournal%5D)">Observation of the development of leaf vein and stomata and identification of candidate transcription factors related to vein/stoma development in grapevine leaf (Vitis vinifera L.).</a> Sci Hortic. 307, 111-518 (2023).</li>
<li>Richardson, D. S., Lichtman, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clarifying+tissue+clearing%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Clarifying tissue clearing.</a> Cell. 162 (2), 246-257 (2015).</li>
<li>Ariel, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+beginner%27s+guide+to+tissue+clearing%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Biochem+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">A beginner's guide to tissue clearing.</a> Int J Biochem Cell Biol. 84, 35-39 (2017).</li>
<li>García-Gutiérrez, E., Ortega-Escalona, F., Angeles, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel%2C+rapid+technique+for+clearing+leaf+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">A novel, rapid technique for clearing leaf tissues.</a> Appl Plant Sci. 8 (9), e11391(2020).</li>
<li>Sai, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((StomaAI%3A+an+efficient+and+user-friendly+tool+for+measurement+of+stomatal+pores+and+density+using+deep+computer+vision%5BTitle%5D)+AND+%22New+Phytol%22%5BJournal%5D)">StomaAI: an efficient and user-friendly tool for measurement of stomatal pores and density using deep computer vision.</a> New Phytol. 238 (2), 904-915 (2023).</li>
<li>Liu, C., Sack, L., Li, Y., Zhang, J., Yu, K., Zhang, Q., He, N., Yu, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Relationships+of+stomatal+morphology+to+the+environment+across+plant+communities%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Relationships of stomatal morphology to the environment across plant communities.</a> Nat Commun. 14, 42136(2023).</li>
<li>Lawson, T., Vialet-Chabrand, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Speedy+stomata%2C+photosynthesis+and+plant+water+use+efficiency%5BTitle%5D)+AND+%22New+Phytolt%22%5BJournal%5D)">Speedy stomata, photosynthesis and plant water use efficiency.</a> New Phytolt. 221 (1), 93-98 (2019).</li>
<li>Stein, R. A., Sheldon, N. D., Smith, S. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((comparing+methodologies+for+stomatal+analyses+in+the+context+of+elevated+modern+CO2%5BTitle%5D)+AND+%22Life%22%5BJournal%5D)">comparing methodologies for stomatal analyses in the context of elevated modern CO2.</a> Life. 14 (1), 78(2024).</li>
<li>Schindelin, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fiji%3A+an+open-source+platform+for+biological-image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Fiji: an open-source platform for biological-image analysis.</a> Nat Methods. 9 (7), 676-682 (2012).</li>
<li>R Core Team. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22R%3A+A+language+and+environment+for+statistical+computing%22">R: A language and environment for statistical computing</a>. , R Foundation for Statistical Computing. Vienna, Austria. (2025).</li>
<li>Gibbs, J. A., Burgess, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+deep+learning+for+the+analysis+of+stomata%3A+a+review+of+current+methods+and+future+directions%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Bot%22%5BJournal%5D)">Application of deep learning for the analysis of stomata: a review of current methods and future directions.</a> J Exp Bot. 75 (21), 6704-6718 (2024).</li>
<li>Wang, J., Renninger, H. J., Ma, Q., Jin, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measuring+stomatal+and+guard+cell+metrics+for+plant+physiology+and+growth+using+StoManager1%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">Measuring stomatal and guard cell metrics for plant physiology and growth using StoManager1.</a> Plant Physiol. 195 (1), 378-394 (2024).</li>
<li>Rikisahedew, J. J., Niinemets, Ü, Scodeller, R., Tosens, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assessing+structural+traits+in+Triticum+aestivum+and+Zea+mays+for+C+and+C+photosynthetic+differentiation+using+free-hand+and+semi-thin+sections%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Assessing structural traits in Triticum aestivum and Zea mays for C and C photosynthetic differentiation using free-hand and semi-thin sections.</a> J Vis Exp. (209), e66843(2024).</li>
<li>Poole, I., Weyers, J. D. B., Lawson, T., Raven, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Variations+in+stomatal+density+and+index%3A+implications+for+palaeo+climatic+reconstructions%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Environ%22%5BJournal%5D)">Variations in stomatal density and index: implications for palaeo climatic reconstructions.</a> Plant Cell Environ. 19 (6), 705-712 (1996).</li>
<li>Smith, S., Weyers, J. D. B., Berry, W. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Variation+in+stomatal+characteristics+over+the+lower+surface+of+Commelina+communis+leaves%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Environ%22%5BJournal%5D)">Variation in stomatal characteristics over the lower surface of Commelina communis leaves.</a> Plant Cell Environ. 12 (6), 653-659 (1989).</li>
<li>Niewiadomski, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comprehensive+illustrated+protocol+for+clearing%2C+mounting%2C+and+imaging+leaf+venation+networks%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">A comprehensive illustrated protocol for clearing, mounting, and imaging leaf venation networks.</a> Appl Plant Sci. 13 (2), (2025).</li>
<li>Wang, J., Renninger, H. J., Ma, Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Labeled+temperate+hardwood+tree+stomatal+image+datasets+from+seven+taxa+of+Populus+and+17+hardwood+species%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Data%22%5BJournal%5D)">Labeled temperate hardwood tree stomatal image datasets from seven taxa of Populus and 17 hardwood species.</a> Sci Data. 11 (1), (2024).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Desinfecterende vloeibare reiniger NaClO &lt;5%</td><td>Domestos, GB</td><td>H000023244</td><td>&nbsp;Huidverbranding&nbsp;</td></tr><tr><td>Dinatriumwaterstoffosfaatdihydraat (Na2HPO4. 2H2O)&nbsp;</td><td>PENTA, CZ</td><td>10028-24-7</td><td>NA</td></tr><tr><td>Ethanol, abs. 100% a.r.</td><td>Chem-Lab NV, BE</td><td>CL00.0505.1000</td><td>&nbsp;Zeer ontvlambaar&nbsp;</td></tr><tr><td>Glazen flacon 2 mL</td><td>VWR Life Science, US</td><td>548-0045</td><td></td></tr><tr><td>Glutaraldehyde 50% oplossing</td><td>VWR Life Science, US</td><td>23H2856331</td><td>Dodelijk bij inademing. Giftig indien ingeslikt.&nbsp; Draag beschermende handschoenen,&nbsp; kleding,&nbsp; bril.</td></tr><tr><td>Microscoopglaasjes</td><td>Normax, PT</td><td>5470308A</td><td>NA</td></tr><tr><td>Nagelverzorging topcoat sneldrogend</td><td>B<img alt="Equation 1" src="/files/ftp_upload/69615/69615eq3.jpg" style="margin: auto;"/>K (INEZA), LT</td><td>LT-02244</td><td>NA</td></tr><tr><td>Nikon Eclipse E600 en Nikon DS0Fi1 5 MP</td><td>Nikon Corporation, JP</td><td>https://www.microscopyu.com/museum/eclipse-e600</td><td>NA</td></tr><tr><td>Pipetten en pipettentips</td><td>Thermo Scientific, FI</td><td>KJ16047</td><td>NA</td></tr><tr><td>Eenzijdige stalen messen</td><td>Oxford instruments</td><td>51-1625-0182</td><td>NA</td></tr><tr><td>Natriumdiwaterstoffosfaatdihydraat (NaH2PO4 . 2H2O) puur</td><td>PENTA, CZ</td><td>13472-35-0</td><td>NA</td></tr><tr><td>Natriumhydroxide korrels (NaOH) puur</td><td>Merck KGaA, DE</td><td>1310-73-2</td><td>Ernstige brandwonden.&nbsp;</td></tr><tr><td>Kantoorartikelen doorzichtige tape</td><td>FOROFIS, LV</td><td>91231</td><td>NA</td></tr><tr><td>Toluidineblauw, algemeen gebruik</td><td>ThermoFisher Scientific, GB</td><td>2045836</td><td>NA</td></tr></tbody></table>

karakterisering van huidmondjes en epidermale kenmerken met behulp van peelings, clearing en ai-gebaseerde beeldanalyse

Characterizing Stomatal and Epidermal Traits Using Peels, Clearing, and AI-Based Image Analysis

Karakterisering van huidmondjes en epidermale kenmerken met behulp van peelings, clearing en AI-gebaseerde beeldanalyse

Accurate characterization of stomatal morphology and surrounding epidermal traits is essential for understanding stomatal function. A comparative protocol ...

characterizing-stomatal-epidermal-traits-using-peels-clearing-ai

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

Ontwikkelingsbiologie

We hebben een eenvoudige en reproduceerbare protocol om stomatale reactie op de levende bacteriën te openen. Deze methode minimaliseert verwonden en manipulatie van het blad ten opzichte van het gebruik van de epidermale schillen eerder gerapporteerd.

Het beoordelen van stomatale Reactie op bacteriële cellen Live met behulp van Whole Leaf Imaging

We beschrijven een protocol met behulp van dia's kamer en de media te planten zaadlobben voor confocale beeldvorming van de opperhuid te immobiliseren over meerdere dagen van de ontwikkeling, het documenteren van stomata differentiatie. Fluorofoor-gemerkte eiwitten kan dynamisch worden gevolgd door expressie en subcellulaire lokalisatie, het verhogen van het inzicht in de mogelijke rollen tijdens de celdeling en cel-type differentiatie.

Lange termijn, hoge resolutie Confocale Time Lapse Imaging van<em&gt; Arabidopsis Cotyledon</em&gt; Epidermis Bij het ontkiemen

Ontrafelen hoe fysiologie en morfologie worden gekoppeld staat een dieper inzicht in de mechanistische werking van de bladeren van de planten. We presenteren zowel een procedure om de parameters van stomataire regelgeving ontlenen stomatale geleidbaarheid metingen en correlaties met traditionele functionele blad kenmerken.

Betrekking stomatale geleidbaarheid om Leaf functionele kenmerken

Dit protocol beschrijft een methode voor te bereiden van verrijkte stomatal guard cellen die nuttig is voor fysiologische en andere biologische studies.

Stoma Tape-Peel: Een verbeterde methode voor de bereiding van de monsters van de Guard cel

Wij bieden een methode voor het identificeren van modulatoren van bladtranspiratie door grootschalige screening van een samengestelde bibliotheek.

Identificatie van nieuwe regulatoren van plantaardige transpiratie door grootschalige thermische beeldvorming screening in Helianthus Annuus

Dit artikel beschrijft twee fenotyperingsmethoden zonder het gebruik van epidermale peelings om de genen te karakteriseren die de stomatale ontwikkeling regelen. De eerste methode demonstreert hoe een stomataal fenotype kan worden geanalyseerd met behulp van een toluidineblauwe O-gekleurde plantenepidermis. De tweede methode beschrijft hoe stomatale liganden te identificeren en hun biologische activiteiten te volgen.

Identificatie van de genen die betrokken zijn bij de ontwikkeling van stomato via epidermale fenotypescores

Verschillende veelgebruikte methoden worden hier geïntroduceerd om de membraanhandelgebeurtenissen van een plasmamembraanreceptorkinase te bestuderen. Dit manuscript beschrijft gedetailleerde protocollen, waaronder de bereiding van het plantmateriaal, de farmacologische behandeling en de confocale beeldvorming.

Op afbeeldingen gebaseerde methoden om membraanhandelgebeurtenissen in somatale afstammingscellen te bestuderen

Hier presenteren we een eenvoudige methode voor directe observatie en geautomatiseerde meting van stomatale reacties op bacteriële invasie in Arabidopsis thaliana. Deze methode maakt gebruik van een draagbaar stomatale beeldvormingsapparaat, samen met een beeldanalysepijplijn die is ontworpen voor bladbeelden die door het apparaat zijn vastgelegd.

Directe observatie en geautomatiseerde meting van stomatale responsen op Pseudomonas syringae pv. tomaat DC3000 in Arabidopsis thaliana

Er wordt een methode gepresenteerd voor goedkope beeldvorming van planten om fenotypes te meten, samen met best practices voor het vastleggen van afbeeldingen en een pijplijn voor beeldanalyse voor het kwantificeren van planteigenschappen. Deze methoden werden toegepast om de fenotypes van maïs (Zea mays) te meten onder hitte, droogte en gecombineerde abiotische stressomstandigheden.

Beeldvorming en analyse voor het kwantificeren van maïs (Zea mays) abiotische stressfenotypes

Het manuscript hier een eenvoudige set van methoden voor het analyseren van de afscheiding en de verspreiding van fluorescent gelabelde liganden in Xenopus. Dit verschaft een context voor het testen van het vermogen van andere eiwitten ligand distributie passen en waardoor experimenten inzicht in mechanismen reguleren morfogeen gradiënten kunnen leiden.

Met behulp van confocale Analyse<em&gt; Xenopus laevis</em&gt; Om Modulators van Wnt en Shh Morfogen Verlopen Onderzoek

Centre of Estonian Rural Research and Knowledge.  This protocol presents a comparative method to assess stomatal and epidermal traits in two distinct species using epidermal peels, clearing techniques, and AI-assisted image analysis. The goal is to enable high-throughput, reproducible quantification of cellular structures underlying stomatal function for agricultural applications and broad plant research.

Karakterisering van huidmondjes en epidermale kenmerken met behulp van peelings, clearing en AI-gebaseerde beeldanalyse

Meer video's verkennen