ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol>
	<li>Almansour, N. M. Triple-negative breast cancer: brief review about epidemiology, risk factors, signaling pathways, treatment and role of artificial intelligence. Front Mol Biosci. 9, 836417 (2022).</li>
	<li>Nedeljkovic, M., Damjanovic, A. Mechanisms of chemotherapy resistance in triple-negative breast cancer-how we can rise to the challenge. Cells. 8 (9), 957 (2019).</li>
	<li>Bianchini, G., Balko, J. M., Mayer, I. A., Sanders, M. E., Gianni, L. Triple-negative breast cancer: challenges and opportunities of a heterogeneous disease. Nat Rev Clin Oncol. 13 (11), 674&#8211;690 (2016).</li>
	<li>Holohan, C., Van Schaeybroeck, S., Longley, D. B., Johnston, P. G. Cancer drug resistance: an evolving paradigm. Nat Rev Cancer. 13 (10), 714&#8211;726 (2013).</li>
	<li>Flavahan, W. A., Gaskell, E., Bernstein, B. E. Epigenetic plasticity and the hallmarks of cancer. Science. 357 (6348), eaal2380 (2017).</li>
	<li>Beretta, G. L. et al. Novel insights into taxane pharmacology: update on drug resistance mechanisms, immunomodulation and drug delivery strategies. Drug Resist Updat. 81, 101223 (2025).</li>
	<li>Sajid, A., Rahman, H., Ambudkar, S. V. Advances in the structure, mechanism and targeting of chemoresistance-linked ABC transporters. Nat Rev Cancer. 23 (11), 762&#8211;779 (2023).</li>
	<li>Szakacs, G., Paterson, J. K., Ludwig, J. A., Booth-Genthe, C., Gottesman, M. M. Targeting multidrug resistance in cancer. Nat Rev Drug Discov. 5 (3), 219&#8211;234 (2006).</li>
	<li>Robey, R. W. et al. Revisiting the role of ABC transporters in multidrug-resistant cancer. Nat Rev Cancer. 18 (7), 452&#8211;464 (2018).</li>
	<li>Chen, Z. et al. Mammalian drug efflux transporters of the ATP binding cassette (ABC) family in multidrug resistance: review of the past decade. Cancer Lett. 370 (1), 153&#8211;164 (2016).</li>
	<li>You, D., Richardson, J. R., Aleksunes, L. M. Epigenetic regulation of multidrug resistance protein 1 and breast cancer resistance protein transporters by histone deacetylase inhibition. Drug Metab Dispos. 48 (6), 459&#8211;480 (2020).</li>
	<li>Shalem, O., Sanjana, N. E., Zhang, F. High-throughput functional genomics using CRISPR-Cas9. Nat Rev Genet. 16 (5), 299&#8211;311 (2015).</li>
	<li>Doench, J. G. Am I ready for CRISPR? User&#39;s guide to genetic screens. Nat Rev Genet. 19 (2), 67&#8211;80 (2018).</li>
	<li>Yedier-Bayram, O. et al. EPIKOL, chromatin-focused CRISPR/Cas9-based screening platform, to identify cancer-specific epigenetic vulnerabilities. Cell Death Dis. 13 (8), 710 (2022).</li>
	<li>Gottesman, M. M., Lavi, O., Hall, M. D., Gillet, J. P. Toward better understanding of the complexity of cancer drug resistance. Annu Rev Pharmacol Toxicol. 56, 85&#8211;102 (2016).</li>
	<li>Theile, D., Staffen, B., Weiss, J. ATP-binding cassette transporters as pitfalls in selection of transgenic cells. Anal Biochem. 399 (2), 246&#8211;250 (2010).</li>
	<li>Yedier-Bayram, O. et al. Chromatin-focused genetic and chemical screens identify BRPF1 as a targetable vulnerability in Taxol-resistant triple-negative breast cancer. Exp Mol Med. 57 (6), 1294&#8211;1307 (2025).</li>
	<li>Gokbayrak, B. et al. Identification of selective SWI/SNF dependencies in enzalutamide-resistant prostate cancer. Commun Biol. 8 (1), 169 (2025).</li>
	<li>Kala, E. Y. et al. Functional genomic screens reveal RBBP4 as key regulator of cell cycle progression in TMZ-resistant glioblastoma. bioRxiv. doi:10.1101/2025.05.09.653010 (2025).</li>
	<li>Chan, K., Tong, A. H. Y., Brown, K. R., Mero, P., Moffat, J. Pooled CRISPR-based genetic screens in mammalian cells. J Vis Exp. 151, e59780 (2019).</li>
	<li>Yuan, Y. et al. Genome-wide CRISPR screen for unveiling radiosensitive and radioresistant genes. J Vis Exp. 219, e67982 (2025).</li>
	<li>Stewart, C., Manriquez Roman, C., Kenderian, S. S. Performing an in vitro genome-wide CRISPR knockout screen in chimeric antigen receptor T cells. J Vis Exp. 215, e67338 (2025).</li>
	<li>Joung, J. et al. Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout and transcriptional activation screening. Nat Protoc. 12 (4), 828&#8211;863 (2017).</li>
	<li>Li, W. et al. MAGeCK enables robust identification of essential genes from genome-scale CRISPR/Cas9 knockout screens. Genome Biol. 15 (12), 554 (2014).</li>
	<li>McDermott, M. et al. In vitro development of chemotherapy and targeted therapy drug-resistant cancer cell lines: practical guide with case studies. Front Oncol. 4, 40 (2014).</li>
	<li>Hart, T. et al. High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and genotype-specific cancer liabilities. Cell. 163 (6), 1515&#8211;1526 (2015).</li>
	<li>Meyers, R. M. et al. Computational correction of copy number effect improves specificity of CRISPR-Cas9 essentiality screens in cancer cells. Nat Genet. 49 (12), 1779&#8211;1784 (2017).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>100 mm plate</td><td>Corning</td><td>353003</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>45 &micro;m filter&nbsp;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>SLHVM33RS</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>6 well plate</td><td>Corning</td><td>3506</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>96-well black clear bottom plates</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>CLS356259</td><td>Voor CellTiter-Glo Luminescent Cell Viability Assay</td></tr><tr><td>Blasticidin</td><td>Thermo Fisher</td><td>A1113903</td><td>Voor selectie</td></tr><tr><td>CellTiter-Glo luminescent cell viability assay</td><td>CellTiter-Glo, Promega</td><td>G7570</td><td>Voor CellTiter-Glo Luminescent Cell Viability Assay</td></tr><tr><td>DMEM</td><td>Gibco</td><td></td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>DMSO</td><td>PanReac AppliChem</td><td>A3672,0050</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>FBS</td><td>Gibco</td><td>16140071</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>Ham&rsquo;s F12 nutrient mix</td><td>Gibco</td><td>11765054</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>HEK293T cells</td><td></td><td></td><td>Vriendelijk verstrekt door Robert Weinberg (MIT, Boston, USA).</td></tr><tr><td>HEPES</td><td>Thermo Fisher</td><td>15630080</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>Hydrocortisone</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>H4001-1G</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>Insulin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>I9278-5ML</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>LentiCas9-blast</td><td>Addgene&nbsp;</td><td>#52962</td><td>Voor Cas9-stabiele cellijngeneratie</td></tr><tr><td>LentiGuide-Puro&nbsp;</td><td>Addgene&nbsp;</td><td>#52963</td><td>Backbone voor gRNA klonering&nbsp;</td></tr><tr><td>MN NucleoSpin tissue kit</td><td>Macherey-Nagel</td><td>740952.5</td><td>Voor genomische DNA extractie</td></tr><tr><td>PBS</td><td>Gibco&nbsp;</td><td>10010023</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>Penicillin-Streptomycin</td><td>Gibco</td><td>15140122</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>pLentiCRISPR v2&nbsp;</td><td>Addgene&nbsp;</td><td>#52961</td><td>Backbone voor gRNA klonering&nbsp;</td></tr><tr><td>Polyethyleenglycol (PEG)-8000</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P2139-500G</td><td>Voor lentiviruconcentratie</td></tr><tr><td>Polyethyleeniminee, lineair (PEI)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>765090-1G</td><td>Voor lentiviruproductie</td></tr><tr><td>Protaminesulfaat (PS)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P4380-25G</td><td>Voor lentiviruinfectie</td></tr><tr><td>psPAX2</td><td>Addgene&nbsp;</td><td># 12260</td><td>Voor lentiviruproductie</td></tr><tr><td>Puromycin</td><td>Thermo Fisher</td><td>A1113803</td><td>Voor selectie</td></tr><tr><td>SUM159PT adherent cells</td><td></td><td></td><td>Vriendelijk verstrekt door Robert Weinberg (MIT, Boston, USA).</td></tr><tr><td>Taxol</td><td>Paclitaxel, Sigma</td><td>PHR1803-200MG</td><td>Voor res celgeneratie en onderhoud</td></tr><tr><td>Trypsin-EDTA (0.05%)</td><td>Gibco&nbsp;</td><td>25300054</td><td>Celcultuur</td></tr><tr><td>Verapamil</td><td>Selleck Chemicals</td><td>S4202</td><td>Voor selectie</td></tr><tr><td>VSV-G</td><td>Addgene&nbsp;</td><td># 8454</td><td>Voor lentiviruproductie</td></tr></tbody></table>

epigenoom-brede crispr-cas9-gebaseerde knockout-screens op chemoresistente cellen

Epigenome-Wide CRISPR-Cas9-Based Knockout Screens on Chemoresistant Cells

Epigenoom-brede CRISPR-Cas9-gebaseerde knockout-screens op chemoresistente cellen

Chemotherapy resistance remains a major challenge in cancer treatment, driven by cancer cells&#39; ability to acquire adaptive properties, rewire ...

We onderzoeken epigenetische mechanismen die chemoresistentie in triple-negatieve borstkanker aansturen met behulp van CRISPR-gebaseerde screeningsbenaderingen. Begin met het aanpassen van circa 159 PT adherente cellen naar 2 × 10³ cellen per putje in 96-wells zwart-transparante bodemplaten met Ham's F-12 Nutrient Mix, aangevuld met de gepresenteerde componenten. Incubeer de cellen gedurende 16 uur in een celkweekincubator bij 37 °C en 5% CO₂.Bereid vervolgens een Taxol-stockoplossing voor, opgelost in dimethylsulfoxide of DMSO. Om de cellen te behandelen, worden seriële verdunningen van Taxol in cultuurmedium gemaakt, variërend van 0,3 nanomolar tot 10 micromolar, waarbij DMSO alleen als vehikelcontrole wordt gebruikt. Behandel de cellen in triplo met 200 microliters van toenemende doses Taxol.Laat de plaat 72 uur in een celkweekincubator staan bij 37 graden Celsius met 5% koolstofdioxide. Beoordeel na 72 uur drugbehandeling de celviabiliteit met behulp van een luminescentie-gebaseerde ATP-kwantificatie-assay. Meet de luminescentie met een microplatelezer en normaliseer de resultaten ten opzichte van de DMSO-controlewaarden.Bereken vervolgens de 10% en 50% inhibitiestofconcentratiewaarden met behulp van niet-lineaire regressie met een logistisch dosis-responsmodel met vier parameters in geschikte statistische software. Om de generatie van chemoresistente cellen te starten, zaai 2 × 10⁵ 159 PT-cellen per put in zes-wells platen. Incubeer deze vervolgens gedurende de nacht bij 37 °C met 5% CO2.Behandel de cellen de volgende dag gedurende 72 uur met inhibitieconcentraties van 10% of 50% Taxol in twee milliliter kweekmedium. Als de cellen de huidige drugconcentratie tolereren, worden ze verdeeld over twee wells. Houd één well aan als reservecontrole met vers medium en verdubbel de Taxol-concentratie in de andere well.Tijdens het genereren van resistente cellen worden de ouderlijke cellen als controle gepasseerd in medium dat DMSO bevat, waarbij het DMSO-volume wordt aangepast om overeen te komen met de hoeveelheid in de corresponderende Taxol-behandeling. Meet elke drie tot vier weken de celviabiliteit totdat er een significant verschil in de 50% inhiberende concentratiewaarden wordt waargenomen tussen de ouderlijke en de resistente cellijnen. Houd de stabiele resistente cellen in stand bij de uiteindelijke Taxol-concentratie die tijdens de dosisescalatie is gebruikt.Voer voor de karakterisering van resistente cellen RNA-sequencing, Western blotting, qPCR en celviabiliteitsassays uit in aanwezigheid van het geneesmiddel. Zaai enkele 159 PT Taxol-resistente en parentale cellen in triplicaat uit in zwarte 96-wells platen met een transparante bodem met 2 × 10³ cellen per well. Incubeer de cellen overnacht bij 37 °C met 5% CO₂.Behandel de cellen met tweevoudige seriële verdunningen van verapamil, variërend van 80 micromolar tot 1,25 micromolar, terwijl een constante Taxol-concentratie over alle behandelingscondities wordt gehandhaafd. Beoordeel na 72 uur behandeling de celviabiliteit met behulp van een luminescentie-gebaseerde ATP-kwantificatie-assay. Bepaal de verapamil-concentratie die de celviabiliteit behoudt terwijl de gevoeligheid in resistente cellen wordt hersteld.Om de puromycineconcentratie te bepalen die in combinatie met verapamil moet worden gebruikt, zaait u een aantal 159 PT Taxol-resistente cellen in een 96-wellplaat met 2 × 10³ cellen per well. Incubeer de plaat gedurende 16 uur bij 37 °C en 5% CO2. Bereid tweevoudige seriële verdunningen van puromycine, variërend van 40 tot 0,625 µg/mL, in medium dat de eerder bepaalde verapamilconcentratie bevat.Behandel de cellen dienovereenkomstig gedurende 72 uur met de puromycinediluties. Stel na de levensvatbaarheidsassay de laagste puromycineconcentratie vast die de levensvatbaarheid reduceert tot 5% of minder in aanwezigheid van verapamil. Gebruik vervolgens enkele 159 PT Taxol-resistente cellen om de virustitratie en de multiplicity of infection te berekenen.Voeg het berekende volume Cas9-lentivirus, gebaseerd op de gewenste multiplicity of infection, direct toe aan de cellen in kweekmedium dat acht microgram per milliliter protaminesulfaat bevat. Vervang het virale medium 16 uur na infectie door vers medium. Pas de volgende dag blasticidine-selectie toe door het kweekmedium te vervangen door medium dat de eerder bepaalde concentratie blasticidine bevat.Zet de selectie voort totdat niet-geïnfecteerde cellen zijn geëlimineerd. Valideer de Cas9-activiteit met controle-single guide RNA's voor essentiële genen of gebruik GFP als reporter om de knockout-efficiëntie te beoordelen. Bereken het aantal succesvol geïnfecteerde cellen dat nodig is om de gewenste bibliotheekdekking te bereiken met behulp van de gepresenteerde vergelijking.Bereid onafhankelijke infectiemengsels voor voor elk biologisch replicaat. Nadat de eerder berekende cellen zijn uitgezaaid, worden deze geïnfecteerd met een bepaald viraal volume in acht milliliters compleet kweekmedium dat acht microgram per milliliter protaminesulfaat bevat. Vervang na 16 uur het virale medium door vers medium en incubeer de cellen bij 37 °C met 5% koolstofdioxide.Pas puromycineselectie toe in aanwezigheid van verapamil bij de eerder vastgestelde concentraties om sg-RNA-geïnfecteerde cellen te verrijken in sommige 159 PT Taxol-resistente cellen. Ga door met de selectie totdat alle cellen in de niet-geïnfecteerde controleplaat zijn geëlimineerd. Gewoonlijk duurt dit ongeveer drie dagen.Na voltooiing van de selectie met puromycine en verapamil, trypsiniseer de cellen en verzamel een initiële tijdspanne, een celpellet bij tijd nul, van elk biologisch replica dat overeenkomt met het tijdens de transductie besloten dekkingsniveau. Verdeel de cellen over de experimentele armen, waarbij de dekking behouden blijft. Eén arm dient als controle met DMSO.En de andere als de behandeling met Taxol. Houd de culturen gedurende 14 tot 16 populatiedubbelingen in stand. Bereken het niveau van de populatiedubbeling met behulp van de opgegeven formule.Controleer bij elke passage de celviabiliteit en de groeikinetiek. Handhaaf voldoende celaantallen om bottlenecks te voorkomen. Zodra het gewenste populatieverdubbelingsniveau is bereikt, worden de pellets van het laatste tijdspunt verzameld voor elk replicaat en elke conditie, waarbij de bibliotheekdekking per pellet behouden blijft.Bewaar de pellets bij 80 graden Celsius tot aan de daaropvolgende extractie van genomisch DNA. De resistente cellen bleven prolifereren, ondanks de Taxol-behandeling, terwijl de ouderlijke cellen niet overleefden onder dezelfde behandeling. RNA-sequencing identificeerde ABCB1 als een van de meest gereguleerde genen in resistente cellen, gevolgd door andere ABC-transporters, waaronder ABCB4 en ABCA5.De upregulatie van de ABCB1-expressie in resistente cellen werd gevalideerd via kwantitatieve PCR. Taxol-resistente cellen vertoonden een multi-drug resistentie-fenotype en resistentie tegen doxorubicine en vincristine. Puromycineselectie is mogelijk niet efficiënt in resistente cellen, omdat puromycine kan worden uitgepompt via ABCB1-gemedieerde drug efflux.Verapamil alleen had geen effect op de celviabiliteit. Echter, wanneer het gecombineerd werd met chemotherapeutische middelen, herstelde verapamil de gevoeligheid voor deze middelen. Niet-toxische doses verapamil herstelden ook de puromycinesensitiviteit in Taxol-resistente cellen.Wanneer monsters van het eindtijdstip van de DMSO- of Taxol-behandelde condities werden vergeleken met het initiële tijdstip, waren bijna alle essentiële genen uitgeput na knockout, wat de kwaliteit van de screening bevestigt. In tegenstelling hiermee toonde de vergelijking van DMSO-behandelde en Taxol-behandelde eindmonsters geen uitputting van essentiële genen, aangezien deze genen in beide groepen essentieel blijven. In plaats daarvan onthult deze vergelijking epigenetische modifiers die de gevoeligheid voor Taxol verhogen.Meerdere positieve controlegenen en epigenetische modifiers waren significant verarmd in de EPIKOL-screen uitgevoerd in Taxol-resistente cellen. Single guide RNA's gericht tegen ABCB1 waren specifiek verarmd in de met Taxol behandelde groep, wat bevestigt dat ABCB1 een positieve controle is voor Taxol-gevoeligheid in de screen. Dit protocol stelt onderzoekers in staat om therapieresistentie in kankermodellen te bestuderen en epigenetische regulatoren van chemotherapieresistentie te identificeren met behulp van CRISPR-screeningplatforms.De belangrijkste overweging bij het screenen van chemioresistente cellen is het behouden van de bibliotheekrepresentatie en het optimaliseren van de transactie- en selectiecondities. Toekomstig werk zal therapeutische kwetsbaarheden van multidrugresistente kankercellen identificeren en nieuwe combinatorische benaderingen ontwikkelen om chemioresistentie te overwinnen.

epigenome-wide-crispr-cas9-based-knockout-screens-on-chemoresistant

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Kankeronderzoek

Dit protocol laat zien hoe fluorescent gemerkt, genetisch bepaald klonale tumoren in de Drosophila oog / antennaal verbeelding schijven (EAD) te genereren. Het beschrijft hoe de EAD en de hersenen ontleden van de derde instar larven en hoe ze te verwerken te visualiseren en te kwantificeren genexpressie veranderingen en tumor invasiviteit.

De<em&gt; Drosophila</em&gt; Imaginal Disc Tumor Model: visualisatie en kwantificering van genexpressie en Tumor Invasiviteit met behulp van genetische Mozaïeken

We presenteren een nieuwe aanpak karakteriseren van tumorcellen. We immunofluorescentie gecombineerd met DNA TL -in-situ-hybridisatie te evalueren van cellen gevangen genomen door een functionalized medische draad staat in vivo verrijken CTCs rechtstreeks uit bloed van de patiënt.

Karakterisering van tumorcellen met behulp van een medische draad voor het vastleggen van de circulerende tumorcellen: een 3D aanpak gebaseerd op immunofluorescentie en DNA vis

Momenteel is de methode van keuze voor gehaltebepaling eiwit expressie immunefluorescentie kleuring op vaste cellen wanneer morfologische ook noodzakelijk is. Dit protocol gepresenteerd hierin voorziet in een alternatieve methode van immunocytochemie op cel paraffine-ingebedde blokken.

Bepaling van eiwit expressie niveau in gekweekte cellen door immunocytochemie op cel paraffine-ingebedde blokken

Uit te breiden het vermogen van laboratoria wereldwijd te beoordelen van de subsidiabiliteit van de patiënten met longkanker voor behandeling met pembrolizumab, op een betrouwbare en reproduceerbare wijze, ontwikkelden we een bepaling die gebruikmaakt van het 22C 3 antilichaam concentraat op een overal verkrijgbaar immunohistochemische autostainer, voor zowel biopsie en cytologie specimens.

Met behulp van 22C 3 Anti-PD-L1 antilichaam concentreren op biopsie en cytologie monsters van niet-kleincellige longkanker kankerpatiënten

Een HMCA gebaseerde imaging plaat wordt gepresenteerd voor invasie assay prestaties. Deze plaat vergemakkelijkt de vorming van driedimensionale (3D) tumor spheroïden en het meten van kanker cel invasie in de extracellulaire matrix (ECM). De invasie assay kwantificering wordt bereikt door semi-automatische analyse.

Analyse van kanker cel invasie en anti-metastatische Drug Screening met behulp van Hydrogel Micro-kamer Array (HMCA)-op basis van platen

Dit manuscript wordt een geclusterde regelmatig Interspaced korte palindromische herhaalt (CRISPR) CRISPR-Cas9-gebaseerde methode voor eenvoudige en snelle onderzoek van de rol van meerdere kandidaat-genen in Acute myeloïde leukemie (AML) celproliferatie in beschreven parallel. Deze techniek is schaalbaar en kan worden toegepast in andere kanker cel beeldlijnen.

Onderzoek naar genetische afhankelijkheden met behulp van CRISPR-Cas9-concurrentie op basis van testen

Hier presenteren we een eenvoudig te gebruiken co-cultuurtest om glioblastoom (GBM) migratie op neuronen met patronen te analyseren. We ontwikkelden een macro in FiJi-software voor eenvoudige kwantificering van GBM-celmigratie op neuronen en merkten op dat neuronen GBM-celinvasieve capaciteit wijzigen.

Co-cultuur van Glioblastoom Stam-achtige cellen op patroonneuronen om migratie en cellulaire interacties te bestuderen

Hier demonstreren we een methode om vochtscheringsspanning toe te passen op kankercellen in suspensie om de effecten van hemodynamische stress op circulerende tumorcellen te modelleren.

Modelleren van de effecten van hemodynamische stress op circulerende tumorcellen met behulp van een spuit en naald

Dit protocol beschrijft de isolatie van dubbelnegatieve thymocyten uit de thymus van de muis, gevolgd door retrovirale transductie en co-cultuur op het delta-achtige 4-tot expressie brengende beenmerg stromale cellijn co-cultuursysteem (OP9-DL4) voor verdere functionele analyse.

Co-cultuur en transductie van murine thymocyten op delta-achtige 4-tot expressie brengende stromale cellen om oncogenen in T-cel leukemie te bestuderen

Dit protocol beschrijft de orthotope implantatie van kankercellen van patiënten in de blindedarmwand van immunodeficiënte muizen. Het model recapituleert gevorderde uitgezaaide ziekte van colorectale kanker en maakt de evaluatie van nieuwe therapeutische geneesmiddelen mogelijk in een klinisch relevant scenario van long- en levermetastasen.

Orthotope implantatie van patiënt-afgeleide kankercellen bij muizen recapituleert gevorderde colorectale kanker

Koç University School of Medicine.  Hier presenteren we een protocol voor het genereren van chemoresistente cellen met behulp van een dosis-escalatie-methode, gevolgd door een CRISPR/Cas9-gebaseerde screen met een gerichte sgRNA-bibliotheek die epigenetische modifiers gebruikt om regulatoren van verworven chemoresistentie te identificeren. Het protocol biedt ook meerdere optimalisatiepunten die zijn afgestemd op chemoresistente celmodellen, en biedt een robuust kader voor o...

Epigenoom-brede CRISPR-Cas9-gebaseerde knockout-screens op chemoresistente cellen

Meer video's verkennen