Name: Visualisering van activatie van het zygotische genoom in individuele cellen van vroege embryos (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-04-03T13:10:00.000+00:00
Duration: 7 min 30 s
Description: Leer hoe je zygotische genoomactivatie visualiseert in individuele cellen van vroege embryo's met Xenopus laevis. Deze methode met 5-EU-labeling en confocale microscopie maakt ruimtelijke en temporele analyse van transcriptiedynamiek mogelijk.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Kojima, M. L., Hoppe, C., Giraldez, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+maternal-to-zygotic+transition%3A+Reprogramming+of+the+cytoplasm+and+nucleus%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Genet%22%5BJournal%5D)">The maternal-to-zygotic transition: Reprogramming of the cytoplasm and nucleus.</a> Nat Rev Genet. 26 (4), 245-267 (2025).</li>
<li>Vastenhouw, N. L., Cao, W. X., Lipshitz, H. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+maternal-to-zygotic+transition+revisited%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">The maternal-to-zygotic transition revisited.</a> Development. 146 (11), dev161471(2019).</li>
<li>Jukam, D., Shariati, S. A. M., Skotheim, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zygotic+genome+activation+in+vertebrates%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Cell%22%5BJournal%5D)">Zygotic genome activation in vertebrates.</a> Dev Cell. 42 (4), 316-332 (2017).</li>
<li>Palfy, M., Joseph, S. R., Vastenhouw, N. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+timing+of+zygotic+genome+activation%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Genet+Dev%22%5BJournal%5D)">The timing of zygotic genome activation.</a> Curr Opin Genet Dev. 43, 53-60 (2017).</li>
<li>Chen, H., Einstein, L. C., Little, S. C., Good, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatiotemporal+patterning+of+zygotic+genome+activation+in+a+model+vertebrate+embryo%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Cell%22%5BJournal%5D)">Spatiotemporal patterning of zygotic genome activation in a model vertebrate embryo.</a> Dev Cell. 49 (6), 852-866.e7 (2019).</li>
<li>Chen, H., Good, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nascent+transcriptome+reveals+orchestration+of+zygotic+genome+activation+in+early+embryogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Nascent transcriptome reveals orchestration of zygotic genome activation in early embryogenesis.</a> Curr Biol. 32 (19), 4314-4324.e7 (2022).</li>
<li>Chen, H., Good, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+nascent+transcription+in+whole-mount+vertebrate+embryos+to+characterize+zygotic+genome+activation%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Enzymol%22%5BJournal%5D)">Imaging nascent transcription in whole-mount vertebrate embryos to characterize zygotic genome activation.</a> Methods Enzymol. 638, 139-165 (2020).</li>
<li>Jao, C. Y., Salic, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Exploring+RNA+transcription+and+turnover+in+vivo+by+using+click+chemistry%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Exploring RNA transcription and turnover in vivo by using click chemistry.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 105 (41), 15779-15784 (2008).</li>
<li>Chan, S. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Brd4+and+P300+confer+transcriptional+competency+during+zygotic+genome+activation%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Cell%22%5BJournal%5D)">Brd4 and P300 confer transcriptional competency during zygotic genome activation.</a> Dev Cell. 49 (6), 867-881.e8 (2019).</li>
<li>Adar-Levor, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cytokinetic+abscission+is+part+of+the+midblastula+transition+in+early+zebrafish+embryogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Cytokinetic abscission is part of the midblastula transition in early zebrafish embryogenesis.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 118 (15), e2021210118(2021).</li>
<li>Chen, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantifying+nascent+transcription+in+early+embryogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Quantifying nascent transcription in early embryogenesis.</a> Methods Mol Biol. 2923, 143-162 (2025).</li>
<li>Harland, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+hybridization%3A+An+improved+whole-mount+method+for+Xenopus+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">In situ hybridization: An improved whole-mount method for Xenopus embryos.</a> Methods Cell Biol. 36, 685-695 (1991).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>16% Paraformaldehyde (PFA)</td><td>EMS</td><td>15710-S</td><td>Voor het maken van de fixatieoplossing</td></tr><tr><td>20&times; SSC</td><td>Mediatech</td><td>MT46-020-CM</td><td>Voor het maken van de bleekoplossing</td></tr><tr><td>3D nutating mixer</td><td>VWR</td><td>76595-802</td><td>Voor nutterende embryo's</td></tr><tr><td>9 mm Screw-Thread Vials (2 mL)</td><td>VWR</td><td>46610-722</td><td>Voor het verwerken van embryo's</td></tr><tr><td>Anti-Histone H3 antibody</td><td>Abcam</td><td>ab1791</td><td>Voor immunokleuring</td></tr><tr><td>Ascorbic acid</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A7506</td><td>Voor het maken van de click reactie</td></tr><tr><td>Benzyl alcohol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>305197</td><td>Voor het verhelderen van embryo's</td></tr><tr><td>Benzyl benzoate</td><td>ACROS Organics</td><td>105860010</td><td>Voor het verhelderen van embryo's</td></tr><tr><td>Bovine serum albumin (BSA)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A3059</td><td>Voor het maken van de blokkeringsoplossing</td></tr><tr><td>Caps for 9 mm Screw-Thread Vials (2 mL)</td><td>VWR</td><td>46610-712</td><td>Voor het verwerken van embryo's</td></tr><tr><td>Coverglass (24 mm &times; 40 mm)</td><td>VWR</td><td>48393-060</td><td>Voor het maken van de beeldvormingskamer</td></tr><tr><td>CuSO4</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>61230</td><td>Voor het maken van de click reactie</td></tr><tr><td>Ethylenebis (oxyethylenenitrilo)tetraacetic acid (EGTA)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>AC409915000</td><td>Voor het maken van de fixatieoplossing</td></tr><tr><td>Fiji ImageJ</td><td>NIH</td><td></td><td>Voor beeldverwerking</td></tr><tr><td>Formamide</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>AC181090010</td><td>Voor het maken van de bleekoplossing</td></tr><tr><td>Glass Pasteur pipets</td><td>VWR</td><td>14673-010</td><td>Voor het overbrengen van BABB</td></tr><tr><td>Goat anti-rabbit Alex Fluor 488 secondary antibody</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>A27034</td><td>Voor immunokleuring</td></tr><tr><td>Goat serum</td><td>Abcam</td><td>ab7481</td><td>Voor het maken van de blokkeringsoplossing</td></tr><tr><td>Hydrogen peroxide</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>H1009</td><td>Voor het maken van de bleekoplossing</td></tr><tr><td>Magnesium sulfate (MgSO4)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>M65-500</td><td>Voor het maken van de fixatieoplossing</td></tr><tr><td>Methanol</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>A4524</td><td>Voor het dehydrateren van embryo's</td></tr><tr><td>Methanol, anhydrous</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>322415</td><td>Voor het dehydrateren van embryo's</td></tr><tr><td>MOPS</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>AC172631000</td><td>Voor het maken van de fixatieoplossing</td></tr><tr><td>Multi-mode nutating mixer</td><td>VWR</td><td>76595-812</td><td>Voor nutterende embryo's</td></tr><tr><td>Plastic transfer pipette</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>13-711-9AM</td><td>Voor het overbrengen van embryo's</td></tr><tr><td>Razor blade</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>18-100-970</td><td>Voor het snijden van tapes</td></tr><tr><td>RNase-free water</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>BP561-1</td><td>Voor het maken van Rnase-vrije oplossingen</td></tr><tr><td>Roto-Mini PLUS (rotator)</td><td>VWR</td><td>470313-912</td><td>Voor het roeren van embryo's</td></tr><tr><td>Tetramethylrhodamine (TAMRA)-azide</td><td>Abcam</td><td>ab146486</td><td>Voor het maken van de click reactie</td></tr><tr><td>TO-PRO-3</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>T3605</td><td>Voor het kleuren van DNA</td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>10789704001</td><td>Voor het maken van de wasbuffer</td></tr><tr><td>Trizma Base (Tris Base)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T1503</td><td>Voor het maken van de Tris buffer</td></tr><tr><td>VHB 3M GPH-110GF Tapes (45 mil.)</td><td>VWR</td><td>76524-608</td><td>Voor het maken van de beeldvormingskamer</td></tr><tr><td>Zeiss LSM 700 confocal microscope</td><td>Zeiss</td><td></td><td>Voor confocale beeldvorming</td></tr></tbody></table>

visualisering van activatie van het zygotische genoom in individuele cellen van vroege embryo's

Visualizing Zygotic Genome Activation In Single Cells of Early Embryos

Visualisering van activatie van het zygotische genoom in individuele cellen van vroege embryo's

Early embryogenesis requires the maternal-to-zygotic transition (MZT) that necessitates the zygotic genome activation (ZGA). During ZGA, hundreds to ...

visualizing-zygotic-genome-activation-in-single-cells-of-early-embryos

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

Ontwikkelingsbiologie

In deze video, demonstreren we een methode om de ontwikkeling van gewervelde hersenen te analyseren in levende zebravis embryo's bij enkele cel resolutie door confocale microscopie. Dit omvat de methode waarmee we injecteren van de single-cell zebravis embryo en vervolgens monteren en het imago van de zich ontwikkelende hersenen.

Live-Imaging van de zebravis embryonale Brain door confocale microscopie

Dit protocol beschrijft beeldvorming van individuele neuronen of neurale cellen in levende zebravis embryo's. Deze methode wordt gebruikt om cellulaire gedrag en actine lokalisatie met behulp van fluorescentie confocal time-lapse microscopie bestuderen.

Live-Imaging van celbeweeglijkheid en actine cytoskelet van individuele neuronen en neurale cellen in de zebravis embryo&#39;s

De huidige video toont een methode die gebruik maakt van de combinatie van elektroporatie en confocale microscopie te leven imaging op individuele neurale stamcellen uit te voeren in de zich ontwikkelende zebravis voorhersenen.

Time-lapse Live-Imaging van klonaal verwante neurale progenitorcellen in de ontwikkelingslanden zebravis voorhersenen

Dit artikel beschrijft een techniek voor de visualisatie van de vroege gebeurtenissen van embryogenese in de...

Time-lapse microscopie van de vroege embryogenese in Caenorhabditis elegans

Live volgen van individuele WT retinale voorlopers in verschillende genetische achtergronden maakt voor de beoordeling van de bijdrage van de cel niet-zelfstandige signalering tijdens de neurogenese. Hier, een combinatie van gen knockdown, chimeer generatie via embryo transplantatie en in vivo time-lapse confocale beeldvorming werd gebruikt voor dit doel.

In vivo beeldvorming van transgene Gene Expression Individuele retinale voorouders in chimère zebravis embryo&#39;s to Cell Nonautonomous Invloeden Studie

Dit manuscript beschrijft een in vitro zaadknop cultivatiemethode die het mogelijk live-cel beeldvorming van Arabidopsis zygoten en embryo's maakt. Deze methode wordt gebruikt om te visualiseren de intracellulaire dynamiek tijdens de zygote polarisatie en de cel lot specificatie bij de ontwikkeling van de embryo's.

In Vitro Zaadknop teelt voor Live-cel Imaging van Zygote polarisatie en Embryo patronen in Arabidopsis thaliana

Een combinatie van de geavanceerde optische technieken van laser scanning microscopie met lange golflengte fluorescentie multi foton excitatie werd uitgevoerd om vast te leggen van real-time, hoge resolutie, driedimensionale beeldvorming van neurale crest migratie in GS (sox10:EGFP) en GS (foxd3:GFP) zebrafish embryo's.

Multi foton Time Lapse Imaging te visualiseren van ontwikkeling in realtime: visualisatie van migreren neurale kamcellen in Zebrafish embryo's

Dit werk beschrijft een semi-High-throughput protocol dat gelijktijdige 3D time-lapse beeldvorming van embryogenese in 80 – 100 C. elegans embryo's in een enkele nachtelijke run toestaat. Daarnaast worden tools voorbeeld verwerking en visualisatie meegeleverd om de gegevensanalyse te stroomlijnen. De combinatie van deze methoden met aangepaste reporter stammen maakt gedetailleerde controle van embryogenese.

Een semi-High-throughput imaging methode en data visualisatie Toolkit om C. elegans embryonale ontwikkeling te analyseren

Er wordt een strategie voor de voorbereiding van monsters beschreven voor het afbeelden van vroege zebravisembryo's in een intact chorion met behulp van een light-sheet-microscoop. Het analyseert de verschillende oriëntaties die embryo's verwerven in het chorion in de 70% epiboly- en knopstadia en beschrijft beeldvormingsstrategieën voor het verkrijgen van resolutie op cellulaire schaal in het hele embryo met behulp van het light-sheet-systeem.

Light Sheet Microscopie, beeldvorming en montagestrategieën voor vroege zebravisembryo's

Dit artikel stelt een pijplijn op voor hoogwaardige eencellige en kernsuspensies van gastrulerende muizenembryo's voor sequencing van individuele cellen en kernen.

Single-cell RNA-sequencing van gemuteerde hele muizenembryo's: van de epiblast tot het einde van de gastrulatie

We bieden gedetailleerde methoden om beginnende transcripten metabolisch te labelen en te zuiveren voor transcriptoomanalyse in vroege embryo's van Xenopus met behulp van 5-ethynyl-uridine (5-EU).

Metabole labeling van het ontluikende transcriptoom in de vroege embryogenese van Xenopus

Leer hoe je zygotische genoomactivatie visualiseert in individuele cellen van vroege embryo's met Xenopus laevis. Deze methode met 5-EU-labeling en confocale microscopie maakt ruimtelijke en temporele analyse van transcriptiedynamiek mogelijk.

Visualisering van activatie van het zygotische genoom in individuele cellen van vroege embryo's

Meer video's verkennen