Name: DNA-FISH-metafase verspreidt zich om extrachromosomaal DNA te onderscheiden van homogene kleuringsgebieden in menselijke kankercellijnen (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-08-04T13:35:00.000+00:00
Duration: 8 min 21 s
Description: Leer DNA-FISH op metafase verspreidingen om extrachromosomaal DNA te onderscheiden van homogeen kleurende gebieden in menselijke kankercellijnen. Deze methode biedt inzicht in oncogeen amplificatiemechanismen.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

<ol>
	<li>Albertson DG. Gene amplification in cancer. Trends Genet. 2006;22:447-455.</li>
	<li>Bagci O, Kurtg&#246;z S. Amplification of cellular oncogenes in solid tumors. N Am J Med Sci. 2015;7:341-346.</li>
	<li>Schimke RT, et al. Gene amplification and drug resistance in cultured animal cells. Cancer Treat Rev. 1984;11:9-17.</li>
	<li>Baker TM, Waise S, Tarabichi M, Van Loo P. Aneuploidy and complex genomic rearrangements in cancer evolution. Nat Cancer. 2024;5:228-239.</li>
	<li>Ohshima K, et al. Integrated analysis of gene expression and copy number identified potential cancer driver genes with amplification-dependent overexpression in 1,454 solid tumors. Sci Rep. 2017;7:641.</li>
	<li>Pecorino LT, Verhaak RGW, Henssen A, Mischel PS. Extrachromosomal DNA (ecDNA): An origin of tumor heterogeneity, genomic remodeling, and drug resistance. Biochem Soc Trans. 2022;50:1911-1920.</li>
	<li>Cox D, Yuncken C, Spriggs AI. Minute chromatin bodies in malignant tumours of childhood. Lancet. 1965;286:55-58.</li>
	<li>Kohl NE, et al. Transposition and amplification of oncogene-related sequences in human neuroblastomas. Cell. 1983;35:359-367.</li>
	<li>Giollant M, et al. Characterization of double minute chromosomes&#39; DNA content in a human high-grade astrocytoma cell line using comparative genomic hybridization and fluorescence in situ hybridization. Hum Genet. 1996;98:265-270.</li>
	<li>Stephens PJ, et al. Massive genomic rearrangement acquired in a single catastrophic event during cancer development. Cell. 2011;144:27-40.</li>
	<li>Zhang CZ, et al. Chromothripsis from DNA damage in micronuclei. Nature. 2015;522:179-184.</li>
	<li>Lange JT, et al. The evolutionary dynamics of extrachromosomal DNA in human cancers. Nat Genet. 2022;54:1527-1533.</li>
	<li>Turner KM, et al. Extrachromosomal oncogene amplification drives tumour evolution and genetic heterogeneity. Nature. 2017;543:122-125.</li>
	<li>Wu S, et al. Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression. Nature. 2019;575:699-703.</li>
	<li>Deshpande V, et al. Exploring the landscape of focal amplifications in cancer using AmpliconArchitect. Nat Commun. 2019;10:392.</li>
	<li>Levan A, Levan G. Have double minutes functioning centromeres? Hereditas. 1978;88:81-92.</li>
	<li>St&#246;ber MC, et al. Intercellular extrachromosomal DNA copy-number heterogeneity drives neuroblastoma cell state diversity. Cell Rep. 2024;43:114711.</li>
	<li>Kaufman RJ, Brown PC, Schimke RT. Amplified dihydrofolate reductase genes in unstably methotrexate-resistant cells are associated with double minute chromosomes. Proc Natl Acad Sci U S A. 1979;76:5669-5673.</li>
	<li>Kim H, et al. Extrachromosomal DNA is associated with oncogene amplification and poor outcome across multiple cancers. Nat Genet. 2020;52:891-897.</li>
	<li>Schlesinger HR, et al. Establishment and characterization of human neuroblastoma cell lines. Cancer Res. 1976;36:3094-3100.</li>
	<li>Balaban-Malenbaum G, Gilbert F. Double minute chromosomes and the homogeneously staining regions in chromosomes of a human neuroblastoma cell line. Science. 1977;198:739-741.</li>
	<li>Gilbert F, et al. Homogeneously staining region in a retinoblastoma cell line: Relevance to tumor initiation and progression. J Natl Cancer Inst. 1981;67:301-306.</li>
	<li>Quinn LA, Moore GE, Morgan RT, Woods LK. Cell lines from human colon carcinoma with unusual cell products, double minutes, and homogeneously staining regions. Cancer Res. 1979;39:4914-4924.</li>
	<li>Montgomery KT, Biedler JL, Spengler BA, Melera PW. Specific DNA sequence amplification in human neuroblastoma cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 1983;80:5724-5728.</li>
	<li>Singer MJ, et al. Amplification of the human dihydrofolate reductase gene via double minutes is initiated by chromosome breaks. Proc Natl Acad Sci U S A. 2000;97:7921-7926.</li>
	<li>Shimizu N. Gene amplification and the extrachromosomal circular DNA. Genes (Basel). 2021;12:1533.</li>
	<li>Carroll SM, et al. Double minute chromosomes can be produced from precursors derived from a chromosomal deletion. Mol Cell Biol. 1988;8:1525-1533.</li>
	<li>Alitalo K, et al. Homogeneously staining chromosomal regions contain amplified copies of an abundantly expressed cellular oncogene (c-myc) in malignant neuroendocrine cells from a human colon carcinoma. Proc Natl Acad Sci U S A. 1983;80:1707-1711.</li>
	<li>George DL, Powers VE. Amplified DNA sequences in Y1 mouse adrenal tumor cells: Association with double minutes and localization to a homogeneously staining chromosomal region. Proc Natl Acad Sci U S A. 1982;79:1597-1601.</li>
	<li>Storlazzi CT, et al. Gene amplification as double minutes or homogeneously staining regions in solid tumors: Origin and structure. Genome Res. 2010;20:1198-1206.</li>
	<li>Biedler JL, Meyers MB, Spengler BA. Homogeneously staining regions and double minute chromosomes, prevalent cytogenetic abnormalities of human neuroblastoma cells. In: Fedoroff S, Hertz L, editors. Advances in Cellular Neurobiology. Academic Press; New York, NY; 1983. p. 267-307.</li>
	<li>Shoshani O, et al. Chromothripsis drives the evolution of gene amplification in cancer. Nature. 2021;591:137-141.</li>
	<li>Nathanson DA, et al. Targeted therapy resistance mediated by dynamic regulation of extrachromosomal mutant EGFR DNA. Science. 2014;343:72-76.</li>
	<li>Song K, et al. Plasticity of extrachromosomal and intrachromosomal BRAF amplifications in overcoming targeted therapy dosage challenges. Cancer Discov. 2022;12:1046-1069.</li>
	<li>Kang X, et al. Extrachromosomal DNA replication and maintenance couple with the DNA damage pathway in tumors. Cell. 2025;188:3405-3421.e27.</li>
	<li>Pommier Y, Nussenzweig A, Takeda S, Austin C. Human topoisomerases and their roles in genome stability and organization. Nat Rev Mol Cell Biol. 2022;23:407-427.</li>
	<li>Coquelle A, et al. Expression of fragile sites triggers intrachromosomal mammalian gene amplification and sets boundaries to early amplicons. Cell. 1997;89:215-225.</li>
	<li>Coquelle A, et al. A new role for hypoxia in tumor progression: Induction of fragile site triggering genomic rearrangements and formation of complex double minutes and homogeneously staining regions. Mol Cell. 1998;2:259-265.</li>
	<li>Mandahl N, Mertens F, Mitelman F. Gene amplification in neoplasia: A cytogenetic survey of 80,131 cases. Genes Chromosomes Cancer. 2024;63:e23214.</li>
	<li>Roepman P, et al. Clinical validation of whole genome sequencing for cancer diagnostics. J Mol Diagn. 2021;23:816-833.</li>
	<li>Ho SS, Urban AE, Mills RE. Structural variation in the sequencing era. Nat Rev Genet. 2020;21:171-189.</li>
	<li>Rajkumar U, et al. EcSeg: Semantic segmentation of metaphase images containing extrachromosomal DNA. iScience. 2019;21:428-435.</li>
	<li>Purshouse K, Pollard SM, Bickmore WA. Imaging extrachromosomal DNA (ecDNA) in cancer. Histochem Cell Biol. 2024;162:53-64.</li>
	<li>Shapiro DN, et al. Detection of N-myc gene amplification by fluorescence in situ hybridization: Diagnostic utility for neuroblastoma. Am J Pathol. 1993;142:1339-1346.</li>
	<li>Krupina K, et al. Chromothripsis and ecDNA initiated by N4BP2 nuclease fragmentation of cytoplasm-exposed chromosomes. Science. 2025;390:1156-1163.</li>
	<li>Trask BJ, Hamlin JL. Early dihydrofolate reductase gene amplification events in CHO cells usually occur on the same chromosome arm as the original locus. Genes Dev. 1989;3:1913-1925.</li>
	<li>Biedler JL, Spengler BA. A novel chromosome abnormality in human neuroblastoma and antifolate-resistant Chinese hamster cell lines in culture. J Natl Cancer Inst. 1976;57:683-695.</li>
	<li>Nunberg JH, Kaufman RJ, Schimke RT, Urlaub G. Amplified dihydrofolate reductase genes are localized to a homogeneously staining region of a single chromosome in a methotrexate-resistant Chinese hamster ovary cell line. Proc Natl Acad Sci U S A. 1978;75:5553-5556.</li>
	<li>Gapski GR, et al. Synthesis of a fluorescent derivative of amethopterin. J Med Chem. 1975;18:526-528.</li>
	<li>Verma RS, Babu A. Tissue culture techniques and chromosome preparation. In: Human Chromosomes: Manual of Basic Techniques. Pergamon Press; 1989. p. 4-45.</li>
	<li>Moorhead PS, et al. Chromosome preparations of leukocytes cultured from human peripheral blood. Exp Cell Res. 1960;20:613-616.</li>
	<li>Ohara H, Terasima T. Colcemid effects on mitotic synchrony and synchronized cells. Cell Struct Funct. 1976;1:187-195.</li>
	<li>Kaufman RJ, Brown PC, Schimke RT. Loss and stabilization of amplified dihydrofolate reductase genes in mouse sarcoma S-180 cell lines. Mol Cell Biol. 1981;1:1084-1093.</li>
	<li>Marsden CG, Dragon JA, Wallace SS, Sweasy JB. Base excision repair variants in cancer. Methods Enzymol. 2017;591:119-157.</li>
	<li>Nichols A, et al. Chromosomal tethering and mitotic transcription promote ecDNA nuclear inheritance. Mol Cell. 2025;85:2839-2853.e8.</li>
	<li>Henegariu O, et al. Improvements in cytogenetic slide preparation: Controlled chromosome spreading, chemical aging, and gradual denaturing. Cytometry. 2001;43:101-109.</li>
	<li>Lichter P, et al. Delineation of individual human chromosomes in metaphase and interphase cells by in situ suppression hybridization using recombinant DNA libraries. Hum Genet. 1988;80:224-234.</li>
	<li>Pinkel D, et al. Fluorescence in situ hybridization with human chromosome-specific libraries: Detection of trisomy 21 and translocations of chromosome 4. Proc Natl Acad Sci U S A. 1988;85:9138-9142.</li>
	<li>Sumner AT, Evans HJ, Buckland RA. New technique for distinguishing between human chromosomes. Nature New Biol. 1971;232:31-32.</li>
	<li>Howe B, Umrigar A, Tsien F. Chromosome preparation from cultured cells. J Vis Exp. 2014;e50203.</li>
	<li>Cavalli G, Misteli T. Functional implications of genome topology. Nat Struct Mol Biol. 2013;20:290-299.</li>
	<li>Kosak ST, Groudine M. Form follows function: The genomic organization of cellular differentiation. Genes Dev. 2004;18:1371-1384.</li>
	<li>Sehgal P, Chaturvedi P. Chromatin and cancer: Implications of disrupted chromatin organization in tumorigenesis and its diversification. Cancers (Basel). 2023;15:466.</li>
	<li>Misteli T. Beyond the sequence: Cellular organization of genome function. Cell. 2007;128:787-800.</li>
	<li>Zhu Y, et al. Oncogenic extrachromosomal DNA functions as mobile enhancers to globally amplify chromosomal transcription. Cancer Cell. 2021;39:694-707.</li>
	<li>Hung KL, et al. ecDNA hubs drive cooperative intermolecular oncogene expression. Nature. 2021;600:731-736.</li>
	<li>Taghbalout A, et al. Extrachromosomal DNA associates with nuclear condensates and reorganizes chromatin structures to enhance oncogenic transcription. Cancer Cell. 2025;43:2191-2205.e6.</li>
	<li>Hsu TC, Pomerat CM. Mammalian chromosomes in vitro: II. A method for spreading the chromosomes of cells in tissue culture. J Hered. 1953;44:23-30.</li>
	<li>Erwin GS, Bhimsaria D, Eguchi A, Ansari AZ. Mapping polyamide-DNA interactions in human cells reveals a new design strategy for effective targeting of genomic sites. Angew Chem. 2014;126:10288-10292.</li>
	<li>Erwin GS, et al. Synthetic genome readers target clustered binding sites across diverse chromatin states. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016;113:E7418-7427.</li>
	<li>Erwin GS, et al. Synthetic transcription elongation factors license transcription across repressive chromatin. Science. 2017;358:1617-1622.</li>
	<li>Erwin GS, et al. Recurrent repeat expansions in human cancer genomes. Nature. 2023;613:96-102.</li>
	<li>Shimizu N, Kanda T, Wahl GM. Selective capture of acentric fragments by micronuclei provides a rapid method for purifying extrachromosomally amplified DNA. Nat Genet. 1996;12:65-71.</li>
	<li>Jaworski JJ, et al. ecDNA replication is disorganized and vulnerable to replication stress. Nucleic Acids Res. 2025;53:gkaf711.</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>15-mL conische centrifuge</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Centrifugatie.&nbsp;</td></tr><tr><td>15-mL conische buizen</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Celcollectie.</td></tr><tr><td>200 proof ethanol</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Wasstappen.&nbsp;</td></tr><tr><td>Azijnzuur, glashelder, 99,7%</td><td>Millipore Sigma</td><td>695092</td><td>Carnoys fixatie en wasstappen op de dia.</td></tr><tr><td>Antifade montagemedium</td><td>FisherScientific</td><td>NC9265087</td><td>Diamontage na voltooide diavoorbereiding</td></tr><tr><td>Biologische veiligheidskast met vacuumontsluiting</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Chemische opslag.</td></tr><tr><td>Colcemid (N-methyl-N-deacetyl-colchicine)</td><td>Millipore Sigma</td><td>10295892001</td><td>Bindt tubuline, arresteert cellen in metafase.</td></tr><tr><td>Coplin-potten</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Wasstappen.&nbsp;</td></tr><tr><td>DAPI (4&prime;,6-diamidino-2-fenylindole)</td><td>Milipore Sigma</td><td>D8417-1MG</td><td>Fluorescente DNA-kleuring.</td></tr><tr><td>EGFR/CON7 FISH-sonde&nbsp;</td><td>Empire Genomics</td><td>EGFR-CHR07</td><td>Locus-specifieke fluorescente&nbsp;sonde.&nbsp;</td></tr><tr><td>Elmer's rubbercement</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>De dekplaat tijdens overnachtelijke sondehybridisatie op zijn plaats houden.</td></tr><tr><td>Etanolbestendige permanente marker</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Dialabeling.</td></tr><tr><td>Fluorescente microscoop</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Diabeeldvorming.&nbsp;</td></tr><tr><td>Glazen Dekplaat, 22 x 22mm</td><td>ThermoFisher</td><td>50-143-780</td><td>Sondehybridisatie op de dia.</td></tr><tr><td>Glazen Dia, voorgereinigd</td><td>VWR</td><td>48311-703</td><td>Om metafase-uitstrekkingen te laten vallen en DNA-FISH uit te voeren.</td></tr><tr><td>Bevochtigde CO2-incubator</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Live-celincubatie.</td></tr><tr><td>Hybridisatiebuffer</td><td>Empire Genomics</td><td>Hyb-Buffer</td><td>Buffer gebruikt met sonde.&nbsp;</td></tr><tr><td>IJsemmer</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Carnoy's fixatie koud houden.&nbsp;</td></tr><tr><td>KCl (2M)</td><td>ThermoFisher</td><td>AM9640G</td><td>Cellen opzwellen voor fixatie.&nbsp;</td></tr><tr><td>Methanol, 99,9%, HPLC-kwaliteit</td><td>Millipore Sigma</td><td>1060351000</td><td>Voor Carnoys fixatie.&nbsp;</td></tr><tr><td>Microcentrifuge</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Centrifugatie.&nbsp;</td></tr><tr><td>Microcentrifugebuisjes</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Voor cellen tijdens fixatie en voor sondebereiding.&nbsp;</td></tr><tr><td>MYC / SE 8 Sonde</td><td>Leica</td><td>KI-10106</td><td>Locus-specifieke fluorescente&nbsp;sonde.&nbsp;</td></tr><tr><td>PBS, pH 7,4</td><td>Gibco</td><td>10010-023</td><td>Wasstappen.&nbsp;</td></tr><tr><td>Phasecontrastmicroscoop</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Beeldvorming van metafase-uitstrekkingen direct na het laten vallen</td></tr><tr><td>Pipettips</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Pipetteren.</td></tr><tr><td>Natriumchloride</td><td>Millipore Sigma</td><td>S9888</td><td>Voor SSC-buffer.</td></tr><tr><td>Natriumcitraat</td><td>Millipore Sigma</td><td>567446</td><td>Voor SSC-buffer.</td></tr><tr><td>Steriele ultrapure water</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Wasstappen.&nbsp;</td></tr><tr><td>ThermoBrite programmeerbare dia-incubator</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Dia-incubatie.</td></tr><tr><td>Tang</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Voor wasstappen op de dia.&nbsp;</td></tr><tr><td>Waterbad</td><td>elke bron</td><td>NA</td><td>Voor KCl-incubatie.&nbsp;</td></tr></tbody></table>

dna-fish-metafase verspreidt zich om extrachromosomaal dna te onderscheiden van homogene kleuringsgebieden in menselijke kankercellijnen

DNA-FISH Metaphase Spreads to Distinguish Extrachromosomal DNA from Homogeneously Staining Regions in Human Cancer Cell Lines

DNA-FISH-metafase verspreidt zich om extrachromosomaal DNA te onderscheiden van homogene kleuringsgebieden in menselijke kankercellijnen

Whole-genome sequencing identifies focal DNA amplifications with base-pair resolution but cannot determine whether amplified sequences reside on ...

Ons onderzoek richt zich op het bepalen of geamplificeerde oncogenen zich bevinden op extrachromosomaal DNA of binnen afzonderlijke, chromosomaal geïntegreerde homogene kleurende regio's (HSR). Sequencing slaagt er niet in om ecDNA te onderscheiden van HSR-amplificatie, dus ons protocol lost dit op met resolutie op enkelcelniveau.Begin met het verdunnen van de Colcemid-stamloplossing in een verhouding van 1:1 met steriel ultrapuur water. Voor de arrestatie in de metafase worden 100 µL van de verdunde Colcemid-oplossing toegevoegd aan de COLO320DM-cellen, die in 10 mL medium in de logaritmische groeifase worden gehouden bij een confluentie van 70% tot 90%, waarna ze gedurende 45 minuten tot een nacht in een celkweekincubator worden geplaatst. Bereid een vers Carnoy-fixatief voor met een verhouding van 3:1 methanol ten opzichte van azijnzuur. Houd het Carnoy-fixatief gedurende de gehele fixatieprocedure op ijs. Bereid een verse 0,075 M kaliumchloride-oplossing en verwarm deze oplossing in een waterbad van 37 °C. Was na centrifugatie en celtelling de cellen met PBS. Resuspendeer de cellen voorzichtig in 10 mL van de warme 0,075 M kaliumchloride-oplossing en meng de suspensie door voor

dna-fish-metaphase-spreads-to-distinguish-extrachromosomal-dna-from

Research

JoVE Journal

Biology

Biologie

Dit artikel beschrijft de selectie van geschikte probes voor single-cell FISH, het verspreiden van technieken voor blastomeer kernen, en in situ hybridisatie en signaal scoren, toegepast op de pre-implantatie genetische diagnose (PGD) in een klinische setting.

FISH voor Pre-implantatie genetische diagnostiek

Chromosomics: Detectie van numerieke en structurele veranderingen in alle 24 menselijke chromosomen tegelijk met behulp van een roman OctoChrome FISH-test

Circulating tumor cells (CTC) isolation and characterization from the blood of cancer patients is a type of non-invasive liquid biopsy and associated with relapse and disease progression. This video describes the technique of DNA fluorescence-in-situ-hybridization (DNA FISH) on CTCs captured on a medical wire, to study a specific gene of interest.

3D DNA FISH: A Technique to Locate a Specific Gene on a Chromosome

Hier beschrijven we een protocol voor gelijktijdige detectie van histonmodificaties door immunofluorescentie en DNA-sequenties van DNA FISH gevolgd door 3D microscopie en analyses (3D-immuno DNA FISH).

Gecombineerd Immunofluorescentie en DNA FISH op 3D-bewaarde interfase kernen aan veranderingen in 3D Nuclear Organisatie Studie

We beschrijven een robuuste en veelzijdige protocol voor de analyse nucleaire architectuur door 3D DNA FISH met direct gelabelde fluorescerende probes.

Robuuste 3D DNA FISH behulp direct gemerkt Probes

DNA herstelmechanismen zijn essentieel om de genomische integriteit en preventie mutatie en kanker. Het doel van dit protocol is om instabiliteit van het genoom te kwantificeren door middel van directe observatie van chromosoomafwijkingen in metafase verspreidt van de muis B-cellen met behulp van fluorescente in situ hybridisatie (FISH) voor telomeer DNA herhalingen.

Snelle analyse van chromosoomafwijkingen in Muis B-lymfocyten door PNA-FISH

We presenteren een nieuwe aanpak karakteriseren van tumorcellen. We immunofluorescentie gecombineerd met DNA TL -in-situ-hybridisatie te evalueren van cellen gevangen genomen door een functionalized medische draad staat in vivo verrijken CTCs rechtstreeks uit bloed van de patiënt.

Karakterisering van tumorcellen met behulp van een medische draad voor het vastleggen van de circulerende tumorcellen: een 3D aanpak gebaseerd op immunofluorescentie en DNA vis

Nucleaire oppervlaktespreads zijn een onmisbaar hulpmiddel voor het bestuderen van chromosoomgebeurtenissen tijdens meiose. Hier demonstreren we een methode om meiotische chromosomen voor te bereiden en te visualiseren tijdens profase I van zebravissen spermatocyten.

Bereiding van Meiotic Chromosome Spreads van Zebrafish Spermatocyten

3D multicolor DNA FISH vertegenwoordigt een hulpmiddel om meerdere genomische loci binnen 3D bewaarde kernen te visualiseren, ondubbelzinnig definiëren d.m.v. hun wederzijdse interacties en lokalisatie binnen de nucleaire ruimte op één celniveau. Hier wordt een stap voor stap protocol beschreven voor een breed spectrum van menselijke primaire cellen.

3D Multicolor DNA FISH Tool om nucleaire architectuur in menselijke primaire cellen te bestuderen

Het combineren van DNA-halopreparaten met fluorescentie in situ hybridisatie maakt een analyse met hoge resolutie van genomische interacties met het nucleoskelet mogelijk. Bijgevoegd genoom leidt tot gehybridiseerde fluorescerende signalen die zich in de resterende geëxtraheerde kernen bevinden, terwijl het niet-gehechte genoom zich in de halo van DNA rond de resterende kernen bevindt.

Fluorescentie in situ hybridisatie op DNA-halopreparaten om hele chromosomen, telomeren en genloci te onthullen

Dit protocol biedt een reproduceerbare methode om genamplificatie te visualiseren in in formaline gefixeerde, in paraffine ingebedde (FFPE) weefselmonsters.

Robuuste detectie van genamplificatie in in formaline gefixeerde, in paraffine ingebedde monsters door fluorescentie in situ hybridisatie

Leer DNA-FISH op metafase verspreidingen om extrachromosomaal DNA te onderscheiden van homogeen kleurende gebieden in menselijke kankercellijnen. Deze methode biedt inzicht in oncogeen amplificatiemechanismen.

DNA-FISH-metafase verspreidt zich om extrachromosomaal DNA te onderscheiden van homogene kleuringsgebieden in menselijke kankercellijnen (Video) | JoVE Journal

DNA-FISH-metafase verspreidt zich om extrachromosomaal DNA te onderscheiden van homogene kleuringsgebieden in menselijke kankercellijnen

Meer video's verkennen