Name: Assemblage en gebruik van een plant-gnotobiotisch groeisysteem voor plant-microbe interactiestudies in granen (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-06-26T13:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 47 s
Description: Ontdek het GNOVA-gnotobiotische systeem voor het kweken van granen zoals tarwe en maïs onder gecontroleerde microbiele omstandigheden. Dit systeem maakt geavanceerde studies van plant-microbe interacties mogelijk.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

<ol><li>Batista, B. D., Singh, B. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Realities+and+hopes+in+the+application+of+microbial+tools+in+agriculture%5BTitle%5D)+AND+%22Microbial+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Realities and hopes in the application of microbial tools in agriculture.</a> Microbial Biotechnology. , (2021).</li>
<li>Parnell, J. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((From+the+Lab+to+the+Farm%3A+An+Industrial+Perspective+of+Plant+Beneficial+Microorganisms%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">From the Lab to the Farm: An Industrial Perspective of Plant Beneficial Microorganisms.</a> Frontiers in Plant Science. , (2016).</li>
<li>Busby, P. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Research+priorities+for+harnessing+plant+microbiomes+in+sustainable+agriculture%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+Biology%22%5BJournal%5D)">Research priorities for harnessing plant microbiomes in sustainable agriculture.</a> PLOS Biology. , (2017).</li>
<li>Compant, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Harnessing+the+plant+microbiome+for+sustainable+crop+production%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Reviews+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Harnessing the plant microbiome for sustainable crop production.</a> Nature Reviews Microbiology. , (2025).</li>
<li>Vorholt, J. A., Vogel, C., Carlström, C. I., Müller, D. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Establishing+Causality%3A+Opportunities+of+Synthetic+Communities+for+Plant+Microbiome+Research%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Host+and+Microbe%22%5BJournal%5D)">Establishing Causality: Opportunities of Synthetic Communities for Plant Microbiome Research.</a> Cell Host and Microbe. , (2017).</li>
<li>Liu, Y. X., Qin, Y., Bai, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reductionist+synthetic+community+approaches+in+root+microbiome+research%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Opinion+in+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Reductionist synthetic community approaches in root microbiome research.</a> Current Opinion in Microbiology. , (2019).</li>
<li>Basic, M., Bleich, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gnotobiotics%3A+Past%2C+present+and+future%5BTitle%5D)+AND+%22Laboratory+Animals%22%5BJournal%5D)">Gnotobiotics: Past, present and future.</a> Laboratory Animals. , (2019).</li>
<li>Williams, S. C. P. Gnotobiotics. Proceedings of the National Academy of Sciences, , (2014).</li>
<li>Bennett, R. A., Lynch, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bacterial+Growth+and+Development+in+the+Rhizosphere+of+Gnotobiotic+Cereal+Plants%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology%22%5BJournal%5D)">Bacterial Growth and Development in the Rhizosphere of Gnotobiotic Cereal Plants.</a> Microbiology. , (1981).</li>
<li>Lindberg, T., Granhall, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Acetylene+reduction+in+gnotobiotic+cultures+with+rhizosphere+bacteria+and+wheat%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+and+Soil%22%5BJournal%5D)">Acetylene reduction in gnotobiotic cultures with rhizosphere bacteria and wheat.</a> Plant and Soil. , (1986).</li>
<li>Maplestone, P. A., Campbell, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Colonization+of+roots+of+wheat+seedlings+by+bacilli+proposed+as+biocontrol+agents+against+take-all%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+Biology+and+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Colonization of roots of wheat seedlings by bacilli proposed as biocontrol agents against take-all.</a> Soil Biology and Biochemistry. , (1989).</li>
<li>Simons, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gnotobiotic+System+for+Studying+Rhizosphere+Colonization+by+Plant+Growth-Promoting+Pseudomonas+Bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22MPMI%22%5BJournal%5D)">Gnotobiotic System for Studying Rhizosphere Colonization by Plant Growth-Promoting Pseudomonas Bacteria.</a> MPMI. , (1996).</li>
<li>Walley, F. L., Germida, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Response+of+spring+wheat+to+interactions+between+Pseudomonas+species+and+Glomus+clarum+NT4%5BTitle%5D)+AND+%22Biology+and+Fertility+of+Soils%22%5BJournal%5D)">Response of spring wheat to interactions between Pseudomonas species and Glomus clarum NT4.</a> Biology and Fertility of Soils. , (1997).</li>
<li>Ma, K. W., Ordon, J., Schulze-Lefert, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gnotobiotic+Plant+Systems+for+Reconstitution+and+Functional+Studies+of+the+Root+Microbiota%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Protocols%22%5BJournal%5D)">Gnotobiotic Plant Systems for Reconstitution and Functional Studies of the Root Microbiota.</a> Current Protocols. , (2022).</li>
<li>Niu, B., Paulson, J. N., Zheng, X., Kolter, R. Simplified and representative bacterial community of maize roots. Proceedings of the National Academy of Sciences, , (2017).</li>
<li>Hsu, P. C. L., O’Callaghan, M., Condron, L., Hurst, M. R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+a+gnotobiotic+plant+assay+for+assessing+root+colonization+and+mineral+phosphate+solubilization%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+and+Soil%22%5BJournal%5D)">Use of a gnotobiotic plant assay for assessing root colonization and mineral phosphate solubilization.</a> Plant and Soil. , (2018).</li>
<li>McLaughlin, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Versatile+Glass+Jar+System+for+Semihydroponic+Root+Exudate+Profiling%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">A Versatile Glass Jar System for Semihydroponic Root Exudate Profiling.</a> Journal of Visualized Experiments. , (2023).</li>
<li>Miebach, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Litterbox%E2%80%94A+gnotobiotic+Zeolite-Clay+System+to+Investigate+Arabidopsis%E2%80%93Microbe+Interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Microorganisms%22%5BJournal%5D)">Litterbox—A gnotobiotic Zeolite-Clay System to Investigate Arabidopsis–Microbe Interactions.</a> Microorganisms. , (2020).</li>
<li>Salvato, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+Protein+Extraction+Methods+for+Metaproteomic+Analyses+of+Root-Associated+Microbes%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Plant-Microbe+Interactions%22%5BJournal%5D)">Evaluation of Protein Extraction Methods for Metaproteomic Analyses of Root-Associated Microbes.</a> Molecular Plant-Microbe Interactions. , (2022).</li>
<li>Kawasaki, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+sterile+hydroponic+system+for+characterising+root+exudates%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Methods%22%5BJournal%5D)">A sterile hydroponic system for characterising root exudates.</a> Plant Methods. , (2018).</li>
<li>Kremer, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Peat-based+gnotobiotic+plant+growth+systems+for+Arabidopsis+microbiome+research%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Protocols%22%5BJournal%5D)">Peat-based gnotobiotic plant growth systems for Arabidopsis microbiome research.</a> Nature Protocols. , (2021).</li>
<li>Nezhad, A. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microfluidic+platforms+for+plant+cells+studies%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+on+a+Chip%22%5BJournal%5D)">Microfluidic platforms for plant cells studies.</a> Lab on a Chip. , (2014).</li>
<li>Gao, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ecosystem+Fabrication+protocols+for+plant-microbe+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Ecosystem Fabrication protocols for plant-microbe interactions.</a> Journal of Visualized Experiments. , (2018).</li>
<li>Gupta, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((EcoFAB+3.0%3A+a+sterile+system+for+studying+sorghum%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">EcoFAB 3.0: a sterile system for studying sorghum.</a> Frontiers in Plant Science. , (2024).</li>
<li>Verma, S. K., et al. Exploring Endophytic Communities of Plants. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aVerma%2C+SK+%22Seed+Endophytes%3A+Biology+and+Biotechnology%22">Seed Endophytes: Biology and Biotechnology</a>. , Springer. Cham. (2019).</li>
<li>Parnell, J. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effective+Seed+Sterilization+Methods+Require+Optimization+Across+Maize+Genotypes%5BTitle%5D)+AND+%22Phytobiomes+Journal%22%5BJournal%5D)">Effective Seed Sterilization Methods Require Optimization Across Maize Genotypes.</a> Phytobiomes Journal. , (2024).</li>
<li>Lee, J., Kim, H. S., Jo, H. Y., Kwon, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Revisiting+soil+bacterial+counting+methods%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+One%22%5BJournal%5D)">Revisiting soil bacterial counting methods.</a> PLOS One. , (2021).</li>
<li>Thomas, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimization+of+single+plate-serial+dilution+spotting+method%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnology+Reports%22%5BJournal%5D)">Optimization of single plate-serial dilution spotting method.</a> Biotechnology Reports. , (2015).</li>
<li>Munkager, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((AgNO3+Sterilizes+Grains+of+Barley+without+Inhibiting+Germination%5BTitle%5D)+AND+%22Plants%22%5BJournal%5D)">AgNO3 Sterilizes Grains of Barley without Inhibiting Germination.</a> Plants. , (2020).</li>
<li>Wagner, M. R., et al. Microbe-dependent heterosis in maize. Proceedings of the National Academy of Sciences, , (2021).</li>
<li>Poorter, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pot+size+matters%3A+effects+of+rooting+volume+on+plant+growth%5BTitle%5D)+AND+%22Functional+Plant+Biology%22%5BJournal%5D)">Pot size matters: effects of rooting volume on plant growth.</a> Functional Plant Biology. , (2012).</li>
<li>Ferrante, A., Mariani, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Agronomic+management+for+enhancing+plant+tolerance+to+abiotic+stresses%5BTitle%5D)+AND+%22Horticulturae%22%5BJournal%5D)">Agronomic management for enhancing plant tolerance to abiotic stresses.</a> Horticulturae. , (2018).</li>
<li>Vollmer, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+Gas+Exchange+Rate+and+Vessel+Type+on+plant+growth%5BTitle%5D)+AND+%22Plants%22%5BJournal%5D)">Effect of Gas Exchange Rate and Vessel Type on plant growth.</a> Plants. , (2024).</li>
<li>Cardoso, E. J. B. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Soil+health%3A+suitable+indicators+for+assessment%5BTitle%5D)+AND+%22Scientia+Agricola%22%5BJournal%5D)">Soil health: suitable indicators for assessment.</a> Scientia Agricola. , (2013).</li>
<li>Sinclair, T. R., Ludlow, M. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Influence+of+soil+water+supply+on+plant+water+balance%5BTitle%5D)+AND+%22Australian+Journal+of+Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">Influence of soil water supply on plant water balance.</a> Australian Journal of Plant Physiology. , (1986).</li>
<li>Döll, S., Koller, H., van Dam, N. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protocol+for+collecting+root+exudates+from+soil+grown+plants%5BTitle%5D)+AND+%22Rhizosphere%22%5BJournal%5D)">Protocol for collecting root exudates from soil grown plants.</a> Rhizosphere. , (2024).</li>
<li>Williams, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparing+root+exudate+collection+techniques%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+Biology+and+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Comparing root exudate collection techniques.</a> Soil Biology and Biochemistry. , (2021).</li>
<li>Carlström, C. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthetic+microbiota+reveal+priority+effects+and+keystone+strains%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Ecology+and+Evolution%22%5BJournal%5D)">Synthetic microbiota reveal priority effects and keystone strains.</a> Nature Ecology and Evolution. , (2019).</li>
<li>Seethepalli, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RhizoVision+Explorer%3A+software+for+root+image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22AoB+Plants%22%5BJournal%5D)">RhizoVision Explorer: software for root image analysis.</a> AoB Plants. , (2021).</li>
<li>Pace, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+maize+seedling+roots+using+ARIA%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+One%22%5BJournal%5D)">Analysis of maize seedling roots using ARIA.</a> PLOS One. , (2014).</li>
<li>Jensen, T. B. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+DNA+extraction+and+metagenome+preparation%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+One%22%5BJournal%5D)">High-throughput DNA extraction and metagenome preparation.</a> PLOS One. , (2024).</li>
<li>Romero-Salas, E. A., Ibarra-Sánchez, C. L. Isolation of Metagenomic DNA from Plant Roots. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aRomero-Salas%2C+EA+%22Plant+Microbiome+Engineering%22">Plant Microbiome Engineering</a>. , Springer. New York. (2025).</li>
<li>Su, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recovery+of+metagenome-assembled+genomes+from+rice+phyllosphere%5BTitle%5D)+AND+%22Scientific+Data%22%5BJournal%5D)">Recovery of metagenome-assembled genomes from rice phyllosphere.</a> Scientific Data. , (2022).</li>
<li>Northen, T. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Community+standards+for+synthetic+communities+in+plant%E2%80%93microbiota+research%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Community standards for synthetic communities in plant–microbiota research.</a> Nature Microbiology. , (2024).</li>
<li>Poursalavati, A., Javaran, V. J., Laforest-Lapointe, I., Fall, M. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Soil+Metatranscriptomics%3A+improved+RNA+extraction+method%5BTitle%5D)+AND+%22Phytobiomes+Journal%22%5BJournal%5D)">Soil Metatranscriptomics: improved RNA extraction method.</a> Phytobiomes Journal. , (2023).</li>
<li>Vannier, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-resolved+metatranscriptomics+reveals+conserved+root+colonization+determinants%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">Genome-resolved metatranscriptomics reveals conserved root colonization determinants.</a> Nature Communications. , (2023).</li>
<li>Zheng, L., et al. Extraction of Proteins from Soil. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aZheng%2C+L+%22Metaproteomics%3A+Methods+and+Protocols%22">Metaproteomics: Methods and Protocols</a>. , Springer. New York. (2024).</li>
<li>Zheng, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+physiological+and+proteomic+response+to+phosphate+deficiency%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Proteomics%22%5BJournal%5D)">Comparative physiological and proteomic response to phosphate deficiency.</a> Journal of Proteomics. , (2023).</li>
<li>Rieusset, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cross-metabolomic+approach+in+wheat%E2%80%93Pseudomonas+interaction%5BTitle%5D)+AND+%22Metabolites%22%5BJournal%5D)">Cross-metabolomic approach in wheat–Pseudomonas interaction.</a> Metabolites. , (2021).</li>
<li>Zhang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metabolite-mediated+responses+of+phyllosphere+microbiota%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology+Spectrum%22%5BJournal%5D)">Metabolite-mediated responses of phyllosphere microbiota.</a> Microbiology Spectrum. , (2023).</li>
<li>Swenson, T. L., Northen, T. R. Untargeted Soil Metabolomics. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSwenson%2C+TL+%22Microbial+Metabolomics%3A+Methods+and+Protocols%22">Microbial Metabolomics: Methods and Protocols</a>. , Springer. New York. (2019).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Powerconnect snoerloze boormachine &amp; 100-delige set</td><td>Black+Decker</td><td>BDC120VA100</td><td>1/4" en 1/8" boorkopjes nodig. </td></tr><tr><td>Vinyl tape, geel, 1" breed x 36 meter&nbsp;</td><td>3M</td><td>471</td><td>Verbruiksartikel</td></tr><tr><td>Sterling rubberbanden maat #32&nbsp; (2 rubberbanden per systeem)</td><td>Amazon</td><td>B001I1QO00</td><td>Verbruiksartikel. </td></tr><tr><td>Tarwezaad</td><td></td><td></td><td>Cultivar gebruikt in dit experiment: Catawba</td></tr><tr><td>Glasvezel pijpwikkelisolatie, 3 " breed x 1/2 " dik&nbsp; (2 voorgesneden cirkels per systeem)</td><td>Lowe's</td><td>28930</td><td>Snijden in 2 7/8 " (7.3 cm) diam cirkels. Verbruiksartikel. Voor hoogwaardige productie van cirkels rolt u de wikkelisolatie uit en gebruikt u de open rand van de pot om de cirkel te snijden door de pot boven de isolatiewikkel te plaatsen en druk en draai toe te passen. </td></tr><tr><td>DW4 Filter media, Voorgesneden tot 15" x 75 meter&nbsp; (1 gesneden cirkel per systeem)</td><td>Class Biological Clean, Ltd</td><td>NA</td><td>Snijden in 6.3 " (16.02 cm) diam cirkels. CBC heeft andere voorgesneden of standaardrolmaten die indien gewenst kunnen worden gekocht.&nbsp; Verbruiksartikel. knip een sjabloon van de cirkel in karton en gebruik deze om cirkels door het gebied van de DW4-media te tekenen en met een schaar te snijden.</td></tr><tr><td>Siliconen buis, Versilon SPX-50 Hoogsterkte, 1/8" ID x 1/4" OD x 1/16" wanddikte</td><td>Saint-Gobain</td><td>ABX00007</td><td>Snijden in twee lange stukken ( 16" // 40.64 cm) en drie korte stukken (2.5" // 6.35 cm)&nbsp;</td></tr><tr><td>Natriumhypochloriet 5% beschikbaar chloor in waterige oplossing</td><td>VWR</td><td>JT9416-1</td><td>Verdunnen tot 2% v/v en gebruiken voor maïs sterilisatie protocol</td></tr><tr><td>Murashige &amp; Skoog medium, micro en macro elementen. 25 L</td><td>Research Products International</td><td>M10200-25.0</td><td>Verdund tot 0.5x sterkte</td></tr><tr><td>Ethanol, 100%, Deacon Labs</td><td>Fisher scientific</td><td>04-355-451</td><td>Verdund tot 95% v/v</td></tr><tr><td>Spuit 3 mL, luer lock ongesteriliseerd&nbsp; (2 per systeem)</td><td>Fisher scientific</td><td>14-817-117</td><td>Werp de plunjer weg en bewaar alleen de cilinder, vul met glaswol en dek af met folie.</td></tr><tr><td>Glazen bekers, 250 mL&nbsp;</td><td>VWR</td><td>470191-150</td><td>Vijf zijn nodig voor sterilisatie van tarwezaad</td></tr><tr><td>Maïszaad</td><td></td><td></td><td>Genotype gebruikt in dit experiment: Mexico 21&ndash;22 B73XMo17</td></tr><tr><td>Aluminium bakplaat 18" x 26"&nbsp;</td><td>Amazon</td><td>B01FIK54LQ</td><td>Zorg ervoor dat het past op de afmetingen van uw stroomkast</td></tr><tr><td>Natriumchloride</td><td>Fisher scientific</td><td>BP358-1</td><td>Bereid 0.145 M oplossing.</td></tr><tr><td>3D geprinte basis, polymelkzuur (PLA) filament gebruikt (1 per systeem)</td><td>Protolabs</td><td>NA</td><td>Afdrukken en bewerkbare bestanden zijn te vinden in aanvullende materialen. Beschikbare bestanden op Dryad.org DOI https://doi.org/10.5061/dryad.f7m0cfzbc. AUTOCLAVE NIET als PLA werd gebruikt als filament om de basis te produceren. PLA smelt boven 150 &deg;C en kan vervormd raken boven 60 &deg;C. Het wordt aanbevolen dat de integriteit van de PLA 3D geprinte basis wordt getest als deze bij temperaturen boven 40 &deg;C wordt gebruikt. Voor materialen met hogere hittebestendigheid zoals PETG (Polyethyleen tereftalaat Glycol) of PC (polycarbonaat) kan in plaats daarvan worden gebruikt; dit zal de kosten van het onderdeel verhogen en mogelijk nog steeds niet autoclaveerbaar zijn. 3D-printing van de basisprototypen werd voltooid in een persoonlijke printer met bouwvolumes van 256 &times; 256 &times; 256 mm (lengte &times; breedte &times; hoogte). Voor snelheid en kostenefficiëntie raden we aan om in bulk te printen bij lokale commerciële 3D-printserviceproviders. </td></tr><tr><td>Mannelijke luer naar slangbarb fitting 1/8 " ID, dierlijk afgeleide-vrije polypropelene&nbsp; (2 per systeem)</td><td>Cole-Parmer</td><td>EW-50114-69</td><td>Refereert als fitting 1 in het protocol</td></tr><tr><td>Mannelijke slip luer naar slangbarb fitting 1/8 " ID, dierlijk afgeleide-vrije polypropyleen&nbsp; (1 per systeem)</td><td>Cole-Parmer</td><td>EW-50114-63</td><td>Refereert als fitting 2 in het protocol</td></tr><tr><td>201 Roestvrij staal wormwiel slangklemmen, 1 1/2" -3 1/2" klemmotie (1 per systeem)</td><td>Grainger</td><td>5CZF2</td><td>Refereert als slangklemmen in protocol</td></tr><tr><td>Airstream Gen 3 Laminaire stromingskast met eenvoudige schakelaar, afmetingen 24 1/4" x 47 " x 28 1/4 "&nbsp;</td><td>ESCO Lifesciences</td><td>2120707</td><td>Refereert als laminaire stromingskap in protocol. Elke laminaire stromingskap met vergelijkbare afmetingen werkt. Aanpassingen kunnen nodig zijn in kleinere stromingskappen. </td></tr><tr><td>Speelzand, Quikrete Premium. 50 lb</td><td>The Home Depot</td><td>1001709466</td><td>Refereert als zand in protocol</td></tr><tr><td>304 Roestvrij staal geweven draad, 120 maas (1 per systeem)</td><td>Amazon</td><td>B09KRS5F7T</td><td>Refereert als roestvrij stalen draadgaas in artikel. Snijd in 4.7" (11.9 cm) diameter cirkels. Voor hoge doorvoer of cirkelproductie, knip een sjabloon van de cirkel in karton en gebruik deze om cirkels door het gebied van het geweven gaas van het geweven gaas te tekenen en met een schaar te snijden. </td></tr><tr><td>Klei (

assemblage en gebruik van een plant-gnotobiotisch groeisysteem voor plant-microbe interactiestudies in granen

Assembly and Use of a Plant Gnotobiotic Growth System for Plant&#8211;Microbe Interaction Studies in Cereals

Assemblage en gebruik van een plant-gnotobiotisch groeisysteem voor plant-microbe interactiestudies in granen

The development of microbial-based agricultural amendments that work consistently in the field requires an understanding of the molecular mechanisms of ...

Ons onderzoek onderzoekt hoe micro-organismen plantenwortels koloniseren en de veerkracht van planten tegen stress beïnvloeden. Dit protocol kan worden toegepast bij het bestuderen van plant-microbe-interacties in een breed scala aan plantensoorten, die verder gaan dan de traditionele kleine modelplanten.Begin met het pakken van de voor het experiment voorbereide potten en verwijder de plastic dop. Giet 378 milliliters half-sterke Murashige and Skoog medium in de pot. Gebruik voor klei- en zandsubstraten respectievelijk 360 en 350 milliliters om een waterverzadiging van de porieruimte van 70% te bereiken. Plant met een steriele pincet de gesteriliseerde zaden op de juiste diepte. Zaai tarwe op een diepte van 0,5 inches en maïs op een diepte van 1 inch. Plaats de plastic dop terug op de pot en haal de pot vervolgens uit de zuurkast. Als alternatief kunnen steriele, voorgekiemde zaailingen in GNOVA worden gezaaid. Houd na het overbrengen van de pot en de glazen cilinder naar een groeikamer de glazen cilinder met de onderzijde naar beneden dicht bij de pot. Houd de sterilisatiewikkel en de plastic dop vast. Verwijder in één beweging snel de plastic dop van de pot en de sterilisatiewikkel van de glazen cilinder. Plaats de glazen cilinder op de bovenzijde en zet deze op de rand van de 3D-geprinte basis. Kweek tarwe bij 22 degrees Celsius overdag en 16 degrees Celsius 's nachts onder fluorescentieverlichting met een fotoperiode van 12 uur. Handhaaf voor maïs 27 degrees Celsius overdag en 23 degrees Celsius 's nachts onder dezelfde omstandigheden.Bevestig een lang stuk siliconen slang aan de flessen bovenop-dispenser. Plaats de vlam in de buurt van de irrigatieleiding. Verwijder de spuitcilinder uit de irrigatieleiding en de filterhouder. Houd alle slanguiteinden binnen de vlamzone. Bevestig de filterhouder aan de irrigatieleiding. Verbind de twee spuitcilinders. Verbind vervolgens het lange stuk slang dat aan de flessen bovenop-dispenser is bevestigd met de onderste poort van de filterhouder. Doseer 150 milliliters half-sterke Murashige and Skoog-media. Scheid de twee spuitcilinders. Koppel de siliconen slang los van de filterhouder en ontkoppel de filterhouder van de irrigatieleiding. Vervang deze door één spuitcilinder.Gebruik een irrigatiestrategie met 10% bleek bij grote experimenten met meer dan 50 monsters om de doorvoersnelheid van het bewateren te verhogen. Schenk een 10% volume-per-volume bleekoplossing in twee kleine plastic bekers. Plaats de bekers bij de irrigatielijn en verwijder de spuitcilinder uit de irrigatielijn. Dompel de uiteinden van de slang onder in een 10% bleekoplossing tot ze nodig zijn. Verwijder de spuitcilinder uit de filterhouder. Dompel alle uiteinden van de slangen onder in de 10% bleekoplossing tot ze nodig zijn. Schud het overtollige bleekoplossing eraf. Bevestig de filterhouder aan de irrigatielijn van de potten. Verbind het lange stuk slang dat aan de flesdispenser is gekoppeld met de onderste poort van de filterhouder. Doseer 150 milliliters halfsterke Murashige and Skoog-medium. Koppel het lange stuk siliconen slang los van de onderste poort van de filterhouder. Vervang het filter in de irrigatielijn door een spuitcilinder nadat het overtollige bleek is verwijderd. Als het irrigatievolume verandert, gebruik dan ongeveer 20 milliliters medium om de lijn te primen.Pas het oogstprotocol aan om het af te stemmen op de specifieke onderzoeksdoelen en het volume van de monsters dat wordt verwerkt. Verwijder de glazen cilinder uit de pot. Plaats de pot snel in de laminaire flowkast en haal deze van de 3D-geprinte basis af. Houd de plant bij de basis vast en giet het bodemsubstraat in een container. Verwijder voorzichtig grote kluiten aarde van de wortels. Indien nodig kunnen bodemmonsters worden verzameld in overeenstemming met de specifieke onderzoeksdoelstellingen. Scheid de scheuten van de wortels met een steriele schaar. Noteer het natgewicht van de scheut. Reinig de wortels door ze voorzichtig te schudden in een bekerglas met gedeïoniseerd water. Dep de wortels droog. Noteer het natgewicht van de wortel en verzamel, indien nodig, wortelmonsters volgens de specifieke onderzoeksdoelstellingen.Tarwe en maïs bereikten een kiempercentage van 100% binnen GNOVA, terwijl in het zakkensysteem tarwe een kiempercentage van 67% en maïs een kiempercentage van 75% bereikte na twee weken. Tarwe gekweekt in GNOVA bereikte Zadok-groeistadium 13, terwijl tarwe gekweekt in het zakkensysteem in Zadok-groeistadium 11 bleef. In week 5 bereikte tarwe binnen GNOVA Zadok-groeistadium 21, zoals aangegeven door de verschijning van zijscheuten, terwijl zijscheuten afwezig waren in het zakkensysteem en de planten in Zadok-groeistadium 13 bleven. Na 12 weken groei in GNOVA vertoonden de tarweplanten meer chlorotische bladeren en was de glazen cilinder gevuld met plantbiomassa. Wanneer de tarweplanten nog twee weken extra in GNOVA werden gekweekt, was er geen merkbare toename in biomassa. De groei van maïs werd gedurende vier weken binnen GNOVA beoordeeld en vergeleken met maïs gekweekt in zakken. De verse biomassa van maïs gekweekt in GNOVA nam met 593% toe ten opzichte van die in het zakkensysteem. Maïs gekweekt binnen GNOVA had een significant grotere scheut- en wortellengte dan maïs gekweekt in het zakkensysteem.Dit protocol stelt onderzoekers in staat om plant-microbe-interacties onder gecontroleerde omstandigheden te bestuderen en causaliteit vast te stellen tussen microbiële effectoren en plantresponsies. Het meest uitdagende aspect van dit protocol is de zorgvuldige behandeling van de bewateringslijnen om de steriliteit te waarborgen. Toekomstige studies kunnen dit systeem combineren met synthetische microbiële gemeenschappen om effectoren die de plantengroei bevorderen te identificeren en mechanismen van de assemblage van microbiële gemeenschappen te onderzoeken.

assembly-use-plant-gnotobiotic-growth-system-for-plantmicrobe

Research

JoVE Journal

Biology

Biologie

We brengen verslag uit een methode voor de introductie, tracking en kwantitatieve analyse van de GFP expressie in plantencellen. Deze methode maakt gebruik van een speciaal ontworpen robotica systeem voor semi-continue foto collectie van grote aantallen monsters, in de tijd. We tonen ook aan het gebruik van ImageJ en ImageReady voor de analyse van foto-serie.

Robotica en Dynamic Image Analysis voor Studies van genexpressie in plantenweefsels

We zullen zien hoe het effect van een enkele puntmutatie op de functie van een ionkanaal studie.

Mutagenese en Functionele analyse van ionenkanalen heteroloog Uitgedrukt in zoogdiercellen

Clathrine-gemedieerde endocytose afhankelijk van de adapter eiwitten die lading selectie en clathrine vacht montage coördineren. Hier beschrijven we de procedures voor adapter-clathrine fysieke interactie en live cell imaging methoden gebruikt als een model de gist endocytische adapter eiwit Sla1p bestuderen.

In vivo en in vitro studies van Adapter-clathrine Interactie

Een automatische methode om geschikte hydrofobe interactie chromatografie (HIC) media te gebruiken in het proces van eiwitzuivering gepresenteerd. De werkwijze maakt gebruik van een medium-druk vloeistof chromatografie systeem met automatische buffer mengen dynamische monsterlus injectie opeenvolgende kolomselektiemiddelen, multi-golflengte analyse en split fractie eluaat collectie.

Geautomatiseerde hydrofobe interactiechromatografie Kolomselectieopties voor gebruik in Protein Purification

We methode om te evalueren hoe predatie risico kan de chemische kwaliteit van herbivoor prooi te veranderen door het induceren van veranderingen in het dieet op de eisen van verhoogde stress te voldoen, en hoe de ontbinding van karkassen van deze stress herbivoren vertraagt ​​latere fabriek strooiselafbraak door de bodem microben.

Linking predatierisico, Herbivore fysiologische stress-en Microbiële afbraak van Plant Litter

Het Lateral Root Inducible System (LRIS) maakt gelijktijdige inductie van laterale wortels mogelijk en wordt gepresenteerd voor Arabidopsis thaliana en maïs.

Laterale Root Induceerbare System in<em&gt; Arabidopsis</em&gt; En maïs

Hier, twee medium-throughput assays voor de beoordeling van effecten op Ca2 +-signalering en Acrosoom reactie in het menselijk sperma worden beschreven. Deze tests kunnen worden gebruikt om te sluiten snel en eenvoudig grote hoeveelheden compounds voor effecten op Ca2 +-signalering en Acrosoom reactie in het menselijk sperma.

Medium-throughput Screening tests voor de beoordeling van effecten op Ca2 +-signalering en Acrosoom reactie in het menselijk sperma

Dit protocol illustreert een cel inkapseling methode door snelle fysieke gelatie van alginaat om cellen te immobiliseren. Verkregen microbeads laten gecontroleerde en aanhoudende secretie van amyloid-β toe na verloop van tijd en kunnen worden gebruikt om de effecten van uitgescheiden amyloid-β in in vitro en in vivo modellen te bestuderen.

Vervaardiging van amyloid-β-afscheidende alginaat Microbeads voor gebruik bij de modellering van de ziekte van Alzheimer

Dit protocol wordt gebruikt bij het vaststellen en onderhouden van gnotobiotische Amerikaanse kakkerlakken (Periplaneta americana) door de eigevallen (oothecae) vóór het uitkomen te steriliseren. Deze gnotobiotische insecten bevatten hun verticaal overgedragen Blattabacterium endosymbionts maar hebben axenische darmen.

Oprichting en onderhoud van Gnotobiotische Amerikaanse kakkerlakken (Periplaneta americana)

Hier presenteren we een methode om de vorming van ternaire complexen tussen drie eiwitpartners te visualiseren met behulp van fluorescerende gelabelde eiwitten door biFC-gebaseerde FRET-FLIM-assay. Deze methode is waardevol voor het bestuderen van eiwit-eiwitinteractiecomplexen in vivo.

Bepaling van de tripartiete interactie tussen twee monomeren van een MADS-box transcriptiefactor en een calciumsensoreiwit door BiFC-FRET-FLIM-assay

Ontdek het GNOVA-gnotobiotische systeem voor het kweken van granen zoals tarwe en maïs onder gecontroleerde microbiele omstandigheden. Dit systeem maakt geavanceerde studies van plant-microbe interacties mogelijk.

Assemblage en gebruik van een plant-gnotobiotisch groeisysteem voor plant-microbe interactiestudies in granen

Meer video's verkennen