Transkrypcja u bakterii

Aby zainicjować transkrypcję, holoenzym polimerazy RNA wiąże się niespecyficznie z DNA z niskim powinowactwem. Następnie przesuwa się wzdłuż DNA, aby zlokalizować sekwencję promotora.

Kiedy wślizguje się do promotora, a konkretnie do regionów -10 i -35 przed miejscem inicjacji, podjednostka sigma polimerazy RNA ściśle wiąże się z promotorem i rozwija DNA, tworząc kompleks "otwartego promotora".

Holoenzym polimerazy RNA, umieszczony teraz w miejscu inicjacji transkrypcji, syntetyzuje transkrypt RNA, dodając komplementarne nukleotydy do matrycy DNA. Po zsyntetyzowaniu łańcucha RNA o długości 10 nukleotydów czynnik sigma zostaje uwolniony.

Enzym rdzeniowy polimerazy RNA kontynuuje dodawanie nukleotydów do rosnącego transkryptu RNA. Gdy polimeraza porusza się do przodu, DNA jest stale rozwijane przed enzymem i przewijane za nim.

Proces trwa do momentu, gdy gen zostanie przepisany, a polimeraza rdzeniowa napotka sygnał zakończenia. Najczęstszym sygnałem zakończenia jest symetryczne, odwrócone powtórzenie sekwencji bogatej w GC, po której następuje ogon poli-A.

Kiedy ta sekwencja jest transkrybowana na RNA, samokomplementarna sekwencja łączy się w pary, tworząc stabilną strukturę pętli spinki do włosów.

Spinka do włosów destabilizuje asocjację mRNA i matrycy DNA oraz powoduje zatrzymanie i dysocjację polimerazy. W ten sposób pęcherzyk transkrypcyjny zapada się, a DNA przewija się do podwójnej helisy, a nowo utworzony transkrypt pre-mRNA zostaje uwolniony.