Name: Kwantificatie van embryonale dodelijkheidsgraad bij Caenorhabditis elegans (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-06-12T15:15:00.000+00:00
Duration: 11 min 35 s
Description: Leer een eenvoudige, kosteneffectieve methode om embryonale dodelijkheid te kwantificeren bij Caenorhabditis elegans zonder gespecialiseerde apparatuur. Dit protocol is toegankelijk voor beginners en geschikt voor diverse experimentele toepassingen.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

<ol>
	<li>Corsi A. K., Wightman B., Chalfie M. A Transparent window into biology: A primer on Caenorhabditis elegans. WormBook Online Rev C Elegans. Biol. 2015; doi/10.1895/wormbook.1.177.1.</li>
	<li>Kwah J. K., Jaramillo-Lambert A. Measuring Embryonic viability and brood size in Caenorhabditis elegans. J Vis Exp. 2023;192:e65064.</li>
	<li>Harlow P. H. et al. The nematode Caenorhabditis elegans. as a tool to predict chemical activity on mammalian development and identify mechanisms influencing toxicological outcome. Sci Rep. 2016;6:22965.</li>
	<li>Wang S. et al. A high-content imaging approach to profile C. elegans. embryonic development. Development. 2019;146(7):dev174029.</li>
	<li>Mendoza A. D., Woodruff T. K., Wignall S. M., O&#8217;Halloran T. V. Zinc availability during germline development impacts embryo viability in Caenorhabditis elegans. Comp Biochem Physiol Toxicol Pharmacol CBP. 2017;191:194&#8211;202.</li>
	<li>Baris Atakan H., Alkanat T., Cornaglia M., Trouillon R., Gijs M. A. M. Automated phenotyping of Caenorhabditis elegans. embryos with a high-throughput-screening microfluidic platform. Microsyst Nanoeng. 2020;6:24.</li>
	<li>Guan G., Zhao Z., Tang C. Delineating the mechanisms and design principles of Caenorhabditis elegans. embryogenesis using in toto high-resolution imaging data and computational modeling. Comput Struct Biotechnol J. 2022;20:5500&#8211;15.</li>
	<li>Zipperlen P., Fraser A. G., Kamath R. S., Martinez-Campos M., Ahringer J. Roles for 147 embryonic lethal genes on C. elegans. chromosome I identified by RNA interference and video microscopy. EMBO J. 2001;20(15):3984&#8211;92.</li>
	<li>Kamath R. S. et al. Systematic functional analysis of the Caenorhabditis elegans. genome using RNAi. Nature. 2003;421(6920):231&#8211;7.</li>
	<li>Bergwell M. et al. A primary microcephaly-associated sas-6 mutation perturbs centrosome duplication, dendrite morphogenesis, and ciliogenesis in Caenorhabditis elegans. Genetics. 2023;224(4):iyad105.</li>
	<li>Stiernagle T. Maintenance of C. elegans. WormBook Online Rev C Elegans. Biol. 2006;1&#8211;1.</li>
	<li>S&#246;nnichsen B. et al. Full-genome RNAi profiling of early embryogenesis in Caenorhabditis elegans. Nature. 2005;434(7032):462&#8211;9.</li>
	<li>Bolker, B. M. Ecological models and data in R. Princeton University Press. Princeton, NJ (2008); ISBN9780691125220.</li>
	<li>Sulston J. E., Schierenberg E., White J. G., Thomson J. N. The embryonic cell lineage of the nematode Caenorhabditis elegans. Dev Biol. 1983;100(1):64&#8211;119.</li>
	<li>Giunti S., Blanco M. G., De Rosa M. J., Rayes D. The ketone body &#946;-hydroxybutyrate ameliorates neurodevelopmental deficits in the GABAergic system of daf-18/PTEN Caenorhabditis elegans. mutants. eLife. 2024;13:RP94520.</li>
	<li>Choi B., Kang J., Park Y. S., Lee J., Cho N. J. A possible role for FRM-1, a C. elegans. FERM family protein, in embryonic development. Mol Cells. 2011;31(5):455&#8211;9.</li>
	<li>Wong A., Boutis P., Hekimi S. Mutations in the clk-1 gene of Caenorhabditis elegans. affect developmental and behavioral timing. Genetics. 1995;139(3):1247&#8211;59.</li>
	<li>Libina N., Berman J. R., Kenyon C. Tissue-specific activities of C. elegans. DAF-16 in the regulation of lifespan. Cell. 2003 Nov;115(4):489&#8211;502.</li>
	<li>Bayer E. A. et al. Insulin signaling and osmotic stress response regulate arousal and developmental progression of C. elegans. at hatching. Genetics. 2022;220(1):iyab202.</li>
	<li>Muschiol D., Schroeder F., Traunspurger W. Life cycle and population growth rate of Caenorhabditis elegans. studied by a new method. BMC Ecol. 2009;9:14.</li>
	<li>Geens E. et al. Yolk-deprived Caenorhabditis elegans. secure brood size at the expense of competitive fitness. Life Sci Alliance. 2023 Jun;6(6):e202201675.</li>
	<li>Ponomarova O. et al. A D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase mutant reveals a critical role for ketone body metabolism in Caenorhabditis elegans. development. PLoS Biol. 2023;21(4):e3002057.</li>
	<li>Ponomarova O. et al. idh-1 neomorphic mutation confers sensitivity to vitamin B12 in Caenorhabditis elegans. Life Sci Alliance. 2024;7(10):e202402924.</li>
	<li>Kamath R. S., Ahringer J. Genome-wide RNAi screening in Caenorhabditis elegans. Methods. 2003;30(4):313&#8211;21.</li>
	<li>Zhou X. et al. Nuclear RNAi contributes to the silencing of off-target genes and repetitive sequences in Caenorhabditis elegans. Genetics. 2014;197(1):121&#8211;32.</li>
	<li>De-Souza E. A. et al. RNA interference may result in unexpected phenotypes in Caenorhabditis elegans. Nucleic Acids Res. 2019;47(8):3957&#8211;69.</li>
	<li>Perez M. F., Francesconi M., Hidalgo-Carcedo C., Lehner B. Maternal age generates phenotypic variation in Caenorhabditis elegans. Nature. 2017;552(7683):106&#8211;9.</li>
	<li>Lanier V. J., White A. M., Faumont S., Lockery S. R. Theory and practice of using cell strainers to sort Caenorhabditis elegans. by size. PloS One. 2023;18(2):e0280999.</li>
	<li>Bai X. et al. Loss of the seipin gene perturbs eggshell formation in Caenorhabditis elegans. Development. 2020;147(20):dev192997.</li>
	<li>Green R. A. et al. Automated profiling of gene function during embryonic development. Cell. 2024;187(12):3141-3160.e23.</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Ampicillin natriumzout</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A9518</td><td></td></tr><tr><td>Bacteriologische pepton</td><td>Fischer Scientific</td><td>DF0118-17-0</td><td></td></tr><tr><td>C. elegans N2</td><td>Caenorhabditis Genetics Center</td><td>N2</td><td>wild type</td></tr><tr><td>C. elegans NL2099</td><td>Caenorhabditis Genetics Center</td><td>NL2099</td><td>rrf-3(pk1426) II. RNAi-gevoelig</td></tr><tr><td>Calciumchloride, watervrij</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>746495</td><td></td></tr><tr><td>Cholesterol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C3045</td><td></td></tr><tr><td>Conische buizen, 15 mL</td><td>VWR</td><td>60818-725</td><td></td></tr><tr><td>Kweekbuisjes, 14 mL</td><td>VWR</td><td>470150-966</td><td></td></tr><tr><td>Diafragmavacuümpomp</td><td>Amazon</td><td>TC-100</td><td></td></tr><tr><td>Dissectiemicroscoop</td><td>AmScope&nbsp;</td><td>SM-2</td><td></td></tr><tr><td>Escherichia coli HT115</td><td>Caenorhabditis Genetics Center</td><td></td><td>RNAse III-deficiënt, gebruikt voor RNAi door voerexperimenten</td></tr><tr><td>Escherichia coli OP50</td><td>Caenorhabditis Genetics Center</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Gegranuleerde agar</td><td>Fischer Scientific</td><td>BP97445</td><td></td></tr><tr><td>Handteller</td><td>LabDepot</td><td>HTCP01</td><td></td></tr><tr><td>IPTG, dioxaanvrij (Isopropyl-b-D-thiogalactoside)</td><td>US Biological</td><td>I8500</td><td></td></tr><tr><td>LB-bouillon (Miller)</td><td>US Biological</td><td>L1520</td><td>Om LB-medium te maken, lost u 25 g LB-poeder op in 1 L gedistilleerd water. Steriliseer gedurende 20 min bij 121,1 &deg;C.</td></tr><tr><td>Luer Lok wegwerpspuit</td><td>BH Supplies</td><td>BH20LL</td><td></td></tr><tr><td>Magnesiumsulfaat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M2643</td><td></td></tr><tr><td>Microscoopglaasjes</td><td>Sail Brand</td><td>7101</td><td></td></tr><tr><td>Petrischalen, 100 mm</td><td>Tritech Research</td><td>T3371</td><td></td></tr><tr><td>Petrischalen, 35 mm</td><td>Tritech Research</td><td>T3501</td><td></td></tr><tr><td>Kaliumfosfaatbuffer (PPB)</td><td></td><td></td><td>Om kaliumfosfaatbuffer (1 M) te maken, lost u 98 g kaliumfosfaat monobasisch en 48 g kaliumfosfaat dibasisch op in 1 L gedistilleerd water. Breng de pH op 6. Steriliseer gedurende 20 min bij 121 &deg;C.</td></tr><tr><td>Kaliumfosfaat dibasisch</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>795496</td><td></td></tr><tr><td>Kaliumfosfaat monobasisch</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>529568</td><td></td></tr><tr><td>Wiegelaar (nutterende mixer)</td><td>Corning LSE</td><td>6720</td><td></td></tr><tr><td>Serologische pipetten, 25 mL&nbsp;</td><td>Corning</td><td>4489</td><td></td></tr><tr><td>Serologische pipetten, 5 mL&nbsp;</td><td>Celltreat</td><td>229235</td><td></td></tr><tr><td>Schudende incubator Infors Multitron</td><td>INFORS HT</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>Natriumchloride</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S9888</td><td></td></tr><tr><td>Natriumhydroxideoplossing, 5 N</td><td>Fisher Scientific</td><td>&nbsp;SS256-500</td><td></td></tr><tr><td>Natriumhypochloriet, 5%</td><td>LabDepot</td><td>LC246302</td><td></td></tr><tr><td>Natriumfosfaat dibasisch</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S9763</td><td></td></tr><tr><td>Sorvall ST1 Plus Centrifuge</td><td>Thermo Scientific</td><td>75016030</td><td></td></tr><tr><td>Rolplaat</td><td>&nbsp;ONilab</td><td>ONi28-S</td><td></td></tr><tr><td>Spuitfilters</td><td>Semmerfeld</td><td>JQP033022QE1</td><td></td></tr><tr><td>Waterbad</td><td>FOUR E's Scientific</td><td>WB401</td><td></td></tr></tbody></table>

kwantificatie van embryonale dodelijkheidsgraad bij caenorhabditis elegans

Quantifying Embryonic Lethality Rate in Caenorhabditis elegans

Kwantificatie van embryonale dodelijkheidsgraad bij Caenorhabditis elegans

Embryonic lethality is a cornerstone phenotype used in Caenorhabditis elegans research to characterize developmental defects arising from factors such as ...

Our research focuses on measuring embryonic lethality in Caenorhabditis elegans and determining how strongly a perturbation affects development. This protocol can be applied to assess embryonic lethality caused by genetic mutations, RNAi knockdowns, drug treatment, nutritional supplementation, or environmental perturbations.To begin, gather the required reagents. Prepare 1 liter of nematode growth medium or NGM in a 2-liter bottle. Allow the medium to cool to 55 degrees Celsius in a water bath. After placing the bottle on a stir plate, aseptically add the required reagents. Pour approximately 25 milliliters of medium into each 100-milliliter plate. Inoculate 200 milliliters of LB medium with a single E. coli OP50 colony using a sterile inoculation loop. Place the flask on an orbital shaker at 200 revolutions per minute, and incubate overnight at 37 degrees Celsius. Transfer the E. coli OP50 culture into autoclaved centrifuge bottles. After centrifugation, resuspend the bacterial pellet in 1/20th of the original volume. Seed each 100-millimeter NGM plate with one to 1.5 milliliters of the concentrated culture, and incubate overnight at room temperature to allow the bacteria to grow.

quantifying-embryonic-lethality-rate-in-caenorhabditis-elegans

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

Ontwikkelingsbiologie

Deze video beschrijft een traditionele, op platen gebaseerde methode om de levensduur van C. elegans te meten. Het voorbeeldprotocol meet de levensduur van wormen die met RNAi worden behandeld.

Levensduuranalyse: Het meten van de levensduur van C. elegans

C. elegans eierleggedrag kan belangrijke informatie bieden in ontwikkelings-, reproductieve en anatomische studies.  Deze video introduceert de belangrijke stappen van een eierlegtest en toont een monsterexperiment waarbij een medicijn wordt getest op reproductietoxiciteit.

Egg Laying Assay: Een methode om het eierleggedrag van C. elegans te kwantificeren

Source: Anderson, Q. L., et al. A High-throughput, High-content, Liquid-based C. elegans Pathosystem. J. Vis. Exp. (2018)The video demonstrates a liquid-based assay where genetically modified C. elegans larvae are exposed to pathogenic bacteria in a microplate. Bacterial toxins secreted into the medium induce host stress and death. A fluorescent dye stains dead worms, allowing imaging-based quantification of mortality to assess genetic susceptibility or resistance.

Assessing Pathogenic Bacteria–Induced Mortality in C. elegans Larvae

Een ei-in-worm (EIW) test is een handige methode om eierleggende gedrag te kwantificeren. Veranderingen in eileg kan een gedragsmatige reactie van het modelorganisme...

Het meten van de effecten van bacteriën op<em&gt; C. Elegans</em&gt; Gedrag Met behulp van een Ei Retention Assay

We beschrijven de gedetailleerde stappen van een hoog-doorvoer chemische test bij de rondworm Caenorhabditis elegans die wordt gebruikt om de toxiciteit van de kiemcellen te beoordelen. Bij deze test wordt de verstoring van de kiemcellenfunctie na blootstelling aan chemicaliën gemonitord met behulp van een fluorescerende reporter specifiek voor aneuploïde embryo's.

Uitgebreide beoordeling van Kiembaan chemische toxiciteit De nematode<em&gt; Caenorhabditis elegans</em

Hier beschrijven we protocollen die specifiek zijn ontworpen om morfogenetische defecten te monitoren die optreden tijdens de vroege en late fasen van embryonale verlenging van de rondworm Caenorhabditis elegans. Uiteindelijk zijn deze protocollen ontworpen om genen te identificeren die deze fasen reguleren en om hun differentiële vereisten langs de antero-posterior as van het embryo te karakteriseren.

Novel Metrics te karakteriseren Embryonale Verlenging van de nematode<em&gt; Caenorhabditis elegans</em

Hier beschrijven we de replicaset methode, een benadering tot kwantitatief maatregel C. elegans levensduur/overleving en de healthspan in een high-throughput en robuuste manier, waardoor screening van vele voorwaarden zonder in te boeten op kwaliteit van de gegevens. Dit protocol details van de strategie en biedt een software-instrument voor de analyse van gegevens van de replicaset.

De Replica Set, methode: Een High-throughput benadering van kwantitatief maatregel Caenorhabditis elegans levensduur

Dit werk beschrijft een semi-High-throughput protocol dat gelijktijdige 3D time-lapse beeldvorming van embryogenese in 80 – 100 C. elegans embryo's in een enkele nachtelijke run toestaat. Daarnaast worden tools voorbeeld verwerking en visualisatie meegeleverd om de gegevensanalyse te stroomlijnen. De combinatie van deze methoden met aangepaste reporter stammen maakt gedetailleerde controle van embryogenese.

Een semi-High-throughput imaging methode en data visualisatie Toolkit om C. elegans embryonale ontwikkeling te analyseren

Om chaperonne-chaperonne- en chaperonne-substraatinteracties te bestuderen, voeren we synthetische interactiescreenings uit in Caenorhabditis elegans met behulp van RNA-interferentie in combinatie met milde mutaties of overexpressie van chaperonnes en monitoren we weefselspecifieke eiwitdisfunctie op organismaal niveau.

Caenorhabditis elegans gebruiken om te screenen op weefselspecifieke chaperonne-interacties

Hier presenteren we een algemene methode om de embryonale levensvatbaarheid en het totale aantal geproduceerde embryo's (broed) te bepalen met behulp van het modelorganisme C. elegans.

Het meten van de embryonale levensvatbaarheid en broedgrootte bij Caenorhabditis elegans

Leer een eenvoudige, kosteneffectieve methode om embryonale dodelijkheid te kwantificeren bij Caenorhabditis elegans zonder gespecialiseerde apparatuur. Dit protocol is toegankelijk voor beginners en geschikt voor diverse experimentele toepassingen.

Kwantificatie van embryonale dodelijkheidsgraad bij Caenorhabditis elegans

Meer video's verkennen