Name: De MODS methode voor de diagnose van tuberculose en multidrug-resistente tuberculose (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2008-08-11T14:00:00.000+00:00
Duration: 23 min 6 s
Description: Leer de MODS-methode voor snelle diagnose van tuberculose en multiresistente tuberculose. Deze kosteneffectieve vloeibare kweektechniek detecteert Mycobacterium tuberculosis sneller dan vaste media en identificeert tegelijkertijd resistentie tegen isoniazide en rifampicine.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

We willen graag Sean Fitzwater en Carmen Giannina Luna Colombo te erkennen voor de tuberculose groei van time-lapse video segment. Wij danken Marty Roper voor haar grondige en uitstekende feedback tijdens het bewerken en co-authoring de handleiding, waaruit het huidige protocol werd genomen meestal letterlijk. De productie van deze video werd gefinancierd door het NIH / Fogarty International Center <a href="http://www.fic.nih.gov/">http://www.fic.nih.gov/</a> David AJ Moore droeg als een Wellcome Trust Clinical Research Fellow in Tropische Geneeskunde en Reader in Infectieziekten aan het Imperial College London (Fellowship award nummer 078067/Z/05). Mark F. Brady droeg als een NIH / Fogarty International Center Research Fellow.

<ol><li> Bereid voorraadoplossingen <ol><li> Fosfaatbuffer voorraad <ol><li> Mix capaciteit van 950 van natrium dibasisch oplossing (9.47g van dibasisch opgelost in gedestilleerd water 1000ml) met een capaciteit van 950 kalium monobase oplossing (9.07g van kalium monobase opgelost in gedestilleerd water 1000ml) en roer; houden achterkant 50 ml van elke oplossing aan te passen pH, indien nodig </li><li> Pas de pH op 6,8 ± 0,2: voeg dibasisch oplossing om de pH te verhogen; toe te voegen kalium monobasisch oplossing voor een lagere pH </li><li> Autoclaaf bij 121-124 ° C gedurende 15 minuten om te steriliseren </li><li> Plaat een 100μl hoeveelheid van de fosfaatbuffer op voedingsagar medium in een petrischaal en incubeer bij 37 ° C gedurende 48 uur tot steriliteit te bevestigen </li><li> Bewaren in de koelkast bij 2-8 ° C gedurende een maand Opmerking: Elke sputummonster vraagt ​​10 ml van de fosfaatbufferoplossing </li></ol></li><li> Decontaminatie voorraad <ol><li> Combineer gelijke volumes van natriumhydroxide-oplossing (8.0g van natriumhydroxide opgelost in 200 ml steriel gedistilleerd water) en natriumcitraat oplossing (5,8 g natrium citraat gedistilleerd in 200 ml steriel gedistilleerd water) </li><li> Mix en autoclaaf bij 121-124 ° C gedurende 15 minuten </li><li> Bewaren in de koelkast bij 2-8 ° C gedurende een maand Opmerking: Elke sputummonster vereist 2 ml van decontaminatie voorraad </li></ol></li><li> Cultuurmedia voorraad <ol><li> In 900 ml van steriel gedestilleerd water toe te voegen 3.1ml van glycerol en 1.25g van casitone en 5.9g van 7H9 medium poeder, meng met een constante agitatie tot het volledig is opgelost </li><li> Autoclaaf bij 121-124 ° C gedurende 15 minuten </li><li> Koel en verdeel de steriele medium in 4.5ml porties in een steriele 16x 100 mm glazen buizen voor monstervoorbereiding, en 10.8ml porties voor de voorbereiding van antibiotica en de interne controles </li><li> Incubeer bij 37 ° C gedurende 48 uur om de steriliteit (gebrek aan troebelheid) te controleren </li><li> Bewaren bij 2-8 ° C met dop goed afgesloten, voor maximaal een maand Opmerking: Elke sputummonster vereist een buisje met 4.5ml van 7H9 medium </li></ol></li><li> Antibiotica stockoplossingen <ol><li> A. Isoniazide voorraad (8 mg / ml) <ol><li> Los 20 mg isoniazide volledig in 2,5 ml steriel gedistilleerd water </li><li> Filter met 0.2μm spuitfilter voor waterige oplosmiddel </li><li> Bewaren in 20μl aliquots in steriele micro centrifugeren buisjes bij -20 ° C tot 6 maanden Opmerking: Elke opgeslagen 20μl hoeveelheid is voldoende voor maximaal 100 monsters (met inbegrip afval) </li></ol></li><li> B. Rifampicine voorraad (8 mg / ml) </li></ol><ol><li> Volledig oplossen 20 mg rifampicine in 1,25 ml DMSO </li><li> Voeg 1,25 ml steriel gedestilleerd water toe en meng </li><li> Filter met 0.2μm spuit filter voor organische oplosmiddelen </li><li> Bewaren in 20μl aliquots in steriele microcentrifugebuizen bij -20 ° C tot 6 maanden Opmerking: Elke opgeslagen 20μl hoeveelheid is voldoende voor maximaal 100 monsters (met inbegrip afval) </li></ol></li></ol></li><li> Bereid te werken oplossingen <ol><li> Decontaminatie werkende oplossing <ol><li> Los van 0.1g NALC kristallen in elk 20 ml van de benodigde decontaminatie-oplossing Let op: Elk monster heeft 2 ml van de decontaminatie-oplossing Opmerking: Gooi NaOH-NALC decontaminatie-oplossing die ongebruikt blijft na 24 uur als NALC verliest zijn mucolytische activiteit loop van de tijd </li></ol></li><li> Cultuur media werkende oplossing <ol><li> Uiteengezet: <ol><li> 1 tube met 7H9 medium voor elke sputum monster worden verwerkt, plus een extra buis voor elke plaat (voor de negatieve controle kolom) </li><li> 2 buizen van 7H9 medium voor de positieve controles (3 indien monoresistant stammen worden gebruikt) </li><li> 1-2 buizen met 10.8ml 7H9 voor antibiotica oplossing voorbereiding </li></ol></li><li> Voeg 0,5 ml OADC aan de 4.5ml van 7H9 in elk monster buis </li><li> Voeg 1,2 ml OADC aan buizen met 10.8ml 7H9 </li><li> Zet opzij twee buizen met 5ml 7H9-OADC voor positieve controles, en buis (s) met 12ml 7H9-OADC te worden gebruikt voor antibiotica-oplossing voorbereiding (deze hoeven niet PANTA) </li><li> Reconstrueren PANTA en voeg 0,1 ml aan elk monster buis en met de negatieve controle buizen (7H9-OADC-PANTA: totaal volume = 5.1ml) Let op: Compleet medium met PANTA (7H9-OADC-PANTA) wordt gebruikt voor sputum monsters en negatieve controles, gebruik 7H9-OADC zonder PANTA voor positieve controles en voor antibiotica oplossing voorbereiding </li></ol></li><li> Antibiotica werken oplossingen <ol><li> 1. Zie figuur 1 voor stappen om het maken van het antibioticum werkende oplossing in een ongebruikte 24-well plaat Opmerking: Voor een nauwkeurige gevoeligheid resultaten, de laatste antibiotica concentraties zijn van cruciaal belang. De volgende procedure is geschikt voor laboratories uitgerust met micropipetten. Als micropipetten niet beschikbaar zijn, kunnen tuberculine injectiespuiten worden gebruikt met een andere reeks van verdunningen wordt beschreven in de Gebruikershandleiding Bijlage 3 bij modsperu.org Let op: niet opnieuw invriezen of hergebruik antibiotica werken of stock-oplossingen als drug activiteit kan worden verloren Gooi alle ongebruikte antibiotica aan het einde van de verwerking dag Figuur 1.. Het maken van de antibiotische werking oplossingen (van User Guide op modsperu.org) </li></ol></li></ol></li><li> Sputummonster en plaat voorbereiding <ol><li> Decontaminatie <ol><li> Plaats 2 ml sputum monster in een 15ml centrifugebuis (indien minder, vul aan tot 2 ml met fosfaat buffer, als er meer, gebruik 2 ml) </li><li> Voeg 2 ml NaOH-oplossing NALC </li><li> Cap buis strak en vortex gedurende 20 seconden; omkeren buis om ervoor te zorgen NaOH-oplossing in contact NALC de gehele binnenkant van de buis en deksel </li><li> Laat staan ​​voor een minimum van 15 minuten - kan verlengen door een paar minuten als het monster is bijzonder viskeus. Om te voorkomen dat over de behandeling, mag niet meer dan 20 minuten </li><li> De buis wordt tot 14ml met fosfaatbuffer (pH 6,8) te neutraliseren alkali en beëindiging van de decontaminatie-proces, en goed door het buisje mix 4 keer </li><li> Centrifugeer bij 3000 g gedurende 15 minuten (zie bijlage 2 in de User Guide op modsperu.org voor de vergelijking van rotaties per minuut nodig is om 3000 g te bereiken) </li><li> Giet af bovendrijvende in een vloeibare afvalstoffen container met 10% natriumhypochloriet of een ander geschikt ontsmettingsmiddel en behouden van de pellet </li></ol></li><li> De voorbereiding van de uiteindelijke monster schorsing en back-up <ol><li> Met behulp van 7H9-OADC-PANTA (van de buis met 5.1ml), resuspendeer de sample pellet in een totaal volume van 2 ml in de centrifugebuis met een Pasteur pipet; meng goed </li><li> Verwijder 1 ml van het monster schorsing en op te slaan in een microcentrifugebuis bij 2-8 ° C als een back-up </li><li> Voeg de seconde 1 ml van het monster schorsing op de buis met de rest van 7H9-OADC-PANTA, meng goed. Dit is de uiteindelijke steekproef oplossing klaar voor plating </li></ol></li><li> Het plaatsen van monster suspensies in 24-well plaat <ol><li> Plaats 900μl van het eindmonster schorsing in elk van de vier putten van een kolom in de 24-well plaat </li><li> Herhaal dit met extra monsters totdat alle kolommen van de plaat, met uitzondering van kolom 3, worden gevuld (of totdat alle monsters zijn verguld) </li><li> Plaats 900μl van 7H9-OADC medium zonder monster in de vier putten van Kolom 3 van elk monster plaat (negatieve interne controles) </li></ol></li><li> Het toevoegen van antibiotica om monsters te <ol><li> Met behulp van een multi-channel pipet voorzichtig vullen 4 tips met 100μl uit de putten met 7H9-OADC en antibiotica werken oplossingen (kolom 2 in antibiotica verdunning plaat-zie figuur 1) </li><li> Voeg de 100μl monsters om de kolom te putten met een 900μl sample oplossingen zonder te raken plaat of monster </li><li> Herhaal dit totdat alle kolommen hebben ontvangen van de extra 100μl van medium (drugsvrije putten) of antibiotica oplossingen (inclusief negatieve controle kolom 3) </li><li> Sluit de plaat met het deksel en plaats het in een afsluitbare plastic (Ziplock) zak en seal (tas is niet meer geopend vanaf dit punt) </li><li> Incubeer bij 37 ° C (CO 2 verrijking is niet nodig) </li></ol></li></ol></li><li> Kwaliteitscontrole <ol><li> Negatieve controles worden uitgevoerd op elk bord. De aanwezigheid van een groei in een van de putten in de negatieve controle kolom geeft kruisbesmetting, dus de hele plaat moet worden weggegooid en de monsters opnieuw verguld. </li><li> Positieve controles worden uitgevoerd op een aparte plaat aan het eind van de dag. Een volledig drugs-gevoelige stam is uitgevoerd in een kolom en een stam resistent tegen INH en RIF is uitgevoerd in een andere kolom. Als er bezorgdheid over het uitvoeren van een MDR stam, zowel een INH monoresistant stam en een RIF monoresistant stam kan worden uitgevoerd in de plaats van de gevoelige en MDR stammen. Alle positieve controles moeten de groei in de drugsvrije putten dat de media ondersteunen de groei aan te tonen. Om aan te tonen dat het medicijn concentraties juist zijn, dient de kwetsbare stam groeien niet in de INH of RIF putten, maar de MDR stam moet groeien ook groeien in de INH en RIF putten. </li></ol></li><li> Plaat te lezen <ol><li> Met de dag in de platen als &quot;Dag 0,&quot; plaat lezen begint op dag 5, en als negatief op dag 5 te lezen is gedaan om de dag (of andere dagen afhankelijk van de werkbelasting) tot en met dag 14 en daarna om de 2-3 dagen vanaf dag 15 -21. Platen zijn onderzocht op eenomgekeerde lichtmicroscoop met het 10x objectief </li><li> Een positieve cultuur is er een waarin er twee of meer kolonievormende eenheden (&gt; 2 CFU) in zowel drugsvrije putten. Vroege mycobacteriële groei ziet eruit als kleine gebogen komma&#39;s of spiralen (dag 5-9). Kolonie de vorming vordert meestal om &quot;snoeren&quot; of &quot;knopen&quot; (zie afbeelding bibliotheek op modsperu.org) </li><li> Op de dag dat een cultuur is positief in de twee drugsvrije putten, het geneesmiddel-bevattende putten moeten worden gelezen. Eventuele groei in de aanwezigheid van een geneesmiddel geeft weerstand tegen deze drug. Opmerking: Als het lezen van het geneesmiddel-bevattende putten gebeurt&gt; 1 week na een positieve cultuur wordt opgemerkt in de drug-free putten, kan dit niet verzet vertegenwoordigen als break-through groei is af en toe gezien </li><li> Monsters die niet positief op dag 21 worden beschouwd als negatief culturen </li><li> Vertroebeling van de putten is een gevolg van besmetting overmatige groei, terwijl mycobacteriële de groei niet leidt tot troebelheid </li><li> Aan het einde van 21 dagen culturen kunnen worden weggegooid. Culturen blijven in de verzegelde tassen en worden geplaatst in autoclaafzakken en geautoclaveerd bij 121-124 ° C voor 45-60 minuten </li></ol></li></ol>

<ol><li>Arias, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clinical+evaluation+of+the+microscopic-observation+drug-susceptibility+assay+for+detection+of+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Infect+Dis%22%5BJournal%5D)">Clinical evaluation of the microscopic-observation drug-susceptibility assay for detection of tuberculosis.</a> Clin Infect Dis. 44, 674-674 (2007).</li>
<li>Caviedes, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid%2C+efficient+detection+and+drug+susceptibility+testing+of+Mycobacterium+tuberculosis+in+sputum+by+microscopic+observation+of+broth+cultures.+The+Tuberculosis+Working+Group+in+Peru%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid, efficient detection and drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis in sputum by microscopic observation of broth cultures. The Tuberculosis Working Group in Peru.</a> J Clin Microbiol. 38, 1203-1203 (2000).</li>
<li>Caviedes, L., Moore, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Introducing+MODS%3A+a+low-cost%2C+low-tech+tool+for+high-performance+detection+of+tuberculosis+and+multidrug+resistant+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Indian+J+Med+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Introducing MODS: a low-cost, low-tech tool for high-performance detection of tuberculosis and multidrug resistant tuberculosis.</a> Indian J Med Microbiol. 25, 87-87 (2007).</li>
<li>Caws, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+the+MODS+culture+technique+for+the+diagnosis+of+tuberculous+meningitis%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Evaluation of the MODS culture technique for the diagnosis of tuberculous meningitis.</a> PLoS ONE. 2, e1173-e1173 (2007).</li>
<li>Ejigu, G. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microscopic-observation+drug+susceptibility+assay+provides+rapid+and+reliable+identification+of+MDR-TB%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Tuberc+Lung+Dis%22%5BJournal%5D)">Microscopic-observation drug susceptibility assay provides rapid and reliable identification of MDR-TB.</a> Int J Tuberc Lung Dis. 12, 332-332 (2008).</li>
<li>Kim, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Risk+of+occupational+tuberculosis+in+National+Tuberculosis+Programme+laboratories+in+Korea%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Tuberc+Lung+Dis%22%5BJournal%5D)">Risk of occupational tuberculosis in National Tuberculosis Programme laboratories in Korea.</a> Int J Tuberc Lung Dis. 11, 138-138 (2007).</li>
<li>Mello, F. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clinical+evaluation+of+the+microscopic+observation+drug+susceptibility+assay+for+detection+of+Mycobacterium+tuberculosis+resistance+to+isoniazid+or+rifampin%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Clinical evaluation of the microscopic observation drug susceptibility assay for detection of Mycobacterium tuberculosis resistance to isoniazid or rifampin.</a> J Clin Microbiol. 45, 3387-3387 (2007).</li>
<li>Moore, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Future+prospects+for+the+MODS+assay+in+multidrug-resistant+tuberculosis+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Future+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Future prospects for the MODS assay in multidrug-resistant tuberculosis diagnosis.</a> Future Microbiol. 2, 97-97 (2007).</li>
<li>Moore, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Infrequent+MODS+TB+culture+cross-contamination+in+a+high-burden+resource-poor+setting%5BTitle%5D)+AND+%22Diagn+Microbiol+Infect+Dis%22%5BJournal%5D)">Infrequent MODS TB culture cross-contamination in a high-burden resource-poor setting.</a> Diagn Microbiol Infect Dis. 56, 35-35 (2006).</li>
<li>Moore, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microscopic-observation+drug-susceptibility+assay+for+the+diagnosis+of+TB%5BTitle%5D)+AND+%22N+Engl+J+Med%22%5BJournal%5D)">Microscopic-observation drug-susceptibility assay for the diagnosis of TB.</a> N Engl J Med. 355, 1539-1539 (2006).</li>
<li>Moore, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microscopic+observation+drug+susceptibility+assay%2C+a+rapid%2C+reliable+diagnostic+test+for+multidrug-resistant+tuberculosis+suitable+for+use+in+resource-poor+settings%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Microscopic observation drug susceptibility assay, a rapid, reliable diagnostic test for multidrug-resistant tuberculosis suitable for use in resource-poor settings.</a> J Clin Microbiol. 42, 4432-4432 (2004).</li>
<li>Moore, D. A., Roper, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diagnosis+of+smear-negative+tuberculosis+in+people+with+HIV%2FAIDS%5BTitle%5D)+AND+%22Lancet%22%5BJournal%5D)">Diagnosis of smear-negative tuberculosis in people with HIV/AIDS.</a> Lancet. 370, 1033-1033 (2007).</li>
<li>Oberhelman, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improved+recovery+of+Mycobacterium+tuberculosis+from+children+using+the+microscopic+observation+drug+susceptibility+method%5BTitle%5D)+AND+%22Pediatrics%22%5BJournal%5D)">Improved recovery of Mycobacterium tuberculosis from children using the microscopic observation drug susceptibility method.</a> Pediatrics. 118, e100-e100 (2006).</li>
<li>Palomino, J. C., Martin, A., Portaels, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MODS+assay+for+the+diagnosis+of+TB%5BTitle%5D)+AND+%22N+Engl+J+Med%22%5BJournal%5D)">MODS assay for the diagnosis of TB.</a> N Engl J Med. 356, 188-189 (2007).</li>
<li>Park, W. G., Bishai, W. R., Chaisson, R. E., Dorman, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Performance+of+the+microscopic+observation+drug+susceptibility+assay+in+drug+susceptibility+testing+for+Mycobacterium+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Performance of the microscopic observation drug susceptibility assay in drug susceptibility testing for Mycobacterium tuberculosis.</a> J Clin Microbiol. 40, 4750-4750 (2002).</li>
<li>Shiferaw, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+microscopic+observation+drug+susceptibility+assay+for+detection+of+multidrug-resistant+Mycobacterium+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Evaluation of microscopic observation drug susceptibility assay for detection of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis.</a> J Clin Microbiol. 45, 1093-1093 (2007).</li>
<li>Tovar, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improved+diagnosis+of+pleural+tuberculosis+using+the+microscopic-+observation+drug-susceptibility+technique%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Infect+Dis%22%5BJournal%5D)">Improved diagnosis of pleural tuberculosis using the microscopic- observation drug-susceptibility technique.</a> Clin Infect Dis. 46, 909-909 (2008).</li>
<li>Vargas, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diagnosis+of+sputum-scarce+HIV-associated+pulmonary+tuberculosis+in+Lima%2C+Peru%5BTitle%5D)+AND+%22Lancet%22%5BJournal%5D)">Diagnosis of sputum-scarce HIV-associated pulmonary tuberculosis in Lima, Peru.</a> Lancet. 365, 150-150 (2005).</li>
</ol>

De MODS test is gericht op gebieden met beperkte middelen. Voor de eerste keer, MODS brengt de mogelijkheid voor een snelle detectie van vloeibare cultuur tuberculose en multidrug-resistente tuberculose voor gebieden met beperkte middelen iets minder dan drie dollar per test. MODS is een non-proprietary, iteratieve methode, en de MODS gemeenschap is altijd geïnteresseerd in verbeteringen die andere laboratoria hebben weten te maken. Een terugkerend zorg is de bioveiligheid van vloeibare media cultuur van tuberculose, want vloeistoff...

<table><tbody><tr><td>Koelkast/vriezer</td><td>Apparatuur</td><td></td><td></td><td>voor het bewaren van vooraf bereide bouillon en antibiotica-voorraden</td></tr><tr><td>Vortexen</td><td>Apparatuur</td><td></td><td></td><td>om de decontamination van sputum te ondersteunen</td></tr><tr><td>Centrifugeer</td><td>Apparatuur</td><td></td><td></td><td>voor sputumconcentratie; in staat om 3000 g te bereiken; d&amp;#8211;hoeft niet gekoeld te worden, maar MOET biosafe zijn (emmers kunnen worden afgesloten)</td></tr><tr><td>Incubator (37 °C)</td><td>Apparatuur</td><td></td><td></td><td>voor cultuur; hoeft niet CO2-verrijkt te zijn</td></tr><tr><td>Omgekeerde lichtmicroscoop</td><td>Microscoop</td><td></td><td></td><td>om MODS-platen uit te lezen</td></tr><tr><td>Autoclaaf</td><td>Apparatuur</td><td></td><td></td><td>om media, PBS en gebruikte platen te steriliseren</td></tr><tr><td>Weegschaal</td><td>Apparatuur</td><td></td><td></td><td>het afwegen van isoniazid, rifampicine en NALC</td></tr><tr><td>Middlebrook 7H9-bouillon (Difco)</td><td>Reagens</td><td>Fisher Scientific</td><td>DF0713-17-9</td><td>500 g/fles; basis voor kweekmedium</td></tr><tr><td>Casitone (pancreatisch verteerd caseïne)</td><td>Reagens</td><td>Fisher Scientific</td><td>DF0259&amp;#8208;17&amp;#8208;9</td><td>500 g/fles; basis voor cultuurmedium</td></tr><tr><td>Glycerol (glycerine) gevriesdroogd</td><td>Reagens</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G&amp;#8208;33&amp;#8208;500</td><td>500 ml/fles; basis voor kweekmedium</td></tr><tr><td>PANTA (Gelyofiliseerd antibioticummengsel BD) </td><td>Reagens</td><td>Fisher Scientific</td><td>B4345114</td><td>6 flessen/verpakking; antibioticumsupplement voor media</td></tr><tr><td>OADC (Middlebrook OADC-verrijkingsmedium BD)</td><td>Reagens</td><td>Fisher Scientific</td><td>B11886</td><td>10 x 20 ml/verpakking; supplement voor voedingsmedium</td></tr><tr><td>Dimethylsulfoxide (Hibri-Max)</td><td>Reagens</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>D-2650</td><td>100 ml/fles; ter bereiding van rifampicine-voorraadoplossing</td></tr><tr><td>Antibioticumvoorraden: isoniazid</td><td>Reagens</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>I-3377</td><td>50 g/fles; directe gevoeligheidstesten</td></tr><tr><td>Antibioticumvoorraden: rifampicine</td><td>Reagens</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>R-3501</td><td>1 g/fles; directe gevoeligheidstesting</td></tr><tr><td>Natriumhydroxide (pellets)</td><td>Reagens</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>221465</td><td>500 g/fles; sputumdecontaminatie</td></tr><tr><td>Natriumcitraat (trisodiumzout dihydraat)</td><td>Reagens</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S-4641</td><td>500 g/fles; sputumdecontaminatie</td></tr><tr><td>N-acetyl-L-cysteïne</td><td>Reagens</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A-7250</td><td>50 g/fles; sputumdecontaminatie</td></tr><tr><td>Kaliumfosfaat monobasisch kristal. KH2PO4</td><td>Reagens</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P0662</td><td>500 g/fles; sputumdecontaminatie</td></tr><tr><td>Natriumfosfaatdibasisch, watervrij. Na2HPO4</td><td>Reagens</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S0876</td><td>500 g/fles; sputumdecontaminatie</td></tr><tr><td>Natriumhypochloriet</td><td>Reagens</td><td>huishoudbleekmiddel</td><td></td><td>om besmet afval weg te werpen</td></tr><tr><td>15 ml centrifugebuisjes (polypropyleen 15 ml Falcon 35&amp;#8208;2096)</td><td>Verbruiksartikel</td><td>Fisher Scientific</td><td>14&amp;#8208;959&amp;#8208;49B</td><td>500 stuks/doos; voor sputumdecontaminatie en concentratie</td></tr><tr><td>24-well platen (Plates Tissue 24 wells BD Falcon 35)&amp;#8208;3047)</td><td>Verbruiksartikel</td><td>Fisher Scientific</td><td>08-772-1</td><td>50 platen/doos; voor kweek en uitlezing</td></tr><tr><td>Afdichtbare polyetheen zakken 6 X 6 &amp;#8220; (sluitzakje)</td><td>Verbruiksartikel</td><td></td><td></td><td>voor biosecurity om een 24-wells plaat te bevatten</td></tr><tr><td>Glazen buisjes met dop (16 x 100 mm en 18 x 145 mm)</td><td>Verbruiksartikelen</td><td>VWR international</td><td>47729-583</td><td>500 buisjes/doos; voor het bewaren van aliquots van het bereide bouillon</td></tr><tr><td>Microcentrifugebuisjes met schroefdop (1,5 ml)</td><td>Verbruiksartikel</td><td>Fisher Scientific</td><td>05&amp;#8208;669&amp;#8208;22</td><td>1000 stuks/doos; voor het bewaren van aliquots van antibioticumvoorraden</td></tr><tr><td>0.22&amp;mu;m-filters (waterige oplosmiddelen) Spuitfilter Millex blauw</td><td>Verbruiksartikel</td><td>Fisher Scientific</td><td>SLGL 025 OS</td><td>50 eenheden/doos; voor het filteren van antibioticumvoorraden</td></tr><tr><td>0.22&amp;mu;m filters (organische oplosmiddelen) Spuitfilter Millex geel</td><td>Verbruiksartikel</td><td>Fisher Scientific</td><td>SLGV 033 RS</td><td>50 eenheden/doos; voor het filteren van antibiotica-voorraden</td></tr><tr><td>Wegwerppasteurpipetten van borosilicaatglas 9&amp;#8243;</td><td>Verbruiksartikel</td><td>Fisher Scientific</td><td>13&amp;#8208;678&amp;#8208;20°C</td><td>720 st./doos; om PANTA met mediummix te mengen</td></tr><tr><td>Aerosolbarrier-tips 1000&amp;#8208;1300&amp;mu;Hier is de vertaling van de brontekst:</td><td>Verbruiksartikel</td><td>Fisher Scientific</td><td>02&amp;#8208;707&amp;#8208;51</td><td>1000 st./verp.; om medium in de plaat te dispenseren</td></tr><tr><td>USA Scientific Tips One 1&amp;#8208;200&amp;mu;gele tips</td><td>Verbruiksartikel</td><td>Fisher Scientific</td><td>1111&amp;#8208;0006</td><td>1000 tips/zak; voor het verdunnen van antibioticumvoorraden</td></tr></tbody></table>

de mods methode voor de diagnose van tuberculose en multidrug-resistente tuberculose

The MODS method for diagnosis of tuberculosis and multidrug resistant tuberculosis

Patiënten met actieve longtuberculose (tbc) te infecteren 10-15 andere personen per jaar, waardoor de diagnose van actieve tuberculose essentieel voor zowel het genezen van de patiënt en het voorkomen van nieuwe infecties. Bovendien is de opkomst van multidrug-resistente tuberculose (MDRTB) betekent dat de detectie van resistentie tegen geneesmiddelen noodzakelijk is voor het stoppen van de verspreiding van resistente stammen. De microscopische observatie-drug-gevoeligheid (MODS) test is een low-cost, low-tech tool voor high-performance detectie van TB en MDRTB. De MODS test is gebaseerd op drie principes: 1) Mycobacterium tuberculosis (MTB) groeit sneller in vloeibare media dan op vaste media 2) microscopische MTB groei kan eerder in vloeibare media worden gedetecteerd dan te wachten tot de macroscopische verschijnen van kolonies op vaste media, en dat de groei is kenmerkend voor MTB, waardoor het kan worden onderscheiden van atypische mycobacteriën of schimmel of bacteriële besmetting 3) de drugs isoniazide en rifampicine kunnen worden opgenomen in de MODS test te laten voor gelijktijdige directe detectie van MDRTB, het wegnemen van de noodzaak voor subcultuur uit te voeren een indirecte drug gevoeligheid te testen. Concurrerende huidige diagnostiek wordt gehinderd door een lage gevoeligheid met sputum uitstrijkje, lange vertragingen tot diagnose met stevige mediacultuur, onbetaalbaar hoge kosten met bestaande vloeibare media cultuur methoden, en de noodzaak om subcultuur doen voor indirecte drug gevoeligheid testen om MDRTB op te sporen. In tegenstelling tot de niet-merkgebonden MODS methode heeft een hoge gevoeligheid voor TBC en MDRTB, is een relatief snelle cultuur-methode, biedt gelijktijdige medicijn testen van de gevoeligheid voor MDRTB, en is toegankelijk voor gebieden met beperkte middelen op slechts minder dan $ 3 voor het testen op TBC en MDRTB.

De microscopische observatie-drug-gevoeligheid (MODS) test is een low-cost, low-tech tool voor high-performance detectie van tuberculose (TB) en multiresistente tuberculose (MDRTB). Deze video beschrijft de MODS vloeistof mediacultuur methode.

De MODS methode voor de diagnose van tuberculose en multidrug-resistente tuberculose

Patiënten met actieve pulmonale tuberculose (TB) infecteren jaarlijks 10 tot 15 andere personen, waardoor het diagnosticeren van actieve TB essentieel is voor zowel de genezing van de patiënt als ...

Van elke drie mensen ter wereld is er één geïnfecteerd met tuberculose. Het diagnosticeren van actieve tuberculose voorkomt nieuwe infecties, aangezien patiënten met actieve tuberculose jaarlijks tussen de 10 en 15 andere mensen zullen infecteren totdat zij behandeld worden of overlijden. MODS is een acroniem dat we gebruiken om te voorkomen dat we telkens microscopische observatie en gevoeligheidsmeting voor geneesmiddelen moeten noemen; de reden voor deze benaming wordt duidelijk naarmate de methodologie wordt uitgelegd.In deze korte video schetsen we de mods-methodologie voor de snelle en goedkope diagnostiek van tuberculose en multi-drug resistente tuberculose. De video zet de methodologie stap voor stap uiteen. We bespreken de biosafety-implicaties van het werken met vloeibare culturen en we leggen ook enkele belangrijke aspecten van kwaliteitsbewaking toe die vereist zijn voor het gebruik van deze methodologie.De mods-assay werd ontwikkeld aan de Kayana Universiteit in Lima, Peru, in het laboratorium van Bob Gilman. Dit volgde op waarnemingen die aanvankelijk waren gedaan door loose cavi. LOOSE probeerde snelle methoden te identificeren voor het detecteren van mycobacterium t

the-mods-method-for-diagnosis-tuberculosis-multidrug-resistant

Research

JoVE Journal

Biology

Biologie

Antimicrobiële gevoeligheid testen van Mycobacterium tuberculosis is een uitdaging, maar essentieel voor de patiëntenzorg. Dit microtiterplaat formaat biedt het testen van 12 antimycobacteriële drugs en zorgt voor minimale remmende concentratie (MIC) waarden, die zal helpen bij een passende behandeling.

Antimicrobiële gevoeligheid testen van Mycobacterium tuberculosis-complex voor de eerste en tweede lijn drugs door de bouillon verdund in een microtiterplaat Format

De Xpert MTB / RIF-test integreert monster ontsmetting, hands-free bediening, on-board steekproef verwerking, en ultra-gevoelige hemi-geneste PCR voor de simultane detectie...

Diagnose van longtuberculose met de Xpert MTB / RIF Test

Een amplificatie microarray combineert asymmetrische PCR-amplificatie en microarray hybridisatie in een enkele kamer, die aanzienlijk stroomlijnt microarray workflow voor de eindgebruiker. Vereenvoudiging microarray workflow is een noodzakelijke eerste stap voor het maken van microarray-gebaseerde diagnostiek die routinematig kan worden gebruikt in een lagere-resource-omgevingen.

Aantonen van een multiresistente<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em&gt; Versterking Microarray

We hebben een modulair high-throughput screening ontwikkeld voor het ontdekken van nieuwe verbindingen tegen Mycobacterium tuberculosis, intracellulaire targeting en-bouillon kweken bacteriën en cytotoxiciteit tegen de zoogdiergastheercel.

Systeem voor de werkzaamheid en cytotoxiciteit Screening van inhibitoren voor intracellulaire<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em

We presenteren een geoptimaliseerde methode voor DNA-extractie uit ontsmet sputum met behulp van een matrix-gebaseerde extractiemethode in combinatie met een magnetische parelzuivering voor downstream gerichte next-generation sequencing van Mycobacterium tuberculosis.

Matrix-gebaseerde DNA-extractie voor gerichte sequencing van de volgende generatie op ontsmette sputummonsters

Hier presenteren we een protocol om potentiële anti-tuberculose-geneesmiddelkandidaten te identificeren via fenotypische screening, waaronder de chemische synthese van een 4-aminoquinolineverbinding, het bepalen van de minimale remmende concentratie tegen Mycobacterium tuberculosis en de beoordeling van de cytotoxiciteit in zoogdiercellijnen.

Identificatie van potentiële anti-TB-kandidaten: Een stapsgewijze gids voor synthese, MIC-bepaling en cytotoxiciteitsbeoordeling in zoogdiercellen

Anopheles stephensi muggen zijn vectoren voor malaria wonen India en de rest van Azië. Deze video toont de techniek voor het uitvoeren van micro-injecties van deze soorten met transgenen die weerstand zal verlenen aan de malaria aan de mug. Een groot deel van de methodologie kunnen zien in deze video is van toepassing op micro-injectie technieken van andere muggensoorten.

Injectie van An. stephensi Embryo&#39;s aan Malaria-resistente muggen Generate

In dit protocol tonen we de uitdrukking, oplosbaar, en zuivering van een recombinant uitgedrukt membraaneiwit, MexB, als een oplosbare proteïne detergent complex. MexB is een multidrug resistance membraan transporter uit de opportunistische bacteriële pathogeen Pseudomonas aeruginosa.

Uitdrukking, Wasmiddel oplosbaar, en zuivering van een Membraan Transporter, de MexB Multidrug Resistance Protein

Hele embryo cultuur techniek stelt ons in staat om de cultuur muis en rat...

De Methode van Knaagdieren Hele Embryo Cultuur met behulp van de Rotator-type Bottle Cultuur System

Wij bieden een kosteneffectieve en snelle moleculaire genotypering protocol dat ras-specifieke PCR-primers werken die zich richten op DNA-sequentie verschillen binnen de chloroplast trnL-F spacer regio onderscheid te maken tussen...

Een PCR-gebaseerde genotyperingsmethode onderscheid te maken tussen wild-type en Sier Rassen van Imperata cylindrica</em

Leer de MODS-methode voor snelle diagnose van tuberculose en multiresistente tuberculose. Deze kosteneffectieve vloeibare kweektechniek detecteert Mycobacterium tuberculosis sneller dan vaste media en identificeert tegelijkertijd resistentie tegen isoniazide en rifampicine.

De MODS methode voor de diagnose van tuberculose en multidrug-resistente tuberculose

Meer video's verkennen